Помощь в учёбе, очень быстро...
Работаем вместе до победы

Роль гиперметилирования генов в патогенезе билатеральных опухолей молочной железы

Диссертация: Роль гиперметилирования генов в патогенезе билатеральных опухолей молочной железы
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Особый интерес для молекулярно-генетических исследований представляет билатеральный рак молочной железы (БРМЖ), так как при этой форме заболевания две опухоли развиваются в пределах одного организма на фоне идентичных эндогенных и экзогенных воздействий. Кроме того, БРМЖ является самой частой формой первично-множественных опухолей у человека. Эпигенетические нарушения при БРМЖ практически… Читать ещё >

Содержание

  • Список используемых сокращений и терминов
  • Глава 1. Обзор литературы
    • 1. 1. Метилирование ДНК в норме и в опухолях
      • 1. 1. 1. Распределение метилированных и неметилированных оснований в геноме
      • 1. 1. 2. ДНК-метилтрансферазы
      • 1. 1. 3. Механизмы репрессии транскрипции
      • 1. 1. 4. Основные функции метилирования в норме
      • 1. 1. 5. Нарушения метилирования в опухолях
    • 1. 2. Нарушения метилирования при раке молочной железы
      • 1. 2. 1. Метилирование ЕБЮ при РМЖ
      • 1. 2. 2. Метилирование ВКСА1 при РМЖ
      • 1. 2. 3. Метилирование <ХЖ)2 при РМЖ
      • 1. 2. 4. Метилирование ЯАЯЬ2 при РМЖ
    • 1. 3. Билатеральный рак молочной железы
      • 1. 3. 1. Эпидемиологические и клинические характеристики БРМЖ
      • 1. 3. 2. Изучение конкордантности/дискордантности молекулярных нарушений при БРМЖ
  • Глава 2. Материалы и методы
    • 2. 1. Исследуемые группы
    • 2. 2. Выделение ДНК
    • 2. 3. Выбор генов для исследования
    • 2. 4. Анализ метилирования ДНК
      • 2. 4. 1. Бисульфитная обработка ДНК
      • 2. 4. 2. Пиросеквенирование
    • 2. 5. Определение экспрессии мРНК ЕБШ
      • 2. 5. 1. Выделение РНК
      • 2. 5. 2. ПЦР в режиме реального времени
    • 2. 6. Статистический анализ данных
  • Глава 3. Результаты собственных исследований
    • 3. 1. Общая оценка метилирования генов Е8Я1, ВЯСА1, ССЫЭ2, КАЯЬ в исследуемых группах
    • 3. 2. Анализ корреляций между метилированием и возрастом
    • 3. 3. Анализ конкордантности/дискордантности внутри билатеральных пар опухолей
    • 3. 4. Анализ корреляций между метилированием ЕБЮ и внутриопухолевой экспрессией рецепторов эстрогенов
    • 3. 5. Анализ корреляций между метилированием генов ЕБЮ, ВЯСА1,
  • ССЫ02, КАЯЬ2 при РМЖ
    • 3. 6. Анализ ассоциаций между метилированием и клинико-биологическими характеристиками опухолей молочной железы
  • Глава 4. Обсуждение результатов исследования
  • Выводы

Роль гиперметилирования генов в патогенезе билатеральных опухолей молочной железы (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Актуальность проблемы.

Рак молочной железы (РМЖ) является самой распространенной онкологической патологией у женщин. На сегодняшний день довольно подробно изучены спектр и частота молекулярно-генетических нарушений при РМЖ. Вместе с тем, наряду с аномалиями на уровне генома, внимание современных исследователей привлекают изменения эпигенетических процессов, к которым относится метилирование ДНК. Метилирование цитозина в составе так называемых «CpG-островков» активирует деацетилирование гистонов, что, в свою очередь, приводит к изменению конфигурации хроматина и локальному подавлению транскрипции (Ng НН, Bird А, 1999). CpG-островки" представляют собой короткие участки в промоторных областях генов, содержащие повышенное по сравнению с остальным геномом число CG-динуклеотидовэти районы практически всегда не метилированы в нормальных клетках.

Для опухолей характерен дисбаланс эпигенетической регуляции: на (фоне глобального гипометилирования наблюдается гиперметилирование промоторных областей множества генов. Для" новообразований' разных локализаций, включая РМЖ, установлены специфичные профили метилирования^ (С os te, Но JF et al, 2000).

Во многих случаях гиперметилирование является причиной инактивации супрессорных генов (Jones PA and Baylin SB, 2002; Herman JG and Baylin SB, 2003). В соответствии с классической моделью Knudson’a, функция одного из аллелей гена-супрессора может быть" подавлена вследствие метилирования, а другого — за счет точковой мутации или делеции (Plass С, Soloway PD, 2002). В отличие от мутаций, необратимо изменяющих первичную структуру ДНК, присоединение метильной группы к основаниям потенциально обратимо. Этот факт лег в основу разработок терапии, направленной на восстановление нормальной картины метилирования и, соответственно, экспрессии антионкогенов (Herman JG and Baylin SB, 2003).

Гиперметилирование генов ESR1 (ER-alpha), BRCA1, CCND2, RARb2 встречается со значительной частотой при раке молочной железы.

По данным Li S et al. (2005), ER-alpha гиперметилирован в 84% РМЖ. Определение экспрессии рецепторов эстрогенов (ЭР) в опухолевой ткани остается одним из наиболее важных параметров при определении прогноза заболевания и выборе лечебной тактики. Приблизительно треть опухолей не содержит рецепторов стероидных гормонов на момент диагноза, кроме того, фракция изначально ЭР-положительных карцином перестает экспрессировать их в ходе прогрессирования. Между тем, причины нарушений экспрессии рецепторов эстрогенов пока еще во многом неясны. Некоторые исследования указывают на ассоциацию гиперметилирования, промотора гена ESR1 с потерей его транскрипции (Weigel RJ, deConinck ЕС, 1993; Kim SJ et al., 2004).

Мутации в антионкогене BRCA1 обуславливают до 10−15% наследственных карцином молочной железы. В спорадических случаях, напротив, соматические мутации встречаются, чрезвычайно редко. Тем не менее, такие факты, как высокая^ частота потерь гетерозиготности (LOH — Loss of Heterozygosity) в этом локусе и снижение экспрессии BRCA1 в «несемейных» РМЖ, свидетельствуют об участии этого гена и в развитии ненаследственных неоплазий. На сегодняшний^ день доказано, что гиперметилирование промотора принадлежит к числу возможных способов инактивации BRCA1 (Esteller М et al., 2000).

Еще одной частой мишенью эпигенетических нарушений является ген циклина D2 (CCND2). CCND2 вместе с другими D-циклинами отвечает за переход от S1- к G-фазе клеточного цикла путем активации циклин-зависимых киназ, фосфорилирования белка RB1накопления транскрипционных факторов. Кроме того, он обладает и альтернативной антипролиферативной активностью (Meyyappan М et al., 1998). Возможно, угнетение именно этой супрессорной-функции при метилировании промотора CCND2 имеет значение в патогенезе РМЖ.

Доля РМЖ с гиперметилированием промотора гена рецептора ретиноевой кислоты (RARb2) составляет, по некоторым данным, до 69% (Bean GR et al., 2005). RARb2 необходим для реализации функции ретиноидов, которые участвуют в регуляции роста и дифференцировки нормальных клеток в эмбриогенезе и неопластических клеток в процессе малигнизации.

Особый интерес для молекулярно-генетических исследований представляет билатеральный рак молочной железы (БРМЖ), так как при этой форме заболевания две опухоли развиваются в пределах одного организма на фоне идентичных эндогенных и экзогенных воздействий. Кроме того, БРМЖ является самой частой формой первично-множественных опухолей у человека. Эпигенетические нарушения при БРМЖ практически не охарактеризованы. Изучение вопроса о конкордантности или дискордантности статуса метилирования описанных выше генов в двух неоплазмах от одной пациентки предоставляет исключительную возможность судить о степени сходства патогенеза обеих опухолей и о роли эпигенетических нарушений в их развитии.

Цели и задачи исследования.

Целью настоящей работы является изучение особенностей картины метилирования генов в билатеральных опухолях молочной железы. В связи с этим поставлены следующие задачи:

1) Сравнить уровни метилирования и частоты гиперметилирования генов Е8Я1, ВЯСА1, ССКБ2, КАШэ2 в билатеральных и монолатеральных опухолях молочной железы.

2) Провести анализ конкордантности/дискордантности изучаемых" явлений в парных образцах БРМЖ.

3) Сопоставить данные о метилировании, гена Е8Я1 при РМЖ с информацией об экспрессии рецепторов эстрогенов на уровне РНК и белка в тех-же опухолях.

4) Провести анализ корреляций между статусом метилирования генов ЕБШ, ВЫСА1, ССИВ2, КАШ>2.

5) Провести анализ ассоциаций между статусом метилирования изучаемых генов и клинико-биологическими параметрами РМЖ.

Научная новизна полученных результатов.

В настоящей работе впервые изучены профиль и частота гиперметилирования генов Е8Я1, ВКСА1, ССКБ2, 11А11Ь2 при БРМЖ. Также проведено сравнение частот изученных явлений между монолатеральными и билатеральными опухолями.

Практическая значимость.

Полученные данные об эпигенетических нарушениях при >билатеральной форме РМЖ дополняют «молекулярный портрет» БРМЖ и вносят вклад в понимание его патогенеза. В дальнейшем эта информация может быть использована при разработке новых принципов противоопухолевой терапии.

Основные положения, выносимые на защиту:

1) — Билатеральные опухоли молочной железы не отличаются от монолатеральных по уровню метилирования и по частоте гиперметилирования генов BRCA1, CCND2, RARb2.

2) Билатеральные опухоли молочной железы отличаются от монолатеральных по уровню метилирования промотора генаESR1. В билатеральных-карциномах1 значительно выше доля случаев, с низким, (<10%) уровнем метилирования.

3) Гиперметилирование промотора гена ESR1 является редким событием при раке молочной железы (частота составляет 4% в монолатеральных и 4% в билатеральных карциномах). Колебания уровня метилирования ниже порога гиперметилирования не ассоциированы с изменением экспрессии рецепторов эстрогенов.

4) Метилирование генов ESR1, BRCA1, CCND2, RARb2 не проявляет тенденции к повышенной конкордантности в парных билатеральных карциномах молочной железы. Данное наблюдение ставит под сомнение критическую роль эпигенетических нарушений в патогенезе БРМЖ.

Апробация работы.

Результаты работы были представлены на научной межлабораторной конференции НИИ онкологии им. H.H. Петрова (22 декабря 2008 г., Санкт-Петербург, Россия), на конференции по фундаментальной онкологии «Петровские чтения — 2009» (17 апреля 2009 г., Санкт-Петербург, Россия).

Структура и объем диссертации

.

Диссертация изложена на 100 страницах и состоит из введения, обзора литературы, глав материалов и методов, результатов исследований, обсуждения полученных данных и выводов. Работа иллюстрирована 12 таблицами и 16 рисунками. Библиографический указатель включает 193 публикации, в том числе 7 отечественных и 186 зарубежных.

выводы.

Билатеральные опухоли молочной железы не отличаются от монолатеральных по уровню метилирования и частоте гиперметилирования генов ВКСА1, ССЫБ2, ЯАКЬ2 (частоты гиперметилирования этих генов в МРМЖ и БРМЖ составляют 5% и 9%, 22% и 35%, 17% и 20%, соответственно).

Билатеральные опухоли молочной железы отличаются от монолатеральных по уровню метилирования промотора гена Е8Ю. Среди билатеральных карцином значительно выше доля случаев с низким уровнем метилирования (встречаемость низкого (менее 10%) уровня метилирования при МРМЖ и БРМЖ составляет 16/68 (24%) и 31/52 (60%), соответственно, р=0.0001).

Гиперметилирование промотора гена ЕБЮ является редким событием при раке молочной железы (частота составляет 4% в монолатеральных и 4% в билатеральных карциномах). Колебания уровня метилирования' ниже порога гиперметилирования не ассоциированы с изменением экспрессии рецепторов эстрогенов.

Метилирование четырех изученных генов не проявляет тенденции к повышенной конкордантности в парных билатеральных опухолях молочной железы. Данное наблюдение ставит под сомнение, критическую роль рассматриваемых эпигенетических нарушений в патогенезе БРМЖ.

Статус метилирования гена ЕБШ коррелирует со статусом метилирования гена ВКСА1 (КБреагшап—0.33, р=0.001). Метилирование гена ВЯСА1 коррелирует со степенью дифференцировки опухоли: уровень метилирования возрастает с уменьшением степени дифференцировки (К8реагтап=0.48, р=0.002).

Показать весь текст

Список литературы

  1. Л.М. Гормональный канцерогенез // СПб.: Наука, 2000. 2001. С.
  2. H.H., Азизов Ю. М., Иткнн Б. З., Ванюшин Б. Ф. Изменение метилирования ДНК лимфоцитов крупного рогатого скота при хроническом лимфолейкозе // Биохимия. 1977. — Т. 42. — С. 1690−1696.
  3. E.H., Хансон К. П. Эпидемиология и биология билатерального рака молочной железы // Лекции по фундаментальной и клинической онкологии / Под ред. Моисеенко В. М., Урманчеевой А. Ф., Хансона К. П. СПб.: Издательство Н-Л, 2004.-С. 51−69.
  4. В.М., Семиглазов В.Ф, Тюляндин С. А. Современное лекарственное лечение местно-распространенного и метастатического рака молочной железы // СПб.: Грифон, 1997. 253 С.
  5. Н.П., Киселев Ф. Л. Деметилирование ДНК и канцерогенез // Биохимия. 2005. — Т. 70. — С. 900−911.
  6. В.Ф., Попова Р. Т. Диагностика билатерального рака молочной железы // Первично-множественные злокачественные опухоли / Под ред. Н. П. Напалкова, Я. В. Бохмана, В. Ф. Семиглазова. Л., 1987. — С. 7−16.
  7. Ahuja N, Issa JP. Aging, methylation and cancer // Histol Histopathol. -2000.-V. 15.-P. 835−842.
  8. Ahuja N, Li Q, Mohan AL, Baylin SB and Issa J-PJ. Aging and DNA methylation in colorectal mucosa and cancer // Cancer Res. 1998. — V. 58. — P. 54 895 494.
  9. Alaminos M, Davalos V, Cheung NK, Gerald WL, Esteller M. Clustering of gene hypermethylation associated with clinical risk groups in neuroblastoma // J Natl Cancer Inst. 2004. V. 96. — P. 1208−1219.
  10. Allaman-Pillet N, DjemaT A, Bonny C, Schorderet DF. Methylation status of CpG sites and methyl-CpG binding proteins are involved in the promoter regulation of the mouse Xist gene // Gene Expr. 1998. — V. 7. — P. 61−73.
  11. Archey WB, McEachern KA, Robson M, Offit K, Vaziri SA, Casey G, Borg A, Arrick BA. Increased CpG methylation of the estrogen receptor gene in BRCA1— linked estrogen receptor-negative breast cancers // Oncogene. 2002. — V. 21. — P. 7034−7041.
  12. Asada H, Yamagata Y, Taketani T, Matsuoka A, Tamura H, Hattori N, Ohgane J, Hattori N, Shiota K, Sugino N. Potential link between estrogen^ receptor-alpha gene hypomethylation and uterine fibroid formation // Mol Hum Reprod. 2008. -V. 14.-P. 539−545.
  13. Bae YK, Brown A, Garrett E, Bornman D, Fackler MJ, Sukumar S, Herman JG, Gabrielson E: Hypermethylation in histologically distinct classes of breast cancer // Clin Cancer Res. 2004. — V. 10. — P. 5998−6005.
  14. Ballestar E, Esteller M. Methyl-CpG-binding proteins in cancer: blaming the DNA methylation messenger // Biochem Cell Biol. 2005. — V. 83. — P. 374−384.
  15. Ballestar E, Paz MF, Valle L, Wei S, Fraga MF, Espada J, Cigudosa JC, Huang TH, Esteller M. Methyl-CpG binding proteins identify novel sites of epigenetic inactivation in human cancer // EMBO J. 2003. — V. 22. — P. 6335−6345.
  16. Baylin SB, Herman JG. DNA hypermethylation in tumorigenesis: epigenetics joins genetics // Trends Genet. 2000. — V. 16. — P. 168−174.
  17. Bednarik DP. DNA methylation and retrovirus expression // EXS. 1993. -V. 64. — P. 300−329.
  18. Bergman Y, Cedar H. A stepwise epigenetic process controls immunoglobulin allelic exclusion // Nat Rev Immunol. 2004. — V. 4. — P. 753−761.
  19. Bird A, Tweedie S. Transcriptional noise and the evolution of gene number // Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 1995. — V. 349. — P. 249−253.
  20. Bird A. DNA methylation patterns and’epigenetic memory // Genes Dev. — 2002.-V. 16.-P. 6−21.
  21. Birgisdottir V, Stefansson OA, Bodvarsdottir SK, Hilmarsdottir H, Jonasson JG, Eyfjord JE. Epigenetic silencing and deletion of the BRCA1 gene in sporadic breast cancer // Breast Cancer Res. 2006. V. 8(4):R38.
  22. Bock C, Paulsen M, Tierling S, Mikeska T, Lengauer T, Walter J. CpG Island Methylation in Human Lymphocytes Is Highly Correlated with DNA Sequence, Repeats, and Predicted DNA Structure // PLoS Genetics. 2006. — V. 2(3): e26.
  23. Bonanni B, Lazzeroni M. Retinoids and breast cancer prevention // Recent Results Cancer Res. 2009. — V. 181. — P. 77−82.
  24. Bovenzi V, Le NL, Cote S, Sinnett D, Momparler LF, Momparler RL. DNA methylation of retinoic acid receptor beta in breast cancer and possible therapeutic role of 5-aza-2'-deoxycytidine // Anticancer Drugs. 1999. — V. 10/ - P. 471−476.
  25. Buckley MF, Sweeney KJ, Hamilton JA, Sini RL, Manning DL, Nicholson RI, deFazio A, Watts CK, Musgrove EA, Sutherland RL. Expression and amplification of cyclin genes in human breast cancer // Oncogene. 1993. — V. 8. — P. 2127−2133.
  26. Chang HG, Kim SJ, Chung KW, Noh DY, Kwon Y, Lee ES, Kang HS. Tamoxifen-resistant breast cancers show less frequent methylation of the estrogen receptor beta but not the estrogen receptor alpha gene // J Mol Med. 2005. — Y. 83. -P. 132−139.
  27. Chaudary MA, Millis RR, Hoskins EO^ Haider M, Bulbrook RD, Cuzick J, Hayward JL. Bilateral primary breast cancer: a prospective study of disease incidence // Br J Surg.- 1984.-V. 71.-P. 711−714.
  28. Chen T, Li E. Establishment and maintenance of DNA methylation patterns in mammals // Curr Top Microbiol Immunol. 2006. — V. 301. — P. 179−201.
  29. Chen Y, Thompson W, Semenciw R, Mao Y. Epidemiology of contralateral breast cancer // Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 1999. — V. 8. — P. 855−861.
  30. Chow JC, Yen Z, Ziesche SM, Brown CJ. Silencing of the mammalian X chromosome // Annu Rev Genomics Hum Genet. 2005. — V. 6. — P. 69−92.
  31. Chu MW, Siegmund KD, Eckstam CL, Kim JY, Yang AS, Kanel GC, Tavare S, Shibata D. Lack of increases in methylation at three CpG-rich genomic loci in non-mitotic adult tissues during aging // BMC Med Genet. 2007. — Y. 8:50.
  32. Clark SJ. Action at a distance: epigenetic silencing of large chromosomal regions in carcinogenesis // Hum Mo 1 Genet. — 2007. V. 16. — Spec No l: R88−95.
  33. Coradini D, Oriana S, Mariani L, Miceli R, Bresciani G, Marubini E, Di Fronzo G. Is steroid receptor' profile in contralateral breast, cancer a marker of independence of the corresponding primary tumour? // Eur J Cancer. 1998. — Y. 34. -P. 825−830.
  34. Cross SH, Bird AP. CpG islands and genes // Curr Opin Genet Dev. 1995. -V. 5.-P. 309−314.
  35. Cui H, Onyango P, Brandenburg S, Wu Y, Hsieh CL, Feinberg AP. Loss of imprinting in colorectal cancer linked to hypomethylation of HI9 and IGF2 // Cancer Res. 2002. — V. 62. — P. 6442−6446.
  36. DiNardo DN, Butcher DT, Robinson DP, Archer TK, Rodenhiser DI. Functional analysis of CpG methylation in the BRCA1 promoter region // Oncogene. -2001. V. 20. — P. 5331−5340.
  37. Dobrovic A, Simpfendorfer D. Methylation of the BRCA1 gene in sporadic breast cancer // Cancer Res. 1997. — V. 57. — P. 3347−3350.
  38. Duthie SM, Nesterova TB, Formstone EJ, Keohane AM, Turner BM, Zakian SM, Brockdorff N. Xist RNA exhibits a banded localization on the inactive X chromosome and is excluded from autosomal material in eis // Hum Mol Genet. — 1999. -V. 8.-P. 195−204.
  39. Eads CA, Danenberg KD, Kawakami K, Saltz LB, Danenberg PV, Laird PW. CpG island hypermethylation in human colorectal tumors is not associated with DNA methyltransferase overexpression // Cancer Res. 1999. — V. 59. — P. 2302−2306.
  40. Ehrlich M, Wang RY. 5-Methylcytosine in eukaryotic DNA // Science. -1981. V. 212. — P. 1350−1357.
  41. Ehrlich M. Amount and distribution of 5-me thy Icy to sine in human DNA from different types of tissues or cells // Nucleic Acids Res. 1982. — V. 10, — P. 27 092 721.
  42. Esteller M. Epigenetic gene silencing in cancer: the DNA hypermethylome // Hum Mol Genet. 2007. — V. 16. — P. 50−59.
  43. Fackler MJ, McVeigh M, Evron E, Garrett E, Mehrotra J, Polyak K, Sukumar S, Argani P. DNA methylation of RASSF1A, HIN-1, RAR-beta, Cyclin D2 and Twist in in situ and invasive lobular breast carcinoma // Int J Cancer. — 2003. V. 107. — P. 970−975.
  44. Feinberg AP, Gehrke CW, Kuo KC, Ehrlich M. Reduced genomic 5-methylcytosine content in human colonic neoplasia // Cancer Res. — 1988. V. 48. — P. 1159−1161.
  45. Feltus FA, Lee EK, Costello JF, Plass C, Vertino PM. DNA motifs associated with aberrant CpG island methylation // Genomics. 2006. — V. 87. — P. 572−579:
  46. Fiegl H, Millinger S, Goebel G, Muller-Holzner E, Marth C, Laird PW, Widschwendter M. DNA Methylation Profiles in Cancer Cells and Tumor Stroma: Association with HER-2/neu Status in Primary Breast Cancer // Cancer Res. 2006. -V. 66.-P. 29−33.
  47. Fuks F, Hurd PJ, Wolf D, Nan X, Bird AP, Kouzarides T. The methyl-CpG-binding protein MeCP2 links DNA methylation to histone methylation // J Biol Chem. -2003. V. 278. — P. 4035—4040.
  48. Gama-Sosa MA, Slagel VA, Trewyn RW, Oxenhandler R, Kuo KC, Gehrke CW, Ehrlich M. The 5-methylcytosine content of DNA from human tumors // Nucleic Acids Res. 1983. — V. 11. — P. 6883−6894.
  49. Giacinti L, Claudio PP, Lopez M, Giordano A. Epigenetic information and estrogen receptor alpha expression in breast cancer // Oncologist. 2006. — V. 11. — P. 1−8.
  50. Gopisetty G, Ramachandran K, Singal R. DNA methylation and apoptosis // Mol Immunol. 2006. — V. 43. — P. 1729−1740.
  51. Hanstein B, Djahansouzi S, Dall P, Beckmann MW, Bender HG. Insights into the molecular biology of the estrogen receptor define novel therapeutic targets for breast cancer // Eur J Endocrinol. 2004. — V. 150. — P. 243−255.
  52. Hartman M, Czene K, Reilly M, Adolfsson J, Bergh J, Adami HO, Dickman PW, Hall P. Incidence and prognosis of synchronous and metachronous bilateral breast cancer // J Clin Oncol. 2007. — V. 25. — P. 4210−4216.
  53. Hemminki K, Granstrom C. Morphological types of breast cancer in family members and multiple primary tumours: is morphology genetically determined? // Breast Cancer Res. 2002. — V. 4(4):R7.
  54. Herman JG, Baylin SB. Gene silencing in cancer in association with promoter Hypermethylation // N Engl J Med. 2003. — V. 349. — P. 2042−2054.
  55. Holliday R, Pugh JE. DNA modification mechanisms and gene activity during development // Science. 1975. — V. 187. — P. 226−232.
  56. Hori M, Iwasaki M, Yoshimi F, Asato Y, Itabashi M. Hypermethylation of the Estrogen Receptor Alpha Gene Is Not Related to Lack of Receptor Protein in Human Breast Cancer // Breast Cancer. 1999. — V. 6. — P. 79−86.
  57. Hotchkiss RD. The quantitative separation- of purines, pyrimidines, and nucleosides by paper chromatography // J Biol Chem. 1948. — V. 168. — P. 315−332.
  58. Hu XG, Wong IH, Chow LW. Tumor-derived aberrant methylation in plasma of invasive ductal breast cancer patients: clinical implications // Oncol Rep. — 2003. — V. 10.-P. 1811−1815.
  59. Imyanitov EN, Hanson KP. Mechanisms of breast cancer // Drug Discov Today: Dis Mech. 2004. — V. 1. — P. 235−245.
  60. Issa JP, Ottaviano YL, Celano P, Hamilton. SR, Davidson NE, Baylin SB. Methylation of the oestrogen receptor CpG island links ageing and neoplasia in, the human colon // Nat Genet. 1994. — V. 7. — P. 536−540.
  61. Issa JP. CpG island methylator phenotype in cancer // Nat Rev Cancer. -2004.-V. 4.-P. 988−993.
  62. Iwase H, Omoto Y, Iwata H, Toy ama T, Hara Y, Ando Y, Ito Y, Fujii Y, Kobayashi S. DNA methylation analysis at distal and proximal promoter regions of the oestrogen receptor gene in breast cancers // Br J Cancer. 1999. — V. 80. — P. 19 821 986.
  63. Jaenisch R, Bird A. Epigenetic regulation of gene expression: how the genome integrates intrinsic and environmental signals // Nat Genet. 2003. — V. 33. — P. 245−254.
  64. Jaenisch R. DNA methylation and imprinting: why bother? // Trends Genet. — 1997.-V. 13.-P. 323−329.
  65. Jenuwein T, Allis CD. Translating the histone code // Science 2001, V. 293. -P. 1074−1080.
  66. Jeronimo C, Costa I, Martins MC, Monteiro P, Lisboa S, Palmeira C, Henrique R, Teixeira MR, Lopes C. Detection of gene promoter hypermethylation in fine needle washings from breast lesions // Clin Cancer Res. 2003. — V. 9. — P. 34 133 417.
  67. Jobsen JJ, van der Palen J, Ong F, Meerwaldt JH. Synchronous, bilateral breast cancer: prognostic value and incidence // Breast. 2003. — V. 12. — P. 83—88.
  68. Johnson MR, Wang K, Smith JB, Heslin MJ, Diasio RB. Quantitation of dihydropyrimidine dehydrogenase expression by real-time reverse transcription polymerase chain reaction // Anal Biochem. 2000. — V. 278. — P. 175−184.
  69. Jones PA, Baylin SB. The fundamental role of epigenetic events in cancer // Nat Rev Genet. 2002. — V. 3. — P. 415−428.
  70. Jones PL, Veenstra GJ, Wade PA, Vermaak D, Kass SU, Landsberger N, Strouboulis J, Wolffe AP. Methylated DNA and MeCP2 recruit histone deacetylase to repress transcription // Nat Genet. 1998. — V. 19. — P. 187−191.
  71. Kim GD, Ni J, Kelesoglu N, Roberts RJ, and Pradhan S. Co-operation and communication between the human maintenance and de novo DNA (cytosine—5) methyltransferases // EMBO J. 2002. — V. 21. — P. 4183−4195.
  72. Kim JY, Siegmund KD, Tavare S, Shibata D. Age-related human small intestine methylation: evidence for stem cell niches // BMC Med. 2005. — V. 3. — P. 10−15.
  73. Kim JY, Tavare S, Shibata D. Counting human somatic cell replications: Methylation mirrors endometrial stem cell divisions // Proc Natl Acad Sci USA. 2005. -V. 102.-P. 17 739−17 744.
  74. Kim SJ, Kim TW, Lee SY, Park SJ, Kim HS, Chung-KW, Lee ES, Kang HS. CpG methylation of the ERalpha and ERbeta genes in breast cancer // Int J Mol Med. -2004. V. 14. — P. 289−293.
  75. Kollias J, Pinder SE, Denley HE, Ellis IO, Wencyk P, Bell JA, Elston CW, Blarney RW. Phenotypic similarities in bilateral breast cancer // Breast Cancer Res Treat. 2004. — V. 85. — P. 255−261.
  76. Kontorovich T, Cohen Y, Nir U, Friedman E. Promoter methylation patterns of ATM, ATR, BRCA1, BRCA2 and P53 as putative cancer risk modifiers in Jewish BRCA1/BRCA2 mutation carriers // Breast Cancer Res Treat. 2009. — V. 116. — P. 195−200.
  77. Kopelovich L, Crowell JA, Fay JF. The epigenome as a target for cancer chemoprevention // J Natl Cancer Inst. 2003. — V. 95. — P. 1747−1757.
  78. Kos M, Reid G, Denger S, Gannon F. Minireview: genomic organization of the human ERalpha gene promoter region // Mol Endocrinol. 2001. — V. 15. — P. 2057−2063.
  79. Kuo WH, Yen AM, Lee PH, Chen KM, Wang J, Chang KJ, Chen TH, Tsau HS. Cumulative survival in early-onset unilateral and bilateral breast cancer: an analysis of 1907 Taiwanese women // Br J Cancer. 2009. — V. 100. — P. 563−570.
  80. Kwabi-Addo B, Chung W, Shen L, Ittmann M, Wheeler T, Jelinek J, Issa JP. Age-related DNA methylation changes in normal human prostate tissues // Clin Cancer Res. 2007. — V. 13. — P. 3796−3802.
  81. Lapidus RG, Nass SJ and Davidson NE. The loss of estrogen and progesterone receptor gene expression in human breast cancer // J Mammary Gland Biol Neoplasia. 1998. — V. 3. — P. 85−94.
  82. Lee A, Kim Y, Han K, Kang CS, Jeon HM, Shim SI. Detection of tumor markers including carcinoembryonic antigen, APC, and cyclin D2 in< fine-needle aspiration fluid of breast // Arch Pathol Lab Med. 2004. — V. 128. — P. 1251−1256.
  83. Lehmann U, Ahrens P, Wingen LU, Schlegelberger B, Langer F, Kreipe H. Hypermethylation of cyclin D2 and DAP kinase is associated with the lobular subtype of breast cancer // Breast Cancer Res. 2005. — V. 7(Suppl 2):P4.16.
  84. Lehmann U, Langer F, Feist H, Glockner S, Hasemeier B, Kreipe H. Quantitative assessment of promoter hypermethylation during breast cancer development // Am J Pathol. 2002. — V. 160. — P. 605−612.
  85. Lewis CM, Cler LR, Bu DW, Zochbauer-Muller S, Milchgrub S, Naftalis EZ, Leitch AM, Minna JD, Euhus DM. Promoter hypermethylation in benign breast epithelium in relation to predicted breast cancer risk // Clin Cancer Res. 2005. — V. 11. -P. 166−172.
  86. Li LC, Dahiya R. MethPrimer: designing primers for methylation PCRs // Bioinformatics. -2002. V. 18.-P. 1427−1431.
  87. Li S, Rong M, Iacopetta B. DNA hypermethylation in breast cancer and its association with clinicopathological features // Cancer Lett. 2006. — V. 237. — P.' 272 280.
  88. Li SY, Rong M, Iacopetta B. DNA hypermethylation in breast cancer and its association with clinicopathological features // Cancer Lett. — 2006. V. 237. — P. 272−280.
  89. Mancini DN, Rodenhiser DI, Ainsworth PJ, O’Malley FP, Singh SM, Xing W, Archer TK. CpG methylation within the 5' regulatory region of the BRCA1 gene is tumor specific and includes a putative CREB binding site // Oncogene. 1998. — V. 16. -P. 1161−1169.
  90. Matros E, Wang ZC, Lodeiro G, Miron A, Iglehart JD, Richardson AL. BRCA1 promoter methylation in sporadic breast tumors: relationship to gene expression profiles // Breast Cancer Res Treat. 2005. — V. 91. — P. 179−186.
  91. Meyyappan M, Atadja PW, Riabowol KT. Regulation of gene expression and transcription factor binding activity during cellular aging-// Biol Signals. 1996. — V. 5.-P. 130−138.
  92. Meyyappan M, Wong H, Hull C, Riabowol KT. Increased expression of cyclin D2 during multiple states of growth arrest in primary and established cells // Mol Cell Biol. 1998.-V. 18.-P. 3163−3172.
  93. Miremadi A, Oestergaard MZ, Pharoah PD, Caldas-.C. Cancer genetics of epigenetic genes // Hum Mol Genet. 2007. — V. 16. — Spec No 1: R28−49.
  94. Mirza S, Sharma G, Prasad CP, Parshad R, Srivastava A, Gupta SD, Raihan R. Promoter hypermethylation of TMS1, BRCA1, ERalpha and PRB in serum and tumor DNA of invasive ductal breast carcinoma patients // Life Sei. 2007. — V. 81. — P. 280−287.
  95. Muller HM, Widschwendter A, Fiegl H, Ivarsson L, Goebel G, Perkmann E, Marth C, Widschwendter M. DNA methylation in serum of breast cancer patients: an independent prognostic marker // Cancer Res. 2003. — V. 63. — P. 7641−7645.
  96. Ng HH, Bird A. DNA methylation and, chromatin modification // Curr Opin Genet Dev. 1999. — V. 9. — P. 158−163.
  97. Niwa Y, Oyama T, Nakajima T. BRCA1 expression status in relation to DNA methylation of the BRCA1 promoter region in sporadic breast cancers // Jpn J Cancer Res. 2000. — V. 91. — P. 519−526.
  98. Noguchi S, Motomura K, Inaji H, Imaoka S, Koyama H. Differentiation of primary and secondary breast cancer with clonal analysis // Surgery. 1994. — V. 115.— P. 458−462.
  99. Novak P, Jensen T, Oshiro MM- Watts GS, Kim CJ, Futscher BW. Agglomerative epigenetic aberrations are a common event in human breast cancer // Cancer Res. 2008. — V. 15. — P. 8616−8625.
  100. Okano M, Bell DW, Haber DA, Li E. DNA methyltransferases Dnmt3a and Dnmt3b are essential for de novo methylation and mammalian development // Cell. 1999. — V. 99. — P. 247−257.
  101. Okano M, Xie S, Li E. Cloning and characterization of a family of novel mammalian DNA (cytosine-5) methyltransferases // Nat Genet. 1998. — Y. 19. — P. 219−220.
  102. Osin P, Lu YJ, Stone J, Crook T, Houlston RS, Gasco M, Gusterson BA, Shipley J. Distinct genetic and epigenetic changes in medullary breast cancer // Int J Surg Pathol.-2003.-Y. 11.-P. 153−158.
  103. Ottaviano YL, Issa JP, Pari FF, Smith HS, Baylin SB, Davidson NE. Methylation of the estrogen receptor gene CpG island marks loss of estrogen receptor expression in human breast cancer cells // Cancer Res. 1994. — V. 54. — P. 2552−2555.
  104. Pinzone JJ, Stevenson H, Strobl JS, Berg PE. Molecular and cellular determinants of estrogen receptor alpha expression // Mol Cell Biol. 2004. — V. 24. -P.4605−4612.
  105. Plass C, Soloway PD. DNA methylation, imprinting and cancer // Eur J Hum Genet. 2002. — V. 10. — P. 6−16.
  106. Qu GZ, Grundy PE, Narayan A, Ehrlich M. Frequent hypomethylation in Wilms tumors of pericentromeric DNA in chromosomes 1 and 16 // Cancer Genet Cytogenet. 1999. -V. 109. — P. 34−39.
  107. Razin A, Riggs AD. DNA methylation and gene function // Science. — 1980.-V. 210.-P. 604−610.
  108. Rhee I, Bachman KE, Park BH, Jair KW, Yen RW, Schuebel KE, Cui H, Feinberg AP, Lengauer C, Kinzler KW, Baylin SB, Vogelstein B. DNMT1 and DNMT3B cooperate to silence genes in human cancer cells // Nature. — 2002. V. 416. -P. 552−556.
  109. Rhee I, Jair KW, Yen RW, Lengauer C, Herman JG, Kinzler KW, Vogelstein B, Baylin SB, Schuebel KE. CpG methylation is maintained in human cancer cells lacking DNMT1 // Nature. 2000. — V. 404. — P. 1003−1007.
  110. Rice JC, Futscher BW. Transcriptional repression of BRCA1 by aberrant cytosine methylation, histone hypoacetylation and chromatin condensation of the BRCA1 promoter // Nucleic Acids Res. 2000. — V. 28. — P. 3233−3239.
  111. Rice JC, Massey-Brown KS, Futscher BW. Aberrant methylation of the BRCA1 CpG island promoter is associated with decreased BRCA1 mRNA in sporadic breast cancer cells // Oncogene. 1998. — V. 17. — P. 1807−1812.
  112. Rideout WM 3, Coetzee GA, Olumi AF, Jones PA. 5-Methylcytosine as an endogenous mutagen, in the human LDL receptor and p53 genes // Science. 1990. -V. 249.-P. 1288−1290.
  113. Riggs AD, Xiong Z, Wang L, LeBon JM: Methylation dynamics, epigenetic fidelity and X chromosome structure // Novartis Found Symp. — 1998. V. 214.-P. 214−232.
  114. Roll JD, Rivenbark AG, Jones WD, Coleman WB. DNMT3b overexpression contributes to a hypermethylator phenotype in human breast cancer cell lines // Molecular Cancer. 2007. — V. 7. — P. 15.
  115. Russnes HG, Kuligina ESh, Suspitsin EN, Jordanova ES, Cornelisse CJ, Borresen-Dale AL, Imyanitov EN. Paired distribution of molecular subtypes in bilateral breast carcinomas. Article in press.
  116. Russo VEA, Martienssen RA, Riggs AD. Epigenetic mechanisms of gene regulation // Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY, 1996. — 693 p.
  117. Sakuma M, Akahira J, Ito K, Niikura H, Moriya T, Okamura K, Sasano H, Yaegashi N. Promoter methylation status of the Cyclin D2 gene is associated with poor prognosis in human epithelial ovarian cancer // Cancer Sci. 2007. — V. 98. — P. 380 386.
  118. Sharma G, Mirza S, Prasad' CP, Srivastava A, Gupta SD, Ralhan R. Promoter hypermethylation of pl6INK4A, pl4ARF, CyclinD2 and Slit2 in serum and tumor DNA from breast cancer patients // Life Sci. 2007. — V. 80. — P. 1873−1881.
  119. Shibata A, Tsai YC, Press MF, Henderson BE, Jones PA, Ross RK. Clonal analysis of bilateral breast cancer // Clin Cancer Res. 1996. — V. 2. — P. 743−748.
  120. Shinozaki M, Hoon DS, Giuliano AE, Hansen NM, Wang HJ, Turner R, Taback B. Distinct hypermethylation profile of primary breast cancer is associated with sentinel lymph node metastasis // Clin Cancer Res. 2005. — V. 11. — P. 2156−2162.
  121. So K, Tamura G, Honda T, Homma N, Waki T, Togawa N, Nishizuka S, Motoyama T. Multiple tumor suppressor genes are increasingly methylated with age in non-neoplastic gastric epithelia // Cancer sei. 2006. — V. 97. — P. 1155−1158.
  122. Stimson KM, Vertino PM. Methylation-mediated silencing of TMS1/ASC is accompanied by histone hypoacetylation and CpG island-localized changes in chromatin architecture // J Biol Chem. 2002. — V. 277. — P. 4951−4958.
  123. Sunami E, Shinozaki M, Sim MS, Nguyen SL, Vu AT, Giuliano AE, Hoon DS. Estrogen receptor and HER2/neu status affect epigenetic differences of tumor-related genes in primary breast tumors // Breast Cancer Res. 2008. — V. 10. — R46.
  124. Suspitsin EN, Sokolenko AP, Togo AV, Lazareva YR, Turkevich EA, Matsko DE, Henrich KO, Borresen-Dale AL, Schwab M, Cornelisse CJ, Imyanitov EN.
  125. Nonrandom distribution of oncogene amplifications in bilateral breast carcinomas: Possible role of host factors and survival bias // Int J Cancer. 2007. — V. 120. — P. 297−302.
  126. Takahashi H, Watanabe K, Takahashi M, Taguchi K, Sasaki F, Todo S. The impact of bilateral breast cancer on the prognosis of breast cancer: a comparative study with unilateral breast cancer // Breast Cancer. 2005. — V. 12. — P. 196−202.
  127. Turker MS. Gene silencing in mammalian cells and the spread of DNA methylation // Oncogene. 2002. — V. 21. — P. 5388−5393.
  128. Turner BM. Cellular memory and the histone code // Cell. 2002. — V. 111.-P. 285−291.
  129. Turner NC, Reis-Filho JS, Russell AM, Springall RJ, Ryder K, Steele D, Savage K, Gillett CE, Schmitt FC, Ashworth A, Tutt AN. BRCA1 dysfunction" in sporadic basal-like breast cancer // Oncogene. 2007. — V. 26. — P. 2126−2132.
  130. Van" Beers EH, Joosse SA, Ligtenberg MJ, Fles R, Hogervorst FB, Verhoef S, Nederlof PM. A multiplex PCR predictor for aCGH success of FFPE samples // Br J Cancer. 2006. — V. 94. — P. 333−337.
  131. Waki T, Tamura G, Sato M, Motoyama T. Age-related methylation of tumor suppressor and tumor-related genes: an analysis of autopsy samples // Oncogene. 2003. — V. 22. — P. 4128−4133.
  132. Wei M, Xu J, Dignam J, Nanda R, Sveen L, FackenthaLJ, Grushko TA, Olopade OI. Estrogen receptor alpha, BRCA1, and FANCF promoter methylation occur in distinct subsets of sporadic breast cancers // Breast Cancer Res Treat. 2008. V. 111. -P. 113−120.
  133. Weigel RJ, deConinck EC. Transcriptional control of estrogen receptor in estrogen receptor-negative breast carcinoma // Cancer Res. 1993. — Y. 53. — P. 3472— 3474.
  134. Widschwendter M, Jones PA. DNA methylation and breast carcinogenesis // Oncogene. 2002. — V. 21. — P. 5462−5482.
  135. Widschwendter M, Siegmund KD, Miiller HM, Fiegl H, Marth C, Muller-Holzner E, Jones PA, Laird PW. Association of breast cancer DNA methylation profiles with hormone receptor status and response to tamoxifen // Cancer Res. 2004. — V. 64. -P. 3807−3813.
  136. Yakushiji T, Uzawa K, Shibahara T, Noma H, Tanzawa H. Overexpression of DNA methyltransferases and CDKN2A gene methylation status in squamous cell carcinoma of the oral cavity // Int J Oncol. 2003. — V. 22. — P. 1201— 1207.
  137. Yang Q, Sakurai T, Kakudo K. Retinoid, retinoic acid receptor beta and breast cancer II Breast Cancer Res Treat. 2002. — V. 76. — P. 167−173.
  138. Yenbutr P, Hilakivi-Clarke L, Passaniti A. Hypomethylation of an exon I estrogen receptor CpG island in spontaneous and carcinogen-induced mammary tumorigenesis in the rat // Mech Ageing Dev. 1998. — V. 106. — P. 93−102.
  139. YeoW, Wong WL, Wong N, Law BK, Tse GM, Zhong S. High frequency of promoter hypermethylation of RASSF1A in tumorous and non-tumourous tissue of breast cancer // Pathology. 2005. — V. 37. — P. 125−130.
  140. Yoder J A, Walsh CP, Bestor TH. Cytosine methylation and the ecology of intragenomic parasites II Trends Genet. 1997. — V. 13. — P. 335−340.
  141. Zhu H, Geiman TM, Xi S, Jiang Q, Schmidtmann A, Chen T, Li E, Muegge K. Lsh is involved in de novo methylation of DNA II EMBO J. 2006. — V. 25. -P. 335−345.
Заполнить форму текущей работой

Пора сдавать?