Участие малатдегидрогеназы в метаболической адаптации к типу питания у бактерий разных систематических групп
Диссертация
Практическая значимость. Практическая значимость настоящей работы состоит в расширении и углублении знаний о роли структурно-функциональных изменений МДГ в механизмах адаптации к изменяющимся факторам внешней среды, а также в выявлении четкой корреляции между индукцией глиоксилатного цикла и синтезом тетрамерной формы МДГ. МДГ находит широкое применение в исследовательской практике, являясь… Читать ещё >
Содержание
- ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
- 1. 1. Физиолого-биохимическая характеристика бактерий Macromonas bipunctata и Rhodopseudomonas palustiis
- 1. 1. 1. Особенности метаболизма бесцветных серобактерий
- 1. 1. Физиолого-биохимическая характеристика бактерий Macromonas bipunctata и Rhodopseudomonas palustiis
- 1. 1. 2. Эколого-биохимическая характеристика фототрофных бактерий
- R. palustrisЮ
- 1. 1. 3. Особенности генома R. palustris
- 1. 1. 4. Распространение и практическое значение исследуемых бактерий
- 1. 2. Сравнительная характеристика МДГ из организмов различных таксономических групп
- 1. 2. 1. Способы получения высокоочищенных препаратов МДГ
- 1. 2. 2. Общая характеристика каталитического действия
- 1. 2. 3. Кинетические параметры
- 1. 2. 4. Влияние концентрации ионов водорода
- 1. 2. 5. Влияние интермедиатов и ионов
- 1. 2. 6. Температурный оптимум
- 1. 2. 7. Особенности малатдегидрогеназной системы организмов, живущих в экстремальных условиях
- 1. 2. 8. Множественные молекулярные формы МДГ
- 1. 3. Характеристика структуры молекулы малатдегидрогеназы
- 1. 3. 1. Анализ аминокислотного состава МДГ из различных о бъектов3 о
- 1. 3. 2. Вторичная, надвторичная и третичная структурные организации белковой молекулы МДГ
- 1. 3. 3. Строение и механизм действия активного центра МДГ
- 1. 3. 4. Характеристика четвертичной структуры МДГ
- 1. 3. 5. Факторы, обеспечивающие стабильность и олигомерное состояние молекулы МДГ
- 1. 3. 6. Характеристика структуры гена МДГ5 О
- 2. 1. Цель и задачи исследования
- 2. 2. Объекты и методы исследования
- 2. 2. 1. Объекты исследования
- 2. 2. 2. Методы исследования
- 2. 2. 2. 1. Состав питательных сред для культивирования микроорганизмов
- 2. 2. 2. 2. Определение активности ферментов
- 2. 2. 2. 3. Определение количества белка
- 2. 2. 2. 4. Выделение и очистка МДГ
- 2. 2. 2. 5. Электрофоретические исследования
- 2. 2. 2. 5. 1. Аналитический электрофорез
- 2. 2. 2. 5. 2. Определение гомогенности ферментных препаратов
- 2. 2. 2. 5. 3. Специфическое проявление малатдегидрогеназы
- 2. 2. 2. 5. 4. Специфическое проявление изоцитратдегидрогеназы
- 2. 2. 2. 5. 5. Специфическое проявление изоцитратлиазы
- 2. 2. 2. 5. 6. Определение молекулярной массы субъединиц МДГ
- 2. 2. 2. 6. Определение молекулярной массы нативного фермента
- 2. 2. 2. 7. Ингибиторный анализ
- 2. 2. 2. 8. Исследование кинетических характеристик и регуляции активности ферментов
- 2. 2. 3. Статистическая обработка экспериментальных данных
- 2. 3. Полученные результаты и их обсуждение
- 2. 3. 1. Влияние различных условий культивирования на активность МДГ и некоторых ферментов ЦТК и глиоксилатного цикла у исследуемых микроорганизмов
- 2. 3. 1. 1. Исследование активности ферментов ЦТК и глиоксилатного цикла из R. palustris и М. bipunctata
- 2. 3. 1. 2. Изоферментный состав некоторых ферментов из исследуемых бактерий
- 2. 3. 2. Получение гомогенных препаратов МДГ из бактерий родов Macromonas и Rhodopseudomonas
- 2. 3. 2. 1. Очистка малатдегидрогеназы
- 2. 3. 2. 2. Определение гомогенности ферментных препаратов
- 2. 3. 3. Физико-химические свойства МДГ
- 2. 3. 3. 1. Определение молекулярной массы нативной МДГ из изучаемых объектов
- 2. 3. 3. 2. Определение субъединичного строения МДГ
- 2. 3. 4. Кинетические и регуляторные характеристики МДГ
- 2. 3. 4. 1. Влияние концентрации ионов водорода
- 2. 3. 4. 2. Определение константы Михаэлиса
- 2. 3. 4. 3. Определение константы субстратного ингибирования
- 2. 3. 4. 4. Влияние интермедиатов и ионов на активность МДГ
- 2. 3. 4. 5. Температурный оптимум
- 2. 3. 5. Функциональная роль изоформ МДГ у R. palustris
- 2. 3. 5. 1. Зависимость четвертичной структуры МДГ от условий культивирования R. palustris
- 2. 3. 5. 2. Влияние итаконата и малоната на соотношение димерной и тетрамерной изоформ МДГ из пурпурных бактерий R. palustris
- 2. 3. 1. Влияние различных условий культивирования на активность МДГ и некоторых ферментов ЦТК и глиоксилатного цикла у исследуемых микроорганизмов
Список литературы
- Александров В.Я. Реактивность клеток и белки / В. Я. Александров. М. .-Наука, 1985.-318 с.
- Березов Т.Т. Биологическая химия : учеб. пособие / Т. Т. Березов, Б. Ф. Коровкин. М.: Медицина, 1998. — 704 с.
- Биохимия человека: в 2-х т. / Р. Мари и др. — перевод с англ. В. В. Борисова, Е. В. Дайниченко — под ред. Л. М. Гинодмана. М.: Мир, 1993. -Т. 1.-384 с.
- Блюменфельд Л.А. Единичные циклы прямой ферментативной реакции на примере МДГ/ Л. А. Блюменфельд, П. Г. Плешанов // Биофизика. -1986. Т. 30, вып. 5. — С. 760−763.
- Варфоломеев С.Д. Биокинетика / С. Д. Варфоломеев, К. Г. Гуревич. -М.: ФАИР-ПРЕСС, 1999. 720 с.
- Волвенкин С.В. Субклеточная локализация и свойства ферментов глиоксилатного цикла в печени крыс с аллоксановым диабетом / С. В. Волвенкин, В. Н. Попов, А. Т. Епринцев // Биохимия. 1999. — Т. 64, вып. 9. — С. 1185−1191.
- Воробьева Л.И. Стрессоры, стрессы и выживаемость бактерий / Л. И. Воробьева // Прикладная биохимия и микробиология. 2004. — Т. 40, № 3.-С. 261−269.
- Выделение, очистка и свойства малатдегидрогеназы из серобактерий Beggiatoa leptomitiformis / А. Т. Епринцев и др. // Известия АН. Сер. биологическая. 2003. — № 3. — С. 301−305.
- Гааль Э. Электрофорез в разделении биологических макромолекул / Э. Гааль, Г. Медьеши, Л. Верецкеи. М.: Мир, 1982. — 446 с.
- Гильманов М.К. Методы очистки и изучения ферментов растений / М. К. Гильманов, О. В. Фурсов, А. П. Францев. Алма-Ата: Наука, 1981.-92 с.
- Глиоксилатный цикл растений / А. А. Землянухин и др. Воронеж: Изд-во Воронеж, ун-та, 1986. — 148 с.
- Готтшалк Г. Метаболизм бактерий / Г. Готтшалк. М.: Мир, 1982. -310с.
- Давранов К. Влияние некоторых органических кислот на активность малатдегидрогеназы семян хлопчатника / К. Давранов, М. А. Кученкова, П. Х. Юлдашев // Химия природных соединений. 1972. — № 2. — С. 7579.
- Детерман, Г. Гель-хроматография / Г. Детерман. М.: Мир, 1970. — 173 с.
- Диксон М. Ферменты : в 3-х т. / М. Диксон, Э. Уэбб — перевод с англ. Л. М. Гинодмана, М. И. Левянт — под ред. В. К. Антонова, А. Е. Браунштейна. М.: Мир, 1982. — Т. 3. — 216 с.
- Дубинина Г. А. Выделение чистых культур ТЫозргга и изучение их серного метаболизма / Г. А. Дубинина, М. Ю. Грабович // Микробиология, 1983.-Т.52, вып. 1.-С. 5−11.
- Дэвени Т. Аминокислоты, пептиды и белки / Т. Дэвени, Я. Гергей. М.: Мир, 1976.-364 с.
- Дюга Г. Биоорганическая химия / Г. Дюга, К. Пенни. М.: Мир, 1983. -512 с.
- Епринцев А.Т. Активность и изоформы малатдегидрогеназы в высоко- и низкомасличных линиях кукурузы / А. Т. Епринцев, А. У. Игамбердиев // Физиология растений. 1995. — Т. 42, № 5. — с. 760−767.
- Епринцев А.Т. Малатдегидрогеназа термофильных бактерий Vulcanithermus medioatlanticus / А. Т. Епринцев, М. И. Фалалеева, Н. В. Парфенова // Биохимия. 2005. — Т. 70, № 9. — С. 1245−1250.
- Епринцев А.Т. Ферментативная регуляция метаболизма ди- и трикарбоновых кислот в растениях / А. Т. Епринцев, В. Н. Попов. -Воронеж: Изд-во Воронеж, ун-та, 1999. 192 с.
- Епринцев А.Т. Экспрессия и регуляция ферментов глиоксилатного цикла / А. Т. Епринцев, В. Н. Попов, М. Ю. Шевченко. Воронеж: Изд-во Воронеж, ун-та, 2005. — 224 с.
- Жеребцов H.A. Биохимия : учеб. пособие / H.A. Жеребцов, Т. Н. Попова, В. Г. Артюхов. Воронеж: Изд-во Воронеж, ун-та, 2002. — 696 с.
- Землянухин A.A. Большой практикум по физиологии и биохимии растений: учеб. пособие / A.A. Землянухин, JI.A. Землянухин. -Воронеж: Изд-во Воронеж, ун-та, 1996. 188 с.
- Землянухин A.A. Выделение и характеристика изоцитратлиазы из щитка кукурузы / A.A. Землянухин, А. У. Игамбердиев, E.H. Преснякова //Биохимия. 1986.-Т. 51, № 3.-С. 442−446.
- Иванищев В.В. Ферменты метаболизма малата: характеристика, регуляция активности и биологическая роль / В. В. Иванищев, Б. И. Курганов // Биохимия. 1992. — Т. 57, вып. 5. — С. 653−661.
- Ивановский Р.Н. Механизм ассимиляции ацетата у пурпурной несерной бактерии Rhodospirillun rubrum, не имеющей изоцитратлиазы / Р. Н. Ивановский, E.H. Красильникова, И. А. Берг // Микробиология. 1997. -Т. 66, № 6. — С. 744−749.
- Индукция пероксисомальной изоформы малатдегидрогеназы в печени крыс при пищевой депривации / В. Н. Попов и др. // Биохимия. 2001. -Т. 66, вып. 5.-С. 617−623.
- Исследование механизма ассимиляции ацетата у пурпурных несерных бактерий, не имеющих глиоксилатного шунта. Ассимиляция ацетата клетками Rhodobacter sphaeroides / Jl.В. Филатова и др. // Микробиология. 2005. — Т. 74, № 3. — С. 313−318.
- Исследование механизма ассимиляции ацетата у пурпурных несерных бактерий, не имеющих глиоксилатного шунта. Ферменты цитрамалатного цикла у Rhodobacter sphaeroides / Л. В. Филатова и др. // Микробиология. 2005. — Т. 74, № 3. — С. 319−328.
- Кашнер Д. Жизнь микробов в экстремальных условиях / Д. Кашнер. -М.: Мир, 1981.-518 с.
- Квеситадзе Г. И. Ферменты микроорганизмов, живущих в экстремальных условиях / Г. И. Квеситадзе. М.: Наука, 1990. — 54 с.
- Келети Т. Основы ферментативной кинетики / Т. Келети. — М.: Мир, 1990.-350 с.
- Клячко О.С. Температура вызывает структурные и функциональные изменения лактатдегидрогеназы из скелетных мышц рыб /О.С. Клячко, Е. С. Полосухина, Н. Д. Озернюк // Биофизика. 1993. — Т. 38, вып. 4. -С. 596−601.
- Кондратьева E.H. Автотрофные прокариоты / E.H. Кондратьева. М.: Изд-во Московского ун-та, 1996. — 312 с.
- Кондратьева E.H. Фототрофные микроорганизмы / E.H. Кондратьева, И. В. Максимов, В. Д. Самуилов. М.: Изд-во Московского ун-та, 1989. -376 с.
- Коэн Ф. Регуляция ферментативной активности / Ф. Коэн. М.: Мир, 1986.-144 с.
- Лакин Г. Ф. Биометрия / Г. Ф. Лакин. М.: Высшая школа, 1990. — 352 с.
- Ландау М.А. Молекулярные механизмы действия физиологически активных соединений / М. А. Ландау. М.: Наука, 1981. — 262 с.
- Ллойд Э. Справочник по прикладной статистике / Э. Ллойд, У. Ледерман. М.: Финансы и статистика, 1989. — 508 с.
- Мауэр Г. Диск-электрофорез / Г. Мауэр. М.: Мир, 1971. — 222 с.
- Молекулярная биология клетки: в 3-х т. / Б. Альберте и др. — пер. с англ. Т. Н. Власика — под ред. Т. П. Георгиева. М.: Мир, 1994. Т. 1. -517 с.
- Наградова Н.К. Белок-белковые взаимодействия в функционировании НАД-зависимых дегидрогеназ / Н. К. Наградова. М.: Наука, 1990. — 56 с.
- Озернюк Н.Д. Механизмы адаптаций / Н. Д. Озернюк. М.: Наука, 1992.-272 с.
- Особенности углеродного метаболизма у бесцветных серобактерий Macromonas bipunctata / М. Ю. Грабович и др. // Микробиология.1993. Т. 62, вып. 3. — С. 421−429.
- Остерман Л.А. Исследование биологических макромолекул / Л. А. Остерман. -М.: Мир, 1983. 297 с.
- Очистка и физико-химические свойства малатдегидрогеназы из бактерий рода Beggiatoa П А. Т. Епринцев и др. // Биохимия. 2003. — Т. 68, № 2. -С. 207−211.
- Парфенова Н.В. Роль структурно-функциональных изменений малатдегидрогеназы в адаптации микроорганизмов к факторам внешней среды : автореф. дис.. канд-та биол. наук / Н. В. Парфенова. -Воронеж, 2004. 24 с.
- Пинейру де Корвалью М.А. А. Малатдегидрогеназа высших растений / М.А. А. Пинейру де Корвалью, A.A. Землянухин, А. Т. Епринцев. -Воронеж: Изд-во Воронеж, ун-та, 1991.-216 с.
- Проблема белка: в 5-ти т. / Е. М. Попов и др.- под ред. Т. И. Соркиной. М.: Наука, 1996. — Т. 2: Пространственное строение белка. — 480 с.
- Пути синтеза и утилизации включений оксалатов бесцветной серобактерией Macromonas bipunctata / М. Ю. Грабович и др. // Микробиология. 1995. — Т. 64, № 5. — С. 630−636.
- Райдер К. Изоферменты / К. Райдер, К. Тейлор. М.: Мир, 1983. — 106 с.
- Резников A.A. Методы анализа природных вод. / A.A. Резников, Е. П. Муликовская, В. Ю. Соколов. -М.: Госгеолтехиздат, 1970. 488 с.
- Роль изоформ малатдегидрогеназы в регуляции анаболических и катаболических процессов у бесцветных серобактерий Beggiatoa leptomitiformis Д-402 / Епринцев А. Т. и др. // Микробиология. 2004. -Т. 73, № 4.-С. 437−442.
- Романова А.К. Биохимические методы автотрофии у микроорганизмов /
- A.К. Романова. М.: Наука, 1980. — 160 с.
- Скоупс Р. Методы очистки белков / Р. Скоупс. М.: Мир, 1985. — 358 с.
- Современная микробиология: прокариоты: в 2-х т. / перевод с англ. И. А. Берга — под ред И. Ленгелера, Г. Древса, Г. Шлегеля. М.: Мир, 2005.-Т. 1.-656 с.
- Соркина Д.А. Структурно-функциональные свойства белков : учеб пособие для вузов / Д. А. Соркина, И. Н. Залевская. Киев: Выща школа, 1990.-216 с.
- Справочник биохимика / Р. Досон и др. М.: Мир, 1991. — 544 с.
- Степанов В.М. Молекулярная биология : структура и функции белков /
- B.М. Степанов — под ред. A.C. Спирина. М.: Высш. шк., 1996. — 335 с.
- Степанова И.Ю. Некоторые кинетические характеристики малатдегидрогеназы из Beggiatoa alba / И. Ю. Степанова // Труды молодых ученых. Воронеж, 2000. — Вып. 2. — С. 130−140.
- Степанова И. Ю Физико-химические и регуляторные свойства малатдегидрогеназы из серобактерий рода Beggiatoa: автореф. дис.. канд-та б иол. наук / И. Ю. Степанова. Воронеж, 2002. — 24 с.
- Страйер JI. Биохимия : в 3-х т. / JI. Страйер — перевод с англ. М. Д. Гроздовой — под ред. С. Е. Северина. М.: Мир, 1984. — Т. 1. — 232 с.
- Участие различных форм малатдегидрогеназы в перестройке типа метаболизма у пресноводных нитчатых бесцветных серобактерий рода Beggiatoa / И. Ю. Степанова и др. // Микробиология. 2002. — Т. 71, № 4.-С. 445−451.
- Феофилова Е.П. Торможение жизненной активности как универсальный биохимический механизм адаптации микроорганизмов к стрессовым воздействиям / Е. П. Феофилова // Прикладная биохимия и микробиология. 2003. — Т. 39, № 1. — С. 5−24.
- Фридрих П. Ферменты: четвертичная структура и надмолекулярные комплексы / П. Фридрих. М.: Мир, 1986. — 374 с.
- Хочачка П. Биохимическая адаптация / П. Хочачка, Дж. Сомеро. М.: Мир, — 1988.-568 с.
- Чеканова Ю.А. Особенности ультраструктурной организации Macromonas bipunctata / Ю. А. Чеканова, Г. А. Дубинина // Микробиология. 1990. — Т. 59, № 5. — С. 837−843.
- Чернышев Г. А. Вероятность и статистика в биологии и химии / Г. А. Чернышев, В. Н. Стариков. Воронеж: Изд-во Воронеж, ун-та, 1998. — 270 с.
- Чернядьев И.И. Ассимиляция ацетата Rhodopseudomonas palustris I И.И. Чернядьев, E.H. Кондратьева, Н. Г. Доман // Микробиология. 1970. — Т. 39, вып. 1.-С. 24−29.
- Шульц Г. Принципы структурной организации белков / Г. Шульц, Р. Ширмер. М.: Мир, 1982. — 354 с.
- Эллиот В. Биохимия и молекулярная биология / В. Эллиот, Д. Эллиот. -М.: МАИК «Наука / Интерпериодика», 2002. 446 с.
- A structural view of evolutionary divergence / B. Spiller et. al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1999. — V. 96. — P. 12 305−12 310.
- Aeration conditions affecting growth of purple nonsulfur bacteria in an organic wastewater treatment process / K. Izu et. al. // Syst. and Appl. Microbiol. 2001. — V. 24, № 2. — P. 294−302.
- Albers H. Acetate metabolism in Rhodopseudomonas gelatinosa and several other Rhodospirillaceae / H. Albers, G. Gottschalk // Arch. Microbiol. -1976.-V. Ill, № 1−2.-P. 45−49.
- An a-proteobacterial type malate dehydrogenase may complement LDH function in Plasmodium falciparum: cloning and biochemical characterization of the enzyme / K. Abhai et. al. // Eur. J. Biochem. 2004. -V. 271.-P. 3488−3502.
- Aquino-Silva M.R. Isoform expression in the multiple soluble malate dehydrogenase of Hoplias malabaricus (Erythrinidae, Characiformes) / M.R. Aquino-Silva, M.L.B. Schwantes, A.R. Schwantes // Braz. J. Biol. 2003. -V. 63, № i.p. 7−15.
- Bayley S.T. Recent developments in the molecular biology of extremely halophilic bacteria. / S.T. Bayley, R.A. Morton // Crit. Rev. Microbiol. -1978.-V. 6.-P. 151−205.
- Beatty J.T. Biosynthetic and bioenergetic functions of citric acid cycle reactions in Rhodopseudomonas capsulata / J.T. Beatty, H. Gest // J. Bacteriol.- 1981.-V. 148, № 2. -P. 584−593.
- Biogeography of the purple nonsulfur bacterium Rhodopseudomoas palustris / Y. Oda et. al. // Appl. and Env. Microbiol. 2003. — V. 69, № 9. — P. 5186−5191.
- Birktoft J J. Structure-function relationships among nicotinamide-adenine dinucleotide dependent oxidoreductases / J.J. Birktoft, L.J. Banaszak // Peptide Protein Rev. 1984. — V. 4. — P. 1−46.
- Breiter D.R. Engineering the quaternary structure of an enzyme: construction and analysis of a monomeric form of malate dehydrogenase from Escherichia coli / D.R. Breiter, E. Resnik, LJ. Banaszak // Protein Sei. 1994. — V. 3, № 11.-P. 2023−2032.
- Catalitic-rate improvement of a thermostable malate dehydrogenase by a subtle alteration in cofactor binding / R. M. Alldread et.al. // Biochem. J. -1995. V. 305, № 2. — P. 539−548.
- Characterization of alanine and malate dehydrogenases from a marine psychrophile strain PA-43 / J.A. Irwin et. al. // Extremophiles. 2001 — V.5, № 3. P. 199−211.
- Characterization of an essential histidine residue in thermophilic malate dehydrogenase / S. Iijima et. al. // J. Biochem. (Tokyo). 1986. — V. 99, № 6.-P. 1667−1672.
- Characterization of malate dehydrogenase from deep-sea psychrophilic Vibrio sp. strain no. 5710 and cloning of its gene / M. Ohkuma et. al. // FEMS Microbiol. Lett. 1996. — V. 137, № 2−3. — P. 247−252.
- Clarke A.R. The role of an aspartate-histidine pair in active site of lactate dehydrogenase / A.R. Clarke, H.M. Wilks, J.J. Holbrook // Protein Eng. -1987.-V. 1, № 3. P. 137−142.
- Cloning and sequence analysis of cDNAs encoding mammalian cytosolic malate dehydrogenase. Comparison of the amino acid sequences of mammalian and bacterial malate dehydrogenase / T. Joh et. al. // J. Biol. Chem. 1987. — V. 262, № 31.-P. 15 127−15 131.
- Cloning, sequencing, and expression in Escherichia coli of the gene coding for malate dehydrogenase of the extremely halophilic archaebacterium Haloarcula marismortui / F. Cendrin et. al. // Biochemistry. 1993. — V. 32.-P. 4308−4313.
- Comparative genomic analysis of five R. palustris strains: insights into genetic and functional diversity within a metabolically versatile species / Y. Oda et al. // Conference on Metabolic Engineering, USA, February 1215 2006. P. 16.
- Complete genome sequence of the metabolically versatile photosynthetic bacterium Rhodopseudomonas palustris / F.W. Larimer et. al. // Nat. Biotechnol. 2004. — Vol. 22. — P. 55−61.
- Complete nucleotide sequence of the Escherichia coli gene enconding malate dehydrogenase / L. McAlister-Henn et. al. // Nucleic Acids Research. -1987.-V. 15, № 12.-P. 4993.
- Complete sequence of Rhodopseudomonas palustris HaA2 / A. Copeland et. al. (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/).
- Construction of a stable dimer of Bacillus stearothermophilus lactate dehydrogenase / R.M. Jackson et. al. // Biochemistry. 1992. — V. 31, № 35.-P. 8307−8314.
- Contribution of engineered electrostatic interactions to the stability of cytosolic malate dehydrogenase / F. Trejo et. al. // Protein Eng. 2001. -V. 14, № 11.-P. 911−917.
- Cox J.C. Increased activity of respiratory enzymes from photosynthetically grown Rhodopseudomonas capsulata in response to small amounts of oxygen / J.C. Cox, J. T. Beatty, and J.L. Favinger // Arch Microbiol. 1983. — V. 134.-P. 324−328.
- Crystal structure of the MJ0490 gene product of the hyperthermophilic archaebacterium Methanococcus jannaschii, a novel member of the lactate/malate family of dehydrogenases / B.I. Lee et. al. // J. Mol. Biol. -2001.- V. 307, № 5.-P. 1351−1362.
- Cytoplasmic malate dehydrogenase from Phycomyces blakesleeanus: kinetics and mechanim / F. Teixido et. al. // Can. J. Biochem. Cell. Biol. -1985. V. 63, № 10. — P. 1097−1105.
- Davis, B.J. A new high resolution electrophoresis method / B.J. Davis, L. Ornstein // Society for the study at the New York Academy of medicine. -1959. P. 112−118.
- Ding Y. Characterization of a cytosolic malate dehydrogenase cDNA which encodes an isozyme toward oxaloacetate reduction in wheat / Y. Ding, Q.H. Ma // Biochimie. 2004. — V. 86, № 8. — P. 509−518.
- Directed evolution of a thermostable esterase / L. Giver et. al. // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1998. — V. 95. — P. 12 809−12 813.
- Directed evolution of thermostable kanamycin-resistance gene: a convenient selection marker for Thermus thermophilus / J. Hoseki et al. 11 J. Biochem.- 1999. -V. 126.-P. 951−956.
- Directed evolution study of temperature adaptation in a psychrophilic enzyme /K. Miyazaki et. al. // J. Mol. Biol. -2000. -V. 297. P. 1015−1026.
- Drmota T. Isolation and characterisation of cytosolic malate dehydrogenase from Trichomonas vaginalis / T. Drmota, J. Tachezy, J. Kulda // Folia Parasitol. (Praha). 1997. -V. 44, № 2. — P. 103−108.
- Dubinina G.A. Genus Macromonas Utermohl and Koppe in Koppe 1924 / G.A. Dubinina, F. Rainey, J.G. Kuenen // Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. 2004. — V. 2. — P. 41−44.
- Dym O. Structural features that stabilize halophilic malate dehydrogenase from an Archaebacterium / O. Dym, M. Mevarech, J.L. Sussman // Science. -1995.-V. 267.-P. 1344−1346.
- Electrostatic interactions across the dimer-dimer interface contribute to the pH-dependent stability of a tetrameric malate dehydrogenase / A. Bj0rk et. al. // FEBS Lett. 2003. — V. 553, № 3. — P. 423−426.
- Eley J.H. Effect of growth condition on enzymes of the citric acid cycle and the glyoxylate cycle in the photo synthetic bacterium Rhodopseudomonas palustris / J.H. Eley, K. Knobloch, T.W. Han // J. Antonie van Leuwenhock.- 1979. -V. 45.-P. 521−529.
- Enhancement of the turnover number of thermostable malate dehydrogenase by deleting hydrogen bonds around the catalytic site / M. Nishiyama et. al. // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1996. — V. 225, № 3. — P. 844−848.
- Enzymatic and physico-chemical characteristics of recombinant cMDH and mMDH of Clonorchis sinensis / N. Zheng et. al. II Parasitol. Res. 2006. -V. 99, № 2.-P. 174−180.
- Expression profiles of hot pepper (Capsicum annum) genes under cold stress conditions / E.W. Hwang et. al. // J. Biosci. 2005. — V. 30, № 5. — P. 657 667.
- Factors affecting L-malate activation of mitochondrial malate dehydrogenase from chicken liver / A. Dordal et. al. // Biochem. Int. 1990. — V. 20, № 1. -P. 177−182.
- Fieldes M.A. An explanation of the achromatic bands produced by peroxidase isozymes in polyacrylamide electrophoresis gels stained for malate dehydrogenase / M.A. Fieldes // Electrophoresis. 1992. — V. 13, № 1−2.-P. 82−86.
- Functional characterization and subcellular localization of the three malate dehydrogenase isozymes in Leishmania spp. / A. Leroux et. al. // Mol. Biochem. Parasitol. 2006. — V. 149, № 1. — P. 74−85.
- Garnak M. Purification and properties of phosphorilated isocitrate dehydrogenase of Escherichia coli / M. Garnak, H. C Reeves // J. Biol. Chem. 1979. -V. 254. — P. 7915−7920.
- Genda T. Purification and characterization of malate dehydrogenase from Corinebacterium glutamicum / T. Genda, T. Nakamatsu, H. Ozaki // J. of Bioscience and Bioengineering. 2003. — V. 95, № 6. — P. 562−566.
- Genotypic and phenotypic diversity within species of purple nonsulfur bacteria isolated from aquatic sediments / Y. Oda et. al. // Appl. and Env. Microbiol. 2002. — V. 68, № 7. — P. 3467−3477.
- Gibson N. Physical and genetic interactions of cytosolic malate dehydrogenase with other gluconeogenic enzymes / N. Gibson, L. McAlister-Henn // J. Biol. Chem. 2003. — V. 278, № 28. — P. 25 628−25 636.
- Gietl C. Malate dehydrogenase isoenzymes: cellular locations and role in the flow of metabolites between the cytoplasm and cell organelles / C. Gietl // Biochim. Biophys. Acta. 1992. -V. 1100, № 3. — P. 217−234.
- Goodman M.M. Malate dehydrogenase: viability of cytosolic nulls and lethality of mitochondrial nulls in maize (enzyme/multilocus) / M.M. Goodman, K.J. Newton, C.W. Stuber // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1981. -V. 78, № 3.-P. 1783−1785.
- Goward C.R. Malate dehydrogenase: a model for structure, evolution, and catalysis / C.R. Goward, D.J. Nicholls // Protein Sci. 1994. — V. 3. — P. 1883−1888.
- Gross G.G. Cell wall-bound malate dehydrogenase from horseradish / G.G. Gross // Phytochemistry. 1977. — V. 16, № 3. — P. 319−321.
- Hagele E. The malate dehydrogenase isoenzymes of Saccharomyces cerevisiae. Purification, characterisation and studies on their regulation / E. Hagele, J. Neeff, D. Mecke // European Journal of Biochemistry. 1978. -V. 83.-P. 67−76.
- Ho L.T. Growth of Rhodopseudomonas palustris under phototrophic and non-phototrophic conditions and its CO-dependent № production / L.T. Ho, P. Ji-young, P. Sunghoon // Biotechnol. Lett. 2002. — V. 24, № 1. — P. 9196.
- Hones J. Chemical modification of the essential arginine in malate dehydrogenase / J. Hones, P. Pfleiderer // Biolog. Chem. Hoppe-Seyler. -1985.-V. 366.-P. 1109−1112.
- How enzymes adapt: lessons from directed evolution / F.H. Arnold et. al. // TrendsBiochem. Sci.-2001.-V. 26.-P. 100−106.
- Identification, cloning and expression analysis of strawberry (Fragaria xananassa) mitochondrial citrate synthase and mitochondrial malate dehydrogenase / P.P. Iannetta et. al. // Physiol. Plant. 2004. — V. 121, № l.-P. 15−26.
- Ileana C.C. Purification and physical and kinetic characterization of an NAD-dependent malate dehydrogenase from leaves of pineapple {Ananas comosus) / C.C. Ileana, F.E. Podesta // Physiologia plantarum. 2000. — V. 108. — P. 240−248.
- Janiczek O. Purification and properties of malate dehydrogenase from Paracoccus denitrificans / O. Janiczek, J. Kovar, Z. Glatz // Prep. Biochem. -1993.-V. 23, № 3.-P. 285−301.
- Jurgensen S.R. Active subunits in hybrid-modified malate dehydrogenase / S.R. Jurgensen, J.H. Harrison // J. Biol Chem. 1982. — V. 257, № 1. — P. 569−574.
- Kalinowski A. Maize pollen enzymes after two-dimensional polyacrilamide gel electrophoresis in the presence or absence of sodium dodecyl sulfate / A. Kalinowski, M. Radlowski, S. Bartkowiak // Electrophoresis. 2002. — V. 23,№ l.-P. 138−143.
- Kinetic and molecular modeling of nucleoside and nucleotide inhibition of malate dehydrogenase / DJ. Harris et. al. // Nucleosides. Nucleotides. Nucleic Acids. 2002. — V. 21, № 11−12. — P. 813−823.
- Kinetic stabilization of Bacillus licheniformis-amylsiSQ through introduction of hydrophobic residues at the surface / M. Machius et al. // J. Biol. Chem. -2003.-V. 278.- P. 11 546−11 553.
- Kirby RR. Cloning and primary structure of putative cytosolic and mitochondrial malate dehydrogenase from the mollusc Nucella lapillus (L.) / R.R. Kirby//Gene.-2000.-V. 245, № l.-P. 81−88.
- Kristjansson H. Purification and properties of malate dehydrogenase from the extreme thermophile Bacillus caldolyticus / H. Kristjansson, C. Ponnamperuma//Orig. Life. 1980. — V. 10, № 2.-P. 185−192.
- Kuijk B.L. Purification and characterization of malate dehydrogenase from the syntrophic propionate-oxidizing bacterium strain MPOB / B.L. Kuijk, A.J. Stams //FEMS Microbiol. Lett. 1996. -V. 144, № 2−3. — P. 141−144.
- Kutzenko A.S. Conserved supersecondary structural motif in DNA-dependent dehydrogenases / A.S. Kutzenko, V.S. Lamzin, V.O. Popov // FEBS Lett. 1998. -V. 423. — P. 105−109
- Kwak K.H. Localization and characteristics of lactate and malate dehydrogenase in the sparganum and adult worm of Spirometra erinacei. / K.H. Kwak, E.W. Cheon, C.H. Kim // Korean J. Parasitol. 1996. — V. 34, № l.-P. 59−68.
- Labrou N.E. Dye-affmity labeling of bovine heart mitochondrial malate dehydrogenase and study of the NADH-binding site / N.E. Labrou, E. Eliopoulos, Y.D. Clonis // Biochem. J. 1996. — V. 315, № 2. — P. 687−693.
- Labrou N.E. L-Malate dehydrogenase from Pseudomonas stutzeri: purification and characterization / N.E. Labrou, Y.D. Clonis // Arch. Biochem. Biophys. 1997. -V. 337, № 1. — P. 103−114.
- Laemmly U.K. Cleavage of structural proteins during assembly of the head of bacteriophage T4 / U.K. Laemmly // Nature. 1970. — V. 77, № 4. — P.680−683.
- Lance C. The central role of malate in plant metabolism / C. Lance, P. Rustin // Physiol. Veg. 1984. — V. 22. — P. 625−641.
- Lang-Unnasch N. Purification and properties of Plasmodium falciparum malate dehydrogenase / N. Lang-Unnasch // Mol. Biochem. Parasitol. 1992. -V. 50,№ l.-P. 17−25.
- Lehnindger A.L. Principles of biochemistiy / A.L. Lehnindger, D.L. Nelson, M.M. Cox. WH Freeman&Co, 4th Ed., 2004. — 1119 p.
- L-Malyl-coenzyme A/-Methylmalyl-coenzyme A lyase is involved in acetate assimilation of the isocitrate lyase-negative bacterium Rhodobacter capsulatus / M. Meister et. al. // J. Bacteriol. 2005. — Vol. 187, № 4. — P. 1415−1425.
- Ma H. Malate dehydrogenase isoenzymes in Aspergillus niger / H. Ma, C.P. Kubicek, M. Rohr // FEMS Microbiol. Lett. 1982. — V. 12, № 2. — P. 147 151.
- Machado M.F. Malate dehydrogenase (MDH- EC 1.1.1.37) isozymes in tissues and callus cultures of Cereus peruvianus (Cactaceae) / M.F. Machado, A.J. Prioli, C.A. Mangolin // Biochem. Genet. 1993. — V. 31, № 3−4. — P. 167−172.
- Mader M. Isolation of malate dehydrogenase from cell walls of Nicotina tabacum / M. Mader, P. Schloss // Plant Science Letters. 1979. — V. 17, № l.-P. 75−80.
- Madern D. Molecular adaptation: the malate dehydrogenase from the extreme halophilic bacterium Salinibacter rubber behaves like a non-halophilic protein / D. Madern, G. Zaccai // Biochimie. 2004. — V. 86, № 4−5. — P. 295−303.
- Malate dehydrogenase: distribution, function and properties / R.A. Musrati et. al. // Gen. Physiol. Biophys. 1998. — V. 17, № 3. — P. 193−210.
- Malate dehydrogenases structure and function / P. Minarik et. al. // Gen. Physiol. Biophys. — 2002. -V. 21, № 3. — P. 257−265.
- Malick A.W. Effect of lipids on enzymatic activity of pig heart mitichondrial malate dehydrogenase monomolecular films / A.W. Malick, N.D. Weiner // J. Pharm. Science. 1977. — V. 66, № 10. — P. 1465−1469.
- Mansini E. Purification and properties of mitochondrial malate dehydrogenase of Toxocara canis muscle / E. Mansini, E.G. Oestreicher, L.P. Ribeiro // Comp. Biochem. Physiol. B. 1986. — V. 85, № 1. — P. 223−228.
- Martin A. In vitro selection of highly stabilized protein variants with optimized surface / A. Martin, V. Sieber, F.X. Schmid // J. Mol. Biol. 2001. -V. 309. — P. 717−726.
- Mass spectrometric sequncing of proteins from silver-stained Polyacrylamide gels / A. Shevchenko et. al. // Anal. Chem. 1996. — V. 68. — P. 850−858.
- McEwan A.G. Photosynthetic electron transport and anaerobic metabolism in purple non-sulfur phototrophic bacteria / A.G. McEvan // Antonie van Leeuwenhoek. 1994. -V. 66. — P. 151−164.
- McGuire J.P. Studies of enzyme inhibition. The interaction of some platinum (II) complexes with fumarase and malate dehydrogenase / J.P. McGuire, M.E. Friedman, Ch.A. McAuliffe // Inorganic. Chim. Acta. 1984. — V. 91, № 3. — P. 725−731.
- Mitochondrial malate dehydrogenase from the thermophilic, filamentous fungus Talaromyces emersonii / A.P. Maloney et. al. // Eur. J. Biochem. -2004.-V. 271,№ 15.-P. 3115−3126.
- Mottram J.C. Purification of particulate malate dehydrogenase and phosphoenolpyruvate carboxykinase from Leishmania mexicana / J.C. Mottram, G.H. Coombs // Biochem. Biophys. Acta. 1985. — V. 827, № 2. -P. 310−319.
- Nesterenko M.V. A simple modification of Blum’s silver stain method allows for 30 minute detection of proteins in Polyacrylamide gels / M.V. Nesterenko, M. Tilley, S.J. Upton // J. Biochem. Biol. 1994. — V. 28. — P. 239−242.
- Okabayashi K. Purification and properties of mitochondrial malate dehydrogenase from unfertilized eggs of the sea urchin, Anthocidariscrassispina / K. Okabayashi, E. Nakano // J. Biochem. (Tokyo). 1984. — V. 95.-P. 1625−1632.
- Organelle and translocatable forms of glyoxysomal malate dehydrogenase. The effect of the N-terminal presequence / B.R. Cox et. al. // Febs J. 2005. -V. 272.-P. 643−654.
- Pfenning N.D. Uber das vitamin Bi2 bedurfuis phototropher Schwefelbakterien / N.D. Pfenning, K.D. Lippert / Arch. Microbiol. — 1966. -V. 55.-P. 245−259.
- Powers E.T. A perspective on mechanisms of protein tetramer formation / E.T. Powers, D.L. Powers // Biophys J. 2003. — V. 85, № 6. — P. 35 873 599.
- Probing the role of oligomerization in the high thermal stability of Pyrococcus furiosus ornithine carbamoytransferase by site specific mutants / B. Clantin et. al. // Eur. J. Biochem. 2001. — V. 268. — P. 3037−3942.
- Probing the specificity of a trypanosomal aromatic a-hydroxy acid dehydrogenase by site-directed mutagenesis / J. Vernal et. al. // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2002. — V. 293. — P. 633−639.
- Properties and function of malate enzyme from Pseudomonas putida / A. Garrido-Pertierra et. al. // Biochimie. 1983. — V. 65, № 11−12. — P. 629 635.
- Properties and primary structure of the L-malate dehydrogenase from the extremely thermophilic archaebacterium Methanothermus fervidus / E. Honka et. al. //Eur. J. Biochem. 1990. -V. 188, № 3. — P. 623−632.
- Protein measurment with the folin pihend reagent / O.H. Lowry et. al. // J. Biologi. 1951. — V. 193. — P. 265−275.
- Protein thermostability in extremophiles / R. Scandurra et. al. // Biochimie. 1998. -V. 80, № 11.-P. 933−941.
- Purification and characterization of malate dehydrogenase from Streptomyces aureofaciens / D. Mikulasova et. al. // FEMS Microbiol. Lett. 1998. — V. 159, № 2.-P. 299−305.
- Purification and properties of malate dehydrogenase from the thermoacidophilic archaebacterium Thermoplasma acidophilum / W. Grossebuter et. al. // Biol. Chem. Hoppe Seyler. 1986. — V. 367, № 6. — P. 457−463.
- Purification and properties of two malate dehydrogenases from Candida sp. N-16 grown on methanol / J. Yoshikawa et. al. // Biosci. Biotechnol. Biochem. 2001. — V. 65, № 7. — P. 1659−1662.
- Purification of bacterial malate dehydrogenases by selective elution from a triazinyl dye affinity column / K. Smith et. al. // Biochim. Biophys. Acta. -1982.-V. 708.-P. 17−25.
- Quinlan R.G. An investigation into the role of protein-ligand interactions on obligate and transient protein-protein interactions: a dissertation of doctor of philosophy / R.G. Quinlan. Texas, 2004. — 221 pp.
- Rat liver mitochondrial malate dehydrogenase: purification, kinetic properties, and role in ethanol metabolism / M.S. Wiseman et. al. // Arch. Biochem. Biophys. 1991.-V. 290, № 3,-P. 191−196.
- Reeves H.S. Determination of isocitrate lyase activity in Polyacrylamide gels / H.S. Reeves, M.J. Volk // Anal. Biochem. 1972. — V. 48, № 2. — P.437−441.
- Regulation of mitochondrial malate dehydrogenase. Evidence for an allosteric citrate-binding site / T.R. Mullinax et. al. // J. Biol. Chem. 1982. — V. 257, № 22. — P. 13 233−13 239.
- Rice S.C. The aconitase of yeast. II crystallisation and general properties of yeast aconitase / S.C. Rice, N.G. Pon // J. Biochem. 1975. — V. 77, № 2. -P. 367−372.
- Roderick S.L. The three dimensional structure of porcine heart mitochondrial malate dehydrogenases at 3.0-A resolution / S.L. Roderick, L.J. Banaszak // J. Biol. Chem. 1986. — V. 261. — P. 9461−9464.
- Roth S. Cat8 and Sip4 mediate regulated transcriptional activation of the yeast malate dehydrogenase gene MDH2 by three carbon source-responsive promoter elements / S. Roth, H.J. Schuller // Yeast. 2001. — V. 182, № 2. -P. 151−162.
- Saito R. Differences in malate dehydrogenases from the piezophilic deep-sea bacterium Moritella sp. strain 2D2 and the psychrophilic bacterium Moritella sp. strain 5710 / R. Saito, A. Nakayama // FEMS Microbiol. Lett. 2004. -V. 233, № i.p. 165−172.
- Shah H.N. Malate dehydrogenase and glucose-6-phosphate dehydrogenase, key markers for studing the genetic diversity of Actinobacillus actinomycetemcomitans / H.N. Shah, D.M. Andrews // FEMS Microbiol. Lett. 1994. — V. 122, № i2. — P. 69−73.
- Sheikh S. Active site mapping studies of malate dehydrogenase:. identification of essential amino acid residues by o-phthalaldehyde / S.
- Sheikh, S.S. Katiyar // Biochem. Int. 1992. — V. 27, № 3. — P. 517−524.
- Schuelter A.R. Inheritance of malate dehydrogenase in wild pepper / A.R. Schuelter, V.W. Casali, F.L. Finger // Bragantia. 1999. — V. 58, № 1. — P. 1−6.
- Sinha S.N. Ecological role of thiosulfate and sulfide utilizing purple nonsulfur bacteria of a riverine ecosystem / S.N. Sinha, R.D. Banerjee // FEMS Microbiol. Ecol. 1997. — V. 24, № 3. — P. 211−220.
- Site-directed mutagenesis reveals role of mobile arginine residue in lactate dehydrogenase catalysis / A.R. Clarke et. al. // Nature. 1986. — V. 324. -P. 699−702.
- Smith K. Malate dehydrogenases from actinomycetes: structural comparison of Thermoactinomyces enzyme with other actinomycete and Bacillus enzymes / K. Smith, T.K. Sundaram, M. Kernick // J. Bacteriol. 1984. — V. 157, № 2.-P. 684−687.
- Stabilization of halophilic malate dehydrogenase / G. Zaccai et. al. // J. Mol. Biol. 1989. — V. 208, № 3. — P. 491−500.
- Steffan J.S. Isolation and characterization of the yeast gene encoding the MDH-3 isoenzyme of malate dehydrogenase / J.S. Steffan, L. McAlister-Henn // J. Biol. Chem. 1992. — V. 267, № 34. — P. 24 708−24 715.
- Steffan J.S. Structural and functional effects of mutations altering the subunit interface of mitochondrial malate dehydrogenase /J.S. Steffan, L. McAlister-Henn // Arch. Biochem. Biophys. 1991. — V. 287, № 2. — P. 276−282.
- Structural analyses of a malate dehydrogenase with a variable active site / J.K. Bell et. al. // J. Biol. Chem. 2001. — V. 276, № 33. — P. 31 156−31 162.
- Structural basis for cold adaptation. Sequence, biochemical properties, and crystal structure of malate dehydrogenase from a psychrophile Aquaspirillumarcticum / S.Y. Kim et. al. // J. Biol. Chem. 1999. — V. 274, № 17. — P. 11 761−11 767.
- Structural basis for thermophilic protein stability: structures of thermophilic and mesophilic malate dehydrogenases / B. Dalhus et. al. // J. Mol. Biol. -2002. V. 318, № 3. — P. 707−721.
- Structural basis of substrate specificity in malate dehydrogenase: crystal structure of a ternary complex of procine cytoplasmic malate dehydrogenase, a-ketomalonate and tetrahydoDNA / A.D. Chapman et. al. // J. Mol. Biol. -1999.-V. 285.-P. 703−712.
- Structural organization of the mouse cytosolic malate dehydrogenase gene: comparison with that of the mouse mitochondrial malate dehydrogenase gene / C. Setoyama et. al. // J. Mol. Biol. 1988. — V. 202, № 3. — P. 355−364.
- Structural organization of the mouse mitochondrial malate dehydrogenase gene/H. Takeshima et. al. //J. Mol. Biol. 1988. -V. 200, № 1. — P. 1−11.
- Structure of a ternary complex of an allosteric lactate dehydrogenase from Bacillus stearothermophilus at 2.5 A resolution / P.G. Wigley et. al. // J. Mol. Biol. 1992. — V. 223. — P. 317−335.
- Sutherland P. Isolation and expression of the Escherichia coli gene encoding malate dehydrogenase / P. Sutherland, L. Mc Alister-Henn // J. Bacteriol. -1985.-V. 163, № 3.-P. 1074−1079.
- Szilagyi A. Structural differences between mesophilic, moderately thermophilic and extremely thermophilic protein subunits: results of a comprehensive servey / A. Szilagyi, P. Zavodszky // Structure. 2000. — V. 8, № 5.-P. 493−504.
- Tabita F.R. Anoxygenie photosynthetic bacteria / F.R. Tabita, T.E. Hanson // Microbial Genomics. 2004. — V. 38. — P. 225−243.
- Tayeh M.A. Malate dehydrogenases in phototrophic purple bacteria: purification, molecular weight, and quaternary structure / M.A. Tayeh, M.T. Madigan // J. Bacteriol. 1987. — V. 169, № 9. — P. 4196−4202.
- Tayeh M.A. Malate dehydrogenases in phototrophic purple bacteria. Thermal stability, amino acid composition and immunological properties / M.A. Tayeh, M.T. Madigan // Biochem. J. 1988. — V. 252, № 2. — P. 595−600.
- Tetrameric and dimeric malate dehydrogenase isoenzymes in Trypanosoma cruzi epimastigotes / G.R. Hunter et. al. // Mol. Biochem. Parasitol. 2000. -V. 105, № 2.- P. 203−214.
- The 2.9 A resolution crystal structure of malate dehydrogenase from Archaeoglobus fulgidus: mechanisms of oligomerisation and thermal stabilization / A. Irimia et. al. // J. Mol. Biol. 2004. — V. 335, № 1. — P. 343−356.
- The malate dehydrogenase isoforms from Trypanosoma brucei: subcellular localization and differential expression in bloodstream and procyclic forms / A. Aranda et. al. // Int. J. Parasitol. 2006. — V. 36, № 3. p. 295−307.
- The oligomeric states of Haloarcula marismortui malate dehydrogenase are modulated by solvent components as shown by crystallographic and biochemical studies / A. Irimia et. al. // J. Mol. Biol. 2003. — V. 326, № 3. -P. 859−873.
- The unique pentagonal structure of an archeal rubisco is essential for its high thermostability / N. Maeda et. al. // J. Biol. Chem. 2002. — V. 277. — P. 31 656−31 662.
- Tiny TIM: a small tetrameric, hyperthermostable triosephosphate isomerase / H. Walden et. al. // J. Mol. Biol. 2001. -V. 306. — P. 745−757.
- Tlapakova T. Localization, structure and polymorphism of two paralogous Xenopus laevis mitochondrial malate dehydrogenase genes / T. Tlapakova, V. Krylov, J. Macha // Chromosome Res. 2005. — V. 13, № 7. — P. 699−706.
- Toshihiro T. Molecular cloning and mapping of a human cDNA for cytosolic malate dehydrogenase (MDH1) / T. Toshihiro, I. Johji, N. Yusuke // Genomics. 1996. — V. 32, № 1. — P. 128−130.
- Tyagi A.K. Studies on the purification and characterization of malate dehydrogenase from Mycobacterium phlei / A.K. Tyagi, F.A. Siddiqui, T.A. Venkitasubramanian // Biochim. Biophys. Acta. 1977. — V. 485. — P. 255 267.
- Uttaro A.D. Characterisation of the two malate dehydrogenase from Phytomonas sp. Purification of the glicosomal isoenzyme i A.D. Uttaro, F.R. Opperdoes // Mol. Biochem. Parasitol. 1997. — V. 89, № 1. — P. 51−59.
- Veeger C.B. Succinate dehydrogenase / C.B. Veeger, B.W. Devatanin // Meth. enzyme citric acid cycle. 1969. -V. 23. — P. 81−90.
- Vessal M. Partial purification and kinetic properties of cytoplasmic malate dehydrogenase from ovine liver Echinococcus granulosus protoscolices / M. Vessal, S.M. Tabei // Comp. Biochem. Physiol. B. Biochem. Mol. Biol. -1996.-V. 113, № 4.-P. 757−763.
- Vieille C. Hyperthermophilic enzymes: sources, uses, and molecular mechanisms for thermostability / C. Vieille, G.J. Zeikus // Mol. Biol. Rev. -2001.-V. 65.-P. 1−43.
- Waters J.K. Malate dehydrogenase from Rhizobium japonicum 31 lb-143. Bacteroids and glicin max root nodule mitochondria / J.K. Waters, D.B. Karr, D.W. Emerich // Biochemistry. 1985. — V. 24, № 23. — P. 6479−6486.
- Wise D.J. Purification and kinetic characterization of Haemophilus influenzae malate dehydrogenase / D.J. Wise, C.D. Anderson, B.M. Anderson // Arch. Biochem. Biophys. 1997. — V. 344, № 1. — P. 176−183.
- Wright S.K. Alteration of the specificity of malate dehydrogenase by chemical modulation of an active site arginine / S.K. Wright, R.E. Viola // J. Biol. Chem. 2001. — V. 276, № 33. — P. 31 151−31 155.
- Yano J.K. New understandings of thermostable and peizostable enzymes / J.K. Yano, T.L. Poulos // Current Opinion in Biotechnology. 2003. — V. 14. -P. 360−365.
- You K. Purification and properties of malate dehydrogenase from Pseudomonas testosteroni / K. You, N. Kaplan // J. Bacteriol. 1975. — V. 123, № 2.-P. 704−716.
- Yueh A.Y. Purification and molecular properties of malate dehydrogenase from the marine diatom Nitzchia alba / A.Y. Yueh, C.S. Chung, Y.K. Lai // Biochem. J. 1989. -V. 258, № 1. — P. 221−228.
- Zenka J. Purification and properties of cytoplasmic malate dehydrogenase from Taenia crassiceps (Zeder, 1800) cysticerci / J. Zenka, J. Prokopic // Folia Parasitol. (Praha). 1989. — V. 36, № 1. — P. 59−65.
- Zhao H. Directed evolution converts subtilisin E into a functional equivalent of thermitase / H. Zhao, F.H. Arnold // Protein Eng. 1999. — V. 12. — P. 4753.