Молекулярно-генетический анализ генома животных и человека с использованием ДНК-маркеров
Диссертация
С введением ДНК-маркеров наметился прогресс в моле-кулярно-генетическом анализе генома эукариот. В обозримой перспективе генетический анализ признаков, кодируемых определенными локусами хромосом, будет вероятно базироваться на знании полной последовательности нуклеотидов соответствующих локусов и знании вариантов этих последовательностейаллелей. Однако, пока такая информация для геномов человека… Читать ещё >
Содержание
- 1. введение
- 2. структура исследования
- 3. результаты и обсуждение
- 3. 1. ОБЩИЙ АНАЛИЗ ГЕНОМА: СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ГЕНОМА BOS TAURUS
- 3. 1. 1. Материалы и методы
- 3. 1. 2. Термическое фракционирование ДНК и характеристика AT- и GC-обогащенных фракций
- 3. 1. 3. Анализ транскрипционной активности генома в разных органах Bos taurus на основе кинетики гибридизации поли (А)-мРНК с кДНК
- 3. 1. ОБЩИЙ АНАЛИЗ ГЕНОМА: СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ГЕНОМА BOS TAURUS
Список литературы
- Аитова С.С., Сулимова Г. Е., Удина И. Г. К вопросу о характеристике ПДРФ-маркера локуса D13S25 13-й хромосомы человека: локализация Sspl-сайтов в пробе рН2−42// Молекулярная биология. 1995. Т.29. С.813−817.
- Аитова С.С., Мойсяк Е. В., Сулимова Г. Е., Удина И. Г. Характеристика локуса D13S25 13-й хромосомы человека: ПЦР-ПДРФ и компьютерный анализ// Сб. трудов 5-й конференции «Геном человека-96″. Черноголовка. 1996 .
- Айала Ф. Введение в популяционную генетику// М: Мир. 1984.
- Алтухов Ю.П. Балансирующий отбор как фактор поддержания аллозимного полиморфизма // Успехи соврем, биол. 1989. Т.107. С.323−340.
- Алтухов Ю.П. Генетические процессы в популяциях. М.: Наука, 1989, 328 с.
- Алтухов Ю. Генетический мониторинг популяций в связи с состоянием среды // Генетика и благосостояние человечества. М.: Наука, 1981. С. 205−220.
- Алтухов Ю.П. Проблемы популяционно-генетической организации вида у рыб // Журн. общ. биол. 1977.1. Т.38. С. 893−906.
- Алтухов Ю.П., Корочкин Л. И., Рычков Ю. Г. Наследственное биохимическое разнообразие в процессах эволюции и индивидуального развития// Генетика. 1996. Т.32. С.1450−1473.
- Алтухов Ю.П., Рычков Ю. Г. Генетический мономорфизм видов и его возможное биологическое значение // Журн.общ.биологии. 1972. Т.33. С.281−300.
- Антонов A.C., Белозерский А. Н. Сравнительное изучение нуклеотидного состава ДНК некоторых позвоночных и беспозвоночных// Докл. АН СССР. 1961. Т.138. С.12−17.
- Белозерский А.Н., Спирин A.C. Состав нуклеиновых кислот и систематика//Известия АН СССР. 1960. No.l. С.64−68.
- Будовский Э.И., Демушкин В. П. Разделение олиго-нуклеотидов//Биохимия. 1964. Т.29. С.1063−1069.
- Ванюшин Б.Ф., Белозерский А. Н. Нуклеотидный состав ДНК высших растений//Докл.АН СССР. 1959. Т.129. С.944−947.
- Ванюшин Б.Ф., Бурьянов Я. И. Получение и щелочной гидролиз апиримидиновой ДНК//Биохимия. 1969. Т.34. С.547−556.
- Габерманн В. Химические методы частичного управляемого расщепления дезоксирибонуклеиновых кис-лот//Усп.соврем.биологии. 1964. Т.57. С.177−191.
- Городецкий С.И., Каледин A.C. Анализ нуклеотид-ной последовательности кДНК каппа-казеина коровы.// Генетика. 1987. Т.23. С.596−604.
- Городецкий С.И., Сулимова Г. Е., Мильшина Н. В., Богуспаев К. К., Слюсаренко А. Г. Сложность и гетерогенность поли(А)-содержащих информационных РНК из разных органов Bos taurusZ/Молекул.биология. 1982. Т.16. С.82−93.
- Городецкий С.И., Сулимова Г. Е., Попендиките В. Х., Мильшина Н. В., Иванов В. Н. Выделение и характеристика поли(А+)-РНК лактирующей молочной железы коровы//Биохимия. 1984. Т.49. С.633−643.
- Дрожденюк A.n., Сулимова Г. Е., Ванюшин Б. Ф. Содержание 5-метилцитозина в разных классах повторяющихся последовательностей ДНК некоторых высших рас-тений//Биохимия. 1977. Т.42. С.1439−1444.
- Забаровский Е.Р., Домнинский Д. А., Киселев Л. Л. Физическое картирование генома человека: на пути к выработке оптимальной стратегии//Молекул. биология. 1994. Т.28. С.1231−1244.
- Кирьянов Г. И., Поляков В. Ю., Ченцов Ю. С. Биохимический подход к проблеме полинемности хромосом некоторых растений//Докл.АН СССР. 1974. Т.218. С. 485−488.
- Мазин А.Л., Сулимова Г. Е., Ванюшин Б. Ф. Термическое фракционирование ДНК по составу //Молекул.биология. 1970. Т.4. С.265−274.
- Мазин А.Л., Сулимова Г. Е. Корреляция между содержанием ГЦ и 5-метилцитозина в ДНК растений//Докл.АН СССР. 1973. Т.211. С.985−988.
- Мазин А.Л., Сулимова Г. Е. Хроматография нуклеиновых кислот, белков и некоторых фагов на гранулированном гидроксиапатите//Биохимия. 1975. Т.40. С.115−122.
- Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. // Молекулярное клонирование. М.: Мир. 1984. 479 с.
- Мильшина H.B., Сулимова Г. Е. Анализ кинетики гибридизации ДНК-РНК с помощью ЭВМ //В сб."Молекулярная биология» АН УССР. 1984. Т.37. С.62−70.
- Мирошниченко Г. П., Антонов A.C., Вальехо-Роман K.M. Результаты исследования кинетики реасоциации денатурированных фрагментированных ДНК некоторых высших растений//Докл.АН СССР. 1972. Т.205. С.1243−1245.
- Наумов С.П., Кузякин A.n. Жизнь животных// Москва: Просвещение. 1971. Т.6. С.539−553.
- Ней М. Генетические расстояния и молекулярная таксономия// В книге: Вопросы общей генетики. М., Наука. 1981. С.7−18.
- Попендиките B.X., Слюсаренко А. Г., Сулимова Г. Е., Городецкий С. И. Сравнительный анализ различных методов выделения информационных РНК из молочной железы коровы//Биоорган.химия. 1982. Т.8. С.667−675.
- Попендиките B.X., Сулимова Г. Е., Мильшина Н. В., Городецкий С. И. Фракционирование поли(А+)-РНК лактирующей молочной железы коровы и характеристика ее отдельных фракций//Молекул.генетика, микробиология и вирусология. 1984. Вып.1. С.24−27.
- Рожков Ю.И., Охапкин С. К. Генетический полиморфизм животных, его адаптационное значение и использование в селекции//Сельскохоз.биология. 1989. N0.1. С.14−24.
- Свердлов Е.Д. Подходы к иследованию первичной структуры ДНК//В сб. «Физико-химические методы в молекулярной биологии». Серия «Итоги науки и техники». Молекулярная биология. М.1975. Т.4.
- Семикозова О.П., Берберов Э. М., Шайхаев Г. О., Сулимова Г. Е. Оптимизация условий блот-гибридизации ДНК для различных типов мембран//Молек.генетика, микробиология и вирусология. 1992. N0.11−12. С.14−19.
- Сипко Т.П., Удина И.Г, Бадагуева Ю. Н, Сулимова Г. Е. Сравнительная характеристика полиморфизма ДНК гена каппа-казеина у представителей семейства Воу1-йае //Генетика. 1994. Т.30. С.225 229.
- Слепченко А.Р. Главный комплекс гистосовместимо-симости сельскохозяйственных животных: иммуногенети-ческие и популяционные аспекты // Успехи современной генетики. М.:Наука, 1994. Вып. 19. С.178−205.
- Соколова С.С., Сулимова Г. Е., Удина И. Г. Изучение главного комплекса гистосовместимости (BoLa) у крупного рогатого скота. // В сб. «Генетические методы в селекции с/х животных». М.1991, С.74−82.
- Соколова С.С., Сулимова Г. Е. ДНК-полиморфизм генов главного комплекса гистосовместимости у крупного рогатого скота// В сб."Главный комплекс гистосовместимости крупного рогатого скота (под ред. проф.Э.К.Бороздина). М.-1993. Изд-во «ВНИИПлем». С.7−86.
- Сулимова Г. Е. Анализ нуклеотидной последовательности ДНК.//Hayчн.докл.высш.школы, биологич. науки. 1977. No.12. С.7−26.
- Сулимова Г. Е. Методы фракционирования ДНК//В сб."Физико-химические методы молекулярной биологии" (под ред.И.В.Березина). Изд-во МГУ. 1978. С.3−32.
- Сулимова Г. Е. Полиморфизм длин рестриктных фрагментов ДНК: методология и свойства//Сельскохоз.биология. 1989. No.1. С.60−67.
- Сулимова Г. Е. Полиморфизм длин рестрикционных фрагментов ДНК сельскохозяйственных животных: методология, результаты и перспективы//Успехи соврем, генетики. 1993. Вып.18. С.3−35.
- Сулимова Г. Е. К вопросу о номенклатуре аллелей каппа-казеина у представителей подсемейства Bovi-пае//Генетика. 1998. Т.34. No.4. С.1−3.
- Сулимова Г. Е., Ахундова A.A., Капелинская Т. В., Городецкий С. И. Локализация места синтеза и содержание мРНК кининогена быка// Биохимия. 1985. Т. 50. С.279−288.
- Сулимова Г. Е., Бадагуева Ю. Н., Удина И. Г. Полиморфизм гена каппа-казеина в популяциях подсемейства Воу1пае//Генетика. 1996. Т.32. N.11. С.1576−1582.
- Сулимова Г. Е., Богуспаев К. К., Мильшина Н. В., Слюсаренко А. Г., Городецкий С. И. Сравнительное изучение кинетической сложности поли(А)-содержащих информационных РНК из печени и селезенки коровы//Докл. АН СССР. 1979. Т.248. С.247−251.
- Сулимова Г. Е., Городецкий С. И. Полиморфизм длин рестрикционных фрагментов гена Ъ-казеина Bos tau-rus/УСельскохоз.биология. 1988. No.3. С.31−34.
- Сулимова Г. Е., Дрожденюк А. П., Ванюшин Б. Ф. Выделение и очистка ДНК из высших растений с помощью бромистого цетилтриметиламмония в сочетании с хроматографией на оксиапатите //Биоорган.химия. 1976. Т.2. С.1182 1188.
- Сулимова Г. Е., Мазин А. Л., Ванюшин Б. Ф., Белозерский А. Н. Содержание 5-метилцитозина в различных по составу фракциях ДНК высших растений//Докл. АН СССР. 1970. Т.193. С.1422−1425.
- Сулимова Г. Е., Мазин А. Л. Характер нуклеотидной последовательности и содержание 5-метилцитозина в различных по составу фракциях ДНК некоторых высших растений и животных//Вестник МГУ. 1971. Т.2. С.100−103.
- Сулимова Г. Е., Мазин А. Л. Термическое фракционирование ДНК по составу//В сб."Методы биохимического эксперимента", Изд-во МГУ, М. 1974. С.68−94.
- Сулимова Г. Е., Маркарян А. Ю. Сравнительный анализ полиморфизма длин рестриктных фрагментов генов казе-инов у крупного рогатого скота//В сб."Молекулярные механизмы генетических процессов". М. 1991. С.58−63.
- Сулимова Г. Е., Слюсаренко А. Г. Выделение дезокси-рибонуклеиновых кислот из тканей высших растений//В сб."Строение ДНК и положение организмов в системе" (под ред.А. Н. Белозерского и А.С.Антонова), Изд-во МГУ, М. 1972. С.19−34.
- Сулимова Г. Е., Соколова С. С., Семикозова О. П., Нгует Л. М., Берберов Э. М. Анализ полиморфизма ДНК кластерных генов у крупного рогатого скота: гены ка-зеинов и гены главного комплекса гистосовместимости (BoLA)//Цитология и генетика. 1992. Т.26. С.18−26.
- Сулимова Г. Е., Стрельченко Л. В. Полиморфизм длин рестриктных фрагментов генов казеинов у крупного рогатого скота // Изв. СО АН СССР. Сер.биол.науки. 1989. Вып.2. С. 41.
- Сулимова Г. Е., Удина И. Г., Шайхаев Г. О., Захаров И. А. ДНК-полиморфизм гена BOLA-DRB3 у крупного рогатого скота в связи с устойчивостью и восприимчивостью к лейкозу // Генетика. 1995. Т.31. С.
- Сулимова Г. Е., Шайхаев Г. О., Берберов . М., Марка-рян А.Ю., Кандалова Л. Г. Генотипирование локуса каппа-казеина у крупного рогатого скота с помощью поли-меразной цепной реакции// Генетика. 1991. Т.27. С.2053−2062.
- Сулимова Г. Е., Шайхаев Г. О., Захаров И. А., Шевченко В. Г. Способ определения генетических вариантов каппа-казеина у сельскохозяйственных животных// Авторское свидетельство No.1 659 448 (на заявку No.4 672 018/30−13 (46 112) от 31.03.1989). Бюл. No.24
- Удина И.Г. Гены главного комплекса гистосовместимости человека и животных// Успехи современной генетики. 1994. Вып.19. С.133−177.
- Удина И. Г., Бадагуева Ю. Н., Сулимова Г. Е., Захаров И. А. Распределение аллелей гена каппа-казеина в популяции зубра (Bison bonasus)// Генетика. 1995. Т.31. N.12. С. 1704 -1706.
- Удина И.Г., Сипко Т. П., Соколова С. С., Сулимова Г. Е. Сравнительная характеристика полимофизма ДНК локусов DQB И DRB главного комплекса гистосовместимости у представителей семейства Bovidae// Генетика. 1994. Т.30. N.3. С.356−360.
- Уханов C.B., Столповский Ю. А., Банникова Л. В., Зубарева Л. А., Иванова З. И., Вердиев З. К. Генетические ресурсы крупного рогатого скота: редкие и исчезающие отечественные породы// М.Наука. 1993. С.135−138.
- Хаертдинов Р. А. Влияние генотипа коров по бета-казеину на количественное содержание белков молока// Генетика. 1989. Т. 25. С.
- Чжан Юй Го. Сравнительый анализ полиморфизма гена DQB главного комплекса гистосовместимости у крупного рогатого скота// Диссертация на соискание ученой степени канд. биол. наук. М.1995. 87с.
- Чжан Юй Го, Сулимова Г. Е. Анализ полиморфизма генов главного комплекса гистосовместимости у крупного рогатого скота (BoLA) при помощи ПЦР// Тезисы I Международной конференции по молекулярно-генетическим маркерам животных. Киев, 1994. С. 69.
- Шайхаев Г. О., Маркарян А. Ю., Сулимова Г. Е. Полиморфизм длин рестриктных фрагментов ДНК: оптимизация условий определения для генетико-селекционных исследований// Изв. СО АН СССР. Сер.биол.науки. 1989. Вып.2. С.41
- Шпикитер В.О. Методы исследования биополимеров с помощью аналитической ультрацентрифуги//В сб."Современные методы в биохимии". Изд-во «Медицина», М. 1964. С.5−37.
- Эрнст Л.Н., Сулимова Г. Е., Орлова А. Р., Удина И. Г., Павленко С. П. Особенности распространения антигенов BoLA-DRB3 у черно-пестрого скота в связи с ассоциацией с лейкозом//Генетика. 1997. Т.33. С.87−95.
- Adachi Т., Ahn 3.Y., Yamamoto К., Aoki N., Nakamura R., Matsuda T. Characterization of the Bovine Kappa-Casein Gene Promoter // Bioscience Biotechnology and Biochemistry. 1996. V. 60. P. 1937−1940.
- Affara N.A., Jacquet M., Jacob H., Jacob F., Gross F. Comparison of polysomal polyadenylated RNA from embrional carcinoma and commited myogenic and erithropoietic cell lines// Cell. 1977. V.12. P.509−520.
- Albertsen H.A. Abderrahim H., Cann H., et al.
- Construction and characterisation of a yeast artificial chromosome library containing seven haploid human genome equivalents//Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1990. V.87. P.4256−4260.
- Alexander L.3., Stewart A.F., Mackinlay A.G., Kapelinskaya T.V., Tkach T.M., Gorodetsky S.I. Isolation and characterization of the bovine k-casein gene//Eur 3 Biochem. 1988. V.178. P.395−401.
- Amorena B. & Stone W.H. Serologically defined SD locus in cattle // Science. 1978. Vol.201. P.159−160.
- Andersson C. Genome shortcut leads to problems//Science. 1993. V.259. P.1684−1687.
- Andersson L. Organization of the bovine MHC class II region as revealed by genomic hibridizations // Animal Genetics. 1988. V.19. P.32−34.
- Andersson L., Bohme 3., Rask L., Peterson P.A. Genomic hybridization of bovine class II major histocompatibility genes: 1. Extensive polymorphism of DQa and DQb genes // Animal Genetics. 1986. V.17. P.95−112.
- Andersson L., Lunden A., Sigurdottir S., Davies Ch.CJ., Rask L. Linkage relationships in the bovine MHC region. High recombination frequency between class II subregions // Immunogenetics. 1988. V.27. P.273−280.
- Andersson L., Rask L. Characterization of the MHC class II region in cattle. The number of DQ genes varies between haplotypes // Immunogenetics. 1988. V.27. P.110−120.
- Axel R., Feigelson R., Schiitz G. Analysis of the complexity and diversity of mRNA from chicken liver and oviduct//Cell. 1976. V.7. P.247−254.
- Baker C.M., Manwell C. Chemical classification of cattle. 1. Breed groups//Anim. Blood Groups and Biochem. Genet. 1980. V.ll. P.127−150.
- Ballingall K.T., Luyai A., Mckeever D.CJ. Analysis of Genetic Diversity at the Dqa Loci in African Cattle Evidence for a Bola-Dqa3 Locus // Immunogenetics. 1997. V. 46. P.237−244.
- Bannikova L.V., Sulimova G.E., Zubareva L.A., Zakharov I.A. Polymorphism of genes of blood and milk proteins of cattle breeds of Russia//Abstracts of the XXIII International Conference on Animal Genetics. 1992. P.14.
- Barthurst I.C., Craig R.K., Herries D.G., Campbell P.N. Differential distribution of poly (A)-containing RNA sequences between the nucleus and post-nuclear supernatant of the lactating guinea-pig mammary gland//Eur. J. Biochem. 1980. V.109. P.183−191.
- Beckmann J.S., Soller M. Restriction fragment length polymorphisms in genetic improvement: methodologies, mapping and costs // Theor. Appl. Genet. 1983. V.67. P.35−43.
- Beckmann O.S., Soller M. Restriction fragment length polymorphisms and genetic improvement of agricultural species // Euphytica. 1986. V.35. P.111−124.
- Bendich A., Pahl H.B., Beiser S.M.
- Chromatographic fractionation of deoxyribonucleicacids with special emphasis on the transforming factor of Pneumococcus//Cold Spring Harbor Symp.Qunt.Biol. 1956.V.21. P.31−48.
- Bernardi G. Chromatography of nucleic acids on hydroxyapatite //Nature. 1965. V.206. P.779−781.
- Bernardi G. Chromatography of nucleic acids on hydroxyapatite //Biochim.Biophys.Acta. 1969. V.174. P.423−457.
- Bernardi G., Olofsson B., Filipski J., Zerial M., Salinas J., Cuny G., Meunier-Rotival M., Rodier F. The mosaic genome of warm-blooded vertebrates // Science. 1985. V.228. P.953−958.
- Bernoco D., Lewin H.A., Andersson L. et al. Joint Report of the Fourth International Bovine Lymphocyte Antigen (BoLA) Workshop // Animal Genetics. 1992. V. 22. P.477−496.
- Bishop J.O., Morton J.G., Rosbash M., Richardson M. Three abundance classes in HeLa cell messenger RNA//Nature. 1974. V.250. P. 199−204.
- Bonsing 3., Ring J.M., Stewart A.F., Mackinlay A.G. Complete nucleotide sequence of the bovine beta-casein gene // Aust. J. Biol. Sci. 1988. V.41. P.527−537.
- Boom R., Sol C.J.A., Salimans M.M.M. Rapid and simple method for purification of nucleic acids // 3. Clin. Microbiol. 1990. V.28. P. 495−503.
- Botstein D., White R.L., Skolnik M. Construction of a genetic linkage map in man using RLFP// Am. 3. Hum. Genet. 1980. V.32. P.314−331.
- Bringe N.A., Kissela CJ.E. Forces involved in the enzymatic and acidic coagulation of casein micelles// Development in Food Proteins 5. London: Appl. Sc. Publish. 1987. P.159−173.
- Britten R.J., Davidson E.H. Gene regulation for higher cells// Theory Science. 1969. V.165. P.349−357.
- Britten R.J., Davidson E.H. Repetitive and non-repetitive DNA sequences and a speculation on the origins of evolutionary novelety//
- Quant.Rev.Biol. 1971. V.46. P.111−133.
- Britten R.J., Graham D.E., Neufeld B.R. Analysis of repeating DNA sequences by reassociation//In Methods in Enzimology. 1974. V.28E. P.363−418.
- Britten R.O., Kohne D.E. Nucleotide sequencerepetition in DNA// Carnegie Inst.Wash.Yearbook. 1967. V.65. P.78−106.
- Britten R.J., Kohne D.E. Repeated sequences in DNA// Science. 1968. V.161. P.529−540.
- Brown A.G., Ross F.M., Dunne E.M., Steel M.C., Weir-Thompson E.M. Evidence for a new tumour supressor locus (DBM) in human B-cell neoplasia telomeric to the retinoblastoma gene// Nature Genet. 1993. V.3. P.67−72.
- Bull C.P., Thomas G.R. et al The Wilson disease gene is a putative copper transporting P-type ATPase similar to the Menkes gene//Nature Genet. 1993. V.5. P.327−337.
- Burke D.T., Carle G.F., Olson M.V. Cloning of large segments of exogenous DNA into yeast by means of artificial chromosome vectors//Science. 1987. V.236. P.806−812.
- Burke M.G., Stone R.T., Muggli-Cockett E. Nucleotide sequence and Nothern analysis of a bovine major histocompatibility class II DRB-like cDNA // Animal Genetics. 1991a. V.22. P.343−352.
- Burke M.G., Stone R.T., Muggli-Cockett N.E. The nucleotide sequence of bovine majorhistocompatibility class II DRB cDNA and hybridization to lymphocyte RNA // Animal Genetics. 19 916. V.22. Suppl.l. P.49−50.
- Burton K. Frequences of nucleotide sequences in deoxyribonucleic acids//Biochem.0. 1960. V.77. P.547−552.
- Burton K., Petersen G.B. The frequences of certain sequences of nucleotides in deoxyribonucleic acid//J.Biochem. 1960. V.75. P.17−27.
- Chargaff E. Isolation and composition of deoxypentose nucleic acids and of the corresponding nucleoproteins//The nucleic acids. 1955. V.l. P.307−371.
- Chargaff E., Rust P., Temperli A., Morisawa S., Danon A. Investigation of the purine sequences in deoxyribonucleic acids// Biochim.Biophys.Acta. 1963. V.76. P.149−151.
- Chiba H., Tani F., Yoshikawa M. Opioid antagonist peptides derived from k-casein//J.Dairy Res. 1989.1. V.56. P.363−366.
- Chikaraishi D.M., Dub S.S., Sueoka N. Sequence complexity of nuclear RNAs in adult rat tissue//Cell. 1978. V.13. P.111−120.
- Chumakov I., LeGall I., Billaut A. Isolation of chromosome 21-specific yeast artificial chromosomes from a total human genome library// Nature Genet. 1992. V.l. P.222−225.
- Clay O., Caccio S., Zoubak S., Mouchiroud D., Bernardi G. Human coding and noncoding DNA: compositional correlations//Mol. Phylogenet. Evol. 1996. V.5. P.2−12.
- Cohen D., Chumakov I., Weissenbach J. Afirst-generation physical map of the human genome//Nature. 1993. V.366. P.698−701.
- Corneo G., Ginelli I., Polli E. A satellite DNA isolated from human tissues//J.Mol.Biol. 1967. V.23. P.619−622.
- David V. A., Deutch A. H., Detection of bovine alphaSl-casein genomic variants using the allele-specific polymerase chain reaction//Animal Genetics. 1992. V.23. P.425−430.
- Denicourt R., Sabour M.P., McAllister A.J. Detection of bovine kappa-casein genomic variants by the PCR method.// Animal Genetics. 1990. V.21. P.215−216.
- Dietz A.B., Detilleux D.C., Freeman A.E., Kelley D.H., Stabel J.R., Kehrli M.E. Genetic Association of Bovine Lymphocyte Antigen Drb3 Alleles with Immunological Traits of Holstein Cattle // J. Dairy Sci. 1997. V. 80. P. 400−405.
- Di Stasio L., Merlin P. Polimorphismo biochimici del latte nella razza bovina Grigio Alpina// Rivista di Zootechia e Veterinaria. 1979. V.2. P.64−67.
- Ephrussi B. Hybridization of somatic cells. Oxford Univ. Press. 1972. P.195−197.
- Erhardt G. Detection of a new 3C-casein variant in milk of Pinzgauer cattle//Animal Genetics. 1996.1. V.27. P.105−107.
- Fabre W. Regulation of MHC expression// Immunology letters. 1991. Vol.29. N. l-2. P.3−8.
- Feretti L., Leone P., Sgaramella V. Long range restriction analysis of the bovine casein genes// Nucleic Acids Research. 1990. V.18. P.6829−6833.
- Fiat A.-M., Jolles P. Caseins of various origines and biologycally active casein peptides and oligosaccharides: structural and phisiological aspects// Mol.Cel.Biochem. 1989. V.87. P.5−30.
- Fitchett M., Griffiths M.O., Oscier D.G., Johnson S., Seabright M. Chromosome Abnormalities Involving Band 13ql4 in Hematologic Malignances//Cancer Genet. Cytogenet. 1987. V.24. P.143−150.
- Fox P., Mullvichil D.M. Milk proteins: molecular, colloid and functional propetries// J. Dairy Res. 1982. V.49. P.678−693.
- Fries R., Hediger R.R., Strazinger G. Tentative chromosomal localization of the bovine major histocompatibility complex by in situ hybridization // Animal Genetics. 1986. V.17. P.287−294.
- Fries R., Beckmann O.S., Georges M. et al. The bovine gene map // Anim. Genet. 1989. V.20. P.3−29.
- Giovambattista G., Golijow C.D., Dulout F.N., Lojo M.M. Gene frequencies of DRB3.2 locus of
- Argentine Creole cattle // Animal Genetics. 1996. V.27. P. 55−56.
- Germain R.N. & Hendrix L.P. MHC class II structure, occupancy and surface expression determined by post-endoplasmic reticulum antigen binding // Nature. 1991. V.353. P.134−139.
- Groenen M.A.M., van der Poel J.J., Dijkhof R.J.M., Giphart M.J. The nucleotide sequence of bovine MHC class II DQB and DRB genes // Immunogenetics. 1990. V.31. P.37−44
- Grosclaude F., Mahe M.-F., Mercier J.-C., Ribadeau-Dumas B. Localization des substitutions d’acides amines differenciant les variants A et B de la caseine bovine//Ann. Genet. Sel. Anim. 1972. V.4. P.515−521.
- Grosclaude F., Joudrier P., Mahe M.-F.
- Polymorphisme de la casein bovine: etroite liasion du locus k-Cn avec les loci aSl-Cn, b-Cn et k-Cn, mise evidence d’une deletion le variant CnD, //Ann.Genet.Sel.Anim. 1978. V.10. P.313−327.
- Gusella T.E. DNA polymorphism and human disease//Annu. Rev. Biochem. 1986. V.55. P.831−854.
- Hastie N.D., Bishop J.O. The expression of three abundance classes of messenger RNA in mouse tissues//Cell. 1976. V.9. P.761−774.
- Hojny D., Stratil A. Report on the pig and sheep blood group and polymorphic protein workshops// Anim. Blood Groups and Biochem. Genet. 1978. V.9. P.245−251.
- Jacguet M., Affara N.A., Robert B., Jacob H.,
- Jacob F., Gross F. Complexity of nuclear and polysomal polyadenylated RNA in a pluropotent embryonal carcinoma cell line//Biochemistry. 1978. V.17. P.69−79.
- Jeffreys A.J., Wilson V., Thein S.L.
- Hypervariable minisatellite regions in human DNA // Nature. 1985. V.314. P.67−73.
- Jolles P., Loucheux-Lefebvre M.H., Henschen A. Structure relatedness of k-casein and fibrinogen g-chain//J. Mol. Evol. 1978. V.U. P.271−277.
- Jolles P., Henschen A. Comparison between the clotting of blood and milk//TIBS. 1982. V.7. P.325−328.
- Joosten I., Hensen E.J., Sanders M.F. & Andersson L. Bovine MHC class II restriction fragment length polymorphism linked to expressed polymorphism // Immunogenetics. 1990. V.31. P.123−126.
- Josse I., Kaiser A.D., Kornberg A. Enzymatic synthesis of DNA. VIII. Frequences of nearest neighbor base sequences in DNA // J.Biol.Chem. 1961. V.236. P.864−875.
- Juliusson G., Oscier D.G., Fitchett M. et al. Prognostic subgroups in B-CELL chronic lymphocytic leukemia defined by specific chromosomal abnormalities//N.Engl.J.Med. 1990. V.323. P.720−725.
- Kaplan D. C. Le clonage des genes humains // La presse Medicale. 1984. V.13. P.1565−1570.
- Kary B., Mull is K.B. The PCR in an anaemic mode: how to avoid cold oligodeoxyribonuclear fusing // PCR Methods and Applications. 1991. V.l. P. 1−4.
- Malik S., Sidhu N.S., Kumar S., Kumar A., Rani R. Kappa-Casein Alleles in Zebu and Crossbred (½-Friesian, l/4−3ersey, ¼-Hariana) Cattle from India Using Polymerase Chain-Reaction and
- Sequence-Specific Oligonucleotide Probes (PCR-Ssop) // Genetic Analysis Biomolec. Engineering. 1997. V. 14.P. 61−63.
- Mandell J.D., Hershey A.D. A fractionating column for analysis of nucleic acids//Analyt.Biochemistry. 1960. V.l. P.66−77.
- Marmur D. A procedure for the isolation of deoxyribonucleic acid from microorganisms // J. Mol. Biol. 1961. V.3. P.208−218.
- Marmur D., Doty P. Thermal renaturation of
- DNA//J.Mol.Biol. 1961. V.3. P.585−594.
- Marshall C.J. Tumour suppressor genes// Cell. 1991. V.64. P.313−326.
- Mazin A.L., Sulimova G.E., Vanyushin B.F. Granulated hydroxyapatite: preparation andchromatographic properties. //Analyt. Biochemistry. 1974. V.61.P.62−71.
- McKusick V.A. Mendellian inheritance in man//Baltimore: Johns Hopkins Univ.Press. 1983. Medrano F.J., Cordova
- A.E. Genotyping of bovine kappa-casein loci following DNA sequence amplification//
- Biotechnology. 1990. V.8. P.144−146.
- Mercier J.-C., Chobert J.-M., and Addeo F. Comparative study of the amino acid sequences of the caseinmacropeptides from seven species//FEBS Letters. 1976. V.72. P.208−214.
- Meselson M., Stahl F.W., Vinograd J. Equilibrium sedimentation of macromolecules in densitygradients//Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 1957. V.43. P.581−588.
- Mikko S., Lewin H.A., Andersson L. A Phylogenetic Analysis of Cattle Drb3 Alleles with a Deletion of Codon-65 // Immunogenetics. 1997., V. 47. P. 23−29
- Morton M.E. Parameters of the human genome//Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1991. V.88. P.7474−7476.
- Muggli-Cockett N.E. & Stone R.T. Partial nucleotide sequence of a bovine major histocompatibility class II DRB-like gene // Animal Genetics. 1989. V.20. P.361−370.
- Mullis K. B., Faloona F. A., Specific syntesis of DNA in vitro via a polymerase catalysed chain reaction.// Methods of Enzimology. 1986.
- Olson M., Hood L., Cantor C. and Botstein D. A common language for physical mapping of the human genome//Science. 1989. V.245. P.1434−1435.
- Ostrow R.S., Woods W.Y., Vosika G.J., Faras A.D. Analysis of the genetic complexity and abundance classes of messenger RNA in human liver and leukemic cells//Biochim.Biophys.Acta. 1979. V.562. P.92−102.
- Pearson W.R., Davidson E.H., Britten R.J. A program for least squares analysis of reassociation and hybridization data//Nucl.Acids Res. 1977. V.4. P. 1727−1737.
- Rando A., DiGregorio P., Masina P. Identification of bovine k-casein genotypes at the DNA level// Anim.Genet. 1988. V.19. P.51−54.
- Rijnkels M., Kooiman P.M., Deboer H.A., Pieper F.R. Organization of the Bovine Casein Gene Locus // Mammalian Genome. 1997. V. 8. P.148−152.
- Roger M., Beckmann C.O., Hotchkiss R.D. Separation of native and denatured fractions from partially denatured pneumococcal DNA//J.Mol.Biol. 1966. V.18. P.156−173.
- Roger M., Beckmann C.O., Hotchkiss R.D. Fractionation of denatured pneumococcal DNA: evidence for resolution of complementary strands//J.Mol.Biol. 1966. V.18. P.174−194.
- Russell G.C., Gallagher A., Craigmile S., Glass E.J. Characterization of Cattle cDNA Sequences from 2 Dqa Loci // Immunogenetics. 1997. V. 45. P.455−458.
- Saiki R.K., Scharf S., Faloona F. et al. Enzymatic amplification of b-globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sickle cell anemia//Science. 1985. V.230. P.1350- 1354.
- Saiki R.K., Gelfand D.H., Stoffel S. et al. Primer-directed enzymatic amplification of DNA witha thermostable DNA Polymerase // Science. 1988. V.239. P.487−491.
- Sanger F., Nicklen S., Coulson A.R. DNA sequencing with chain terminating inhibitors // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1975. V.74. P. 5463−5467.
- Sarkar G., Cassady J., Bottemo C.D.K., Sommer S.S. Characterisation of polymerase chain reaction amplification of specific alleles// Anal. Biochemistry. 1990. V.186. P. 64−68.
- Savage M.J., Sala-Trepat S.M., Bonner J. Measurement of the complexity and diversity of poly (A)containing mRNA from rat // Biochemistry. 1978. V.17. P.462−467.
- Schaar J. Effect of 86-casein genetic variants and lactation number on the renetting properties of individual milks//3.Dairy Res. 1984. V.51. 397−406.
- Schlieben S., Erhardt G., Senft B. Genotyping of bovine k-casein following DNA sequence amplification and direct sequencing of k-Cn E PCR product// Animal Genet. 1991. V.22. P.333−342.
- Schmid D.O., Bushemann H.G. Blutgruppen bei Tieren. // Stuttgart: Enke. 1985. P.428.
- Skinner D.M. Satellite DNA’s in the crabs Gecarcinus lateralis and Cancer pagurus // Proc.
- Natl. Acad. Sci. USA. 1967. V.58. P.103−110.
- Scott P.C., Gogolin-Ewens K.3., Adams T.E., Brandon M.R. Nucleotide sequence, polymorphism, and evolution of ovine MHC // Immunogenetics. 1991a V.34. P.69−79.
- Scott P.C., Madox J.F., Cogolin-Ewens K.J., Brandon M.R. The nucleotide sequence and evolution of ovine MHC class II B genes: DQB and DRB // Immunogenetics. 19 916. V.34. P.80−87.
- Sigurdardottir S., Borsch C., Gustafsson K., Andersson L. Cloning and sequence analysis of 14 DRB alleles of the bovine major histocompatibility complex by using the polymerase chain reaction // Animal Genetics. 1991a. V.22. P.199−211.
- Sigurdardottir S., Borsch C., Gustafsson K., Andersson L. Conserved polymorphism at major histocompatibility DRB loci in man and cattle // Animal Genetics. 19 916. V.22. Suppl.1. P.59−60.
- Stear M.J., Dimmock C.K., Newman M.J., Nicholas F.W. BoLA antigens are associated with increased frequency of persistent lymphocytosis in bovine leukaemia virus // Animal Genetics. 1988. V.19. P.151−158.
- Stewart A.E., Willis I.M., Mackinlay A.G. Nucleotide sequences of bovine aSl- and k-caseincDNAs//Nucl.Acids Res. 1984. V.12. P.3895−3907.
- Stewart A.E., Alexander L.J., Mackinlay A.G. Isolaton and characterisation of the bovine k-casein gene//Eur. J. Biochem. 1988. V.178. P.395−401.
- Still I.H., Roberts T., Bia B., Hawthorn L. et al. Incorporation of 35 novel gene transcripts into the physical and genetic map of human chromosome 13//Genomics. 1996. V.33. P.159−166
- Stone R.T., Muggli-Cockett N.E. Partialnucleotide sequence of a novel bovine major histocompatibility complex class II b-Chain gene, BoLA-DIB // Animal Genetics. 1990. V.21. P.353−360.
- Sueoka N., Cheng T.Y. Fractionation of nucleic acids with the methylated albumin column //3. Mol. Biol. 1962. V.4. P.161−172.
- Sueoka N., Marmur 0., Doty P. Heterogeneity in DNA.II. The dependence of the density of DNA on guanine-cytosine content//Nature. 1959. V.183. P.1429−1431 .
- Sulimova G.E., A.V.Baranova, I.G.Udina,
- S.S.Aitova, V.M. Zakharjev, A.V. Belyavsky,
- N.K.Yankovsky. Analysis of microsatellitedistribution in enriched with chromosome 13 cDNA library and constructing EST-markers//Human Genome Meeting. Toronto, Canada. Abstracts. 1997.
- Sulimova G.E., Semikozova O.P., Berberov E.M. The use of polymerase chain in the exploration of the human k-casein gene//European society of human genetics. Abstracts of 24th annual meeting. 1992. Elsinore, Denmark. P.141−142.
- Sulimova G.E., Udina I.G., Karamysheva E.E., Turkova S.O., Orlova A.R. B0LA-DRB3-associated resistance to persistant lymphocytosis in Russian dairy cattle//Proceedings of International Conference on Animal Biotechnology. Beijing, 1997. P.81−84.
- Sulimova G.E., Udina I.G., Orlova A.R., BoLA-DRB3 genotyping of Black Pied cattle, aspects of resistance and susceptibility to leukemia//Animal Genetics. 1996. V.27. Suppl.2. P.46−47.
- Sulimova G.E., Zakhariev V.N., Udina I.G., Bliskcovsky V.V., Kirillov A.V., Kapanadze B.I., Yankovsky N.K. Human probe pH2−42 in D13S25 locus: sequence, PCR-markers// Abstracts of 25th Annual
- Meeting of European society of human genetics. 1993. Barcelona. P.93.
- Swartz M.N., Trautner T.A., Kornberg A. Enzymatic synthesis of DNA. XI. Further studies on nearest neighbor base sequensec in deoxyribonucleic acids//J.Biol.Chem. 1962. V.237. P.1961−1967.
- Teale A.J., Kaushal AQ., MacHugh N., Toye P. & Bensaid A. Bovine MHC class I cDNA clones: evidence for expression of two loci // Animal Genetics. 1991. V.22. Suppl.l. P.59.
- Thompson M.P., Farrel H.H. Lactation-3//N.Y. Acad.Press. 1974. P.109−132.
- Thompson M.D., Dave J.R., Nakhasi H.K. Molecular cloning of mouse mammary gland k-casein: comparison with rat k-casein and rat and human g-fibrinogen//DNA. 1985. V.4. P.263−271.
- Threadgill D.W., Womark J.E. Genomic analysis of the major bovine milk protein genes// Nucl. Acids Res. 1990. V.18. P.6935−6942.
- Trowsdale J. Molecular organization of the MHC molecules// Immunological Letters. 1991. V.29. P.178.
- Udina I.G., Sulimova G.E. PCR-analysis of hypervariable region of factor VII gene.// Abstracts of 25th Annual Meeting of European society of human genetics. 1993. Barcelona. P.73.
- Udina I.G., Sulimova G.E., Aitova S.S., Zabarovsky E.R., Zakhariev V.N., Kashuba V.I., Kisselev L.L. STS-markers of human chromosome 3 to regions with NotI-sights. //Human Genome Meeting. Toronto, Canada. Abstracts. 1997.
- Udina I.G., Sulimova G.E., Badagueva Yu.N. Characteristics of kappa-casein alleles in cattle breeds and some Bovidae species//The 46th Annual Meeting of the European Association for Animal Production. Commission on Animal Genetics. Prague. 1995.
- Usinger W.R., Curie-Cohen M., Stone W.H. Lymphocyte-defined loci in cattle // Science. 1977. V.196. P.1017−1018.
- Van der Poel J. D., Groenen M.A.M., Dijkhof R.J.M., Ruyter D., Giphart M.J. The nucleotide sequence of bovine MHC class II alpha genes: DRA,
- DQA and DYA // Immunogenetics. 1990. V.31. P.29−36.
- Van Eijk M.J.T. Bovine lymphocyte antigen (BoLA) class II genes: Polymorphism, disease association and linkage relationships with the prolactin and BoLA-A genes// Thesis Urbana (III), 1993. 365p.
- Van Eijk M.J.T., Stewart-Haynes J.A. & Lewin H.A. Extensive polymorphism of the BOLA-DRB3 gene distinguished by PCR-RFLP // Animal Genetics. 1992. V. 23. P.483−496.
- Vogel F. Genetics of retinoblastoma// Hum Genet. 1979. V.52. P.1−543.
- Vogelstein B., Gillespie D. Preparative and analytical purification of DNA from agarose // Proc.Natl.Acad.Sci USA. 1979. V.76. P.615−619.
- Washburn K.W., Maeda Y., Lanza G.M. Protein polymorphism in a random bred chicken population // Anim. Blood Groups and Biochem. Genet. 1980. V.ll. P.261−269.
- Washington S.S., Warburton D., Chakravarti A. Report of the second international workshop on human chromosome 13 mapping 1994 //Cytogenet. Cell Genet. 1995. V.70. P.2−16.
- Watkins P. C. Restriction fragment length polymorphism (RFLP): application in human chromosome mapping and genetic disease research //
- BioTechniques. 1988. V.6. P.214−234.
- Weinberg, R.A. The retinoblastoma gene and gene product. // Cancer Surveys 12 // Levine A.3. and Franks L.M., Eds. NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1992.
- Wilkes P.R., Birnie G.D., Paul J. Changes in nuclear and polysomal polyadenylated RNA sequnces during rat-liver regeneration //Nucl. Acids Res. 1979. V.6. P.2193−2208.
- Xu A. Polymorphism of bovine MHC class II genes: association with persistent lymphocytosis caused by bovine leukemia virus. Thesis. University of Illinois, Urbana, Illinois. 1992. 145p.
- Xu, A., Van Eijk, M.3.T., Park, Ch., and Lewin, H.A., Polymorphism in BoLA-DRB3 exon 2 correlates with resistance to persistant lymphocytosis caused by bovine leukemia virus// J. Immunol. 1993. V.151.1. P. 6977 6985.
- Yankovsky N.K., Kapanadze B.I., Brodjansky V.M., Sulimova G.E. A chromosome 13 mapping project based on the Los Alamos cosmid library// 1994−95 DOE humane genome programm report.
- Zabarovsky E.R., Boldog F., Erlandsson R. et al. New strategy for mapping the human genome based on a novel procedure for construction of jumping libraries//Genomics. 1991. V.ll. P.1030−1039.
- Zabarovsky E., Klein G., Winberg G.//Gene. 1993. V.127. P.1−14.
- Zakharov I.A., Sulimova G.E., Udina I.G., Bannikova L.V. & Badagueva Yu.N. The study of the polymorphism of casein genes in some Russian cattle breeds and related species of Bovinae// Anim. Genet. 1996. V. 27. Suppl.2. P.26.
- Zoubak S., Clay O., Bernardi G. The gene distribution of the human genome//Gene. 1996. V.174. P.95−102.
- В заключение я приношу глубокую благодарность моим научным консультантам проф. И. А. Захарову и проф. Н. К. Янковскому за внимание к моей работе, научные консультации, обсуждение полученных результатов, в особенности в ходе написания работы.
- Я хочу также поблагодарить моих первых наставников на научном поприще: проф. Б. Ф. Ванюшина и д.б.н. А. Л. Мазина.
- Приношу мою искреннюю благодарность моей давней и постоянной помощнице ст. лаборанту Г. В. Костюниной.
- Благодарю за постоянную помощь и поддержку всех сотрудников лаборатории сравнительной генетики животных ИОГен РАН, и в особенности, к.б.н. И. Г. Удину .
- Благодарю также всех моих дорогих коллег: сотрудников, аспирантов, студентов, принимавших участие в выполнении этой многолетней работы.