Помощь в учёбе, очень быстро...
Работаем вместе до победы

Паспортизация сортов люпина методами ISSR-PCR и RAPD-PCR для биотехнологических исследований

Диссертация: Паспортизация сортов люпина методами ISSR-PCR и RAPD-PCR для биотехнологических исследований
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Однако метод белковых маркеров был часто сопряжен с недостаточным полиморфизмом белков, в частности альбуминов или глобулинов. Для некоторых видов* растений применение метода белковых маркеров в сортовой идентификации был непригоден из-за низкого уровня межсортового разнообразия. Метод белковых маркеров отражает лишь ту часть генома, экспрессия которой проявляется в синтезе белковых молекул… Читать ещё >

Содержание

  • Список использованных сокращений
  • Глава 1. Обзор литературы
    • 1. 1. Характеристика объекта исследования
    • 1. 2. Современные методы исследования генетического полиморфизма растений
      • 1. 2. 1. Молекулярно-генетический анализ ДНК с помощью RAPD-маркеров
      • 1. 2. 2. Молекулярно-генетический анализ ДНК с помощью
    • I. SSR- и SSR маркеров
      • 1. 2. 3. Другие молекулярно-генетические мультилокусные методы анализа полиморфизма растений
      • 1. 3. Методы паспортизации сортов растений
      • 1. 4. Маркирование видов и сортов люпина
  • Глава 2. Материалы и методы
    • 2. 1. Исходный материал
    • 2. 2. Выделение геномной ДНК люпина
    • 2. 3. Определение качества и количества ДНК '
    • 2. 4. Полимеразная цепная реакция
    • 2. 5. Электрофоретический анализ ДНК
    • 2. 6. Обработка результатов генетического анализа
  • Глава 3. Результаты и обсуждение
    • 3. 1. Выбор метода выделения ДНК люпина
    • 3. 2. Оптимизация условий PCR
    • 3. 3. Характеристика праймеров для RAPD-и ISSR-PCR
    • 3. 4. Характеристика полиморфных фрагментов, амплифицируемых при
    • I. SSR-PCR
      • 3. 4. 1. Межвидовой полиморфизм
      • 3. 4. 2. Внутривидовой полиморфизм
      • 3. 5. Генетическое сходство сортов люпина по 188Ы-маркерам
      • 3. 6. Разработка системы паспортизации сортов люпина
      • 3. 7. Дихотомический ключ определения сортов люпина
  • Выводы 88 Рекомендации производству
  • Список использованной литературы
  • Приложения

СОКРАЩЕНИЯ БГБ — белорусский генетический банк ДНК — дезоксирибонуклеиновая кислота НК — нуклеиновая кислота

ПДРФ — полиморфизм длин рестрикционных фрагментов п.н. — пара нуклеотидов

ПЦР — полимеразная цепная реакция

РНК — рибонуклеиновая кислота

AFLP — Amplified Fragment Length Polymorphism

СТАВ — Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide

DArT — Diversity Array Technology

HRM — High-Resolution Melt analysis

IRAP — Inter-Retrotransposon Amplified Polymorphysm

ITAP — Intron-Target Amplified Polimorphism,

ISSR — Inter-Simple Sequence Repeat

LP-RAPD — Long Primer Random Amplified Polymorphic DNA MAS — Marker Assisted Selection

MFLP — Microsatellite-anchored Fragment Length Polymorphisms

PCR — Polymerase Chain Reaction

QTL — Quantitative Trait Loci

RAPD — Random Amplified Polymorphic DNA

RAMP — Randomly Amplified Microsatellite Polymorphism

REMAP — Retrotransposone Microsatellite Amplified Polymorphism

RFLP — Restriction Fragment Length Polymorphism

SAMPL — Selective Amplification of Microsatellite Polymorphic Loci

SCAR — Sequence Characterized Amplified Region

SNP — Single Nucleotide Polymorphism

SSLP — Simple Sequence Length Polymorphism

SSR — Simple Sequence Repeats

STR — Short Tandem Repeats

UPGMA — Unweighted Pair Group Method with Arithmetic mean

VNTR — Variable Number Tandem Repeat

WPGMA — Weighted Pair Group Method with Arithmetic mean

Паспортизация сортов люпина методами ISSR-PCR и RAPD-PCR для биотехнологических исследований (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

В современной мировой науке биотехнология является одной из наиболее динамично развивающихся дисциплин биологического профиля. На развитие исследований по биотехнологии в мире выделяются сотни миллиардов долларов, а валовой доход мирового биотехнологического производства составляет триллионы долларов США. В России разработана программа развития биотехнологии, она входит в число приоритетных направлений развития науки.

Биотехнология возникла на стыке таких фундаментальных дисциплин, как генетика, физиология, молекулярная биология, микробиология. В 80-х годах прошлого столетия она была выделена в отдельную дисциплину и продолжает активно развиваться. Например, недавно появилось новое направление — бионанотехнология.

В настоящее время биотехнологические методы широко используются для проведения исследований в смежных областях науки, в частности в селекции растений, растениеводстве и семеноводстве (Харченко, 2006; Сельскохозяйственная биотехнология, 2008). Сегодня невозможно представить успешное развитие селекционных работ без применения методов генетической и клеточной инженерии, культивирования органов и тканей растений in vitro, молекулярных белковых или ДНК-маркеров, ПЦР-диагностики фитопатогенов.

Особое значение в современной биотехнологии имеет разработка современных методов анализа сортов и видов растений на основе полимеразноцепной реакции, поскольку метод ПЦР имеет высокую чувствительность, точность, воспроизводимость результатов и производительность анализа, достаточно прост в исполнении и не требует сложного дорогостоящего оборудования (Сулимова, 2004; Карлов, 2009). ПЦР широко используется в медицине для экспресс-диагностики инфекционных и генетических заболеваний, в исследованиях по эволюционному и филогенетическому анализу разных таксонов животных и растений (Kochieva, 2004; Лукашов, б.

2009), в генетике и селекции для определения генетического родства сортов разных видов' растений- (Зайцев, 2001; Нам, 2004), является неотъемлемой частью работ по генетической инженерии.

Большое значение дляселекции хозяйственно-ценных культур и семеноводства имеет разработка методов паспортизации сортов растений на основе молекулярных маркеров. Ранее для анализа генотиповш' сортов разных культур использовался метод белковых маркеров, — который позволял по спектрам альбуминов, глобулинов, пролактинов и различных, изоферментных систем разных культур определять сортовую принадлежность таких важных злаковых культур, как рожь, пшеница и др. (Созинов, 1985; Конарев, 1993). Полученные результаты использовали в селекции, для составления схем гибридизации, анализа, гибридных образцов, контроля сортовой чистоты различных партий элитных семян.

Однако метод белковых маркеров был часто сопряжен с недостаточным полиморфизмом белков, в частности альбуминов или глобулинов. Для некоторых видов* растений применение метода белковых маркеров в сортовой идентификации был непригоден из-за низкого уровня межсортового разнообразия. Метод белковых маркеров отражает лишь ту часть генома, экспрессия которой проявляется в синтезе белковых молекул: Однакоболее половины генома, растений представлена сателлитной и микросателлитной ДНК, функции которой не* связаны с биосинтезом белков, и эта часть генома никак не может быть выявлена методами белковых маркеров. В то же время доказана высокая вариабельность этих последовательностей ДНК, что в последние 20 лет активно используется в биотехнологических исследованиях для изучения происхождения и генетического родства представителей разных таксонов.

Развитие методов ДНК-маркеров на основе полимеразно-цепной реакции с использованием случайных праймеров (ИАРО-РСК., АРЬР), а также микросателлитных последовательностей (ЗБЯ-РСЯ,БЯ-РСЫ, МРЪР) позволило расширить возможности для разработки методов молекулярного 7 маркирования с целью изучения филогенетических связей, генетического родства внутри разных семейств и родов растений:

ДНК-маркеры используются для паспортизации сортов и в семеноводстве различных сельскохозяйственных культур, в частности, были разработаны молекулярные, маркеры, хозяйственно-ценных^ признаков — люпина: узколистного (Yang, 2004″ 2008) и. способ идентификации" ряда, австралийскихсортов узколистного: люпина (Yuan, 2005). В России подобные исследованияна люпине разных видов не проводились.

Люпин является важной для России зернобобовой культурой кормового й сидерального направления, семенакоторой характеризуются: высоким качеством’запасных белков. Люпин называют «северной соей», но в отличие от сои люпин неприхотлив, к: плодородию почв, он относится к пионерским культурам и может произрастать, на бедных почвах — например, на песчаниках или, лавовых потоках после извержений вулканов. Для созревания семян люпина не требуется высокой суммы активных температур, он приспособлен к произрастанию Вусловиях средней полосы России, в Белоруссии, Украине и Польше. .

В нашей стране проводятся селекционные работыпо созданию высокопродуктивных и устойчивых сортов-трех видов люпина: белого, желтого и узколистного. Поскольку зачастую: исходнымматериаломдля селекции являются.'формы белорусской, польской", украинской" селекции, а также в связи с постоянным обменом селекционными образцами между селекционерами и генетиками этих, стран, логично ожидать, что сорта российской: селекции должны быть близки по генетической природе сортам, завезенным из этих стран.

В: связи с вышесказанным, разработка биотехнологических высокопроизводительных методов на основе ПЦР, позволяющих провести экспресс-анализ для паспортизации сортов люпина разных видов, подбора родительских пар при скрещивании с целью ускорения селекциилюпина, определения, сорта или анализа сортовой чистоты элитной партии семян, 8 является актуальным направлением биотехнологии применительно к, данной культуре.

Настоящее исследование посвящено разработке метода паспортизации сортов трех видов люпина на основе 18 811- и КАРО-РСЫ, что необходимо для ускорения селекционной работы, идентификации сортов разных видов люпина, а также контроля чистоты разных партий семян в семеноводстве этой культуры.

Цель и задачи исследования

Целью настоящего исследования являлась разработка метода паспортизации сортов люпина разных видов на основе методов 18 811-РСК и КАРБ-РСЯ.

Для достижения цели решались следующие задачи:

1) выбор метода выделения ДНК из образцов люпина;

2) подбор оптимальных условий проведения 18 811- и КАРО-РСЫ на ДНК люпина;

3) подбор праймеров, обеспечивающих достаточный полиморфизм и стабильную амплификацию полиморфных фрагментов люпина;

4) изучение генетического полиморфизма сортов, сортообразцов и гибридных форм люпина;

5) составление генетических паспортов сортов люпина узколистного, желтого и белого;

6) изучение генетического сходства сортов и сортообразцов люпина узколистного;

7) разработка схем дихотомического ключа для идентификации сортов люпина по генетическим паспортам.

Научная новизна и значимость работы. Впервые в России разработан метод паспортизации сортов люпина трех видов на основе 188Я-РСК. Метод паспортизации сортов люпина включает протокол выделения ДНК, набор праймеров и условия проведения 188К-РСК. Составлены паспорта сортов трех видов люпина, возделываемых в России, установлено генетическое сходство сортов люпина узколистного. Установлены уровни внутривидового разнообразия, степень генетической дифференциации сортов.

Практическая ценность исследований. Полученные в данной работе паспорта сортов люпина белого, желтого и узколистного будут использованы в селекции люпина, а также для поиска маркеров хозяйственно-ценных признаков при разработке биотехнологий получения высокопродуктивных сортов этого ценного растения. Составленные паспорта могут быть использованы при передаче сортов в Госкомиссию и для контроля чистоты посевного материала.

Основные положения, выносимые на защиту.

1. Метод паспортизации сортов трех видов люпина.

2. Паспорта сортов люпина узколистного, желтого и белого.

3. Дихотомический ключ идентификации сортов люпина.

4. Генетическое сходство сортов люпина узколистного.

5. Результаты работы предлагается использовать при составлении курсов биотехнологии, генетики и основ сельского хозяйства в вузах.

Р9 ол.

Показать весь текст

Список литературы

  1. , Е.В. Анализ генетической изменчивости редкого эндемичного вида Oxytropis chankaensis Jurtz. (Fabaceae) на основе RAPD маркеров / Е. В. Артюкова, А. Б. Холина, М. М. Козыренко, Ю. Н. Журавлев // Генетика. -2004. Т. 40. — № 7. — С. 877−884.
  2. , C.B. Генетическая паспортизация популяций редких видов растений рода Adonis с использованием ISSR- и RAPD-маркеров / C.B. Боронникова II Известия ТХСА. 2009. — Вып. 1. — С. 82−88.
  3. Вишнякова, М.А. RAPD анализ видового полиморфизма рода чина1. thyrus L. семейства Fabaceae Lindl. / М. А. Вишнякова, М. О. Бурляева, i
  4. Н.В. Алпатьева, Ю. В. Чесноков // Информационный вестник ВОГиС. — 2008. -Т. 12.-№ 4.-С. 595−607.
  5. , H.H. Молекулярное маркирование признака устойчивости к коккомикозу у вишни с использованием RAPD-PCR / H.H. Волосевич, А. Л. Лагоненко, Н. В. Кухарчик // Плодоводство. 2007. — Т. 19. — С. 117−123.
  6. Генная инженерия растений. Лабораторное руководство: пер с англ. / [под. ред. Дж. Дрейпера, Р. Скотта, Ф. Армитиджа, Р. Уолдена]. М.: Мир, 1991.-408 с.
  7. Генофонд и селекция зернобобовых культур (люпин, вика, соя, фасоль) / под ред. Курловича Б. С., Репьева С. И. СПб, 1995. 430 с.
  8. , Т.Т. Молекулярно-генетические подходы в селекции зерновых / Т. Т. Глазко, В. И. Глазко // Известия ТСХА. 2006. — Вып. 4. — С. 100−107.
  9. , В.И. Оценка полиморфизма различных генетических элементов в контроле разнообразия генофондов культурных растений / В. И. Глазко // Вестник ВОГиС. 2008. — Т. 12. — № 4. — С. 590−594.
  10. , С.А. Использование молекулярный маркеров для анализа генома растений / С. А. Гостимский, З. Г. Кокаева, В. К. Боброва // Генетика. -1999. Т. 35.-№ И.-С. 1538−1549.
  11. Динамика популяционных генофондов при антропогенных воздействиях / под ред. Ю. П. Алтухова. М.: Наука, 2004. — 619 с. 1. ПГ1
  12. , Е.А. Оценка генетической изменчивости позднеспелых сортов капусты белокочанной с использованием RAPD-маркеров / Е. А. Домблидес, A.C. Домблидес, Е. Г. Добруцкая, Е. В. Шевцова // Овоч1вництво i баштанництво. — 2007. Вип. 53. — С. 3−9.
  13. , А.Г. Ботаника: систематика высших, или наземных растений: Учеб. для студентов высших пед. учебных заведений / А. Г. Еленевский, М. П. Соловьева, В. Н. Тихомиров. М.: Академия, 2004. -432 с.
  14. , А.Т. Идентификация и исследование экспрессии генов: учебно-методическое пособие для вузов / А. Т. Епринцев, В. Н. Попов, Д. Н. Федорин. Воронеж: ИПЦ ВГУ, 2008. — 64 с.
  15. , Ю.Н. ПЦР-генотипирование женьшеня с использованием произвольных праймеров / Ю. Н. Журавлев и др. // Докл. Академии наук. -1996.-Т. 349.-№ 1.-С. 111−114.
  16. , B.C. Идентификация генотипов растений с помощью ПЦР-анализа* рассеянных повторов последовательностей R173 / B.C. Зайцев, Э. Е. Хавкин // Докл. РАСХН. 2001. — № 3. — С. 3−5.
  17. , Р.Н. Типы молекулярно-генетических маркеров w их применение / Р. Н. Календарь, В. И. Глазко // Физиология и биохимия культурных растений. 2002. — Т. 34. — № 4. — С. 279−296.
  18. , Г. И. Молекулярно-генетические и молекулярно-цитогенетические подходы для ускоренного создания селекционного материала растений с заданными свойствами : автореф. дис.. д-ра.биол. наук / Г. И. Карлов. М., 2009. — 50 с.
  19. , В.Г. Молекулярно-биологические аспекты прикладной ботаники, генетики и селекции (Теор. осн. селекции Т. 1) / В. Г. Конарев, И. П. Гаврилюк, Н. К. Губарева. -М.:Колосс, 1993. 447 с.
  20. , Е.З. Идентификация видового и сортового полиморфизма у томатов / Е. З. Кочиева, Т. П. Супрунова // Генетика. 1999а. — Т. 35. — № 10. -С. 1386−1389.1. П1
  21. , Е.З. Использование RAPD-анализа для идентификации сортов баклажанов {Solamum melongena L.) / Е. З. Кочиева, Т. П. Супрунова, С. К. Семенова // Генетика. 1999b. — Т. 35, — № 8. — С. 1165−1168.
  22. , Н.С. Люпин. Генетика, селекция, гетерогенные посевы. / Н. С. Купцов, И. П. Такунов. Клинцы: Клинцовская городская типография., 2006. — 576 с.
  23. , В.В. Молекулярная эволюция и филогенетический анализ / В. В. Лукашов. М.: БИНОМ, 2009. — 256 с.
  24. , H.A. Люпин. / H.A. Майсурян, А. И. Атабекова. М., 1974. -199 с.
  25. , C.B. Молекулярные маркеры в генетическом картировании растений / C.B. Малышев, H.A. Картель // Молекулярная биология. 1997. -Т. 3. -№ 62. — С. 197−208.
  26. , A.B. Биохимия люпина. / A.B. Мироненко. Минск: Наука и техника, 1975. — 312 с.
  27. Нам, И .Я. Оптимизация применения регуляторов роста и развития растений в биотехнологиях in vitro: автореферат дис.. доктора биологических наук: 03.00.23 / И. Я. Нам. М., 2004. — 42 с.
  28. Ней, М. Молекулярная эволюция и филогенетика / М. Ней, С. Кумар пер. с англ. Киев: КВ1Ц, 2004. — 418 с.
  29. , A.C. Маркирование видов и сортов картофеля с помощью метода RAPD-PCR / A.C. Оганисян.С., Е. З. Кочиева, А. П. Рысков // Генетика. 1996. Т. 32. — № 3. — С. 448−451.
  30. , Л.И. Искусственные генетические системы / Л. И. Патрушев. -М.: Наука, 2004.-526 с.
  31. , С.А. Идентификация сортов сои с использованием молекулярно-генетических методов: автореф. дис.. канд.биол. наук — Краснодар, 2008. 26 с.
  32. Сельскохозяйственная биотехнология / под ред. B.C. Шевелухи. 2-е издание перераб. и доп. — М.: Высшая школа, 2008. — 710 с.
  33. , Ю.М. Генетический полиморфизм злаковых растений, при помощи ПЦР с произвольными праймерами / Ю. М. Сиволап, Р. Н. Календарь, C.B. Чеботарь // Цитология и генетика. 1994. — Т. 28. — № 6. — С. 54−61.
  34. , В.В. Использование ISSR-маркеров для молекулярно-генетической идентификации и паспортизации сортов малины / В. В. Соболевой др. // Сельскохозяйственная биология. 2006. — № 5. — С. 48−52.
  35. , A.A. Полиморфизм белков и его значение в генетике и селекции /A.A. Созинов. -М.: Наука, 1985.-217 с.
  36. Сорта селекции всероссийского научно-исследовательского института люпина / П. А. Агеева и др. Брянск: Читай-город, 2005. — 48 с.
  37. , Г. Е. ДНК-маркеры в генетических исследованиях: типы маркеров, их свойства и области применения / Г. Е. Сулимова // Успехи современной биологии. 2004. — Т. 124. — № 3. — С.260−271.
  38. , О.Ю. Идентификация сортов яблони с использованием SSR-анализа в Беларуси / О. Ю. Урбанович, З. А. Козловская, H.A. Картель // Плодоводство. 2007. — Т. 19. — С. 32−39.
  39. Халяфян, A.A. Statistica 6. Статистический анализ данных. Учебник. / A.A. Халяфян. 3-е изд. — М.: Бином-Пресс, 2007. — 512 с.
  40. , П.Н. ДНК-технологии в развитии агробиологии / П. Н. Харченко, В. И. Глазко. М.: Воскресение, 2006. — 480 с.
  41. Цветков^ И. А. Генетическая дифференциация сортов риса по1 IRAP-маркерам / И. А. Цветков, А. Н. Иванов, В. И. Глазко // Известия ТСХА. 2006. -№ 4.-С. 155−159:
  42. , Н.М. Генетические основы селекции зернобобовых культур на устойчивость к патогенам / Н. М. Чекалин. Полтава: 1нтерграфжа., 2003.- 186 с.
  43. , Н.М. Селекция зернобобовых культур / Н. М. Чекалин. М.: Колос, 1981.-335 с.
  44. Ainouche, A.K. Phylogenetic relationships in Lupinus (Fabaceae: Papilionoideae) based on internal transcribed spacer sequences (ITS) of nuclear9b
  45. Akkaya, M.S. Length polymorphisms of simple sequence repeat DNA in soybean / M.S. Akkaya, A.A. Bhagwat, P.B. Cregan // Genetics. 1992. — Vol. 132. -P. 1132−1139.
  46. Ammiraju, J.S.S. Identification of inter simple sequence repeat (ISSR) marker associated with seed size in wheat / J.S.S. Ammiraju et al. // Theoretical and applied genetics. 2001 — Vol. 102. — P. 726−733.
  47. Arcade, A. Application of AFLP, RAPD and ISSR markers to genetic mapping of European and Japanese larch / A. Arcade et al. // Theoretical and applied genetics. 2000. — Vol. 100. — P. 299−307.
  48. Astarini, I.A. Fingerprinting of cauliflower cultivars using RAPD markers / I.A. Astarini, J.A. Plummer, R.A. Lancaster, G. Yan // Australian journal of agricultural research. 2004. — Vol. 55. — P. 117−124.
  49. Badr, A. Chloroplast DNA restriction polymorphismin Genistae (Legumninosae) suggests a common origin for European and American lupines / A. Badr, W. Martin U. Jensen // plant systematic and evolution. 1994. -P.95−106
  50. Badr, A. Systematic relationships in Lathyrus sect. Lethyrus (Fabaceae) based on ampliphied fragment polymorphism (AFLP) data / A. Badr, H. el Shazly, H. el Rabey, L.E. Watson // Canadian, journal of botany. 2002. — Vol. 80. -P. 962−969.9Yn/l
  51. Becker, J. Combined mapping of AFLP and RFLP markers an barley / J. Becker, P. Vos, M. Kuiper, F. Salamini, M. Heun // Molecular genetics and genomics. 1995. — Vol. 249. — P. 65−73.
  52. Boersma, J.G. Development of a PCR marker tightly linked to mollis, the gene-that controls seed dormancy in Lupinus angusifolius L. / J.G. Boersma, B.J. Buirchell, K. Sivasithamparam, H. Yang // Plant breeding. 2007a. — Vol. 126. -P. 612−616.
  53. Boersma, J. G Contribution of the molecular genetics of the narrow-leafed lupin {Lupinus angustifolius L.) — mapping, marker development and QTL analusis / J.G. Boersma. The University of Wester Australia, 2007d. — P. 216.
  54. Brien, S.J. A molecular marker for early maturity {Ku) and marker-assisted breeding of Lupinnus angustifolius / S.J. Brien et al. // Proc. 11th aust. plant breeding conf. (Adelaide). 1999. — P. 204−205.r"r
  55. Garlier, J.D. Genetic maps of RAPD, AFLP and ISSR- markers in Ananas bractealus and A. comosus using the pseudo-testcross- strategy / J. D: Carlier et al. //
  56. Plant-breeding, -2004. Vol- 123. — P: 186−192.
  57. Chomczynski, P.' Single-step 'method of RNA isolation by acid guanidine thiocyanate-phenol-chloroform extraction / P. Chomczynski, N. Sacchi // Analytical biochemistry:.- 1987. Vol- 162- - P. 156−159?
  58. Croft-, AiM'- Molecular"'analysisoi--Lethyeusf sativus: B. (grass pea) — and related species / A. M- Croft, E.C.K.Pang, P. W J-Taylor // Euphytica. — 1999- - Vol. 107. — P. 167−176.
  59. Dangi,.R.S. Assessment of genetic diversity in Trigonellafoenum-graecum and Trigonella caerulea using ISSR and RAPD markers / R.S. Dangi et al. // BMC Plant biology. 2004. — P. 4−13.
  60. Dulson, J. Efficacy of bulked DNA samples for RAPD DNA fingerprinting of 1 genetically complex Brassica napus. xultivars / J. Dulson, L.S. Kott, V.L. Ripley //
  61. Euphitica. 1998. — Vol. 102. — P. 65−70.
  62. Ferreira, A.R. Soybean genetic map of RAPD markers assigned to an existing scaffold RPLP map / A.R. Ferreira, K.R. Foutz, P. Keim // Journal of heredity. -2000- Vol. 91. — P. 392−396.
  63. Gillings, M: Amplification of anonymous DNA fragments usingi pairs? of long primers generates reproducible DNA fingerprints that are sensitive to genetic variation / M. Gillings, M- Holley // Electrophoresis. 1997. — Vol. 18. — P- 15 121 518.
  64. Gladstones, J.S. A historical view of lupins in Australia // Proceedings of the First Australian Lupin Technical Symposium Eds. Dracup M-, Palta J.J. 1994. -P. 1−38.
  65. Gupta, S. Interspecific reproductive barriers and genomic similarity among the rough-seeded Lupinus species / S. Gupta, B.J. Buirchell, W.A. Cowling // Plant breeding. 1996. — Vol. 115. — P. 123−127.
  66. Gupta, S. Molecular markers and their application in wheat breading / S. Gupta, R.K. Varshney, P.C. Sharma, B. Ramesh // Plant breeding. 1999. — Vol. 118.-P. 369−390.
  67. Harrison, J.E.M: General control of alkaloids in Lupinus albus / J.E.M. Harrison, W. Williams // Euphytica. 1982. — Vol. 31. — P. 357−364.
  68. He, Q. Effects of thermocyclers and primers an the reproducibility of banding patterns in randomly amplified polymorphic DNA analysis / Q. He, M.K. Viljanen, J. Mertsola // Molecular and cellular probes. 1994. — Vol. 8. -P. 155−160.
  69. Hu, J. Generation of DNA-based markers in specific genome regions by two primer RAPD reactions / J. Hu, J. van Eysden, C.F. Quiros // PGR methods and appl. 1995. — Vol. 4. — № 6. — P. 346−351.
  70. Janssen, P. Evaluation of the DNA fingerprinting method' AFLP as a new tool in bacterial taxonomy / P. Janssen et al. // Microbiology. 1996. — Vol. 142.-P. 1881−1893.
  71. Jones, C.J. Reproducibility testing of RAPD, AFLP and SSR markers in plants by a network of European laboratories / C.J. Jones et al. // Molecular breeding. -1997.-Vol. 3.-P. 381−390.
  72. Joshi, S.P. Genetic diversity and phylogenetic relationship as revealed by inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphism in the genus Oryza / S.P. Joshi et al. // Theoretical and applied genetics. 2000. — Vol. 100. — № 8. — P. 1311−1320.
  73. Kalendar R. IRAP and REMAPA two new retrotransposon-based DNA fingerprinting techniques / R. Kalendar et al. // Theoretical and applied genetics. -1999.-Vol. 98.-P. 701−711.
  74. Kass, E. Molecular phylogeny and phylogeography of Lupinus (Leguminosae) inferred from nucleotide sequences of the rbcL gene and ITS 1+2 regions of rDNA /nr""7
  75. E. Kass., M. Wink // Plant systematics and evolution. 1997. -Vol. 208. — P. 139−167.
  76. Kenicer, G J. Systematics and biogeography of Lathyrus (Leguminosae) based on internal transcribed spacer and cpDNA sequence data / G.J. Kenicer, T. Kajita, R.T. Pennington, J. Murata // American journal of. botany. 2005. — Vol. 97.-P. 1199−1209.
  77. Kennedy, G.C. The minisatellite an the diabetes susceptibility locus IDDM2 regulates insulin transcription / G.C. Kennedy, M.S. German, W.J. Rutter // Nature genetics. 1995. — № 9. — P. 293−298.
  78. Kim, D.H. Genetic relationships of sesame germplasm collection as revealed by inter-simple sequence repeats / D.H. Kim et al. // Plant breeding. 2002. -Vol. 121.-P. 259−262.
  79. Kochieva E.Z. Assessment of genetic relationships in the genus Capsicum using different DNA marker systems / E.Z. Kochieva, N.N. Ryzhova, W. van Dooijeweert, I.W. Boukema, P. Arens .// Eucarpia. 2004. — P. 44−50.
  80. Koreth, J. Microsatellites and PCR genome analysis / J. Koreth, J.J. O’Leary, J.O. McGee // The journal of pathology. 1996. — Vol. 178. -P. 239−248.
  81. Kruszka, K. Linkage maps of morphological and molecular markers in lupin / K. Kruszka, B. Wolko II Proc. 9th Int. Lupin conf. Klink/Muritz, Germany. International Lupin Association. 1999. — P. 100−105.
  82. Lagercrantz U. The abundance of various polymorphic microsatellite motifs differs between plants and vertebrates / U. Lagercrantz, H. Ellegren, L. Andersson // Nucleic acids research. 1993. — Vol. 21. — № 5. — P. 1111−1115.
  83. Li, Y.-Ch. Microsatellites: genomic distribution, putative functions and mutational mechanisms: a review / Y.-Ch. Li et al. // Molecular ecology. 2002. -Vol. 11.-P. 2453−2465.
  84. Liebhard, R. Development and characterization of 140 new microsatellites an apple {Malus x domestica Borkh.) / R. Liebhard et al. // Molecular breeding. —2002. -Vol. 10.-P. 217−241.
  85. Lin, J.-J. Identification of molecular markers in soybean comparing RFLP, RAPD and AFLP DNA mapping techniques / J.-J. Lin et al. // Plant molecular biology reporter.-1996.-Vol. 14.-P. 156−159.
  86. Lin, R. Development of a sequence-specific PCR marker linked to the gene «pauper» conferring low-alkaloids in white lupin (Lupinus albus L.) for marker assisted selection / R. Lin et al. // Molecular breeding. 2009. — Vol. 23. -P. 153−161.
  87. Lin, R. Characterisation of genetic diversity and DNA fingerprinting of Australian chickpea (Cicer arietmum L.) cultivars using MFLP markers / R. Lin et al. // Australian journal of agricultural research. 2008. — Vol. 59. — P.707−713.
  88. Lupins as crop plants: biology, production and utilization / Gladstones J.S., Atkins C.A., Hamblin J., eds. 1998. — P. 192.
  89. MacPherson, J.M. Variability of the random amplified polymorphic DNA assay among thermal cyclers, and effects of primer and DNA concentration / J.M. MacPherson, P.E. Eckstein, A.A. Gajadhar // Molecular and cellular probes. -1993.-Vol. 7.-P. 293−299.
  90. Meuneir, J.R. Factors affecting reproducibility of random amplified polymorphic DNA fingerprinting / J.R. Meuneir, P.A. Grimont // Research in microbiology. 1993. — Vol. 144. — P. 373−379.
  91. Nelson, M.N. The first gene-based map of Lupinus angustifalius L. location of domestication genes and conserved synteny with Medicago truncatula 7 M: N. Nelson et al. // TAG Theoretical and applied genetics. 2006. — Vol. 113. — P 225 238.
  92. Pearl, H.M. Construction of a genetic map for Arabica coffee / H.M. Pearl et al. // Theoretical and applied genetics. 2004. — Vol. 108: — P. 829−835.
  93. Penner, G.A. Reproducibiliy of random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis among laboratories / G.A. Penner et al.'// PCR methods and applications. -1993a.-Vol. 2.-P. 341−345.1. WO
  94. Penner, G.A. Identification of a RAPD marker linked to the oat stem rust gene Pg3 / G.A. Penner et al. // TAG Theoretical and applied genetics. 1993b. — Vol. 85.-P. 702−705.
  95. Pradhan, A. Development of DNA fingerprinting keys for the identification of radish cultivars / A. Pradhan, G. Yan, J.A. Plummer // Australian journal of experimental agriculture. 2004. — Vol. 44. — P. 95−102.
  96. Prevost, A. A new system of comparing PCR primers applied to ISSR fingerprinting of potato cultivars / A. Prevost, M.J. Wilkinson // TAG Theoretical and applied genetics. 1999. — Vol. 98. — P. 107−112.
  97. Qiu, J. Evaluating genetic diversity of white lupin using polymerase chain reaction based RAPD technology / J. Qiu, E. van Santen, S. Tuzun // VII International Lupin Conference, April 18−23, 1993. Evora, Portugal. P. 51−53.
  98. Rafalski, J.A. Genetic diagnostics in plant breeding: RAPDs, microsatellites and machines / J.A. Rafalski, S.V. Tingey // Trends in genetics. 1993. — Vol. 9. — P. 275−280.
  99. Rakoczy-Trojanowska, M. Characteristics and comparison of three classes of microsatellite-based markers and their application in plants / M. Rakoczy-Trojanowska, H. Bolibok // Cellular and molecular biology letters. 2004. — Vol. 9. -№ 2.-P. 221−238.
  100. Reiter, R.S. Global and local genome mapping in Arabidopsis thaliana by using recombinant inbred lines and random amplified polymorphic DNAs / R.S. Reiter et al. // Proceedings of the national academy science. 1992. — Vol. 89. -P. 1477−1481.
  101. Roy, A. Evaluation of genetic diversity in jute {Corchorus species) using STMS, ISSR and RAPD markers / A. Roy et al. // Plant breeding. 2006. — Vol. 125.-P. 292−297.
  102. Saliba-Colombani, V. Efficiency of PFLP, RAPD and AFLP markers for the construction of an intraspecific map of the tomato genome / V. Saliba-Colombani, M. Causse, L. Gervais., J. Philouse // Genome. 2000. — Vol. 43. — P. 29−40.
  103. Shan X. Convertion of AFLP markers to sequence-specific PCR markers in barley and weat / X. Shan, T.K. Blake, L.E. Talbert // TAG Theoretical and applied genetic. 1999. — Vol. 98. — P. 1072−1078.
  104. Sica, M. ISSR markers show differentiation among Italian populations of Asparagus acutifolius L. / M. Sica et al. // BMC Genetics. 2005. — Vol. 6. — P. 6−17.
  105. Southern, E.M. Detection of specific sequences among DNA fragments separated by gel electrophoresis / E.M., Southern // Journal of molecular biology. 1975. Vol. 98 -№. 3. — P. 503−517.
  106. Steele, K.P. Phylogenetic analysis of tribes Trifolieae and Vicieae, based on sequences of the plastid gene matK (Papilionoideae: Leguminosae) / K.P. Steele, M.F. Wojciechowski // Advances in Legume Systematics / Eds K. KHtgaard, A.
  107. Bruneau. Part 10, High Level Systematics. Royal Botanic Garden, Kew. 2003. P. 355−370.
  108. Talhinhas, P. AFLP, ISSR, RAPD markers reveal high levels of genetic diversity among Lupinus spp. / P. Talhinhas, J. Neves-Martins, J. Leitao // Plant breeding. 2003. — Vol. 122. — P. 507−510.
  109. Tautz, D. Hypervariability af simple sequences as a general source for polymorphic DNA / D. Tautz // Nucleic acids research. 1989. — Vol. 17. — P. 6463−6471.
  110. Vos, P. AFLP: a new technique for DNA fingerprinting / P. Vos et al. // Nucleic acids research. 1995. — Vol. 23. — P. 4407−4414.
  111. Waldron, J. Randomly amplified DNA fingerprinting: a culmination of DNA marker technologies based on arbitrarily-primed PCR amplification / J. Waldron et al. // Journal of biomedicine and biotechnology. 2002. — Vol. 2. — № 3. -P. 141−150.
  112. Weber, J.L. Abundant class of human DNA polymorphism wich can be typed using the polymerase chain reaction / J.L. Weber, P.E. May // American journal of human-genetic. 1989. — Vol. 44. — P. 388−396.
  113. Williams, J.G.K. DNA polymorphism amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers / J.G.K. Williams et al. // Nucleic acids research. 1990. — Vol. 18.-P. 6531−6535.
  114. Wolko, B. Molecular markers in genetic studies of Lupinus genus / B. Wolko // Hodowla rolin aklimatizacia i nasiennictwo. 1995. — Vol. 39. — P. 3−64.
  115. Wu, K. Detection of microsatellite polymorphisms without cloning / K. Wu, R. Jones, L. Dannederger, P.A. Scolnik // Nucleic acids research. 1994. — Vol. 22. -P. 3257−3258.
  116. Yaish, M.W.F. Isolation of (GA)n microsatellite sequences and description of a predicted MADS-box sequence isolated from common bean / M.W.F. Yaish, M. Perez de la Vega // Genetics, molecular, biology. 2003. — Vol. 26. — P. 337−342.
  117. You, M. A PCR-based molecular marker applicable for marker-assisted selection for anthracnose disease resistance in lupin breeding / M. You et al. // Cellular and molecular biology letters. 2005. — Vol. 10. — P. 123−134.
  118. Yu, K. Optimization of PCR program for RAPD analysis / K. Yu., K.P. Pauls // Nucleic acids research. 1992. — Vol. 20. — P. 2606.
Заполнить форму текущей работой

Пора сдавать?