Генетическая изменчивость цитоплазматических маркеров и биогеография лиственниц (Larix Mill., Pinaceae) Дальнего Востока России
Диссертация
Научная новизна. Впервые с использованием маркеров хлоропластной и митохондриальной ДНК на обширном материале исследована генетическая изменчивость лиственницы континентального северо-востока Азии и о.Сахалина. Выявлена генетическая самостоятельность Larix cajanderi Мауг. и родственные связи лиственниц юга о. Сахалин с японской лиственницей L. kaempferi Lamb. Впервые исследована изменчивость… Читать ещё >
Содержание
- ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
- 1. 1. Биологические особенности, эволюция, систематика и распространение рода Ьапх
- 1. 2. Изучение изменчивости, дифференциации и филогении рода Ьапх
- 1. 3. Палеогеография Дальнего Востока в позднем плейстоцене и голоцене
- 1. 4. Генетические эффекты послеледниковой реколонизации
- Использование генетических цитоплазматических маркеров для их изучения
- ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
- 2. 1. Видовой состав, характеристика и локализация выборок
- 2. 2. Материалы и методы, использованные в анализе генетической изменчивости хлоропластных микросателлитов и маркеров митохондриальной ДНК
- ГЛАВА 3. ИЗМЕНЧИВОСТЬ ХЛОРОПЛАСТНЫХ МИКРОСАТЕЛЛИТОВ У ВИДОВ ЬАШХ ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА РОССИИ
- 3. 1. Полиморфизм микросателлитных локусов хлоропластной ДНК. Внутрипопуляционная изменчивость
- 3. 2. Межпопуляционная и пространственная дифференциация
- ГЛАВА 4. ИЗМЕНЧИВОСТЬ МАРКЕРОВ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК ЬАШХ ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА РОССИИ
- 4. 1. Полиморфизм маркеров митохондриальной ДНК
- Внутрипопуляционная изменчивость
- 4. 2. Межпопуляционная и пространственная дифференциация
- ГЛАВА 5. ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ, ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ И БИОГЕОГРАФИЯ ЛИСТВЕННИЦ ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА РОССИИ
- 5. 1. Генетическая изменчивость и дифференциации изученных популяций лиственниц
- 5. 2. Биогеография лиственниц Дальнего Востока России на основе структуры изменчивости маркеров митохондриальной и хлоропластной ДНК
- ВЫВОДЫ
Список литературы
- Абаимов А.П. Лиственницы Гмелина и Каяндера / А. П. Абаимов, И. Ю. Коропачинский. -М.: Наука, 1984. 120с.
- Адрианова И.Ю. Генетическая изменчивость островных популяций лиственниц Российского Дальнего Востока / И. Ю. Адрианова // Материалы V съезда ВОГиС, 21−28 июня 2009 г. М.: РГАУ-МСХА им. К. А. Тимирязева, 2009.-С. 142.
- Александрова А.Н. Плейстоцен Сахалина / А. Н. Александрова. М.: Наука, 1982.-192с.
- Богатов В.В. Биогеографические проблемы Курильского архипелага /
- B.В. Богатов // Растительный и животный мир Курильских островов: материалы междунар. Курил, проекта. Владивосток: Дальнаука, 2002.1. C.150−165.
- Блохина Н. И. Древесина Laricioxylon shilkinae (Pinaceae) из верхнего олигоцена бухты Сизиман (Хабаровский край) / Н. И. Блохина // Ботат.журн. 1984. — Т. 69, № 11. — С. 1498−1501.
- Блохина Н.И. Новый вид ископаемой лиственницы (по древесине) и проблема происхождения сибирской и даурской лиственниц / Н. И. Блохина // Комаровские чтения. Владивосток: ДВНЦ АН СССР, 1985. — Вып. 32. — С. 3−13.
- Блохина Н.И. О происхождении и историческом развитии дальневосточных лиственниц / Н. И. Блохина // «Палеогеография, центры происхождения и миграция организмов»: тез. докл. XLI сес. палеонтол. о-ва, С.-Петербург, 30 янв. 3 февр. 1995. — СПб., — С.8−10.
- Блохина Н.И. Проблемы систематики лиственниц по признакам анатомического строения древесины. / Н. И. Блохина // Комаровские чтения. Владивосток: Дальнаука, 1998. — Выпуск 45. — С. 10−28.
- Бобров Е.Г. История и систематика лиственниц / Е. Г. Бобров // Комаровские чтения. Л, 1972а. Вып. 25. — С.1- 96.
- Бобров Е.Г. Интрогрессивная гибридизация, формообразование и смены растительного покрова / Е. Г. Бобров // Ботан. Журн. 19 726. -Т.57, № 8. — С.865−889.
- Бобров Е.Г. Лесообразующие хвойные СССР / Е. Г. Бобров. Л.: Наука, 1978. — 189с.
- Бобров Е.Г. Об изучении внутривидовой систематики хвойных / Е. Г. Бобров // Ботан. Журн. 1980. — Т. 65, № 9. — С. 1157−1163.
- Боярская Т.Д. Сопоставление амплитуды изменчивости палеоклиматов позднего плейстоцена и голоцена различных районов СССР / Т. Д. Боярская //Палеоклиматы позднеледниковья и голоцена. М.: Наука, 1989. — С.85−90.
- Будкевич Е.В. Анатомическое строение древесины видов Larix в связи с их систематикой / Е. В. Будкевич // Ботан. Журн. 1956. — Т.41, № 1. — С.64−80.
- Васильев В.Н. Происхождение флоры и растительности Дальнего Востока и Восточной Сибири / В. Н. Васильев // Материалы по истории флоры и растительности СССР. М.- Л.: Изд-во АН СССР, 1958. — Вып.З. — С. 361−457.
- Васюткина Е.А. Генетическая изменчивость и дифференциация популяций лиственницы ольгинской в Приморском крае / Е. А. Васюткина // Материалы V съезда ВОГиС, 21−28 июня 2009 г. М.: РГАУ-МСХА им. К. А. Тимирязева, 2009. — С. 152.
- Величко A.A. Развитие оледенений в позднем плейстоцене / А. А. Величко, М. А. Фаустова // Палеоклиматы и палеоландшафты внетропического пространства Северного полушария: поздний плейстоцен-голоцен: атлас-монография. М.: ГЕОС, 2009. — С. 32−42.
- Воробьев Д.П. Larix Mill. Лиственница / Д. П. Воробьев // Дикорастущие деревья и кустарники Дальнего Востока. — Л.: Наука, 1968. — С. 25−29.
- Генетическая изменчивость и взаимоотношения лиственниц Сибири и Дальнего Востока по данным RAPD-анализа / М. М. Козыренко и др. // Генетика. 2004. — Т.40, № 4. — С. 506−515.
- Генетическая изменчивость и популяционная структура лиственниц Приморского края / М. М. Козыренко и др. // Лесоведение. 2004. — № 6. -С.34−41.
- Генетическая изменчивость сибирской кедровой сосны Pinns sibirica Du Tour. Сообщение IV / K.B. Крутовский, Д. В. Политов, Ю. П. Алтухов и др. // Генетика 1989. — Т. 25, № 11. — С. 2009−2032.
- Гладенков Ю.Б. Эоцен западной Камчатки / Ю. Б. Гладенков, В. Н. Синельникова, А. Е. Шанцер. -М.: Наука, 1991. 184с.
- Голубева Л.В. Растительность и стратиграфия плейстоцена и голоцена юга Дальнего Востока / Л. В. Голубева, Л. П. Караулова. М.: Наука, — 1983. -144с.
- Гончаренко Г. Г. К вопросу о генетической изменчивости и дифференциации лиственницы курильской {Larix kurilensis Мауг.) и лиственницы японской {Larix kaempferi Sarg.) / Г. Г. Гончаренко, А. Е. Силин. // Докл. акад. наук. 1997. — Т. 354, № 6. — С. 835−838.
- Грант В. Видообразование у растений / В. Грант. М.: Мир, 1984. — 528с.
- Гричук В.П. Опыт реконструкции некоторых элементов климата Северного полушария в атлантический период голоцена / В. П. Гричук // Голоцен / под ред. М. И. Нейштадта. М.:Наука, 1969. — С.41−51.
- Гричук В.П. Растительность Европы в позднем плейстоцене / В. П. Гричук // Палеогеография Европы за последние сто тысяч лет: атлас-монография / под ред. И. П. Герасимова и A.A. Величко. М.:Наука, 1982. -С.92−109.
- Гричук В.П. Растительный покров: поздний плейстоцен / В. П. Гричук, O.K. Борисова // Палеоклиматы и палеоландшафты внетропического пространства Северного полушария: поздний плейстоцен-голоцен: атлас-монография. М.: ГЕОС, 2009. — С. 70−78.
- Гуков Г. В. Популяции лиственницы приморской на Дальнем Востоке и ее место в систематике рода Larix / Г. В. Гуков // Теоритические основывнутривидовой изменчивости и структура популяций хвойных пород. -Свердвловск, 1974. С. 76−80.
- Гуков Г. В. Дальневосточное лесоводство / Г. В. Гуков. Владивосток: Изд-во Дальневост. ун-та, 1989. — 259с.
- Дальний Восток / A.M. Короткий и др. // Изменение климата и ландшафтов за последние 65 миллионов лет: кайнозой: от палеоцена до голоцена). М.: ГЕОС, 1999. — С. 146−159.
- Дорофеев П.И. Третичные флоры бассейна Омолоя. / П. И. Дорофеев // История флоры и растительности Евразии. JL: Наука, 1972.- С.41−112.
- Дылис Н.В. Лиственница Восточной Сибири и Дальнего Востока / Н. В. Дылис.- М.: Изд-во АН СССР, 1961. 209с.
- Дылис Н.В. Сибирская лиственница/Н.В. Дылис.-М.:МОИП, 1947.- 136с. Жизнь растений: в 6 т. / под ред. И. В. Грушевицкого, С. Г. Жилина.- М.: Просвещение, 1978. Т.4: Мхи. Плауны. Хвощи. Папоротники. Голосеменные растения. — 447с.
- Изменение растительного покрова Северо-Востока Сибири на границе плейстоцена и в голоцене / A.B. Ложкин и др. // Берингия в четвертичный период. Магадан: СВКНИИ ДВО РАН, 2000. — С. 53−75.
- Изучение генетической изменчивости и дифференциации популяций лиственницы в пределах ареала Larix olgensis А. Henry в Приморском крае / Левина Е. А. и др. // Генетика. 2008. — Т. 44, № 3. — С. 374−380.
- Ильченко Т.П. Сравнительный кариологический анализ лиственниц Приморья / Т. П. Ильченко // Лесоведение. 1973. — № 6. — С. 69−72.
- Ирошников А.И. Лиственницы России: биоразнообразие и селекция / А. И. Ирошников. М.: ВНИИЛМ, 2004. — 182 с.
- Кабанов Н.Е. Типы лиственничных лесов Камчатки / Н. Е. Кабанов // Леса Камчатки и их лесохозяйственное значение. М.: Изд-во АН СССР -1963.-С. 12−126.
- Климатические смены на территории юга Дальнего Востока в позднем Кайнозое: миоцен-плейстоцен / A.M. Короткий и др. -Владивосток: ДВГУ, 1996. С. 58.
- Козубов Г. М. Современные голосеменные / Г. М. Козубов, E.H. Муратова. Л.: Наука, 1986. — 192с.
- Колесников Б.П. К систематике и истории развития лиственниц секции Pauciseriales Patschke / Б. П. Колесников // Материалы по истории флоры и растительности СССР. М.- Л.: Изд. АН СССР, 1946. — Вып. 2. — С. 321−364.
- Коропачинский И.Ю. / Древесные растения Азиатской России / И. Ю. Коропачинский, Т. Н. Встовская. Новосибирск: Гео, 2002. 707с.
- Коропачинский И.Ю. Естественная гибридизация древесных растений / И. Ю. Коропачинский, Л. И. Милютин. Новосибирск: Гео, 2006. — 223с.
- Коропачинский И.Ю. Интрогрессивная гибридизация лиственниц сибирской и даурской в южной части их ареалов / И. Ю. Коропачинский, Л. И. Милютин // Селекция древесных пород в Восточной Сибири. М.: Наука, 1964.-С. 20−31.
- Кременецкий К.В. История ареалов основных хвойных пород Сибири в голоцене / К. В. Кременецкий // Короткопериодные и резкие ландшафтно-климатические изменения за последние 15 000 лет. М.: Наука, 1994. — С. 160−210.
- Крестов П.В. Ботанико-географическое районирование острова Сахалин / П. В. Крестов, В. Ю. Баркалов, A.A. Таран // Растительный и животный мир острова Сахалин: материалы междунар. Сахалин, проекта). -Владивосток: Дальнаука, 2004. Ч. 1. — С.67−92.
- Круклис M.B. Характеристика кариотииов некоторых хвойных растений в связи с их эволюцией. / М. В. Круклис // Теоретические основы внутривидовой изменчивости и структура популяций хвойных пород. -Свердловск, 1974.-С. 95−101.
- Круклис М.В. Лиственница Чекановского / М. В. Круклис, Л. И. Милютин. М.: Наука, 1977. 212с.
- Крюссман Г. Хвойные породы / Г. Крюссман // М.: Лесн. пром-сть, 1986. -256с.
- Ларионова А.Я. Генетическое разнообразие и дифференциация популяций лиственницы Гмелина в Эвенкии: Средн. Сибирь / А. Я. Ларионова, Н. В. Яхнева, А. П. Абаимов // Генетика. 2004. — Т. 40, № 10. — С. 1370−1377.
- Леса СССР / гл. ред. А. Б. Жуков М.: Наука, 1969. — Т.4: Леса Урала, Сибири и Дальнего Востока. — 766с.
- Ложкин A.B. Современный пыльцевой дождь в арктических районах Берингии и реконструкция растительности ледниковых интервалов плейстоцена / A.B. Ложкин // Четвертичная палеогеография Берингии. -Магадан: СВКНИИ, 2002. С. 13−27.
- Лузганов А.Г. Роль речных бассейнов и ветра в расселении и эволюции лиственниц, кедра сибирского и других древесных пород / А. Г. Лузганов, А. П. Абаимов // Лиственница. 1977. — С.31−38.
- Мамаев С.А. Некоторые вопросы формирования популяционной структуры видов древесных растений / С. А. Мамаев // Экология. -Красноярск, 1970. Вып.8 — С.39−49.
- Мамаев С.А. Формы внутривидовой изменчивости древесных растений: на примере семейства Pinaceae / С. А. Мамаев. М.: Наука, 1973. -284с.
- Мелекесцев И.В. Позднеплейстоценовый вулканизм и оледенения Камчатки / И. В. Мелекесцев, В. Н. Олюнин // Развитие ландшафтов и климата Северной Евразии: поздний плейстоцен голоцен- элементы прогноза. — М.: Наука, 1993. — Вып. 1.-С.71−73.
- Милютин Л.И. Лесные генетические ресурсы Сибири / Л. И. Милютин // Современное состояние исследования естественной дендрофлоры с сособым учетом сохранения ее генофонда: X конгр. дендрологов. София, 1988.-С. 272−277.
- Милютин Л.И. Особенности краевых популяций древесных растений / Л. И. Милютин // Экология популяций. М.: Наука, 1991. — С.86−97.
- Милютин Л.И. Биоразнообразие лиственниц России / Л. И. Милютин // Хвойные бореальной зоны. 2003. — Вып.1. — С.6−9.
- Мочалова O.A. О новом местонахождении ели сибирской {Picea obovata Ledeb.) на Крайнем Северо-Востоке Азии / O.A. Мочалова // Ботан. журн. 1996. — Т.81, N 12. — С.127−133.
- Муратова E.H. Добавочные хромосомы у лиственницы Гмелина Larix gmelinii (Rupr.) Rupr. / E.H. Муратова // Докл. АН СССР. 1991. — Т. 318, № 6.-С. 1511−1514.
- Муратова E.H. Кариотип лиственницы охотской (Larix ochotensis Kolesn.) в связи с ее систематическим положением / E.H. Муратова // Бюл. МОИП. Отд. биол.- 1993.-Т.98.-Вып. З.-С. 129−133.
- Муратова E.H. Хромосомный полиморфизм в природных популяциях лиственницы Гмелина Larix gmelinii (Rupr.) Rupr. / E.H. Муратова // Цитология и генетика. 1994. — Т.28, № 4. — С. 14−22.
- Муратова E.H. Систематические взаимоотношения в роде Larix на основе данных кариологии и анализа ДНК / E.H. Муратова // Вестник ТГУ. -2004. -№ 10.-С. 59−63.
- Недолужко В.А. Конспект дендрофлоры российского Дальнего Востока / В. А. Недолужко. Владивосток: Дальнаука, 1995. — 208с.
- Никитин В.П. Палеокарпологическая изученность палеогена и неогена Северо-Востока Азии / В. П. Никитин // Геология и геофизика. 2007.- Т.48, N8.-0. 871−880.
- Орешкова Н.В. Генетическое разнообразие лиственницы сибирской в Ужурской лесостепи: Красноярский край / Н. В. Орешкова, А. Я. Ларионова // Вест. СВНЦ ДВО РАН. 2007. — № 3. — С. 50−55.
- Орешкова Н.В. Популяционная изменчивость лиственницы Каяндера в республике Саха (Якутия) / Н. В. Орешкова, А. П. Барченков // Вестник СВНЦ ДВО РАН. 2009. — № 1. — С. 81 -87.
- Плетнев С.П. Геологическое развитие острова Сахалин / С. П. Плетнев // Флора и фауна острова Сахалин. Владивосток, 2004. — С. 11−23.
- Поздняков Л.К. Даурская лиственница / Л. К. Поздняков. М.: Наука, 1975.-312с.
- Полежаева М. А. Генетическая изменчивость срБЗЯ маркеров в роде Ьапх на Дальнем Востоке / М. А. Полежаева, В. Л. Семериков // Вестник СВНЦ. 2009. — № 2. -С. 75−84.
- Пономарев H.A. Лиственницы СССР / H.A. Понамарев. М.: Гослестехиздат, 1934. — 246с.
- Потенко В.В. Генетическая изменчивость и популяционная структура лиственницы даурской на территории Хабаровского края / В. В. Потенко, П. Н. Разумов //Лесоведение. 1996. — № 5. — С. 11−17.
- Путенихин В.П. Лиственница Сукачева на Урале: изменчивость и популяц.-генет. структура / В. П. Путенихин, Г. Г. Фарукшина, З.Х. Шигапов- Отв. ред. Н. В. Старова. М.: Наука, 2004. — 276с.
- Развитие ландшафтов и климата Северной Евразии. / отв. Ред. A.A. Величко. -М.: Наука, 1993-Вып. 1.- 101с.
- Реликтовые комплексы растительности современных рефугиумов северо-восточной Азии / П. В. Крестов и др. // Комаровские чтения. 2009.-вып.56. — С.5−63.
- Савина Л.Н. Сохранность пыльцы лиственницы в лесных почвах и отражение состава лиственничных лесов Монголии в рецентных спектрахт/ Л. Н. Савина, Т. А. Буренина // Палеоботанические исследования в лесах Северной Азии. Новосибирск: Наука, 1981. — С. 6−83.
- Санников С.Н. Гипотеза гидрохорного расселения популяций хвойных древесных растений / С. Н. Санников, Н. С. Санникова // Экология. 2007. -№ 2.-С. 83−87.
- Санников С.Н. Дифференциация популяций сосны обыкновенной / С. Н. Санников, И. В. Петрова. Екатеринбург: УрО РАН, 2003. 248с.
- Санников С.Н. Изоляция и типы границ популяций у сосны обыкновенной / С. Н. Санников // Экология. 1993. — № 1. — С. 4−11.
- Семериков В.Л. Изучение генетической изменчивости лиственницы сибирской (Larix sibirica Ldb.) по изоферментным локусам. / В. Л. Семериков, A.B. Матвеев // Генетика. 1995. — Т. 31, № 8. — С. 1107−1113.
- Семериков В.Л. Изменчивость митохондриальной ДНК и биогеография рода Larix (Pinaceae) / В. Л. Семериков // Материалы V съезда ВОГиС, 21−28 июня 2009 г. М.: РГАУ-МСХА им. К. А. Тимирязева, 2009. — С. 187.
- Семериков В.JI. Популяционная структура и молекулярная систематика видов Larix Mill.: автореф. дис.. д-ра биол. наук: 03.00.05: защищена 16.05.2007 / Семериков Владимир Леонидович. Екатеринбург, 2007а. — 38с.
- Семериков В.Л. Структура изменчивости митохондриальной ДНК лиственниц Восточной Сибири и Дальнего Востока / В. Л. Семериков, М.А. Полежаева// Генетика, 2007. — Т. 43. — № 6. — С.782−789.
- Семериков В.Л. Структура изменчивости митохондриальной ДНК и послеледниковая история лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) /
- B.Л. Семериков, А. И. Ирошников, М. Ласко // Экология. 20 076. — № 3. — С. 163−171.
- Семерикова С.А. Изменчивость хлоропалстных микросателлитных локусов у пихты сибирской (Abies sibirica Ledeb.) и двух дальневосточных видов пихт A. nephrolepis (Trautv.) Maxim, и A. sachalinensis Fr. Schmidt /
- C.А. Семерикова, В. Л. Семериков // Генетика. 2007. — Т.43, № 12. — С. 1−10.
- Семерикова С.А. Структура аллозимной изменчивости и генетические связи пихт сахалинской Abies sachalinensis Fr. Schmidt, и белокорой А. nephrolepis (Trautv.) Maxim. / С. А. Семерикова, В. Л. Семериков // Вестн. СВНЦ ДВО РАН. 2008. — № 1. — С. 77−85.
- Семерикова С.А. Популяционно-таксономическая структура видов пихт (Abies Mill, Pinaceae) Северо-Востока Евразии: автореф. дис.. канд. биол. наук: 03.00.05: защищена 25.11.08 / С. А. Семерикова Екатеринбург, 2008.-24с.
- Сочава В.П. Элементы растительного покрова Северного Сихотэ-Алиня и их взаимоотношения / В. П. Сочава // Сов. ботаника. 1945. -Т.13, № 1.-С. 14−32.
- Сукачев В.Н. Дендрология с основами лесной геоботаники / В. Н. Сукачев. — Л.: Гослестехиздат, 1938. 576с.
- Сукачев В.Н. К истории развития лиственниц / В. Н. Сукачев // Лесное дело. М.- Л.: Новая деревня, 1924. — С.12−44.
- Сукачев В.Н. О двух новых ценных для лесного хозяйства породах / В. Н. Сукачев // Тр. по лесн. хоз-ву и лесн. пром-сти. 1931. — № 10. — С. 1−12.
- Унифицированная региональная стратиграфическая схема четвертичных отложений Западно-Сибирской равнины: объясн. Записка: рассмотрена и утв. Межведомств. Стратигр. Ком. России 29 мая 200 г. -Новосибирск: СНИИГГИМС, 2000. 64 с.
- Урусов В.М. Гибридизация в природной флоре Дальнего Востока и Сибири: причины и перспективы использования / В. М. Урусов. Владивосток: Дальнаука, 2002. 221с.
- Усенко Н.В. Хвойные деревья и кустарники Дальнего Востока / Н. В, Усенко. Хабаровск: кн. изд-во, 1966 — 96 с.
- Уханов В.В. Род Larix Mill. Лиственница / B.B. Уханов // Деревья и кустарники СССР. М.- Л.: АН СССР, 1949. — Т. I: Голосеменные. — С. 153 176.
- Фрадкина А.Ф. Эоцен Новосибирских островов / А. Ф. Фрадкина, Г. В. Труфанов, A.C. Вакуленко // Континентальные третичные толщи Северо-Востока Азии. Новосибирск: Наука, 1979.- С. 22−30.
- Чудный A.B. Состав терпентинных масел и таксономия лиственницы в СССР / A.B. Чудный // Лесоведение. 1982. — № 3. — С.32−40.
- Шиманюк А.П. Биология древесных растений и кустарниковых пород СССР / А. П. Шиманюк. М.: Просвещение, 1964. — 478с.
- Яхнева Н.В. Генетико-таксономический анализ популяций лиственницы Гмелина (Larix gmelinii (Rupr.) Rupr.) / H.B. Яхнева: автореф. дис.. канд. биол. наук. Красноярск, — 2004. — С. 16.
- A genetic linkage map for Pinus radiate based on RFLP, RAPD and microsatellite markers / M.E. Devey et al. // Theor. Appl. Genet. 1996. -Vol.92.- P.673−679.
- A mitochondrial DNA minisatellite reveals the postglacial history of jack pine {Pinus banksiana), a broadrange North American conifer / J. Godbout et al. // Molecular Ecology. 2005. — Vol. 14. — P. 3497−3512.
- A set of primers for amplification of 20 chloroplast microsatellites in Pinaceae / G.G.Vendramin et al. // Molecular Ecology. 1996. — Vol. 5. — P. 595 598.
- Afzal-Rafii Z. Chloroplast DNA supports a hypothesis of glacial refugia over postglacial recolonization in disjunct populations of black pine (Pinus nigra) in western Europe. / Z. Afzal-Rafii, R. S. Dodd // Molecular ecology. 2007. -Vol.16,-P.723−736.
- An evaluation of genetic distances for use with microsatellite loci / D.B. Goldstein et al. // Genetics. 1995. — Vol. 139. — P. 463−471.
- Ancestry and divergence of subtropical montane forest isolates: molecular biogeography of the genus Abies (Pinaceae) in southern Mexico and Guatemala / J.P. Jramillo-Correa et al. // Molecular Ecology. 2008. — Vol.17. — P.2476−2490.
- Anderson E. Introgressiv hybridization / E. Anderson. N.Y.: Wiley, 1949.- 109 p.
- Avis J. Molecular markers, natural history and evolution./ J. Avis // New York: Chapman and Hall, 1994. XIV, 51 lp.
- Axelrod D.I. The early Miocene Buffalo Canyon flora of southern Idaho / D.I. Axelrod // Univ. of California Publi. Publications, Geological Sci. 1991. — Vol. 135. -P. 1−76.
- Beringia as a glacial refugium for boreal trees and shubs: new perspectives from mapped pollen data./L.B. Brubaker et al. // J.Biogeogr. 2005. -Vol.32. -P.833−848.
- Carlson C.E. Cone and seed morphology of western larch (Larix occidentalis), alpine larch (Larix lyalii) in Western Montana / C. E. Carlson, L. J. Theroux // Ibid. 1993. — Vol. 23. — P. 1264−1269.
- Cheliak W.M. Population structure and genetic diversity in tamarack, Larix laricina (Du Roi) K. Koch / W.M. Cheliak, J. Wang, J.A. Pitel // Canad. J. Forest Ras.- 1988.-Vol. 18.-P. 1218−1324.
- Chiba S. Tetraploids of Larix leptolepis that have appeared in the nurseries / S. Chiba, M. Watanabe // J. Jap. Forest. Soc. 1952. Vol. 34, N 3. — P. 276−278.
- Chloroplast DNA variation in European white oaks. Phylogeography and patterns of diversity based on data from over 2600 populations / R.J. Petit et al. // Forest Ecology and Management. 2002. — Vol. 156. — P. 5−26.
- Chloroplast microsatellites analysis reveals the presence of population subdivision in Norway Spruce (Picea abies K.) / G.G. Vendramin et al. // Genome. 2000. — Vol.43. — P. 68−78.
- Comparative phylogeography and demographic history of the wood lemming (Myopus schisticolor): implications for late Quaternary history of the taiga species in Eurasia / V.B. Fedorov et al. // Molecular Ecology. 2008. -Vol. 17.-P. 598−610.
- Comparative phylogeography and postglacial colonization routes in Europe / P. Taberlet et al. // Molecular ecology. 1998. — Vol. 7. — P.453−464.
- Comparison of genetic diversity estimates within and among populations of maritime pine using chloroplast simple-sequence repeat and amplified fragment length polymorphism data / M.M. Ribeiro et al. // Molecular ecology. 2002. -Vol. 11. — P.869−877.
- Conflicting phylogenies of Larix (Pinaceae) based on cytoplasmic and nuclear DNA / V.L. Semerikov et al. // Molecular Phylogenetic Evolution. -2003.-Vol. 27.-P. 173−184.
- Contrasting microsatellite variation between subalpine and western larch, two closely related species with different distribution patterns / D.P. Khasa et al. // Molecular Ecology. -2006. Vol.15. P. 3907−3918.
- Decoupled mitochondrial and chloroplast DNA population structure reveals Holocene collapse and population isolation in a threatened Mexican-endemic conifer / J.P. Jaramillo-Correa et al. // Molecular Ecology. 2006. — Vol.15. -P.2787−2800.
- DeVerno L.L. Inheritance of mitochondrial DNA in the conifer Larix / L.L. DeVerno, P.J. Charest, L. Bonen I I Theoretical and Applied Genetics.- 1993. -Vol. 86.-P. 383−388.
- Du F.K. More introgression with less gene flow: chloroplast vs. mitochondrial DNA in the Picea asperata complex in China, and comparison with other Conifers / F. K Du, R.J. Petit, J.Q. Liu // Molecular Ecology. 2009.- Vol.18 -P. 1396−1407.
- Dumoulin-Lapegue S. An enlarged set of consensus primers for the study of organelle DNA in plants / S. Dumoulin-Lapegue, M.H. Pemonge, R.J. Petit // Molecular Ecology. 1997. — Vol. 6. — P. 393−397.
- Dupanloup I. A simulated annealing approach to define the genetic structure of populations /1. Dupanloup, S. Schneider, L. Excoffier. // Molecular Ecology. -2002.-Vol. 11. P.2571−2581.
- Excoffier L. Analysis of molecular variance inferred from metric distances among DNA haplotypes application to human mitochondrial DNA restrictiondata / L. Excoffier, P.E.Smouse, J.M. Quattro I I Genetics. 1992. — Vol. 131. — P. 479−491.
- Extensive mitochondrial introgression from Pinus pumila to P. parvtflora var. pentaphylla (Pinaceae) / M. Senjo et al. // Journal of Plant Research. 1999. -Vol.112-P. 97−105.
- Farjon A. Pinaceae: drawings and description of the genera Abies, Cedrus, Pseudolarix, Ketleeria, Nototsuga, Tsuga, Cathaya, Pseudotsuga, Larix and Picea / A. Farjon. Konigstein: Koeltz scientific Books, 1990. — 198p.
- Fins L. Genetic variation in allozymes of western larch. / L. Fins, L.W. Sebb //Canad. J. Forest Res. 1986.-Vol. 16.-P.1013−1018.
- Genetic diversity and population structure in natural populations of Moroccan Atlas cedar (Cedrus atlantica, Pinaceae) determined with cpSSR markers/A. Terrab et al. //American J. Botany. 2006. -Vol. 93. -P. 1274−1280.
- Genetically depauperate but widespread: The case of an emblematic mediterranean pine / G.G. Vendramin et al. // Evolution. 2008. — Vol. 62. — P. 680−688.
- Gernandt D.S. Internal transcribed spacer region evolution in Larix and Pseudotsuga (Pinaceae) / D.S. Gernandt, A. Liston // Amer. J. Botany. 1999.-Vol. 86.-P. 711−723.
- Glacial refugia: Hotspots but not melting pots of genetic diversity / R.J. Petit, et al. Science. 2003.- Vol. 300. — P. 1563−1565.
- Glacial vicariance in Eurasia: mitochondrial DNA evidence from Scots pine for complex heritage involving genetically distinct refugia at mid-northern latitudes and in Asia Minor / K. Naydenov et al. // BMC Evol Biol. 2007. -Vol.22.-P. 7−233.
- Glacial vicariance in the Pacific Northwest: evidence from a lodgepole pine mitochondrial DNA minisatellite for multiple genetically distinct and widely separated refugia / J. Godbout et al. // Molecular Ecology. 2008. — Vol. 17. — P. 2463−2475.
- Grichuk V.P. Late Pleistocene vegetation history / V.P. Grichuk // Late Quaternary environments of the Soviet Union. Minneapolis: University of Minnesota Press, 1984. P.155−178.
- Hattemer H.H. Genetic structures and population sizes / H.H. Hattemer // //Conservation and management of forest resources in Europe eds: Th. Geburek & J. Turok. Zvolen: Arbora publishers, 2005. Cht 3: Genetics in forest tree populations. — P. 149−168.
- Heterozygosity and hybrid performance in larch / A. Arcade et al. // Theor. fnd Appl. Genet. 1996. — N 261. — P. 1−86.
- Hewitt G.M. Genetic consequences of climate oscillations in the Quaternary / G.M. Hewitt // Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B, Biol. Sci.- 2004. Vol. 359. — P. 183−195.
- Hewitt G.M. Post-glacial re-colonization of European biota / Hewitt G.M. // Biological Journal of the Linnean Society. 1999. — Vol. 68. — P. 87−112.
- Hopkins D.M. The consensus view: Limited glacial ice extend across N.E. Russia during LGM / D.M. Hopkins, J. Brigham-Grette // EOS, AGU. 1998. -Vol. 79, N 45: Abstracts of Fall Meeting American Geophysical Union. — P. 491.
- Jaramillo-Correa J.P. Mitochondrial genome recombination in the zone of contact between two hybridizing conifers / J.P. Jaramillo-Correa, J. Bousquet // Genetics. 2005. — Vol. 171. — P. 1951−1962.
- Kimura M. The number of alleles that can be maintained in a finite population./ M. Kimura, J. F. Crow // Genetics. 1964. — Vol. 49 -P. 725−38.
- Kimura M. Stepwise mutation model and distribution of allelic frequencies in a finite population / M. Kimura, T. Ohta // Proc. Nat. Acad. Sei. USA. 1978. -Vol. 75.-P. 2868−2872.
- Page B.A. A new species Larix (Pinaceae) of Axel Heiberg Island, Arctic Canada / B.A. La Page, J.F. Besinger // Rev. of Paleobotany and Polynology. -1991.-Vol. 70.-P. 89−111
- Mantel N.A. The detection of disease clustering and a generalized regression approach / N.A. Mantel // Cancer Res. 1967. — Vol.27. — P. 209−220.
- Michalakis Y. A generic estimation of population subdivision using distances between alleles with special reference to microsatellite loci / Y. Michalakis, L. Excoffier// Genetics. 1996. — Vol. 142. — P. 1061−1064.
- Mitochondrial and chloroplast phylogeography of Picea crassifolia Kom. (Pinaceae) in the Qinghai-Tibetan Plateau and adjacent highlands / L.H. Meng et al. //Molecular Ecology. 2007. — Vol. 16. — P. 4128−4137.
- Mitton J.B. Glacial refugia of limber pine (Pinus flexilis James) inferred from the population structure of mitochondrial DNA / J.B. Mitton, B.R. Kreiser, R.G. Latta // Molecular Ecology. 2000. — Vol. 9. — P. 91−97.
- Molecular analysis of plant migration and refugia in the Arctic / R.J. Abbott, et al. // Science. 2000. — Vol. 289. — P. 1343−1346.
- Mousadik A. E. High level of genetic differentiation for allelic richness among populations of the argan tree (Argania spinosa (L.) Sceels) endemic to
- Morocco / A. El Mousadik, R.J. Petit // Theor. Appl. Genet. 1996. — Vol.92. — P. 832−839.
- Neale D.B. Paternal inheritance of chloroplast DNA and maternal inheritance of mitochondrial DNA in loblolly pine / D.B. Neale, R.R. Sederoff // Theoretical and Applied Genetics. 1989. — Vol. 77. — P. 212−216.
- Nei M. Molecular Evolutionary Genetics./ M. Nei // N.Y.: Columbia Univ.Press., 1987.-512p.
- Ostenfeld C.H. The species of the genus Larix and their geographical distribution / C. H. Ostenfeld, C. Syrach- Larsen. Kobenhavn, 1930.- 177p.
- Palmer J.D. Mitochondrial DNA in plant systematics: applications and limitations / J.D. Palmer // Molecular systematics of plants / eds.: P. S. Soltis [et. al. N.Y.: Chapman & Hall, 1992. P. 36−49.
- Palmer J.D. Plant mitochondrial-DNA evolves rapidly in structure, but slowly in sequence / J.D. Palmer, L.A. Herbon // J. of Molecular Evolution. -1989.-Vol. 28.-P. 87−97.
- Parducci L. PCR-RFLP analysis of cpDNA in the genus Abies / L. Parducci, A. E. Szmidt // Theor. Appl. Genet. 1999. -Vol.98. — P 802−808.
- Patschke W. Uber die extra-tropischen ostsiatischen Coniferen / W. Patschke // Engler’s Bot. Jahrb. -1913. Vol. 48. — P.651−655.
- Petit R.J. Gene flow and species delimitation / R.J. Petit, L. Excoffier // Trends in ecology & Evolution. 2009. — Vol. 24. — P. 386−393.
- Phylogeographic structure of white oaks throughout the European continent / S. Dumolin-Lapegue et al. // Genetics. 1997. — Vol. — 146. — P. 1475−1487.
- Phylogeography of Eurasian Larix species inferred from nucleotide variation in two nuclear genes // I.A. Khatab et al. // Genes Genet. Syst. 2008. — Vol. 83. -P.55−56.
- Phylogeography of Larix sukaczewii Dyl. and Larix sibirica L. inferred from nucleotide variation of nuclear genes / N.T. Araki et al. // Tree Genetics & Genomes. 2008. — Vol. 4. — P.611−623.
- Phylogeography of a northeast Asian spruce, Picea jezoensis, inferred from genetic variation observed in organelle DNA markers / M. Aizawa et al. // Molecular Ecology. 2007. — Vol.16. -P.3393−3405.
- Phylogeography of Pinus tabulaeformis Carr. (Pinaceae), a dominant species of coniferous forest in northern China / K.M. Chen et al. // Molecular Ecology. -2008. Vol.17. -P.4276−4288.
- Population genetic structure of the relict Serbian spruce, Picea omorika, inferred from plastid DNA / N. Nasri et al. // Plant Systematics and Evolution. -2008.-Vol. 271.-P. 1−7.
- Potenko V.V. Relationships among spruce {Picea A. Dietr, Pinaceae) of the Russian Far East / V.V. Potenko // Plant Systematics and Evolution. 2007. — Vol. 268.-P. 1−13.
- Provan J. Chloroplast microsatellites: new tools for studies in plant ecology and evolution / J. Provan, W. Powell, P.M. Hollingsworth // Trends in Ecology and Evolution. 2001. -Vol.16. -P.142−147.
- Qian T. Genetic relationships among larch species based on analysis of restriction fragment variation for chloroplast DNA / T. Qian, R.A. Ennos, T. Helgason // Can. J. For. Res. 1995. — Vol. 25.- P. 1197−1202.
- Ran J.-H. Molecular phylogeny and biogeography of Picea {Pinaceae): Implications for phylogeographical studies using cytoplasmic TIaplotypes/ J.-H. Ran, X.-X. Wei, X.-Q. Wang // Molecular Phylogenetics and Evolution. 2006. -Vol. 41.-P. 405−419.
- Range-wide genetic structure in a north-east Asian spruce {Picea jezoensis) determined using nuclear microsatellite markers / M. Aizawa et al. // J. Biogeography. 2009. -Vol.36. — P.996−1007.
- Range-wide phylogeography and gene zones in Pinns pinaster Ait. revealed by chloroplast microsatellite markers / G. Bucci et al. // Molecular Ecology. -2007.-Vol. 16.-P. 2137−2153.
- RAPD-derived, PCR-based mitochondrial markers for Larix species and their usefulness in phylogeny / V.L. Semerikov et al. // Conservation genetics. -2006.-Vol. 7.-P. 621−625.
- Rhylogeny of Abies (Pinaceae) inferred from nrlTS sequence data / Q.-P. Xiang et al. // Taxon. 2009. — Vol. 58, № 1. — P.141−152.
- Rohlf E.J. Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System: ver. 1.50 / E.J. Rohlf. N.Y.: Exter. Pabl. LTD, — 1988.
- Rohlf F. J. Algorithm 76. Hierarchical clustering using the minimum spanning tree./ F. J Rohlf. // The Computer J. 1973. — Vol. 16. — P. 93−95.
- Rozen S. Primer 3: A software component for picking primers / S. Rozen, H.J. Skelesky. Mode access http://fokker.wi.mit.edu/primer3/input.htm. — 1999.
- Sambrook J. Molecular Cloning a Laboratory Manual / J. Sambrook, E.F. Fritsch, T. Maniatis. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989.
- Satellite- and pollen-based quantitative woody cover reconstructions for northern Asia: Verification and application to late-Quaternary pollen data / P.E. Tarasov et al. // Earth and Planetary Science Letters. 2007.- Vol. 264. P. 284 298
- Saville B.J. MtDNA recombination in a natural population / B.J. Saville, Y. Kohli, J.B. Anderson// Proc. Natl.Acad.Sci.USA. 1998. — Vol.95. P.1331−1335.
- Savoskul O.S. Holocene glacier advances in the headwaters of Sredniaya Avacha, Kamchatka, Russia / O.S. Savoskul // Quaternary Res. 1999. — Vol.52. -P. 14−26.
- Schlotterer C. Evolutionary dynamics of microsatellite DNA / C. Schlotterer // Chromosoma. 2000. — Vol. 109. — P. 365−371.
- Seed collection and seed quality of Larix sp. From Russia Initial Phase of Russian — Scandinavian Larch project / A.P. Abaimov et al. // Euras.J.Forest Res. — 2002.-Vol. 4.-P. 39−49.
- Semerikov V.L. Genetic relationship among Eurasian and American Larix species based on allozymes / V.L. Semerikov, M. Lascoux // Heredity.- 1999. -Vol. 83.- P.62−70.
- Semerikov V.L. Intra- and interspecific allozyme variability in Eurasian Larix Mill. Species. / V.L. Semerikov, L.F. Semerikov, M. Lascoux //Heredity. -1999.-Vol. 82.-P. 193−204.
- Semerikov V.L. Nuclear and cytoplasmic variation within and between Eurasian Larix (Pinaceae) species / V.L. Semerikov, M. Lascoux // Amer. J. Botany.- 2003.- Vol.90, N3. P. 1113−1123.
- Species-diagnostic markers in Larix spp. based on RAPDs and nuclear, cpDNA, and mtDNA gene sequences, and their phylogenetic implications / M.-C. Gros-Luis et al. // Tree Genet Genomes. 2005. — Vol.1. — P. 50−63.
- Stadler T. Ancient mitochondrial hyplotypes and evidence for intragenic recombination in a gynodioecious plant / T. Stadler, L.F. Delph // Proc.Natl. Acad. Sei. USA. 2002.- Vol. 99. -P. 11 730−11 735
- Study on natural population genetic structure of Larix olgensis Henry / H.-G. Zhang et al. // J. Northeast Forest. Univ. 1995. — Vol. 23, N 6. — P. 21−31.
- Szmidt A.E. Paternal inheritance of chloroplast DNA in Larix / A.E. Szmidt, T. Alden, J.E. Hallgren // Plant Molecular Biology. 1987. — Vol. 9. — P. 59−64.
- Takahata N. Extranuclear differentiation and gene flow in the finite island model / N. Takahata, S. R. Palumbi // Genetics. 1985. — Vol. 109 — P. 441157.
- Takei F. Distribution and management of Japanese larch / F. Takei // Ecology and management of Larix forests: a look ahead: Intern. Symp., Oct. 5−9, 1992, Whitefish, Montana, U.S.A.: Proc. Whitefish, 1995. — P. 58−65.
- The hidden side of invasions: massive introgression by local genes / M. Currat, M. Ruedi, R.J. Petit, L. Excoffier // Evolution. 2008. — Vol.62. — P. 19 081 920.
- The problems with hybrids: setting conservation guidelines / Allendorf R.G. et al. // Trends in Ecology and evolution. 2001. — Vol. 16, -№ 11. — P. 613−622.
- Timing the Eastern Asian Eastern North American floristic disjunction: molecular clock corroborates paleontological estimates / Q.-Y. Xiang et al. // Molecular Phylogenetic and Evolution. — 2000. — Vol. 15. — P. 462−472.
- Variation in chloroplast single-sequence repeats in Portuguese maritime pine (Pinus pinaster Ait.) / M.M. Ribeiro et al. // Theor. And Appl. Genet. 2001. -Vol.102.-P.97−103.
- Velichko A.A. The last glaciation of earth: size and volume of ice-sheets / A.A. Velichko, Y. M. Kononov, M.A. Faustova // Quaternary International. -1997.-Vol. 41−42.-P. 43−51.
- Vendramin G.G.Characterization and inheritance of polymorphic plastid microsatellites in Abies / G. G Vendramin, B. Ziegenhagen // Genome. 1997. -Vol. 40.-P. 857−864.
- Watano Y. Genetic structure of hybrid zones between Pinus pumila and P-parviflora var. Pentaphylla (Pinaceae) revealed by molecular hybrid index analysis / Y. Watano, I. Kanai, N Tani // Amer.J.Botany. 2004. — Vol. 91. — P. 65−72.
- Watano Y. Spatial distribution of cpDNA and MtDNA haplotypes in a hybrid zone between Pinus pumila and P. parviflora var. pentaphylla (Pinaceae) / Y. Watano, M. Imazu, T. Shimizu // Journal of Plant Research. 1996. — Vol. 109. -P. 403−408.
- Wei X.X. Recolonization and radiation in Larix (Pinaceae): evidence from nuclear ribosomal DNA paralogues / X.X. Wei, X.Q. Wang // Molecular Ecology. 2004a. — Vol. 13, N 10. — P. 3115−3123.
- Wei X.X. Evolution of 4-coumarate: coenzyme A ligase (4CL) gene and divergence of Larix (Pinaceae) / Wei X.X., X.Q. Wang // Molecular Phylogenetic Evolution. 20 046. — Vol. 31, N 2. — P. 542−553.
- Wei X.X. Phylogenetic split of Larix: evidence from paternally inherited cpDNA trnT-trnF region / X.X. Wei, X.Q. Wang // Plant Systematics and Evolution. 2003. — Vol. 239, N ½. -P.67−77.
- Weir B.S. Estimating F-statistic for the analysis of population structure / B.S. Weir, C.C. Cockerham // Evolution. 1984. — Vol. 38. — P. 1358−1370
- Ying L. The population structure of Larix laricina in New Brunswick, Canada / L. Ying, E.K. Morgenstern // Silvae genet. 1991. — Vol. 40, N 5/6. -P.180−184.
- Zhang X. Analysis of genetic structure in population of Larix kaempferi by chloroplast SSR markers / X. Zhang, S. Shiraishi, M. Huang // Yichuan. 2004. -Vol. 26. — P. 486−490.