Помощь в учёбе, очень быстро...
Работаем вместе до победы

Микроэкологические основы коррекции «дисбиозной» микробиоты человека

Диссертация: Микроэкологические основы коррекции «дисбиозной» микробиоты человека
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Для количественного описания видового разнообразия сообществ симбиотических микроорганизмов толстой кишки человека проведены расчеты с использованием общепринятых в экологии индексов: видового разнообразия Шеннона, доминирования Симпсона, видового богатства Маргалефа и выравненное&tradeПиелу. Для подтверждения сделанных обобщений и получения статистически корректных оценок различий (t-критерий… Читать ещё >

Содержание

  • Глава 1. Обзор литературы. Современные аспекты синэкологии симбиотических микроорганизмов толстой кишки человека и принципы коррекции микробиоты с помощью препаратов из штаммов-симбионтов
    • 1. 1. Видовая структура биотических сообществ
    • 1. 2. Симбиотические сообщества как объекты биоэкологических исследований
    • 1. 3. Роль микробиоты в процессе жизнедеятельности макроорганизма
    • 1. 4. Структурная организация микробиоценоза пищеварительного тракта
    • 1. 5. Функции нормальной микрофлоры пищеварительного тракта
    • 1. 6. Формирование микрофлоры у детей
    • 1. 7. Качественный и количественный состав нормальной микрофлоры ЖКТ
    • 1. 8. Дисбиоз кишечника
    • 1. 9. Средства коррекции микрофлоры
    • 1. 10. Молекулярно-биологические методы для индикации, идентификации пробиотических микроорганизмов и типирования промышленно-значимых штаммов
    • 1. 11. Современные принципы коррекции дисбиозов различных биотопов организма человека
  • СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
  • Глава 2. Материалы и методы исследований
    • 2. 1. Дизайн исследования
    • 2. 2. Объем экспериментальных данных
    • 2. 3. Методы изучения видового состава и численности симбиотических микроорганизмов
      • 2. 3. 1. Классические микробиологические методы
      • 2. 3. 2. Методика молекулярно-генетического анализа
      • 2. 3. 3. Метод экспертных оценок
      • 2. 3. 4. Клинические методы исследований, использованные в работе для оценки эффективности пробиотиков
      • 2. 3. 5. Методы статистического анализа
      • 2. 3. 6. Методы ранговых распеределений
      • 2. 3. 7. Методы экологического анализа
  • Глава 3. Синэкологический анализ симбиотичнской микробиоты толстой кишки людей разных возрастных групп
    • 3. 1. Выбор параметров оценки состояния микробиоценоза толстой кишки
    • 3. 2. Особенности возрастной динамики численности симбиотических микроорганизмов толстой кишки здоровых" людей
      • 3. 2. 1. Характеристика микрофлоры просвета толстой кишки здоровых" детей
      • 3. 2. 2. Характеристика микрофлоры просвета толстой кишки здоровых" взрослых
    • 3. 3. Особенности возрастной динамики численности симбиотических микроорганизмов толстой кишки больных" людей
    • 3. 4. Сравнение возрастной динамики численности симбиотических микроорганизмов толстой кишки здоровых" и «больных» людей
      • 3. 4. 1. Сравнительная характеристика микрофлоры просвета толстой кишки «здоровых» и «больных» детей
      • 3. 4. 2. Сравнительная характеристика микрофлоры просвета толстой кишки «здоровых» и «больных» взрослых
    • 3. 5. Синэкологический анализ микробиоценозов толстой кишки «здоровых» и «больных» людей разных возрастных групп
      • 3. 5. 1. Анализ ранговых распределений
      • 3. 5. 2. Результаты кластеризации исходного массива данных бактериологических исследований
      • 3. 5. 3. Результаты статистического анализа с использованием критериев Манна-Уитни и Краскала-Уоллиса
      • 3. 5. 4. Анализ видового разнообразия
  • Глава 4. Теоретические и экспериментальные основы отбора производственных штаммов-продуцентов пробиотиков
    • 4. 1. Изучение биологических свойств штаммов-продуцентов пробиотиков
      • 4. 1. 1. Определение антагонистической активности пробиотических штаммов лактобацилл
      • 4. 1. 2. Изучение биосовместимости штаммов лактобацилл и бифидобактерий
      • 4. 1. 3. Определение антагонистической активности лактобацилл к грибам рода Candida
      • 4. 1. 4. Изучение выживаемости молочнокислых бактерий в кислой среде
      • 4. 1. 5. Характеристика антибиотикорезистентности стартерных культур пробиотиков
    • 4. 2. Молекулярно-генетическая идентификация штаммов-продуцентов
      • 4. 2. 1. Разработка методики индикации бактерий рода Lactobacillus и Bifidobacterium на основе ПЦР гена 16S рРНК
      • 4. 2. 2. Разработка методики видовой идентификации лактобацилл с использованием гнездового варианта ПЦР
      • 4. 2. 3. Изучение динамики роста лактобацилл в аксеничной и смешанной культуре
      • 4. 2. 4. Разработка алгоритма контроля динамики культивирования лактобацилл в смешанной культуре методом ПЦР
  • Глава 5. Конструирование новых жидких пробиотиков как средств коррекции микробной экосистемы человека
    • 5. 1. Конструирование и разработка технологии производства жидкого бактериального концентрата на основе лактобацилл «LL-комплекс»
    • 5. 2. Конструирование и разработка технологии производства пробиотика в форме БАД к пище на основе лакто-и бифидобактерий «LB-комплекс»
    • 5. 3. Конструирование и разработка технологии производства жидкого бактериального концентрата на основе лакто-и бифидобактерий «LB-комплекс S»
  • Глава 6. Бактериологическая и клиническая эффективность созданных жидких пробиотиков
    • 6. 1. Изучение эффективности включения синбиотика «ЬЬ-комплекс» в схемы лечения гастродуоденальной и аллергологической патологии у детей
    • 6. 2. Изучение эффективности включения синбиотика «ЬЬ-комплекс» в программы лечения воспалительных заболеваний органов малого таза (ВЗОМТ), осложненных кандидозом
    • 6. 3. Анализ результатов использования нового симбиотика «ЬВ-комплекс» в лечебных программах выхаживания недоношенных новорожденных в педиатрическом стационаре
    • 6. 4. Эффективность включения пробиотиков «ЬВ-комплекс» и «ЬЬ-комплекс» в программы оздоровления беременных женщин и детей на территории г. Н.Новгорода
    • 6. 5. Эффективность использования пробиотика «ЬВ-комплекс» в системе оздоровительно-реабилитационных мероприятий в ДОУ
    • 6. 6. Оценка эффективности использования БАД к пище
  • ЬВ-комплекс" в схемах антихеликобактерной терапии
    • 6. 7. Изучение эффективности включения симбиотика «ЬВ-комплекс Б» в алгоритм лечения туберкулезной инфекции у детей
    • 6. 8. Изучение эффективности использования симбиотика «ЬВ-комплекс Э» в программе оздоровления студентов старших курсов медицинского ВУЗа
  • Глава 7. Разработка алгоритма комплексной коррекции дисбиозной микробиоты желудочно-кишечного и репродуктивного тракта человека

Микроэкологические основы коррекции «дисбиозной» микробиоты человека (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Актуальность работы. Изучение микробной эндоэкологии человека (микроэкологии) относится к одному из наиболее актуальных направлений прикладных и фундаментальных исследований в области экологии, биологии, и медицины. Это связано с важной ролью, которую играет микробиота в жизнедеятельности макроорганизма, а также с повсеместно наблюдаемыми изменениями экологии микроорганизмов, повлекшими нарастание удельного веса заболеваний, вызываемых т.н. микробами-оппортунистами. В связи с этим большой интерес представляет изучение видового разнообразия и структуры сообщества симбиотических микроорганизмов человека. В организме человека наибольшим видовым богатством характеризуется микробное сообщество толстой кишки. Известно, что нет ни одной функции макроорганизма, на которую прямо или косвенно не влиял бы микробиоценоз этого биотопа (Ткаченко, 2009).

Следует отметить, что, несмотря на большое количество работ, посвященных микробиоценозам кишечника, изучением качественного и количественного состава микрофлоры толстой кишки у «здоровых» людей различных возрастных групп занималось не так много исследователей, а выбранные группы «здоровых» были довольно малочисленны. Это обусловлено тем, что понятие «здоровье» не имеет четкого определения и носит, скорее, философский характер, в связи с чем затруднительно формировать группы «действительно здоровых» людей для определения «нормальных» показателей микрофлоры (Перетц, 1955; Геймберг, 1964; Гончарова, Вилыпанская, 1968; Ленцнер, 1968; Лизько, 1970; Марко, 1970; Куваева, 1976; Эпштейн-Литвак, Вилыпанская, 1977; Козлова, 1978; Наепе1, 1970). Другой аспект этой темы сводится к частным вопросам: частоте обнаружения того или иного вида микроорганизмов в микробиоте, микрофлоре определенных возрастных групп при различной патологии и т. п., обобщенных в ОСТ 91 500.11.0004−2003 «Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника».

В настоящее время появились новые доступные высокотехнологичные методы исследований, позволяющие более подробно изучать видовую структуру симбиотических сообществ микробиоты организма человека. Современные информационные технологии дают возможность структурировать обширные базы данных, оценивать как множество единичных признаков, так и их совокупность в многомерном пространстве показателей, проводить статистический и экологический анализ. В частности, экологический анализ успешно применен при изучении эндоэкологии симбиотических сообществ микробиоценозов миндалин человека (Бухарин и др., 2011). Однако, масштабные исследования видовой структуры симбиотических сообществ микробиоценозов толстой кишки человека до настоящего времени не проводились. Поэтому актуальным вопросом является изучение закономерностей, управляющих динамикой численности популяций микроорганизмов в составе микробиоты, ее пространственной и видовой структурой, изучение разнообразных типов межпопуляционных отношений, обеспечивающее образование сообществ, как систем с относительно стабильным видовым составом. Понимание и теоретическое осмысление экологических закономерностей функционирования симбиотической микрофлоры является необходимой предпосылкой для развития и совершенствования способов влияния на ее формирование и нормализацию с помощью различных форм пробиотиков из представителей резидентной микрофлоры. Однако, широкое распространение дисбиотических нарушений ставит на повестку дня важность разработки методов комплексной коррекции микробиоты, направленных не только на восстановление эволюционно обусловленных микробных популяций, но и обеспечивающих воздействие на макроорганизм в целом.

Цель работы: на основании изучения экологических закономерностей формирования сообществ симбиотических микроорганизмов толстой кишки «здоровых» и «больных» людей разных возрастных групп, проживающих на территории крупного промышленного мегаполиса, создать новые пробиотики в форме бактериальных концентратов, восстанавливающие эволюционно обусловленную микробиоту человека.

Задачи исследования:

1. Изучить видовую структуру сообществ симбиотических микроорганизмов толстой кишки «здоровых» и «больных» людей разных возрастных групп (от периода новорожденности до старости), проживающих на территории города Нижнего Новгорода.

2. Провести выбор параметров оценки состояния микробиоценозов толстой кишки.

3. Создать базу данных результатов исследования качественного и количественного состава микрофлоры толстой кишки больных и здоровых людей разных возрастных групп, и систему управления базой данных для сбора, хранения, статистической обработки и графического представления данных.

4. На основе анализа результатов структурирования базы данных произвести отбор видов микроорганизмов, перспективных в качестве стартерных культур пробиотиков.

5. Изучить биологические и молекулярно-генетические свойства микроорганизмов продуцентов пробиотиков с целью подбора производственно перспективных штаммов.

6. Сконструировать новые пробиотики для коррекции микробиоты человека и отработать технологии их производств.

7. Оценить эффективность введения новых пробиотиков в комплексы профилактических, лечебно-оздоровительных и реабилитационных мероприятий у разных возрастных групп населения с различными нозологическими формами заболеваний, протекающих на фоне «дисбиозной» микробиоты.

8. Разработать алгоритмы комплексной коррекции микробиоты желудочно-кишечного тракта разных возрастных групп населения.

Научная новизна. Впервые создана база данных результатов бактериологических исследований качественного и количественного состава микрофлоры толстой кишки «здоровых» и «больных» людей разных возрастных групп, проживающих на территории г. Нижнего Новгорода, и система управления базой данных, позволившая провести синэкологический анализ сообществ симбиотических микроорганизмов (Свидетельство о госрегистрации № 2 011 614 233 РФ). Доказано, что в процессе формирования микрофлоры кишечника человека участвуют как аэробные, так и анаэробные микроорганизмы, причем в равных соотношениях с первого часа жизни, процесс нарастания анаэробной компоненты (представители родов Lactobacillus, Lactococcus и Bifidobacterium) идет параллельно с ростом условно-патогенных микроорганизмов и кишечной палочки, минуя стадию «трансформации». С наибольшей частотой 92% оппортунистические микроорганизмы в значимых количествах (> 105 КОЕ/г) выделяются в группе «здоровых» детей в возрасте от одного месяца до года. Частота обнаружения УПМ в микрофлоре толстой кишки здорового человека начинает снижаться после первого года жизни и составляет 18% в возрастной группе 60 лет и старше. Доказано, что общее количество симбиотических микроорганизмов различных видов, выделяемых из толстой кишки «здоровых» людей во всех возрастных группах, на один-два порядка выше, чем у больных (р<0,05), за исключением группы 60 лет и старше.

Впервые на основе гнездовой ПЦР гена 16S рРНК разработана методика индикации и идентификации симбиотических видов бактерий родов Lactobacillus и Bifidobacterium и алгоритм контроля динамики роста стартерных культур при совместном периодическом и непрерывном культивировании (патент РФ № 2 375 459, 2008).

Впервые выявлен феномен симбиоза по типу мутуализма двух штаммов Ь. р1ап1ашт 8 11А-3 и Ь. fermentum 39, обуславливающий более высокую анти-микотическую активность штаммов, выращенных в совместной культуре, чем при монокультивированиии (Патент РФ № 2 280 465, 2004).

В результате углубленного изучения биологических свойств штаммовпродуцентов впервые создан ряд гипоаллергенных жидких сими синбиотиков на основе гидролизатов белка: «ЬЬ-комплекс», «ЬВ-комплекс» и «ЬВ-комплекс 8» (Патент РФ № 2 280 465, 2004; патент РФ № 2 192 269, 2000 г), причем микробный консорциум стартерных культур подобран с учетом хромосомно опосредованной резистентности отдельных штаммов к антибиотикам 14 фармакологических групп, наиболее часто используемых в клинической практике, что делает возможным применение пробиотиков на фоне антибактериальных препаратов в комплексной терапии различных нозологических форм заболеваний.

Впервые разработан алгоритм коррекции дисбиоза желудочно-кишечного и репродуктивного трактов человека, осложняющего течение основного заболевания. Сформулированы основные направления комплекса мероприятий, направленных на коррекцию нарушений видовой структуры и восстановление численности популяции симбиотической резидентной микрофлоры (патент РФ № 2 193 398, 2002).

Научно-практическая значимость работы. В ходе выполнения работы получены новые знания о формировании симбиотической микробиоты желудочно-кишечного тракта человека, выявлены возрастные особенности качественного и количественного состава микрофлоры толстой кишки «здоровых» людей, проживающих на территории мегаполиса. Полученные данные о формировании и особенностях микрофлоры людей разных возрастных групп при различных функциональных состояниях могут быть использованы для коррекции существующих критериев оценки состояния микробиоценозов человека.

Результаты работы востребованы научными, учебными, лечебно-профилактическими учреждениями и организациями медико-биологического профиля. Полученные теоретические данные используются в учебном процессе на кафедре профилактической медицины ФПКВ ГБОУ ВПО «Нижегородской медицинской академии» Минздрава РФ в циклах усовершенствования и повышения квалификации врачей.

В результате изучения комплекса биологических и молекулярно-генетических свойств культур лактои бифидобактерий отобраны штаммы-продуценты пробиотиков и использованы в качестве стартерных культур во вновь разработанных жидких сими синбиотиках «ЬЬ-комплекс», «ЬВ-комплекс», «ЬВ-комплекс 8». Разработаны технологии, оформлены пакеты нормативно-технической документации и создано производство. Алгоритм комплексной коррекции микробиоты с включением в качестве пробиотической составляющей диетотерапии новых жидких бактериальных концентратов используется в девяти лечебно-профилактических учреждениях г. Н. Новгорода в программах лечения больных с различными нозологическими формами заболеваний, осложненных дисбиозом.

Утверждены и используются на местном уровне методические рекомендации «Совершенствование санитарно-эпидемиологического надзора в акушерско-педиатрических стационарах с целью снижения младенческой заболеваемости», 1999 г. и пособие для врачей «Использование бактериальных препаратов и продуктов лечебного питания», 2000 г.

Положения, выносимые на защиту:

1. В период постнатального онтогенеза здорового человека (0−60 лет) происходят статистически значимые изменения видовой структуры микрофлоры толстой кишки, характерные для определенных возрастных групп, требующие для правильной оценки состояния микрофлоры подразделение каждой из крупных возрастных групп (0−1 год и 1год — 60 лет по ОСТ 91 500.11.0004−2003) минимум на 3 подгруппы: 24 часа — 6 суток, 7 -29 суток, 1−11 месяцев и 1год — 6 лет, 7−17 лет, 18−60 лет.

2. В процессе формирования микрофлоры кишечника человека, начиная с первого часа жизни, в равных соотношениях участвуют как аэробные (E.coli, Enterococcus spp., УПМ семейств Staphylococcaceae, Enterobacteriaceae), так и анаэробные микроорганизмы (Bifidobacterium spp., Lactobacillus spp., L. lactis), минуя стадию «трансформации».

3. С наибольшей частотой оппортунистические микроорганизмы в значимых количествах (> 105 КОЕ/г) выделяются у «здоровых» детей в возрастной группе 1−11 месяцев с последующим резким снижением в возрасте от года до 17 лет, с дальнейшим сохранением стабильно невысокой частоты выделения у взрослых.

4. Численность бактерий родов Lactobacillus и Bifidobacterium, а также Е. coli, Enterococcus spp., S. epidremidis, S. aureus, Klebsiella spp., Citrobacter spp., Proteus spp., Enterobacter spp. относится к «информационно-значимым показателям», поскольку их численность статистически значимо различается у «здоровых» и «больных» людей одного возраста и между возрастными группами, что позволяет верифицировать классификационные решения по разделению пациентов на категории «здоровые» и «больные» с учетом возраста в многомерном пространстве показателей.

5. Видовая структура сообществ симбиотических микроорганизмов толстой кишки человека, представленных фиксированным набором клинически значимых культивируемых видов, может быть описана в рамках экологического анализа при помощи канонических индексов и показателей экологического разнообразия, что свидетельствует о применимости положений современной теоретической экологии к характеристике микробиоценозов макроорганизма.

6. Выявлен феномен усиления антагонистической активности по отношению к грибам вида С. albicans совместно выращенной композиции штаммов лактобацилл L. plantarum 8RA-3 и L. fermentum 39 по сравнению с их аксеничными культурами.

7. Для контроля динамики роста стартерных культур при совместном периодическом и непрерывном культивировании целесообразно использовать метод индикации и идентификации симбиотических видов бактерий рода Lactobacillus и Bifidobacterium на основе гнездовой ПЦР гена 16S рРНК.

8. Высокая эффективность дополнения базовой терапии различных нозологических форм заболеваний, осложненных дисбиозами, новыми жидкими мультиштаммовыми пробиотиками из лактои бифидобактерий доказывает лидирующее значение последних в обеспечении образования сообществ как систем с относительно стабильным видовым составом у людей разного возраста.

Апробация работы и публикации. Основные положения диссертации доложены на всероссийской конференции с международным участием «Пробиотики и пробиотические продукты в профилактике и лечении наиболее распространенных заболеваний человека» (г. Москва, 1999) — всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Гигиена детей и подростков на пороге третьего тысячелетия. Основные направления развития» (г. Москва, 1999) — IV международном симпозиуме «Биологически активные добавки к пище: XXI век (г. Москва, 2000) — международной конференции, посвященной памяти академика РАМН и АМТН И. Н. Блохиной (г. Москва, 2001) — 1-м всероссийском конгрессе «Современные технологии в педиатрии и детской хирургии» (г. Москва, 2002) — XI Российском национальном конгрессе «Человек и лекарство», г. Москва, 19−23 апреля, 2004 г.- Международной конференция «Пробиотики, пребиотики, синбиотики и функциональные продукты питания. Современное состояние и перспективы». Форум «Новые технологии. Экология и здоровье», г. Москва, 2−4 июня, 2004. III съезде Всероссийского общества биотехнологов России, г. Москва, 25−27.10.2005. 6-м съезде научного общества гастроэнтерологов России, г. Москва, 1−3 февраля 2006; 4-м съезде биотехнологов России, г. Пущино. 5−7.12.2006; Международном конгрессе.

Пробиотики, пребиотики, синбиотики и функциональные продукты питания. Фундаментальные и клинические аспекты", г. Санкт-Петербург, 1518.05 2007; Международном форуме «Современные технологии на службе охраны здоровья россиян» в рамках выставки «Медицина^-», г. Нижний Новгород, 27.04.2010; круглом столе в рамках конференции, посвященной долгожителям Грузии в Сендайском университете (г.Сендай, Япония), 24.07.2010; конференции Японского общества по молочнокислым бактериям (г.Сендай, Япония), 26−27.07.2010; кафедре микробиологии университета Киорин (Токио), 28.07.2010; международной конференции «Пробиотики и здоровье», г. Ереван, Армения, 05−07.10.2010; Международная конференция «Пробиотики и бактериофаги как альтернатива антибиотиков», Тбилиси, Грузия, 29.06.-04.07.2012; Научно-практический конгресс с международным участием «Актуальные вопросы детской гастроэнтерологии», Киев, 28−29 ноября 2012; на XIV Международном медицинском форуме «Технологии профилактики — современный путь развития здравоохранения» 28−30 мая 2013 мая г. Н. Новгород.

По материалам диссертации опубликовано 53 работы, из них 28 в изданиях, рекомендованных ВАК.

Структура и объем диссертации

Диссертационная работа состоит из введения, 7 глав, заключения, выводов, списка цитированной литературы и приложения. Диссертация иллюстрирована 123 рисунками и 63 таблицами. Основной текст изложен на 396 страницах. Библиографический указатель включает 373 источника литературы (282 отечественных и 91 иностранных).

выводы.

1. Показано, что в процессе формирования микрофлоры кишечника человека участвуют как аэробные, так и анаэробные микроорганизмы, причем в равных соотношениях с первого часа жизни, процесс нарастания анаэробной компоненты (представители родов Lactobacillus, Lactococcus и Bifidobacterium) идет параллельно с ростом условно-патогенных микроорганизмов, E. coli и бактерий рода Enterococcus, минуя стадию «трансформации», что подтверждено результатами синэкологического анализа базы данных видового состава симбиотических микроорганизмов толстой кишки проведенного с использованием разработанной программы для ЭВМ «Автоматизированная система микробиологического мониторинга микробиоценозов желудочно-кишечного тракта (ЖКТ)».

2. Установлено, что с наибольшей частотой — в 92% случаевоппортунистические микроорганизмы в значимых количествах (> 105 КОЕ/г) выделяются в группе «здоровых» детей в возрасте от одного месяца до года. Частота обнаружения УПМ в микрофлоре толстой кишки здорового человека начинает снижаться после первого года жизни, и составляет 18% в возрастной группе 60 лет и старше. Доказано, что суммарная численность сообществ симбиотических микроорганизмов, выделяемых из толстой кишки здоровых людей во всех возрастных группах на один — два порядка выше, чем у больных (р<0,05) за исключением группы 60 лет и старше.

3. Доказано, что все экологические законы и зависимости, свойственные другим природным биотопам и популяциям, справедливы и в отношении микробиоты человека. Кроме того, все выявленные закономерности, характерные для части микробного сообщества микрофлоры толстой кишки, представленной фиксированным набором 29 показателей, учитывающих количества различных видов микроорганизмов в одном грамме субстрата, сохраняются и развиваются также и для популяции в целом.

4. Выявлено, что количество бактерий родов Lactobacillus и Bifidobacterium, а также Е. coli, Enterococcus spp, S. epidremidis, S. aureus, Klebsiella spp., Citrobacter spp., Proteus spp., Enterobacter spp. относится к «информационно-значимым показателям», то есть их численность статистически значимо различается у здоровых и больных людей одного возраста и между возрастными группами, что позволяет верифицировать классификационные решения по разделению пациентов на категории «здоровые» и «больные» с учетом возраста в многомерном пространстве показателей.

5. Разработан ряд новых жидких препаратов — сими синбиотиков из пробиотических микроорганизмов родов Lactobacillus и Bifidobacterium, что обусловлено их достоверно высокой значимостью и лидирующими позициями в численности сообществ симбиотических микроорганизмов здоровых людей всех возрастных групп (р<0,001).

6. Доказана необходимость использования в составе жидких мультиштаммовых пробиотиков консорциума биосовместимых культур с выраженной хромосомно опосредованной антибиотикорезистентностью, кислотоустойчивостью и высоким уровнем антагонизма по отношению к оппортунистическим и патогенным микроорганизмам, что подтверждается эффективностью применения пробиотиков на их основе в комплексных программах оздоровления и лечения заболеваний, отягощенных дисбиозом.

7. Выявлен феномен симбиоза по типу мутуализма двух штаммов L. plantarum 8 RA-3 и L. fermentum 39, обуславливающий более высокую противокандидозную активность штаммов, выращенных при совместном культивировании, что явилось основанием для создания нового синбиотика «LL-комплекс». Выраженное антимикотическое действие этого препарата подтверждается высокой эффективностью его применения в комплексной терапии заболеваний, осложненных дисбиозом с преимущественным выделением грибов вида Candida albicans.

8. Разработана методика валидации процесса контроля динамики роста стартерных культур с использованием гнездовой ПЦР гена 16S рРНК при совместном периодическом и непрерывном культивировании симбиотических видов бактерий рода Lactobacillus и Bifidobacterium.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

.

Обобщая изложенное в предшествующих главах, необходимо отметить, что вопрос изучения видового разнообразия микроорганизмов кишечника человека и коррекции дисбиозной микробиоты сохраняет актуальность по сей день и является предметом исследования для многих ученых, как в России, так и за рубежом. Тем не менее, многие аспекты данной проблемы еще не освещены.

В представленной работе проведен глубокий анализ качественного и количественного состава микрофлоры просвета толстой кишки 3268 человек, с использованием новых доступных информационных технологий, позволяющих рассматривать как отдельные показатели, так и их совокупность в многомерном пространстве данных.

Подробно рассмотрен и проиллюстрирован процесс формирования микрофлоры просвета толстой кишки у детей с первых часов жизни, а также особенности микробиоты в различных возрастных группах.

В ходе выполнения работы были определены критерии оценки состояния «здоровья» для каждой возрастной группы. Изучен качественный и количественный состав микрофлоры просвета толстой кишки и определены 29 показателей, характеризующих видовой состав симбиотических микроорганизмов толстой кишки человека. Затем была создана база данных результатов бактериологического исследования качественного и количественного состава микрофлоры просвета толстой кишки различных возрастных групп людей, проживающих на территории г. Нижнего Новгорода, и система управления базой данных (файл-серверная реляционная СУБД), позволяющая обрабатывать и систематизировать результаты бактериологических исследований из базы данных и проводить сравнение выборок по критериям Краскела-Уоллиса, Колмогорова-Смирнова и Манна-Уитни на уровне достоверности 0,05 (р<0,05), а также строить ЗО диаграммы, в том числе ранговые распределения, с помощью которых был проведен синэкологнческий анализ видовых сообществ симбиотических микроорганизмов.

В результате проведенных исследований показано, что в процессе формирования микрофлоры кишечника человека участвуют как аэробные, так и анаэробные микроорганизмы, причем в равных соотношениях с первого часа жизни, процесс нарастания анаэробной компоненты (представители родов Lactobacillus, Lactococcus и Bifidobacterium) идет параллельно с ростом условно-патогенных микроорганизмов, E. coli и бактерий рода Enterococcus, минуя стадию «трансформации», что подтверждено результатами синэкологического анализа базы данных видового состава симбиотических микроорганизмов толстой кишки проведенного с использованием разработанной программы для ЭВМ «Автоматизированная система микробиологического мониторинга микробиоценозов желудочно-кишечного тракта (ЖКТ)».

Установлено, что в периоде постнатального онтогенеза здорового человека (0−60 лет) происходят статистически значимые изменения видовой структуры микрофлоры толстой кишки, характерные для определенных возрастных групп, требующие для правильной оценки состояния микрофлоры подразделение каждой из крупных возрастных групп (0−11 месяцев и 1год — 60 лет) минимум на 3 подгруппы: 24 часа — 6 суток, 7−29 суток, 1−11 месяцев и 1год — 6 лет, 7−17 лет, 18−60 лет.

Показано, что с наибольшей частотой — в 92% случаевоппортунистические микроорганизмы в значимых количествах (> 105 КОЕ/г) выделяются в группе «здоровых» детей в возрасте от одного месяца до года. Частота обнаружения УПМ в микрофлоре толстой кишки здорового человека начинает снижаться после первого года жизни, и составляет 18% в возрастной группе 60 лет и старше. Доказано, что суммарная численность сообществ симбиотических микроорганизмов, выделяемых из толстой кишки здоровых людей во всех возрастных группах на один — два порядка выше, чем у больных (р<0,05) за исключением группы 60 лет и старше.

Построены ранговые распределения видовой структуры сообществ симбиотических микроорганизмов. Ранговые профили с сохранением порядка показателей «референс» группы для последующих групп сравнения наглядно демонстрируют перестройку сообществ симбиотических микроорганизмов толстой кишки. Использование ранговых профилей позволило выявить как выпадение и появление новых видов микроорганизмов в группах сравнения (качественный аспект) так и изменение их численностей (количественный аспект). Кластерный анализ общей матрицы данных позволил разделить большой объем данных на два крупных кластера соответствующих группам «здоровые» и «больные». Метод K-средних подтвердил результаты, полученные многомерным кластерным анализом.

Было доказано, что в период постнатального онтогенеза здорового человека (0−60 лет) происходят статистически значимые изменения видовой структуры микрофлоры толстой кишки, характерные для определенных возрастных групп, требующие для правильной оценки состояния микрофлоры подразделение каждой из крупных возрастных групп (0−1 год и 1год — 60 лет по ОСТ 91 500.11.0004−2003) минимум на 3 подгруппы: 24 часа — 6 суток, 7 -29 суток, 1−11 месяцев и 1год — 6 лет, 7−17 лет, 18−60 лет.

С использованием критериев Манна-Уитни и Крускала-Уолиса в каждой возрастной группе пациентов были выявлены «информационно значимые показатели» — виды микроорганизмов, которые статистически значимо различались по численности между здоровыми и больными людьми.

Установлено, что количество бактерий родов Lactobacillus и.

Bifidobacterium, а также Е. coli, Enterococcus spp, S. epidremidis, S. aureus,.

Klebsiella spp., Citrobacter spp., Proteus spp., Enterobacter spp. относится к информационно-значимым показателям", то есть их численность статистически значимо различается у здоровых и больных людей одного возраста и между возрастными группами, что позволяет верифицировать классификационные решения по разделению пациентов на категории.

334 здоровые" и «больные» с учетом возраста в многомерном пространстве показателей.

Для количественного описания видового разнообразия сообществ симбиотических микроорганизмов толстой кишки человека проведены расчеты с использованием общепринятых в экологии индексов: видового разнообразия Шеннона, доминирования Симпсона, видового богатства Маргалефа и выравненное&tradeПиелу. Для подтверждения сделанных обобщений и получения статистически корректных оценок различий (t-критерий Стьюдента) в видовом разнообразии микрофлоры толстой кишки разновозрастных групп здоровых и больных людей, был применен индекс Шеннона, для которого разработаны соответствующие алгоритмы. Доказано, что все экологические законы и зависимости, свойственные другим природным биотопам и популяциям, справедливы и в отношении микробиоты человека. Кроме того, все выявленные закономерности, характерные для части микробного сообщества микрофлоры толстой кишки, представленной фиксированным набором 29 показателей, учитывающих количества различных видов микроорганизмов в одном грамме субстрата, сохраняются и развиваются также и для популяции в целом.

Доказана достоверно высокая значимость (р<0,001) и лидирующие позиции в численности сообществ симбиотических микроорганизмов здоровых людей всех возрастных групп бактерий родов Lactobacillus и Bifidobacterium, что и обосновало проведение работ по отбору пробиотических штаммов именно из этих родов микроорганизмов.

Штаммы пробиотических микроорганизмов были изучены в соответствии с МУ 2.3.2.2789−10 «Методические указания по санитарно-эпидемиологической оценке безопасности и функционального потенциала пробиотических микроорганизмов, используемых для производства пищевых продуктов».

Определены нуклеотидные последовательности фрагмента гена 16S рРНК отобранных штаммов, полученные последовательности депонированы.

335 в международной базе данных GenBank/EMBL, отобран консорциум биосовместимых культур L. plantarum 8RA-3, L. fermentum 39, L. fermentum 90 TC-4, В. bifidum 1, В. bifidum 791, В. longum 379 (патент РФ № 2 192 269- патент РФ № 2 441 907) причем установлено, что выбранные штаммы обладают относительно высоким уровнем кислотоустойчивости.

Консорциум выбранных штаммов устойчив к действию антибактериальных препаратов 14 фармакологических групп, (штаммы в отдельности обладают различными уровнями чувствительности к антибиотикам, но всегда есть штамм с хромосомно опосредованной резистентностью к определенному препарату).

Выявлен феномен усиления антагонистической активности по отношению к грибам вида С. albicans совместно выращенной композиции штаммов лактобацилл L. plantarum 8RA-3 и L. fermentum 39 по сравнению с их аксеничными культурами (патент РФ № 2 280 465, 2004).

Создана универсальная методика индикации и точной идентификации лактобацилл и бифидобактерий на основе гнездовой мультиплексной ПЦР и системы специально подобранных олигонуклеотидных праймеров (патент РФ № 2 375 459, 2009).

Разработана методика валидации процесса контроля динамики роста стартерных культур на основе гнездовой ПЦР гена 16S рРНК при совместном, периодическом и непрерывном культивировании симбиотических видов бактерий рода Lactobacillus и Bifidobacterium и доказана целесообразность ее использования в производстве.

Сконструированы питательные основы, в качестве полупродукта которых использован гидролизат белка, обеспечивающие одинаково высокий выход биомассы штаммов-продуцентов родов Lactobacillus и Bifidobacterium, их жизнеспособность и активность в течение длительного времени (не менее 60 суток), а также сохранность и накопление ценных метаболитов.

Полученные на предыдущем этапе исследований результаты позволили создать три новых жидких пробиотика в форме БАД к пище: «LB-комплекс»,.

ЬЬ-комплекс" и «ЬВ-комплекс 8». Разработана промышленная технология ихпроизводства, оформлена и утверждена на Федеральном уровне технологическая документация.

В ходе выполнения данной работы был создан алгоритм комплексной коррекции дисбиозов с использованием вновь сконструированных пробиотиков (патент РФ № 2 193 398, 2000; № 2 184 558, 2000).

Опыт использования новых жидких пробиотиков в форме БАД к пище в алгоритме комплексной коррекции дисбиозов, осложняющих течение различных нозологичеких форм заболеваний, показал их выраженную эффективность в 22 ЛПУ г. Нижнего Новгорода. Улучшилось общее состояние микрофлоры пациентов, зафиксировано снижение количества и частоты выделения оппортунистических микроорганизмов, восстановление основного компонента нормальной микрофлоры — бифидои лактобактерий, отмечено более быстрое купирование клинических проявлений основных заболеваний по сравнению с контрольными группами, снизилось количество осложнений токсического и токсико-аллергического характера после базовой терапии. Во всех случаях отмечена хорошая переносимость новых жидких пробиотиков, полное отсутствие каких-либо побочных эффектов.

Также препараты успешно применялись в программах оздоровительно-реабилитационных мероприятий в 14 ДОУ г. Нижнего Новгорода и в программе оздоровления студентов НижГМА.

Таким образом, высокая эффективность применения алгоритма комплексной коррекции дисбиозной микробиоты с использованием вновь созданных жидких многокомпонентных пробиотиков в программах оздоровления, лечения и реабилитации пациентов подтверждает теоретические закономерности, выявленные в результате проведенного синэкологического анализа видового разнообразия симбиотических сообществ микроорганизмов просвета толстой кишки человека.

Показать весь текст

Список литературы

  1. , В.Г. Применение пробиотиков и пребиотиков в гастроэнтерологии / В. Г. Авдеев // Врач. 2008. -№ 3. — С. 24−27.
  2. , Г. Г. Пробиотики новый подход к старым проблемам / Г. Г. Алехина, А. Н. Суворов // Успехи современного естествознания. — 2007. — № 6. — С. 36−39.
  3. , A.B. Поликомпонентые пробиотические препараты -конструирование, производство и стратегия их продвижения на Российском фармацевтическом рынке: Автореф. дис.докт. биол. наук. / A.B. Алешкин -М&bdquo- 2011, 47 с.
  4. , A.M. Научно-производственная разработка новых препаратов-синбиотиков: Автореф. дис. докт. биол. наук./ A.M. Амерханова М., 2009. — 48 с.
  5. , В.А. Медицинская микология / В. А. Андреев, А. В. Зачиняева, А. В. Москалев, В. Б. Сбойчаков М.: ГЭОТАР — Медиа, 2008. — 208 с.
  6. Ю.Аруин, Л. И. Морфологическая диагностика болезней желудка и кишечника / Л. И. Аруин, Л. Л. Капуллер, В. А. Исаков. М.: «Триада-Х», 1998. — 496 с.
  7. Н.Асташкина, А. П. Современные взгляды на биологическую роль бифидо- и лактобактерий /А.П. Асташкина // Вестник Воронежского государственного университета. Серия: Химия. Биология. Фармация. -2010.-№ 1.-С. 133−139.
  8. Аутофлора человека в норме и патологии и ее коррекция: Респ. сб. под ред. И. Н. Блохиной, К. Я. Соколовой. Горький: Мед. ин-т, 1988. — 144 с.
  9. Ашбель, 3.3. Вопросы гигиены труда и состояния здоровья рабочих при промышленном применении ультразвука: Автореф. дисс.канд. мед. наук./ 3.3. Ашбель Горький, 1965. — 22 с.
  10. , Л.Г. Изучение антагонистического действия лактобацилл на Helicobacter pylori / Л. Г. Баженов, В. М. Бондаренко, Е. А. Лыкова // Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. 1997. — № 3. — С.89−91.
  11. , А. Медицинская статистика понятным языком: вводный курс / пер. с англ. под ред. В. П. Леонова / А. Банержи. М.: Практическая медицина, 2007. — 287 с.
  12. , А.А. Лизоцим: теория и практика. / А. А. Баранов, В. Г. Дорофейчук НижнийНовгород: Информатик, 1999. — 126 с.
  13. , С.В. Становление кишечного микробиоценоза у детей первого года жизни и пути его коррекции /С.В. Бельмер, Л. М. Карпина //Вопросы современной педиатрии. 2010. — Т. 9, № 4. — С. 138−142.
  14. Бифидобактерии и их использование в клинике, медицинской промышленности и сельском хозяйстве: Сборник науч. трудов. М.:1986. -207 с.
  15. , О. В. Культивирование клеток: Курс лекций / О. В. Блажевич -Мн.:БГУ, 2004.-78 с.
  16. , И.Н. Дисбактериозы / И. Н. Блохина, В. Г. Дорофейчук М.: Медицина. — 1979. — 175 с.
  17. , А.Ф. Клиническое значение количественного состава анаэробной и аэробной флоры микрофлоры кишечника при кишечных заболеваниях / А. Ф. Блюгер, Р. Я. Паберза, И. Н. Новицкий: Методические рекомендации -Рига, 1981.-9 с.
  18. Большая советская энциклопедия. М.: Сов. Энциклопедия, 1972. Т.9. -624 с.
  19. , В.М. Дисбактериозы желудочно-кишечного тракта / В. М. Бондаренко., Б. В. Боев, Е. А. Лыкова // Росс. Журн. гастроэнтерол., гепатол. и колопроктол. 1998. — № 1. — С. 66−70.
  20. В.М., Пробиотики, пребиотики и синбиотики в терапии и профилактике кишечных дисбиозов / В. М. Бондаренко, Н. М. Грачева //Фарматека. 2003. — № 7. -С. 56−63.
  21. , В.М. Метаболитные пробиотики: механизмы терапевтического эффекта при микроэкологических нарушениях / В.М. Бондаренко//Соп8Шит тесйсит. -2005. -Т. 7, № 6. С. 437−443.
  22. , В.М. Стабилизирующее действие метаболитного пробиотика Хилак форте на нормальную микрофлору кишечника / В.М. Бондаренко//Фарматека. 2005. — № 1. — С. 36−43.
  23. , В.М. Роль условно-патоогенных бактерий кишечника в полиорганной патологии человека / В. М. Бондаренко М. — Тверь: ООО «Издательство «Триада», 2007. — 64 с.
  24. , В.М. Дисбактериоз кишечника как клинико-лабораторный синдром: современное состояние проблемы / В. М. Бондаренко, Т. Н. Мацулевич ГЭОТАР-Медиа, 2007. — 304 с.
  25. , В.М., Клинический эффект жидких симбиотических биокомплексов, содержащих физиологически активные клетки бифидобактерий и лактобацилл / В. М. Бондаренко, Л.И. Шапошникова- М. Тверь: ООО «Издательство «Триада», 2007. — 95 с.
  26. , В.М. Идеи Мечникова и современная микроэкология кишечника человека / В. М. Бондаренко, В. Г. Лиходед // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2008, № 5. — С. 23−29
  27. , Т.Э. Лечебное питание при пищевой непереносимости у детей / Т. Э. Боровик, К. С. Ладодо, Н. Н. Семенова, Е. А. Рославцева, А. В. Сирота,
  28. B.И. Круглик //Педиатрия. Журнал им. Г. Н. Сперанского. 1997. — № 1.1. C. 20.
  29. , Т.Э. Использование белковых гидролизатов в практике педиатра / Т. Э. Боровик, В. А. Ревякина // Аллергология. 2004. — № 2. — С. 56−58.
  30. , Т.Э. Национальная стратегия вскармливания детей первого года жизни в российской федерации. Организация прикорма / Т. Э. Боровик, К. С. Ладодо, Г. В. Яцык, В. А. Скворцова, И. Я. Конь // Практика педиатра. -2008,-№ 9.-С. 81−87.
  31. , Т.Э. Роль смесей гидролизатов белка в прифилактике и диетотерапии пищевой аллергии у детей раннего возраста / Т. Э. Боровик, С. Г. Макарова, С. Н. Дарчия, А. В. Гамалеева // Вопросы современной педиатрии.-2010.-Т. 9,№ 1.-С. 150−156.
  32. , С.Г. Реклассификация отечественных пробиотических культур бактерий рода Lactobacillus / С. Г. Ботина, К. М. Климина, Н. В. Коробан, A.M. Амерханова, В. В. Зинченко, В. Н. Даниленко // Генетика. 2010а. — Т. 46, № 11.-С. 1306−1313.
  33. , С.Г. Молекулярно-биологические подходы к отбору бактериальных культур при создании заквасок для биотехнологии: Автореф. дис. .докт. биол. наук. / С. Г. Ботина. М., 2011. — 46 с.
  34. , И.А. Состояние микрофлоры толстой кишки у детей раннего возраста (по материалам амбулаторных исследований) / И. А. Бочков, Л. П. Юрко, Н. М. Юдицкая // Инфекционные болезни. 2004. — Т. 2, № 3. — С. 83−85.
  35. , Т.А. Влияние половых гормонов на цитадгезию лактобацилл влагалища / Т. А. Брилене // Аутофлора человека в норме и патологии и ее коррекция. Горький: ГМИ им. С. М. Кирова, 1988. — С. 59−64.
  36. , Е.М. Пробиотки: клинические и диетологические аспекты применения / Е. М. Булатова, Н. М. Богданова, Е. А. Лобанова, Т. В. Габрусская //Педиатрия. Журнал им. Г. Н. Сперанского. 2010. — Т. 89, № 3. -С. 84−91.
  37. , О.В. Межбактериальные взаимодействия / О. В. Бухарин, Б. Я. Усвяцова, Л. М. Хуснутдинова // ЖМЭИ. 2003. — № 4. — С. 3- 8.
  38. , О.В. Прогнозирование состояния микросимбиоценоза с помощью математического моделирования межмикробных взаимодействий / О. В. Бухарин, Б. Я. Усвяцов, Ю. А. Хлопко, A.M. Осипова // Экология человека. -2011. -№ 10. С.59−64
  39. , Т.Я. Динамика и функции экзометаболитов в процессе роста периодической культуры Escherichia coli М-17 / Т. Я. Вахитов, E.H. Момот, Ю. Н. Толпаров // ЖМЭИ. 2005. — № 1. — С. 16−21.
  40. , Т. Я. Регуляторные функции экзометаболитов бактерий / Т. Я. Вахитов, Л. Н. Петров // Микробиология. 2006. -Т. 75, N 4. — С. 483−488.
  41. , Ю.Е. Объективные показатели нормального развития и стстояния здоровья ребенка (нормативы детского возраста) / Ю. Е. Вельтищев, В. П. Ветров. М.: 2000. — 96 с.
  42. , A.A. Дисбактериозы актуальные проблемы медицины / A.A. Воробьев, H.A. Абрамов, В. М. Бондаренко // Вестн. Росс. АМН. — 1997. -№ 3. — С. 4−7.
  43. , A.A. Микроэкологические нарушения при клинической патологии и их коррекция бифидосодержащими пробиотиками / A.A. Воробьев, В. М. Бондаренко, Е. А. Лыкова // Вестн. РАМН. 2004. — № 2. -С. 13−17.
  44. , О.Л. Мультилокусное секвенирование информативный подоход молекулярной экологии / О. Л. Воронина, М. С. Кунда, В. Г. Лунин, А. Л. Гинцбург //Вестник Московского университета. Серия 16: Биология. -2010,-№ 4.-С. 7−10.
  45. , Ю.А. Атопический дерматит и дисбактериоз / Ю. А. Галлямова //Лечащий врач. 2010. — № 10. — С. 14−17.
  46. , В.Г. Состав нормальной кишечной микрофлоры и влияние на нее некоторых антибактериальных препаратов/ в кн.: Вопросы гигиены питания/ В. Г. Геймберг, С. Я. Михлин, Л. И. Петрушина М., 1964. — С. 90 109.
  47. , Д.Б. Эколого-экономический анализ экотоксикологической опасности промышленных предприятий города Н. Новгорода / Д. Б. Гелашвили, В. А. Басуров, Н. И. Ефимова (Зазнобина) // Экологический ежемесячник. 2001. — № 7(82). — С.22−25.
  48. , Д.Б. Структурная организация и фрактальная природа макрозообентоса малых городских водоемов/ Д. Б. Гелашвили, Д.А.
  49. , Д.И. Иудин// Поволжский экологический журнал. 2007. -№ 1. — С.1−15.
  50. , Д.Б. Мультифрактальный анализ видовой структуры сообществ мелких млекопитающих Волго-Уральского палеоценоза / Д. Б. Гелашвили, А. И. Дмитриев, Д. И, Иудин, Г. С. Розенберг, JI.A. Солнцев //Докл. РАН. 2008а. — Т. 421. — № 4. — С.562 — 566.
  51. , Д.Б. Мультифрактальный анализ видовой структуры сообществ мелких млекопитающих Нижегородского Поволжья / Д. Б. Гелашвили, Д. И, Иудин, А. И. Дмитриев, В. Н. Якимов, Г. С. Розенберг, JI.A. Солнцев // Экология. 2008b. — № 6. — С.456−461.
  52. , С. Медико-биологическая статистика / С. Гланц. М.: Практика, 1998.-459 с.
  53. , H.A. Биологические свойства лактобацилл / H.A. Глушанова // Бюллетень сибирской медицины. 2003. — № 4. — с. 50−58.
  54. , H.A. Экспериментальное обоснование новых подходов к коррекции микробиоценоза кишечника: Автореф. дис.. докт. мед. наук. /
  55. H.A. Глушанова Москва, 2005. — 56 с.
  56. , H.A. О биологической и антагонистической активности «сухого» и «жидкого» пробиотика «Наринэ»/ H.A. Глушанова, А. И. Блинов //Бюллетень Восточно-Сибирского научного центра СО РАМН. 2005. № 1.-С. 148−153.
  57. , O.A. Роль биоценоза кишечника беременной женщины во внутриутробном инфицировании плода и пути его коррекции: Дис. канд. мед. наук. / O.A. Глушкова Н. Новгород, 2000. — 202 с.
  58. , Т.Н. Опыт совместного культивирования лактобацилл / Т. Н. Головач // Микробиологический журнал. 2004. — № 6. — С.23−25.
  59. , Т.В. Диагностика дисбактериоза кишечника и его коррекция биологическими препаратами у взрослых больных острыми лейкозами / Т. В. Голосова, Т. В. Толкачева: Методические рекомендации. М., 1984. -16с.
  60. Гончар, Н. В Пробиотики в неонатологии / Н. В. Гончар //Бюллетень Федерального Центра сердца, крови и эндокринологии им. В. А. Алмазова. -2010,-№ 6.-С. 16.
  61. , Г. И. Бифидофлора человека, ее защитная роль в организме и обоснование сфер применения препарата бифидумбактерина: Автореф. дисс. д-ра. биол. наук. -М., 1982. 38с.
  62. , Г. И. Частота обнаружения В. bifidum в испражнениях взрослых людей / Г. И. Гончарова, Ф. Л. Вилыианская //ЖМЭИ. 1968. — № 7 — С.55−59.
  63. , A.B. Пробиотики: механизмы действия и эффективность при инфекциях желудочно-кишечного тракта / A.B. Горелов, Д. В. Усенко // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2006. — № 4. — С.53 — 56.
  64. , Е.М. Адгезия микробов к эпителиальным клеткам кишечника // Антибиотики и микроэкология человека и животных / Е. М. Горская М., 1998.-С. 79−82.
  65. , Н.М. Комплексное применение препарата «Хилак форте» и антибиотиков и их действие на микрофлору кишечника / Н. М. Грачева, A.A. Аваков, А. Ф. Гаврилов // Новые лекарственные препараты: экспресс-информ. -2006. Вып. 1. — С. 15−23.
  66. , Н.М. Применение бактерийных биологических препаратов в практике лечения больных кишечными инфекциями. Диагностика и лечение дисбактериоза кишечника / Н. М. Грачева, Г. И. Гончарова: Методические рекомендации М., 1986. — 24 с.
  67. , Н.М. Дисбактериоз кишечника у взрослых / Н. М. Грачева, О. С. Партии, И. Т. Щербаков //Инфекционные болезни. 2003. -Т. 1, № 1. — С. 34−38.
  68. , В.Б. Пребиотики как основа микробиоценоз-ориентированной терапии / В. Б. Гриневич, С. М. Захаренко, Е. И. Сас //Лечащий врач. 2008. -№ 10.-С. 47−50.
  69. , А.И. Пробиотики и их роль в современной медицине / А. И. Гришель, Е. П. Кишкурно // Вестник фармации. 2009. — № 1(43). — С. 9093.
  70. Диагностика и биокоррекция нарушений антиинфекционного гомеостаза в системе «мать-дитя». книга для практического врача. / под ред. проф. Ефимова Е. И., Соколовой К .Я. — Н. Новгород, НГМА, 2004. — 376 с.
  71. Дисбиоз кишечника. Руководство по диагностике и лечению. / Под редакцией проф. Ткаченко Е. И., проф. Суворова А. Н. СПб.: Спецлит, 2007. — 238с.
  72. Дисбиоз кишечника. Руководство по диагностике и лечению. 2-е изд., испр. и доп. / под ред. Е. И. Ткаченко, А. Н. Суворова. — СПб.: ИнформМед, 2009. — 276 с.
  73. , И.В. Противоречивая микроэкология / И. В. Домарадский, Т. Х. Хохоев, O.A. Кондракова // Росс. Химический журнал. 2002. — Т.46, № 3. — С.80−89.
  74. Донецкая, Э.Г. А. Клиническая микробиология: Руководство для специалистов клинической лабораторной диагностики / Э.Г. А. Донецкая -М.: ГЭОТАР-Медиа, 2011. 480с
  75. , А.Ф. Функциональное питание / А. Ф. Доронин, Б. А. Шендеров -М.: Гранть, 2002.-296 с.
  76. , Е.В. Грибковые и некоторые паразитарные заболевания женских половых органов 2-е изд., перераб. и доп. / Е. В. Егорова, О. Б. Минскер -М.: Медицина, 1988. — 224 с.
  77. , JI.A. Показатель внутрипопуляционного разнообразия / JI.A. Животовский // Журн.общ.биол. 1980. — Т. 41, № 6. — С 829−836.
  78. , В.В. Модуляция клеток иммунной системы лактобактериями / В. В. Зорина, Т. Н. Николаева, В. М. Бондаренко // Журн. Микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. 2004. -№ 6. — С. 57−60.
  79. , Д.В. Чувствительность к антибиотикам Pseudomonas aeruginosa, выделенным при внутрибольничных инфекциях / Д. В. Иванов // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2006. — № 5. — С. 32−36.
  80. , В.Т. Местный иммунитет и микробиоценоз при заболеваниях кишечника / В. Т. Ивашкин, H.JI. Денисов // Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. 2009. — Т. 19, № 6. -С. 11−16.
  81. Инструкция по микробиологическому контролю производства на предприятиях молочной промышленности, утвержденная Главным государственным санитарным врачом СССР от 28.04.87 г.
  82. Инструкция по приготовлению молочного бифидумбактерина на молочных кухнях, М., 1987.- Юс.
  83. Инструкция по приготовлению кисломолочного бифилакта на молочных кухнях, М., 1987.- Юс.
  84. , В.А. Азитромицин (Сумамед) новый компонент антихеликобактерной терапии / В. А. Исаков, JI.B. Кудрявцева // Клиническая фармакология и терапия. — 2000. — т.9, № 1. — С.22−24.
  85. , Д. И. Мультифрактальный анализ структуры биотических сообществ / Д. И. Иудин, Д. Б. Гелашвили, Г. С. Розенберг // Докл. РАН. -2003. Т. 389, № 2. — С. 279−282.
  86. , Д.И. Методология принципа самоподобия в исследовании видовой структуры биотических сообществ: Автореферат дисс. док. биол. наук. / Д. И. Иудин Тольятти, 2006. — 40 с.
  87. , Э. М. Основы индивидуального здоровья человека: Введение в общую и прикладную валеологию: Учеб. пособие для высш. учеб. заведений. / Э. М. Казин, Н. Г. Блинова, Н. А. Литвинова М.: Гуманит. изд. центр ВЛАДОС, 2000. — 192с.
  88. , A.A. Эндотоксемия и дисбактериоз кишечника у детей с желчнокаменной болезнью / A.A. Камалова, О. Д. Зинкевич, Г. А. Хуснуллина, H.A. Сафина // Российский педиатрический журнал. 2010. -№ 5. — С. 26−29.
  89. , Л.И. Особенности становления микрофлоры у детей раннего возраста / Л. И. Кафарская, Б. А. Ефимов, Е. А. Постникова, Е. Е. Донских // Детские инфекции. 2006b. — Т. 5, № 1. — С. 6−11.
  90. , Е.С. Микробиоценоз кишечника у детей раннего возраста: факторы, влияющие на его становление, роль видов вскармливания / Е. С. Кешишян, Е. К. Бердникова // Российский вестник перинатологии и педиатрии. 2009. — Т. 54, № 5. — С. 20−24.
  91. , Е.В. Пробиотики, пребиотики и синбиотики. Общие и избранные разделы проблемы / Е. В. Климова // Экологическая безопасность в АПК. Реферативный журнал. 2009. — № 2. — С. 587−587.
  92. Клинические аспекты диагностики и лечения дисбиоза кишечника в общетерапевтической практике. Учебно-методическое пособие. СПб., 2003. — 36 с.
  93. Клиническая лабораторная аналитика. Том IV. Частные аналитические технологии в клинической лаборатории под. ред. Меньшикова В. В. М.: Агат-Мед, 2003.-816 с.
  94. , Н.К. Использование ПЦР для идентификации представителей родов Lactobacillus и Streptococcus / Н. К. Коваленко, Л. Н. Бурьяновский, B.C. Подгорский // Микробиологический журнал. 2000. — № 62 (6). — С. 7−14.
  95. , Д.И. Состояние кишечного микробиоценоза и течение Н. pylori-ассоциированного гастрита в условиях эрадикационной и симбиотической терапии: Автореф. дис.канд. мед. наук./ Д. И. Козлова. СПб, 2004. — 21 с.
  96. , Э.П. Микрофлора кишечника новорожденных детей в норме и патологии и восстановление ее бифидумбактерином: автореф. дис. канд. мед. наук. / Э. П. Козлова М., 1978. — 23 с.
  97. , С.П. Влияние экологических факторов на состояние микробиоценоза кишечника у детей / С. П. Кокорева, Н. П. Куприна, С. А. Шишлова // Системный анализ и управление в биомедицинских системах. 2008. — Т. 7, № 3. — С. 654−657.
  98. , Ю.В. Дисбиоз в пожилом и старческом возрасте / Ю. В. Конев, Л. Б. Лазебник, Л. Г. Каган, М. Ю. Яковлев // Клин, геронтология. 2001. — № 9. -с. 7−12.
  99. , A.B. Гистобактериоскопический и бактериологический методы исследования колонобиоптатов и характеристика пристеночной микрофлоры как показатель биоценоза толстой кишки / A.B. Кононов, О. Н. Миронова /Пособие для врачей. 2005. — С. 12−23.
  100. , И. Я. Пребиотики в детском питании / И. Я. Конь // Вопросы детской диетологии. 2006. — Т. 4, № 3. — С. 35−40.
  101. , Н.К. Пути усовершенствования питательных сред, используемых в технологии производства медицинских и ветеринарных пробиотиков: Автореф. дисс. канд. биол. наук./ Н. К. Конькова Нижний Новгород, 2002. -21с.
  102. , H.A. Профилактика и коррекция нарушений микробиоценза кишечника у детей раннего возраста /H.A. Коровина, З. Н. Вихирева. М., 1995.-32 с.
  103. , В.М. Коррекция микрофлоры кишечника при химиотерапевтических дисбактериозах с помощью аутоштаммов бифидобактерий и лактобактерий / В. М. Коршунов, H.A. Синицина, Г. А. Гинодман, Б. В. Пинегин // ЖМЭИ, — 1985. № 9. — С. 20−25.
  104. , В.М. Коррекция дисбиотических нарушений ваиальной микрофлоры с помощью препарата из высокоадгезивных лактобактерий / В. М. Коршунов, Л. И. Кафарская, H.H. Володин, Н. П. Тарабрина // ЖМЭИ, — 1990,-№ 7.-С. 17−19.
  105. , В.М. Рациональные подходы к проблеме коррекции микрофлоры кишечника / В. М. Коршунов, В. В. Смеянов, Б. А. Ефимов // Вест. РАМН. 1996. — № 2. — С. 60−65.
  106. , В.М. Микроэкология влагалища. Коррекция микрофлоры при вагинальных дисбактериозах. / В. М. Коршунов, В. В. Володин, Б. А. Ефимов М.: ВУНМЦ МЗ РФ, 1999. — 80 с.
  107. , В.М. Изучение бифидофлоры влагалища у женщин репродуктивного возраста / В. М. Коршунов, З. А. Гудиева, Б. А. Ефимов // Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол 1999. -№ 4. — С. 74−78.
  108. , В.М. Дисбактериозы кишечника / В. М. Коршунов, В. В. Володин, Б. А. Ефимов // Детская больница. 2000. — № 1. — С. 66−74.
  109. , В.Н. Дисбактериоз кишечника и его клиническое значение./ В. Н. Красноголовец М.: Медицина, 1979. — 192 с.
  110. , В.Н. Дисбактериоз кишечника. / В. Н. Красноголовец -М.: Медицина, 1989. 208 с.
  111. , И. Б. Микроэкология и иммуноглобулины пищеварительных секретов и копрофильтратов человека в норме и при патологии / И. Б. Куваева, Т. Я. Темкина, М. А. Виноградова // Вестник АМН СССР. 1975. -№ 12. — С.70−77.
  112. , И.Б. Обмен веществ организма и кишечная микрофлора. / И. Б. Куваева М.: Медицина, 1976. — 248с.
  113. , И. Б. Микроэкологические и иммунные нарушения у детей. / И. Б. Куваева, К. С. Ладо до М.: Медицина, 1991. — 240 с.
  114. , Т.С. Желудочно-кишечный тракт, микрофлора и иммунитет / Т. С. Лазарева, Ф. Ф. Жвания // Педиатрическая фармакология. 2009. — Т. 6, № 1.-С. 46−50.
  115. , B.B. Дизайн праймеров для ДНК лактобактерий / В. В. Лашевский, Н. К. Коваленко // Микробиологический журнал. 2003. — № 65 (З).-С. 46−53.
  116. , О.В. Формирование микроэкологии толстой кишки у здоровых новорожденных в условиях европейского севера / О. В. Лебедева, Т. А. Бажукова // Медицинский академический журнал. 2007. — Т. 7., № 4. — С. 93−100.
  117. , М.Н. Руководство к практическим занятиям по медицинской микробиологии. / М. Н. Лебедева М.: Медицина, 1973 — 312с.
  118. , Л.А. Становление микрофлоры кишечника у детей первого года жизни. / Л. А. Леванова, В. А. Алешкин, A.A. Воробьев //Журн. микробиол. 2001. — № 4. — С.47−50.
  119. , Г. Ф. Фенотаксономия и геносистематика лактобацилл/ Г. Ф. Леванова, Е.И. Ефимов/ под ред. д.б.н. Григорьевой Г. И. Н. Новгород: Изд. Ю. А. Николаев, 2009. — 248 с.
  120. , А.П. Структура экологических сообществ / А. П. Левич. М.: Изд-во МГУ, 1980.
  121. , А.П. Математические аспекты вариационного моделирования в экологии сообществ / А. П. Левич, В. Л. Алексеев, В. А. Никулин // Математическое моделирование. 1994. — Т. 6, № 5. — С. 55−71.
  122. , А.П. Феноменология, применение и происхождение ранговых распределений в биоценозах и экологии как источник идей для тех-ноценозов и экономики / А. П. Левич // Общая и прикладная ценология. -2007.-№ 5.-С. 14−19.
  123. М.П. Микробная экосистема человека. / Ледник М. П. // Материалы Международной научно-практической конференции «Здоровье: человек и технологии». Киев, 2010. — с. 25.
  124. , A.A. О количественном составе микрофлоры кала здоровых взрослых при обычном питании / A.A. Ленцнер, М. Э. Микельсаар, М. Н. Воронина / В кн.: Материалы XVI научн. сессии института питания АМН СССР.-М., 1966. Т.2. — С. 153−154.
  125. , A.A. О видовом составе лактобацилл кала пожилых людей / A.A. Ленцнер, М.Э. Микельсаар/ В кн.: Сб. докладов научн. конф. -Таллин, 1968. С.29−31.
  126. , H.H. Изменение состава нормальной кишечной микрофлоры при различных рационах питания и в условиях длительного пребывания человека в герметически замкнутом объеме: автореф. дис. канд. мед. наук / H.H. Лизько. М., 1970. — 25 с.
  127. , А.Ю. Совершенствование видовой идентификации лактобацилл с использованием микрокультуральных тест-систем и данных о строении геном / А. Ю. Лихачева, К. Я. Соколова, Г. Ф. Леванова // Журн. микробиол. 1995. — № 5. — С. 45−48.
  128. , И.В. Пробиотики и пребиотики в клинической практике / И. В. Маев, A.A. Самсонов, И. Н. Никушкина, Н. Ю. Ивашкина, Е. Ю. Плотникова // Фарматека. 2011. — № 5. — С. 33−41.
  129. , M.B. Пробиотики и пробиотические продукты в практике врача-гастроэнетролога / М. В. Маевская // Фарматека. 2010. — № 2. — С. 72−77.
  130. , JI.H. Пробиотики. Характеристика препаратов и выбор в педиатрической практике / JI.H. Мазанкова, Е. А. Лыкова //Детские инфекции. 2004. — № 1. — С. 18−23.
  131. , В.В. Основы здорового образа жизни и профилактика болезней / В. В. Макаров М: Академия, 2001. — 320 с.
  132. , A.B. Пребиотики и их роль в формировании кишечной микрофлоры / A.B. Малкоч, C.B. Бельмер //Педиатрия. Журнал им. Г. Н. Сперанского. 2009. — Т. 87, № 4. — С. 111−114.
  133. , Р. Облик биосферы / Р. Маргалеф. М.: Наука, 1992. — 254 с.
  134. , Л. Роль симбиоза в эволюции клетки / Л. Маргелис. М.: Мир, 1983.-352 с.
  135. , О.П. Кишечная микрофлора при неспецифическом язвенном колите / О. П. Марко // Применение колибактерина для профилактики и лечения кишечных заболеваний и технология его производства: сб.научн. тр.-М. 1967.
  136. , О.П. О составе микрофлоры кишечника здоровых людей / О. П. Марко. Лабораторное дело. -1970. — № 6. — С.365
  137. Методы бактериологического исследования условно-патогенных микроорганизмов в клинической микробиологии: методические рекомендации. М.: Минздрав. — 1991.
  138. , И. И. Этюды оптимизма / И. И. Мечников М.: Наука, 1964. -128 с.
  139. , И.И. О д1этическомъ значенш «кислаго молока» проф. Мечникова. Клиничесюя наблюдешя изъ СПБ. Морского Госпиталя, доктора мед. Г. А. Макарова. / И. И. Мечников: С.-Петербургъ. Издаше К. JI. Риккера. Невскш пр., 14. 1907.
  140. , М.Э. О количественном составе микрофлоры кала здоровых взрослых при обычном питании/ М. Э. Микельсаар, М. Н. Воронина / В кн.: Материалы XVI научн. сессии института питания АМН СССР. М., 1966, Т.2.- С. 153−154.
  141. , О.В. Иммунопрофилактика гнойно-воспалительных инфекций у недоношенных детей: Автореф. дис.канд. мед. наук. / О. В. Миловидова М., 1994. — 25 с.
  142. , С.Д. Метаболиты нормальной микрофлоры человека в экспресс-диагностике и контроле лечения дисбиоза толстой кишки: Автореф. дис. .д-ра мед. наук./ С. Д. Митрохин М., 1998. — 37 с.
  143. , Н.П. Все о молоке / Н. П. Могильный, Л. А. Трушкина -изд-во «Экономика», М., 1989. 80 с.
  144. , Е.И. Разработки отечественных метаболических пробиотиков и их стандартизация / Е. И. Молохова, Ю. В. Сорокина // Сибирский медицинский журнал (г. Томск). 2011. — Т. 26, № 1−1. — С. 29−33.
  145. , Е.И. Лекарственные препараты на основе метаболитов микроорганизмов и фрагментов клеток / Е. И. Молохова, Ю. В. Сорокина, A.B. Казьянин // Фармация. 2010. — № 6. — С. 52−55.
  146. , З.М. Микробиоценоз влагалища и его коррекция / З. М. Мусаева // Проблемы женского здоровья. 2008. — Т. 3, № 3. — С. 43−53.
  147. , Э. Экологическое разнообразие и его измерение. Пер. с англ. / Э. Мэгарран. -М.: Мир, 1992. 184 с.
  148. , В.А. Микробиологические и технологические аспекты получения, контроля и конструирования препаратов: дисс. докт. мед. наук./ В. А. Несчисляев Пермь, 2005. -277с.
  149. , В.А. Пробиотики: сравнительная характеристика моно- и поликомнонентных препаратов / В. А. Несчисляев, Я. В. Долгих, Е. В. Орлова, К. А. Лыско, Е. М. Валиева // Сибирский медицинский журнал. -2011. Т. 26, № 2−2. — С. 68−70.
  150. , В.А. К вопросу разработки пробиотических препаратов из культуральной жидкости лактобактерий / В. А. Несчисляев, Е. И. Молохова, Л. П. Чистохина // Клиническое питание. 2007. — № 1−2. — С. А-55.
  151. , О. К. Питание грудного ребенка и кишечная микрофлора / О. К. Нетребенко // Педиатрия. 2005а. — № 3. — С. 57−61.
  152. , О. К. Развитие и укрепление иммунитета в первый, решающий год жизни, раздел «Эволюция кишечной микрофлоры». Информация только для медицинских работников / О. К. Нетребенко. -2005b.
  153. , Н. И. Роль транслокации бактерий в патогенезе хирургической инфекции / Н. И. Никитенко, В. В. Захаров, A.B. Бородин // Хирургия. 2001. — № 2. — С. 63−66.
  154. , И.В. Кишечная микрофлора у здоровых детей раннего возраста / И. В. Николаева, В. А. Анохин, И. А. Айнутдинова // Российский вестник перинатологии и педиатрии. 2009. — Т. 54, № 2. — С. 30−33.
  155. , Ю. Экология / Ю. Одум. М.: Мир, 1986. — Т.2. — 376 с.
  156. Олескин, А. В Экологически важные свойства популяций микроорганизмов. / A.B. Олескин // Соросовский образовательный журнал.-2001.-т. 7, № 8.-С. 7−12.
  157. , A.B. Колониальная организация и межклеточная коммуникация у микроорганизмов. / A.B. Олескин, И. В. Ботвинко, Е. А. Цавкелова // Микробиология. 2000. — Т. 69, № 3. — С. 309−327.
  158. , A.B. Биосоциальность одноклеточных (на материале исследования прокариот). / A.B. Олескин // Журнал общей биологии. 2009. Т. 70, № 3. — С. 225−238.
  159. Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам: методические указания № 4.2.1890−04. М.: Федеральный центр Госсанэпиднадзора Минздрава России. — 2004. — 91 с.
  160. Организация определения лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза: инструкция по применению. Минск: МЗ республики Беларусь. — 2007. — 9 с.
  161. А.И. Экспертные оценки. Учебное пособие. М.: 2002. — 31 с.
  162. ОСТ 91 500.11.0004−2003. Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника. Утвержден приказом МЗ РФ № 231 от 09.06.2003. М.: изд-во Госстандартов, 2003. — 173 с.
  163. , E.H. Препараты группы 5-нитроимидазола для лечения анаэробных и протозойных инфекций / E.H. Падейская // Инфекции и антимикробная терапия. 2000. — Т.2, № 4. — С. 240.
  164. , М.В. Дисбактериозы кишечника. / М. В. Панчишина, С. Ф. Олейник Киев: Здоров’я, 1977. — 190 с.
  165. Пат. № 2 193 398 Россия, МПК 7 А 61 К 31/00, 35/00, 35/74, А 61 Р 1/00, Способ лечения дисбактериозов / И. В. Соловьева, К. Я. Соколова, В. А. Княжев (Россия). № 2 000 107 271/14 заявлено 24.03.2000, опубл. 27.11.2002, Бюл. № 33. С. 18.
  166. Пат. № 2 122 868 Россия, МПК А61М31/00, А61КЗЗ/06, Способ энтеросорбции / Н. И. Богомолов, Н. И. Кулиш, H.H. Богомолова (Россия). № 7 111 429/14, заявлено 08.07.1997, опубл. 10.12.1998.
  167. Пат. № 2 095 072 Россия, МПК А61К35/74, Способ лечения неспецифической инфекционной патологии урогениталий у женщин / А. Е. Щербинов, A.B. Казаков, Г. В. Телякова (Россия). № 93 012 461/14, заявлено 01.04.1993, опубл. 10.11.1997.
  168. Пат. № 2 113 806 Россия, МПК A23L1/30, A23L1/304, A23L1/305, A23L1/076, А61К35/78, А61К35/64, Пищевая биологически активная добавка / И. Д. Фадеева (Россия). № 97 101 811/13, заявлено 05.02.1997, опубл. 27.06.1998.
  169. Пат. № 2 280 465 Россия, МПК А61К 35/74 А23С 9/12 C12N 1/20 C12R 1/225 C12R 1/25, Способ приготовления пробиотика / И. В. Соловьева, К. Я. Соколова, Е. И. Ефимов, Т. П. Иванова, А. Г. Точилина, И.В. Белова
  170. Россия). № 2 004 131 097/13 заявлено 25.10.2004, опубл. 27.07.2006, Бюл. № 19. С. 8.
  171. Пат № 2 375 459 Россия, МПК C12Q 1/68, С12Р 19/34. Способ индикации бактерий рода Lactobacillus / Новикова Н. А., Точилина А. Г., Соловьева И. В. (Россия). № 2 008 113 591, заявлено 07.04.2008, опубл. 10.12.2009, Бюл. 34. С. 6.
  172. , Л.Г. Значение нормальной микрофлоры для организма человека. / Л. Г. Перетц. М.: Медгиз. — 1955. — 250 с.
  173. , М.В. Инулин и олигофруктоза пребиотики с давних времен до наших дней / М. В. Перковец // Пищевая промышленность. — 2007. — № 4.-С. 56−58.
  174. , Ю.А. Принципы и методы количественного анализа в фаунистических исследованиях / Ю. А. Песенко. М.: Наука, 1982. — 288 с.
  175. Петровская В. Г, Марко О. П. Микрофлора человека в норме и патологии. / В. Г. Петровская, О. П. Марко. М.: Медицина, 1976. — 612 с.
  176. , Э. Эволюционная экология / Э. Пианка. М.: Мир, 1981. — 400 с.
  177. , Ю.П. Санитарно-значимые микроорганизмы (таксономическая характеристика и дифференциации) / Ю. П. Пивоваров, В. В. Королик М.: Изд-во ИКАР, 2000. — 268 с.
  178. , В.В. Дисбактериозы кишечника / В. В. Пинегин, В. Н. Мальцев, В. М. Коршунов -М.: Медицина, 1984., 144 с.
  179. , Л.Я. Антибиотикорезистентность штаммов бифидобактерий, выделенных из генитального тракта женщин репродуктивного возраста /
  180. Л.Я. Плахтий, З. А. Уртаева, Л. В. Цаллагова, Е. И. Рындина // Жур. Клин.361микробиологии и антимикробной химиотерапии. 2002. -Т.4, Прил. 1. -С.35.
  181. , Г. И. Медицинская гнотобиология / Г. И. Подопригора. -Медицинское информационная агентство, 2003. 272 с.
  182. , O.K. Энтеробактерии: руководство для врачей / O.K. Поздеев, Р. В. Федоров. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2007. — 720 с.
  183. Приказ Минздрава СССР № 535 «Об унификации микробиологиченских (бактериологических) методов исследования, применяемых в клнико-диагностических лабораториях лечебно-профилактических учреждений», 22.04.1985
  184. , Н.А. Метаболическая интеграция организмов в системах симбиоза / Н. А. Проворов, Е. А. Долгих // Журн. общ. биологии. 2006 — Т. 67, № 6.-С. 403−422.
  185. , Ю.Г. Семантические аспекты биоразнообразия / Ю. Г. Пузаченко, А. Ю. Пузаченко // Журн. общ. биол. 1996. — Т. 57, № 1. — С. 143.
  186. , Р.Н. Грибы рода Candida при заболеваниях негрибковой этиологии / Р. Н. Реброва. 2-е изд., перераб. и доп. — М.: Медицина, 1989. -128 с.
  187. , Г. В. Энтеросорбция в терапевтических программах различных заболеваний у детей / Г. В. Римарчук, Н. И. Урсова, Л, А. Щеплягина // Альманах клинической медицины. 1999. — № 2. — С. 283−292.
  188. Руководство по инфекционному контролю в стационаре / под ред. В. Венцеля, Т. Бревера, Ж.-П. Бутцлера- пер с англ. Смоленск: МАКМАХ, 2003.-272 с.
  189. , O.B. Атлас ультраструктуры микробиоты кишечника человека. / О. В. Рыбальченко, В. М. Бондаренко, В. П. Добрица. СПб. ИИЦ BMA, 2008.- 112 с.
  190. , О.В. Образование биопленок симбионтными представителями микробиоты кишечника как форма существования бактерий / О. В. Рыбальченко, В. М. Бондаренко // Вестник Санкт-Петербургского университета. 2013. — Серия 11, № 1. — С. 179−186.
  191. , Е.В. Кишечно-мозговые взаимоотношения в норме и патологии/ Е. В. Рябиченко, В. М. Бондаренко // Верхневолжский медицинский журнал. 2013. — Т. 11, № 1. — С. 34−39.
  192. , Е.С. Фармакотерапия язвенной болезни / Е. С. Рысс, Э. Э. Звартау. -СПб., М.: «Невский Диалект» «Издательство БИНОМ», 1998. — 253 с.
  193. , А.Б. Биосистемалогия (системные основы теории эволюции и экологии). Учебное пособие / А. Б. Савинов. Н. Новгород: Изд-во ННГУ, 2006. — 205 с.
  194. , В.А. Молочные продукты пробиотической направленности / В. А. Самойлов, П. Г. Нестеренко, O.A. Суюнчев // Молочная промышленность. 2007. — № 7. — С. 45−46.
  195. Санитарно-эпидемиологическая оценка обоснования сроков годности и условий хранения пищевых продуктов: методические указания № 4.2.1847−04. М.: Федеральный центр Госсанэпиднадзора Минздрава России, 2004. — 19 с.
  196. , В.И. Математическая статистика в клинических исследованиях / В. И. Сергиенко, И. Б. Бондарева. 2-е изд., перераб. и доп. — М.: ГЭОТАР-Медиа, 2006. — 304 с.
  197. , Е.В. Роль нормальной микрофлоры в поддержании здоровья человека / Е. В. Симонова, O.A. Пономарева// Сибирский медицинский журнал. 2008. — № 8. — С. 20 -25.
  198. , У. Ваш малыш от рождения до двух лет / У. Сире, М. Сире М.: Эксмо, 2011.-912 с.
  199. , Г. И. Сезонные изменения кишечной микрофлоры здоровых детей / Г. И. Скирда. Педиатрия. — 1971. — № 11. — с. 16−20.
  200. , К.Я. Изучение микробиоценозов кишечника детей, больных острой дизентерией, с использованием ЭЦВМ: Автореф. дис.канд. мед. наук. / К. Я. Соколова. Москва, 1972. — 18 с.
  201. Соколова, К. Я! Методика оценки состояния микрофлоры толстой кишки с использованием ЭВМ. / К. Я. Соколова, И. В. Шутова, A.C. Коровенков // ЖМЭИ 1998. — № 11.-с. 11−16.
  202. , К.Я. Дисбактериозы: Теория и практика / К. Я. Соколова, И. В. Соловьева Н. Новгород. — 1999. — 199 с.
  203. , И.В. Характеристика микрофлоры влагалища женщин в норме и патологии: дисс. канд. мед. наук. / И. В. Соловьева. Горький, 1987. -145 с.
  204. , А.Й. Йогурт и другие кисломолочные продукты / А. Й. Тамим, Р. К. Робинсон, пер с англ. под науч ред. JI.A. Забодаловой СПб.: Профессия, 2003. — 664 с.
  205. , Н.Б. Сравнительное изучение лактобактерий и E.coli Mi7 в целях разработки нового препарата лактобактерина: дис.. канд. мед. наук / Тарасова Н. Б. — Горький, 1969. — 245 с.
  206. , A.JI. «Quorum sensing» или социальное поведение бактерий / АЛ. Тинцбург, Т. С. Ильина, Ю. М. Романова // ЖМЭИ. 2003. — № 5. -С.86−93
  207. , Е.И. Питание, эндоэкология человека, здоровье, болезни. Современный взгляд на проблему их взаимосвязи / Е. И. Ткаченко // Терапевтический архив. 2004. — № 2. — С. 67−71.
  208. , Е.И. Питание, микаробиоцноз и интеллект человека / Е. И. Ткаченко, Ю. П. Успенский. СПб.: СпецЛит, 2006. — 590 с.
  209. , А.Г. Биохимическая и молекулярно-Огенетическая идентификация бактерий рода Lactobacillus: Дис.. канд. биол. наук / А. Г. Точилина. Нижний Новгород, 2009. — 147 с.
  210. , М.В. К механизму антагонистической активности лактобацилл / М. В. Тюрин, Б. А. Шендеров, Н. Г. Рахимова // Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. 1989. — № 2. — С. 3−8.
  211. , A.M. Теория адекватного питания и трофология/ A.M. Уголев. -СПб.: Наука, 1991.-270 с.
  212. Урсова, Н. И Основные физиологические функции интестинальной микрофлоры и формирование мйкробиоценоза у детей / Н. И. Урсова // Вопросы практической педиатрии. 2006. — Т. 1, № 1. — С. 51−57.
  213. , Д.В. Пробиотики и пробиотические продукты / Д. В. Усенко // Вопросы детской диетологии. 2006. — Т. 4, № 6. — С. 36−43.
  214. , O.E. Микробиоценоз кишечника как микроэкологическая система организма / O.E. Фалова, Н. С. Глебова, Ю. Ю. Красноперова, Н.И. Потатуркина-Нестерова // Современные наукоемкие технологии. 2005. -№ 4. С. 98−98.
  215. Фармакопейная статья ФС 0054−00. Лактобактерии сухой. Утверждена 01.11.2000.
  216. , Л.В. Лактосодержащие отечественные пробиотики / Л. В. Феклисова // Кремлевская медицина. Клинический вестник. 2007. — № 4. -С. 48−50.
  217. , Л.В. Отечественные бифидосодержащие пробиотики, а педиатрической практике / Л. В. Феклисова, Т. В. Мацулевич // Альманах клинической медицины. 2002. — № 5. — С. 296−300.
  218. , И.Е. Формирование микробиоценоза кишечника у новорожденных детей раннего неотнатального периода / И. Е. Филиппова // Медицина в Кузбассе. 2006. — № 4. — С. 26−32.
  219. , А.Ю. Микроэкология человека (Часть I). / А. Ю. Цибулевский, A.B. Соколов // Успехи современного естествознания. -2008а.-№ 7. С. 17−21.
  220. , А.Ю. Микроэкология человека (Часть II). / А. Ю. Цибулевский, A.B. Соколов // Успехи современного естествознания. -2008b. -. № 7. С. 22−26.
  221. , О.В. Микробиологические и иммунологические основы гнотобиологии / О. В. Чахава, Е. М. Горская, С. З. Рубан. М.: Медицина, 1982. — 200 с.
  222. , Ю.В. Бактериоциногенные высокоантагонистические штаммы лактобацилл / Ю. В. Червинец, В. М. Бондаренко, H.A. Шабанова, A.M. Самоукина, В. М. Червинец // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2006. — № 7. — С. 78−82.
  223. , В.М. Формирование биопленок антагонистическими штаммами лактобацилл полости рта / В. М. Червинец, Ю. В. Червинец, A.M. Самоукина, Е. С. Михайлова, O.A. Гаврилова // Стоматология. -2012.-Т. 91, № 1.-С. 16−19
  224. , Ю.В. Нарушения микробиоты желудочно-кишечного тракта здоровых лиц / Ю. В. Червинец, Е. А. Беляева, В. М. Червинец и др. // Международный журнал прикладных и фундаментальных исследований. -2013.-№ 3.-с. 55−58.
  225. , В.В. Дисбактериоз мукозной микрофлоры эзофагогастродуоденальной зоны / В. В. Чернин, В. М. Бондаренко, В. М. Червинец, С. Н. Базлов. М.: ООО «Медицинское информационное агентство», 2011. — 144 с.
  226. , Н. П. Неонатология / Н. П. Шабалов— М.: Медпресс-ин- форм, 2004. С. 128−129.
  227. , И.А. Роль и место молекулярно-генетических методов в эпидемиологическом анализе внутрибольничных инфекций / И. А. Шагинян // КМАХ. 2000. — т.2, № 3 — С. 82−95.
  228. , Л.И. Микробиотиа человека как основной физиологический орган / Л. И. Шапошникова // Успехи современного естествознания. 2006. — № 9. — С. 80−82.
  229. , С.А. Пробиотики, пребиотики и пробиотические продукты. Современное состояние вопроса / С. А. Шевелева / Вопросы питания. -№ 2. 1999. — С.32−39.
  230. Шевяков, М.А. Candida species в кишечнике. Клинические аспекты / М. А. Шевяков, Е. Б. Авалуева, Н. В. Барышникова // Проблемы медицинской микологии. 2007. — Т. 9, № 4. — С. 4−11.
  231. , Б.А. Колонизационная резистентность крыс, родившихся от животных с экспериментальным дисбактериозом / Б. А. Шендеров, Р. Г. Ануфриева, С. М. Навашин // Антибиотики и медицинская биотехнология.- 1986.-№ 6. -С. 440−445.
  232. , Б.А. Медицинская микробная экология и функциональное питание. Том I: Микрофлора человека и животных и ее функции / Б. А. Шендеров М.: Издательство ГРАНТЪ, 1998а. — 288 с.
  233. , Б.А. Медицинская микробная экология и функциональное питание. Том II: Социально-экологические и клинические последствия дисбаланса микробной экологии человека и животных. / Б. А. Шендеров -М.: Издательство ГРАНТЪ, 1998b. 416 с.
  234. , Б.А. Нормальная микрофлора и ее роль в поддержании здоровья человека / Б. А. Шендеров // Рос. Журн. Гастроэнтерол., гепатол., колопроктол. 1998с. — Т. 7, № 1. — С. 61−65.
  235. , Б.А. Медицинская микробная экология и функциональное питание. Том III: Пробиотики и функциональное питание. / Б. А. Шендеров М.: Издательство ГРАНТЪ, 2001. — 288 с.
  236. , В.В. Термины и определения в эпидемиологии: словарь / В. В. Шкарин, A.C. Благонравова. Н. Новгород: Издательство НГМА, 2010. -300 с.
  237. , А.Н. Бифидобактерии: традиционный взгляд и современные генетические исследования / А. Н. Шкопоров, Б. А. Ефимов, H.H. Володин, Л. И. Кафарская // Вопросы практической педиатрии. 2007. — Т. 2, № 5. -С. 76−79.
  238. , П.Л. Микроэкология кишечника у детей и ее нарушения./ П. Л. Щербаков, A.A. Нижевич, В. В. Логиновская, М. Ю. Щербакова, Л. В. Кудрявцева, С. Д. Митрохин, Н. М. Нуртдинова, P.A. Очилова //Фарматека.- 2007. № 14.-с. 28−34.
  239. Экология человека и профилактическая медицина. Мегатезаурус -большой словарь-справочник. Москва-Воронеж, 2001. — 487 с.
  240. Эпштейн-Литвак, Р.В. К характеристике дисбактериоза кишечника / Р.В. Эпштейн-Литвак, Ф. Л. Вилыианская // Материалы III съезда эпидемиологов, микробиологов, инфекционистов АзССР. Баку, 1967. -С.81−82.
  241. Эпштейн-Литвак, Р. В. Бактериологическая диагностика дисбактериоза кишечника. / Р.В. Эпштейн-Литвак, Ф. Л. Вилыианская // Метод, рекомендации. М., 1977. — 22 с.
  242. , Д.С. Перспективы использования пропионовокислых бактерий в составе пробиотиков / Д. С. Янковский, В. В. Бережной, Г. С. Дымент // Соврем, педиатрия. 2004. — № 1(2). — С. 111−118.
  243. Ahlroos, Т. Quantitative strain-specific detection of Lactobacillus rhamnosus GG in human faecal samples by real-time PCR / T. Ahlroos, S. Tynkkynen // J Appl Microbiol. 2009. — Vol.106, № 2. — P.506−14.
  244. Andrew, J. In Vitro Biofilm Models: An Overview / J. Andrew, I. McBain // Advances in Applied Microbiology. 2009. — Vol. 69. — P. 100−126.
  245. Bary de, A. Die Erscheinung der Symbioses / A. de Bary. Trubker: Strassburg, 1879.-235 p.
  246. Brinques, G.B. Optimization of probiotic and lactic acid production by Lactobacillus plantarum in submerged bioreactor systems / G.B. Brinques, M. do Carmo Peralba, M.A. Ayub // J Ind Microbiol Biotechnol. 2010. — V.37 (2).-P. 205−12.
  247. Chaitov, L. Probiotics. Thorsons Publishing Group/ L. Chaitov, N. Trenev. -Northamptonshire, England, 1990.
  248. Chagnaud, P. Rapid PCR-based procedure to identify lactic acid bacteria application to six common Lactobacillus species / P. Chagnaud // J of Microbiol Meth. 2001. — Vol.44. — P. 139−148.
  249. Collado, M.C. Assessment of the bacterial diversity of breast milk of healthy women by quantitative real-time PCR / M. C. Collado, S. Delgado, A. Maldonado, J.M. Rodriguez // Lett Appl Microbiol. 2009. — Vol.48, № 5. — P. 523−8.
  250. Collins, M.D. Probiotics, prebiotics, and synbiotics: approaches for modulating the microbial ecology of the gut / M.D.Collins, G.R.Gibson //Am J Clin Nutr. -1999. Vol. 69. — P.1052S-7S.
  251. Costerton, J.W. Bacterial biofilms: a common cause of persistent infections / J.W. Costerton, P. S. Stewart, E.P. Greenberg // Science. 1999. — № 284. -P.1318−1322
  252. Cusick, S. M. Use of a Single, Triplicate Arbitrarily Primed-PCR Procedure for Molecular Fingerprinting of Lactic Acid Bacteria / S.M. Cusick, D.J. O’Sullivan // Appl Environ Microbiol. 2000. — Vol. 66, № 5. — P. 2227−2231.
  253. Dach, S.K. Acidophilus: The Friendly Bacteria / S.K. Dach // In: Total Health. 1995.-Apr.: 27
  254. Douglas, A.E. Symbiotic interactions / A.E. Douglas. Oxford, New York, Toronto: Oxford Univer. Press, 1994. — 148 p.
  255. Edwards, C. A. Intestinal flora during the first months of life new perspectives / C. A. Edwards, A. M. Parret // Br. J. Nutr. 2002. — Vol. 88 (11). — P. 11−18.
  256. Fanaro, S. Intestinal microflora in early infancy: composition and develop-ment / S. Fanaro, R. Chierici, P. Guerrini, V. Vigi // Acta Paediat. -2003. -Vol. 91 (441).-P. 48−55.
  257. Fisher, H.M. Genetic regulation of nitrogen fixation in rhizobia / H.M. Fisher // Microbiol. Review. 1994. — V.58. — P. 352−386.
  258. Gibson, G.R. Dietary modulation of the human colonic microbiota: Introducing the concept of prebiotics. / G.R. Gibson, M.B. Roberfroid // J Nutr. 1995. -Vol. 125.-P. 1401−1412.
  259. Gissen, A.S. Off Probiotics, Prebiotics & Synbiotics Iss VRPs Inc. Vit Res Prod Newsletters, Sept, 1995, USA.
  260. Graham, D. Choosing the best anti-Helicobacter pylori therapy: effect of antimicrobial resistance / D. Graham, W.A. de Boer, G.N.J. Tytgat // Am. J. Gastroenterol. 1996. — Vol. 91. — P.1072−1076.
  261. Haenel, H. Zur Mikroekologie des Duenndarmes und des oberen Colon beim Menschen nach Untersuchungen an punktiertem Material / H. Haenel, A. von Lutzki, G. Feldheim «Med. Welt», 1961. — Vol. 12. — P. 370.
  262. Haenel, H. Human normal and abnormal gastrointestinal flora / H. Haenel //Am. J. Clin. Nutr. 1970. — v.23, N 11. — p. 1433−1439.
  263. Hammes, W.P. The genus of Lactobacillus and Carnobacterium / The Procaryotes / W.P. Hammes, C.A. Hertel, H.G. Balows, G. Truper, M. Dworkin, W. Harder, K.-H. Schleifer, Vol.4, Edition 2. 1992, SpringerVerlag, New-York.
  264. Holzapfel, W.H. Taxonomy and important features of probiotic microorganisms in food and nutrition / W.H. Holzapfel, P. Haberer, R. Geisen // Am.J. Clin. Nutr. 2001. — Vol. 73. — P. 365S-373S.
  265. Hopkins, M.J. Changes in predominant bacterial populations in human faeces with age and with Clostridium difficile infection. / M.J. Hopkins, G.T. Macfarlane // J. Med. Microbiol. — Vol. 51 (2002). -p. 448154
  266. Indrio, F. Effects of probiotic and prebiotic on gastrointestinal motility in newborns / F. Indrio, .Riezzo, F. Raimondi // J Physiol Pharmacol 2009. -V.60 (6).-P. 27−31.
  267. Janson, S. Measures of ecological association / S. Janson, J. Vegelius // Oecologia. 1981. — V. 49. — P. 371−376.
  268. Karapetsas, A. Rapid detection and identification of probiotic Lactobacillus casei ATCC 393 by multiplex PCR / A. Karapetsas, E. Vavoulidis, A Galanis, R. Sandaltzopoulos, Kourkoutas Y.//J Mol Microbiol Biotechnol. 2010. -Vol.18, № 3,-P. 156−61.
  269. Kennedy, M.J. Mechanism association of Candida albicans with intestinal mucosa / M.J. Kennedy, P.A. Volz, C.A. Edwards, R.L. Yancey // J.Med. Microbiol. 1987. — Vol.24. — P.333−341.
  270. Kleerebezem, M. Quorum sensing control of lantibiotic production- nisin and subtilin autoregulate their own biosynthesis / M. Kleerebezem // Peptides. -2004. -Vol. 25(9). P. 1405−1414.
  271. Kollenbrander, P. E. Communication among oral bacteria /Kollenbrander P., E., Andersen R.N., Blehert D.S. // Microbiology and molecular biology rew. -2002. Vol. 66, № 3. — P. 486−505.
  272. Kramer, M. Quantification of live and dead probiotic bacteria in lyophilised product by real-time PCR and by flow cytometry / M. Kramer, N. Obermajer, I. Rogelj, V. Kmetec // Appl Microbiol Biotechnol. 2009. — Vol.84, № 6. -P.l 137−47.
  273. Lactic acid bacteria and bifidobacteria. / Edited by K. Sonomoto, A. Yokoto. Caister Academic Press, Norfolk, UK. 2011. — 285 p.
  274. Lactobacillus, molecular biology. From genomics to probiotics./ Edited by A. Ljungh, T. Wanstrom. Caister Academic Press, Norfolk, UK. 2009. — 205 p.
  275. Le Chevallier, M.W. Inactiwation of biofilm bacteria / M.W. Le Chevallier, D. Cawthen, R.G. Lee // Appl. Environm. Microbiol. 1998. — Vol. 54, № 10. -P.68−80.
  276. Lewis, D.H. Microorganisms and plants: the evolution of parasitisms and mutualism / D.H. Lewis // Evolution of microbial world (Proc. 24th Sym p. Soc. General Microbiol). Cambridge: Univ. Press, 1974. — P. 367−392.
  277. Liu, C. Antibiotic resistance of probiotic strains of lactic acid bacteria isolated from marketed foods and drugs / C. Liu, Z.Y. Zhang, K. Dong, J.P. Yuan, X.K. Guo //Biomed Environ Sci. -2009. Vol.22, № 5. — P.401−12.
  278. Marcovitch, H. Does Fusobacterium varium cause ulcerative colitis? / H. Marcovitch // BMJ: British Medical Journal. 2003. — T. 326, № 7388. — C. 521.
  279. Mackie, R.I. Developmental microbial ecology of the neonatal gastrointestinal tract / R.I. Mackie, A. Sghir, H.R. Gaskins // Am J Clin Nutr. 1999. -Vol. 69. -P.1035S^15S.
  280. Martin, R. Human milk is a source of lactic acid bacteria for the infant gut / R. Martin // FEMS Microbiol Ecol. 2008. — Vol.66 (3). — P. 630−636.
  281. Martin, R. Probiotic potentialof 3 Lactobacilli strains iso lated from breast milk / R. Martin, M. Olivares, M. L. Marin // J. Hum. Lact. — 2005. Vol. 21. — P. 8−17
  282. Martin, R. The commensal microflora of human milk new perspectives for food bacteriotherapy and probiotics / R. Martin // Trends Food Sci. Tech. 2004. -Vol. 15.-P. 17−21.
  283. Muller, M.R.A. Multiplex PCR for the detection of Lactobacillus ponis and two related species in a sourdough fermentation / M.R.A. Muller, M.A. Ehrmann, R.F. Vogel // Appl. Environ Microbiol. 2000. -Vol.66, № 5. — P. 2113−2116.
  284. Ohkusa, T. Fusobacterium varium / T. Ohkusa, N. Sato, T. Ogihara, K. Morita, M. Ogawa, Okayasu I. // Journal of Gastroenterology and Hepatology. 2002. -T. 17, № 8.-C. 849−853.
  285. Orrhagt, K. Factors controlling the bacterial colonization of the intestine in breastfed infants / K. Orrhagt, C. E. Nord // Acta Paediatr Suppl. 1999. -Vol. 88 (4−30). — P. 47−57.
  286. Ouwehand, A. From new strain to health claim / A. Ouwehand // Gastroenterology of St. Petersburg. 2009, № 4. — c. A19.
  287. Pielou, E. C. The measurement of diversity in different types of biological collections / E.C. Pielou // J. Theor. Biol. 1966. — V. 13. — P. 131−144.
  288. Polzin, K.M. Copy number and location of insertion sequences ISS1 and IS981 in lactococci and several other lactic acid bacteria / K.M. Polzin, D. Romero, M. Shimizu-Kadota, T.R. Klaenhammer, L.L. McKay // J. Dairy Sci. 1993. -Vol. 76:-P. 1243−1252.
  289. Pond, F.R. R-body producing bacteria / F.R. Pond, I. Gibson, J. Lalucat // Microb. Rev. 1989. — V. 53, № 1. — P. 25−67.
  290. Requena, T. Identification, detection and enumeration of human Bifidobacteriun species by PCR targeting the transaldolase gen / T. Requena, J. Burton, T. Matsuki // Appl. Environ Microbiol. -2002. -Vol.68, № 5. P. 2420−2427.
  291. Romling, U. Physical genome analysis of bacteria / U. Romling, D. Grothues, T. Heuer, B. Tummler // Electrophoresis. 1992. — Voll3. — P. 626−631.
  292. Roy, D. Molecular differentation of Bifidobacterium species with amplified ribosomal DNA restriction analysis and alignment of short regions of the ldh gene / D. Roy, S. Sirois // FEMS Microbiol Lett. 2000. — Vol. 191- P. 17 -24.
  293. Sager, P.E. Species diversity in lacustrine phytoplankton. I. The components of the index of diversity from Shannon’s formula / P.E. Sager, A.D. Hasler // Amer. Natur. 1969. — V. 103, № 929. — P. 51−59.
  294. Schiffrin, E.J. Immunomodulation of human blood cells following the ingestion of lactic acid bacteria / EJ. Schiffrin, F. Rochat, H. Linc-Amster // J. Dairy Sci. 1995. — Vol. 78. — P. 491−497.
  295. Schiffrin, E.J. Interactions between the microbiota and the intestinal mucosa / E.J. Schiffrin, S. Blum // Eu J Clin Nutr. -2002. Vol. 56. — P. S60-S64.
  296. Shannon, C.E. A mathematical theory of communication / C.E. Shannon // Bell System Technical Journal. 1948. — V. 27. — P. 379−423.
  297. Simpson, E.H. Measurement of diversity / E.H. Simpson // Nature. 1949. — V. 163.-688 p.
  298. Song, Y. Rapid identification of 11 human intestinal Lactobacillus species by multiplex PCR assays using group- and species- specific praimers deraived from the 16S-23S rRNA intergenic spacer region and its flanking 23S rRNA /
  299. Y. Song, N. Kato, C. Liu // FEMS Microbiol Lett. 2000. — Vol. 187. — P. 167 173.
  300. Southwood, T.R.E. Ecological methods / T.R.E. Southwood. London: Chapman and Hall, 1978. — 524 p.
  301. Spiegel, J.E. Safety and Benefits of Fructooligosaccharides as Food Ingredients / J.E. Spiegel, R. Rose, P. Karabell// Food Technology. 1994, Jan. — P. 85−89
  302. Stene, L.C. Relation between oc currence of type 1 diabetes and asthma / L. C. Stene, P. Nafstad // Lancet. 2001. — Vol. 357. — P. 607−608.
  303. Tani, K. Development of a direct in situ PCR method for detection of specific bacteria in natural environments / K. Tani, K. Kurokawa, M. Nasu // Appl. Environ. Microbiol. 1998. — Vol.64. — P. 1536−1540.
  304. Teale, C.J. Antimicrobial resistance and the food chain / C.J. Teale //J. Appl. Microbiol. 2002. — Vol. 92. — P. 85.
  305. Toole, G.A. Biofilm formation as microbial development / G.A. Toole, H.B. Kaplan, R. Kolter // Annu. Rev. Microbiol. 2000. — № 54. — P.49−79.
  306. Thompson, J.P. Product Total Flora. Support Questions and Answers / J.P. Thompson // Iss. Interchange Inc. 1997.
  307. Torriani, S. Plasmid DNA and antibiotic susceptibility in lactobacillus strains from human vagina / S. Torriani, U. Sotilli, A. Giorgi, M. Vescovo, F. Dellaglio // Microbiol, alim. nutr. 1988. — Vol.6, N1. — P. 63−68.
  308. Tynkkynen, S. Comparison of Ribotyping, Randomly Amplified Polymorphic DNA Analysis, and Pulsed-Field Gel Electrophoresis in Typing of Lactobacillus rhamnosus and L. casei srains / S. Tynkkynen, R. Satokari, M.
  309. Saarela, M. Mattila-Sandholm, M. Saxelin // Appl. Environ Microbiol. 1999. — Vol. 65, № 9. — P. 3908−3914.
  310. Vandenplas, Y. Helicobacter pylori infection / Y. Vandenplas // Clin Microbiol Infect. 1999.-Vol.5.-P. 1−11.
  311. Ward, L.J. Differentiation of Lactobacillus casei, Lactobacillus paracasei and Lactobacillus rhamnosus by polymerase chain reaction / L.J. Ward, M.J. Timmins // Lett Appl Microbiol. 1999. — Vol.29. — P. 90−92.
  312. Williams, C.L. Helicobacter pylori: bacteriology and laboratory diagnosis / C.L. Williams // J Infect. 1997. — Vol. 34. — P. 1−5.
  313. Whittaker, R.H. Communities and ecosystems / R.H. Whittaker N.Y.- L.: Macmillan, 1970. — 162 p.
  314. Whittaker, R.H. Evolution end measurement of species divercity / R.H. Whittaker // Taxon. 1972. — V.21, № 2/3 — P. 213−251.
  315. Yakimov, V. Multifractal diversity-area relationship at small scales in dune slack plant communities / V. Yakimov, B. Bossuyt, D. Iudin, D. Gelashviliy // Oikos. 2008. — V. 117. — P. 33 — 39.
  316. Yu, Z. Dynamics of bacterial community in solid-state fermented feed revealed by 16S rRNA / Z. Yu, B. Dong, W. Lu // Lett Appl Microbiol. 2009. -Vol.49, № 2.-P. 166−72.
  317. Yun, J.W. Fructooligosaccharides Occurence, Preparation and Applications / J.W. Yun // Enzyme a Microbiol. Technol. -1996. — Vol. 19. — P. 107 -117.
  318. Zhong, W. Differentiation of lactobacillus species by molecular typing / W. Zhong, R. Millsap, H. Bialkowska-Hobrzanska // Appl. Environ Microbiol. -1998. Vol.64, № 7. -P. 2418−2423.
  319. Zoetendal, E.G. DNA isolation protocols affect the detection limit of PCR approaches of bacteria in samples from the human gastrointestinal tract / E.G. Zoetendal, K. Ben-Amor, A.D. Akkermans // Syst Appl Microbiol. 2001. -Vol. 24, № 3. — P.405−410.
Заполнить форму текущей работой

Пора сдавать?