Помощь в учёбе, очень быстро...
Работаем вместе до победы

Создание высокоспецифичных амплификационных тест-систем для детекции возбудителей туберкулеза, чумы, холеры, герпеса и гепатита A

ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Нужно отметить, что для Mycobacterium tuberculosis характерен медленный рост на питательных средах. Это не позволяет своевременно выявить у пациентов лекарственноустойчивые штаммы, в частности, штаммы, устойчивые к рифампицину — одному из ведущих противотуберкулезных препаратов. Возможной альтернативой остается определение мутаций, вызывающих устойчивость к лекарству. Для определения таких… Читать ещё >

Содержание

  • ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
    • 1. 1. ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ
      • 1. 1. 1. ФАКТОРЫ, ВЛИЯЮЩИЕ НА ЭФФЕКТИВНОСТЬ ПЦР
        • 1. 1. 1. 1. Структура и совместимость праймеров
        • 1. 1. 1. 2. Денатурация ДНК-матрицы
        • 1. 1. 1. 3. Температура отжига праймеров
        • 1. 1. 1. 4. Количество циклов амплификации
      • 1. 1. 2. ЗНАЧЕНИЕ ПЦР ПРИ ОПРЕДЕЛЕНИИ МУТАЦИЙ И АЛЛЕЛЬНЫХ ВАРИАНТОВ
        • 1. 1. 2. 1. Обзор методов детекции мутаций в ПЦР фрагментах
        • 1. 1. 2. 1. 1. Полный анализ нуклеотндной последовательности, проводимый с помощью ссквснированпн
        • 1. 1. 2. 1. 1.1. Определение нуклеотндной последовательности методом секвенирования по Сеигеру
        • 1. 1. 2. 1. 1.2. Секвеиироваиие, основанное на гибридизации.24 1.1.2.1.2. Методы, направленные на идентификацию огличий в нуклсотидпой последовательности или па определение избранных мутаций
        • 1. 1. 2. 1. 2.1. Конформационные методы
        • 1. 1. 2. 1. 2.1.1. Метод, основанный на локальном плавлениии ДНК
        • 1. 1. 2. 1. 2.1.2. Гетеродуплексный анализ
        • 1. 1. 2. 1. 2.1.3. Конформационно-чувствительньш электрофорез в агарозе
        • 1. 1. 2. 1. 2.1.4. Конформациопиый полиморфизм однонитевых фрагментов ДНК
        • 1. 1. 2. 1. 2.2. Лигазная цепная реакция
        • 1. 1. 2. 1. 2.3. Гибридизация и микрочипы
        • 1. 1. 2. 1. 2.4. Использование рестрикции для детекции мутаций
        • 1. 1. 2. 1. 2.5. Микросиквенс
        • 1. 1. 2. 1. 2.6. Использование белков, узнающих иекомплемеитариости
        • 1. 1. 2. 1. 2.7. Химическое расщепление некомтемеитариостеи
        • 1. 1. 2. 1. 2.8. Метод «молекулярныхмаяков» (Molecular beacons)
        • 1. 1. 2. 1. 2.9. Агчель-специфическая амплификация
      • 1. 1. 3. ПРЕИМУЩЕСТВА «ГНЕЗДОВОГО» МЕТОДА ПРОВЕДЕНИЯ ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ
    • 1. 2. АНАЛИЗ ГЕНА RPOB КАК МЕТОД ОПРЕДЕЛЕНИЯ УСТОЙЧИВОСТИ К РИФАМПИЦИНУ У MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS
    • 1. 3. ОПАСНОСТЬ ИНФИЦИРОВАНИЯ ВИРУСОМ ГЕРПЕСА И ЗНАЧЕНИЕ ЛАБОРАТОРНЫХ МЕТОДОВ В ЕГО ДИАГНОСТИКЕ
    • 1. 4. ПРИМЕНЕНИЕ ПЦР ДЛЯ ДЕТЕКЦИИ ВОЗБУДИТЕЛЯ ЧУМЫ
      • 1. 4. 1. АКТУАЛЬНОСТЬ ВЫЯВЛЕНИЯ ВОЗБУДИТЕЛЯ ЧУМЫ В УСЛОВИЯХ СОВРЕМЕННОГО ОБЩЕСТВА
      • 1. 4. 2. ВЫБОР ГЕНЕТИЧЕСКОЙ МИШЕНИ ДЛЯ ДЕТЕКЦИИ YERSINIA PESTIS
    • 1. 5. ХОЛЕРНЫЙ ЭНТЕРОТОКСИН КАК ФАКТОР ВИРУЛЕНТНОСТИ И МИШЕНЬ ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ
    • 1. 6. РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ ГЕПАТИТА, А И ЗНАЧЕНИЕ ПЦР В ЕГО ДИАГНОСТИКЕ
  • ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
    • 2. 1. БАКТЕРИАЛЬНЫЕ И ВИРУСНЫЕ ШТАММЫ, ПИТАТЕЛЬНЫЕ СРЕДЫ, ИСТОЧНИКИ КЛИНИЧЕСКИХ ОБРАЗЦОВ
    • 2. 2. ВЫДЕЛЕНИЕ ДНК И РНК
      • 2. 1. 2. 1. Выделение ДНК из м. tuberculosis
      • 2. 1. 2. 2. Выделение РНК вируса гепатита А
      • 2. 1. 2. 3. Выделение ДНК У. Pestis, V. choleraew вируса герпеса
    • 2. 3. ПРАЙМЕРЫ ДЛЯ ПЦР
    • 2. 4. ПРОВЕДЕНИЕ ПЦР И СОВМЕЩЕННЫХ РЕАКЦИЙ ОБРАТНОЙ ТРАНСКРИПЦИИ С ПЦР
    • 2. 5. СЕКВЕНИРОВАНИЕ ГЕНА RPOB MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS
    • 2. 6. АЛЛЕЛЬ-СПЕЦИФИЧЕСКАЯ АМПЛИФИКАЦИЯ
    • 2. 7. АНАЛИЗ КОНФОРМАЦИОННОГО ПОЛИМОРФИЗМА (SSCP)
  • ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
    • 3. 1. ОПРЕДЕЛЕНИЕ УСТОЙЧИВОСТИ К РИФАМПИЦИНУ У MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS
      • 3. 1. 1. ХАРАКТЕРИСТИКА СПЕКТРА МУТАЦИЙ, ОБУСЛАВЛИВАЮЩИХ УСТОЙЧИВОСТЬ К РИФАМПИЦИНУ
      • 3. 1. 2. РАЗРАБОТКА УПРОЩЕННОЙ МЕТОДИКИ ОПРЕДЕЛЕНИЯ МУТАЦИЙ УСТОЙЧИВОСТИ К РИФАМПИЦИНУ НА ОСНОВЕ КОНФОРМАЦИОННОГО ПОЛИМОРФИЗМА И АЛЛЕЛЬ-СПЕЦИФИЧЕСКОЙ АМПЛИФИКАЦИИ
      • 3. 1. 3. ВЫЯВЛЕНИЕ ЗНАЧИМОСТИ РЕДКИХ МУТАЦИЙ
      • 3. 1. 4. ВОЗМОЖНЫЕ ПУТИ РЕШЕНИЯ ПРОБЛЕМЫ ОПРЕДЕЛЕНИЯ МУТАЦИЙ В ПЦР-ПРОДУКТАХ
    • 3. 2. РАЗРАБОТКА ОПТИМАЛЬНЫХ УСЛОВИЙ ПРОВЕДЕНИЯ ПЦР ДЛЯ ДЕТЕКЦИИ ВОЗБУДИТЕЛЯ ЧУМЫ И ИСПЫТАНИЕ СОЗДАННОЙ ТЕСТ-СИСТЕМЫ НА КОЛЛЕКЦИОННЫХ ШТАММАХ
    • 3. 3. СОЗДАНИЕ ТЕСТ-СИСТЕМЫ НА ОСНОВЕ ГНЕЗДОВОЙ ПЦР ДЛЯ ДЕТЕКЦИИ ДНК VIBRIO CHOLERAE И ЕЕ ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ДЛЯ АНАЛИЗА ВИРУЛЕНТНОСТИ ВИБРИОНОВ
    • 3. 4. ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ГНЕЗДОВОЙ ПЦР ДЛЯ ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНОЙ ДИАГНОСТИКИ ВИРУСА ПРОСТОГО ГЕРПЕСА ЧЕЛОВЕКА I И II ТИПА (HSV И HSV2)
    • 3. 5. ИСПЫТАНИЕ ТЕСТ-СИСТЕМЫ НА ОСНОВЕ ПЦР ДЛЯ ДЕТЕКЦИИ РНК ВИРУСА ГЕПАТИТА А
  • ВЫВОДЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ Русскиа АТФ (англ. АТР) —аденозиптрифосфорная кислота ИФА иммуноферментный анализ МКК мопононуклеарные клетки крови ПЦР (англ. PCR) — полимеразная цепная реакция, А иглийскис, А аденин АТР аденозиптрифосфорная кислота BLAST Basic Local Alignment Search Tool (Базовый инструмент поиска сходства последовательностей, основанный на принципе локального сопоставления) bp пуклеотидпая пара-пара комплементарных пуклеотидов, находящихся напротив друг друга в двух цепях ДНК С цитозип CMV цитомегаловнрус u АТР дезоксиаденозинтрнфосфорпая кислота uCTP дезокснцитиднитрнфосфориая кислота UGTP — дезоксигуанозннтрнфосфорная кислота UTTP дезокситнмндинтрнфосфорная кислота EBV вирус Эшитейпа-Барра G гуанин HAV вирус гепатита, А HBV вирус гепатита В I1HV6 вирус герпеса типа VI HI V-1 — вирус иммунодефицита человека типа I HSV1 вирус простого герпеса человека I типа HSV2 вирус простого герпеса человека II типа HTLV-1 -Т-лимфотропный вирус человека типа I HZV вирус герпеса зостср NCBI National Center for Biotechnology Information (Государственный Центр Биотехнологической Информации, США) RT-PCR совмещенная реакция обратной транскрипции (ЯТ)и ПЦР (PCR) SDS додецплсульфат натрия SSCP single-strand conformation polymorphism (конформационный полиморфизм однонитевых фрагментов ДИК) Т-тимин

Создание высокоспецифичных амплификационных тест-систем для детекции возбудителей туберкулеза, чумы, холеры, герпеса и гепатита A (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

1. Актуальность проблемы.

Важнейшим элементом диагностики инфекционных болезней, бактерионосительства, санитарного контроля, экологического мониторинга окружающей среды является детекция инфекционного агента. Среди способов определения возбудителей главенствуют классический микробиологический и иммуноферментный методы. В последнее время в диагностике микрорганизмов применяют выявление специфического фрагмента нуклеотидной последовательности возбудителя, который можно идентифицировать, используя как индикатор его наличия, способность к воспроизведению in vitro в присутствии ДНК-полимеразы, праймеров и дезоксирибонуклеотидов. Этот процесс, подобный процессу естественной репликации хромосом и отличающийся от него исключительно быстрым экспоненциальным накоплением короткого фрагмента ДНК, называется полимеразной цепной реакцией (ПЦР) [104].

По чувствительности, быстроте, простоте и дешевизне ПЦР сопоставима с иммуноферментным анализом или даже превосходит его. В некоторых, случаях ПЦР оказывается предпочтительным пли единственно возможным методом детекции возбудителя.

Актуальность представленной диссертационной работы обусловлена необходимостью повышения достоверности, чувствительности и скорости выявления возбудителей. Вариант метода ПЦР, называемый nested или гнездовой ПЦР, нацелен на исключение ошибочных реультатов и обладает повышенной чувствительностью. Суть гнездовой ПЦР заключается в проведениии двух последовательных реакций, при которых исходным материалом для второй реакции является продукт (ампликон) первой [166]. Так обеспечивается двойной контроль результата анализа, практически исключающий вероятность ошибки. Кроме этого, гнездовая ПЦР обладает дополнительным преимуществом. Оно состоит в том, что при использовании аплель-специфических праймеров во время второй реакции гнездовой ПЦР, благодаря структурной простоте матрицы, становится возможным определение мутаций, удаленных от З'-конца праймера [114].

Создание новых методов тестирования, на наш взгляд, прежде всего необходимо для возбудителей пяти особо опасных или социально значимых инфекций — чумы, холеры, гепатита А, простого герпеса I и II типа (HSVI и HSVII), а также устойчивого к рифампицину Mycobacterium tuberculosis.

Например, выявление с помощью гнездовой ПЦР возбудителя чумы в тестируемом материале позволит своевременно применить экстренные меры профилактики и терапии [90].

Трудоемкость, длительность и относительно высокий риск ошибок при использовании на практике традиционного двухэтапного подхода, применяемого для обнаружения вирулентных штаммов Vibrio cholerae у больных, вибрионосителей, в объектах окружающей среды также делает гнездовую ПЦР предпочтительным методом анализа. В данном случае ПЦР позволяет идентифицировать возбудителя непосредственно в клиническом материале, прошедшем бактерицидную обработку, минуя стадию подращивания и клонирования этого опасного микроорганизма.

Нужно отметить, что для Mycobacterium tuberculosis характерен медленный рост на питательных средах. Это не позволяет своевременно выявить у пациентов лекарственноустойчивые штаммы, в частности, штаммы, устойчивые к рифампицину — одному из ведущих противотуберкулезных препаратов [173]. Возможной альтернативой остается определение мутаций, вызывающих устойчивость к лекарству. [8, 70, 146] Для определения таких мутаций необходим быстрый, недорогой и нетрудоемкий метод. В этом случае также может быть применена гнездовая ПЦР с использованием аллель-специфических праймеров, перекрывающих несколько мутантпых сайтов, дополненная методом конформационного полиморфизма ДНК (single-strand conformation polymorphism, SSCP).

Герпетическая инфекция человека — болезнь, дающая серьезные осложнения. При этом, патологические состояния, вызванные HSV I иHSV И, неодинаковы по своим проявлениям и последствиям [2]. ПЦР позволяет проводить дифференциальную диагностику HSV I и IISV II, а ее гнездовой вариант — исключить ошибки при анализах.

Результаты, полученные при детекции вируса гепатита, А в крови пациентов с помощью ИФА, требуют подтверждающего теста, который также может быть выполнен методом ПЦР.

Цель работы. Разработка и испытание методов гнездовой ПЦР и конформационного полиморфизма ДНК (SSCP) как инструментов детекции генов, специфичных для пяти возбудителей инфекционных болезней человека: чумы, холеры, туберкулеза, герпеса и вирусного гепатита А.

Задачи исследования.

1. Определить спектр мутаций устойчивости к рифампицину у штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих в России, и разработать упрощенный метод определения данных мутаций на основе сочетания аллель-специфической амплификации и SSCP.

2. Разработать чувствительный и специфичный метод комбинированной гнездовой ПЦР и обратной транскрипции для детекции РНК вируса гепатита А. Сопоставить результаты, полученные методами ИФА и гнездовой ПЦР при анализе форменных элементов крови и сывороток у больных гепатитом, А или смешанными формами гепатита.

3. Создать метод гнездовой ПЦР для дифференциальной диагностики вируса простого герпеса I и II типа и проверить его чувствительность и специфичность. Получить данные о распределении I и II типа вируса между различными клиническими группами больных и между различными типами материала, полученного от больных и носителей.

4. Разработать гнездовую ПЦР, направленную на непосредственную идентификацию гена, кодирующего факторвирулентности (энтеротоксин) V. cholerae, у больных, вибрионосителей и в окружающей среде.

5. Разработать метод гнездовой ПЦР для определения У. pestis, не дающий перекрестных реакций с У. enterocolitica и У. pseudotuberculosis.

Научная новизна. Научно обоснованы и апробированы методы гнездовой ПЦР с коллекционными штаммами yersinia pestis, Vibrio cholerae, рифампицин-резистентного Mycobacterium tuberculosis, IISV I и HSV II и вируса гепатита А, а также с образцами материала, инфицированного этими микроорганизмами.

Впервые определен спектр мутаций устойчивости к рифампицину в российских штаммах М tuberculosis. При этом было зарегистрировано необычно высокое относительное количество мутаций в кодоне 516 гена гроВ и была открыта новая, не описанная в литературе двойная мутация.

Показано, что при идентификации точечных мутаций с помощью аллель-специфического праймера возможно определение единичных нуклеотидных замен, удаленных от 3'-конца праймера.

Создан оригинальный метод комбинированной аплель-специфической амплификации и SSCP, при котором единственный аллель-специфический праймер в одном эксперименте способен выявлять любую из шести мутаций, а в едином опыте SSCP можно выявлять любую из пяти других мутаций. Аналогичные подходы могут найти применение на других моделях.

Методом гнездовой ПЦР с обратной транскрипцией получены экспериментальные данные, касающиеся ассоциации вируса гепатита, А с мононуклеарными клетками крови, что расширяет возможности выявления этого вируса у человека в случае отрицательного результата при анализе сыворотки пациента.

Выявлена более высокая способность HSVI проникать в различные органы и ткани, сравнительно с HSVII.

Практическая значимость работы. Разработка быстрого, экономичного метода определения устойчивости к рифампицину в культурах M. tuberculosis, выделенных от больных, позволяет применять адекватные подходы к лечению больных. Метод обеспечивает значительное сокращение срока анализа, если в качестве исходного материала используют чистые культуры возбудителя, выращенные на питательной среде, поскольку отпадает необходимость пересева этих культур на среду, содержащую рифампицин, и последующего ожидания результата в течение нескольких недель или месяцев.

Созданные методы гнездовой ГТЦР позволяют повысить достоверность и чувствительность выявления Y. pestis, V. cholerae, HSV! и HSVII, вируса гепатита, А в инфицированном материале различного происхождения. Этот метод позволяет проводить анализы с ипактивированпьиш возбудителями, не представляющими угрозы для здоровья человека, что очень важно при работе с возбудителями особо опасных инфекций. При этом сокращаются сроки выполнения анализов.

В случае V. cholerae выбор непосредственного фактора вирулентности как мишени для амплификации выгодно отличает разработанный нами подход от применяемых в настоящее время иммуноферментных и микробиологических тестов, имеющих косвенный характер.

Обнаружено, что, в отличие от мазков из урогенитального тракта и клеточного материала мочи, соскобы из урогенитального тракта дают наиболее полную и объективную информацию о совместном присутствии вирусов HSV I и HSV II у больных с диагнозом «герпетическая инфекция».

Высокая чувствительность метода гнездовой ПЦР позволяет проводить поиск возможной аккумуляции вируса гепатита, А во фракции мононуклеарных клеток крови при отсутствии возбудителя в сыворотках.

В случае гепатита, А и герпеса практическая ценность разработанных методов, в значительной мере, заключается в возможности использовать их как дополнительный тест, подтверждающий результаты ИФА.

Положения, выносимые на защиту.

1. Разработан оригинальный метод детекции мутаций устойчивости к рифампицину у Mycobacterium tuberculosis с применением подходов, не предполагающих секвенирования ДНК.

2. Созданы методы гнездовой ПЦР, имеющие преимущества сравнительно с одноступенчатой ПЦР, для тестирования возбудителей простого герпеса I и II типа, холеры, чумы и гепатита А.

3. Гнездовая ПЦР может быть использована при лабораторной диагностике для обнаружения в клиническом материале РНК вируса гепатита А, ДНК вирусов герпеса и возбудителя холеры.

ВЫВОДЫ.

1. Определен спектр мутаций устойчивости к рпфамницину в штаммах Л/. tuberculosis, циркулирующих у больных в России. Разработан упрошенный вариант метода детекции мутаций устойчивости к рифампицину путем комбинированного применения аллель-специфичной амплификации и SSCP.

2. Показана возможность применения аллель-специфической амплификации для определения нуклеотидных замен, удаленных от З'-конца праймера.

3. Продемонстрирована высокая чувствительность и специфичность гнездового метода ПЦР при детекции возбудителей простого герпеса человека I и II типа, холеры, чумы и гепатита А. Показаны его преимущества по сравнению с одноступенчатой ПЦР.

4. Показана эффективность применения гнездовой ПЦР для обнаружения ДНК вирусов герпеса и бактерий холеры, а также PIIK вируса гепатита, А в клиническом материале, что свидетельствует о целесообразности использования гнездовой ПЦР в лабораторной диагностике.

5. Установлена способность вируса гепатита, А накапливаться во фракции монопуклеарных клеток крови, что позволяет расширить возможности его обнаружения в крови.

Показать весь текст

Список литературы

  1. И.Ф., Шубладзс А. К., Каспаров А. А., Гребешок В. Н. Герпес: этиология, диагностика, лечение// 1986, Медицина, Москва.
  2. А.Ф., Кицак В. Я., Бочаров Е. Ф., Трухачсв А. А. Вирус простого герпеса // 1982, Наука, Новосибирск.
  3. Э.В., Альтшулср М. Л., Говорун В. М., Лопухин Ю.М., Голышевская
  4. B.И., Черноусова Л. Н., Хоменко А. Г. Детекция и характеристика мутаций в гене гроВ резистентных к рифампицину клинических штаммов М. tuberculosis // 1999, Проблемы туберкулеза, 7:39−42.
  5. Е.И., Куш А.А. РНК вируса гепатита С у пациентов с диагнозом «вирусный гепатит С» // 2002, Вопросы вирусологии, 47:4−11.
  6. Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Молекулярное клонирование // 1984, Мир, Москва.
  7. В.И., Поздеев O.K. (ред.). Медицинская микробиология // 1999, ГЭОТАР-МЕД, Москва.
  8. Е.С., Николаев А. Я. Биохимия // 2001, ГЭОТАР-МЕД, Москва.
  9. Г., Кэлиндер Р. Молекулярная генетика //1981, Мир, Москва.
  10. И.Л., Радуто О. И. Вирусные гепатиты в России: официальная статистика и экономические потерн//2001, Вакцинация. Новости вакцинопрофплактпкп, № 6 (18):5−10.
  11. Amor M, Parker KL, Globcrman H, New Ml, White PC. Mutation in the CYP21B gene (iIel72-to-asn) causes steroid 21-hydroxylase deficiency // 1988, PNAS, 85:1600−1604.
  12. Applied Biosystems. 3730/3730×1 DNA analyzers//2004,http:/AvAvw.wtcrf.ed.ac./genetics/433 1467b.pdf
  13. Baklouti F, Giraud Y, Francina A, Richard G, Perier C, Geyssant A, Jaubert J, Brizard
  14. C, Dclaunay J. Hemoglobin Grange-Blanche beta 27(B9) Ala—Val., a new variant with normal expression and increased affinity for oxygen // 1987, FEBS Lett, 223:5962.
  15. Babon JJ, McKcnzie M, Cotton RG. The use of resolvascs T4 cndonuclease VII and T7 endonuclease I in mutation detection // 2003, Mol Biotechnol, 23:73−81.
  16. Barany F. The Ligase chain reaction in a PCR world //1991, PCR Methods and Applic, 1:5−16.
  17. Barbosa GHTS, Santanal EM, Almeida AMP, Araujo AM, Fatibcllo-Filho O, Carvalho LB, Jr. The use of filter paper plasticized with polyvinyl alcohol-glutaraldchyde in ELISA II2000, Braz J Med Biol Res, 33: 823−827.
  18. Bassam BJ, Caetano-Anolles G, GressholTPM. Fast and sensitive silver staining of DNA in Polyacrylamide gels//1991, Anal Biochem, 198:217−220.
  19. Bi LJ, Zhou YF, Zhang XE, Deng JY, Zhang ZP, Xie B, Zhang CG. A MutS-based protein chip for detection of DNA mutations // 2003, Anal Chem, 75:4113−4119.
  20. Blouquit Y, Bardakdjian J, Lena-Russo D, Arous N, Pcrrimond II, Orsini A, Rosa J, Galacteros F. HB Bruxellcs: beta-41 or 42(C7 or CDl) phe deleted // 1989, Hemoglobin, 13:465−474.
  21. Boom R, Sol CJ, Salimans MM, Jansen CL, Wortheim-van Dillen PM, van der Noordaa J. Rapid and simple method for purification of nucleic acids // 1990, J Clin Microbiol, 28:495−503.
  22. Bottaro M, Berti E, Biondi A, Migone N, Crosti L. Hctcroduplex analysis of T-ccll receptor y gene rearrangements for diagnosis and monitoring of cutaneous T-cell lymphomas // 1994, Blood, 83:3271−3278.
  23. Bradley RD, Ilillis DM. Recombinant DNA sequences generated by PCR amplification //1997, Mol Biol Evol, 14:592−593.
  24. Brcnnan SO, Williamson D, Symmans WA, Carrell RW. Two unstable hemoglobins in one individual: Hb Atlanta (beta 75 Leu leads to Pro) and Hb Coventry (beta 141 Leu deleted)// 1983, Hemoglobin, 7:303−312.
  25. Bunce M, Young NT, Welsh KI. Molecular HLA typing the brave new world // 1997, Transplantation, 64:1505−1513.
  26. Burke JF (ed.). PCR: Essential techniques // 1996, Wiley, New York-London-Amstcrdam-Sydney.
  27. Butler T. Plague and other Yersinia infections // 1983, In «Current Topics in Infectious Diseases», W.B. Greenough and T.S. Mcrigan (eds), Plenum Press, New York.
  28. Canetti G, Froman S, Grossctt A. Mycobacteria: Methods for testing drug sensitivity and resistance // 1963, J Bull Wld Health Org, 29:565−579.
  29. Caugant DA, Sandven P, Eng J, Jeque JT, Tonjum T. Detection of rifampin resistance among isolates of Mycobacterium tuberculosis from Mozambique // 1995, Microb Drug Resist, 1:321−326.
  30. Cha RS, Zarbi H, Keohavong P, Thilly WG. Mismatch amplification mutation assay (MAMA) // 1992, PCR methods applic, 2:14−20.
  31. Chang HL, Zaroukian MH, Esselman WJ. T200 alternate exon use in murine lymphoid cells determined by reverse transcription-polymerase chain reaction // 1989, J Immunol, 143:315−321.
  32. Chantcau S, Rahalison L, Ralafiarisoa L, Foulon J, Ratsitorahina M, Ratsifasoamanana L, Carniel E, Nato F. Development and testing of a rapid diagnostic test for bubonic and pneumonic plague// 2003, Lancet, 361:211−216.
  33. Chiou S-H, Hu M-C, Chung B. A misscnse mutation at ilcl72-to-asn or arg356-to-trp causes steroid 21-hydroxylase deficiency // 1990, J Biol Chem, 265:3549−3552.
  34. Chomszynski P, Sacchi N. Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanatc-phcnol-cloroform extraction// 1987, Anal Biochem, 162:156−159.
  35. Chung H, Jaykus L-A, Sobsey MD. Detection of human enteric viruses in oysters by in vivo and in vitro amplification of nucleic acids // 1996, Appl Environment Microbiol, 62:3772−3778.
  36. Cooksley G. Hepatitis disease management-integrating prevention, diagnostics and therapeutics // 2002, Proceedings of the 10th International Congress on Infectious Diseases, Singapore, CTp. 34.
  37. Cooper KL, Gocring RV. Development of a universal probe for electronic microarray and its application in characterization of the Staphylococcus aureus polC gene // 2003, J Mol Diagn, 5:28−33.
  38. Corso D, Cognata B, Ciaccio C, Piazza T, Dibcncdctto SP, Samperi P, Russo Mancuso G, Schiliro G. Hb Agenogi beta 90(F6)Glu—Lys. and beta zero-thalassemia in a Sicilian family // 1990, Hemoglobin, 14:549−553.
  39. Costa-Mattioli M, Di Napoli A, Fcrre V, Billaudel S, Perez-BercolTR, Cristina J. Genetic variability of hepatitis A virus//2003, J Gen Virol, 84:3191−3201.
  40. Cotton RG, Rodrigues NR, Campbell RD. Reactivity of cytosine and thymine in singlc-base-pair mismatches with hydroxylamine and osmium tetroxide and its application to the study of mutations // 1988, PNAS, 85:4397−4401.
  41. Coyle PV, Jain S, Wyatt D, McCaughey C, O’Neill HJ. Description of a nonlcthal herpes simplex virus type 1 glycoprotein D deletion mutant affecting a site frequently used for PCR // 2000, Clin Diagn Lab Immunol, 7:322−324.
  42. Covne VE, James MD, Reid SJ, Rybicki EP. Molecular Biology Tcchniqucs Manual (3T ed). Polymerase chain reaction //1998, http://www.mcb.uct.ac.za/manual/MolBiolManual.htm
  43. Cuthbcrt JA. Hepatitis A: old and new//2001, Clinical Microbiol Rev, 14:38−58.
  44. Dallas WS, Falkow S. Amino acid sequence homology between cholera toxin and Escherichia coli heat-labile toxin // 1980, Nature, 288:499−501.
  45. Di Pinto A, Fortev T, Tantillo GM, Terio V, Buonavoglia C. Detection of hepatitis A virus in shellfish (Mytilus galloprovincialis) with RT-PCR // 2003, Food Prot, 66:1681−1685.
  46. Dutton C, Sommer SS. Simultaneous detection of multiple single-base alleles at a polymorphic site//1991, Biotechniques, 11:700−702.
  47. Feodorova VA, Devdariani ZL. Development, characterisation and diagnostic application of monoclonal antibodies against Yersinia pestis fibrinolysin and coagulase // 2000, J Med Microbiol, 49:261−269.
  48. Genes and Disease. Nutritional and metabolic diseases. Diabetes, type 1 // 2004, http://www.ncbi.nIm.nih.gov/books/
  49. Gill P. Application of low copy number DNA profiling // 2001, Croat Med J, 42:22 932.
  50. Globerman II, Amor H, Parker KL, New MI, White PC. A nonsense mutation causing steroid 21-hydroxylase deficiency // 1988, J Clin Invest, 82:139−144.
  51. Gurgey A, Sipahioglu M, Aksoy M. Compound heterozygosity for Hb E-Saskatoon or bcta22(B4)glu-to-lys and bcta-thalassemia type IVS-I-6 (T-to-C) // 1990, Hemoglobin, 14:449−451.
  52. Helmberg A, Tusie-Luna MT, Tabarelli M, Koller R, White PC. R339H and P453S: CYP21 mutations associated with nonclassic steroid 21-hydroxylase deficiency that are not apparent gene conversions // 1992, Molec Endocr, 6:1318−1322.
  53. Henegarin O. PCR and Multiplex PCR Guide//1997,http://info.med.yale.edu/genetics/ward/tavi/guide.html
  54. Higashi Y, Tanae A, Inoue II, Fujii-Kuriyama Y. Evidence for frequent gene conversion in the steroid 21-hydroxylase P-450(C21) gene: implications for steroid 21-hydroxylase deficiency // 1988, Am J Hum Genet, 42:17−25.
  55. Higashi Y, Tanac A, Inoue 11, Iliromasa T, Fujii-Kuriyama Y. Aberrant splicing and niissense mutations cause steroid 21-hydroxylase (P-450C21.) deficiency in humans: possible gene conversion products // 1988, PNAS, 85:7486−7490.
  56. Higgins JA, Ezzell J, Hinnebusch BJ, Shipley M, Ilenchal EA, Ibrahim MS. 5' nuclease PCR assay to detect Yersinia pestis // 1998, J Clin Microbiol, 36:2284−2288.
  57. Ho SK, Chan TM. An overview of assays for serum HBV DNA // 2000, Clin Lab, 46:609−614.
  58. Hongyo T, Buzard GS, Calvert RJ, Weghorst CM. 'Cold SSCP': a simple, rapid and non-radioactive method for optimized single-strand conformation polymorphism analyses // 1993, Nucleic Acids Res, 21:3637−42.
  59. Hopmeier P, Binder C, Gadner H, Fischer M. A case of the unstable Hb Genova (beta 28 Leu—Pro) in an Arab child associated with severe haemolytic anaemia and growth retardation // 1990, Acta Haematol, 83:39−41.
  60. Hovig E, Smith-Sorensen B, Brogger A, Borresen A-L. Constant denaturant gel electrophoresis, a modificatuion of denaturing gel electrophoresis, in mutation detection //1991, Mutat Res, 262:63−71.
  61. Hunt M. Real-time PCR// 2004, http://www.med.sc.edu:85/pcr/realtimc-homc.html.
  62. Hunt JM, Roberts GD, Stockman L, Felmlee TA, Persing DH. Detection of a genetic locus encoding resistance to rifampin in mycobacterial cultures and in clinical specimens // 1994, Diagn Microbiol Infcct Dis, 18:219−227.
  63. Igbal SS, Chambers JP, Goodc MT, Valdes JJ, Brubaker RR. Detection of Yersinia pestis by pesticin fluorogenic probe-couplcd PCR// 2000, Mol Cell Probes, 14:109 114.
  64. Inganas M, Byding S, Eckersten A, Eriksson S, Hultman T, Jorsback A, Lofman E, Sabounchi F, Kressner U, Lindmark G, Tooke N. Enzymatic mutation detection in the P53 gene // 2000, Clin Chem., 46:1562−1573.
  65. Innogcnctics, Inno-Lipa Rif. TB // 2004, http://www.innogenetics.bc/site/diagnostics.html
  66. Isolation of genomic DNA from bacteria// 1998, http://lyco-lycoming.edu/-newman
  67. Jenkins FJ. Basic methods for the detection of PCR products // 1994, PCR Methods Applic, 3: S77-S82.
  68. Judo MSB, Wedel AB, Wilson C. Stimulation and suppression of PCR-mediated recombination// 1998, Nucl Acids Res, 26:1819−1825.
  69. Kahn SM, Jiang TA, Culbertson IB, Weistein GM, Tomita N, Ronai Z. Rapid and sensitive nonradioactive detection of mutant K-ras genes via «enriched» PCR amplification//1991, Oncogene, 6:1079−1083.
  70. Kirby-Keyser L, Porter CC, Donohoue PA. E380D: a novel point mutation of CYP21 in an HLA-homozygous patient with salt-losing congenital adrenal hyperplasia due to 21-hydroxylase deficiency// 1997, Hum Mutat, 9:181−182.
  71. Kobayashi S, Nara T, Nakano Y, Fukazawa H, Kawamura G, Kitajima II, Sugita M, Joh K, Ohba Y, Hattori Y. Hemoglobin Burke: an unstable hemoglobin rarely associated with hemolytic episodes// 1986, Hemoglobin, 10:661−666.
  72. Koos RD, Seidel RH. Detection of acidic fibroblast growth factor mRNA in the rat ovary using reverse transcription-polymerase chain reaction amplification // 1989, Biochem Biophys Res Commun, 165:82−88.
  73. Kosaki R, Nakamura T, Higaki S, Yamamoto S, Inoue Y, Hayashi K, Shimomura Y, Tano Y. The use of competitive PCR for quantitation of HSV-1 DNA // 2003, Jpn J Ophthalmol, 47:240−245.
  74. Kulichenko AN, Norkina OV, Gintsburg AL, Popov Iu. A, Ddrozdov IG. Improvement of a method for detecting of strains of the plague microbe using polymerase chain reaction // 1994, Genetica, 30:167−171.
  75. Kuppuswamy MN, Hoffmann JW, Kasper CK, Spitzer SG, Groce SL, Bajaj SP. Single nucleotide primer extension to detect genetic diseases: Experimental application to hemophilia B (factor IX) and cystic fibrosis genes //1991, PNAS, 88:1143−1147.
  76. Kwok S, Sheng-Yung C, Sninsky JJ, Wang A. A guide to the design and use of mismatched and degenerate primers //1994, PCR methods and applic, manual supplement, 3: S39-S47.
  77. Lajic S, Clauin S, Robins T, Vcxiau P, Blanche H, Bcllanne-Chantelot C, Wedell A. Novel mutations in CYP21 detected in individuals with hyperandrogenism II2002, J Clin Endocr Metab, 87:2824−2829.
  78. Landin B, Berglund S, Wallman K. Two different mutations in codon 97 of the bcta-globin gene cause Hb Malmo in Sweden // 1996, Am J Hematol, 51:32−36.
  79. Lederberg J, Shope RE, Oaks SC, Jr. (eds). Emerging Infections // 1992, National Academy Press, Washington, D.C.
  80. Lee HH. Ligase chain reaction // 1996, Biologicals, 24:197−199.
  81. Maniatis A, Bousios T, Nagcl RL, Balazs T, Ucda Y, Bookchin RM, Maniatis GM. Hemoglobin Crete (beta 129 ala leads to pro): a new high-affinity variant interacting with beta o -and delta beta o -thalassemia // 1979, Blood, 54:54−63.
  82. Maniatis T, Fritsch EE, Sambrook J. Molecular cloning. A laboratory manual // 2001, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor.
  83. Marinucci M, Giuliani A, Maffi D, Massa A, Giampaolo A, Mavilio F, Zannotti M, Tentori L. Hemoglobin bologna (alpha 2 beta 2 61 (E5) lys replaced by met). An abnormal human hemoglobin with low oxygen affinity // 1981, Biochim Biophys Acta, 668:209−15.
  84. Marras SA, Kramer FR, Tyagi S. Multiplex detection of single nucleotide variations using molecular beacons//1999, Genet Anal, 14:151−156.
  85. Matsiota-Bemard P, Vrioni G, Marinis EJ. Characterization of rpoB mutations in rifampin-resistant clinical Mycobacterium tuberculosis isolates from Greece // 1998, J Clin Microbiol, 36:20−23.
  86. Mekalanos JJ. Cholera toxin: genetic analysis, regulation, and role in pathogenesis // 1985, Curr Top Microbiol Immunol, 118:97−118.
  87. Melanitou E, Fain P, Eisenbarth GS. Genetics of type 1A (immune mediated) diabetes // 2003, J Autoimmun, 21:93−98.
  88. Meyerhans A, Vartanian JP, Wain-Hobson S. DNA recombination during PCR // 1990, Nucleic Acids Res, 18:1687−1691.
  89. Miller DR, Wilson JB, Kutlar A, Huisman TH. Hb Bicctre or alpha 2 beta (2)63(E7)His—Pro in a white male: clinical observations over a period of 25 years// 1986, Am J Hematol, 21:209−214.
  90. Monteiro L, Bonnemaison D, Vekris A. Complex polysaccharides as PCR inhibitors in feces: Helycobacter pylori model // 1997, J Clin Microbiol, 35:995−998.
  91. Mullis KB, Ferre F, Gibbs RA (eds). The Polymerase Chain Reaction // 1994, Birkhauser, Boston.
  92. Mullis KB, Faloona FA. Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction //1987, Methods Enzymol, 155:335−350.
  93. Nachamkin I, Kang C, Weinstein MP. Detection of resistance to isoniazid, rifampin, and streptomycin in clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis by molecular methods // 1997, Clin Infect Dis, 24:894−900.
  94. Nash KA, Gaytan A, lnderlied CD. Detection of rifampin resistance in Mycobacterium tuberculosis by use of a rapid, simple, and specific RNA/RNA mismatch assay // 1997, J Infect Dis, 176:533−536.
  95. Negri Aijona S, Maldonado Eloy-Garcia J, Molchanova TP, Wilson JB, Gu L-H, Huisman THJ. Hb Brockton (beta-138 (HI6) ala-to-pro) observed in a Spanish girl // 1992, Hemoglobin, 16:511−514.
  96. Newton CR, Graham A, Heptinstall LE. Analysis of any point mutation in DNA. The amplification refractory mutation system (ARMS) // 1989, Nucleic Acids Res, 17:2503−2516.
  97. Ohlsson G, Muller J, Schwartz M. Gcnetic diagnosis of 21-hydroxylase deficiency: DGGE based mutation scanning of Cyp21 // 1999, Human Mutation, 13:385−389.
  98. Orita M, Iwahana H, Kanazawa H, Hayashi K, Sekiya T. Detection of polymorphisms of human DNA by gel electrophoresis as single-strand conformation polymorphism // 1989, PNAS, 86:2766−2770.
  99. Owerbach D, Sherman L, Ballard A-L, Azziz R. Pro453-to-ser mutation in CYP21 is associated with nonclassic steroid 21-hydroxylase deficiency // 1992, Molec Endocr, 6:1211−1215.
  100. Pastinen T, Partanen J, Syvanen AC. Multiplex, fluorescent, solid-phase minisequencing for efficient screening of DNA sequence variation// 1996, Clin Chem, 42:1391−1397.
  101. Patrushev LI, Zykova ES, Kayushin AL, Korosteleva MD, Miroshnikov AI, Bokarew IN, Leont’ev SG, Koshkin VM, Severin ES. New DNA diagnostic system for detection of factor V Leiden // 1998, Thromb Res, 92:251−259.
  102. Pease AC, Soles D, Sullivan EJ, Cronin MT, Holmes CP, Fodor SP. Lightgenerated oligonucleotide arrays for rapid DNA sequence analysis // 1994, PNAS, 91:5022−5026.
  103. Prctorius GS, Sirgel FA, Schaaf IIS, van Ilelden PD, Victor TC. Rifampicin resistance in Mycobacterium tuberculosis — rapid detection and implications in chemotherapy// 1996, S Afr Med J, 86:50−55.
  104. Prevention of Hepatitis A through Active or Passive Immunization // 1999, Morbidity and Mortality Weekly Report, Centers for Desease Control and Prevention, Atlanta, USA, 48:1−12.
  105. Prezioso VR. General Notes on Primer Design in PCR // 2004, http://www.brinkmann.com/PCRapplprimer.asp
  106. Rahalison L, Vololonirina E, Ratsitorahina M, Chanteau S. Diagnosis of bubonic plague by PCR in Madagascar under field conditions // 2000, J Clin Microbiol, 38:260−263.
  107. Rahbar S, Feagler RJ, Beutler E. Hemoglobin Hammersmith (beta 42 (CD1) Phe replaced by Ser) associated with severe hemolytic anemia//1981, Hemoglobin, 5:97−105.
  108. Rappuoli R, Pizza M, Douce G, Dougan G. Structure and mucosal adjuvanticity of cholera and Escherichia coli heat-labile enterotoxin // 1999, Immunol Today, 20:493−500.
  109. Ridanpaa M, Burvall K, Zhang LH, Husgafvcl-Pursiaincn K, Onfclt A. Comparison of DGGE and CDGE in detecton of single base changes in the hamster hprt and human N-ras genes // 1995, Mutat Res, 334:357−364.
  110. Rinder H, Dobner P, Fcldmann K, Rifai M, Bretzel G, Rusch-Gcrdes S, Loscher T. Disequilibria in the distribution of rpoB alleles in rifampicin-resistant M. tuberculosis isolates from Germany and Sierra Leone. // 1997, Microb Drug Resist, 3:195−7.
  111. Romero C, Fernandez Fuertes I, Quintana A, Blanco L, Navarro JL, Wilson JB, Huisman TH. Hb G-Szuhu or alpha 2 beta 2(80)(EF4)Asn-—Lys, in combination with beta zero-thalassemia in a Spanish family // 1985, Hemoglobin, 9:535−539.
  112. Safrin S, Shaw H, Bolan G, Cuan J, Chiang CS. Comparison of virus culture and the polymerase chain reaction for diagnosis of mucocutaneous herpes simplex virus infection // 1997, Sex Transm Dis, 24:176−80.
  113. Saiki RK, Scharf S, Faloona F, Mullis KB, Horn GT, Erlich HA, Arnheim N. Enzymatic amplificatioon of ?-globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sickle cell anemia// 1985, Science, 230:1350−1354.
  114. Sanger F, Nicklcn S, Coulson AR. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors // 1977, PN AS, 74:5463−5467.
  115. Sanguinetti CJ, Neto ED, Simpson AJG. Rapid silver stainining and recovery of PCR products separated on Polyacrylamide gels // 1994, Biotechniques, 17:915 918.
  116. Schachter J. DFA, E1A, PCR, LCR and other technologies: what tests should be used for diagnosis of chlamydia infections? // 1997, Immunol Invest, 26:157−161.
  117. Schlor S, Riedl S, Bla? J, Reidl J. Genetic Rearrangements of the Regions Adjacent to Genes Encoding Heat-Labile Enterotoxins (eltAB) of Enterotoxigenic Escherichia coli Strains // 2000, Appl Environ Microbiol, 66:352−358.
  118. Sheorey H, Waters MJ. Viral hepatitis? Which test should I order? // 2001, Aust Fam Physician, 30:433−437.
  119. Sherman DR, Mdluli K, Hickey MJ. // 1996, Science, 272:1641−1643.
  120. Speiser PW, New MI, White PC. Molecular genetic analysis of nonclassic steroid 21-hydroxylase deficiency associated with HLA-B14,DR1 // 1988, New Eng J Med, 319:19−23.
  121. Stickney HL, Schmutz J, Woods IG, Holtzer CC, Dickson MC, Kelly PD, Myers RM, Talbot WS. Rapid mapping of zebrafish mutations w ith SNPs and oligonucleotide microarrays // 2002, Genome Res, 12:1929−1934.
  122. Savov A, Angelicheva D, Jordanova A, Eigel A, Kalaydjieva L. High percentage acrylamide gels improve resolution in SSCP analysis // 1992, Nucleic Acids Res, 20:6741−6742.
  123. Stamm WE, Handsfield IUI. The association between genital ulcer disesase and acquisition of HIV infection in homosexual men // 1988, JAMA, 260:1429−1433.
  124. Su X, Robelek R, Wu Y, Wang G, Knoll W. Detection of point mutation and insertion mutations in DNA using a quartz crystal microbalance and MutS, a mismatch binding protein // 2004, Anal Chem, 76:489−494.
  125. Suzuki Y, Katsukawa C, Inoue K, Yin Y, Tasaka H, Ueba N, Makino M. Mutations in rpoB gene of rifampicin resistant clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis in Japan // 1995, Kansenshogaku Zasshi, 69:413−419.
  126. Tanaka Y, Yazawa K, Dabbs ER, Nishikawa K, Komaki H, Mikami Y, Miyaji M, Morisaki N, Ivvasaki S. Different rifampicin inactivation mechanisms in Nocardia and related taxa //1996, Microbiol Immunol, 40:1−4.
  127. Taniguchi H, Aramaki H, Nikaido Y, Mizuguchi Y, Nakamura M, Koga T, Yoshida S. Rifampicin resistance and mutation of the rpoB gene in Mycobacterium tuberculosis// 1996, FEMS Microbiol Lett, 144:103−108.
  128. Taylor GR (ed.). Laboratory methods for the detection of mutations and polymorphisms in DNA // 1997, CRC Press, New-York London.
  129. Tclenti A, Imboden P, Marchesi F, Lowrie D, Cole S, Colston MJ, Matter L, Schopfer K, Bodmer T. Detection of rifampicin-resistant mutations in Mycobacterium tuberculosis// 1993, Lancet, 341:647−650.
  130. Tiesman J, Rizzino A. Expression and developmental regulation of the k-FGF oncogene in human and murine embryonal carcinoma cells // 1989, In Vitro Cell Dev Biol, 25:1193−1198.
  131. Trebesius K, Harmsen D, Rakin A, Schmelz J, Heesemann J. Development of rRNA-targeted PCR and in situ hybridization with fluorescently labelled oligonucleotides for detection of Yersinia species // 1998, J Clin Microbiol, 36:25 572 564.
  132. Tusie-Luna M-T, Speiser PW, Dumic M, New MI, White PC. A mutation (pro30-to-leu) in CYP21 represents a potential nonclassic steroid 21-hydroxylase deficiency allele //1991, Molec Endocr, 5:685−692.
  133. Tusie-Luna M-T, Traktman P, White PC. Determination of functional effects of mutations in the steroid 21-hydroxylase gene (CYP21) using recombinant vaccinia virus // 1990, J Biol Chem, 265:20 916−20 922.
  134. UgozzoH L, Wallace RB. Allele-specific polymerase chain reaction //1991, Methods: A companion to methods in enzymol, 2:42−48.
  135. Waldor MK, Mekalanos JJ. Lysogenic Conversion by a Filamentous Phage Encoding Cholera Toxin// 1996, Science, 272:1910−1914.
  136. Walker L, McFarlanc A, Patterson M, Eng B, Wayc JS. Hb Castilla bcta-32(B14)leu-to-arg. caused by a de novo mutation // 2003, Hemoglobin, 27:253−256.
  137. Walsh PS, Erlich HA, Iliguchi R. Preferential PCR amplification of alleles: Mechanisms and solutions // 1992, PCR Methods Applic, 1:241−250.
  138. Wang NY, Liaw GJ, Weng LC, Chiu YY, Huang FY, Yang DL, Chiang CS. Rapid detection of herpes simplex virus by polymerase chain reaction // 1999, J Microbiol Immunol Infect, 32:99−104.
  139. Wang LF, Rakela Y, Laskus T. Head-to-tail primer tandem repeats // 1997, Mol Cell Probes, 5:385−387.
  140. Wawcr K, Ruggebcrg H, Meyer G, Muyzer G. A simple and rapid electrophoresis method to detect sequence variation in PCR-amplified DNA fragments // 1995, Nucleic Acids Res, 23:4928−4929.
  141. Wedell A, Luthman H. Steroid 21-hydroxylase deficiency: two additional mutations in salt-wasting disease and rapid screening of disease-causing mutations // 1993, Hum Molec Genet, 2:499−504.
  142. Wedell A, Ritzen EM, Haglund-Stengler B, Luthman II. Steroid 21-hydroxylase deficiency: three additional mutated alleles and establishment of phenotype-genotype relationships of common mutations // 1992, PNAS, 89:72 327 236.
  143. Welkos SL, Friedlander AM, Davis KJ. Studies on the role of plasminogen activator in systemic infection by virulent Yersinia pestis strain C092 // 1997, Microb Pathog, 23:211−223.
  144. Wells D, Sherlock JK. Strategies for preimplantation genetic diagnosis of single gene disorders by DNA amplification //1998, Prcnat Diagn, 18:1389−1401.
  145. Wen SY, Wang H, Sun OJ, Wang SQ. Rapid detection of the known SNPs of C YP2C9 using oligonucleotide microarray // 2003, World J Gastroenterol, 9:13 421 346.
  146. Whiley DM, Mackay IM, Syrmis MW, Witt MJ, Sloots TP. Detection and differentiation of herpes simplex virus types 1 and 2 by a duplex LightCycIer PCR that incorporates an internal control PCR reaction // 2004, J Clin Virol, 30:32−38.
  147. White PC, Vitek A, Dupont B, New Ml. Characterization of frequent deletions causing steroid 21-hydroxylase deficiency// 1988, PNAS, 85:4436−4440.
  148. World Health Organization: Hepatitis:Background information on hepatitis A // 2001, httpi/Awvw.vvho.int/vaccincs/cn/hcpatitisa.shtml.
  149. Widjojoatmodjo MN, Fluit AC, Torenma R. The magnetic immuno polymerase chain reaction assay for direct detection of salmonellae in fecal samples // 1992, J Clin Microbiol, 30:3195−3199.
  150. Wiedmann M, Wilson WJ, Czajka J, Luo J, Barany F, Batt CA. Ligase chain reaction (LCR)--overview and applications // 1994, PCR Methods Appl, 3: S51-S64.
  151. Wilde J, Eiden J, Yolken R. Removal of inhibitory substances from human fecal specimens for detection of group A rotaviruses by reverse transcriptase and polymerase chain reactions // 1990, J Clin Microbiol, 28:1300−1307.
  152. Williams DL, Waguespack C, Eisenach K, Crawford JT, Portacls F, Salfingcr M, Nolan CM, Abe C, Sticht-Groh V, Gillis TP. Characterization of rifampin-resistance in pathogenic mycobacteria // 1994, Antimicrob Agents Chemother, 38:2380−2386.
  153. Williams DL, Wagnespack C, Eisenach K. WHO/IUATLD global project on anti-tubcrculosis drug resistance surveillance. Antituberculosis drug resistance in the world // 1997, World Hcalh Organization Publication WIIO/TB 97.229, Geneva.
  154. Williamson D, Brennan SO, Carrell RW. Hb Brisbane (beta 68 (E12) Leu replaced by His) is unstable// 1983, Hemoglobin, 7:473−475.
  155. Williamson D, Nutkins J, Rosthoj S, Brennan SO, Williams DH, Carrell RW. Characterization of Hb Aalborg, a new unstable hemoglobin variant, by fast atom bombardment mass spectrometry// 1990, Hemoglobin, 14:137−145.
  156. Xie J, Wehner TC, Conkling MA. PCR-bascd single-strand conformation polymorphism (SSCP) analysis to clone nine aquaporin genes in cucumbcr // 2002, J Amer Soc Hort Sci, 127:925−930.
  157. Yang YL, Wang G, Dorman K, Kaplan AI I. Long polymerase chain reaction amplification of heterogeneous HIV type 1 templates produces recombination at a relatively high frequency//1996, AIDS Res Hum Retroviruses, 12:303−306.
  158. Yeager AM, Zinkham WH, Jue DL, Winslow RM, Johnson Mil, McGuffey JE, Moo-Penn WF. Hemoglobin Cheverly: an unstable hemoglobin associated with chronic mild anemia// 1983, Pediat Res, 17:503−507.
Заполнить форму текущей работой