Помощь в учёбе, очень быстро...
Работаем вместе до победы

Исследование структуры актинопоринов актиний Oulactis orientalis и Radianthus macrodactylus

Диссертация: Исследование структуры актинопоринов актиний Oulactis orientalis и Radianthus macrodactylus
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Одной из фундаментальных задач физико-химической биологии является выяснение молекулярных основ функционирования биологических мембран, выполняющих ряд важнейших для клеток функций. Мембрана является границей раздела в клеточной компартментализации, через нее осуществляются контакты клеток друг с другом и с окружающей средой, она также защищает клетку от действия агрессивных факторов окружающей… Читать ещё >

Содержание

  • Список сокращений
  • 2. Литературный обзор
    • 2. 1. Классификация пороформирующих токсинов (ПФТ)
    • 2. 2. Структура и механизм действия а-пороформирующих токсинов
      • 2. 2. 1. Колицин
      • 2. 2. 2. Актинопорины
        • 2. 2. 2. 1. Первичная структура актинопоринов
        • 2. 2. 2. 2. Вторичная и третичная структура актинопоринов
        • 2. 2. 2. 3. Механизм действия актинопоринов
    • 2. 3. (З-Пороформирующие токсины
      • 2. 3. 1. Холестеринзависимые цитолизины
      • 2. 3. 2. Стафилококковый а-гемолизин
      • 2. 3. 3. Антиген сибирской язвы
    • 2. 4. Пороформирующие антимикробные пептиды
      • 2. 4. 1. Механизм трансмембранного действия антимикробных пептидов
      • 2. 4. 2. Секропины
      • 2. 4. 3. Магаинины
      • 2. 4. 4. Дермасептины
      • 2. 4. 5. Мелиттин
      • 2. 4. 6. Аламетицин
      • 2. 4. 7. Пардаксин

Исследование структуры актинопоринов актиний Oulactis orientalis и Radianthus macrodactylus (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Одной из фундаментальных задач физико-химической биологии является выяснение молекулярных основ функционирования биологических мембран, выполняющих ряд важнейших для клеток функций. Мембрана является границей раздела в клеточной компартментализации, через нее осуществляются контакты клеток друг с другом и с окружающей средой, она также защищает клетку от действия агрессивных факторов окружающей среды. Важное направление в современных исследованиях составляет изучение механизмов транспорта ионов и метаболитов через мембраны, липид-белковых и белок-белковых взаимодействий в мембране, играющих ключевую роль в ряде биологических процессов. Многие из этих процессов жизненно важны для клеток, а некоторые из них ответственны за их гибель. Общепризнанными и универсальными инструментами в этих исследованиях являются аи (3-пороформирующие токсины (ПФТ), группа цитолитических полипептидов и белков, продуцируемая как прокариотическими, так и эукариотическими клетками. ПФТ многих бактерий являются инвазивными факторами ряда опасных заболеваний, что и предопределяет необходимость всестороннего изучения их структуры и механизма действия.

Наиболее изученными представителями ПФТ, наряду с холестеринингибируемыми цитолизинами грамположительных бактерий, являются сфингомиелинингибируемые цитолизины актиний — актинопорины. Уникальная пространственная организация и способность формировать в мембранах поры лежат в основе антиопухолевой, кардиостимулирующей, антипаразитарной и других видов биологической активности актинопоринов, т. е. ПФТ являются перспективными соединениями для создания новых лекарственных препаратов.

Настоящая работа является частью исследований, проводимых в Тихоокеанском институте биоорганической химии ДВО РАН по изучению структуры и функции биологически активных полипептидов актиний. Данная работа посвящена поиску, изучению физико-химических свойств, установлению структурно-функциональных взаимоотношений актинопоринов тропической актинии Radianthus macrodactylus и актинии Японского моря Oulactis orientalis.

2. Литературный обзор

Цитолитические токсины белковой природы продуцируют бактерии, насекомые, ядовитые рептилии, жалящие морские беспозвоночные. К настоящему времени охарактеризовано более 300 белковых токсинов и, по крайней мере, треть из них действует, разрушая клеточные мембраны [1]. Многие из этих токсинов формируют поры в клеточных мембранах, что приводит к дезорганизации их структуры и, в конечном итоге, к потере морфологической и функциональной целостности клеток (рис. 1). Поэтому в настоящее время токсины, обладающие мембранолитическим действием, принято называть пороформирующими токсинами (ПФТ).

5. Выводы.

1. Проведен скрининг актиний Японского и Охотского морей с целью поиска биологически активных полипептидов, обладающих цитолитической активностью, в результате которого определен перспективный для дальнейших исследований вид О. orientalis, широко распространенный в бореальных водах.

2. Из актинии О. orientalis выделены два полипептида (Or-А и Or-G), которые, согласно их физико-химическим характеристикам, липидной специфичности и механизму действия, отнесены к группе сфингомиелинингибируемых цитолитических полипептидов актиний — актинопоринам.

3. Методами молекулярной биологии установлены полные аминокислотные последовательности Oulactis актинопоринов Ог-А (165 а.о.) и Or-G (173 а.о.) и Radianthus актинопорина RTX-A (175 а.о.).

4. Методом сравнительного моделирования по аминокислотной последовательности полипептидов, предсказаны пространственные структуры Ог-А, Or-G и RTX-A, которые, за исключением //-концевых фрагментов молекул, имеют высокую степень подобия со структурами актинопоринов, установленными экспериментально.

5. Анализ структурно-функциональных взаимосвязей Oulactis актинопоринов Ог-А и Or-G и Radianthus актинопорина RTX-A подтвердил важность //-концевых а-спиральных фрагментов молекул актинопоринов для проявления ими гемолитической активности.

2.5.

Заключение

.

Уникальная способность ПФТ одновременно находиться в двух взаимно несовместимых состояниях определяет то, что в водорастворимом состоянии, токсин транспортируется от продуцирующей его клетки к клеткемишени, а в мембраносвязанном — токсин проявляет свое лирическое действие на клетку-мишень [6|. В водорастворимом состоянии у а-ПФТ гидрофобный а-спирализованпый транс мембранный регион скрыт внутри глобулы молекулы. Его конформация адаптирована к внешнему окружению как в растворимом, гак и в мембраносвязанном состоянии молекулы. В противоположность а-ПФТ, трансмембранные регионы ПФТ находится в водной среде в различных крнформэцИРнНЫ* МР^'^КУЛ.

Для перехода молекулы токсина в связанное с мембраной состояние существует соответствующий «пусковой механизм» (например, протеолиз защитного антигена сибирской язвы), инициирующий перестройку гидрофобных трансмембранных регионов в Р-шпильки, которые способны включаться в мембрану. Эти шпильки образуют пары со шпильками соседних протомеров олигомера, внедряющегося в мембрану.

Ряд особенностей структуры молекулы, которые присущи представителям обоих семейств ПФТ, облегчают взаимодействие токсинов с мембраной:

1) способность изменять конформацию при низких значениях рН (колицин А, дифтерийный токсин, эквинатоксин, защитный антиген сибирской язвы);

2) наличие полостей внутри глобулы молекулы, которые ускоряют ее конформационные изменения (колицины, перфринголизин О);

3) локализация ароматических аминокислотных остатков на поверхности молекулы токсина (эквинатоксины, стафилококковый а-гемолизин, перфринголизин О), что способствует взаимодействию токсина с мембраной.

Токсины обоих структурных семейств могут формировать поры, как в биологических, так и в модельных мембранах различного состава, что указывает на незначительную роль рецепторного взаимодействия токсина с мембраной. Исключением являются холестеринзависимые цитолизины.

Всестороннее исследование структуры и функции всех групп пороформирующих токсинов является не только важной фундаментальной задачей, но и необходимо с прикладной точки зрения, так как позволяет создать предпосылки к получению методами молекулярной биологии новых высокоспецифичных лекарственных препаратов на их основе.

ПФТ в настоящее время широко используются в биологических, биотехнологических и биомедицинских исследованиях. Их химическое и функциональное разнообразие обеспечивает огромный ресурс фармакологических инструментов, которые могут быть применены для изучения ключевых клеточных процессов и физиологических явлений, липид-белковых и белок-белковых взаимодействий, идентификации определенных аминокислотных остатков или областей в белках, которые являются существенными для их функции. Например, с помощью а-гемолизина были построены УФ-светочувствительные поры, поры, чувствительные к протеазам, металл-чувствительные поры и поры, чувствительные к определенным органическим молекулам [6]. В некоторых случаях пороформирующие токсины могут быть использованы как антибактериальные, противовирусные, антиопухолевые препараты. Таким образом, все вышеперечисленное стимулирует всестороннее исследование структуры и функции этой группы пороформирующих токсинов.

3. Результаты и обсуждение.

Пороформирующие токсины продуцируют не только наземные виды животных. (рептилии, насекомые, бактерии и др.), но и морские гидробионты, такие как актинии.

Актинии относят к простейшему уровню организации и вместе с медузами и кораллами образуют тип кишечнополостные (Coelenterata), который насчитывает около 9000 видов. Характерной особенностью кишечнополостных является наличие стрекательных клеток (книдобластов или нематоцистов), вырабатывающих ядовитый секрет, который защищает их от врагов, и с помощью которого они добывают пищу [189]. Секрет состоит из биологически активных полипептидов: нейротоксинов, модифицирующих воротный механизм натриевых каналов электровозбудимых мембранцитотоксинов, вызывающих лизис цитоплазматических мембран клеток эукариотпротеолитических ферментов и высокои низкомолекулярных ингибиторов протеиназ, биологическая роль которых в актиниях во многих случаях пока не ясна [36, 76, 190].

Показано, что цитолизины являются перспективными противоопухолевыми ^ соединениями [30, 191]. Поиск продуцентов новых актинопоринов среди тропических актиний и актиний, обитающих в холодных водах Японского и Охотского морей, сравнительное изучение их структуры позволит получить новые инструменты исследования молекулярной организации биологических мембран, а также проверить гипотезу, согласно которой актинопорины являются родовыми хемотаксономическими маркерами актиний.

3.1. Поиск биологически активных полипептидов в актиниях Японского и Охотского морей.

Наше внимание было направлено на поиск новых источников актинопоринов среди актиний Японского и Охотского морей. С этой целью нами был проведен скрининг нескольких видов актиний, собранных в 27 экспедиционном рейсе НИС щ.

Академик Опарин" в Охотском море в районе южного Сахалина и в заливе Посьета Хасанского района (табл. 3). Видовая принадлежность актиний была определена сотрудником Института биологии моря ДВО РАН (г. Владивосток) к.б.н. Костиной Е.Е.

Как известно, наряду с цитолизинами актинии продуцируют нейротоксины и ингибиторы протеиназ. Содержание цитолизинов, нейротоксинов и ингибиторов трипсина было определено в водных и этанольных экстрактах актиний. Самую высокую токсичность проявили этанольные экстракты Cribrinopsis similis и Stomphia sp. (ЛД5о = 36.55 и 53.36 мг/кг, соответственно). Этанольные экстракты остальных видов имели слабовыраженную токсичность (ЛД50 ~ 200−400 мг/кг). Обычно токсичность этанольных экстрактов актиний связывают, в основном, с действием нейротоксинов [76], вызывающих нарушение сердечной деятельности и остановку сердца экспериментальных животных (так ЛД50 нейротоксина RmlH из тропической актинии R. macrodactylus составляет 20 мкг/кг) [192] и, в меньшей степени, с цитолизинами [193, 194]. Поскольку в этанольных экстрактах исследуемых видов актиний Охотского и Японского морей гемолитическая активность не была обнаружена, можно предположить, что токсическое действие на экспериментальных животных оказывают нейротоксины. Водные экстракты актиний Actinostola callosa, Stomphia sp., Stomphia coccinea, Oulactis orientalis (залив Анива) не были токсичны (табл. 3). Интересно, что токсичность водных экстрактов актиний Actinostola sp., Metridium senile Jimbriatum, О. orientalis (залив Посьета) оказалась в два раза выше, чем соответствующих этанольных. Невысокую, в целом, токсичность водных экстрактов актиний можно объяснить, по-видимому, действием цитолизинов.

Ранее был определен уровень нейрои цитолизинов в этанольных и водных экстрактах 21 вида актиний Индийского океана (Сейшельские и Мальдивские острова, о-в Мадагаскар, о-в Маврикий) и Карибского моря [195]. Оказалось, что токсичность этанольных и водных экстрактов актиний бореальных вод на 2−3 порядка ниже, чем токсичность экстрактов тропических видов актиний.

Показано, что все водные экстракты актиний бореальных вод обладают гемолитической активностью (табл. 3). Но, как и в случае с нейротоксинами, даже самый высокий уровень активности, проявляемой актиниями С. similis и О. orientalis (залив Посьета) (64.93 и 5.68 ГЕ/мг, соответственно), был в несколько раз ниже, чем водных экстрактах актиний, распространенных в тропических водах (табл. 1).

Показать весь текст

Список литературы

  1. Alouf J.E. Pore-forming bacterial toxins: an overview // Pore-Forming Toxins. Springer, Heidelberg, Germany: van der Goot F.G. 2001. P. 1−14.
  2. Lakey J.H., Slatin S.L. Pore-forming colicins and their relatives // Pore-Forming Toxins. Springer, Heidelberg, Germany: van der Goot F.G. 2001. P. 131−161.
  3. Allured V.S., Collier R.J., Carroll S.F., McKay D.B. Structure of exotoxin A of Pseudomonas aeruginosa 3.0 A at resolution // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1986. Vol. 83. P. 1310−1324.
  4. Li J., Carrol J., Ellar D.J. Crystal structure of insecticidal delta-endotoxin from Bacillus thuringiensis at 2.5 A resolution //Nature. 1991. Vol. 353. P. 815−821.
  5. Choe S., Bennett M.J., Fujii G., Curmi P.M., Kantardjieff K.A., Collier R.J., Eisenberg D. The crystal structure of diphtheria toxin // Nature. 1992. Vol. 357. P. 216−222.
  6. Parker M.W., Feil S.C. Pore-forming protein toxins: from structure to function // Prog. Biophys. Mol. Biol. 2005. Vol. 88. P. 91−142.
  7. Wiener M., Freymann D., Ghosh P., Stroud R.M. Crystal structure of colicin la. // Nature. 1997. Vol. 385. P. 461−464.
  8. Song L., Hobaugh M.R., Shustak C., Cheley S., Bayley H., Gouaux J.E. Structure of staphylococcal a-hemolysin, a heptameric transmembrane pore // Science. 1996. Vol. 274. P. 1859−1866.
  9. Petosa C., Collier R.J., Klimpel K.R., Leppla S.H., Liddington R.C. Crystal structure of the anthrax toxin protective antigen //Nature. 1997. Vol. 385. P. 833−838.
  10. Rossjohn J., Feil S.C., McKinstry W.J., Tweten R.K., Parker M.W. Structure of a cholesterol-binding, thiolactivated cytolysin and a model of its membrane form // Cell. 1997. Vol. 89. P. 685−692.
  11. Parker M.W. Cryptic clues as to how water-soluble protein toxins form pores in membranes // Toxicon. 2003. Vol. 42. P. 1−6.
  12. Parker M.W., Postma J.P., Pattus F., Tucker A.D., Tsernoglou D. Refined structure of the pore-forming domain of colicin A at 2.4 A resolution // J. Mol. Biol. 1992. Vol. 224. P. 639−657.
  13. Parker M.W., Tucker A.D., Tsernoglou D., Pattus F. Insights into membrane insertion based on studies of colicins // Trends Biochem. Sci. 1990. Vol. 15. P. 126−129.
  14. Duche D., Parker M.W., Gonzalez-Manas J.M., Pattus F., Baty D. Uncoupled steps of the colicin A pore formation demonstrated by disulfide bond engineering // J. Biol. Chem. 1994. Vol. 269. P. 6332−6339.
  15. Lakey J.H., Duche D., Gonzalez-Manas J.M., Baty D., Pattus F. Fluorescence energy transfer distance measurements. The hydrophobic helical hairpin of colicin A in the membrane bound state//J. Mol. Biol. 1993. Vol. 230. P. 1055−1067.
  16. Zakharov S.D., Lindberg M., Griko Y., Salamamon Z., Tollin G., Prendergast F.G., Cramer W.A. Membrane-bound state of the colicin El channel domain as an extended two-dimensional array // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1998. Vol. 95. P. 4282−4287.
  17. Lindberg M., Zakharov S.D., Cramer W.A. Unfolding pathway of the colicin El channel protein on a membrane surface // J. Mol. Biol. 2000. Vol. 295. P. 679−692.
  18. Muga A., Gonzalez-Manas J.M., Lakey J.H., Pattus F.P., Surewicz W.K. pH-dependent stability and membrane interaction of the pore-forming domain of colicin A // J. Biol. Chem. 1993. Vol. 268. P. 1553−1557.
  19. Evans L.J.A., Goble M.L., Hales K., Lakey J.H. Different sensitivities to acid denaturation within a family of proteins: implications for acid unfolding and membrane translocation//Biochemistry. 1996. Vol. 35 P. 13 180−13 185.
  20. Baty D., Lakey J., Pattus F., Lazdunski C. A 136-amino-acid residue COOH-terminal fragment of colicin A is endowed with ionophoric activity // Eur. J. Biochem. 1990. Vol. 189. P. 409−413.
  21. Levinthal F., Todd A.P., Hubbel W.L., Levinthal C. A single tryptic fragment of colicin El can form an ion channel: stoichiometry con. rms kinetics // Proteins. 1991. Vol. 11. P. 254−262.
  22. Tory M.C., Merrill A.R. Adventures in membrane protein topology. A study of the membrane bound state of colicin El // J. Biol. Chem. 1999. Vol. 274. P. 24 539−24 549.
  23. Kem W.R. Sea anemone toxins: structure and action // The Biology of Nematocysts. Academic Press, New York: Hessinger D. A., Lenhoff H. M. 1988. P. 375−405.
  24. Calton G.J. Burnett J.W. Characterization of nematocyst venoms // The Biology of Nematocysts. Academic Press, Inc, San Diego: Hessinger D.A., Lenhoff H.M. 1988. P. 369 374.
  25. Anderluh G., Macek P. Cytolytic peptide and protein toxins from sea anemones (Anthozoa: Actiniaria) // Toxicon. 2002. Vol. 40. P. 111−124.
  26. M.M., Zykova T.A., Apalikova O.V., Shwets T.V., Kozlovskaya E.P. 2002. Biologically active polypeptides from the tropical sea anemone Radianthus macrodactylus II Toxicon. Vol. 40. P. 1197−1217.
  27. Turk T. Cytolytic toxins from sea anemones // J. Toxicol.-Toxin Rev. 1991. Vol. 10. P. 223−262.
  28. Macek P. Polypeptide cytolytic toxins from sea-anemones (Actiniaria) // FEMS Microbiol. Immunol. 1992. Vol. 105. P. 121−130.
  29. Kem W.R., Dunn B.M. Separation and characterization of four different amino acid sequence variants of a sea anemone (Stichodactyla helianthus) protein cytolysin // Toxicon. 1988. Vol. 26. P. 997−1008.
  30. Norton R.S., Macek P., Reid G.E., Simpson R.J. Relationship between the cytolysins tenebrosin-C from Actinia tenebrosa and equinatoxin II from Actinia equina II Toxicon. 1992. Vol. 30. P. 13−23.
  31. Khoo K.S., Kam W.K., Khoo H.E., Gopalakrishnakone P., Chung M.C.M. Purification and partial characterization of two cytolysins from a tropical sea anemone, Heteractis magnifica II Toxicon. 1993. Vol. 31. P. 1567−1579.
  32. Jiang X.Y., Yang W.L., Chen H.P., Tu H.B., Wu W.Y., Wei J.W., Wang J., Liu W. H, Xu A.L. Cloning and characterization of an acidic cytolysin cDNA from sea anemone Sagartia rosea // Toxicon. 2002. Vol. 40. P. 1563−1569.
  33. Anderluh G., Krizaj I., Strukelj В., Gubensek F., Macek P., Pungercar J. Equinatoxins, pore-forming proteins from sea anemone Actinia equina, belong to a multigene family //Toxicon. 1999. Vol. 37. P. 1391−1401.
  34. Pungercar J., Anderluh G., GubenSek F., Strukelj B. Sequence analysis of the cDNA encoding the precursor of equinatoxin V, a newly discovered hemolysin from the sea anemone Actinia equina II Biochem. Biophys. Acta. 1997. Vol. 1341. P. 105−107.
  35. Anderluh G., Pungercar J., Strukelj В., Macek P., GubenSek F. Cloning, sequencing and expression of equinatoxin II // Biochem. Biophys. Res. Comm. 1996. Vol. 220. P. 437 442.
  36. Lanio M.E., Morera V., Alvarez C., Tejuca M., Gomez Т., Pazos F., Basada V., Martinez D., Huerta V., Padron G., Chavez M.A. Purification and characterization of two hemolysins from Stichodactyla helianthus И Toxicon. 2001. Vol. 39. P. 187−194.
  37. Wang Y., Chua K.L., Khoo H.E. A new cytolysin from the sea anemone, Heteractis magnifica: isolation, cDNA cloning and functional expression // Biochem. Biophys. Acta. 2000. Vol. 1478. P. 8−18.
  38. Athanasiadis A., Anderluh G., Macek, P., Turk D. Crystal structure of the soluble form of equinatoxin II, a pore-forming toxin from the sea anemone Actinia equina II Structure. 2001. Vol. 9. P. 341−346.
  39. Macek P., Belmonte G., Pederzolli C., Menestrina G. Mechanism of action of equinatoxin II, a cytolysin from the sea anemone Actinia equina L. belonging to the family of actinoporins // Toxicology. 1994. Vol. 87. P. 205−227.
  40. Heuck A.P., Hotze E.M., Tweten R.K., Johnson A.E. Mechanism of membrane insertion of a multimeric beta-barrel protein. Perfringolysin О creates a pore using ordered and coupled conformation changes // Mol. Cell. 2000. Vol. 6. P. 1233−1242.
  41. Simpson R.J., Reid G.E., Moritz R.L., Morton C., Norton R.S. Complete amino acid sequence of tenebrosin-C, a cardiac stimulatory and haemolytic protein from sea anemone Actinia tenebrosa II Eur. J. Biochem. 1990. Vol. 190. P. 319−328.
  42. Thompson J.D., Higgins D.G., Gibson T.J. CLUSTALW: improving the senitivity of progressive multiple sequence aligment through sequence weighting, positionspecific gap penalties and weight matrix choice // Nucleic Acid Res. 1994. Vol. 22. P. 4673−4680.
  43. Menestrina G., Cabiaux V., Tejuca M. Secondary structure of sea anemone cytolysins in soluble and membrane bound form by infrared spectroscopy // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1999. Vol. 254. P. 174−180.
  44. Zhang W., Hinds M.G., Anderluh G., Hanse P.E., Norton R.S. Sequence-specific resonance assignments of the potent cytolysin equinatoxin II // J. Biomol. NMR. 2000. Vol. 18. P. 281−282.
  45. Malavasic M., Poklar N., Macek P., Vesnaver G. Fluorescence studies of the effect of pH, guanidine hydrochloride and urea on equinatoxin II conformation // Biochim. Biophys. Acta: Bio-Membranes. 1996. Vol. 1280. P. 65−72.
  46. Mancheno J.M., De los Rios V., Del Pozo A.M., Lanio M.E., Onaderra M., Gavilanes J.G. Partially folded states of the cytolytic protein sticholysin II // Biochim. Biophys. Acta. 2001. Vol. 1545. P. 122−1531.
  47. Poklar N., Volker J., Anderluh G., Macek P., Chalikian T.V. Acid- and base-induced conformational transitions of equinatoxin II // Biophys. Chem. 2001. Vol. 90. P. 103−121.
  48. Мабек P., Lebez D. Kinetics of hemolysis induced by equinatoxin, a cytolytic toxin from the sea anemone Actinia equina. Effect of some ions and pH H Toxicon. 1981. Vol. 19. P. 233−240.
  49. Doyle J.W., Kem W.R. Binding of a radiolabeled sea anemone cytolysin to erythrocyte membranes // Biochim. Biophys. Acta. 1989. Vol. 987. P. 181−186.
  50. Doyle J.W., Kem W.R., Vilallonga F.A. Interfacial activity of an ion channel-generating protein cytolysin from the sea anemone Stichodactyla helianthus II Toxicon. 1989. Vol. 27. P. 465−471.
  51. Michaels D.W. Membrane damage by a toxin from the sea anemone Stoichactis helianthus, I. Formation of transmembrane channels in lipid bilayers // Biochem. Biophys. Acta. 1979. Vol. 555. P. 67−78.
  52. Shin M.L., Michaels D.W., Mayer M.M. Membrane damage by a toxin from the sea anemone Stoichactis helianthus, II. Effect of membrane lipid composition in a liposome system // Biochem. Biophys. Acta. 1979. Vol. 555. P. 79−88.
  53. B.C., Лихацкая Г. Н., Козловская Э. П., Монастырная M.M., Еляков Г. Б. Влияние гемолизина из морской актинии Radianthus macrodactylus на проницаемость липидных мембран // Биол. мембраны. 1984. Т. 1. С. 1019−1024.
  54. Э.П., Иванов А. С., Мольнар А. А., Григорьев П. А., Монастырная М. М., Халилов Э. М., Еляков Г. Б. Ионные каналы в мембранах, индуцированные гемолизином из актинии Radianthus macrodactylus II Докл. АН СССР. 1984. Т. 277. С. 1491−1493.
  55. Bernheimer A.W., Avigad L.S. Properties of a toxin from the sea anemone Stoichactis helianthus, including specific binding to sphingomyelin // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1976. Vol. 73. P. 467−471.
  56. Meinardi E., Florin-Christensen M., Paratcha G., Azcurra J.M., Florin-Christensen J. The molecular basis of the self non self selectivity of a coelenterate toxin // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1995. Vol. 216. P. 348−354.
  57. Caaveiro J.M., Echabe I., Gutierrez-Aguirre I., Nieva J.L., Arrondo J.L.R., Gonzales-Manas J.M. Differential interaction of equinatoxin II with model membranes in response to lipid composition // Biophys. J. 2001. Vol. 80. P. 1343−1353.
  58. Macek P., Zecchini M., Stanek K., Menestrina G. Effect of membrane-partitioned n-alcohols and fatty acids on pore-forming activity of a sea anemone toxin // Eur. Biophys. J. 1997. Vol. 25. P. 155−162.
  59. Tejuca M., Serra M.D., Ferraras M., Lanio M.E., Menestrina G. Mechanism of membrane permeabilisation by sticholysin I, a cytolysin isolated from the venom of the sea anemone Stichodactyla helianthus И Biochemistry. 1996. Vol. 35. P. 14 937−14 957.
  60. Poklar N., Fritz J., Macek P., Vesnaver G., Chalikian T.V. Interaction of the pore-forming protein equinatoxin II with model lipid membranes: A calometric and spectroscopic study // Biochemistry. 1999. Vol. 38. P. 14 999−15 008.
  61. Mouritsen O.G., Jorgensen K., Honger T. Permeability of lipid bilayers near the phase transition // Permeability and Stability of Lipid Bilayers. CRC Press, London: Disalvo E.A., SimonS.A. 1995. P. 137−160.
  62. White S.H., Wimley W.C. Hydrofobic interaction of peptides with membrane interfaces II Biochem. Biophys. Acta: Rev. Biomembr. 1998. Vol. 1376. P. 339−352.
  63. .Н., Гелашвили Д. Б. Ядовитые кишечнополостные // Зоотоксинология. Ядовитые животные и их яды. Москва: Высшая школа. 1985. С. 36−54.
  64. Anderluh G., Pungercar J., Krizaj I., Strukelj В., Gubensek F., Macek P. TV-terminal truncation mutagenesis of equinatoxin II, a pore-forming protein from the sea anemone Actinia equina II Protein Eng. 1997. Vol. 10. P. 751−755.
  65. Malovrh P., Barlic A., Podlesek Z., Macek P., Menestrina G., Anderluh G. Structure-function studies of tryptophan mutants of equinatoxin II, a sea anemone pore-forming protein // Biochem. J. 2000. Vol. 346. P. 223−232.
  66. Anderluh G., Barlic A., Krizaj I., Menestrina G., Gubensek F., Macek P. Avidin-FITC topological studies with three cysteine mutants of equinatoxin II, a sea anemone pore-forming protein II Biochem. Biophys. Res. Commun. 1998. Vol. 242. P. 187−190.
  67. Anderluh G., Barlic A., Portich C., Macek P. Lysine 77 is a key residue in aggregation of equinatoxin II pore-forming toxin from the sea anemone Actinia equina II J. Membrane Biol. 2000. Vol. 173. P. 47−55.
  68. Anderluh G., Dalla Serra M., Viero G., Guella G., Macek P., Menestrina G. Pore formation by equinatoxin II, a eukaryotic protein toxin, occurs by induction of nonlamellar lipid structures // J. Biol. Chem. 2003. Vol. 278. P. 45 216−45 223.
  69. Turk Т., Macek P., GubenSek F. Chemical modification of equinatoxin II, a lethal and cytolytic toxin from the sea anemone Actinia equina L // Toxicon. 1989. Vol. 27. P. 375−384.
  70. Turk Т., Macek P., Gubensek F. The role of tryptophan in structural and functional properties of equinatoxin II // Biochem. Biophys. Acta. 1992. Vol. 1119. P. 1−4.
  71. Khoo H.E., Fong C.L., Yuen R., Chen D.C. Stimulation of haemolytic activity of sea anemone cytolysins by 8-anilino-l-naphthalenesulphonate // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1997. Vol. 232. P. 422−426.
  72. Campos A.M., Lissi E.A., Vergara C., Lanio M.E., Alvarez C., Pazos I., Morera V., Garcia Y., Martinez D. Kinetics and mechanism of St I modification by peroxyl radicals // J. Protein Chem. 1999. Vol. 18. P. 297−306.
  73. Schiffer M., Edmundson A.B. Use of helical wheels to represent the structures of protein and to identify segments with helical potential // Biophys. J. 1967. Vol.7. P. 121 135.
  74. Tweten R.K., Parker M.W., Johnson A.E. The cholesterol-dependent cytolysins // Pore-Forming Toxins. Springer, Heidelberg, Germany: van der Goot F.G. 2001. P. 1−14.
  75. Giddings K.S., Johnson A.E., Tweten R.K. Rede. ning cholesterol’s role in the mechanism of the cholesteroldependent cytolysins // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2003. Vol. 100. P. 11 315−11 320.
  76. Sekino-Suzuki N., Nakamura M., Mitsui K.I., Ohno-Iwashita Y. Contribution of individual tryptophan residues to the structure and activity of y-toxin (perfringolysin-O), a cholesterol-binding cytolysin // Eur. J. Biochem. 1996. Vol. 241. P. 941−947.
  77. Jacobs Т., Daiji A., Frahm N., Rohde M., Wehland J., Chakraborty Т., Weiss S. Listeriolysin O: cholesterol inhibits cytolysis but not binding to cellular membranes // Mol. Microbiol. 1998. Vol. 28. P. 1081−1089.
  78. Shatursky O., Heuck A.P., Shepard L.A., Rossjohn J., Parker M.W., Johnson A.E., Tweten R.K. The mechanism of membrane insertion for a cholesterol-dependent cytolysin: a novel paradigm for pore-forming toxins // Cell. 1999. Vol. 99. P. 293−299.
  79. Petosa C., Liddington R.C. The anthrax toxin // Protein Toxin Structure. R. G. Landes Co., Austin, Texas: Parker, M.W. 1996. P. 97−121.
  80. Pezard C., Berche P., Mock M. Contribution of individual toxin components to virulence of Bacillus anthracis // Infect. Immun. 1991. Vol. 59. P. 3472−3477.
  81. Gordan V.M., Klimpel K.R., Arora N., Henderson M.A., Leppla S.H. Proteolytic activation of bacterial toxins by eukaryotic cells is performed by furin and by additional cellular proteases // Infect. Immun. 1995. Vol. 63. P. 82−87.
  82. Milne J.C., Furlong D., Hanna P.C., Wall J.S., Collier R.J. Anthrax protective antigen forms oligomers during intoxication of mammalian cells // J. Biol. Chem. 1994. Vol. 269. P. 20 607−20 612.
  83. Blaustein R.O., Koehler T.M., Collier R.J., Finkelstein A. Anthrax toxin: channel-forming activity of protective antigen in planar phospholipid bilayers // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1989. Vol. 86. P. 2209−2213.
  84. Milne J.C., Collier R.J. pH-dependent permeabilization of the plasma membrane of mammalian cells by anthrax protective antigen // Mol. Microbiol. 1993. Vol. 10. P. 647−653.
  85. Benson E.L., Huynh P.D., Finkelstein A., Collier R.J. Identi. cation of residues lining the anthrax protective antigen channel // Biochemistry. 1998. Vol. 37. P. 3941−3948.
  86. Papo N., Shai Y. Can we predict biological activity of antimicrobial peptides from their interactions with model phospholipid membranes? // Peptides. 2003 Vol. 24. P. 16 931 703.
  87. Boman H.G. Peptide antibiotics and their role in innate immunity // Annu. Rev. Immun. 1995. Vol. 13. P. 61−92.
  88. Steiner H., Hultmark D., Engstrom A., Bennich H., Boman H.G. Sequence and specificity of two antibacterial proteins involved in insect immunity // Nature. 1981. Vol.292. P. 246−248.
  89. Zasloff M. Magainins, a class of antimicrobial peptides fromXenopus skin: isolation, characterization of two active forms, and partial cDNA sequence of a precursor // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1987. Vol. 84. P. 5449−5453.
  90. Мог A., Nguyen V.H., Delfour A., Migliore-Samour D., Nicolas P. Isolation, amino acid sequence, and synthesis of dermaseptin, a novel antimicrobial peptide of amphibian skin
  91. Biochemistry. 1991. Vol. 30. P. 8824−8830.
  92. Papo N., Oren Z., Pag U., Sahl H.G., Shai Y. The consequence of sequence alteration of an amphipathic alpha-helical antimicrobial peptide and its diastereomers // J. Biol. Chem. 2002. Vol. 277. P. 33 913−33 921.
  93. Habermann E., Jentsch J. Sequence analysis of melittin from tryptic and peptic degradation products Sequence analysis of melittin from tryptic and peptic degradation products Hoppe Seyler’s Z // Physiol. Chem. 1967. Vol. 348. P. 37−50.
  94. Shai Y., Fox J., Caratsch C., Shih Y.L., Edwards C., Lazarovici P. Sequencing and synthesis of pardaxin, a polypeptide from the Red Sea Moses sole with ionophore activity // FEBS Lett. 1988. Vol. 242. P. 161−166.
  95. Mignogna G., Simmaco M., Kreil G., Barra D. Antibacterial and haemolytic peptides containing d-alloisoleucine from the skin of Bombina variegate I IEMBO J. 1993. Vol. 12. P. 4829−4832.
  96. Barra D., Simmaco M. Amphibian skin: a promising resource for antimicrobial peptides//Trends Biotechnol. 1995. Vol. 13. P. 205−209.
  97. Johansson J., Gudmundsson G.H., Rottenberg M.E., Berndt K.D., Agerberth B. Conformation-dependent antibacterial activity of the naturally-occuring human peptide LL-37//J. Biol. Chem. 1998. Vol. 273. P. 3718−3724.
  98. Andreu D., Merrifield R.B., Steiner H., Boman H.G. N-terminal analogues of cecropin A: synthesis, antibacterial activity, and conformational properties // Biochemistry. 1985. Vol.24. P. 1683−1688.
  99. Steiner H., Andreu D., Merrifield R.B. Binding and action of cecropin and cecropin analogues: antibacterial peptides from insects // Biochim. Biophys. Acta. 1988. Vol. 939. P. 260−266.
  100. Chen H.C., Brown J.H., Morell J.L., Huang C.M. Synthetic magainin analogues with improved antimicrobial activity // FEBS Lett. 1988. Vol. 236. P. 462−466.
  101. Zasloff M., Martin В., Chen H.C. Antimicrobial activity of synthetic magainin peptides and several analogues // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1988. Vol. 85. P. 910−913.
  102. Segrest J.P., De L.H., Dohlman J.G., Brouillette C.G., Anantharamaiah G.M. Amphipathic helix motif: classes and properties // Proteins. 1990. Vol. 8. P. 103−117.
  103. Мог A., Amiche M., Nicolas P. Structure, synthesis, and activity of dermaseptin b, a novel vertebrate defensive peptide from frog skin: relationship with adenoregulin // Biochemistry. 1994. Vol. 33. P. 6642−6650.
  104. Gazit E., Lee W.J., Brey P.T., Shai Y. Mode of action of the antibacterial cecropin B2: a spectrofluorometric study//Biochemistry. 1994. Vol. 33. P. 10 681−10 692.
  105. Gazit E., Boman A., Boman H.G., Shai Y. Interaction of the mammalian antibacterial peptide cecropin PI with phospholipid vesicles // Biochemistry. 1995. Vol. 34. P. 1 147 911 488.
  106. Wade D., Boman A., Wahlin В., Drain C.M., Andreu D., Boman H.G., Merrifield R.B. All-D amino acid-containing channel-forming antibiotic peptides // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1990. Vol. 87. P. 4761−4765.
  107. Bessalle R., Kapitkovsky A., Gorea A., Shalit I., Fridkin M. All-D-magainin: chirality, antimicrobial activity and proteolytic resistance // FEBS Lett. 1990. Vol. 274. P. 151−155.
  108. Merrifield E.L., Mitchell S.A., Ubach J., Boman H.G., Andreu D., Merrifield R.B. D-enantiomers of 15-residue cecropin A-melittin hybrids // Int. J. Pept. Protein Res. 1995. Vol. 46. P. 214−220.
  109. Shai Y., Oren Z. Diastereoisomers of cytolysins, a novel class of potent antibacterial peptides // J. Biol. Chem. 1996. Vol. 271. P. 7305−7308.
  110. Oren Z., Hong J., Shai Y. A repertoire of novel antibacterial diastereomeric peptides with selective cytolytic activity//J. Biol. Chem. 1997. Vol. 272. P. 14 643−14 649.
  111. Oren Z., Shai Y. Selective lysis of bacteria but not mammalian cells by diastereomers of melittin: structure-function study // Biochemistry. 1997. Vol. 36. P. 1826−1835.
  112. Y., Rapaport D., Мог A., Nicolas P., Shai Y. Interaction of antimicrobial dermaseptin and its fluorescently labeled analogues with phospholipid membranes // Biochemistry. 1992. Vol. 31. P. 12 416−12 423.
  113. Ehrenstein G., Lecar H. Electrically gated ionic channels in lipid bilayers // Quart Rev. Biophys. 1977. Vol. 10. P. 1−34.
  114. Shai Y. Mechanism of the binding, insertion and destabilization of phospholipid bilayer membranes by alpha-helical antimicrobial and cell non-selective membrane-lytic peptides. //Biochim. Biophys. Acta. 1999. Vol. 1462. P. 55−70.
  115. Matsuzaki K., Murase O., Fujii N., Miyajima K. Translocation of a channel-forming antimicrobial peptide, magainin 2, across lipid bilayers by forming a pore // Biochemistry. 1995. Vol. 34. P. 6521−6526.
  116. Ludtke S.J., He K., Heller W.T., Harroun T.A., Yang L., Huang H.W. Membrane pores induced by magainin // Biochemistry. 1996. Vol. 35. P. 13 723−13 728.
  117. Matsuzaki K., Murase O., Fujii N., Miyajima K. An antimicrobial peptide, magainin 2, induced rapid flip-flop of phospholipids coupled with pore formation and peptide translocation// Biochemistry. 1996. Vol. 35. P. 11 361−11 368.
  118. Sawyer J.G., Martin N.L., Hancock R.E. Interaction of macrophage cationic proteins with the outer membrane of Pseudomonas aeruginosa I I Infect. Immun. 1988. Vol. 56. P. 693−698.
  119. Piers K.L., Brown M.H., Hancock R.E. Improvement of outer membrane-permeabilizing and Iipopolysaccharide-binding activities of an antimicrobial cationic peptide by C-terminal modification // Antimicrob. Agents Chemother. 1994. Vol. 38. P. 2311−2316.
  120. Piers K.L., Hancock R.E. The interaction of a recombinant cecropin/melittin hybrid peptide with the outer membrane of Pseudomonas aeruginosa II Mol. Microbiol. 1994. Vol. 12. P. 951−958.
  121. Falla T.J., Karunaratne D.N., Hancock R.E.W. Mode of action of the antimicrobial peptide indolicidin // J. Biol. Chem. 1996. Vol. 271. P. 19 298−19 303.
  122. Hultmark D., Steiner H., Rasmuson Т., Boman H.G. Insect immunity. Purification and properties of three inducible bactericidal proteins from hemolymph of immunized pupae of Hyalophora cecropia // Eur. J. Biochem. 1980. Vol. 106. P. 7−16.
  123. Boman H.G., Faye I., Gudmundsson G.H., Lee J.Y., Lidholm D.A. Cell-free immunity in Cecropia. A model system for antibacterial proteins // Eur. J. Biochem. 1991. Vol. 201. P. 23−31.
  124. Hultmark D. Immune reactions in Drosophila and other insects: a model for innate immunity // Trends Genet. 1993. Vol. 9. P. 178−183.
  125. Lee J.Y., Boman A., Sun C.X., Andersson M., Jornvall H., Mutt V., Boman H.G. Antibacterial peptides from pig intestine: isolation of a mammalian cecropin // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1989. Vol. 86. P. 9159−9162.
  126. Lee W.J., Brey P.T. Isolation and identification of cecropin antibacterial peptides from the extracellular matrix of the insect integument // Anal. Biochem. 1994. Vol. 217. P. 231−235.
  127. Lockey T.D., Ourth D.D. Formation of pores in Escherichia coli cell membranes by a cecropin isolated from hemolymph of Heliothis virescens larvae // Eur. J. Biochem. 1996. Vol.236. P. 263−271.
  128. Iwai H., Nakajima Y., Natori S., Arata Y., Shimada I. Solution conformation of an antibacterial peptide, sarcotoxin I A, as determined by 1H-NMR // Eur. J. Biochem. 1993. Vol.217. P. 639−644.
  129. Sipos D., Andersson M., Ehrenberg A. The structure of the mammalian antibacterial peptide cecropin PI in solution, determined by proton-NMR // Eur. J. Biochem. 1992. Vol. 209. P. 163−169.
  130. Frohm M., Gunne H., Bergman A.C., Agerberth В., Bergman Т., Boman A., Liden S., Jornvall H., Boman H.G. Biochemical and antibacterial analysis of human wound and blister fluid // Eur. J. Biochem. 1996. Vol. 237. P. 86−92.
  131. Agerberth В., Gunne H., Odeberg J., Kogner P., Boman H.G., Gudmundsson G.H. FALL-39, a putative human peptide antibiotic, is cysteine-free and expressed in bone marrow and testis // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1995. Vol. 92. P. 195−199.
  132. Gudmundsson G.H., Agerberth В., Odeberg J., Bergman Т., Olsson В., Salcedo R. The human gene FALL39 and processing of the cathelin precursor to the antibacterial peptide LL-37 in granulocytes // Eur. J. Biochem. 1996. Vol. 238. P. 325−332.
  133. Giovannini M.G., Poulter L., Gibson B.W., Williams D.H. Biosynthesis and degradation of peptides derived from Xenopus laevis prohormones II Biochem. J. 1987. Vol. 243. P. 113−120.
  134. Gibson B.W., Poulter L., Williams D.H., Maggio J.E. Novel peptide fragments originating from PGLa and the caerulein and xenopsin precursors from Xenopus laevis II J. Biol. Chem. 1986. Vol. 261. P. 5341−5349.
  135. Unger Т., Oren Z., Shai Y. The effect of cyclization of magainin 2 and melittin analogues on structure, function, and model membrane interactions: implication to their mode of action // Biochemistry. 2001. Vol. 40. P. 6388−6397.
  136. Мог A., Nicolas P. Isolation and structure of novel defensive peptides from frog skin //Eur. J. Biochem. 1994. Vol. 219. P. 145−154.
  137. Мог A., Nguyen V.H., Delfour A., Migliore-Samour D., Nicolas P. Isolation, amino acid sequence, and synthesis of dermaseptin, a novel antimicrobial peptide of amphibian skin // Biochemistry. 1991. Vol. 30. P. 8824−8830.
  138. С., Мог A., Dagger F., Nicolas P., Hernandez A., Benedetti E.L., Dunia I. Functional and structural damage in Leishmania mexicana exposed to the cationic peptide dermaseptin // Eur. J. Cell Biol. 1992. Vol. 59. P. 41424.
  139. R., Dagan A., Мог A. Structure-activity relationship study of antimicrobial dermaseptin S4 showing the consequences of peptide oligomerization on selective cytotoxicity // J. Biol. Chem. 2000. Vol. 275. P. 4230238.
  140. Habermann E. Bee and wasp venom: the biochemistry and pharmacology of their peptides and enzymes are reviewed // Science. 1972. Vol. 177. P. 314−322.
  141. Dempsey C.E. The actions of melittin on membranes // Biochim. Biophys. Acta. 1990. Vol. 1031. P. 143−161.
  142. Habermann E., Jentsch J. Sequenzanalyse des Melittins aus den tryptischen und peptischen Spaltstucken // Hope-Seylers Z. Physiol. Chem. 1967. Vol. 348. P. 37−50.
  143. Terwilliger T.C., Weissman L., Eisenberg D. The structure of melittin in the form I crystals and its implication for melittin’s lytic and surface activities // Biophys. J. 1982. Vol. 37. P. 353−361.
  144. Lubke K., Matthes S., Kloss G. Isolation and structure of N 1 -formyl melittin // Experientia. 1971. Vol. 27. P. 765−767.
  145. Gauldie J., Hanson J.M., Rumjanek F.D., Shipolini R.A., Vernon C.A. The peptide components of bee venom // Eur. J. Biochem. 1976. Vol. 61, № 2. P. 369−76.
  146. Dawson C.R., Drake A.F., Helliwell J., Hider R.C. The interaction of bee melittin with lipid bilayer membranes // Biochim. Biophys. Acta. 1978. Vol. 510, № 1. P. 75−86
  147. Yang L., Harroun T.A., Weiss T.M., Ding L., Huang H.W. Barrel-Stave Model or Toroidal Model? A Case Study on Melittin Pores // Biophys. J. 2001. Vol. 81 P. 1475−1485
  148. Meyer C.E., Reusser F. A polypeptide antibacterial agent isolated from Trichoderma viride // Experientia. 1967. Vol. 23. P. 85−86.
  149. Pandery R.C., CookJ. C., Rinehart K.L. Structures of the peptide antibiotics. Emerimicins III and IV 1,2 // J. Am. Chem. Soc. 1977. Vol. 99. P. 8469−8483.
  150. Fox R.O., Richards F.M. A voltage-gated ion channel model inferred from the crystal structure of alamethicin at 1.5 A resolution // Nature. 1982. Vol. 300. P. 325−330.
  151. Jones L.R., Besch H.R. Jr., Watanabe A.M. Monovalent cation stimulation of Ca2+ uptake by cardiac membrane vesicles // J. Biol. Chem. 1977. Vol. 252, № 10. P. 3315−3323.
  152. Mathew M.K., Balaram P. Alamethicin and related membrane channel forming polypeptides // Mol. Cell Biochem. 1983. Vol. 50, № 1. P.47−64.
  153. Lazarovici P., Primor N., Loew L.M. Purification and pore-forming activity of two hydrophobic polypeptides from the secretion of the Red Sea Moses sole (Pardachirus marmoratus) // J. Biol. Chem. 1986. Vol. 261. P. 16 704−16 713.
  154. Zagorski M.G., Norman D.G., Barrow C.J., Iwashita Т., Tachibana K, Patel D.J. Solution structure ofpardaxin P-2 // Biochemistry. 1991. Vol. 30.P. 8009−8017.
  155. Porcelli F., Buck В., Lee D.K., Hallock K.J., Ramamoorthy A., Veglia G. Structure and orientation of pardaxin determined by NMR experiments in model membranes // J. Biol. Chem. 2004. Vol. 279, № 44. P. 45 815−45 823.
  156. Shai Y., Bach D., Yanovsky A. Channel formation properties of synthetic pardaxin and analogues // J. Biol. Chem. 1990. Vol. 265. P. 20 202−20 209.
  157. Shai Y. Pardaxin: channel formation by a shark repellant peptide from fish // Toxicology. 1994. Vol. 87. P. 109−129.
  158. Oren Z., Shai Y. A class of highly potent antibacterial peptides derived from pardaxin, a pore-forming peptide isolated from Moses sole fish Pardachirus marmoratus II Eur. J. Biochem .1996. Vol. 237. P. 303−310.
  159. Halstead B.W. Poisonous and venomous marine animals of the world. Princeton, New York: Darwin Press. 1978. P. 1216.
  160. Shiomi K., Ishikawa M., Yamanaka H., Kikuchi T. Isolation and properties of four serine protease inhibitors from water extracts of sea anemone Actinia equine II Nippon. Suisan. Gakkaishi. 1989. Vol. 55. P. 1235−1241.
  161. Pennington M.W., Zadenberg I. Byrnes M.E., Norton R.S., Kem W.R. Synthesis of the cardiac inotropic polypeptide anthopleurin-A // Int. J. Pept. Protein Res. 1994. Vol. 43. P. 463−470.
  162. Т.А., Винокуров JT.M., Козловская Э. П., Еляков Г. Б. Аминокислотная последовательность нейротоксина III из актинии Radianthus macrodactylus И Биорг. химия. Т.11, № 3. С. 302−310.
  163. М.М., Зыкова Т. А., Козловская Э. П. Выделение и характеристика высокомолекулярных цитолизинов морской актинии Radianthus macrodactylus II Биоорган, химия. 1999. Т. 25. С. 733−741.
  164. Khoo K.S., Kam W.K., Khoo H.E., Gopalakrishnakone P., Chung M.C.M. Purification and partial characterization of two cytolysins from a tropical sea anemone, Heteractis magnified//Toxicon. 1993. Vol. 31. P. 1567−1579.
  165. Э.П., 1990. Токсины морских актиний: структура и функция действия//Диссертация. д.х.н., Владивосток. 1990. 310 с.
  166. В.Г. Актинии залива Посьет Японского моря // Исслед. фауны морей. 1967. Т. 5. С. 62−77.
  167. Ottaway J.R. Predators of sea anemones // Tautara. 1977. Vol. 22. P. 213−221.
  168. Ross D.M. Behavior patterns in associations and interactions with other animals // Coelenterate biology. Academic Press. New York, San Francisco: Muscatine L., Lenhoff H.M. 1974. P. 281−312.
  169. Davenport D. Cnidarian symbioses and the experimental analysis of behavior // The Cnidaria an their evolution. Proceed. Symp. Zool. Soc. London. № 16. Academic Press. London: Rees W.J. 1966. P. 361−372.
  170. Hessinger D.A., Lenhoff Н.М. Membrane structure and function. Mechanism of hemolysis induced by nematocyst venom: roles of phospholipase A and direct lytic factor // Arch. Biochem. Biophys. 1976. Vol. 173. P.603−613.
  171. Mebs D., Gebauer E. Isolation of proteinase inhibitory, toxic and hemolytic polypeptides from a sea anemone, Stoichactis sp. Toxicon. 1980. Vol. 18. P. 97−106.
  172. Lenarcic В., Ritonja A., Strukelj В., Turk В., Turk V. Equistatin, a new inhibitor of cysteine proteinases from Actinia equina, is structurally related to thyroglobulin type-1 domain // J. Biol. Chem. 1997. Vol. 272. P. 13 899−13 903.
  173. T.B., Монастырная M.M., Зыкова T.A., Козловская, Э.П., Высокомолекулярные ингибиторы протеиназ из морской актинии Radianthus macrodactylus // Второй Межд. симп. «Химия и химическое образование»: Сб. тез. докл. Владивосток. 2000.С. 233.
  174. Shiomi К., Ishikawa M., Yamanaka H., Kikuchi Т. Isolation and properties of four serine protease inhibitors from water extracts of sea anemone Actinia equine II Nippon. Suisan. Gakkaishi. 1989. Vol. 55. P. 1235−1241.
  175. E.B., Ильина А. П., Монастырная M.M., Бурцева Ю. В., Костина Е. Е., Зыкова Т. А., Мензорова Н. И., Козловская Э.ГТ. Биологически активные полипептиды и гидролитические ферменты в актиниях низкобореальных вод // Биол. моря. 2003. Т. 29. С. 189−194.
  176. Norton R.S. Structure and function of peptide and protein toxins from marine organisms // J. Toxicol.-Toxin reviews. 1998. Vol. 17. P. 99−130.
  177. T.A., Монастырная M.M., Апаликова O.B., Швец Т. В., Козловская Э. П. Низкомолекулярные цитолизины и ингибиторы трипсина из морской актинии Radianthus macrodactylus. Выделение и частичная характеристика // Биоорг. химия 1998. Т. 24. С. 509−516.
  178. Т.А., Винокуров JI.M., Маркова Л. Ф., Козловская Э. П., Еляков Г. Б. Аминокислотная последовательность ингибитора трипсина IV из Radianthus macrodactylus II Биорг. химия 1985. Т. 11. С. 293−301.
  179. Blumenthal К.М., Kem W.R. Primary structure of Stoichactis helianthus II Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1983. Vol. 258.P. 5574−5581.
  180. Ferlan I., Jackson K.W. Partial amino acid sequence of equinatoxin // Toxicon. 1983. Vol. 21, № 3. P. 141−144.
  181. А.П., Монастырная M.M., Сокотун И. Н., Егоров Ц. А., Назаренко Ю. А., Лихацкая Г. Н., Козловская Э. П. Актинопорины из актинии Японского моря Oulactis orientalis: выделение и частичная характеристика // Биоорг. химия. 2005. Т. 31, № 1. С. 39−48.
  182. Sanger F., Nicklen S., Coulson A.R. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1977. Vol. 74. P. 5463−5467.
  183. Anderluh G., Pungercar J., Strukelj В., Macek P., Gubensek F. The coding region of the equinatoxin II gene lacks introns // Croat. Chem. Acta 1995. Vol. 68. P. 533−542.
  184. Koradi R., Billeter М., Wtithrich К. MOLMOL: a program for display and analysis of macromolecular structures // J. Mol. Graphics. 1996. Vol.14. P. 51−55.
  185. Guex N., Peitsch M. C. SWISS-MODEL and the Swiss-PdbViewer: An environment for comparative protein modeling. // Electrophoresis. 1997. Vol.18. P. 2714−2723.
  186. Sayle R.A., Milner-White E.J. RASMOL: biomolecular graphics for all // Trends in Biochemical Sciences. 1995. Vol. 20, № 9. P. 374−376.
  187. Popot J.L., Engelman D.M. Membrane protein folding and oligomerization: the two-stage model // Biochemistry. 1990. Vol. 29, № 17. P. 4031−4037.
  188. Yau W.M., Wimley W.C., Gawrisch K., White S.H. The preference of tryptophan for membrane interfaces // Biochemistry. 1998. Vol. 37, № 42. P. 14 713−14 718
  189. Persson S., Killian J.A., Lindblom G. Molecular ordering of interfacially localized tryptophan analogs in ester- and ether-lipid bilayers studied by 2H-NMR // Biophys. J. 1998. Vol. 75, № 3. P. 1365−1371.
  190. Jacobs R.E., White S.H. The nature of the hydrophobic binding of small peptides at the bilayer interface: implications for the insertion of transbilayer helices // Biochemistry. 1989. Vol. 28, № 8. P. 3421−3437.
  191. Brown J.W., Huestis W.H. Structure and orientation of a bilayer-bound model tripeptide: a proton NMR study // J. Phys. Chem. 1993. Vol. 97, № 12. P. 2967−2973.
  192. Landolt-Marticorena С., Williams K.A., Deber C.M., Reithmeier R.A. Non-random distribution of amino acids in the transmembrane segments of human type I single span membrane proteins //J. Mol. Biol. 1993. Vol. 229, № 3. P. 602−608.
  193. Yeagle P.L., Lee D.A. Membrane protein structure // Biochim. Biophys. Acta. 2002. Vol. 1565, № 2. P. I43.
  194. Chattopadhyay A., Raghuraman H. Application of fluorescence spectroscopy to membrane protein structure and dynamics // Current Science. 2004. Vol. 87, № 8. P. 175 180.
  195. Anderluh G., Razpotnik A., Podlesek Z., Macek P., Separovic F., Norton R.S. Interaction of the Eukaryotic Pore-forming CytolysinEquinatoxin II with Model Membranes: 19 °F NMR Studies // J. Mol. Biol. 2005. Vol. 347. P. 27−39
  196. Lowry O.H., Rosebrough N.J., Farr A.L. Randall R.J. Protein measurement with the Folin phenol reagent // J. Biol. Chem. 1951. Vol. 192. P. 265−275.
  197. Vaskovsky V.E., Suppes Z.S. Phospholipases of marine invertebrates. I. Distribution of phospholipase A // Сотр. Biochem. Physiol. B. 1972. Vol. 43, № 3. P. 601−609.
  198. Laemmli U.K. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4 // Nature. 1970. Vol. 227. P. 680−685.
  199. Grey W.R. End-group analysis using dansyl chloride // Methods in Enzymology. Acad. Press, New York, London: Hirs C.H.W., Timasheff S.N. 1972. Vol. 25, part B. P. 121 139.
  200. .Г., Ганкина E.C., Нестеров B.B. Экспрессный ультрачувствительный метод идентификации N-концевых аминокислот в белках и пептидах с помощью тонкослойной хроматографии // Докл. АН СССР. 1967. Т. 172. С. 91−93.
  201. Muller P., Rudin D.O., Tien Н.Т., Wescott W.C. Methods for the formation of single bimolecular lipid membranes in aqueous solution // J. Phis. Chem. 1963. Vol. 67. P. 534 535.
  202. Blin N., Stafford D.W. A general method for isolation of high molecular weight DNA from eukaryotes // Nucleic Acids Res. 1976. Vol. 3. P. 2303−2308.
  203. Altschul S.F., Gish W., Miller W., Myers E.W., Lipman D.J. Basic local alignment search tool. J. Mol. Biol.1990. V. 215. P. 403−410.
  204. А.П., Монастырная М. М., Исаева М. П., Гузев К. В., Рассказов В. А., Козловская Э. П. Первичная структура актинопоринов актинии Oulactis orientalis II Биоорг. химия. 2005. Т. 31, № 4.
  205. Sanchez R., Sali A. Advances in comparative protein-structure modelling // Curr. Opin. Struct. Biol. 1997. Vol. 7. P. 206−214
  206. Baker D., Sali A. Protein structure prediction and structural genomics // Science. 2001. Vol. 294. P. 93−96
  207. Berman H.M., Westbrook J., Feng Z., Gilliland G., Bhat T.N., Weissig H., Shindyalov I.N., Bourne P.E. The Protein Data Bank // Nucleic Acids Research. 2000. Vol. 28. P. 235−242
  208. Schwede Т., Kopp J., Guex N., Peitsch M.C. SWISS-MODEL: an automated protein homology-modeling server//Nucleic Acids Research. 2003. Vol. 31. P. 3381−3385
  209. Peitsch M. C. Protein modeling by E-mail // BioTechnology. 1995. Vol. 13. P. 658 660 246. http://www.chemcomp.com/CorporateInformation/MOE.html
  210. Hooft R.W., Vriend G., Sander C, Abola E.E. Errors in protein structures // Nature. 1996. Vol. 381, № 6580. P.272.
Заполнить форму текущей работой

Пора сдавать?