Закономерности самоочищения водной среды от многокомпонентных органических примесей
Диссертация
Актуальность проблемы. В самоочищении водных экосистем биологические и биохимические процессы разложения органического вещества занимают ведущее место. Наибольшую проблему представляет деструкция стойкого органического вещества техногенного происхождения, которое может накапливаться в водной среде и представлять опасность для водных экосистем. Это, прежде всего, относится к лигнинам, которые… Читать ещё >
Содержание
- ГЛАВА 1. СОВРЕМЕННОЕ СОСТОЯНИЕ ПРОБЛЕМЫ
- 1. 1. Особенности деструкции многокомпонентного органического вещества
- 1. 2. Деструкция техногенного органического вещества
- 1. 3. Деструкция органического вещества в глобальном цикле углерода
- 1. 4. Лигнин — эталон неупорядоченного биополимера
- 1. 5. Подходы к моделированию деструкции
- 1. 6. Методология моделирования
- ГЛАВА 2. АНАЛИЗ СТРУКТУРНОЙ ОРГАНИЗАЦИИ ЛИГНИНА
- 2. 1. Молекулярная структура лигнина
- 2. 2. Модели структуры лигнинов
- 2. 3. Структурная организация лигнина
- 2. 4. Фрактальные свойства макромолекул
- 2. 5. Размеры макромолекул и молекулярная масса лигнина
- 2. 6. Закономерности структурной организации лигнина
- ГЛАВА 3. АНАЛИЗ МЕХАНИЗМОВ БИОХИМИЧЕСКОЙ ДЕСТРУКЦИИ ЛИГНИНА ПОД ДЕЙСТВИЕМ МИКРООРГАНИЗМОВ
- 3. 1. Грибы в водной среде
- 3. 2. Лигнинразрушающие грибы и их ферментные системы
- 3. 3. Механизмы действия лигнинразрушающих ферментов
- 3. 3. 1. Лигнинпероксидаз ы
- 3. 3. 2. Марганецпероксидазы
- 3. 3. 3. Гибридные пероксидазы
- 3. 3. 4. Лакказы
- 3. 3. 5. Размеры ферментов
- 3. 4. Структурные изменения при деструкции лигнина
Список литературы
- Азаров В. И., Буров А. В., Оболенская А. В., 1999. Химия древесины и синтетических полимеров. СПб: СПбЛТА. 628 с.
- Александрова Г. П., Медведева С. А., Бабкин В. А., Соловьев В. А., Малышева О. И. Иванова С. 3., 1989. Влияние состава питательной среды на лигниназную активность базидиомицета Phanerochaete chrysosporium. // Химия древесины. № 6. С. 77−80.
- Антропова О. Н., Билай В. И., Войцеховский Р. В., 1974. Исследование разложения лигнина микромицетами. // В кн. Химия и использование лигнина. Рига. 182 с.
- Афанасьев Н. И., 1975. Структура макромолекул в растворах, на границах раздела фаз и поверхностноактивные свойства лигносульфонатов. Автореф. дисс.. докт. хим. наук. Л. 42 с.
- Беккер 3. Э., 1988. Физиология и биохимия грибов. М.: Изд.-во Моск. Ун-та. 230 с.
- Богомолов Б. Д., 1973. Химия древесины и основы химии высокомолекулярных соединений. М. 400 с.
- Бокрис Дж. О. М., 1982. Химия окружающей среды. // Под ред. А. П. Цыганкова. Пер. с англ. М.: Химия, 672 с.
- Болобова А. В., Аскадский А. А., Кондращенко В. И., Рабинович М. Л., 2002. Теоретические основы биотехнологии древесных композитов. // Отв. ред. A.M. Безбородое. Кн. 2. Ферменты, модели, процессы. М.: Наука. 344 с.
- Брауне Ф.Э., Брауне Д. С., 1964. Химия лигнина. М.: Лесная промышленность. 863 с.
- Вавилин В. А., 1983. Нелинейные модели биологической очистки и процессов самоочищения в реках. М.: Наука. 160 с.
- Варюхин С. Е., Иржак В. И., 2004. К вопросу об эффективности инициирования в радикальной полимеризации. // Докл. РАН. Т. 397. № 5. С. 637−639.
- Волощук В. М., 1984. Кинетическая теория коагуляции. Л.: Гидрометеоиздат. 284 с.
- Гигиенические нормативы ГН 2.1.5.1315 03 http://mostgost.ru/gost preview/gh/gh 2 151 315−03/index.html
- Горшков В. Г., Макарьева А. М., 2002. Изменение глобального круговорота углерода: результаты анализа измерений отношений O2/N2 в атмосфере и парциального давления СО2 у поверхности раздела океан-атмосфера. // Геохимия. № 5. С. 526−535.
- Гравитис Я. А., Озоль-Калнин В. Г., 1977. Строение лигнина как полимера. 2. Структура и образование лигнина с точки зрения теории ветвящихся процессов. // Химия древесины. № 3. С. 24−30.
- Грушников О. П., Шорыгина Н. Н., 1971. О неоднородности природного лигнина. // Успехи химии. Т. 40. № 8. С. 1394−1415.
- Грушников О. П., Шорыгина Н. Н., 1972. Современные представления о биосинтезе лигнина. // Успехи химии. Т. 41. № 11. С. 2024−2064.
- Грушников О. П., Елкин В. В., 1973. Достижения и проблемы химии лигнина. М.: Наука. 296 с.
- Денисова Н. П., 1991. Протеолитические ферменты базидиальных грибов, таксономические и экологические аспекты их изучения. Дисс.. докт. биол. наук. Л.: Ботанический ин-т РАН. 402с.
- Долгоносов Б. М., 2001. Кинетика коагуляции-фрагментации и равновесный спектр агрегатов в движущихся суспензиях. // Теоретические основы химической технологии. Т. 35. № 5. С. 465−471.
- Долгоносов Б. М., 2002а. Эволюция спектра агрегатов в дисперсной системе с обратимой коагуляцией. // Коллоидный журнал. Т. 64. № 3. С. 325−333.
- Долгоносов Б. М., 20 026. Численное моделирование формирования дисперсной фазы с коагуляцией-фрагментацией частиц. // Теоретические основы химической технологии. Т. 36. № 6. С. 592−598.
- Долгоносов Б. М., 2005 Кинетика седиментации коагулирующей взвеси. // Теорет. основы хим. технологии. Т. 39. № 6. С. 325−333.
- Долгоносов Б. М., Губернаторова Т. Н., 2005. Нелинейная модель трансформации примесей в водной среде. // Водн. ресурсы. Т. 32. № 3. С. 322−336.
- Долгоносов Б.М., Губернаторова Т. Н., 2007. Кинетика ферментативной деструкции органических макромолекул с фрактальной структурой // Теоретические основы химической технологии. Т. 41. № 6. С. 671−680.
- Долгоносов Б. М., 2009. Нелинейная динамика экологических и гидрологических процессов. М.: Книжный дом «JTn6p0K0M"/URSS. 440с.
- Блинов Н. П., 1989. Химическая микробиология. М.: Высш. шк. 448с.
- Заварзин Г. А., 2003. Лекции по природоведческой микробиологии. Ин-т микробиологии. М.: Наука. 348 с.
- Иванов В. И., 1996. Как работают ферменты. // Соросовский образовательный журнал. № 9. С. 25−32.
- Исаев А. С., Коровин Г. Н., Замолодчиков Д. Г., 2004. Вклад российских лесов в мировой баланс углерода и задачи лесной отрасли после ратификации Киотского протокола. // Устойчивое лесопользование. Т. 6. № 4.С. 16−20.
- Карманов А. П., Давыдов В. Д., Богомолов Б. Д., 1982. Современное состояние проблемы неоднородности природного лигнина. // Химия древесины. № 2. С. 3−25.
- Карманов А. П., Монаков Ю. Б., 1994. Образование пространственно-периодических структур при биосинтезе дегидрополимеров. // Химия древесины. № 1. С. 62−64.
- Карманов А. П., Кузнецов С. П., 1997. Компьютерное моделирование роста фрактальных макромолекул. // Проблемы химии древесины и лесохимии. Сыктывкар. С. 63−67.
- Карманов А. П., 1999. Лигнин. Структурная организация и самоорганизация. // Химия растительного сырья. № 1. С. 65−74.
- Карманов А. П., 2000. Характеристика лигнина клеточных оболочек. // Высокомолекулярные соединения. Т. 42. № 7. С. 1213−1220.
- Карманов А. П., Матвеев Д. В., 2001. Концепция самоорганизованной критичности в приложении к исследованию динамики биосинтеза лигнина. // Химия растительного сырья. № 2. С. 31−37.
- Карманов А. П., 2004. Самоорганизация и структурная организация лигнина. Екатеринбург: УрО РАН. 269 с.
- Клячко Н. Л., 1997. Ферменты биологические катализаторы: основные принципы действия. // Соросовский образовательный журнал. № 3. С. 58−63.
- Кокоревич А. Г., Гравитис Я. А., Озоль-Калнин В. Г., 1989. Развитие скейлингового подхода при исследовании надмолекулярной структуры лигнина. // Химия древесины. № 1. С. 3−24.
- Кононова М. М., 1963. Органическое вещество почвы, его природа, свойства и методы изучения. М.: Изд-во Академии Наук СССР.
- Кононов Г. Н., 1999. Химия древесины и ее основных компонентов. М. 247с.
- Краткий справочник физико-химических величин, 1974. // Под ред. К. П. Мищенко, А. А. Равделя. Химия. 200 с.
- Криульков В. А., Каплин В. Т., Ганин Г. И., 1974. Механизм превращения лигнина и его производных в природной воде. // В кн. Химия и использование лигнина. Рига. 182 с.
- Кульский Л. А., 1980. Теоретические основы и технология кондиционирования воды. Киев: Наук, думка. 564 с.
- Леонтьевский А. А., 2002. Лигниназы базидиомицетов. Дисс.. докт.биол.наук. Пущино: Ин-т микробиологии и физиологии микроорганизмов РАН. 266с.
- Линник П. Н., Васильчук Т. А., Линник Р. П., 2004. Гумусовые вещества природных вод и их значение для водных экосистем (обзор). // Гидробиол. журнал. Т. 40. № 1. С. 81−107.
- Лунин В. В., Локтева Е. С., 2006. „Зеленая“ химия в России. // Научно-образовательный центр „Химия в интересах устойчивого развития Зеленая химия“. http://www.greenchemistry.ru
- Манская С. М., 1957. Биосинтез и распад лигнина. // Успехи современной биологии. Т. XLIV. Вып. 1(4). С. 19−36.
- Медведева С. А., Бабкин В. А., 1988. Пути деструкции фенольных соединений и лигнина грибами белой гнили. // Превращ. древесины при энзимат. и микробиол. воздействиях: Тез. докл. 3 научн. сем. Рига. С. 85−92.
- Межиковский С. М., Иржак В. И., 2008. Химическая физика отверждения олигоме-ров. М.: Наука. 269 с.
- Мишустин Е. Н., Никитин Д. И., 1961. Атакуемость гуминовых кислот почвенной микрофлорой. // Микробиология. Т. 30. В. 5. С. 841- 848.
- Мищенко К.П., Равдель А. А., 1967. (ред.). Краткий справочник физико-химических величин. Л.: Химия. 200 с.
- Научные основы устойчивости лесов к дереворазрушающим грибам, 1992. М.: Наука. 222 с.
- Никаноров А. М., Хоружая Т. А., 2001. Глобальная экология. Учеб. пособие. М.: Изд-во ПРИОР. 285 с.
- Никитин Н. И., 1951. Химия древесины. М.: Изд-во Акад. наук СССР. 578 с.
- Никитин В. М., 1978. Химия древесины и целлюлозы. М. Лесн. пром-ть. 368 с.
- Оболенская А. В., 1993. Химия лигнина. Из-во СПб лесотехн. академии.80 с.
- Паальме Л. П., Прийман Р. Э., Глушко М. И., Губергриц М. Я., 1975. Совместное фо-тоинициированное окисление 3,4-бензпирена и алкиларилсульфонатов. // Водн. ресурсы. № 2. С. 174−178.
- Пен В. Р., Пен Р. 3., Тарабанько В. Е., 1998. Кинетика делигнификации древесины. 7. Моделирование деструкции лигнина методом Монте-Карло. // Химия растительного сырья. № 3. С. 107−113.
- Пен В. Р., Пен Р. 3., 1998. Кинетика делигнификации древесины. Сиб. ГТУ: Красноярск. 200 с.
- Покаржевский А. Д., 1985. Геохимическая экология наземных животных. М: Наука.250 с.
- Рабинович М. Л., Болобова А. В., Кондращенко В. И., 2001. Теоретические основы биотехнологии древесных композитов. // Отв. ред. А. М. Безбородов. Кн. 1. Древесина и разрушающие ее грибы. М.: Наука. 264 с.
- Рабинович М. Л., Болобова А. В., Васильченко Л. Г., 2004. Разложение природных ароматических структур и ксенобиотиков грибами (обзор). // Прикл. биохимия и микробиология. Т. 40. № 1. С. 5−23
- Ревель П., Ревель Ч., 1995. Среда нашего обитания. В 4-х книгах. Кн. 2. Загрязнение воды и воздуха: Пер. с англ. М.: Мир. 296 с.
- Резников В. М., Чирич Л. В., Якубовский С. Ф., 1974. Нуклеофильное замещение у а-углеродного атома гваяцилглицериновых структурных единиц лигнина. // В кн. Химия и использование лигнина. Рига. 182 с.
- Резников В. М., 1977. Реакционная способность лигнина и его превращение в процессах делигнификации древесины. // Химия древесины. № 3. С. 3−23
- Репникова Е. А, Алешина Л. А., Глазкова С. В., Фофанов А. Д., 2004. Исследование структуры лигнинов. // Химия растительного сырья. № 1. С. 5−9.
- Решетникова И. А., 1997. Деструкция лигнина ксилотрофными макромицетами. М.: Изд-во МГУ. 197 с.
- Ролдугин В. И., 2003. Фрактальные структуры в дисперсных системах. // Успехи химии. Т. 72. №Ю. С. 931−957.
- Романкевич Е.А., Ветров А. А., Пересыпкин В. И. Органическое вещество Мирового океана // Геология и геофизика. 2009. Т. 50. № 4. С. 401−411.
- Романкевич Е.А., Ветров А. А., Пересыпкин В. И. Цикл углерода в современном океане и актуальные проблемы геохимии // Океанология на старте 21-го века / Ред. Верещака А. Л. М.: Наука, 2008. С. 78−107.
- Рудакова И. С., 2007. Исследование агрегативной и седиментационной устойчивости дисперсий сульфатного лигнина в водных растворах электролитов. Автореф. дис.. канд. химич. наук. СПб. 24 с.
- Рудакова И. С., Молодкина Л. М., Чернобережский Ю. М., Дягилева А. Б., 2007. Исследование зависимости размеров частиц водных дисперсий сульфатного лигнина от рН методом фильтрации на трековых мембранах. // Коллоидный журнал. Т. 69. № 5. С. 718−720.
- Рудский В. В., 2004. Место Сибири в глобальной экосистеме на рубеже тысячелетий. // География и экология в школе XXI века. Гео-Эко. № 8. С. 11- 24.
- Сарканен К.В., Людвиг К. Х., 1975. (ред.) Лигнины (структура, свойства и реакции). М.: Лесная промышленность. 592 с.
- Смирнов Б. М., 1991. Физика фрактальных кластеров. М.: Наука. 135 с.
- Синельников В. Е., Демина В. И., 1974. О происхождении перекиси водорода, содержащейся в воде открытых водоемов. // Гидрохим. материалы. Т. 60.
- Синельников В. Е., 1980. Механизм самоочищения водоемов. М.: Стройиздат. 111с.
- Суздалев И. П., 2006. Нанотехнология: физикохимия нанокластеров, наноструктур и наноматериалов. М.: Ком Книга/URSS. 592 с.
- Тимофеева С. С., Меньшикова О. А., 1986. Использование макрофитов для интенсификации биологической очистки роданидсодержащих сточных вод. // Водн. ресурсы. № 6. С. 80−85.
- Тимофеева С. С., Бейм А. М., 1990. Закономерности трансформации лигнинных веществ в воде водоемов Восточной Сибири. // Водн. ресурсы. № 2. С. 115−120.
- Тимофеева С. С., Бейм А. М., 1992. Роль макрофитов в обезвреживании фенолов. // Водн. ресурсы. № 1. С. 89−94.
- Тимофеева С. С., Бейм А. М., 1996. Закономерности экологической трансформации хлорлигнинов в природных водах. // Водн. ресурсы. Т. 23. № 4. С. 467−471.
- Фенгель Д., Вегенер Г., 1988. Древесина: химия, ультраструктура, реакции. М.: Лесн. пром-сть. 512 с.
- Шефер Д., Кефер К., 1988. Структура случайных силикатов: полимеры, коллоиды ипористые твердые тела. // Фракталы в физике. М.: Мир. С. 62−71.
- Шеховцова Т. Н., 2000. Ферменты: их использование в химическом анализе. // Соро-совский образовательный журнал. Т. 6. № 1. С. 44−48
- Шлегель Г., 1987. Общая микробиология. // Пер. с нем. М.: Мир. 567с.
- Шорыгина Н. Н., Резников В. М., Елкин В. В., 1976. Реакционная способность лигнина. М.: Наука. 368 с.
- Эрнестова Jl. С., Ли Вульф Н., 1995. Механизмы окислительно-восстановительной трансформации загрязняющих веществ в природных водах. // Водн. ресурсы. Т. 22. № 6. С. 700−705.
- Яковлев В. А., 1965. Кинетика ферментативного катализа. М.: Наука. 248 с.
- Яковлева Ю. Н., 2005. Оценка экологической опасности лигнинсодержащих соединений. Автореф. дне.. канд. биол. наук. Красноярск. 25 с.
- Adler Е., 1977. Lignin Chemistry past, present and future. // Wood Sci. Technol. V. 11. № 3. P. 169−218.
- Aguer J.-P., Richard C., 1996. Reactive species produced on irradiation at 365 nm of aqueous solutions of humic acids. // J. Photochem. Photobiol. A: Chemistry. V. 93. P. 190 198.
- Aitken M. D., Irvine R. L., 1990. Characterization of reactions catalyzed by manganese peroxidase from Phanerochaete chiysosporhtm. // Arch. Biochem. Biophys. V. 276. P. 405 414.
- Aris R., 1968. Prolegomena to the rational analysis of systems of chemical reactions. II. Some addenda // Archiv Rational Mechanics Analysis. V. 27. P. 356−364.
- Aris R., 1989. Reactions in continuous mixtures // American Institute Chemical Engineering Journal. V. 35. P. 539−548.
- Bak P., Tang C., Wiesenfeld K., 1988. Self-organized criticality // Physical Review A. 38: 364−374. doi:10.1103/PhvsRevA.38.364
- Baker M. D., Marcy V. M» 1956. // Trans. ASME. V. 78.
- Bale H.D., Schmidt P.W., 1984. Small-angle X-ray-scattering investigation of submicros-copic porosity with fractal properties. // Phys. Rev. Lett. V. 53 № 6. P. 596−599.
- Banci L, Ciofi-Baffoni S., Tien M., 1999. Lignin and Mn peroxidase-catalyzed oxidation of phenolic lignin oligomers. //Biochemistry. V. 38. № 10. P. 3205−3210.
- Barber R. Т., 1968. Dissolved organic carbon from deep water resists microbial oxidation. //Nature. V. 220. P. 274−275.
- Beratan D. N., Onuchic J. N., Winkler J. R., Gray H. D., 1992. Electron-tunneling pathways in proteins. // Science. V. 258. P. 1440−1471.
- Berglund G. I., Carlsson G. H., Smith А. Т., Szoke H., Henriksen A., Hajdu J., 2002. The catalytic pathway of horseradish peroxidase at high resolution. // Nature. V. 417. P. 463 468.
- Berner R. A., 1980. A rate model for organic matter decomposition during bacterial sulfate reduction in marine sediments. // Biogeochemistry of Organic Matter at the Sediment-Water Interface. CNRS Int. Colloq. P. 35−44.
- Berry R. S., 1994. // In: Clusters of Atoms and Molecules: Theory, Experiment, and Clusters of Atoms (Springer Series in Chemical Physics. V. 52. Ed. H. Haberland). Berlin: Springer. Ch. 2.8. P. 187−205.
- Bhadra В., Raghukumar C., Pindi P. K., Shivaji S., 2008. Brevibacterium oceanic sp. nov., isolated from deep-sea sediment of the Chagos Trench, Indian Ocean International // J. Systematic and Evolutionary Microbiology. V. 58. P. 57−60.
- Bockle В., Martinez M. J., Guillen F., Martinez А. Т., 1999. Mechanism of peroxidase in-activation in liquid cultures of the ligninolytic fungus Pleurotiis palmonariii. s // Appl. Environ. Microbiol. V. 65. № 3. P. 923−928.
- Bonagura С. A., Bhaskar В., Sundaramoorthy M., Poulos T. L., 1999. Conversion of an engineered potassium-binding site into a calcium-selective site in cytochrome с peroxidase. // J. Biol. Chem. Y. 274. P. 37 827−37 833.
- Boominathan K., Balachandra Dass S., Randall T. A., Kelly R. L., Reddy C. A., 1990. Lignin peroxidase-negative mutant of the white-rot basidiomycete Phanerochaete chrysos-porium. //J. Bacteriol. № 1. P. 260−265.
- Boominadthan K., Reddy C., 1992. Fungal degradation of lignin: biotechnological applications. // In: Arara D. K, Elander R. P., Mukrerji K. G. (ed). Handbook of Applied Mycology. Biotechnology, Marcel Dekker, New York. VAP. P. 763−822.
- Boudreau B. P., Ruddick B. R., 1991. On a reactive continuum representation of organic matter diagenesis. // Am. J. Sci. V. 291. P. 507−538.
- Broda P., 1988. Models of microbial attack on lignin. // Biodeteriorat. 7 Select. Pap. 7-th Int. Biodeteriorat. Symp., Cambridge, 6−11 Sept. 1987, London, New York. P.347−350.
- Brunow G., 2001. Methods to reveal the structure of lignin. // In: Steinbiichel A. (ed.) Bio-polymers. V. 1: Hofrichter M., Steinbiichel A. (eds.) Lignin, Humic Substances and Coal. Wiley-VCH. Germany. P. 89−116.
- Camarero S., Ruiz-Duenas F. J., Sarkar S., et al., 2000. The cloning of a new peroxidase found in Iignocellulose cultures of Pleurotus eryngii and sequence comparison with other fungal peroxidases. // FEMS Microbiol. Lett. V. 191. № 1. P. 37−43.
- Carlson D. J., Mayer L.M., Brann M. L., Mague Т. H., 1985. Binding of monomeric organic compounds to macro-molecular dissolved organic matter in seawater. // Mar. Chem. V. 16. P. 141−153.
- Chance В., 1952. The kinetics and stoichiometry of the transition from the primary to the secondary peroxidase peroxide complexes. // Arch. Biochem. Biophys. V. 41. P. 416−424.
- Chen Т., Lamm M. H., Glotzer S. C., 2004. Biomolecule-directed assembly of nanoscale building blocks studied via lattice Monte Carlo simulation. // J. Chem. Phys. V. 121. №. 8. P. 3919−3929.
- Climate Models, 2008. An Assessment of Strengths and Limitations. // The U.S. Climate Change Science Program. Chapter 6 — Future Model Development, P. 85−90.
- Collins P. J., O’Brien M. M., Dobson A. D. W., 1999. Cloning and characterization of a cDNA encoding a novel extracellular peroxidase from Trametes versicolor. // Appl. Environ. Microbiol. V. 65. P. 1343−1347.
- Corin N., Backlund P., Kulovaara M., 1996. Degradation products formed during UV-irradiation of humic waters. // Chemosphere. V. 33. № 2. P. 245−255.
- Creighton Т. E., 1993. Proteins: Structure and Molecular Properties. New York: W.H. Freeman. 507 p.
- Dalimova G. N., Akhmedova Z. R., 2001. Biodestruction of lignins by the basidiomycete Pleurotus ostreatus. // Chemistry of Natural Compounds. V. 37. № 1. P. 83−85.
- Damare S., Raghukumar C., Raghukumar S., 2006. Fungi in deep-sea sediments of the Central Indian Basin // Deep-Sea Research I. V. 53. P. 14−27.
- Damare S., Raghukumar C., Muraleedharan U., Raghukumar S., 2006. Deep-sea fungi as a source of alkaline and cold-tolerant proteases // Enzyme and Microbial Technology. V. 39. № 2. P. 172−181.
- De Pillis G. D., Wariishi H., Gold M. H., Ortis de Montellano P. R., 1990. Inactivation of lignin peroxidase by phenilhydrazine and sodium azide. // Arch Biochem. Biophys. V. 280. № l.P. 217−223.
- De Souza D. Т., Tiwari R., Sah A. K., Raghukumar C., 2006. Enhanced production of lac-case by a marine fungus during treatment of colored effluents and synthetic dyes // Enzyme and Microbial Technology. V. 38. № 3−4. P. 504−511.
- Domsch К. H., Gams W., Anderson T-H., 1980. Compendium of Soil Fungi. Academic Press, London.
- Dvorak M., Travm’k P., 1976. Uptake of microperoxidase by segmenting rat ova in vitro. // Histochemistry and Cell Biology. V. 47. № 3. P. 257−262.
- Edens W. A., Goins T. Q., Dooley D., Henson J. M., 1999. Purification and Characterization of a Secreted Laccase of Gaeitmannomyces graminis var. tritici. И Appl. Environ. Microbiol. V. 65. P. 3071−3074.
- Egloff M.-P., Uppenberg J., Haalch L., van Tilbeurgh H., 2001. Crystal structure of maltose phosphorylase from Lactobacillus brevis: unexpected evolutionary relationship with glucoamilases. // Structure. V. 9. P. 689−697.
- Emerson S., Hedges J. I., 1988. Processes controlling the organic carbon content of open ocean sediments. // Paleoceanography V. 3. P. 621−634.
- Emerson S., Hedges J. I., 2003. Sediment diagenesis and benthic flux. // In: Treatise on Geochemistry. V. 6. Amsterdam: Elsevier. P. 293−319.
- Eriksson K.-E. L., Blanchette R. A., Ander P., 1990. Microbial and Enzymatic Degradation of Wood Components. Berlin: Springer-Verlag. 398 p.
- Evans C. S., 1987. Lignin degradation. // Progress Biochemistry. V. 22. № 4. P. 102−105.
- Fair G. M., Geyer J.C., 1954. Water Supply and Wastewater Disposal. N. Y.: Wiley. 937 p.
- Fischer J. P., Ferdelman T. G., Hondt S. D., Ray H., Wenzhofer F., 2009. Oxygen penetration deep into the sediment of the South Pacific gyre // Biogeosciences Discuss. V. 6. P. 3159−3186.
- Flaig W., 1964. Effects of microorganisms in the transformation of lignin to humic substances. // Geohim. Cosmochim. Acta. Y. 28. P. 1523−1535.
- Flory P. J., 1953. Principles of Polymer Chemistry. New York. 672 p.
- Forney L. Y., Reddy C. A., Tien M., Aust S. D., 1982. The involvement of hydroxyl radical derived from hydrogen peroxide on lignin degradation by the white-rot fungus Phane-rochaete chrysosporiam. // J. Biol. Chem. V. 257. P. 11 455−11 462.
- Freudenberg K., Neish A. C., 1986. Constitution and Biosynthesis of Lignin. Berlin. 120 p.
- Gerardino A., Notargiacomo A., Morales P., 2003. Laser assisted deposition of nanopat-terned biomolecular layers. // Microelectronic Engineering. Proceedings of the 28th International Conference on Micro- and Nano-Engineering. V. 67−68. P. 923−929.
- Gidh A, Talreja D, Vinzant Т. B, Williford Т. C, Mikell A., 2006. Detailed analysis of modifications in lignin after treatment with cultures screened for lignin depolymerizing agents. // Appl. Biochem. Biotechnol. Mar. V. l 31. № 1−3. P. 829−843.
- Glasser W. G., Glasser H. R., 1981. The evolution of lignin’s chemical structure by experimental and computer simulation techniques. // Paperi ja Puu. V. 63. P. 71−82.
- Goldhaber M.B., Aller R.C., Cochran J.K., Rosenfeld J.K., Martens C.S., Berner R.A., 1977. Sulfate reduction, diffusion, and bioturbation in Long Island Sound sediments: report of the FOAM Group II American Journal of Science. V. 277. P. 193−237.
- Grundmanis V., Murray J. W., 1982. Aerobic respiration in pelagic marine sediments. // Geochim. Cosmochim. Acta. V. 46. P. 1101−1120.
- Hakulinen N., Kiiskinen L. L., Kruus K., Saloheimo M., Paananen A., Koivula A., Rouvi-nen J., 2002. Crystal structure of a laccase from Melanocarpus albomyces with an intact trinuclear copper site. //Nat. Struct. Biol. V. 9. P.601−605.
- Harada K., Hisanaga Т., Tanaka K., 1990. Photocatalytic degradation of organophosphorous insecticides in aqueous semiconductor suspensions. // Water Res. V. 24. № 11. P. 1415−1417.
- Harvey P. J., Palmer J. M., 1990. Oxidation of compound by ligninase. // J. Biotechnol. V.13. № 2−3. P. 169−179.
- Hatakka A., 1994. Ligninolytic enzymes from selected white-rot fungi: production and role in lignin degradation. // FEMS Microbiol. Rev. V.13. P. 125−135.
- Hedges J. I., Oades J. M., 1997. Comparative organic geochemistries of soils and marine sediments. // Org. Geochem. V. 27. № 7/8. P. 319−361.
- Heinfling A., Martinez M. J., Martinez A. T. et al., 1998a. Purification and characterization of peroxidases from the dye-decolorizing fungus Bjerkandera adusta. И FEMS Microbiol. Rev. V. 165. P. 43−50.
- Heinfling A., Ruiz-Duenas F. J., Martinez M. J. et al., 1998b. A study on reducing substrates of manganese-oxidizing peroxidases from Pleurotus eryngii and Bjerkandera adusta. IIFEBS Lett. V. 428. P. 141−146.
- Henriksen A., Smith А. Т., Gajhede M., 1999. The structures of the horseradish peroxidase C-ferulic acid complex and the ternary complex with cyanide suggest how peroxidases oxidize small phenolic substrates. // J. Biol. Chem. V. 274. P. 35 005−35 011.
- Но T.C., Aris R., 1987. On apparent second-order kinetics // American Institute Chemical Engineering Journal. V. 33. P. 1050−1051.
- Jorgensen В. В., 1979. A comparison of methods for the quantification of bacterial sulfate reduction in coastal marine sediments: II. Calculation from mathematical models. // Geo-microbiol. J. V.l. P. 29−47.
- Keil R. G., Kirchman D. L., 1994. Abiotic transformation of labile protein to refractory protein in sea water. // Mar. Chem. V. 45. P. 187−196.
- Kimura Y., Asada Y., Kuwahara M., 1990. Screening of basidiomycetes for lignin peroxidase genes using a DNA probe. // Appl. Microbiol, and Biotechnol.V.32. № 4. P.436−442.
- Kirk Т. K., Farell R. L., 1987. Enzymatic «combustion»: the microbial degradation of lignin. // Ann. Rev. Microbiol. V. 41. P. 465−505.
- Kohlmeyer J., Kohlmeyer E., 1979. Marine Mycology. The higher fungi. Academic Press, New York.
- Kuila D., Tien M., Fee J. A., Ondrias M. R., 1985. Resonance raman spectra of extracellular ligninase: evidence for a heme active site similar to those of peroxidases. // Biochemistry. V. 24. P. 3394−3397.
- Kusakabe K., Aso S., Hayashi J.-I. et al., 1990. Decomposition of humic acid and reduction of trihalomethane formation potential in water by ozone with UV irradiation. // Water Res. V. 24. № 6. P. 781−785.
- Lai Yaun-Zong, Sarkanen К. V., 1975. Structural variation in dehydrogenation polymers of coniferyl alcohol. // Cellul. Chem. Technol. V. 9. № 3. P. 239−245.
- Li X. Wei, Z. Zhang, M. Peng, X. Yu, G. Teng, M. Gong., 2007. Crystal structures of? coli laccase CueO at different copper concentrations. // Biochem. Biophys. Res. Commun. V. 354. P. 21−26.
- Liwarska-Bizukojc E., Bizukojc M., Ledakowicz S., 2002. Kinetics of the aerobic biological degradation of shredded municipal solid waste in liquid phase. // Water Res. V. 36. P. 2124−2132.
- Lorenz R., Molitoris H.P., 1992. High-pressure cultivation of marine fungi: cultivation experiments // In: Balny C., Hayashi R., Masson, P. (Eds.). High pressure and biotechnology. John Libbey & Co., London. P. 315−319.
- Maehly A., 1955. Plant peroxidase, in methods in enzimology. V.II. Academic Press. NY.
- Martinez A.T., 2002. Molecular biology and structure-function of Hgnin-degrading heme peroxidases. // Enzyme and Microbial Technology. V. 30. P. 425−444.
- Medvedeva S. A., Kanitskaya L. V., Volchatova I. V., Turchaninov V. K., 2000. Biotransformation of Aspen lignin by the fungus Trametes villosus. И Chemistry of Natural Compounds. V. 36, №. 4. P. 411- 415.
- Mester Т., Field J. A., 1998. Characterization of a novel manganese peroxidase-lignin peroxidase hybrid isozyme produced by Bjerkandera species strain BOSS55 in the absence of manganese. // J. Biol. Chem. V. 273. P. 15 412−15 417.
- Mester Т., Tien M., 2001. Engineering of a manganese-binding site in lignin peroxidase isozyme H8 from Phanerochaete chrysosporium. II Biochem. Biophys. Res. Commun. V. 284. № 3. P. 723−728.
- Metcalfe C. L., Macdonald I. K., Murphy E. J., Brown K. A., Raven E. L., Moody P. С. E., 2008. The Tuberculosis Prodrug Isoniazid Bound to Activating Peroxidases. // J. Biol. Chem. V. 283. P. 6193.
- Middelburg J. J., 1989. A simple rate model for organic matter decomposition in marine sediments. // Geochim. Cosmochim. Acta. V. 53. P. 1577−1581.
- Moser С. С., Keske J. M., Warncke К. et al., 1992. Nature of biological electron transfer. // Nature (London). V. 355. № 6362. P. 796−802.
- Miiller P.J., Mangini A., 1980. Organic carbon decomposition rates in sediments of the Pa1. ЛЛА Л-JIcific manganese nodule belt dated by Th and Pa // Earth and Planetary Science Letters. Y. 51. P. 94−114.
- Nguyen R., Harvey H. R., 2001. Preservation of protein in marine systems: Hydrophobic and other noncovalent associations as major stabilizing forces. // Geochim. Cosmochim. Acta. V. 65. P. 1467−1480.
- Nimz H., 1974. Beech lignin-proposal of a constitutional scheme. // Angew. Chem. (Internal. Edit.). V. 13. № 5. P. 313−321.
- Ogawa H., Tanoue E., 2003. Dissolved Organic Matter in Oceanic Waters. // J. Oceanography. V. 59. P. 129−147.
- Pantoja S., Lee C., 1999. Molecular weight distribution of proteinaceous material in Long Island Soud sediments. // Limnol. Oceanogr. V. 44. P. 1323−1330.
- Paul E. A., Clark F. E., 1989. Soil microbiology and biochemistry. San Diego, etc.: Acad-press. 274 p.
- Pfeifer P., Avnir D., 1983a. Chemistry in noninteger dimensions between two and three. I. Fractal theory of heterogeneous surfaces. // J. Chem. Phys. V. 79. P. 3558−3565.
- Pfeifer P., Avnir D., 1983b- Chemistry in noninteger dimensions between two and three. II. Fractal surfaces of adsorbents. // J. Chem. Phys. V. 79. P. 3566−3571.
- Piontek K., Antorini M., Choinowski Т., 20 021 Crystal structure of a laccase from the fungus Trametes versicolor at 1.90-A resolution containing a full complement of coppers. I I J. Biol. Chem. V. 277. P. 37 663−37 669.
- Poulos T. L., Edwards S. L., Wariishi H., Gold M. H., 1993. Ciystallographic refinement of lignin peroxidase at 2 A. // J. Biol. Chem. V. 268. P. 4429−4440.
- Raghukumar C., Raghukumar S., Sharma S., Chandramohan D., 1992. Endolithic fungi from deep-sea calcareous substrata: isolation and laboratory studies // In: Desai B.N. (Ed.). Oceanography of the Indian Ocean. Oxford IBH Publ., New Delhi.
- Raghukumar C., Raghukumar S., Sheelu G., Gupta S. M., Nath B. N., Rao B. R., 2004. Buried in time: culturable fungi in a deep-sea sediment core from the Chagos Trench, Indian Ocean // Deep-Sea Research I. V. 51. P. 1759−1768
- Reimers C.E., 1982. Organic matter in anoxic sediments on Central Peru: relations of porosity, microbial decomposition and deformation properties // Marine Geology. V. 46. P. 175−197.
- Reimers C.S., Suess E., 1983. The partitioning of organic carbon fluxes and sedimentary organic matter decomposition rates in the ocean // Marine Chemistry. V. 13. P. 141−168.
- Roth F.J., Orpurt P.A., Ahearn D.J., 1964. Occurrence and distribution of fungi in a subtropical marine environment // Canadian Journal of Botany. V. 42. P. 375−383.
- Ruiz-Duerias F.J., Martinez M.J., Martinez A.T., 1999. Heterologous expression of Pleurotus eiyngii peroxidase confirms its ability to oxidize Mn2+ and different aromatic substrates. // Appl. Environ. Microbiol. V. 65: P. 4705−4707.
- Sabine L. C., Feely R. F., Wanninkhof R., 2005. The global ocean carbon cycle: inventories, sources and sinks. http://www.pmel.noaa.gov/co2/QCO Report/OCQ-2005.pdf211.212.213.214.215.216.217.218.219.220,221,222.223,224,225,226,227,228,229,
- Sakakibara M. A., 1991. Chemistry of lignin. Wood and cellulosic chemistry// Ed. D.N.-S.
- Hon and N. Shiraishi. N.Y. and Basel: Marcel Dekker. P. 111−168.
- Sakkas V. A., Lambropoulou D. A., Albanis T. A., 2002a. Photochemical degradationstudy of irgarol 1051 in natural waters: influence of humic and fulvic substances on thereaction. //J. Photochem. Photobiol., A: Chem. V. 147. P. 135−141.
- Sakkas V. A., Lambropoulou D. A., Albanis T. A., 2002b. Study of chlorothalonil photodegradation in natural waters and in the presence of humic substances. // Chemosphere. V.48. P. 939−945.
- Schink В., Philipp В., Muller J., 2000. Anaerobic degradation of phenolic compounds. // Naturwissenschaften. V. 87. P. 12−23.
- Schoemaker H. E., Lundell Т. K., Floris R. et al., 1994. Do carbohydrates play a role in the lignin peroxidase cycle? Redox catalysis in the endergonic region of the driving force. // Bioorg. Med. Chem. V. 2. № 6. P.509−519.
- Shaw T.J., 1988. The early diagenesis of transition metals in nearshore sediments. Ph. D. dissertation. San Diego: University of California. 164 p.
- Sheng D., Gold M. H., 1998. Irreversible oxidation of ferricytochrome с by lignin peroxidase. // Biochemistry. V. 37. № 7. P. 2029−2036.
- Sheng D., Gold M. H., 1999. Oxidative polymerization of ribonuclease A by lignin peroxidase from Phanerochaete chrysosporium. Role of veratryl alcohol in polymer oxidation. 11 Eur. J. Biochem. V. 259. № 3. P. 626−634.
- Sjostrom E., 1981. Wood chemistry: fundamentals and applications. N.Y., London, Toronto, Sydney: Acad. Press. 223 p.
- Stoychev I., Homolka L., Nerud F., Lis L., 1998. Activities of ligninolytic enzymes in some white-rot basidiomycete strains after recovering from cryopreservation in liquid nitrogen. // Antonie van Leeuwenhoek. V. 73. P. 211−214.
- Sundaramoorthy M., Kishi K., Gold M. H., Poulos T. L., 1994. Preliminary crystallograph-ic analysis of manganese peroxidase from Phanerochaete chrysosporium. // J. Mol. Biol. V. 238. P. 845−848.
- Sundaramoorthy M., Youngs H. L., Gold M. H., Poulos T. L, 2005. High-Resolution Crystal Structure of Manganese Peroxidase: Substrate and Inhibitor Complexes. // Biochemistry V. 44. P. 6463−6470.
- Tonon F., Prior de Castro C, Odier E., 1990. Nitrogen and carbon regulation of lignin peroxidase and enzymes of nitrogen metabolism in Phanerochaete chrysosporium // Exp. Mycol. № 14. P. 243−254.
- Tuor U., Winterhalter K., Fiechter A., 1995. Enzims of white-rot fungi involved in lignin degradation and ecological determination for wood decay. // J. Bio techno logy. V.41. P. l-17
- Turner R. D., 1973. Wood-boring bivalves, opportunistic species in the deep-sea // Science. V. 180. P. 1377−1379.
- Umezawa Т., Higuchi Т., 1988. Cleavages of aromatic ring and side Chain of a (-0−4) lignin substructure model trimer by lignin peroxidase. // Mokuzai Gakkaishi. V. 34. № 11. P. 929−933.
- Urzua U., Larrondo L. F., Lobod S. et al., 1995. Oxidation reactions catalyzed by manganese peroxidase isoenzymes from Ceriporiopsis subvermispora. II FEBS Lett. V. 371. P. 132−136.
- Vetting M. W., Ohlendorf D. H., 2000. The 1.8 A crystal structure of catechol-1,2-dioxy-genase reveals a novel hydrophobic helical zipper as a subunit linker. // Structure. № 8. P. 429−440.
- Waldner R., Leisola M. S. A, Fiechter Armin., 1988. Comparison of ligninolytic activities of selected white-rot fungi. // Appl. Microbiol, and Biotechnol. V.29. № 4. P. 400−407.
- Wang G.-S., Liao C.-H., Wu F.-J., 2001. Photodegradation of humic acids in the presence of hydrogen peroxide. // Chemosphere. V.42. P.379−387.
- Wapples D.W., Sloan J.R., 1980. Carbon and nitrogen diagenesis in deep-sea sediments // Geochim. Cosmochim. Acta. V. 44. P. 1463−1470.
- Wariishi H., Akileswaran L., Gold M. H., 1988. Phanerochaete chrysosporium: spectral characterization of the oxidized states and the catalytic cycle. // Biochemistry. V. 27. P. 5365−5370.
- Wariishi H., Dunford H. В., MacDonald D. I., Gold M. H., 1989a. Manganese peroxidase from the lignin degrading basidiomycete Phanerochaete chrysosporium. Transient state kinetics and reaction mechanism. // J. Biol. Chem. V. 264. P. 3335−3340.
- Wariishi H., Valli K., Renganathan V., Gold M. H., 1989b. Thiol-mediated oxidation of nonphenolic lignin model compounds by manganese peroxidase of Phanerochaete chrysosporium. //J. Biol. Chem. V. 264. № 24. P. 14 185−14 191.
- Wariishi H., Gold M.H., 1990. Lignin peroxidase compound III. Mechanism of formation and decomposition. // J. Biol. Chem. V. 265. № 4. P. 2070−2077.
- Westrich J.T., 1983. The consequences and controls of bacterial sulfate reduction in marine sediments. Ph. D. dissertation. New Haven, CT: Yale University. 530 p.
- Westrich J. Т., Berner R. A., 1984. The role of sedimentary organic matter in bacterial sulfate reduction: The G model tested. II Limnol. Oceanogr. V. 29. № 2. P. 236−249.
- Wilking J. N. Graves S. M., Chang С. В., Meleson K., Lin M. Y., Mason T. G., 2006. Dense cluster formation during aggregation and gelation of attractive slippery nanoemul-sion droplets. II Phys. Rev. Lett. V. 96. No. 1. 15 501 (4).
- Yoshihara K., Umezawa Т., Higuchi Т., Nishiyama M., 1988. Degradation of non-phenolic -0−4 lignin structure model compound by Coriolus hirsutus. II Agricul. Biol. Chem. V. 52. № 9. P. 2345−2346.
- Zaunstock В., Molitoris H.P., 1995. Germination of fungal spores under deep-sea conditions // Abstr. VI International Marine Mycology Symposium. Portsmouth.