Выделение суммарных препаратов нуклеиновых кислот

Этот первый, предварительный этап анализа очень важен для решения поставленной задачи. Для составления полной микробиологической картины изучаемого природного объекта необходимо выявление филотипов каждого из членов сообщества, независимо от численности представленных ими организмов в исходном.

Рис. 6.1. Схема использования молекулярно-биологических методов для анализа микробных сообществ без выделения чистых культур.

образце (в идеале — вплоть до единичных клеток). Для этого нужно, во-первых, как можно полнее отделить клеточную фракцию от органических и неорганических элементов образца, что особенно сложно для почвенных сообществ. Во-вторых, известно, что клеточные стенки микроорганизмов различных филогенетических групп могут значительно различаться по степени устойчивости к разрушению и лизису, поэтому в каждом конкретном исследовании используются различные комплексы механических, химических, ферментативных и других методов разрушения и лизиса клеток. На этой стадии в зависимости от целей исследования могут быть получены суммарные препараты либо ДНК организмов, либо рибосомных РНК.