Регуляция синтеза глутамилэндопептидазы Bacillus intermedius в стационарной фазе роста рекомбинантных штаммов Bacillus subtilis
Диссертация
Одним из условий выживания бактерий является способность быстро реагировать на внеи внутриклеточные сигналы, отражающие изменения в окружающей среде. Первичная реакция на стресс у микроорганизмов заключается в индукции синтеза группы новых белков, ответственных за общий и специфический клеточный ответ. Адаптация бактерий к меняющимся условиям1 существования включает в себя широкий круг явлений… Читать ещё >
Содержание
- Список сокращений
- ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
- 1. Механизмы регуляции биосинтеза внеклеточных ферментов у грамположительных бактерий
- 1. Общие положения
- 1. 1. РНК-полимераза
- 1. 2. Сигма факторы транскрипции
- 1. 3. Регуляция экспрессии генов B. subtilis на уровне транскрипции
- 2. Регуляция синтеза катаболических ферментов
- 3. Регуляция экспрессии генов бактерий в стационарной фазе роста
- 3. 1. Общие механизмы ответа бактериальных клеток на стресс
- 3. 2. Участие двухкомпонентных систем сигнальной трансдукции в клеточной дифференцировке
- 3. 3. Регуляция экспресии генов при спорообразовании
- 3. 3. 1. Механизмы инициации спорообразования
- 3. 3. 2. Факторы транскрипции и механизм дифференциальной экспрессии генов
- 3. 3. 3. Регуляция процесса прорастания спор
Список литературы
- Балабан Н.П. Щелочная внеклеточная протеиназа Bacillus intermedius. Выделение, очистка и некоторые свойства фермента / Н. П. Балабан, М. Р. Шарипова, A.M. Усманова, Е. А. Ицкович, И. Б. Лещинская // Биохимия. -1993. Т.58. — №. 12. — С. 1923−1928.
- Балабан Н.П. Секретируемая протеиназа спорообразующих бактерий Bacillus intermedius / Н. П. Балабан, М. Р. Шарипова, Е. А. Ицкович, И. Б. Лещинская, Г. Н. Руденская // Биохимия. 1994. — Т.59. — №. 9. — С. 10 331 037.
- Гловер Д.М. Клонирование ДНК. Методы: Пер. с англ./ Д. М. Гловер. — М.: Мир, 1988.- 538 с.
- Головлев Е.Л. Введение в биологию стационарной фазы бактерий: механизм общего ответа на стрессы / Е. Л. Головлев // Микробиология. 1999. -Т. 68.-№ 5.-С. 623−631.
- Гусев М.В. Микробиология. / М. В. Гусев, Л. А. Минеева. -М.: Изд. Московского университета, 1985. 376с.
- Демина Н.Н. Сенсорно-регуляторные системы бактерий / Н. Н. Демина, С. Г. Камзолова // Успехи современной биологии. 1992. — Т.26. — С. 13 381 349.
- Ерохина Л.И. Щелочные протеиназы рода Bacillus / Л. И. Ерохина, Е. О. Добржанская // Биосинтез микроорганизмами нуклеаз и протеаз. Под. ред. Имшнецкого А. А. М.: Мир, 1979. — С. 244 — 280.
- Иваница В.А. Влияние аминокислот как единственного источника азота на биосинтез экзопротеаз Aspergillus candidus / В. А. Иваница, Н. С. Егоров, М.А. Аль-Нури // Микробиология. 1978. — Т. 47. — № 3. — С. 424−429.
- Ицкович Е.Л. Биосинтез щелочной внеклеточной протеиназы Bacillus intermedius / Е. Л. Ицкович, Л. В. Знаменская, Н. П. Балабан, Т. А. Ершова, И. Б. Лещинская // Микробиология. 1995. — Т.64. — №.5. — С. 623−629.
- Колев Д.А. Репрессия синтеза у штамма 90−11-формы Bacillus mesentericus аминокислотами / Д. А. Колев // Микробиология. 1986. — Т. 55. — № 4. — С 295−300.1
- Костров С.В. Структурные детерминанты, существенные для функционирования и стабильности протеолитических ферментов: Автореферат дис.. д-ра хим. наук / С.В. Костров- Ин-т молекулярной генетики РАН. М., 2001.-44с.
- Льюин Б. Гены.: В 3 т. Т.2. М.: Мир, 1987. 544 с.
- Мосолова О.В. Glu, Asp-специфичная протеиназа актиномицетов / О. В. Мосолова, Г. Н. Руденская, В. М. Степанов, О. М. Ходова, И. А. Цаплина // Биохимия. 1987. — Т.52. — № 3. — С. 414−422.
- Нестерова Н.Г. Субстратная специфичность ферментов Bacillus mesentericus / Н. Г. Нестерова, Г. В. Чернесова, Н. Ф. Кириллова // Микробиология. 1989. — Т.58. — №.4. — С. 553−556.
- Новикова Т.М. Внеклеточная протеаза Bacillus alvei В-724 / Т. М. Новикова, С. Н. Выборных, Н. С. Егоров, Ж. К. Лория // Прикл. биохимия и микробиология. 1986. — Т., 22. — № 6. — С. 772−777.
- Павлова И.Н. Сериновая протеиназа с литическими свойствами / И. Н. Павлова, М. Г. Жолнер, И. Я. Захарова, Н. З. Тиньянова, Г. Г. Честухина, В. М. Степанов // Микробиология. 1988. — Т. 57. — №. 3. — С. 398−405.
- Прист Ф. Промышленные продукиы бацилл и их применение / Ф. Прист // Бациллы. Генетика и биотехнология. Под. ред. Харвуда К. М.: Мир, 1992.-С. 236−298.
- Руденская Г. Н. Новые подсемейства субтилизиров / Г. Н. Руденская // Биоорг. химия. 1994. — Т.20. — № 5. — С.475−484.
- Руденская Г. Н. Глутамилэндопептидазы микроорганизмов новое подсемейство химотрипсиновых протеиназ / Г. Н. Руденская // Биоорг. химия. -1998. — Т.24. — № 4. — С.256−261.
- Серкина А.В. Структура и функции предшественников бактериальных протеиназ / А. В. Серкина, А. Б. Шевелев, Г. Г. Честухина // Биоорг. химия. 2001. — Т. 27. — № 5. — С. 323−346.
- Хайдарова Н.В. Glu, Asp-специфичная протеиназа из Streptomyces thermovulgaris I Н. В. Хайдарова, Г. Н. Руденская, Л. П. Ревина, В. М. Степанов, Н. С. Егоров // Биохимия. -1989. Т.54. -№.1.-С. 4б-52.
- Хайдарова Н.В. Тиолзависимая сериновая протеиназа Streptomycesthermovulgaris / Н.В.'Хайдарова, Г. Н. Руденская, Л. П. Ревина, В.М. Степаtнов, Н. С. Егоров // Биохимия. 1990. — Т.55. — №.6. — С. 1110−1118.
- Цаплина И.А. Синтез нейтральных протеаз микроорганизмами / И.А. Цап-лина // Биосинтез микроорганизмами нуклеаз и протеаз. Под. ред. Имш-нецкого А.А. М.: Мир, 1979.- С. 197−244.
- Шарипова М.Р. Гидролазы Bacillus intermedins: выделение, свойства, локализация: Дис.. д-ра биол. наук / М.Р. Шарипова- Казанский государственный университет. Казань, 2000. — 224с.
- Шарипова М.Р. Локализация протеолитических ферментов в клетках Bacillus intermedins / М. Р. Шарипова, Е. В. Шакиров, Н. П. Балабан, JI.A. Габ-драхманова, М. А. Шилова, Г. Н. Руденская, И. Б. Лещинская // Микробиология. 2000. — Т. 69. — № 5. — С. 660−667.
- Шарипова М.Р. Гидролитические ферменты и спорообразование у Bacillus intermedins / М. Р. Шарипова, Н. П. Балабан, Л. А. Габдрахманова, М. А. Шилова, Ю. М. Кадырова, Г. Н. Руденская, И. Б. Лещинская // Микробиология. 2002. — Т.71. — № 4. — С. 494−499.
- Alba В.М. DegS and YaeL participate sequentially in the cleavage of RseA to activate the sigma (E)-dependent extracytoplasmic stress response / B.M. Alba, J.A. Leeds, C. Onufiyk, C.Z. Lu, C.A. Gross // Genes Dev. 2002. — V. 16. -№ 16.-P. 2156−2168.
- Banerjee A. Induction of secretory acid proteinase in Candida albigans / A. Banerjee, K. Ganesan, A. Datta // J. Gen. Microbiol. 1991. — V. 137. — P. 24 552 461.
- Barlass P.J. Germination of Bacillus cereus spores in response to L-alanine and to inosine: the roles of gerL and gerQ operons / P.J. Barlass, C.W. Houston, M.O. Clements, A. Moir // Microbiology. 2002. — V.148. — P. 2089−2095.
- Behravan J. Mutations in the gerP locus of Bacillus subtilis and Bacillus cereus affect the access of germinants to their target in the spore / J. Behravan, H. Chi-rakkal, A. Masson, A. Moir//J. Bacteriol. 2000. — V. 182. — P. 1987−1994.•
- Bruckner R. Carbon catabolite repression in bacteria: choice of the carbon source and autoregulatory limitation of sugar utilization / R. Bruckner, F. Tit-gemeyer // FEMS Microbiol. Lett. 2002. — V. 209. — P. 141−148.
- Burbulys D. The initiation of sporulation in Bacillus subtilis is controlled by a multicomponent phosphorelay / D. Burbulys, K.A. Trach, J.A. Hoch // Cell. -1991.-V.64.-P. 545−552.
- Carmona C. Nucleotide sequence of the serine protease of St. aureus strain V8 /
- C. Carmona, G.L. Cray //Nucl. Acid. Res. 1987. — V. 15. — № 6. — P. 6757.
- Cazemier A.E. Effect of sporulation and recovery medium on the heat resistance and amount of injury of spores from spoilage bacilli / A.E. Cazemier, S.F. Wagenaars, P.F. ter Steeg // J. Appl. Microbiol. 2001. — V.90. — № 5. -P.761−770.
- Clements M.O. Role of the gerl operon of Bacillus cereus 569 in the response of spores to germinants / M.O. Clements, A. Moir // J. Bacteriol. 1998. -V.180. — № 24. — P. 6729−6735i
- Coleman G. A model for the regulation of bacterial extracellular enzyme and toxin biosynthesis / G. Coleman, S. Brown, D.A. Stormonth // J. Theor. Biol. -1975. V.52. — № 1. — P.143−148.
- Corfe B.M. The gerB region of the Bacillus subtilis 168 chromosome encodes a homologue of the gerA spore germination operon / B.M. Corfe, R.L. Sammons,
- D.A. Smith, C. Mauel // Microbiology. 1994. — V.140. — P. 471−478.
- Cutting S. The nucleotide sequence and the transcription during sporulation of I the gerE gene of Bacillus subtilis / S. Cutting, J. Mandelstam // J. Gen. Microbiol. 1986. — V. 132. — P. 3013−3024.
- Dartois V. Characterization of a novel member of the DegS-DegU regulon affected by salt stress in Bacillus subtilis / V. Dartois, M. Debarbouille, F. Kunst, G. Rapoport // J. Bacteriol. 1998. — V. 180. — № 7. — P. 1855−1861.
- Demidyuk I.V. Modification of substrate-binding site of glutamyl endopepti-dase from Bacillus intermedius / I.V. Demidyuk, D.V. Romanova, E.A. Nosovskaya, G.G. Chestukhina, I.P. Kuranova, S.V. Kostrov // Prot. Eng. — 2004. -in press.
- Drapeau G.R. Purification and properties of an extracellular protease of Staphylococcus aureus / G.R. Drapeau, Y. Boily, J.J. Houmard // J. Biol. Chem. -1972. -V.247. № 20.-P.6720−6726.
- Dubnau D. Genetic competence in Bacillus subtilis / D. Dubnau // Microbiol. Rev. 1991. — V. 55. — № 3. — P. 395−424.
- Eder S. A Bacillus subtilis secreted phosphodiesterase/alkaline phosphatase is the product of a Pho regulon gene, phoD / S. Eder, L. Shi, K. Jensen, K. Ya-mane, F.M. Hulett//Microbiology. 1996. — V. 142. — P. 2041−2047.
- Engelmann S. Impaired oxidative stress resistance of Bacillus subtilis sigB mutants and the role of katA and katE / S. Engelmann, M. Hecker // FEMS Microbiol. Lett. 1996. — V. 145. — P. 63−69.
- Errington J. Bacillus subtilis: regulation of gene expression and control of morphogenesis / J. Errington // Microboil. Rev. 1993. — V. 57. — № 1. — P. 1−33.
- Errington J. Establishment of cell-specific transcription during sporulation in Bacillus subtilis / J. Errington, N. Illing // Mol. Microbiol. 1993. — V.6. — № 6. -P. 689−695.
- Eymann C. Induction of sigma (B)-dependent general stress genes by amino acid starvation in a spoOH mutant of Bacillus subtilis / C. Eymann, M. Hecker // FEMS Microbiol. Lett. 2001. — V. 199. — № 2. — P.221−227.
- Fabret C. Two-component signal transduction in Bacillus subtilis: how one organism sees its world / C. Fabret, V.A. Feher, J.A. Hoch // J. Bacteriol. 1999. — V.181. -P.1975−1983.
- Feavers I.M. The nucleotide sequence of a spore germination gene (gerA) of Bacillus subtilis 168 / I.M. Feavers, J.S. Miles, A. Moir // Gene. 1985. -V.38. -P. 95−102.
- Feavers I.M. The regulation of transcription of the gerA spore germination op-eron of Bacillus subtilis / I.M. Feavers, J. Foulkes, B. Setlow, D. Sun, W. Nich
- Nicholson, P. Setlow, A. Moir // Mol. Microbiol. 1990. — V. 4. — № 2. — P. 275−282.
- Ferrari E. Trancription of Bacillus subtilis subtilisin and expression of subtil-isin in sporulation mutants / E. Ferrari, D. Henner, M. Perego, J.A. Hoch // J. Bacterid. 1988.- V. 170. -P.289−295.
- Gabdrakhmanova L.A. Biosynthesis and localization of glutamylendopeptidase from Bacillus intermedius3−9 / L.A. Gabdrakhmanova, E.V. Shakirov, N.P. Balaban, M.R. Sharipova, G.N. Rudenskaya, I.B. Leshchinskaya // Microbios. -1999. V.100. -P.97−108.
- Georgiou G. Optimizing the production of recombinant proteins in microorganisms / G. Georgiou // AICHE J. 1988. — V.34. — P. 1233−1248.
- Guidi-Rontani C. Identification and characterization of a germination operon on the virulence plasmid pXOl of Bacillus anthracis / C. Guidi-Rontani, Y. Pereira, S. Ruffle, J-C. Sirard, M. Weber-Levy, M. Mock // Mol. Microbiol. -1999.-V. 33.-P. 407−414.
- Haldenwang W.G. The sigma factors of Bacillus subtilis / W.G. Haldenwang // Microb. Rev. 1995. — V.59. — № 1. — P. l-30.
- Hamoen L.W. The Bacillus subtilis transition state regulator AbrB binds to the -35 promoter region of comK / L.W. Hamoen, D. Kausche, M.A. Marahiel, D. van Sinderen, G. Venema, P. Serror //FEMS Microbiol. Lett. 2003. — V.218. -№ 2. — P. 299−304.
- Hartley B.S. Proteolytic enzymes / B.S. Hartley // Ann. Rev. Biochem. 1960. -V.29. — P. 45−72.
- Hecker M. General stress response of Bacillus subtilis and other bacteria / M. Hecker, U. Volker // Adv. Microb. Physiol. 2001. — V. 44. — P. 35−91.
- Helmann J.D. Compilation and analysis of Bacillus subtilis сгА-dependent promoter sequences: evidence for extended contact between RNA polymerase and upstream promoter DNA / J.D. Helmann // Nucleic Acids Res. 1995. — V.23. -P. 2351−2360.
- Helmann J.D. Alternate sigma factors and the regulation of flagellar gene expression / J.D. Helmann // Mol. Microbiol. 1991. — V.5. — P. 2875−2882.
- Helmann J.D. Homologous metalloregulatory proteins from both Gram-positive and Gram-negative bacteria control transcription of mercury resistance operons / J.D. Helmann, Y. Wang, I. Mahler, C.T. Walsh // J. Bacteriol. 1989. — V.171.-№l.-P. 222−229.
- Henkin T.M. The role of CcpA transcriptional regulator in carbon metabolism in Bacillus subtilis / T.M. Henkin // FEMS Microbiol. Lett. 1996. — V. 135. — P. 9−15.
- Henner DJ. Location of targets of the hpr-91, sacU32 (Ну), and sacQ36 (Ну) mutations in upstream region of the subtilisin promoter / D.J. Henner, E. Ferrari, M. Perego, J.A. Hoch // J. Bacteriol. 1988. — V. 170. — № 1. — P. 296−300.
- Hoch J.A. Keeping signals straight in phosphorelay signal transduction / J.A. Hoch, K.I. Varughese // J. Bacteriol. 2001. — V. 183. — № 17. — P.4941−4949.
- Horsburgh M.J. Transcriptional responses during outgrowth of Bacillus subtilis endospores / M.J. Horsburgh, P.D. Thackray, A. Moir // Microbiology. 2001. -V.147.-P. 2933−2941.
- Huang X. The Bacillus subtilis sigma (X) protein is an extracytoplasmatic function sigma factor contributing to survival at high temperature / X. Huang, A. Decatur, A. Sorokin, J.D. Helmann // J. Bacteriol. 1997. — V.179. — P.2915−2921.
- Hudson K.D. Localization of GerAA and GerAC germination proteins in the Bacillus subtilis spore / K.D. Hudson, B.M. Corfe, E.H. Kemp, I.M. Feavers, P.J. Coote, A. Moir// J. Bacteriol. 2001. — V.183. — № 14. — P. 4317−4322.
- Hullet F.M. Sequential action of two-component genetic switches regulates the PHO regulon in Bacillus subtilis / F.M. Hulett, J. Lee, L. Shi, G. Sun, R. Ches-nut, E. Sharkova, M.F. Duggan, N. Kapp // J. Bacteriol. 1994. — V. 176. — № 5. -P.1348−1358.
- Irie R. A germination mutant of Bacillus subtilis deficient in response to glucose / R. Irie, T. Okamoto, Y. Fujita. // J. Gen. Appl. Microbiol. 1982. -V.28.-P. 345−354.
- Jacob F. Genetic regulatory mechanisms in the synthesis of protein / F. Jacob, J. Monod // J. Mol. Biol. 1961. — V.3. — P. 318−356.
- Jenkinson H.F. Protease deficiency and its association with defects in spore coat structure, germination and resistance properties in a mutant of Bacillus subtilis / H.F. Jenkinson, H. Lord // J. Gen. Microbiol. 1983. — V.129. — P. 2727−2737.
- Jin S. Bacillus subtilis genes that code for enzymes involved in acetyl-CoA metabolism. / S. Jin, A.L. Sonenshein // Presented at the Int. Conf. on Bacilli, 6th, Stanford, Caif. 1991.
- Jonas R.M. The Bacillus subtilis spoIIG operon encodes both oE and gene necessary for oE activation / R.M. Jonas, E.A. Weaver, TJ. Kenney, C.P. Jr. Moran, W.G. Haldenwang //J. Bacteriol. 1988. — V.170. — P.507−511.
- Klier A. Distinct control sites located upstream from the levansucrase gene of Bacillus subtilis / A. Klier, A. Fouet, M. Debarbouille, F. Kunst, G. Rapoport // Mol. Microbiol. 1987. — V.l. — № 2. — P. 233−241.
- Klier A. Positive regulation in the gram-positive bacterium: Bacillus subtilis / A. Klier, T. Msadek, G. Rapoport // Ann. Rev. Microbiol. 1992. — V.46. — P. 429−459.
- Laemmli H.K. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4 / H.K. Laemmli // Nature. 1970. — V.227. — P. 680−685.
- Lenski R.E. Stability of recombinant DNA and its effects on fitness / R.E. Lenski, T.T. Nguen // Trends Biotechnol. Ecol. Evol. 1988. — V.6. — P.51−53.
- Lepesant Y.A. Chromosomal location of mutations affecting sucrose metabolism in Bacillus subtilis / Y.A. Lepesant, F. Kunst, J. Lepesant-Kejzlarova, R. Dedonder// Mol. Gen. Genet. 1972. — V. l 18. -№ 2. — P. 135−160.
- Lonetto M. The ст’и family: sequence conservation and evolutionary relationships /M. Lonetto, M. Gribskov, C.A. Gross // J. Bacteriol. 1992. — V. l74. -P. 3833−3849.
- Losick R. Cascades of sigma factors / R. Losick, J. Pero // Cell. 1981. -V.25. — P. 582−584.
- Losick R. Crisscross regulation of cell-type-specific gene expression during development in Bacillus subtilis / R. Losick, P. Stragier // Nature. 1992. -V.355. — P.601−604.
- Martin J. Identification of a new locus, sacV, involved in the regulation of le-vansucrase synthesis in Bacillus subtilis / J. Martin, M. Debarbouille, A. Klier // FEMS Microbiol. Lett. 1987. — V.44. — P. 39−43.
- Masaki T. Purification and some properties of Achromobacter protease la from Achromobacter lyticus M497−1 / T. Masaki, H. Suzuki, M. Soejima // Agric. Biol. Chem. 1986. — V.50. — № 12. — P.3087−3091.
- Missiakas D. The extracytoplasmatic function sigma factors: role and regulation / D. Missiakas, S. Raina // Mol. Microbiol. 1998. — V.28. — №.6. -P.1059−1066.
- Moir A. Germination properties of a spore coat-defective mutant of Bacillus subtilis / A. Moir // J. Bacteriol. 1981. — V. 146. — №.3. — P. 1106−1116.
- Moir A. The genetics of bacterial spore germination / A. Moir, D. A. Smith // Annu. Rev. Microbiol. 1990. — V.44. — P. 531−553.
- Moir A. Spore germination. / A. Moir // Biology of Bacilli, R. H. Doi, M. McGloughlin (ed.). London: Butterworth-Heinemann, 1992. — P. 23−38.
- Moir A. Spore germination. / A. Moir, B.M. Corfe, J. Behravan // Cell. Mol. Life. Sci. 2002. — V. 59. — № 3. — P. 403−409.
- Moravcolova J. Repression of the synthesis of exocellular and intracellular proteinases in Bacillus megaterium / J. Moravcolova, J. Chaloupka // Folia Microbiol. 1984. — V.29. — P. 273−281.
- Msadek T. Signal transduction pathway controlling synthesis of a class of de-gradative enzymes in Bacillus subtilis: expression of the regulatory genes and analysis of mutations in degS and degU / T. Msadek, F. Kunst, D. Henner, A.
- Klier, G. Rapoport, R. Dedonder // J. Bacteriol. 1990. — V.172. — № 2. — P. 824−834.
- Nienaber V.L. A glutamic acid specific serine protease utilizes a novel his-tidine triad in substrate binding / V.L. Nienaber, K. Breddam, J.J. Birktoft // Biochemistry. 1993. -V.32. — № 43. — P. l 1469−11 475.
- Ohara-Nemoto Y. Characterization and molecular cloning of a glutamyl endopeptidase from Staphylococcus epidermidis / Y. Ohara-Nemoto, Y. Ikeda, M. Kobayashi, M. Sasaki, S. Tajika, S. Kimura // Microb. Pathog. 2002. -V.33. -№ 1.-P. 33−41.
- Paidhungat M. Localization of a germinant receptor protein (GerBA) to the inner membrane of Bacillus subtilis spores / M. Paidhungat, P. Setlow // J. Bacteriol. 2001. — V. 183. — P. 3982−3990.р
- Partridge S. The role of a in prespore-speciflc transcription in Bacillus subtilis / S. Partridge, D. Foulder, J. Errington // Mol. Microbiol. 1991. — V. 5. -P. 757−767.
- Perego M. Pentapeptide regulation of aspartylphospate phosphatases / M. Perego, J.A. Brannigan // Peptides. 2001. — V.22. — P. 1541−1547.
- Postma P.W. Phosphoenolpyruvate: carbohydrate phosphotransferase systems of bacteria / P.W. Postma, J.W. Lengeler, G.R. Jacobson // Microbiol. Rev. -1993.-V. 6.-P. 543−594.
- Power S. Secretion and autoproteolytic maturation of subtilisin / S. Power,
- R.M. Adams, J.A. Wells // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1986. — V.83. — № 5.7 •"1. P.3096−3100.
- Pragai Z. Regulatory interactions between the Pho and sigma (B)-dependent general stress regulons of Bacillus subtilis / Z. Pragai, C.R. Harwood // Microbiology. 2002.- V. 148.-P. 1593−1602.
- Predich M. Bacillus subtilis early sporulation genes kin A, spoF, and spoOA are transcribed by the RNA polymerase containing aH / M. Predich, G. Nair, I. Smith // J. Bacteriol. 1992. — V. 174. — P. 2771−2778.
- Priest F.G. Extracellular enzyme synthesis in the genus Bacilli / F.G. Priest // Bacteriol. Rev. 1977. — V. 41. — P. 711−753.
- Qi Y. The pst operon of Bacillus subtilis has a phosphate-regulated promoter and is involved in phosphate transport but not in regulation of the pho regulon / Y. Qi, Y. Kobayashi, F.M. Hulett // J. Bacteriol. 1997. — V. 179. — № 8. — P. 2534−2539.
- Qian Q. AbrB is a regulator of the sigma (W) regulon in Bacillus subtilis / Q. Qian, C.Y. Lee, J.D. Helmann, M.A. Strauch // FEMS Microbiol. Lett. 2002. — V. 211.- № 2. -P.219−223.
- Rather P.N. Negative regulator of oG-controlled gene expression in stationary-phase Bacillus subtilis / P.N. Rather, R. Coppolecchia, H. DeGrazia, C.P.Jr. Moran // J. Bacteriol. 1990. — V. 172. — P. 709−715.
- Record M.D. Escherichia coli RNA polymerase (Ест), promoters, and thetkinetics of the steps of transcription initiation / M.D. Record, W.S. Reznikoff, V
- M.L. Craig // Escherichia coli and Salmonella Cellular and Molecular Biology. 1996.-P. 792−820.
- Rufo G.A. Jr. Isolation and characterization of a novel extracellular metallo-^ protease from Bacillus subtilis / G.A. Jr. Rufo, B.J. Sullivan, A. Sloma, J.
- Pero // J. Bacteriol. 1990. — V.172. — № 2. — P. 1019−1023.
- Sambrook J. Molecular cloning: a laboratory manual / J. Sambrook, E.F. Fritsch, T. Maniatis. 2nd ed. NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989.
- Sampath P. Physiological and nutritional factor affecting biosyntesis of extracellular protease by Streptomyces sp. G-157 / P. Sampath, J. Chandrakasan //Microbiol. Rev. 1998. — V. 21. — № 1. — P. 55−63.
- Seto-Young D.L. Studies on calcium transport during growth and sporulation * / D.L. Seto-Young, D.J. Ellar// Microbios. 1981. — V.30. — P. 191−208.
- Shafikhani S.H. ScoC mediates catabolite repression of sporulation in
- Bacillus subtilis / S.H. Shafikhani, E. Nunez, T. Leighton // Curr. Microbiol. 2003. — V. 47. — P. 327−336.
- Simonen M. Protein secretion in Bacillus species / M. Simonen, I. Palva // Micribiol. Rev. 1993. — V. 57. — P. 109−137.
- Slynn G.M. Molecular genetical and phenotypical analysis of the gerM spore germination gene of Bacillus Bacillus subtilis 168 / G.M. Slynn, R.L. Sammons, D.A. Smith, A. Moir, B.M. Corfe // FEMS Microbiol. Lett. 1994.-V. 121. P. 315−320.
- Smith I. The role of negative control in sporulation / I. Smith, I. Mandic-Mulec, N. Gaur // Res. Microbiol. 1991. — V. 142.-P. 831−839.
- Stennicke H.R. Characterization of the SI binding site of the glutamic acid-specific protease from Streptomyces griseus / H.R. Stennicke, J.J. Birktoft, K. Breddam // Protein Sci. 1996. — V.5. — № 11. — P. 2266−2275.
- Stepanov V.M. A serine protease of an archaebacterium Halobacterium mediteerranei / V.M. Stepanov, G.N. Rudenskaya, L.A. Revina, Y.B. Gryaznova, E.N. lysogorskaya, I.Yu. Filippova, I.I. Ivanova // J. Biochem. -1992. V.285. — P.284−286.
- Stragier P. Chromosomal rearrangement generating a composite gene for a developmental transcription factor / P. Stragier, B. Kunkel, L. Kroos, R.1.sick// Science. 1989. — V. 243. — P. 507−512.
- Stragier P. Cascades of sigma factors revisited / P. Stragier, R. Losick // Mol. Microbiol. 1990. — V. 4. — P. 1804−1806.
- Strauch M.A. The SpoOA protein of Bacillus subtilis is a repressor of the abrB gene / M. A. Strauch, V. Webb, G. Spiegelman, J. A. Hoch // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1990. — V.85. — № 5.-P. 1801−1805.
- Strauch M.A. SpoOA activates and represses its own synthesis by binding at its dual promoters / M.A. Strauch, K. Trach, J. Day, J. A. Hoch // Biochimie. -1992.-V. 174.-P. 619−626.I
- Strauch M.A. AbrB modulates expression and catabolite repression of a Bacillus subtilis ribose transport operon / M.A. Strauch // J. Bacteriol. -1995a. V. 177. — P. 6727−6731.
- Stulke J. Carbon catabolite repression in bacteria / J. Stulke, W. Hillen // Curr. Opin. Microbiol. 1999. — V. 2. — P. 195−201.
- Stulke J. Regulation of carbon catabolism in Bacillus species / J. Stulke, W. Hillen // Annu. Rev. Microbiol. 2000. — V. 54. — P. 849−880.
- Sun D. Identification of a new sigma-factor involved in a compartmentalized gene expression during sporulation of a Bacillus subtilis / D. Sun, P. Stragier, P. Setlow // Genes Dev. 1989. — V. 3. — P. 141−149.
- Svensden I. The primary structure of the glutamic acid-specific protease of Streptomyces griseus / I. Svensden, M.R. Jensen, K. Breddam // FEBS Lett. -1991. V.292. — P. 105−167.
- Svensden I. Isolftion and aminoacid sequence of a glutamic acid specific endopeptidase from Bacillus licheniformis /1. Svensden, K. Breddam // Eur.J. Biochem. 1992. — V204. — P. 165−171.
- Takagi M. Nucleotide sequence and cloning in Bacillus subtilis of thet
- Bacillus stearothermophilus pleiotropic regulatory gene degT / M. Takagi, H. Takada, T. Imanaka // J. Bacteriol.'- 1990. V. 173. — P. 411−418.
- Tanaka T. PrtR enhances the mRNA level of the Bacillus subtilis extracellular proteases / T. Tanaka, M. Kawata, J. Nagami, H. Uchivama // J. Bacteriol. -1987. V.169. — № 7., — P. 3044−3050.
- Thackray P.D. GerN, an antiporter homologue important in the germination of Bacillus cereus endospores / P.D. Thackray, J. Behravan, T. W. South-worth, A. Moir // J. Bacteriol. 2001. — V. 183. — P. 476−482.
- Thomason P. Eukaryotic signal transduction via histidine- aspartate phos-phorelay / P. Thomason, R. Kay // J. Cell Sci. 2000. — V. 113. — P. 31 413 150.
- Trach K.A. Multisensory activation of the phosphorelay initiating sporulation in Bacillus subtilis: identification and sequence of the protein kinase of the alternative pathway / K.A. Trach, J.A. Hoch // Mol. Microbiol. 1993. — V.8. -P.67−79.Щ
- Varon D. Bacillus subtilis operon under the dual control of the general stress transcription factor sigma В and the sporulation transcription factor sigma H / D. Varon, M.S. Brody, C.W. Price // Mol. Microbiol. 1996. — V. 20. — № 2. -P. 339−350.
- Bacillus cereus. i R.J. Warburg, M.R. Davis, I. Mahler, DJ. Tripper, H.O. Halvorson // Molecular Biology of Microbial Differentiation. J.A.Hoch and P. Setlow (ed.). Washington, D. C. American Society for Microbiology, -1985.- -P. 67−70.
- Weicket M.J. Site-directed mutagenesis of a catabolite repression operator sequense in Bacillus^ subtilis / MJ. Weicket, G.H. Chambliss // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1990. — V. 78. — P. 6238−6242.
- Weiner M.A. Macrophage-mediated germination of Bacillus anthracis en* dospores requires the gerH operon / M.A. Weiner, P.C. Hanna // Infect Immun. 2003. — V.71. — № 7. — P. 3954−3959.
- Weir J. Regulation of SpoOH, a gene coding for the Bacillus subtilisaH factor
- J. Weir, M. Predich, E. Dubnau, G. Nair, I. Smith // J. Bacteriol. 1991. -V.l73. — P.521−529.
- Wells J.A. Cloning, sequensing and secretion of Bacillus amyloliquefaciens subtilisin in Bacillus subtilis / J.A. Wells, E. Ferrari, G.J. Henner, D.A. Estell, E.Y. Chen// Nucl. Acids. Res. 1983. — V. l 1. — P. 7911−7925.
- Wiegert T. Alkaline shock induces the Bacillus subtilis sigma (W) regulon / T. Wiegert, G. Homuth, S. Versteeg, W. Schumann // Mol. Microbiol. 2001.- V.41.-№l.-P. 59−71.
- Wosten M.M. Eubacterial sigma-factors / M.M. Wosten // FEMS Microbiol. Rew. 1998. — V. 22. — P. 127−150.
- Yazdi M.A. Characterization and cloning of the gerC locus of Bacillus subtilis 168 / M.A. Yazdi, A. Moir // J. Gen. Microbiol. 1990 — V. l36. — P. 1335−1342.
- Yokoi K. Genetic and biochemical characterization of glutamyl endopeptidase of Staphylococcus warneri M / K. Yokoi, M. Kakikawa, H. Kimoto, K. Watanabe, H. Yasukawa, A. Yamakawa, A. Taketo, K.I. Kodaira
- Gene. 2001.- V. 281.- P. l 15−122.>
- York K. SpoOA controls the aA- dependent activation of Bacillus subtilis sporulation specific transcription unit spoIIE / K. York, T. J. Kenney, S. Satola, C. P. Moran, H. Poth, P. Youngman // J. Bacteriol. — 1992. — V. 174. -P. 2648−2658.
- Zheng L. Cascade regulation of spore coat gene expression in Bacillus subtilis / L. Zheng, R. Losick // J. Mol. Biol. 1990. — V. 212. — P. 645−660.
- Zuberi A.R. The nucleotide sequence and gene organization of the gerA spore germination operon of Bacillus subtilis 168 / A.R. Zuberi, A. Moir, I.M. Feavers // Gene. 1987. — V. 51. — № 1. — P. 1−11.