Анализ генетического разнообразия в породах и экспериментальных популяциях кур методом ДНК фингерпринтинга
Диссертация
Показано, что в результате селекции на устойчивость к пониженным температурам и неоплазмам, в 10-й и 16-й линиях Русской белоснежной популяции наблюдается выраженная генетическая дивергенция. Значение генетического расстояния между этими линиями D = 0,12 сопоставимо с расстояниями, полученными между разными породами кур. Выявлен маркерный гибридизационный фрагмент ДНК, специфичный для кур породы… Читать ещё >
Содержание
- ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
- 1. 1. Типы последовательностей нуклеотидов в ДНК животных и птиц
- 1. 2. Полиморфизм мини- и -микросателлитных последовательностей ДШС
- 1. 3. Биохимические и молекулярно-генетические подходы к изучению популяций животных и птиц
- 1. 4. Фингерпринтинг ДНК в изучении популяционно-генетического разнообразия в породах и экспериментальных популяциях кур
- ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
- 2. 1. Объект исследования
- 2. 2. Выделение ДНК
- 2. 3. Расщепление (рестрикция) образцов ДНК
- 2. 4. Электрофорез фрагментов ДНК в агарозном геле
- 2. 5. Перенос ДНК с агарозного геля на фильтр
- 2. 6. Прегибридизация и гибридизация ДНК
- 2. 7. Детекция дезоксигенина на фильтрах
- 2. 8. Анализ распределения гибридизационных фрагментов ДНК на фильтрах
- ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
- 3. 1. Оптимизация условий проведения анализа ДНК
- 3. 2. Визуальная оценка распределения гибридизационных фрагментов ДНК
- 3. 3. Маркерные фрагменты ДНК в породах и популяциях кур
- 3. 4. Генетическое разнообразие между породами и популяциями
- 3. 5. Анализ внутрипопуляционного генетического разнообразия в породах и популяциях кур по результатам фингерпринтинга ДНК
- ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
- ВЫВОДЫ
- ПРЕДЛОЖЕНИЯ ПРОИЗВОДСТВУ БИБЛИОГРАФИЧЕСКИЙ УКАЗАТЕЛ
Список литературы
- Адаричев В.А., Корохов Н. П., Остаггчук Я. В., Дымшиц Г. М., Маркель А. Л. Характеристика линий крыс с нормотензивным и типертензивным статусом методом геномного фингерпринтинга // Генетика.-1996.-Т.32.-С. 1669−1672
- Айала Ф. и Кайгер Дж. Современная генетика.-М.:Мир, 1988.-335с.
- Алтухов Ю.П. Внутривидовое генетическое разнообразие: мониторинг и принципы сохранения // Генетика.-1995.-Т.31.-С.1333−1357
- Алтухов Ю.П., Корочкин Л. И., Рычков Ю. Г. Наследственное биохимическое разнообразие в процессах эволюции и индивидуального развития // Генетика.-1996.-Т.32.-С. 1450−1473
- Алтухов Ю.П. Аллозимная гетерозиготность, скорость полового созревания и продолжительность жизни // Генетика.-1998.-Т.34,-С.908−919
- Балдеску Н.Г., Гинскэ и др. Первичное исследование вещественных доказательств и оценка их пригодности для биологической идентификационной экспертизы методом геномной «дактилоскопии» //Суд. мед. эксп.-1990.-Т.4-С.12
- Барышева Е.В., Просняк М. И., Власов М. С. и др. Использование ДНК фага М13 для анализа межиндивидуального полиморфизма ДНК человека на примере изучения популяции г. Краснодара // Генетика.-1989.-Т.25.-С.2079−2081
- Блисковский В.В. Тандемные повторы ДНК в геноме позвоночных: структура, возможные механизмы образования и эволюции // Мол. биол.-1992.-Т.26.-С.965−982
- Борисовский В.А. Проблема збереження та вдосконалення генофонду малочисельних популяцш сшьскогосподарських тварин // I М1жнародна наукова конференщя молодих вчених та спещалшт1в
- Cei i екш й н 0−6 юте x н о л о г i ч н i методи використання генетичного потенщалу сшьскогосподарських тварин". -Кшв, 1994.-С.18
- Брем Г., Кройслих X., Штранцингер Г. Экспериментальная генетика в животноводстве.-М: Перевод на русский язык.-1995.-326с.
- Владыченская Н.С., Мирошниченко Г. П. Развитие представлений о чередовании полинуклеотидных последовательностей в геномах эукариотов // Успехи современной биологии.-1983.-Т.96.-С.196−210
- Гинатулин А.А. Структура, организация и эволюция генома позвоночных.-М.:Наука, 1984.-294 с.
- Глазко В.И. Аллозимная изменчивость в природных популяциях млекопитающих и в условиях их доместикации // Молекулярные механизмы генетических процессов.-М.:Наука, 1990.-С.116−125
- Глазко В.И. Генетические основы породообразования // Материалы конф." Новое в породообразовательном процессе".-Киев, 1993.-С. 125 127
- Глазко В.И., Кириленко С. Д., Созинов А. А. Межлокусные ассоциации некоторых генетико-биохимических систем у крупного рогатого скота //Генетика.-1997.-Т.ЗЗ.-С.512−517
- Глазко В.И., Дунин И М., Глазко Г. В., Калашникова ДА. Введение в ДНК-технологии.- М: ФГНУ Росинформагротех, 2001.-436с.
- Горбачева Н. Сохранить генофонд кур // Птицеводство.-1991.-Т.11,-С.6−8
- Горбачева Н. Породы кур и их содержание в приусадебном хозяйстве.-М: Изд-во «Искусство и мода», 1993.-143с.
- Дементьева Н.В. Оценка полиморфизма минисателлитных ДНК у коров, кур и осетровых рыб: Автореф. дис.канд. биол. наук.-СПб-Пушкин, 1996.-14с.
- Демидова И.А., Сурин B.JT., Менделеева Л. П., Савченко В. Г. Амплификация гипервариабельных участков генома для установления типа гемопоэза у больных гемобластозами после аллогенной трансплантации костного мозга// Генетика.-1997.-Т.ЗЗ.-С.546−549
- Дмитриев В.Б. Гормональный фактор в микроэволюционном процессе и селекции животных// С.-х. биология.-Т.2.-С. 18−30
- Дмитриев В.Б. Способ создания популяции животных с определенным уровнем функциональных резервов надпочечников: Патент на изобретение № 2 157 624.-1999
- Завертяев Б.П. Краткий словарь селекционно-генетических терминов в животноводстве.-М.: Россельхозиздат, 1983.-108 с.
- Зиновьева Н.А., Попов А. Н., Эрнст JI.K. и др. Методические рекомендации по использованию метода полимеразной цепной реакции в животноводстве.-Дубровицы, 1998.-47с.
- Иванов П.Л., Гуртовая С. В., Плаксин В. О. и др. Геномная «дактилоскопия» с использованием в качестве зонда бактериофага М13 (экспертиза вещественных доказательств и идентификация личности) // Суд. мед. эксп.-1989.-Т.4.-С.39−42
- Иванов П.Л., Гуртовая С. В., Вербовая Л. В. и др. Геномная «дактилоскопия» в экспертизе спорного отцовства и определении биологического родства//Суд. мед. эксп.-1990.-Т.2.-С.36−38
- Иванов П.Л., Вербовая Л. В., Гуртовая С. В. Применение геномной «дактилоскопии» для диагностики монозиготности близнецов // Суд. мед. эксп.-1991.-Т.1-С.32−33
- Иванов П.Л. Молекулярно-генетическая индивидуализация человека // авт.док.дисс.-М.-1995.-57 с.
- Инге-Вечтомов С. Г. Генетика с основами селекции.-М.: Высшая школа, 1989.-591 с.
- Каримов К.К., Гинтовт В. Е., Паронян И. А., Изотова З. И. Межпородные различия и группоспецифические особенностигенофондных популяций кур по антигенным факторам крови // Бюлл. ВНИИРГЖ.-1983.-В.63.-С.31−34
- Колесник О.В., Смарагдов М. Г., Босак Н. П., Николаева Е. К., Дмитриев В. Б., Смирнов А. Ф. Использование RAPD-маркеров для оценки дивергенции геномов у кур при разнонаправленной селекции // Сборник научных трудов ВНИИГРЖ.-2001.-С.173−176
- Костюченко М.В., Удина И. Г., Зайцев A.M., Храброва Л. А., Сулимова Г. Е. ДНК-технологии для оценки генетического разнообразия пород лошадей отечественной селекции // С.-х. биология.-2001.~Т.6.-С.29−34
- Кравцова Е. Е, Бавин В. Г., Коваленко С. А., Тыщенко В. И., Терлецкий
- B.П. Изучение дивергенции пород кур // Материалы конференции «Новое в породообразовательном процессе», 25−26 февраля, — Киев, 1993, — С. 152.
- Кривенко А.А., Филипенко М. Л., Адаричев В. А. и др. Анализ косегрегации полиморфных ДНК-маркеров с величиной артериального давления у крыс гипертензивной линии НИСАГ // Генетика. 1999.-Т.35.-С.164−169
- Медников Б.М., Банникова А. А., Ломов А. А., Мельникова М. Н., Шубина Е. А. Рестриктазный анализ повторяющейся ядерной ДНК, критерий вида и механизм видообразования // Мол.Биол.-1995.-Т.6.~1. C.1308−1319
- Моисеева И.Г., Банникова Л. В., Алтухов Ю. П. Состояние птицеводства в России: генетический мониторинг // Междунар. С.-х. журн.-1993.-Т.5−6.-С.66−69
- Моисеева И.Г. Генетические ресурсы куроводства в России // Птицеводство.-1995.-Т.5.-С. 12−15
- Моисеева И.Г. и Лисичкина М.Г. Происхождение и эволюция домашних кур // Природа,-1996.-Т.5.-С.88−96
- Моисеева И.Г., Лисичкина М. Г., Никифоров А. А. История куроводства в России // Природа.-1997.-Т.1.-С.71−80
- Моисеева И.Г. и Лисичкина М.Г. Домашние куры: мифология, традиции, обычаи, народное творчество // Друг.-1997.-Т.1.-С.22−25
- Мустафина О.Е., Туктарова И. А., Бикмеева A.M., Насибуллин Т. Р., Хуснутдинова Э. К. Исследование полиморфизма гена аполипопротеина Е в популяциях Волго-Уральского региона // Генетика.-2001.-Т.37.-С.558−562
- Никифоров А.А., Моисеева И. Г., Захаров И. А. Место русских пород кур в разнообразии пород Евразии // Генетика.-1998.-Т.34.-С.850−851
- Никифоров А.А. Вероятные пути распространения генов домашней курицы из Азии в Россию: анализ геногеографических исследований А. С. Серебровского // Генетика.-1999.-Т.35.-С. 1396−1406
- Петров С.Г. Происхождение и эволюция сельскохозяйственной птицы // Сельскохозяйственная птица.-1962.-Т.1.-С. 125−144
- Петухов В.Л., Эрнст Л. К., Гудилин И. И. и др. Генетические основы селекции животных.-М.:Агропромиздат, 1989.-273с.
- Подоба Б.Е., Ефименко М. Я., Хаврук А. Ф., Цилуйко Г. А. Принципы применения генетических маркеров при формировании структуры создаваемых пород крупного рогатого скота// Материалы конф." Новое в породообразовательном процессе".-Киев, 1993.-С.138−139
- Потапов С.Г., Токарская О. Н., Семенова С. К., Данилкин А. А., Марков Г. Г., Рысков А. П. Диагностические возможности мультилокусных маркеров ДНК в систематике диких копытных животных (Artiodactyla) // Генетика.-1997.-Т.ЗЗ.-С.961−966
- Родионов А.В., Соловей И. В., Макгрегор Г. Интерстициальные сайты консервативной теломерной последовательности (TTAGGG)n в хромосомах птиц отряда Galliformes // Международный симпозиум
- Молекулярная генетика и биотехнология в оценке и изменении геномов сельскохозяйственных животных". -СПб-Пушкин. -1994. -С.92
- Рысков А.П., Джинчарадзе А. Г., Просняк М. И. и др. Геномная «дактилоскопия» организмов различных таксономических групп: использование в качестве гибридизационной пробы ДНК фага М13 // Генетика, — 1988а.-Т.24.-С.227−238
- Рысков А.П., Токарская О. Н., Вербовая J1.B. Геномная «дактилоскопия» микроорганизмов: использование в качестве гибридизационного зонда ДНК фага М13 // Генетика.-1988б.-Т.24.-С.1310−1313
- Сахарова С.А. Совершенствование методов сохранения генофонда малочисленных пород кур в условиях коллекционария «Канд. дисс., СПб-Пушкин. -1992. -124с.
- Семёнова С.К., Филенко A.JL, Васильев В. А., Просняк М. И., Севастьянов А. А., Рысков А. П. Использование полиморфных маркеров ДНК для идентификации пород кур различного происхождения // Генетика.-1996.-Т.32.-С.795−803
- Симоненко ВН. Микросателлитные последовательности (TG)n-THna генома крупного рогатого скота: Автореф. дисс.канд. биол. наук.-Боровск, 2001.-26с.
- Соколова А.Н. Генетико-селекционные методы создания популяции кур с повышенной устойчивостью к неоплазмам: Автореф. дис.докт. с.-х. наук.-СПб-Пушкин, 1999.-56с.
- Сулимова Г. Е., Удина И. Г., Шайхаев Г. О., Захаров И. А. Полиморфизм ДНК в гене BoLA-DRB3 у крупного рогатого скота в связи с устойчивостью и чувствительностью к лейкозу // Генетика.-1995,-Т.31.-С.1294−1299
- Сулимова Г. Е., Бадагуева Ю. Н., Удина И. Г. Полиморфизм гена каппа-казеина в популяциях подсемейства Bovinae // Генетика.-1996.-Т.32,-С.1576−1582
- Сулимова Г. Е. ДНК-маркеры в оценке молочной продуктивности и резистентности крупного рогатого скота // Материалы III Международной конференции „Актуальные проблемы биологии в животноводстве“. -Боровск.-2000.-С.29
- Султанаева З.М., Викторова Т. В., Асеев М. В., Баранов B.C., Хуснутдинова Э. К. Молекулярно-генетический анализ полиморфизма локуса DXS52 у народов Волго-Уральского региона // Генетика,-2001 .-Т.37.-С.661−667
- Токарская О.Н., Зуев А. В., Сорокин Ф. Г. и др. Геномная дактилоскопия журавлей: новый подход для генотипирования видов // Генетика.-1990.-Т.26.-С.599−606
- Тыщенко В.И., Терлецкий В. П., Дементьева Н. В., Яковлев А. Ф. Изучение породообразовательных процессов и генетическойгетерогенности в популяциях сельскохозяйственных животных на основе анализа ДНК // Сб. науч. тр. ВНИИГРЖ.-С.-Пб., 2001.-С.161−168.
- Удина И.Г., Туркова С. О., Костюченко М. В., Лебедева Л. А., Сулимова Г. Е. Полиморфизм гена пролактина (микросателлиты, ПЦР-ПДРФ) у крупного рогатого скота // Генетика.-2001.-Т.37.-С.511−516
- Уфыркина О.В., Васильев В. А., Крюков А. П., Рысков А. П. Геномная дактилоскопия ворон: изучение генетической структуры популяций гибридной зоны // Генетика.-1995.-Т.7.-С.883−888
- Фёдоров А.Н., Гречко В. В., Слобянюк С. Л., Фёдорова Л. В., Тимохина Г. И. Таксономический анализ повторяющихся последовательностей ДНК // Мол. Биол.-1992.-Т.26.-С.464−469
- Эрнст Л.К., Дмитриев Н. Г., Паронян И. А. и др. Генетические ресурсы сельскохозяйственных животных в России и сопредельных странах.-СПб.: ФАОЯОНЕП и РАСХН, 1994.-472
- Эрнст Л.К., Сулимова Г. Е., Орлова А. Р., Удина И. Г., Павленко С. П. Особенности распространения антигенов BoLA-A и аллелей гена BoLA-DRB3 у черно-пестрого скота в связи с ассоциацией с лейкозом // Генетика.-1997.-Т.ЗЗ.-С.87−95
- Эрнст Л.К., Чабан И. М. Влияние трансгенеза на биологические и хозяйственно-полезные признаки свиней.-Москва, 2001.-141с.
- Челомина Г. Н., Павленко М. В., Картавцева И. В., Боескоров Г. Г., Ляпунова Е. А., Воронцов Н. Н. Генетическая дифференциация лесных мышей Кавказа: сравнение изозимной, хромосомной и молекулярной дивергенции // Генетика.-1998.-Т.34.-С.213−225
- Чуркина И.В. Полиморфизм ТГ-обогащенной микросателлитной ДНК домашней курицы (Gallus domesticus): Диссертация.канд. биол. наук, СПб-Пушкин, 1999.-137с.
- Шевелуха B.C., Калашникова Е. А., Дегтярев С. В., Кочиева Е. З., Прокофьев М. И., Новиков Н. Н., Ковалев В. М., Калашников Д. В. Сельскохозяйственная биотехнология // М.: Высшая школа, 1998.-181с.
- Шмидт Т.Ю. Изучение полиморфизма микросателлитных маркеров шестой и девятой хромосом крупного рогатого скота черно-пестрой породы: Автореф. дисс.канд. биол. наук.-Боровск, 2001.-24с.
- Щинов М.Ю. и Букаров Н.Г. Молекулярно-генетические аспекты выявления QTL маркеров на 6 хромосоме крупного рогатого скота // Материалы III Международной конференции „Актуальные проблемы биологии в животноводстве“. -Боровск.-2000.-С.29
- Ajmone-Marsan P., Valentini A., Cassandro М., Vecchiotti-Andaldi G., Bertoni G., Kuiper M. AFLP markers for DNA fingerprinting in cattle // Anim. Genet.-1997.-V.28.-P.418−426
- Ali S., Mailer C.R., Epplen J.T. DNA fingerprinting by oligonucleotide probes specific for simple repeats // Human Genetics.-1986.-V.74.-P. 239−243
- Allen R.W., Wallhermfechtel M» Miller W.V. The application of restriction fragment length polymorphism mapping to parentage testing // Transftision.-1990.-V.30.-P.552−564
- Allen R.W., Wallhermfechtel M., Miller W.V. The application of restriction fragment length polymorphism mapping to parentage testing // Transfusion.-1990.-V.30.-P.552−564
- Astrin S.M., Buss E.G., Haywards W.S. Endogenous viral genes are nonessential in the chicken // Nature.-l 979.-V.282.-P.339−341
- Awedimento V.E. Sequence organization of porcine DNA // Nucl. Acids Res.-1976, — V.3.-P.2491−2505
- Bell G., Selby M., Rutter J. The highly polymorphic region near the human insulin is composed of simple tandemly repeating sequences // Nature.-1982.-V.295.-P.31−35
- Bernardi G., Olofsson В., Filipski J., Zerial M., Salinas J. The mosaic genome of warm-blooded vertebrates // Science.-1985.-V.228.-P.953−958
- Bernardi G. The human genome: organization and evolutionary history // Annu.Rev.Genetics.-1995.-V.29.-P.445−476
- Bettink S., Wullich В., Christmann A., Zwergel Т., Zang K.D., Unteregger G. Genetic heterogeneity of prostatic carcinoma-derived cell lines as emphasized by DNA fingerprinting // Electrophoresis.-1992.-V.13.-P. 644−646
- Blackburn E.H. Telomerases // Annu.Rev.Biochem.-1992.-V.61.-P.l 13 129
- Blanchelot A. Genetic relatedness in honeybees as established by DNA flngeфrinting//J. of Heredity.-1991.-V.82.-P.391−396
- Breen M., Downs P. et al. Intrageneric amplification of horse microsatellite markers with emphasis on the Przewalski’s horse (E. Przewalskii) Anim. Genet.-1994.-V.25.-P.401−405
- Britten R.J. and Kohne D.E. Repeated sequences in DNA // Science.-1968.-V. 161.-P. 529−540
- Brock M.K. and White B.N. Application of DNA fingerprinting to the recovery program of the endangered Puerto Rican parrot // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1997.-V.89.-P. 11 121−11 125
- Bruford M.W., Burke T. Hypervariable DNA markers and their applications in the chicken// In: DNA fingerprinting approaches and applications.-Basel, 1991,-Birkhouser Verlag.- P.230−240
- Buitkamp J., Ammer H., Gelderman H. DNA fingerprinting in domestic animals // Electrophoresis.-1991.-V.12.-P.169−174
- Cepica S., Wolf J., Hojny J., Vackova I., Schroffel J Jr. Relations between genetic distance of parental pig breeds and heterozygosity of their F1 crosses measured by genetic markers // Anim. Genet.-1995.-V.26.-P. 135 140
- Charles D. Courtroom battle over genetic fingerprinting // New scientist.-1992.-V.1817.-P.10
- Cohen J.E. DNA fingerprinting for forensic identification: potential effects on data integration of subpopulation heterogeneity and band number variability // Am. J. Human Genet.-1990.-V.46.-P.358−368
- Davidson E.H. Comparative aspects of DNA organization in Metazoa // Chromosoma.-1975.-V.51.-P.253−259
- Davidson E.H. and Britten R.J. Organization, transcription and regulation in animal genome // Quart.Rev.Biol.-1973.-V.48.-P.565−613
- Dodgson J.B., Cheng H.H., Okimoto R. DNA marker technology: a revolution in animal genetics // Poult.Sci.-1997.-V.76.-P.l 108−1114
- Dolf G., Schlapfer J., Hagger C., Stranzinger G., Gaillard C. Quantitative traits in chicken associated with DNA fingerprint bands // EXS.-1993.-V.67.-P.371−377
- Dunnington E.A. et al. DNA fingerprints of chickens selected for high and low body weight for 31 generations // Anim.Genet.-1990.-V.21.-P.247−257
- Ellegren H., Chowdhary В., Johansson M. et al. A primary linkage map of the porcine genome reveals a low rate of genetic recombination // Genetics.-1994.-V.137.-P.1089
- Epplen C., Epplen J.T. Expression of (cac)n/(gtg)n simple repetitive sequences in mRNA of human lymphocytes // Hum.Genetics.-1994.-V.93.-P.35−41
- Ezzel C. Panel of DNA fingerprints in court cases // Science News.-1992.-V.141.-P.261
- Galan G.A. Evolution of the repetitive and non-repetitive DNA // In: Molecular evolution. Sanderland, MA, Sinauer Assoc., 1976.-P.200−224
- Galeotti P., Pilastro A., tavecchia G., Bonetti A., Congiu L. Genetic similarity in long-eared owl communal winter roots: a DNA fingerprinting study // Mol. Ecol.-1997.-V.6.-P.429−435
- Gavora J.S., Fairfull R.W., Benkel B.F. DNA fingerprints as predictors of heterosis //Proceedings 42nd National breeders Rountable, St.Louis.-1993.-P.62−76
- Gavora J.S., Fairfull R.W., Benkel B.F., Cantwell W.J., Chambers J.R. Prediction of heterosis from DNA fingerprints in chickens // Genetics.-1996.-V. 144.-P.777−784
- Gilbert D.A., Lehman N., O’Brien S.J., Wayne R.K. Genetic fingerprinting reflects population differentiation in the California Channel Island fox // Nature.-1990a.-V.344.-P.764−767
- Gilbert D.A., Parker C., Pusey A.E., Stephens J.C., O’Brien S J. Analytical DNA fingerprinting in lions: parentage, genetic diversity, and kinship // J. Hered.-1991.-V.82.-P.378−386
- Gill P. Forensic application of DNA fingerprints // Nature.-1986.-V.318,-P.577−579
- Glavae D., Dean M. SSCP analysis in detection of DNA polymorphism in Alu I-like DNA sequences // Human Mutation.-1992.-V.2.-P.404
- Grimaldi M.C. and Crouau-Roy B. Microsatellite allelic homoplasy due to variable flanking sequences // J. Mol. Evol.-1997.-V.44.-P.336−340
- Grobet L., Charlier C., Hancet R. DNA fingerprints and leukochimerism in bovine dizygotic twins // Ann. Med. Vet.-1991.-V.135.-P.353−359
- Grobet L., Charlier C., Schwers A., Hancet R. Detection of freemartinism by means of DNA fingerprints and a bovine Y-specific probe // Ann. Med. Vet.-1992.-V.136.-P.41−49
- Grunder A., Sabour M., Gavora J. Estimates of relatedness and inbreeding in goose strains from DNA fingerprints // Anim. Genet.-1994.-V.25.-P.81−88
- Haberfeld A., Dunnington E.A., Siegel P.B., Hillel J. Heterosis and DNA fingerprinting in chickens // Poultry Science.- 1996.-V.75.-P.951−953
- Hanotte О. et al. Minisatellite loci as genetic markers in the chicken genome I I Anirn. Genet.-1994.-V.25.-P.48
- Havenstein G.B., Toelle Y.D., Towner R.H., Emsley A. Effects of genetic strain, slow versus rapid-feathering maternal genotype, and cage density on the performance of Single Comb White Leghorns // Poult.Sci.-1989.-V.68,-P.596−607
- Healy P.J., Dennis J.A., Nickols P.J., Reichmann K.G. Hemeropoetic chimerism: a complication in heterozygote detection tests for inherited defects in cattle // Anim. Genet.-1994.-V.25.-P.l-6
- Hedenskog M., Sjogren M., Cederberg H., Rannug U. Induction of germline-length mutations at the minisatellites PC-1 and PC-2 in male mice exposed to polychlorinated biphenyls and diesel exhaust emissions // Environ. Mol. Mutagen.-1997.-V.30.-P.254−259
- Hillel J., Gal O., Schaap Т., Haberfeld A., Plotsky Y" Marks H., Siegel P.В., Dunnington E.A., Cahaner A. Genetic factors accountable for line-specific DNA fingerprint bands in quail // EXS.-1991.-V.58.-P.263−273
- Hohenhorst J., Strazinger C. Use of microsatellites for parentage control in pigs // Anim. Genet.-1994.-V.25.-P.25
- Holland C.A. Sequence complexity of nuclear and messenger RNA in Hela cells // J.Mol.Biol.-1980.-V. 138.-P.755−778
- Hubner G., Battmer K., Link H. DNA fingerprint analysis in acute leukemias // Leuk. Lymphoma.-1995.-V.l7.-P.27−33
- Inoue M. et al. Isolation of polymorphic microsatellite loci from Japanese black cattle and their application to individual identification // Anim. Genet.-1994.-V.25.-P.144
- Jeffreys A.J., Wilson V., Thein S.L. Hypervariable minisatellite region in human DNA I I Nature.-1985a.-V.314.-P.67−73
- Jeffreys A.J., Wilson V., Thein S.L. Individual-specific «fingerprints» of human DNA //Nature.-1985b.-V.316.-P.76−78
- Jeffreys A.J., Wilson V., Kelly R. Mouse DNA fingerprints analysis of chromosome localization and germ-line stability of hypervariable loci in recombinant inbred strains // Nucl. Acid Res.-1987.-V.l 5.-P.2823−2836
- Jeffreys A.J., Royle N.J., Wilson V., Wong Z. Spontaneous mutation rates to new length alleles at random-repetitive hypervariable loci in human DNA // Nature.-1988.-V.332.-P.278−281
- Jeffreys A.J., Bois P., Buard J., Collick A., Dubrova Y. et al. Spontaneous and induced minisatellite instability // Electrophoresis.-1997.-V. 18.-P.1501−1511
- Jin L., Chakraborty R. Estimation of genetic distance and coefficient of gene diversity from single-probe multilocus DNA fingerprinting data // Mol. Biol. Evol.-1994.-V. 11.-P. 120−127
- Jones C.J., Edwards K.J., Castiglione S. et al. Reproducibility testing of RAPD, AFLP and SSR markers in plants by a network of European laboratories // Mol. Breeding.-1997
- Joshi A.R., Sinha S., Dil-Afroz, Sulaiman I.M., Banerji A.K., Hasnain S.E. Alterations in brain tumor DNA detected by a fingerprinting probe // Indian J. Biochem. Biophys.-1996.-V.33.-P.455−457
- Kadi F., Mouchiroud D., Sabeur G., Bernardi G. The compositional patterns of the avian genomes and their evolutionary implications // J.Mol.Evol.-1993.-V.37.-P.544−551
- Kashi Y., Lipkin E., Darvasi A., Nave A., Gruenbaum Y., Beckmann J. S., Soller M. Parentage identification in the bovine using DNA fingerprints // Dairy Sci.-1990.-V.73.-P.3306−3311
- Kashi Y., Nave A., Gruenbaum Y., Soller M., Beckmann J.S. A minisatellite from bovine which produces highly polymorphic DNA fingerprinting patterns in mammals and chickens // Anim. Genet.-1992.-V.23.-P.570
- Khandka D.K., Tuna M., Tal M., Nejidat A., Golan-Goldhirsh A. Variability in the pattern of random amplified polymorphic DNA // Electrophoresis.-1997.-V. 18.-P.2852−2856
- Kuhnlein U., Dawe Y., Zadvorny D., Gavora J.S. DNA fingerprinting: a tool for determining genetic distances between strains of poultry // Theor. Appl. Genet.-1989.-V.77.-P.669−672
- Kuhnlein U., Zadvorny D., Gavora J.S. Faithful identification of markers associated with quantitative trait loci in chickens by DNA fingerprinting // In: DNA fingerprinting approaches and applications.-Basel, 1991,-Birkhouser Verlag.- P.274−282
- Laber T.L., Iverson J.T., Liberty J.A., Giese S.A. The evaluation and implementation of match criteria for forensic analysis of DNA // J. Forensic Sci.-1995.-V.40.-P. 1058−1064
- Lamont S.J., Lakshmanan N., Plotsky Y., Kaiser M.G., Kuhn M., Arthur J.A., Beck N.J., O’Sullivan N.P. Genetic markers linked to quantitative traits in poultry // Anim. Genet.-1996.-V.l .-P. 1−8
- Levin I., Cahaner A. Classical and novel approaches in poultry breeding // Proceedings 9th European Poultry Conference, Glasgo.-1994a.-P.39−44
- Levin I., Crittenden L.B., Dodgson J.B. Mapping DNA polymorphisms using PCR primers derived from the sequence of an avian CRI element // J.Heredity.-1994b.-V.85.-P.73−78
- Lynch M. Analysis of population genetic structure by DNA fingerprinting // In: «DNA fingerprinting: approaches and applications».-Basel, 1991-Birkhauser Verlag.-P. 113−126
- Macaya G., Cortadas J., Bernardi G. An analysis of the bovine genome by density gradient centryfugation // Eur.J.Biochem.-1978.-V.84.-P. 179−188
- MacPherson J.M., Eckstein P.E., Scoles G.J., Gajadhar A.A. Variability of the random amplified polymorphic DNA assay among thermal cyclers, and effects of primer and DNA concentration // Mol. Cell Probes.-1993.-V. 7,-P.293−299
- Manning J.E. Interspersion of repetitive and non-repetitive DNA sequences in the Drosophila melenogaster genome // Cell.-1975.-V.4.-P. 141−155
- Mathe J., Eisenmann C., Seitz A. Paternity testing of endangered species of birds by DNA fingerprinting with non-radioactive labelled oligonucleotide probes // EXC.-1993.-V.67.-P.387−393
- Mathur P.K., Ponsuksili S., Groen A.F., Horst P. Estimation of genetic variability within and between populations using DNA fingerprints // Proceedings 5th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production.-Guelph.-1994.-P.528−531
- Matsumura Y., Tarin D. DNA fingerprinting survey of various human tumors and their metastases // Cancer Res.-1992.-V.52.-P.2174−2179
- Meng A., Gong G., Chen D., Zhang H" Qi S., Tang H., Gao Z. DNA fingerprint variability within and among parental lines and its correlation with performance of F-l laying hens // Theor. Appl. Genetics.-1996.-V. 92.-P.769−776
- Meyer E. Microsatellite polymorphisms reveal phylogenetic relationships in primates // J.Mol.Evol.-1995.-V.41.-P.10−14
- Miller C., Bruford M.W., Burke T. Hypervariable markers in the chicken genome // J. Cell Biochem.Suppl.E.-1991.-P.207
- Moran C. Microsatellite repeats in pig (Sus domestica) and chicken (Gallus domesticus) // J. of Heredity.-1993.-V.84.-P.274−280
- Moyzis R.K. An alternative view of mammalian DNA sequence organization. 1. Repetitive sequence interspersion in Syrian hamster DNA: a model system // J.Mol.Biol.-1981.-V.153.-P.841−870
- Myers L.E., Silva P. S., Procunier J.D., Little P.B. Genomic fingerprinting of Haemophilus-somnus isolates by using a random-amplified polymorphic DNA assay // Clin. Microbiol.-1993.-V.31.-P.512−517
- Naish K.A., Warren M., Bardakci F., Skibinski D.O., Carvalho G.R., Mair G.C. Multilocus DNA fingerprinting and RAPD reveal similar genetic relationships between strains of Oreochromis niloticus (Pisces: Cichlidae) //Mol.Ecol.-1995.-V.4.-P.271−274
- Nakamura Y., Leppert M., O’Connel P. Variable number of tandem repeat (VNTR) markers for human gene mapping // Science.-1987.-V.135,-P.1616−1622
- Nakamura M., Konishi N., Tsunoda S., Hiasa Y., Tsuzuki Т., Aoki H., Kobitsu K., Nagai H., Sakaki T. Analysis of human gliomas by restriction landmark genomic scanning// J. Neurooncol.-1997.-V.35.-P.l 13−120
- Novikov L.V., Kalinovsky V.P., Henson K.P. Method of DNA fingerprinting for determination of structural peculiarities of human genomic DNA//In: Biotechnology.-St.-Petersburg, 1994.-P.83−84
- Nurnberg P., Marczinek K., Thiel G., hampe J. Parallel genome analysis by one- and two-dimentional DNA fingerprinting in human gliomas // Electrophoresis.-1995.-V.16.-P. 1715−1725
- Okada N., Hamada M., Ogiwara L, Ohshima K. SINEs and LINEs share common 3' sequences: a review//Gene.- 1997.-V.205.-P.229−243
- Papiha S.S. and Sertadaki A. Oligonucleotide (CAC)5 fingerprinting: validity and reliability in paternity testing // Electrophoresis.-1995.-V.16,-P.1624−1626
- Parkin D. The use of genetic fingerprinting in the study of animal population // J. Zoology.-1989.-V.217.-P.351−353
- Penner G.A., Bush A., Wise R., Kim W., Domier L., Kasha K., Laroche A., Scoles G., Molnar S.J., Fedak G. Reproducibility of random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis among laboratories // PCR Methods Appl.-1993.-V.2.-P.341−345
- Pitra С. An assessment og inbreeding in asian wild horse (Equus Przewalskii Polakov, 1881) populaytions using DNA fingerprinting // Anim.Res.Develop.-1997.-V.45.-P.28−36
- Plante Y., Schmutz S.M., Lang K.D.M., Moker J.S. Detection of leukochimerism in bovine twins by DNA fingerprints // Anim. Genet.1992.-V.23.-P.295−302
- Plotsky Y. et al. Analysis of genetic association between DNA fingerprint bands and quantitative traits using DNA mixes // Proc. 4-th WCGALP, XI1I.-1990.-P. 133−138
- Plotsky Y., Cahaner A., Haberfeld A. et al. DNA fingerprint bands applied to linkage analysis with quantitative trait loci in chickens // Anim. Genet.1993.-V.24.-P.105−110
- Rogstad S.H., Pelican S. GELSTATS: a computer program for population genetics analysis using VNTR multilocus probe data // BioTechniques.-1996.-V.-21.-P.1128−1131
- Rothuizen J. and van Wolferen M. Randomly amplified DNA polymorphisms in dogs are reproducible and display Mendelian transmission // Animal Genetics.-1994.-V.25.-P.13−18
- Schneider-Stock R., Gunther Т., Roessner A., Epplen J.T. Somatic DNA alterations in breast carcinomas of different lymph-node status by DNA fingerprint analeses // Cancer Genet. Cytogenet.-1998.-V.103.-P.149−154
- Schwaiger F.M., Gomolka M., Geldermann H., Zischler H., Buitcamp J., Epplen J.Т., Ammer H. Oligonucleotide fingerprinting to individualize ungulates//Appl. Theor. Electrophor.-1992.-V.2.-P.193−200
- Sertadaki A. and Lindsay S. CAC the neglected repeat // BioEssays.-1996.-V.18.-P.237−242
- Sharma D., Appa Rao K.B., Singh R.V., Totey S.M. Genetic diversity among chicken breeds estimated through randomly amplified polymorphic DNA // Anim. Biotechnol.-2001.-V.2.-P.l 11−120
- Shriver M.D. Origins and evolution of VNTR loci: the apolipoprotein B3' VNTR // Ph. D Thesis.-1993.-University of Texas -Houston
- Singer M.F. SINEs and LINEs: highly repeated short and long interspersed sequences in mammalian genomes // Cell.-1982.-V.28.-P.433−434
- Smith J.C. et al. Highly polymorphic minisatellite DNA probes: further evaluation for individual identification and paternity testing // J. Foren. Sci.Soc.-1990.-V.30.-P.3−18
- Sreekumar G.P., Smyth J.R.Jr., Ponce de Leon F.A. Molecular characterization of the Smyth chicken sublines and their parental controls by RFLP and DNA fingerprint analysis // Poult.Sci.-2000.-V. 1 .-P. 1−5
- Stephens J.C., Gilbert D.A., Yuhki N., O’Brien S.J. Estimation of heterozygosity for single-probe multilocus DNA fingerprints // Mol. Biol. Evol.-1992.-V.9.-P.729~743
- Supowit S.C. and Rosen J.M. Gene expression in normal and neoplastic mammary tissue // Biochemistry.-1980.-V. 19.-3452−3460
- Tegelstrom H. and von Essen L. DNA fingerprinting of captive breeding pairs of lesser white-fronted geese (Anser erythropus) with unknown pedigrees //Biochem. Genet.-1996.-V.34.-P.287−296
- Terletski V.P., Falge R.,. Carnwath J. W,. Niemann H. Genetische variabilitat in herden des gefahrdeten Leineschafes // Stocarstvo.- 1997.-V.51.- P.427−437
- Thomsen P.D. and Miller J.R. Pig genome analysis: differential distribution of SINE and LINE sequences is less pronounced than in the human and mouse genomes // Mamm.genome.-1996.-V.7.-P.42−46
- Tixier-Boichard M. Genetic diversity of endogenous viral genes related to avian leukosis viruses and possible association with performance // Proceed. 11-th Int.Symp.Current problems in avian genetics.-1995.-Krakov.-P.10−13
- Trommelen G.J.M., Den Daas J., Vijg J., Vitterlinden A. DNA profiling of cattle using micro-and minisatellite core probes // Animal Genetics.-1993a.-V.23.-P.235−241
- Vanhala Т., Elo К., Tuiskula-haavisto M. Microsatellite DNA variation within and among chicken lines // proc. 11th Int. Symp. «Current problems in avian genetics"-Krakow.-1995.-P. 18−19
- Viard F., Franck P., Dubois M.P., Estoup A., Jarne P. Variation of microsatellite size homoplasy across electrromorphs, loci, and populations in three invertebrate species // J.Mol.Evol.-1998.-V.47.-P.42−51
- Vos P., Hogers R., Bleeker M., Reijans M., van de Lee Т., Homes M., Frijters A., Pot J., Peleman J., Kuiper M. et al. AFLP: a new technique for DNA fingerprinting // Nucl. Acid Res.-1995.-V.23.-P.4407−4414
- Watson J.D. and Crick F.H. Molecular structure of nucleic acids: a structure for desoxyribonucleic acid // Nature.-1953.-V.171.-P.737−738
- Weigend S. and Romanov M.N. Current strategies for the assessment and evaluation of genetic diversity in chicken resources // World’s Poultry Science.-2001.-V.3.-P.275−288
- Welsh J. and McCleland G.M. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers // Nucl. Acids Res.-1990.-V.l8.-P.7213−7218
- Williams J.G.K., Kubelik A.R., Livak K.J., Rafalski J.A., Tingey S.V. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers //Nucl. Acid Res.-1990.-V.18.-P.6531−6535
- Wong A.K., Yee H.A., van de Sande J.H., Rattner J.B. Distribution of CT-rich tracts is conserved in vertebrate chromosomes // Chromosoma.-1990.-V.99.- P.344−351
- Wyman A. and White J. Hypervariable regions in the genomes contain tandem repeats of short DNA sequences // Proc.Nat.Acad.Sci.USA.-1980.-V.77.-P.6754.
- Yamashita H., Okamoto S., Maeda Y., Hashiguchi T. Genetic relationships among domestic and jungle fowls revealed by DNA fingerprinting analysis // Japanese Poultry Science.-1994.-V.31.-P.335−344
- Yauk C.L., Quinn J.S. Multilocus DNA fingerprinting reveals high rate of heritable genetic mutation in herring gulls nesting in an industrialized urban site // Proc.Nat.Acad.Sci.USA.-1996.-V.93.-P.12 137−12 141 141
- Yauk С. L., Fox G.A., McCarry B.E., Quinn J.S. Induced minisatellite germline mutations in herring gulls (Larus argentatus) living near steel mills // Mutat. Res.-2000.-V.452.-P.211−218
- Ye X., Zhu J., Velleman S.G., Nestor K.E. Genetic diversity of commercial turkey primary breeding lines as estimated by DNA fingerprinting // Poult. Sci.-1998a.-V.77.-P.802−807
- Ye X., Zhu J., Velleman S.G., Bacon W.L., Nestor K.E. Measurement of genetic variation within and between Japanese quail lines using DNA fingerprinting // Poult. Sci.-1998b.-V.77.-P.1755−1758
- Zhu J., Nestor K.E., Moritsu Y. Relationship between band sharing levels of DNA fingerprints and inbreeding coefficients and estimation of true inbreeding in turkey lines // Poult. Sci.-1996.-V.75.-P.25−28