Помощь в учёбе, очень быстро...
Работаем вместе до победы

Изучение механизмов АНТИ-ВИЧ активности производных высших тритерпенов и хинонов

ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

ВИЧ это сравнительно небольшой, достаточно просто устроенный вирус с уникальной системой репродукции. Данный вирус имеет три фермента, необходимых ему для успешной репликации — обратную транскриптазу, интегразу и протеазу. Обратная транскриптаза осуществляет синтез двухцепочечной ДНК с вирусной РНК, интеграза встраивает ДНК провируса в геном клетки-хозяина, а протеаза нарезает предшественников… Читать ещё >

Содержание

  • Список сокращений
  • 1. Обзор литературы 10 1.1. Вирус иммунодефицита человека
    • 1. 1. 1. Краткое описание генома ВИЧ
    • 1. 1. 2. Обратная транскриптаза ВИЧ-1 16 1.1.3 .Схема обратной транскрипции 18 1.2 Анти-ВИЧ терапия
    • 1. 2. 1. Блокирование стадии адсорбции
    • 1. 2. 2. Ингибиторы обратной транскрипции 23 Аналоги субстратов 23 Ненуклеозидные ингибиторы ОТ 25 Связывание ненуклеозидных ингибиторов с обратной транскриптазой ВИЧ
    • 1. 2. 3. Ингибиторы других этапов жизненного цикла ВИЧ-1 31 1.3. Глицирризиновая кислота
  • Противовирусная активность глицирризиновой кислоты
    • 2. Материалы и методы
    • 2. 1. Реактивы, используемые в работе
    • 2. 2. Буферные растворы
    • 2. 3. Трансформация клеток E.C.ol
    • 2. 4. Выделение обратной транскриптазы
    • 2. 5. ПААГ SDS-электрофорез
    • 2. 6. Определение скорости реакции, катализируемой ОТ
    • 2. 7. Определение кинетических параметров реакции
    • 2. 8. Исследование противовирусной активности соединений
    • 2. 9. Фаговый дисплей
  • 3. Результаты и обсуждение
    • 3. 1. Характеристика использовавшихся в работе вариантов обратных транскриптаз
    • 3. 2. Исследование ингибирующей активности ГК и ее производных в отношении ОТ ВИЧ
  • Активность производных ГК на культуре клеток 57 Совместное ингибирование обратной транскриптазы ВИЧпента-О-никотинатом ГК и АЗТ
  • Совместное действие пента-О-никотината ГК и невиралина
  • Совместное ингибирование ГК и азидотимидином 65 Совместное действие АЗТ и пента-О-никотината ГК в культуре инфицированных клеток
    • 3. 3. Исследование ингибирующей активности бетулина и его производных 70 Активность производных бетулина в культуре клеток
    • 3. 4. Исследование ингибирующей активности антра- и нафтохинонов 73 Противовирусная активность производных хинонов

    3.5.Поиск сайтов связывания глицирризиновой кислоты методом фагового дисплея 79 Характеристика отобранных фаговых клонов 80 Поиск гомологии отобранных пептидов с белками вирусов человека 82 Гомология отобранных пептидов с белками ВИЧ 84 Поиск гомологии отобранных пептидов с белками человека

Изучение механизмов АНТИ-ВИЧ активности производных высших тритерпенов и хинонов (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Вирус иммунодефицита человека (ВИЧ) — сегодня наиболее известный представитель семейства Ретровирусов. Действительно, синдром приобретенного иммунодефицита или СПИД — болезнь, вызываемая ВИЧ, за последние десятилетия широко распространился по всей планете. По последним данным, за 20 лет, прошедшие с момента открытия вируса, в мире умерло 24 миллиона человек, то есть население Бельгии и Голландии вместе взятых. Всего за это время заразилось «чумой XX века» 40 миллионов человек, и пока эпидемия не выказывает никаких признаков затухания. В России она распространяется со стремительной скоростью. По данным 2002 г. число ВИЧ-инфицированных уже превысило 200 тысяч (и это только официальная статистика, которая отличается от действительной как минимум в 5−10 раз). Если ВИЧ будет распространяться с той же скоростью, то более 5 миллионов россиян станут ВИЧ-положительными к 2007 году (по данным www.aids.ru).

ВИЧ это сравнительно небольшой, достаточно просто устроенный вирус с уникальной системой репродукции. Данный вирус имеет три фермента, необходимых ему для успешной репликации — обратную транскриптазу, интегразу и протеазу. Обратная транскриптаза осуществляет синтез двухцепочечной ДНК с вирусной РНК, интеграза встраивает ДНК провируса в геном клетки-хозяина, а протеаза нарезает предшественников вирусных белков на относительно короткие полипептидные цепи, способствуя образованию новых вирионов (Katz R.A., Skalka A.M., 1994; Freed E., 2001).

Реакция синтеза ДНК с матрицы РНК является специфической особенностью представителей семейства Ретровирусов. Поэтому обратная транскриптаза — фермент, осуществляющий этот процесс, привлекает внимание со стороны ученых, как наиболее перспективная мишень действия противовирусных препаратов.

В первую очередь в качестве ингибиторов обратной транскриптазы были использованы аналоги нуклеозидов (2'-дезоксинуклеозид-5'-трифосфаты (dNTP). Первым из нуклеозидных ингибиторов обратной транскриптазы, принесшим реальный успех в лечении и профилактике ВИЧ-инфекции, был 3'-азидо-2', 3'-дидезокситимидин (азидотимидин, АЗТ). Этот нуклеозид является производным пиримидинового нуклеозида тимидина, в положении З'-гетероцикла молекулы которого находится азидная (N3) группа (Островский, 1999).

Однако вскоре стали понятны недостатки длительного применения азидотимидина. Во-первых, уже через несколько месяцев лечения появляются варианты вируса, обладающие устойчивостью к действию препарата и лечебный эффект АЗТ исчезает (аминокислотные замены, вызывающие устойчивость к АЗТ впервые описаны Larder et al, 1989) — во-вторых, это ряд сильных побочных действий препарата, заключающихся в подавлении функций многих органов. Были разработаны другие соединения, аналоги нуклеозидов — 2', 3'-дидезоксицитидин (ddC), 2', 3'-дидезоксиинозин (ddl), 2', 3'-дидезокси-2', 3'-дидегидротимидин (d4T) и 2', 3'-дидезокси-3'-тиоцитидин (ЗТС) и некоторые другие. В настоящее время для лечения ВИЧ-инфекции практически нигде не применяется монотерапия (лечение одним препаратом), т.к. использование двух или более соединений значительно снижает вероятность появления мутаций и не требует таких высоких концентраций препаратов (Johnson, 1996). Наиболее надежным является использование сочетания соединений нуклеозидной и ненуклеозидной природы. Если аналоги нуклеозидов блокируют синтез ДНК, встраиваясь в растущую цепь, то вещества ненуклеозидного происхождения связываются непосредственно с обратной транскриптазой, меняя ее конформацию таким образом, что дальнейшая ее активность становится невозможной (Litvak S., 1996). Препараты из группы ненуклеозидных ингибиторов обратной транскриптазы ВИЧ-1 обладают рядом преимуществ — более низкой токсичностью, более высоким сродством к ферменту, а в сочетании с аналогами нуклеозидов значительно повышают активность последних (De Clercq, 1999).

Таким образом, поиск новых ингибиторов репликации ВИЧ-1 остается актуальным в настоящее время. Для того, чтобы использовать их с наибольшей эффективностью, необходимо изучить механизмы взаимодействия новых соединений с обратной транскриптазой ВИЧ-1. Особенный интерес вызывают те соединения, о биологической активности которых уже есть данные.

Давно известно, что глицирризиновая кислота (ГК), активный компонент корня солодки (Gyicyrrhiza sps.) подавляет репликацию ВИЧ в культуре клеток (Ito et al, 1988). Позднее было показано, что глицирризиновая кислота (ГК) более активна на ранних стадиях инфекции (Плясунова О.А. и др., 1992). Кроме того, данные о противовирусной активности глицирризиновой кислоты и в отношении других вирусовгепатита В и С, Марбург, Герпесвирусов и по последним данным, Коронавирусов (ТОРС вирус, или SARS). Это соединение обладает и другими биологическими активностями — противоопухолевой, противовоспалительной, антиаллергической и т. д. (Толстиков Г. А. и др. 1997).

Однако, несмотря на большое количество данных о противовирусной активности ГК и ее производных, на настоящий момент очень мало известно о механизмах ее действия в клетке. Есть сообщения об ингибировании ГК различных киназ, в частности, казеин киназы 2 (участвует в фосфорилировании обратной транскриптазы ВИЧ-1, тем самым повышая ее активность (Harada S. et al, 1998)) и протеин киназы С, которая фосфорилирует рецептор CD4 на поверхности Т-лимфоцитов, необходимый для связывания вируса с клеткой (Kazuhiro Н. et al, 1991). С другой стороны, из литературных данных известно, что некоторые природные тритерпены, выделенные из растений Shizandra sphaerandra, Maprounea africana и других, могут служить ингибиторами обратной транскриптазы (ОТ) ВИЧ-1 (Matthee G. et al 1999; Vlietinick A., 1998).

Целью настоящей работы являлось изучение молекулярных механизмов анти-ВИЧ активности глицирризиновой кислоты и ее производных, в том числе способность этих соединений ингибировать рекомбинантную ОТ ВИЧ-1. Также нашей целью являлось исследование ингибирующей активности в отношении ОТ ВИЧ-1 ряда производных бетулина, другого природного тритерпена, и новых синтетических производных хинонов. Для определения возможных мишеней действия ГК в клетке была использована технология фагового дисплея.

Таким образом, перед настоящим исследованием стояли следующие задачи:

1) проверить ингибирующую активность ГК и ее производных в отношении рекомбинантной ОТ ВИЧ-1 и ее мутантных форм, несущих аминокислотные замены, обусловливающие устойчивость к АЗТ;

2) выяснить характер взаимодействия ГК и ее производных с АЗТ и невирапином при совместном ингибировании;

3) проверить ингибирующую активность бетулина и его производных в отношении рекомбинантной ОТ ВИЧ-1 и АЗТ-устойчивых форм ОТ;

4) исследовать ингибирующую активность ряда производных хинонов в отношении ОТ ВИЧ-1;

5) применив метод фагового дисплея, описать возможные мишени противовирусного действия ГК.

Выводы.

Исследование ингибирующей активности ряда производных глицирризиновой кислоты показало, что пента-О-никотинат ГК, моноаммонийная соль ГК, глицирретовая кислота и ее дипептиды ингибируют рекомбинантную обратную транскриптазу ВИЧ-1. В этом ряду пента-О-никотинат ГК показал себя самым активным ингибитором ОТ с константой ингибирования 6,2 мкМ. Пента-О-никотинат ГК эффективно ингибирует активность мутантных форм ОТ, несущих аминокислотные замены, обусловливающие устойчивость к ази дотими дину.

Показано, что при совместном ингибировании ОТ пента-О-никотинат ГКом и азидотимидин-трифосфатом наблюдается аддитивный эффект. Совместное ингибирование пента-О-никотинатом ГК и невирапином выявило взаимонезависимый и синергический эффект их совместного действия. Показано, что эффект совместного ингибирования ОТ азидотимидин-трифосфатом и глицирризиновой кислоты выше ожидаемого, что говорит о синергическом механизме их действия.

Установлено, что аминокислотные производные бетулина эффективно ингибируют рекомбинантную обратную транскриптазу ВИЧ-1 и ее АЗТ-устойчивые формы. Наиболее активным ингибитором ОТ является дипептид бетулоновой кислоты, константа ингибирования ОТ дикого типа для данного соединения составляет 14 мкМ.

Исследовние ингибирующей активности производных нафтои антрахинонов показало, что данные соединения ингибируют рекомбинантную обратную транскриптазу ВИЧ-1 как дикого типа, так и ее мутантные формы, при этом они показывают разный тип ингибирования. Константы ингибирования для наиболее активных соединений — 25 и 45 мкМ.

5. Методом фагового дисплея были отобраны пептиды, специфически взаимодействующие с глицирризиновой кислотой. Была показана гомология отобранных пептидов с поверхностными белками ряда вирусов человека, в том числе ВИЧ-1 (85% пептидов имеют гомологию с гликопротеидом gpl20). Найдена гомология проанализированных пептидов с обратной транскриптазой (44% пептидов).

6. Показана гомология отобранных пептидов с белками человека: тирозин киназами (55% пептидов среди отобранных показали гомологию), серин-треониновым киназам (37% пептидов) и некоторым другим белкам. Анализ аминокислотных последовательностей выявил общие закономерности — повышенное содержание гидрофобных аминокислотповышенная частота сайтов фосфорилирования для некоторых киназ: казеинкиназы I (в случайных последовательностях 23%, в проанализированных пептидах 37%), глюкоген синтазы киназы 3 (GSK3, в случайных последовательностях 7%, в пептидах 17%).

Показать весь текст

Список литературы

  1. А.В., Кузноделов К. Д., Краев А. С. и др. Методы молекулярной генетики и генной инженерии. М.: «Наука». 1990
  2. Т., Фрт Э., Сэмбрук Дж. Молекулярное клонирование. М.: «Мир». 1984
  3. Э.В., Богомолов Б. П., Жданов В. М. Обзор центров, сотрудничающих с ВОЗ по вирусным инфекциям. М. 1986. С.4−7
  4. В.А. Синтетические лекарственные средства против ВИЧ/СПИД. 1999. Соровский образовательный журнал. № 9. С.44−51
  5. Петренко Н. И, Петухова В. З., Шатров М. М Синтетические трансформации высших терпеноидов V. Синтез и спектральные данные производных глицирретовой кислоты, содержащих аминокислотные фрагменты. 2000. Журнал органической химии. Т.36(7). С. 1013−1026
  6. О.А., Егоричева И. Н., Федюк Н. В. Изучение анти-ВИЧ активности (3-глицирризиновой кислоты. 1992. Вопросы вирусологии. Т.37(5−6). С.235−238
  7. А.Г., Плясунова О. А., Гашникова Н. М., Мамаева О. А., Федюк Н. В. Хронически инфицированная ВИЧ-1 культура моноцитов человека U937 как модель для оценки эффективности анти-ВИЧ препаратов. 2001. Вопросы вирусологии. № 6. С. 38−42
  8. А.Г., Федюк Н. В., Абдуллаев С. М., Болтина Л. А., Толстиков Г. А. Индуктор гамма интерферона// Заявка на патент РФ № 2 003 134 868 от 01.12.03
  9. Т.А., Белогуров А. А., Лукин М. А., Чернов Д. Н., Куханова М. К., Бибилишвили Р. Ш. Обратная транскриптаза вируса иммунодефицита человека: выделение и субстратная специфичность. 1993. Молекулярная биология. Т.27. С.618−629
  10. ИА., Карамов Э. В., Горчакова ТА. и др. Штамм перевиваемых клеток моноцитов человека продуцент вируса иммунодефицита человека 1 типа. Патент РФ № 1 554 370, выдан 19.03.1993
  11. Е.А., Плясунова OA., Петренко Н. И., Узенкова Н. В., Шулъц Э. Э., Толстиков ГА., Покровский А. Г. Ингибирование рекомбинантной интегразы ВИЧ-1 производными высших терпеноидов. 2003. Доклады Академии Наук. Т.391(4). С. 218−220
  12. Г. А., Шулъц Э. Э., Болтина Л. А., Толстикова Т. Г. Солодка. Неиспользуемые возможности здравоохранения России. Химия в интересах устойчивого развития. 1997. Т.5. С.57−73
  13. Г. А., Болтина Л. А., Шулъц Э. Э., Покровский А. Г. Глицирризиновая кислота. 1997. Биоорганическая химия. Т.23(7). С. 691−709
  14. Г. А., Шулъц Э. Э., Сафарова Г. М., С.пирихин Л. В. Получение 2-фурилцикланонов диеновым синтезом. 1990. Журнал органической химии. Т. 28(6). С. 1283−1296
  15. Э.Э., Петрова Т. Н., Шакиров М. М., Черняк Е. И., Гранкина В. П., То.чсткков Г. А. Фенольные соединения подземной части солодки уральской (Glycyrrhiza uralensis Fisch.) сибирских популяций. 2000. Химия в интересах устойчивого развития. Т.8. С.453−457
  16. Л. Ингибиторы ферментов и метаболизма. М: Мир. 1966. С. 864
  17. Р. М. Непостоянство генома. М.: «Наука». 1984. С.237
  18. Ahmad N., Venkatesan S. Nef protein of HIV-1 is a transcriptional repressor of HIV-1 LTR. 1988. Science. Y.241. P.1481−1485
  19. Akihisa T, Ogihara J, Kato J, Yasukawa K, Ukiya M, Yamanouchi S, Oishi K. Inhibitory effects of triterpenoids and sterols on human immunodeficiency virus-1 reverse transcriptase. 2001. Lipids. V.36(5). P.507−512
  20. Bagasra O., Whittle P., Heins В., Pomerantz R.J. Anti-human immunodeficiency virus type 1 activity of sulfated monosaccharides: comparison with sulfated polysaccharides and other polyions. 1991. J. Infect. Dis. V.164(6). P.1082−1090
  21. Baltina LA. Chemical modification of glycyrrhizic acid as a route to new bioactive compounds for medicine. 2003. Curr. Med. Chem. V.10(2). P. 155−171
  22. Balzarmi J., De Clercq E., Serafinowski P., Dorlcmd E., Harrap K.R. Synthesis and antiviral activity of some new S-adenosyl-L-homocysteine derivatives. 1992. J. Med. Chem. V.35(24). P.4576−83
  23. Bean P. The use of alternative medicine in the treatment of hepatitis C. 2002. Am. Clin. Lab. V.21(4). P. 19−21
  24. Berube, P., Barbeau, B., Cantin, R, Sekaly, R.-P., ТгетЫауМ- Repression of Human Immunodeficiency Virus Type 1 LTR-driven gene expression by binding of the virus to its primary cellular receptor, the CD4 molecule. 1996. J. Virol. V.6. P.4009−4016
  25. В irk В., Sonnerborg A. Variations in HIV-1 pol gene associated with reduced sensitivity to anti-retroviral drugs in treatment-naive patients. 1998. AIDS. V.12. P.2369−2375
  26. Boyer P.L., Ferris A.L., Hughes S.H. Mutational analysis of the fingers domein of HIV-1 reverse transcriptase. 1992. J. Virol. V.66. 7533−7537
  27. Boyer P.L., Ferris A.L., Clark A. Mutational analysis of the fingers and palm subdomeins of HIV-1 reverse transcriptase. 1994. J. Mol. Biol. V. 243. P.472−483
  28. Bukrinsky, M, Sharova, N., Stevenson, M. Human Immunodeficiency Virus Type 1 2-LTR circles reside in a nucleoprotein complex which is different from the preintegration complex. 1993. J. Virol. V.ll. P.6863−6865
  29. Caputo, A., Grossi, M., Rossi, C" Campion, D., Balboni, PJ. The tat gene and protein of the Human Immunodeficiency Virus Type 1. 1995. Microbiologica. V.18. P. 87-П0
  30. Chang, L.J., Zhang, С. Infection and replication of Tat" HIV: genetic analyses of LTR and tat mutations in primary and long-term human lymphoid cells. 1995. Virology. V.211. P.157−169
  31. A3. С hang W.S., Yan G.F., Chiang H.С. Inhibitory effects of phenolic carboxylic acid analogues on xanthine oxidase. 1995. Anticancer Res. V.15(5). P.2097−2100
  32. Chen I.J., Neamati N., MacKerell A.D. Jr. S tincture-based inhibitor design targeting HIV-1 integrase. 2002. Cuit. Drug Targets Infect. Disord. V.2(3). P.217−234
  33. Cinatl J., Morgenstern В., Bauer G., Chandra .P, Rabenau H., Doerr H.W. Glycyrrhizin, an active component of liquorice roots, and replication of SARS-associated coronavirus. 2003. Lancet. V.361(9374). P.2045−2046
  34. Cowan M.M. Plant products as antimicrobial agents. 1999. Clin. Microbiol. Rev. V.12. P.564−582
  35. C.rance J.M., Scaramozzino N., Jouan A., Garin D. Interferon, ribavirin, 6-azauridine and glycyrrhizin: antiviral compounds active against pathogenic flaviviruses. 2003. Antiviral Res. V.58(l). P.73−79
  36. Cullen, B.R. Mechanism of Action of Regulatory Proteins Encoded by Complex Retroviruses. 1992. Microbiological Reviews. V.9. P.375−394
  37. Dharmaratne H.R., Tan G.T., Marasinghe G.P., Pezzuto J.M. Inhibition of HIV-1 reverse transcriptase and HIV-1 replication by Calophyllum coumarins and xanthones. 2002. Planta Med. V.68(l). P.86−87
  38. Darrick S.H., Kim L., Chen Z, Nguyen V.T., Pezzuto J., Qiu S., Lu Z.Z. A concise semi-synthetic approach to betulinic acid from betulin. 1997. Synth. Commun. V. 27(9). P.1607−1612
  39. Debyser Z., Cherepanov P., Van Maele В., De C. lercq E., Wit>rouw M. In search of authentic inhibitors of HIV-1 integration. 2002. Antivir. Chem. Chemother. V.13(l). P.1−15
  40. De S.K., Marsh J. W. HIV-1 Nef Inhibits a common activation pathway in NIH-3T3 cells. 1994. J. Biol. Chem. V.269(9). P.6656−6660
  41. De Clercq E. Non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NNRTIs) for the treatment of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infections: strategies to overcome drug resistance. 1996. Medical virology. V.6. P.97−110
  42. De Clercq E. Perspectives of non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NNRTIs) ii the therapy of HIV-1 infection. 1999. Farmaco. V.54(l-2). P.26−45
  43. De Clercq E. The emerging role of fusion inhibitors in HIV infection. 1999. Drugs R D. V.2(5). P.321−331
  44. De Clercq E. Current lead natural products for the chemotherapy of humai immunodeficiency virus (HIV) infection. 2000. Med. Res. Rev. V.20(5). P.323−349.
  45. De Clercq E. Inhibition of HIV infection by bicyclams, highly potent and specific CXCR4 antagonists. 2000. Mol. Pharmacol. V.57(5). P.833−839
  46. De Clercq E., Schols D. Inhibition of HIV infection by CXCR4 and CCR5 chemokine receptor antagonists. 2001. Antivir. Chem. Chemother. V.l. P. 19−31
  47. De Clercq E. New anti-HIV agents and targets. 2002. Med. Res. Rev. V.22(6). P.531−565.
  48. Dumaz N., Milne D.M., Meek D.W. Protein kinase CK1 is a p53-threonine 18 kinase which requires prior phosphorylation of serine 15. 1999. FEBS Lett. V.463(3). P.312−316
  49. EsnoufR., Ren J., Ross C., Jones Y., Stammers D., Stuart D. Mechanism of inhibition of HIV-1 reverse transcriptase by non-nucleoside inhibitors. 1995. Nat. Strict Biol. V.2(4). P.303−308
  50. Essex M. Human immunodeficiency viruses in the developing world. 1999. Ad. Virus. Res. V.53. P.71−88юз
  51. Farnei Ch., Haseltine W.A. Integration of humah immunodeficiency vims type 1 DMA in vitro. 1990. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. V.81(6). P.4164−4168
  52. Farnei Ch., Haseltine W.A. Circulisation of humah immunodeficiency vims type 1 DNA in vitro. 1991. J. Virol. V.65. P.6942−695
  53. FreedE.O. HIV-1 replication. 2001. Somat. Cell. Mol. Genet. V.26(l-6). P.13−33
  54. Fujisawa Y., Sakamoto M., Matsushita M., Fujita Т., Nishioka K. Glycyrrhizin inhibits the lytic pathway of complement—possible mechanism of its antiinflammatory effect on liver cells in viral hepatitis. 2000. Microbiol. Immunol. V.44(9). P.799−804
  55. Furman P.A., Fyfe J.A., SaintClair M.H. Posphorylation of 3'-azido-3--deoxythymidine and selective interaction of the 5'-triphosphate with HIV-1 reverse transcriptase. 1986. Proc. Natl. Acad. Sci. V.83. P.8333−8337
  56. Garg R., Gupta S.P., Gao H., Babu M.S., Debnath A.K., Hansch C. Comparative Quantitative Stmcturemrnus sign Activity Relationship Studies on Anti-HIV Drugs. 1999. Chem. Reviews. V. 99(12). P. 3525−3601
  57. Hatano Т., Yasuhara Т., Miyamoto K., Okuda T. Anti-human immunodeficiency virus phenolics from licorice. 1988. Chem. Pharm. Bull. V.36(6). P.2286−2288
  58. Hatomi M., Tanigawa K., Fujihara M., Ito J., Yanahira S., Ohtsuki K. Characterization of bovine and human lactoferrins as glycyrrhizin-binding proteins and their phosphorylation in vitro by casein kinase II. 2000. Biol. Pharm. Bull. V.23. P.1167−1172
  59. Hattori Т., Ikematsu S., Koito A., Matsushita S., Maeda Y., Hada M., Fujimaki M., Takalsuki K. Preliminary evidence for inhibitory effect of glycyrrhizin on HIV replication in patients with AIDS. 1989. Antiviral Res. V.5−6. P.255−261
  60. Harrich D., Ulich C., Gaynor R.B. A critical role for the TAR element in promoting efficient Human Immunodeficiency Virus Type 1 Reverse transcription. 1996. J. Virol. V.6. P.4017−4027
  61. Havsteen B. The biochemistry and medical significance of the flavonoids. Pharmacology and Therapeutics. 2002. V.96(2−3). P.67−202
  62. Higuchi H., Mori К., Kaio A., Ohkuma Т., Endo Т., Kaji H. Antiretroviral activities of anthraquinones and their inhibitory effects on reverse transcriptase. 1991. Antiviral. Res. V. 15(3). P. 205−216
  63. Holz-Smith S.L., Sun C, Jin L, Matthews T.J., Lee K.-H., C. hen С H. Role of Human Immunodeficiency Virus (HIV) Type 1 Envelope in the Anti-HIV Activity of the Betulinic Acid Derivative IC9564. 2001. Antimicrob. Agents Chemother. V. 45. P. 60−66
  64. Hofmann K, Bucher P., Falquet. L., Bairoch A. The PROSITE database, its status in 1999. 1999. Nucleic Acids Res. V.27. P.215−219.
  65. Howcroft Т.К., Palmer L.A., Brown J., Rellahan В., Kashanchi F. HIV Tat represses transcription through Spl-like elements in the basal promoter. 1995. Immunity. V.3. P.127−138
  66. Huang Y., Zhang L., Ho L. Biological Characterization of nef in Long Term Survivors of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Infection. 1995. J. Virol. V.69(12). P.8142−8146
  67. Huang L., Chen C.H. Molecular targets of anti-HIV-1 triterpenes. 2002. Curr. Drug Targets Infect. Disord. V.2(l). P.33−36
  68. Huang X., Miller W. A time-efficient, linear-space local similarity algorithm. 1991. Advances in Applied Mathematics. V. 12. P.337−357
  69. Jacobo-Molina A., Ding J., Nanni R.G. Ciystal structure of of HIV-1 reverse transcriptase complexed with double-stranded DNA at 3.0 a resolution shows bent DNA. 1993. Proc. Natl. Acad. Science. V.92. P. 1222- 1226
  70. Johnson V. Combination therapy for HIV-1 infection-overview: preclinical and clinical analysis of antiretroviral combinations. 1996. Antiviral Res. V.29. P.35−39
  71. Jonckheere H, Anne J, De Clercq E. The HIV-1 reverse transcription (RT) process as target for RT inhibitors. 2000. Med. Res. Rev. V.20(2). P. 129−154
  72. Kah-aichev Z, Walder R., Garzaro D. Anti-HIV activity of extracts from Calendula officinalis flowers. 1997. Biomed. Pharmacother. V.51(4). P. 176−80
  73. Kashiwada Y., Hashimoto F., C. osentino L.M., Chen C.-H., Garrett P.E., Lee K.H. Betulinic acid and dihydrobetulinic acid derivatives as potent anti-HIV agents. 1996. J. Med. Chem. V. 39. P. 1016−1017
  74. Katz R.A., Skalka A.M. The retroviral enzymes. 1994. Annu. Rev. Biochem. V.63. P.133−173
  75. Klimkait. Т., Strebel K., Hoggan M.D., Martin M.A., Orenstein J.M. The human immunodeficiency virus type 1-specific protein vpu is required for efficient virus maturation and release. 1990. J. Virol. V.64(2). P.621−629
  76. Kuritzkes D.R. Resistance to protease inhibitors. 2002. J. HIV Ther. V.7(4). P.87−91
  77. Laemmli U.K. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. 1970. Nature. V.2. P.680−685
  78. Lau A.F., Siedlecki J., Anleitner J., Patterson G.M., C. aplan F.R., Moore RE. Inhibition of reverse transcriptase activity by extracts of cultured blue-green algae (cyanophyta). 1993. PlantaMed. V.59(2). P.148−151
  79. Lee-Huang S., Huang P.L., Nara P.L., Chen H.C., Kung H.F., Huang P., Huang H.I., Huang P.L. MAP 30: a new inhibitor of HIV-1 infection and replication. 1990. FEBS Lett. V.272(l-2). P. 12−18
  80. Levy J. A. Pathogenesis of Human Immunodeficiency Virus Infection. 1993. Microbiological Reviews. V. 11. P. 183−289
  81. Li В.О., Fu Т., Dongyan Y., Mikovils J.A., Ruscetti F.W., Wang JM. Flavonoid baicalin inhibits HIV-1 infection at the level of viral entty. 2000. Biochem. Biophys. Res. Commun. V.276(2). P.534−538
  82. Lifrak S. Retroviral reverse transcriptase. Molecular biology Intellegence Unit. 1996. P.208
  83. Mahmood N., Pizza C., Aquino R., De Tommasi N., Piacente S., Colman S., Burke A., Hay A.J. Inhibition of HIV infection by flavanoids. 1993. Antiviral Res. V.22(2−3). P.189−199
  84. Majumdar C., Stein C.A., Cohen J.S., BroderS., Wilson S.H. Stepwise mechanism of HIV reverse transcriptase: primer function of phosphorothioate oligodeoxynucleotide. 1989. Biochemistry. V.28. P. 1340−1346
  85. Maldarelh F., Sato H., Berthold E., Orenstain J., Martin M.A. Rapid induction of apoptosis by cell-to-cell transmission of Human Immunodeficiency Vims Type 1. 1995. J. Virol. V.69(10). P.6457−6465
  86. Mdisuse I.Т., him Y.A., Hattori M, Correa M" Gupta M.P. A search for anti-viral properties in Panamanian medicinal plants. The effects on HIV and its essential enzymes. 1999. J. Ethnopharmacol. V.64(l). P. 15−22
  87. Merluzzi V.J., Hargra>e K.D., Labadia M., Grozinger K., Skoog M., Wu J.C., Shih C.K., Eckner K, Hattox S., Adams J. Inhibition of HIV-1 replication by a noimucleoside reverse transcriptase inhibitor. 1990. Science. V.250(4986). P. 14 111 413
  88. Min B.S., Nakamura N., Miyashiro H., Kim Y.H., Hattori M. Inhibition of human immunodeficiency vims type 1 reverse transcriptase and ribonuclease H activities by constituents of Juglans mandshurica. 2000. Chem. Pharm. Bull. V.48(2). P. 194−200
  89. Mlinaric A., Kreft S., UmekA., Strukelj B. Screening of selected plant extracts for in vitro inhibitory activity on HIV-1 reverse transcriptase (HIV-1 RT). 2000. Pharmazie. V.55(l). P.75−77
  90. Morin M.J. From oncogene to drug: development of small molecule tyrosine kinase inhibitors as anti-tumor and anti-angiogenic agents. 2000. Oncogene. V. 19(56). P.6574−6583
  91. Motti C., NuzzoM., MeolaA., Galfre G., Felici F., Cortese R., Nicosia A., Mcmaci P. Recognition by human sera and immunogenicity of HBsAg mimitopes selected from an M13 phage display library. 1994. Gene. V. 146. P. 191−198
  92. Mui Ph. W., Jacober S.P., Hargrave K.D., Adams J., Ciystal structure of nevirapine, a non-nucleoside inhibitor of HIV-1 reverse transcriptase, and computational alignment with a structurally diverse inhibitor. 1992. J. Med. Chem. V.35. P.201−202
  93. Nakashima H., Murakami Т., Yamamoto N., Sakagami H., Tanuma S., Ha tan о Т., Yoshida Т., Okuda Т. Inhibition of human immunodeficiency viral replication by tannins and related compounds. 1992. Antiviral Res. V.18(l). P.91−103
  94. Nair V. HIV integrase as a target for antiviral chemotherapy. 2002. Rev. Med. Virol. V. 12(3). P. 179−193
  95. Neer E.J., Clapham D.E. Roles of G protein subunits in transmembrane signaling. 1988. Nature. V.333. P.129−130
  96. Olukoga A., Donaldson D. Liquorice and its health implications. 2000. J. R. Soc. Health. V. 120(2). P.83−89
  97. Ono K., Nakane H., Fukushima M., Chermann J.-C., Barre-Sinoussi F. Differential inhibitory effects of various flavonoids on the activities of reverse transcriptase and cellular DNA and RNA polymerases. 1990. Eur. J. Biochem. V. 190. P.469
  98. C.D. 2-LTR cicular viral DNA as a marker for human immunodeficiency vims type 1 infection in vitro. 1994. Virology. V.205. P.470−478
  99. Pearson L., Garcia J. A transdominant tat mutant that inhibits tat- induced gene expression from the Human Immunodeficiency Vims Long Terminal Repeats. 1990. Proc. Natl. Acad. Sci. V.87. P.5079−5083
  100. Pedersen O.S., Pedersen E.B. Non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors: the NNRT1 boom. 1999. Antivir. Chem. Chemother. V.10(6). P.285−314
  101. G.R., Green В., Вомуег W.J. Steroids and related natural products. VI. The structure of a-apoallobetulin. 1961. J. Org. Chem. V.8. P.2879−2883
  102. Pi ret В., Legrand.-Poels, S., Sappey €., Piette J. NF-kB transkription factor and Human Immunodeficiency Virus Type 1 (HIV-1) activation by methylene blue photosensitization. 1995. Eur J. Biochemistry. V.228. P.447- 455
  103. Ploeger В., Mensinga Т., Sips A., Meulenbelt J., DeJongh• J. A human physiologically-based model for glycyrrhzic acid, a compound subject to presystemic metabolism and enterohepatic cycling. 2000. Pharm. Res. V.12. P. 1516−1525
  104. Pluymers W., De Clercq E., Debyser Z. HIV-1 integration as a target for antiretroviral therapy: a review. 2001. Curr. Drug Targets Infect. Disord. V. l (2). P.133−49
  105. Plyasunova O.A., Pokrovsky A.G., Baltina L. Design of anti-HIV agents based on glycyrrhizic acid // Abstract book v.2 of Tenth International Conference on AIDS, International Conference on STD, Yokohama, Japan. 1994. P.7−12
  106. Pokholok D., Gudima S., Yesipov D., Dobrynin V., Rechinsky V., Kochetkov S. Interactions of the HIV-1 RT AZT-resistant mutant with substrates and AZT-TP. 1993. FEBS Lett. V.325(3). P.237−241
  107. Pokholok D., Gudima S., Yesipov D., Dobrynin V., Rechinsky V., Kochetkov S. Interactions of the HIV-1 RT AZT-resistant mutant with substrates and AZT-TP. 1993. FEBS Lett. V.325(3). P.237−241
  108. Popov S., Rexach M, Ratner L., Blobel G., Bukrinsky M. Viral protein R regulates docking of the HIV-1 preintegration complex to the nuclear pore complex. 1998. J. Biol. Chem. V.273(21). P. 13 347−13 352
  109. Prichard M.N., Shipman C.h. A three-demensional model to analyze drug-drug interactions. 1990. Antiviral Res. V.14. P. 181−201
  110. Pulgar V., Marin O., Meggio F., Allende C.C., Allende J.E., Pinna LA. Optimal sequences for non-phosphate-directed phosphorylation by protein kinase CK1 (casein kinase-l)--a re-evaluation. 1999. Eur. J. Biochem. V.260(2). P.520−526
  111. Ren J., Esnouf R, Garman E., Somers D., Ross C., Kirby /., Keeling J., Darby G., Jones 7., Stuart D. High resolution structures of HIV-1 RT from four RT-inhibitor complexes. 1995. Nat. Struct. Biol. V.2(4). P.293−302
  112. Res tie Т., Muller В., Goody R.S. RNAseH activiry of HIV-1 reverse transcriptases is confined exclusively to the dimeric forms. 1992. FEBS Lett. V.300. P. 97−100
  113. Romero D.L. Advances in development of HIV reverse transcriptase inhibitors. 1994. Ann. Rep. Med Chem. V.29. P. 123−132
  114. Suhnel J. Evaluation of synergism or antagonism for the combined action of antiviral agents. 1990. Antiviral Res. V.13. P.23−40
  115. Schinazi R.F., C. hu C.K., Babu J.R., Oswald B.J., Saalmam V., Cannon D.L., Eriksson B.F.H., Nasr M. Anthraquinones as a new class of antiviral agents against human immunodeficiency vims. 1990. Antiviral Res. V. 13. P. 265−272
  116. SekizaM’a Т., Yanagi K., Itoyama Y. Glycyrrhizin increases survival of mice with herpes simplex encephalitis. 2001. Acta Virol. V.45(l). P.51−54
  117. Shibala Sh, Takanashi K., Yano S., Harada M., Saito H., Tamura Y., Kumagai A., Hirabayashi K., Yamamoto M., Nagata N. Chemical modification of glycyrrhetinic acid in relation to the biological activities. 1987. Chem. Pharm. Bull. V.35. P. 19 101 918
  118. Shimoyama Y., Ohtaka H., Nagata N., Munakata #., Hayashi N., Ohtsuki K. Physiological correlation between glycyrrhizin, glycyrrhizin-binding lipoxygenase and casein kinase II. 1996. FEBS Lett. V.391. P.238−242.
  119. Smith G.P., Petrenko V.A. Phage Display. 1997. Chem.Reviews. V.97. P.391−410
  120. Scott J.K., Smith G.P. Searching for Peptide Ligands with an Epitope Library. 1990. Science. V.249. P.386−390
  121. P., Balfe P., Ludlam C.A., Bishop J.O., Вгом’п A.J. Analysis of sequence diversity in hypervariable regions of the external glycoprotein of human immunodeficiency virus type 1. 1990. J. Virol. V.64(12). P.5840−5850
  122. G.P. 1992. Cloning in fuse vector: A laboratory manual. Division of Biological Sciences, Unuversity of Missouiy, Columbia
  123. Suhnel J. Evaluation of synergism or antagonism for the combined action of antiviral agents. 1990. Antiviral research. V.13. P.23−40
  124. Svinarchuk F.P., Konevetz D.A., Phasunova J.F., Pokrovsty A.G., Vlassov V.V. Inhibition of HIV proliferation in MT4 cells by antisense oligonucleotide conjugated to lipophilic groups. 1993. Biochimie. V. 75. P.243−247
  125. Tan G.T., Kinghorn A.D., Hughes S.H., Pezzuto J.M. Psychotrine and its O-methyl ether are selective inhibitors of human immunodeficiency virus-1 reverse transcriptase. 1991. J. Biol. Chem. V.266(35). P.23 529−23 536
  126. Tan G.T., Pezzuto J.M., Kinghorn A.D., Hughes S.H. Evaluation of natural products as inhibitors of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) reverse transcriptase. 1991. J. Nat. Prod. V.54(l). P.143−54
  127. Tarrago-Litvak L., Andreola M.L., Nevinsky G.A., Sarih-Cottin L., Litvak S. The reverse transcriptase of HIV-1: from enzymology to therapeutic intervention. 1994. FASEB J. V.8(8). P.497−503
  128. Thomson R.H. Naturally occuring quinones.III. Recent advances. N.Y. Chapman and Hall. 1987. P.732
  129. Tochikura T.S., Nakashima H., Yamamoto N. Antiviral agents with activity against human retroviruses. 1989. J. Acquir. Immune Defic. Syndr. V.2(5). P.441−447
  130. Quan Y., Motakis D., BuckheitR. Jr., Xu Z.Q., FlavinM.T., PamiakM.A., Wainberg M.A. Sensitivity and resistance to (+)~calanolide A of wild-type and mutated forms of HIV-1 reverse transcriptase. 1999. Antivir Ther. V.(4). P.203−209
  131. Ugolini S., Mondor .1, Sattentau Q.J. HIV-1 attachment: another look. 1999. Trends Microbiol. V.7(4). P. 144−149
  132. Vlietinck A.J., De Bruyne Т., Apers S., Pieters L.A. Plant-derived leading compounds for chemotherapy of human immunodeficiency vims (HIV) infection. 1998. Planta Med. V.64(2). P.97−109
  133. Vila J., Walker J.M., It arte E., Weber M.J., Sando J. Phosphorylation of protein kinase С by Casein kinase 1. 1989. FEBS Lett. V.255. P.205−208.
  134. WongK., Cantley L.C. Cloning and characterization of a human phosphatidylinositol 4-kinase. 1994. J. Biol. Chem. V.269. P.28 878−28 884
  135. Yuan X., Matsuda Z, Matsuda M., Essex M., Lee Т.Н. Human immunodeficiency vims vpr gene encodes a virion-associated protein. 1992. AIDS Res. Hum. Retroviruses. V.6(ll). P. 1265−1271
  136. Zhang C.F., Nakamura N., Tewtrakul S., HattoriM., Sun Q.S., Wang Z.Т., Fujiwara T. Sesquiterpenes and alkaloids from Lindera chunii and their inhibitory activities against HIV-1 integrase. 2002. Chem. Pharm. Bull. V.50(9). P. 1195−12 001. ОТ АВТОРА
  137. Особая признательность научному руководителю и заведующему лабораторией ретровирусов Покровскому Андрею Георгиевичу, благодаря которому состоялась данная работа.
  138. Исследования были выполнены при поддержке грантов Минобразования РФ «Фундаментальные исследования в области естественных наук» и гранта Международного Научного Технического Центра 1198−98.
Заполнить форму текущей работой