Значение простейших особенно велико в тех случаях, когда требуется оценка загрязнения непосредственно в момент взятия пробы и незадолго до этого. Экспресс-методы оценки экологического состояния по простейшим позволяют получать надёжную информацию практически мгновенно. Этому способствует как простота отбора проб, так и довольно хорошо разработанная система сапробных валентностей с детализацией в пределах отдельных родов. Простейшие являются высокочувствительными индикаторами сапробного состояния водоёмов. В практике полевых работ наиболее предпочтительным следует признать метод прямого микроскопирования нефиксированных проб, поскольку многие простейшие даже при очень строгом подборе фиксатора меняют свою форму, теряют жгутики и разрушаются (Лиепа, 1976; Симаков, 1986).
Простейших в качестве биоиндикаторов следует использовать при сильном бактериальном загрязнении (Hynes, 1960; Bick, 1962) и при контроле за эффективностью биологической очистки по составу населения активного ила (Беляева и др., 1970; Аволиани и др., 1970). Благодаря широким возможностям распространения представители этой группы является космополитами и потому особенно пригодны для использования в сапробной системе (Klapper, 1963). Они имеют короткий жизненный цикл и, следовательно, характеризуют тоже лишь ближайшее прошлое (Hawkes, 1962).
Использовать простейших для биологического анализа возможно только когда лаборатория находится рядом, так как определять их можно лишь в живом виде. Простейшие обладают высокой чувствительностью к химическому составу воды, что делает их ценным показателем органического загрязнения, но ограничивает возможность использования этой группы при наличии в составе сточных род ядовитых промышленных стоков. Широкому применению простейших для биологического анализа препятствует трудность их определения и количественной оценки (Захаров, 1927).
Доступным и простым способом определения качества воды является биотестирование проб на выживаемость инфузорий туфелек (род Рагатесеа), основанное на хемотаксисе. В нормальных условиях (при комнатной температуре) инфузория туфелька находится в непрерывном движении со скоростью 2,0−2,5 мм/сек (Полянский, 1968). Траектория движения туфельки довольно сложная: она движется поступательно передним концом и вращается по часовой стрелке вдоль продольной оси тела. На изменения внешней среды (водной среды) инфузория реагирует изменением направления и скорости движения. При сильном загрязнении химическими веществами парамеции могут погибать. При плохой очистке фекально-бытовых сточных вод обрастания бывают белыми или сероватыми. Как правило, они состоят из прикреплённых инфузорий (сувойки, кархезиум и др.).
