Помощь в учёбе, очень быстро...
Работаем вместе до победы

Конформационные переходы в сложных полиэлектролитных системах

Диссертация: Конформационные переходы в сложных полиэлектролитных системах
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Личный вклад. Результаты, изложенные в диссертации, получены лично автором. Постановка задач исследований, определение методов их решения и интерпретация результатов выполнены совместно с научным руководителем при его личном участии. Впервые показано, что увеличение размеров интерполимерных полиэлектролитных комплексов при введении низкомолекулярной соли может быть вызвано увеличением размеров… Читать ещё >

Содержание

  • ГЛАВА 1. Литературный обзор
    • 1. 1. Конформационные свойства полиэлектролитных макромолекул
    • 1. 2. Интерполимерные полиэлектролитные комплексы
    • 1. 3. Компактизация ДНК. Эффект молекулярного вытеснения
  • ГЛАВА 2. Интерполимерные полиэлектролитные комплексы. Влияние низкомолекулярной соли
    • 2. 1. Модель
    • 2. 2. Результаты вычислений
    • 2. 3. Вычисление видимых размеров частиц
    • 2. 4. Экспериментальные данные
  • ГЛАВА 3. Компактизация ДНК в растворах отрицательно заряженных белков
    • 3. 1. Свойства бычьего сывороточного альбумина
    • 3. 2. Теоретическая часть. Модель компактизации заряженной макромолекулы в растворе сильно заряженных частиц
    • 3. 3. Результаты вычислений
    • 3. 4. Экспериментальные данные

Конформационные переходы в сложных полиэлектролитных системах (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Полиэлектролиты — это макромолекулы, несущие в своей последовательности некоторую долю ионогенных групп. В полярных растворителях иноногенные группы диссоциируют, образуется заряженная полимерная цепь (макроион) и низкомолекулярные контрионы. Полиэлектролитами являются природные макромолекулы (к примеру, ДНК, белки), природные модифицированные макромолекулы (например, хитозан, целлюлоза) и синтетические полимеры (полиакриловая и полиметакриловая кислоты, сульфированный полистирол и т. д.). Полиэлектролиты могут содержать только одноименно отрицательно (полианионы) или положительно (поликатионы) заряженные группы или нести звенья с зарядами обоих знаков (полиамфолиты). Наличие зарядов, с одной стороны, и высокая степень полимеризации, с другой, обусловливают то, что полиэлектролиты обладают уникальными, не характерными как для незаряженных макромолекул, так и для низкомолекулярных электролитов, свойствами. Полиэлектролитные макромолекулы, как правило, хорошо растворяются в экологически чистом растворителе воде, их конформация весьма чувствительна к изменению свойств растворителя и внешней среды, полиэлектролитные макромолекулы обладают высокими способностями к внутрии межмолекулярной самоорганизации. По-видимому, во многом благодаря этому комплексу свойств природные полиэлектролитные макромолекулы функционируют в живой природе, а их модификации и синтетические аналоги находят широкое применение в различных областях промышленности. Важность глубокого понимания поведения полиэлектролитных макромолекул для многих областей науки и промышленности (к примеру, таких как молекулярная биология, биотехнология, косметология, фармацевтика, пищевая промышленность, нефтедобыча и т. д.) обусловила пристальный непрекращающийся интерес к изучению полиэлектролитов с самого начала развития полимерной науки и до настоящего времени. Однако, несмотря на большой объем исследований и совокупность полученных результатов, многие из важных полиэлектролитных систем остаются непонятыми.

Данная работа посвящена исследованию двух таких систем. Это интерполимерные комплексы, состоящие из макромолекул с различным сродством к растворителю, и комплексы ДНК и отрицательно заряженных белков.

Цель работы.

Исследование структуры интерполимерных полиэлектролитных комплексов, состоящих из макромолекул с различным сродством к растворителю, и построение теории компактизации ДНК в присутствии сильно заряженного белка, несущего одноименный с ДНК отрицательный заряд.

Научная новизна результатов.

•Впервые исследованы интерполимерные полиэлектролитные комплексы, состоящие из противоположно заряженных макроионов с различным сродством к растворителю, в растворах, содержащих низкомолекулярную соль.

•Впервые показано, что увеличение размеров интерполимерных полиэлектролитных комплексов при введении низкомолекулярной соли может быть вызвано увеличением размеров самого комплекса, а не ростом числа цепей, входящих в него.

• Впервые исследовано поведение ДНК в растворах одноименно заряженных белков и показано, что такие белки могут вызвать компактизацию ДНК.

•Впервые показано, что введение низкомолекулярной соли может привести к деколлапсу ДНК, компактизация которой была вызвана введением сильно отрицательно заряженного белка.

Практическая значимость работы определяется тем, что ее результаты уже применяются и перспективны для их дальнейшего использования при интерпретации и систематизации экспериментальных данных. Кроме того, результаты работы перспективны и с точки зрения непосредственного практического использования при создании новых функциональных материалов и систем для медицины, косметологии, фармацевтики.

Публикации. На основе результатов данной диссертационной работы опубликовано 9 печатных работ, из которых 3 статьи и 6 тезисов докладов.

Апробация работы. Основные результаты работы были доложены на 5-ой международной летней школе «ДНК и хромосомы: физический и биологический подходы» (DNA and Chromosomes: Physical and Biological Approaches), Корсика, Франция, 2009 г.- на втором азиатском симпозиуме по современным материалам (2nd Asian symposium on advanced materials), г. Шанхай, Китай, 2009 г.- на международной конференции «Горизонты молодых в физике полимеров» (Young frontiers on polymer physics), Киото, Япония, 2009 г.- Пятой Всероссийской Каргинская конференции «Наука о полимерах 21-му веку», г. Москва, Россия, 2009 г.- всемирном полимерном конгрессе (World Polymer Congress MACR02010), г. Глазго, Великобритания, 2010 г.- Международном форуме по нанотехнологиям, г. Москва, 2010 г.

Личный вклад. Результаты, изложенные в диссертации, получены лично автором. Постановка задач исследований, определение методов их решения и интерпретация результатов выполнены совместно с научным руководителем при его личном участии.

Структура и объем диссертации

Диссертация состоит из введения, трех глав, заключения и содержит 107 страницы, включает 35 рисунков и список литературы из 136 наименований.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

.

В работе были исследованы сложные полиэлектролитные системы, обладающие необычным откликом на введение низкомолекулярной соли: стехиометрические интерполимерные полиэлектролитные комплексы, состоящие из макромолекул с одинаковым зарядом, но различным сродством к растворителю, и молекулы ДНК в растворах одноименно и сильно заряженных белков.

По результатам работы можно сделать следующие выводы.

Построена теория, описывающая интерполимерные полиэлектролитные комплексы, состоящие из макромолекул с различным сродством к растворителю, в присутствии низкомолекулярной соли. Показано, что при введении низкомолекулярной соли интерполимерные полиэлектролитные комплексы, состоящие из макромолекул с различным сродством к растворителю, претерпевают переход клубок-глобула, сохраняя структуру «ядро-гидрофильная оболочка», и только при дальнейшем увеличении концентрации соли разрушаются.

Построена теория компактизации ДНК в растворах сильно и одноименно заряженных белковых молекул. Показано, что введением отрицательно заряженного белка можно вызвать коллапс ДНК, который происходит как фазовый переход первого рода. Добавление низкомолекулярной соли в растворы, содержащие такие белки, может ослаблять их действие как компактизующего агента и вызвать возвратный деколлапс ДНК.

Теоретические результаты находятся в соответствии с экспериментальными данными.

Благодарности.

В заключение хотелось бы выразить благодарность своему научному руководителю академику А. Р. Хохлову за постановку интересных задач, обсуждение полученных результатов и поддержку в решении научных проблем.

Автор выражает особую благодарность всем сотрудникам, студентам и аспирантам кафедры физики полимеров и кристаллов за ценные замечания и создание приятной научной атмосферы при работе над диссертацией.

Особую признательность автор выражает родителям и друзьям.

Показать весь текст

Список литературы

  1. А.Ю. Гросберг, А. Р. Хохлов. Статистическая физика макромолекул. Наука, Москва, 1989.
  2. И.М. Лифшиц. Некоторые вопросы статистической теории биополимеров. -ЖЭТФ 1968, т.55, стр. 2408−2422.
  3. И.М. Лифшиц, А. Ю. Гросберг, А. Р. Хохлов. Объемные взаимодействия в статистической физике полимерной макромолекулы. -УФН1979, т.127, стр. 353−389.
  4. А.Ю. Гросберг, А. Р. Хохлов. Полимеры и биополимеры с точки зрения физики. Интеллект, 2010.
  5. P.G. de Gennes, P. Pinkus, R. M Velasco, F. Brochard. Remarks on polyelectrolyte conformation. -J.Physique 1976, v. 37, pp. 1461−1473.
  6. P. Pfeuty, R.M. Velasco, P.G. de Gennes. Conformational properties of one isolated polyelectrolyte chain in d dimensions. J. Physique Lett. 1977, v. 38, pp. 5−9.
  7. A.R. Khokhlov. On the collapse of weakly charged polyelectrolytes. J.Phys.A: Math.Gen. 1980, v.13, pp. 979−987.
  8. M. Stevens, K. Kremer. Structure of salt-free linear polyelectrolytes. -Phys.Rev.Lett. 1993, v. 71, pp. 2228−2231.
  9. M. Stevens, K. Kremer. Form factor of free-salt linear polyelectrolyte. Macromolecules 1993, v.26, pp. 4717−4719.
  10. M. Stevens, K. Kremer. The nature of flexible linear polyelectrolyte in salt free solution: a molecular dynamics study. J.Chem.Phys. 1995, v. 103, pp. 1669−1690.
  11. M. Stevens, K. Kremer. Structure of salt-free linear polyelectrolytes in the Debye-Huckel approximation. J. de Physique 1996, v.6, pp. 1607−1613.
  12. J. Ray, G. Manning. Counterion and coion distribution function in the counterion condensation theory of polyelectrolyte. Macromolecules 1999, v.32, pp. 4588−4595.
  13. E.Yu. Kramarenko, A.R. Khokhlov, K.Yoshikawa. Collapse of polyelectrolyte macromolecules revisited. Macromolecules 1997, v.30, pp. 33 833 388.
  14. V.O. Aseyev, S.I. Klenin, H. Tenhu. Conformational changes of a polyelectrolyte in mixture of water and acetone. J.Polym.Sci.: Polym.Phys.Ed. 1998, v.36, pp. 1107−1114.
  15. V.O. Aseyev, H. Tenhu, S.I. Klenin. Contraction of a polyelectrolyte upon dilution. Light scattering studies on a polycation in saltless water-acetone mixtures. Macromolecules 1999, v.32, pp. 1838−1846.
  16. C. Tanford. Physical Chemistry of Macromolecules. Wiley, New York, 1961. Русский перевод: Ч. Тенфорд. Физическая химия полимеров. Издательство «Химия», Москва 1965.
  17. Polyelectrolyte solutions, ed. by S.A. Rice, M. Nagasawa. Academic Press, London, 1961.
  18. S.E. Kudaibergenov. Recent advances in the study of synthetic polyampholytes in solution. Adv.Polym. Sci. 1999, v. 144, pp. 116−197.
  19. M.B. Волькенштейн. Биофизика. Наука, Москва, 1981.
  20. S.F. Edwards, P.R. King, P. Pinkus. Phase changes in polyampholytes. -Ferroelectrics 1980, v.30, pp. 3−6.
  21. Y. Kantor, M. Kardar. Instabilities of charged polyampholytes. -Phys. Rev. E. 1995, v.51, pp. 1299−1312
  22. A. Bhattacharjee, P. Kundu, A.Dua. Self-consistent theory of structures and transitions in weak Polyampholytes. — Macromol. Theory Simul. 2011, v.20, pp.75−84.
  23. J. Wittmer, A. Johner, J.-F. Joanny. Random and alternating polyampholytes. -Europhys. Lett. 1993, v.24, pp. 263−268.
  24. Е.Ю. Крамаренко, O.E. Филиппова, А. Р. Хохлов. Полиэлектролитные гели как высокочувствительные полимеры. -Высокомолекул. Соед. 2006, Т.48С, стр. 1−20.
  25. Responsive Gels. ed. by К. Dusek. Advances in Polymer Science. 1993, v.109,v.110.
  26. T. Tanaka. Collapse of gels and critical endpoint. Phys.Rev.Lett. 1978, v.40, pp. 820−823.
  27. T. Tanaka. Phase transition in gels and a single polymer. Polymer 1978, v.20, pp. 1404−1412.
  28. T. Tanaka, D. Fillmore, S.-T. Sun, I. Nishio, G. Swislow, A. Shan. Phase transition in ionic gels. Phys.Rev.Lett. 1980, v.45, pp. 1636−1639.
  29. B.B. Василевская, A.P. Хохлов. К теории заряженных полимерных сеток. В сб.: Математические методы для исследования полимеров. Под ред. И. М. Лифшица и А. М. Молчанова. Пущино, 1982, стр. 45−52.
  30. В.В. Василевская, А. Р. Хохлов. Влияние соли на коллапс заряженных полимерных сеток. Высокомолекул. Соед. 1986, Т.28А, стр. 316 320.
  31. A.R. Khokhlov, S.G. Starodubtsev, V.V. Vasilevskaya. Conformational transitions in polymer gels: theory and experiment. Adv. Polym. Sci. 1993, v.109, pp. 123−171.
  32. С.Г. Стародубцев, В. Р. Рябина. Набухание и коллапс полиамфолитных сеток сополимеров акриламида с метакриловой кислотой и 1,2-диметил-5-винилпиридинийметилсульфат. — Высокомолекул.соед. А 1987, т.29, стр. 2281−2285.
  33. J.P. Baker, D.R. Stephens, H.W. Blanch, T.M. Prausnitz. Swelling equilibria for acrylamide-based polyampholyte hydrogels. — Macromolecules 1992, v.25, pp. 1955−1958.
  34. J.P. Baker, H.W. Blanch, T.M. Prausnitz. Swelling properties of acrylamide-based ampholytic hydrogels: comparison of experiments with theory.- Polymer 1995, v.36, pp. 1061−1069.
  35. A.E. English, S. Mate, T.A. Manzanares, X. Yu, A.Yu. Grosberg, T. Tanaka. Equilibrium swelling properties of polyampholyte hydrogels. -J.Chem.Phys. 1996, v. 104, pp. 8713−8720.
  36. G. Nisato, J.P. Munch, S.J. Candau. Swelling, structure and elasticity of polyampholyte hydrogels. -Langmuir 1999, v. 15, pp. 4236−4244.
  37. V.V. Vasilevskaya, A.R. Khokhlov, K. Yoshikawa. Single polyelectrolyte macromolecule in the salt solution: effect of escaped counter ions.- Macromol. Theory Simul. 2000, v.9, pp.600−607.
  38. R.M. Fuoss, H. Sadek. Mutual interaction of polyelectrolytes -Science 1949, v. 110, pp.552−554.
  39. E.A. Bekturov, L.A. Bimendina. Interpolymer Complexes. Adv. Polym.Sci. 1981, v.41,pp.99−147.
  40. E. Tsuchida, K. Abe. Interactions between macromolecules in solution and intermacromolecular complexes Adv. Polym. Sci. 1982, v.45, pp. l-119.
  41. B. Philipp, H. Dautzenberg, K.-J. Linow, J. Koetz, W. Dawydoff. Polyelectrolyte complexes recent developments and open problems. — Prog.
  42. Polym.Sci., 1989, v. 14, n. l, p.91−172
  43. B.A. Изумрудов, А. Б. Зезин, В. А. Кабанов. Равновесие интерполиэлектролитных реакций и явление молекулярного «узнавания» в растворах интерполиэлектролитных комплексов. Успехи химии, 1991, v. 60, № 7, с.1570−1595.
  44. M.W. Hsiang, R.D. Cole. Structure of histone Hl-DNA complex: Effect of histone HI on DNA condensation. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1977, v.74, pp.4852−4856.
  45. J.-P. Behr. Gene transfer with synthetic cationic amphiphilies -prospects for gene therapy. Bioconjug. Chem. 1994, v.5, n.5, p.382−389
  46. A.V. Kabanov, V.A. Kabanov. DNA complexes with polycations for the delivery of genetic material into cells. Bioconjug. Chem. 1995, v.6, n. l, p.7−20
  47. R. de Vries, M.C. Stuart. Theory and simulations of macroion complexation. — Current Opin. Colloid. Interface Sci. 2006, v. l 1, pp. 295−301
  48. D. Srivastava, M. Muthukumar. Interpenetration of Interacting Polyelectrolytes. Macromolecules 1994, v. 27, pp. 1461−1465
  49. R.G. Winkler. Complex formation in systems of oppositely charged polyelectrolytes: A molecular dynamics simulation study. Phys. Review E 2002, v. 66, 21 802 (1−7)
  50. R.G. Winkler. Universal properties of complexes formed by two oppositely charged flexible polyelectrolytes. New Journal of Physics 2004, v.6, pp. 1−9
  51. Z. Ou and M. Muthukumar. Entropy and enthalpy of polyelectrolyte complexation: Langevin dynamics simulations. J. Chem. Phys. 2006, v. 124, 154 902 (1−11)
  52. M. A. Trejo-Ramos, F. Tristan, J.-L. Menchaca, E. Perez, M. Chavez-Paez. Structure of polyelectrolyte complexes by Brownian dynamics simulation: Effects of the bond length asymmetry of the polyelectrolytes. J. Chem. Phys. 2007, v.126, 14 901 (1−8)
  53. K.-K. Kunze, R. R. Netz. Morphologies of semiflexible polyelectrolyte complexes. Europhys. Lett. 2002, v. 58, pp. 299−305.
  54. O. A. Gus’kova, A. S. Pavlov, P. G. Khalatur. Polymer Science, Ser. A, 2006, v. 48, pp. 763−770.
  55. C.F. Narambuena, E.P.M. Leiva, M. Chavez-Paez, E. Perez. Effect of chain stiffness on the morphology of polyelectrolyte complexes. A Monte Carlo simulation study. Polymer 2010, v.51, pp.3293−3302
  56. Y. Hayashi, M. Ullner, P. Linse. A Monte Carlo study of solutions of oppositely charged polyelectrolytes. J. Chem. Phys. 2002, v. 116, pp.6836−6845
  57. Y. Hayashi, M. Ullner, P. Linse. Complex formation in solutions of oppositely charged polyelectrolytes at different polyion compositions and salt content.- J. Phys. Chem. В 2003, v. 107, pp. 8198−8207
  58. Y. Hayashi, M. Ullner, P. Linse. Oppositely charged polyelectrolytes. Complex formation and effects of chain asymmetry.- J. Phys. Chem. В 2004, v. 108, pp.15 266−15 277
  59. A. F. Jorge, J. M. G. Sarraguce, R. S. Dias, А. А. С. C. Pais. Polyelectrolyte compaction by pH-responsive agents. Phys. Chem. Chem. Phys. 2009, v. 11, pp. 10 890−10 898.
  60. B.A. Изумрудов. Явления самосборки и молекулярного «узнавания» в растворах (био) полиэлектролитных комплексов. Успехиxumuu 2008, t.77, c.401−415
  61. V.Yu. Borue, I.Ya. Erukhimovich. A statistical theory of globular polyelectrolyte complexes. Macromolecules 1990, v. 23, pp. 3625−3632.
  62. J. Overbeek, M.J. Voorn. Phase separation in polyelectrolyte solutions: Theory of complex coacervation. Cell. Comp. Phys. 1957, v. 49, pp. 7−26.
  63. M. Castelnovo, J.-F. Joanny. Formation of polyelectrolyte multilayers Langmuir 2000, v. 16, pp. 7524−7532.
  64. M. Castelnovo, J.-F. Joanny. Complexation between oppositely charged polyelectrolytes: beyond the random phase approximation. Eur. Phys. J. E: Soft Matter 2001, v. 6, pp. 377−386.
  65. A. Ermoshkin, M. O. de la Cruz. Gelation in strongly charged polyelectrolytes. J. Polym. Sci. B 2004, v.42, pp. 766−776.
  66. A. Kudlay, A. Ermoshkin, M. O. de la Cruz. Complexation of oppositely charged polyelectrolytes: Effect of ion pair formation. -Macromolecules 2004, v. 37, pp. 9231−9241.
  67. P. M. Biesheuvel, M.C. Stuart. Electrostatic free energy of weakly charged macromolecules and intermacromolecular complexes consisting of oppositely charged polymers. Langmuir 2004, v. 20, pp. 2785−2791.
  68. P. M. Biesheuvel, M. A. C. Stuart. Cylindrical cell model for the electrostatic free energy of polyelectrolyte complexes. Langmuir 2004, v. 20, pp. 4764−4770.
  69. A. Kudlay, M.O. Cruz. Precipitation of oppositely charged polyelsectrolytes in salt solutions. J.Chem.Phys. 2004, v. 120, pp.405−412.
  70. J. Lee, Y.O. Popov, G.H. Fredrickson. Complex coacervation: A field theoretic simulation study of polyelectrolyte complexation. J.Chem.Phys. 2008, v.128, 22 4908(1−13).
  71. E. Spruijt, A.H. Westphal, J.W. Borst, M.A.C. Stuart, J. van der Gucht. Binodal compositions of polyelectrolyte complexes. Macromolecules 2010, v. 43, pp. 6476−6484.
  72. R. de Vries, M.C. Stuart. Fundamentals of Interface and Colloid Science-, Academic Press: London, 1991- v. 5.
  73. A. Harada, K. Kataoka. Formation of polyion complex micells in an aqueous milieu from a pair of oppositely-charged block-copolymers with poly (ethylene glycol) segments. Macromolecules 1995, v.28, pp.5294−5299.
  74. A. Harada, K. Kataoka. Chain length recognition: core-shell supramolecular assembly from oppositely charged block copolymers- Science 1999, v.238, pp.65−67.
  75. A.V. Kabanov, S.V. Vinogradov, Yu.G. Suzdaltseva, V.Yu. Alakhov. Water-soluble block polycations as carriers for oligonucleotide delivery. Bioconjugate Chem. 1995, v.6, pp.639−643.
  76. A.V. Kabanov, V.K. Bronich, V.A. Kabanov, K. Yu, A. Eisenberg. Soluble stoichiometric complexes from poly (N-ethyl-4-vinylpyridinium) cations and poly (ethylene oxide)-block-polymethacrylate anions. Macromolecules 1996, v.29, pp.6797−6802.
  77. E.Yu. Kramarenko, A.R. Khokhlov, P. Reineker. Micelle formation in a dilute solution of block copolymers with a polyelectrolyte block complexed with oppositely charged linear chains. J. Chem.Phys. 2003, v. l 19, pp.4945−4952.
  78. E.Yu. Kramarenko, A.R. Khokhlov, P. Reineker. Stoichiometric polyelectrolyte complexes of ionic block copolymers and oppositely charged polyions. J. Chem.Phys. 2006, v.125, 194 902 (1−8)
  79. M. Castelnovo. Thermodynamics of micellization of oppositely charged polymers. Europhys. Lett. 2003, v.62, pp.841−847.
  80. V.V. Vasilevskaya, L. Leclercq, M. Boustta, M. Vert, A.R. Khokhlov. Study of interpolymer complexes of oppositely charged macromolecules with different affinity to solvent. Macromolecules 2007, v.40, pp.5934−5940.
  81. S. K. Filippov, C. Konak, P. Kopeckova, L. Starovoytova, M. Spirkova, P. Stepanek. Effect of hydrophobic interactions on properties and stability of DNA-polyelectrolyte complexes. Langmuir 2010, v. 26, pp. 49 995 006.
  82. L. Lerman. A transition to a compact form of DNA in polymer solutions. Proc.Nat.Acad.Sci. USA 1971, v.68, pp. 1886−1890.
  83. L. Lerman. The polymer and salt induced condensation of DNA. In: Physico-chemical properties of the nucleic acids. Ed. by J. Duchesne, Academic, London, 1973, pp. 59−76.
  84. U.K. Laemmli, J.K. Paulson, V. Hitchins. Maturation of the head of backteriophage T4. A possible DNA-packing mechanism: in vitro cleavage of the head proteins and the structure of the core of the polyhead. J.Supramol.Struct. 1974, v.2, pp. 276−301.
  85. H.A. Чеботарева, Б. И. Курганов, Н. Б. Ливанова. Биохимические эффекты молекулярного краудинга. — Биохимия 2004, т. 69, с. 1522 — 1536.
  86. D. Miyoshi, N. Sugimoto. Molecular crowding effects on structure and stability of DNA. Biochimie 2008, v. 90, pp. 1040−1051.
  87. K. Richer, M. Nessling, P. Lichter. Macromolecular crowding and its potential impact on nuclear function Biochimica et Biophysica Acta. Molecular cell research 2008, v. 1783, pp. 2100−2107.
  88. V.A. Bloomfield. DNA condensation. Curr.Opin.Struct.Biol 1996, v.6, pp. 334−341.
  89. N.M. Akimenko, E.B. Dijakowa, Yu.M. Evdokimov, E.V. Frisman, Ya.M. Varshavsky. Viscosimetric study on compact form of DNA in water-salt solutions containing polyethyleneglycol. FEBSLetters 1973, v.38, pp. 61−63.
  90. U.K. Laemmli. Characterization of DNA condensates induced by poly (ethylene oxide) and polylesine. Proc.Nat.Acad.Sci. USA 1975, v.72, pp. 4288−4292.
  91. V.V. Vasilevskaya, A.R. Khokhlov, Y. Matsuzawa, K. Yoshikawa. Collapse of single DNA molecule in poly (ethylene glycol) solutions. -J.Chem.Phys. 1995, v.102, pp. 6595−6602.
  92. A.A. Zinchenko, K. Yoshikawa. Na+ shows a markedly higher potential than K+ in DNA compaction in a crowded environment.- Biophysical J. 2005, v.88, pp. 4118−4123.
  93. J. Kapuscinski, Z. Darzynkiewicz. Condensation of nucleic acids by intercalating aromatic cations. Proc.Nat.Acad.Sci. USA 1984, v.81, pp. 73 687 372.
  94. L.S. Gosule, J.A. Schellman. Compact form of DNA induced by spermidine. Nature 1976, v.259, pp. 333−335.
  95. L.S. Gosule, J.A. Schellman. Condensation with polyamines. I. Spectroscopic studies. J.Mol.Biology 1978, v.121, pp. 311−326.
  96. K. Yoshikawa, M. Takahashi, V.V. Vasilevskaya, A.R. Khokhlov. Large discrete transition in a single DNA molecule appears continuous in the ensemble. Phys.Rev.Lett. 1996, v.76, pp. 3029−3031.
  97. D.K. Chattoraj, L.S. Gosule, J.A. Schellman. DNA condensation with polyamines. II. Electron microscopy studies. J.Mol.Biology 1978, v. 121, pp. 327−337.
  98. R.W. Wilson, V.A. Bloomfield. Counterion-induced condensation of deoxyribonucleic acid. A light-scattering study. — Biochemistry 1979, v. 18, pp. 2192−2196.
  99. M. Takahashi, K. Yoshikawa, V.V. Vasilevskaya, A.R. Khokhlov. Discrete coil-globule transition of single duplex DNA induced by polyamines. -J.Phys.Chem. 1997, v. 101, pp. 9396−9401.
  100. J. Widom, R.L. Baldwin. Cation-induced toroidal condensation of DNA. Studies with Co3+(NH3)6. J.Mol.Biology 1980, v. 144, pp. 431−453.
  101. V.V. Vasilevskaya, A.R. Khokhlov, S. Kidoaki, K. Yoshikawa. Structure of collapsed persistent macromolecule: toroid vs. spherical globule. -Biopolymers 1997, v. 41, pp. 51−61.
  102. V.A. Bloomfield. Condensation of DNA by multivalent cations: considerations on mechanism. Biopolymers 1991, v.31, pp. 1471−1481.
  103. S.-M. Cheng, S.C. Mohr. Condensed state of nucleic acids. II. Effects of molecular size, base composition and presence of intercalating dyes on the i//~ transition of DNA. -Biopolymers 1975, v. 14, pp. 663−674.
  104. C.B. Post, B.C. Zimm. Light-scattering study of DNA condensation: competition between collapse and aggregation. Biopolymers 1982, v.21, pp. 2139−2160.
  105. R. Huey, S.C. Mohr. Condensed state of nucleic acids. III. /(+) and |/(.) conformational transitions of DNA induced by ethanol and salt. -Biopolymers 1981, v.20, pp. 2533−2552.
  106. S.M. Melnikov, V.G. Sergeev, K. Yoshikawa. Discrete coil-globule transition of large DNA induced by cationic surfactant. J ACS 1995, v. 117, pp. 2401−2408.
  107. S.M. Melnikov, V.G. Sergeyev, Y.S. Melnikova, K. Yoshikawa. Folding of long DNA chains in the presence of distearyldimethylammoniumbromide and unfolding induced by neutral liposomes. — Faraday Transaction 1997, v. 93, pp.283−288.
  108. A.A.Zinchenko, V.G.Sergeyev, S. Murata, K.Yoshikawa. Controlling the intrachain segregation on a single DNA molecule. JACS 2003, v. 125, pp. 4414−2408.
  109. V.G.Sergeyev, S.V.Mikhailenko, O.A.Pyshkina, I.V.Yaminsky, K.Yoshikawa. How does alcohol dissolve the complex of DNA with a cationic surfactant. JACS 1999, v.121, pp. 1780−1785.
  110. В.Г. Сергеев, О. А. Пышкина, А. А. Зинченко, С. В. Зезин, А. Б. Зезин, В. А. Кабанов. Механизм взаимодействия ДНК с поверхностно-активными веществами в водно-спиртовых средах и структура их комплексов. Высокомолекул. Соед. 2003, т.45А, стр. 493−500.
  111. О. Е. Philippova, Т. Akitaya, I.R. Mullagaliev, A.R. Khokhlov, К. Yoshikawa. Salt-controlled intrachain/interchain segregation in DNA complexed with polycation of natural origin Macromolecules 2005, v. 38, n.22, pp. 93 599 365.
  112. J. Naghizadah, A.R. Massih. Concentration-dependent collapse of a large polymer. Phys.Rev.Lett. 1978, v.40, pp. 1299−1302.
  113. C.B. Post, B.H. Zimm. Internal condensation of a single DNA molecule. Biopolymers 1979, v.18, pp. 1487−1501.
  114. C.B. Post, B.H. Zimm. Theory of DNA condensation: collapse versus aggregation. Biopolymers 1982, v.21, pp. 2123−2137.
  115. А.Ю. Гросберг, И. Я. Ерухимович, Е. И. Шахнович. О компактизации ДНК в разбавленных растворах. Биофизика 1981, т.24, стр. 415−420.
  116. A.Yu. Grosberg, I.Ya. Erukhimovich, E.I. Shakhnovich. On the theory of-compactization. Biopolymers 1982, v.21, pp. 2413−2432.
  117. H.L. Frisch, S J. Fesciyan. DNA phase transitions: the y transition of single coils. J.Polym.Sci.: Polym.Lett.Ed. 1979, v. 17, pp. 309−315.
  118. K Minagawa, Y. Matsuzawa, K. Yoshikawa, A.R. Khokhlov, M. Doi. Direct observation of the coil-globule transition in DNA molecules. -Biopolymers 1994, v. 34, pp. 555−558.
  119. K. Yoshikawa, Y. Matsuzawa. Discrete phase-transition of giant I DNA dynamics of globule formation from a single molecular chain. Physica D1995, v. 84, pp. 220−227.
  120. T. Iwataki, S. Kidoaki, T. Sakaue, K. Yoshikawa, S.S. Abramchuk. Competition between compaction of single chains and bundling of multiple chains in giant DNA molecules.- J. Chem.Phys. 2004, v. 120, pp. 4004−4011.
  121. A.A. Zinchenko, D.M. Baigl, N. Chen, O. Pyshkina, K. Endo, V.G. Sergeyev, K.Yoshikawa. Conformational behavior of giant DNA through binding with Ag+ and metallization. — Biomacromolecules 2008, v.9, n.7, pp. 1981−1987
  122. A.Gonzalez-Perez, J. Carlstedt, R.S. Dias, B. Lindman. Cyclodextrins in DNA decompaction. Colloid and Surfaces B 2010, v.76, n. l, pp. 20−27.
  123. S. Kidoaki, K.Yoshikawa. The folded state of long duplex-DNA chain reflects its solution history. Biophys.J. 1996, v.71, pp. 932−939.
  124. S. Matsumato, K. Morikawa, M. Yanagida. Light microscopic structure of DNA in solution studied by 4,6'-diamidino-2-phenylindole staining method. J. Molecular Biology 1981, v. 152, pp. 501−516.
  125. C. Bustamante. Direct observation and manipulation of single DNAmolecules using fluorescence microscopy. Rev.Biophys. Biophys.Chem. 1991, v.20, pp. 415−446.
  126. B.B. Василевская, С. Г. Стародубцев, A.P. Хохлов. Улучшение совместимости в полимерных системах посредством заряжения одного из компонентов. Высокомолекул.Соед. 1987, Т.29 В, стр. 930−933.
  127. V.V. Vasilevskaya, I.I. Potemkin, A.R. Khokhlov. Swelling and collapse of physical gels formed by associating telechelic polyelectrolytes. -Langmuir 1999, v.15, pp. 7918−7924.
  128. J. Huguet, M. Boustta, M. Vert. Water Soluble Polymers: Synthesis, Solution Properties, and Applications. McCormick, C.L. and Butler, G.B. (ed.), ACS Symposium Series 467, Washington, 1991, p.467.
  129. H. Dautzenberg, A. Zintchenko, C. Konak, T. Reschel, V. Syubr, K. Ulbrich. Polycationic graft copolymers as carriers for oligonucleotide delivery. Complexes of oligonucleotides with polycationic graft copolymers. Langmuir 2001, v. 17, pp. 3096−3102.
  130. Y. Sato, R. Moriyama, S. W. Choi, A. Kano, A. Maruyama. Spectroscopic investigation of cationic comb-type copolymers/DNA interaction: Interpolyelectrolyte complex enhancement synchronized with DNA hybridization. Langmuir 2007, v. 23, pp. 65−69.
  131. M.L. Ferrer, R. Duchowicz, B. Carrasco, J.G. de la Torre and A.U. Acuna. The Conformation of Serum Albumin in Solution- Biophys. J. 2001, v. 80, pp.2422−2430.
  132. U. Bohme, U. Scheler Effective charge of bovine serum albumin determined by electrophoresis NMR. Chem.Phys.Let. 2006, v. 435, pp. 342−345.
  133. A.K. Wright and M.R. Thompson. Hydrodynamic structure of bovine serum albumin determined by transient electric birefringence.- Byophys.J. 1975, v.15, pp.137−141.
Заполнить форму текущей работой

Пора сдавать?