Помощь в учёбе, очень быстро...
Работаем вместе до победы

Применение молекулярного маркирования для повышения эффективности селекции риса

Диссертация: Применение молекулярного маркирования для повышения эффективности селекции риса
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Апробация работы. Основные положения диссертационной работы доложены и одобрены на заседаниях методического совета ВНИИ риса в 2006;2009 гг., а также были представлены на V Московском международном конгрессе (Москва 16−19 марта 2009 г), IX молодежной научной конференции (Москва, 8 апреля 2009 г.). Применение молекулярных маркеров, тесно сцепленных с генами широкого спектра устойчивости… Читать ещё >

Содержание

  • 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
    • 1. 1. Культура риса Orisa sativa L
    • 1. 2. Изучение генома риса
    • 1. 3. Проблема пирикуляриоза риса
    • 1. 4. Генетика устойчивости риса к патогену
    • 1. 5. Молекулярные маркеры: понятие и основные виды
    • 1. 6. Маркерная селекция для выведения новых сортов риса
    • 1. 7. Гены устойчивости к пирикуляриозу риса
      • 1. 7. 1. Гены широко спектра устойчивости к патогену Pi-1 и P
      • 1. 7. 2. Ген Pi-ta — один из эффективных генов устойчивости риса к пирикуляриозу в Краснодарской зоне рисосеяния
  • 2. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ
    • 2. 1. Исходный материал для серии возвратных скрещиваний
    • 2. 2. Исходный материал для поиска доноров устойчивости к пирикуляриозу риса
    • 2. 3. Подготовка растительного материала и экстракция ДНК
    • 2. 4. Молекулярные маркеры, использованные в работе
    • 2. 5. Разработка кодоминантной ДНК-маркерной системы
    • 2. 6. Постановка полимеразной цепной реакции и электрофореза продуктов амплификации
    • 2. 7. Гибридизация растений риса
    • 2. 8. Оценка устойчивости риса к пирикуляриозу
  • 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
    • 3. 1. Создание внутригенной кодоминатнтной ДНК — маркерной системы гена устойчивости к пирикуляриозу риса Pi-ta
    • 3. 2. Поиск доноров устойчивости к пирикуляриозу рисас помощью кодоминантной ДНК-маркерной системы гена устойчивости к пирикуляриозуРг-ta
    • 3. 3. Проверка линии С101-Lac на устойчивость к местной популяции пирикуляриоза
    • 3. 4. Программа пирамидирования генов широкого спектра устойчивости к пирикуляриозу Pi-1 и Pi-ЗЗ в генетическую плазму отечественного сорта риса Виктория
  • ВЫВОДЫ
  • СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Применение молекулярного маркирования для повышения эффективности селекции риса (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Актуальность проблемы.

Создание новых сортов сельскохозяйственных растений, в том числе и риса, основано на использовании природного или созданного человеком генетического разнообразия. Для отбора растений, несущих хозяйственно ценные признаки, и отслеживания этих признаков в процессе селекции используют легко распознаваемые фенотипические проявления геновмаркеры.

Применение в качестве фенотипических маркеров белковых молекул (изоферменты, запасные белки) — продуктов индивидуальных геновсущественно расширило возможности картирования генов и их мониторинга в селекционном процессе и позволило создать новые методы идентификации и систематизации сортов.

Развитие методов молекулярной биологии, в частности, таких как: рестрикционный анализ, полимеразная цепная реакция (ПНР) — амплификация ДНК, секвенирование ДНК (определение олигонуклеотидной последовательности ДНК) привело к появлению нового класса молекулярно-генетических маркеров — фрагментов ДНК, соответствующих нуклеотидным последовательностям, входящих непосредственно в структуру агрономически важного гена или сцепленных с этим геном.

Возможности ДНК-маркеров во много раз превосходят потенциал изоферментов или запасных белков. Кроме того, проявление таких молекулярных маркеров нейтрально по отношению к фенотипу, не является тканеспецифичным и их можно обнаружить на любой стадии развития растений [38].

Методы ДНК-генотипирования и селекции при помощи молекулярных маркеров (marker assisted selection — MAS) позволяют ускорить перенос хозяйственно ценных генов в процессе селекции и обеспечить создание новых сортов с целым комплексом заданных свойств[39].

Успехи в молекулярной биологии риса (Oryza sativa L.) — благоприятная среда для активного использования маркерных технологий именно для этой культуры. Секвенирование генома риса и клонирование генов позволяют создавать ДНК-маркеры, эффективные в работе практической селекции.

Одним из наиболее вредоносных заболеваний риса на всей территории возделывания, в том числе и России, является пирикуляриоз, вызываемый грибом Pyricularia oryzae Cav. Селекция устойчивых сортов — наиболее эффективный подход борьбы с данной болезнью. В создании устойчивых к пирикуляриозу сортов риса применение ДНК-маркеров может быть полезно как для непосредственного проведения селекции с помощью маркеров, так и для поиска доноров генов резистентности.

Цель и задачи исследований. Целью работы являлась разработка молекулярно-генетических маркеров для идентификации селекционно важных генов и на основе этого создание исходного материала риса, устойчивого к пирикуляриозу.

В проводимых исследованиях были поставлены следующие задачи:

1.Создать внутригенную кодоминантную ДНК-маркерную систему гена устойчивости риса к пирикуляриозу Pi-ta.

2. Провести поиск доноров гена Pi-ta в исходном селекционном материале ВНИИ риса.

3. Осуществить перенос генов широкого спектра устойчивости к пирикуляриозу Рг-1 и Рг-33 в генетическую плазму отечественного сорта риса, используя молекулярные маркеры, тесно сцепленные с целевыми генами.

Научная новизна исследований.

1. Впервые создана кодоминантная внутригенная ДНК-маркерная система на основе полимеразной цепной реакции, позволяющая идентифицировать аллельное состояние гена устойчивости к пирикуляриозу РПа.

2. Изучено 104 предселекционные линии ВНИИ риса разработанной маркерной системой гена РЫа .

3. Получены сортообразцы, несущие гены устойчивости к пирикуляриозу Р1−1 и Рг-ЗЗ в гомозиготном состоянии и обладающие комплексом признаков, соответствующих местным агроклиматическим условиям.

Научно-практическая ценность работы.

Показана эффективность применения созданной кодоминантной внутригенной ДНК-маркерной системы для обнаружения гена устойчивости к пирикуляриозу РЫа и ведения маркерной селекции на устойчивость к данному патогену.

Полученные растения риса и их семена, несущие гены Р1−1 и Рг-ЗЗ, могут быть использованы как доноры указанных генов в селекционных программах на устойчивость к пирикуляриозу. Созданные образцы, в отличие от линий зарубежной селекции с данными генами, имеют период вегетации, вегетационный период и морфотип близкий к отечественным сортам.

Апробация работы. Основные положения диссертационной работы доложены и одобрены на заседаниях методического совета ВНИИ риса в 2006;2009 гг., а также были представлены на V Московском международном конгрессе (Москва 16−19 марта 2009 г), IX молодежной научной конференции (Москва, 8 апреля 2009 г.).

Публикации результатов исследований. По материалам исследований опубликовано 9 печатных работ.

Объем и структура диссертации. Диссертация состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследований, результатов и их обсуждения, выводов и списка литературы. Работа изложена на страницах машинописного текста, включающих 16 таблиц и 13 рисунков. Список использованной литературы включает153 источника, в том числе — 106 иностранных авторов.

выводы.

1. Молекулярный полиморфизм локуса расоспецифической устойчивости к пирикуляриозу РЫа позволил создать маркерную систему данного гена для идентификации его аллельного состояния в сортах и сортообразцах риса.

2. Созданный внутригенный аллельспецифичный маркер гена РМа успешно применим для проведения массового скрининга коллекции исходного материала риса с целью поиска доноров целевого гена.

3. Применение молекулярных маркеров, тесно сцепленных с генами широкого спектра устойчивости к пирикуляриозу РП и Р1ЗЗ, повысило эффективность и скорость создания исходного селекционного материала с пирамидированными генами, на основе элитной отечественной генетической плазмы риса.

4. Созданные методом маркерной селекции сортообразцы риса с генами устойчивости к пирикуляриозу РП и РгЗЗ могут служить донорами данных генов в селекционных программах на устойчивых к пирикуляриозу.

ПРЕДЛОЖЕНИЯ ДЛЯ ПРАКТИЧЕСКОЙ СЕЛЕКЦИИ.

1. Рекомендовать сортообразцы риса с пирамидированнми генами широкого спектра устойчивости к пирикуляриозу РП и Р1ЗЗ, переданные в рабочую коллекцию ВНИИ риса, в качестве доноров указанных генов, а также для их дальнейшего использования в селекции на устойчивость к патогену.

2. Использовать созданную ДНК-маркерную систему гена устойчивости к пирикуляриозу РЫа для скрининга образцов рабочей коллекции ВНИИ риса, с целью выявления доноров целевого гена.

3. Применять созданный молекулярный маркер гена устойчивости к пирикуляриозу РЫа для идентификации аллельного состояния данного гена в программах по маркерной селекции, направленных на создание устойчивых к патогену сортов риса.

Показать весь текст

Список литературы

  1. , Е.П. Рис / Е. П. Алешин, Н. Е Алешин. — 2-е изд., перераб. и доп. — Краснодар, 1997. 506 с.
  2. Ван дер Планк, Я. Генетические и молекулярные основы патогенеза у растений /Я. Ван дер Планк М.: Мир, 1981.-236 с.
  3. Введение в генетику, биоинформатика, ДНК-технология, генная терапия, ДНК-экология, протеомика, метаболика/ В. И. Глазко,
  4. Г. В. Глазко. К.: КВ1Ц, 2003.- 640 с.
  5. , В.И. ДНК-технологии в генетике и селекции: курс лекций/ В. И. Глазко, Т. Т. Глазко. Краснодар: ВНИИ риса, 2006. — 399 с.
  6. , С.А. Использование молекулярных маркеров для анализа генома растений/ С. А. Гостимский, З. Г. Кокаева, В. К. Боброва // Генетика.-1999.-Т.35.- С.1538−1549.
  7. Грибные болезни риса / JI.JI. Дорофеева A.A. Кодяков, В. И Кратенко и др.- Ташкент: Фан, 1992. 96 с.
  8. , М.И. Фитопатология / М. И. Деменьтьева, М., 1985. — 397с.
  9. , В.А. Генетика риса / В. А. Дзюба. — Краснодар: ВНИИ риса, 2004.- 283с.
  10. , Ю.Т. Общая и молекулярная фитопатология / Ю. Т. Дьяков, O.JI. Озерецковская В. Г. Джавахия, и др. М.: Общество фитопатологов, 2001.-302 с.
  11. , Г. Л. Селекция сортов риса, устойчивых к пирикуляриозу, рисовой листовой нематоде и бактериальному ожогу в условиях Российской Федерации/ Зеленский Григорий Леонидович: автореф. дис.. д-ра с.-х. наук.- Краснодар, 1993.-48 с.
  12. , Г. JI. Перспективы создания сортов риса с высокой продуктивностью и адаптивными качествами/ Г. Л. Зеленский // Рисоводство.- 2003.- № 3.- С.7−11.
  13. , Д.И. Иммунохимическое изучение водо — солерастворимых белков зерновки риса в связи с вопросами эволюции и таксономии культурных видов рода Oryza L./ Д. И. Иванова: тр. по прикл. бот., ген. и сел.-1979.- № 3.- С.135−144.
  14. , Д.И. Подвидовая дифференциация Oryza sativa L. по результатам иммунохимического анализа белков зерна / Д. И. Иванова // С.-х. биология.- 1980.-№ 6.- С.874−877.
  15. , Д.И. Полиморфизм спирторастворимого белка зерновки риса и перспективы его использование в оценке внутривидового разнообразия Oryza sativa L./ Д. И. Иванова. // С.- х. биология.- 1983.- № 4.- С.41−45.
  16. , Д.И. Идентификация геномов, субгеномов и подвидов риса по белкам зерновки / Д. И. Иванова // С.-х. биология.- 1986.- № 7.- С. З- 9.
  17. , Е.Т. Молекулярное маркирование в селекции риса на устойчивость к пирикуляриозу/ Ильницкая Елена Тарасовна.: автореф. дис.. канд. биол. наук, — Краснодар, 2007.-24 с.
  18. , Е.Д. Методические. указания по оценке устойчивости сортов риса к возбудителю пирикуляриоза / Е. Д. Коваленко, Ю. В Горбунова, A.A. Ковалева, и др. М., 1988.- 42 с.
  19. , A.B. Использование молекулярных маркеров в работе с генетическими ресурсами растений / A.B. Конарев // С.-х. биология.- 1998.-№ 5.- С.3−25.
  20. , В.Г. Белки как генетические маркеры растений / В. Г. Конарев. -М.: Колос, 1983.-320с.
  21. , Т.Jl. Оценка исходного материала для селекции сортов риса с высоким качеством зерна / Коротенко Татьяна Леонидовна.: Автореф. дис. канд. с.-х. наук.- Краснодар.- 1990.- 21 с.
  22. Костылев, П. И. Северный рис (генетика, селекция, технология) / П. И. Костылев, A.A. Парфенюк В. И. Степовой.- Ростов н/Д: ЗАО «Книга», 2004.-576 с.
  23. Лабораторный экспресс-метод оценки сортовой устойчивости риса к пирикуляриозу / A.A. Аверьянов, В. П. Лапикова, Г. Г. Петелина. — Большие Вяземы: ВНИИФ, 1990.- 12 с.
  24. , М.Е. Генетика / М. Е. Лобашев. Ленинград: Издательство ленинградского университета, 1969.- 752с.
  25. , Г. Д. Перспективный способ гибридизации риса / Г. Д. Лось // С.-х. биология, — 1987.- № 12, — С.107−109.
  26. , Г. Д., Создание исходного материала для селекции риса / Г. Д. Лось, А. Р. Третьяков // Рисоводство.- 2003.- № 3.- С.12−13.
  27. , Г. Д. Методика гибридизации риса / Г. Д. Лось // Рисоводство.-2007,-№ 10.- С.42−51.
  28. , А.Г. Рис. Мировое производство и генофонд / А. Г. Ляховкин 2-е изд., перераб. и доп. -СПб.: «профи-информ», 2005.- 288 с.
  29. , Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Молекулярное клонирование / Т. Маниатис, Э. Фрич, Дж. Сэмбрук. М.: Мир. 1984.- 480 с.
  30. Методические указания по оценке устойчивости сортообразцов риса к пирикуляриозу в инфекционном питомнике / В. С. Фролова, Е. Д. Коваленко, Ж. Г. Наскидашвили и др. -М.: ВАСХНИЛ, 1983.- 14 с.
  31. , Ж.М. Генотипирование российских сортов риса микросателлитными маркерами / Ж. М. Мухина, B.C. Ковалев, И. И. Супрун и др. // Рисоводство. № 2, 2002. — С. 32−35.
  32. , Ж.Г. Селекция на устойчивость к пирикуляриозу риса / Ж. Г Наскидашвили., Н. Н. Сокерина, Г. Л. Зеленский // Защита растений.-1987.-№ 12. -С. 18−19.
  33. , М. С. Кластерный анализ Факторный, дискриминантный и кластерный анализ / М. С. Олдендерфер, С. К Блэшфилд. М., 1989. — С.139−210.
  34. , Л.А. 1981 Методы исследования нуклеиновых кислот.- М.: Наука, 1981.- 288 с.
  35. , В.Ф. Болезни зерновых культур / В. Ф. Пересыпкин. М.: Колос, 1979.-279 с.
  36. , А.И. Болезни риса и борьба с ними / А. И. Петрова. М., 1968.-112 с.
  37. Растениеводство с основами селекции и семеноводства / Г. В. Коренев, П. И. Подгорный, С. Н. Щербак, М. — 1973.-512 с.
  38. Селькохозяйственная биотехнология: учеб. / B.C. Шевелуха, Е. А. Калашникова, C.B. Дектярев и др.: Под ред. B.C. Шевелухи. — М., 1998. 416 с.
  39. , Ю.М. Исследование молекулярно-генетического полиморфизма сортов Triticum aestivum L. с помощью RAPD- и SSRP-анализа / Ю. М. Сиволап, C.B. Чеботарь, Е. А. Топчиева и др. // Генетика.- 1999.- Т. 35.- С. 1665−1673.
  40. , А.А. Полиморфизм белков и его значение в генетике и селекции / А. А. Созинов. М., 1985.- 245с.
  41. Система рисоводства Краснодарского края: рекомендации / Под общ. ред. Е. М. Харитонова.- Краснодар: ВНИИ риса, 2005.- 340 с.
  42. , Г. Н., Фунатсуки X., Терами Ф. Филогенетическое родство некоторых сортов, видов и гибридов рода Fagopyrum Mill., установленное RAPD-анализом / Г. Н. Суворова, X. Фунатсуки, Ф. Терами // Генетика.-1999.- Т. 35.- С. 1659−1664.
  43. , Э.Е. Молекулярные маркеры в растениеводстве/ Э. Е. Хавкин // Сельскохозяйственная биология.- 1997.- № 5.- С.3−19.
  44. , Э.Е. Молекулярная селекция растений: ДНК-технологии создания новых сортов сельскохозяйственных культур / Э. Е. Хавкин // С.-х. биология.- 2003.- № 3.- С.26−41.
  45. , Д.К. Полимеразная цепная реакция и молекулярно-генетический анализ биоптатов / Д. К. Шибата // Молекулярная клиническая диагностика,-М.: Мир, 1999.- С. 395−427.
  46. В.Н. Селекция и сорта риса на Кубани / В. Н. Шиловский, Е. М. Харитонов, А. Х. Шеуджен Майкоп, 2001.-34 с.
  47. Akagi, Н., Highly polymorphic microsatellites of rice consist of AT repeats, and classification of closely related cultivars with these microsatellite loci / Akagi H., Yokozeki Y., Inagaki A. et al. // Theor. Appl. Genet.- 1997, — V. 94.- P.61−67.
  48. Aharon, A. DNA microarrays for functional plant genomics/ Aharon A., Vorst О // Plant Mol. Biol.- 2001.- V. 48.- P. 99−118.
  49. Ahn, S.N. RFLP analysis of genomic regions associated with cooked-kernel elongation in rice / Ahn S.N., Bollich C.N., McClung A.M. et al. // Theor. Appl. Genet.- 1991.- V. 87.- P. 141−145.
  50. Ahn, S.N. Comparative linkage maps of the rice and maize genomes / Ahn S.N., Tenksley S.D. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA -1993.- V. 90.- P. 79 807 984.
  51. Ahn, S.N. Molecular mapping of a new gene for resistance to rice blast (Pyricularia grisea Sacc.) / Ahn S.N., Kim Y.K., Hong H.C. et al. // Euphytica.- 2000.- V. 116.- P. 17−22.
  52. Andaea, V.C. QTLs conferring cold tolerance at the booting stage of rice using recombinant inbred lines from a japonicax indica cross / Andaea V.C., Mackill D.J. // Theor. Appl. Genet.- 2003, — V.106.- P. 1084−1090.
  53. Atkins, J.S. International set of rice varieties for differentiating races of Pyricularia oryzae / Atkins J.S. Robert A.L., Adair C.R. et al. // Phytopathology.- 1967.- V. 57.- P. 297−301.
  54. Ayres, N.M. Microsatellites and a single-nucleotide polymorphism differentiate apparent amylose classes in an extended pedigree of US rice germ plasm / Ayres N.M., McClung A.M., Larkin H.P. // Theor. Appl. Genet.-1997.- V. 94.- P. 773−781.
  55. Barry, G. The use of the Monsanto draft rice genome sequence in research/Barry G.//Plant Physiol.- 2001.- V. 125.-P. 1164−1165.
  56. Berruyer, B. Identification and fine mapping of Pi33, the rice resistance gene corresponding to the Magnaporthe grisea avirulence gene ACE1 / Berruyer B., Adreit H., Milazzo J. et al. // Theor. Appl. Genet.- 2003.- V.107.-P.1139−1147.
  57. Bryan, G.T. A single amino acid difference distinguishes resistant and susceptible alleles of the rice blast resistance gene Pi-ta / Bryan G.T., Wu K.S., Farrall L. et al. // The Plant Cell- 2000.- V.12.- P. 2033−2045.
  58. Castiglioni, P An AFLP-Based Procedure for the Efficient Mapping of Mutations and DNA Probes in Barley / Castiglioni P., Pozzi C., Heun M., Terzi V., et al. // Genetics.- 1998.- V. 149.- P. 2039−2056.
  59. Causse, M.A. Saturated molecular map of the rice genome based on an interspecific backcross population / Causse M.A., Fulton T.M., Cho Y.G. et al. // Genetics.- 1994.- V.138.- P. 1251−1274.
  60. Chen, D.H. Phenotypic characterization of the Rice Blast Resistance Gene Pi-2(t) / Chen D.H., Zeigler R.S., Ahn S.W. et al. // Plant Disease.- 1996.-V.80.-P.52−56.
  61. Chen, D.H. Pathotypes of Pyricularia grisea in rice fields of central and southern China / Chen D.H., Chen B.T., Zhang D.P. et al. // Plant Disease.-2001.- V.85.- P. 843−850.
  62. Chen, M. An integrated physical and genetic map of the rice genome / Chen M., Presting G., Barbazuk W.B. et al. // The Plant Cell.- 2002.- V. 14.- P. 537 545.
  63. Chen, M. Sequence organization and conservation in sh2/al-homologous regions of sorghum and rice / Chen M., San Miguel P., Bennetzen J.L. // Genetics.- 1998.- V. 148.- P. 435−443.
  64. Chin, E.C.L. Maize simple repetitive DNA sequences: abundance and allele variation / Chin E.C.L., Senior M.L., Shu H. et al. // Genome.- 1996.- V.39.- P. 866−873.
  65. Conaway-Bormans, C.A. Molecular markers linked to the blast resistance gene Pi-z, in rice for use in marker-assisted selection / Conaway-Bormans C.A., Marchetti M.A., Johnson C.W. et al. // Theor. Appl. Genet.- 2003.-V.107.- P. 1014−1020.
  66. Correa-Victoria, F.J. Gene combinations in rice for the development of durable resistance to Pyricularia grisea in Colombia / Correa-Victoria F.J.,
  67. Tharreau D., Martinez C., Vales M. et al. Proc. 3rd Int. Temperate Rice Conference.- Punta del Este.- 2003.
  68. Deng, Y. Genetic characterization and fine mapping of the blast resistance locus Pigm (t) tightly linked to Pi2 and Pi9 in a broad-spectrum resistant Chinese variety /. Deng Y., Zhu X.,-Shen Y., He Z. // Theor. Appl. Genet.-2006.- V. 113.- P. 705−713.
  69. Diwan, N. Automated sizing of fluorescent-labeled simple sequence repeat (SSR) markers to assay genetic variation in soybean / Diwan N., Cregan P.B. // Theor. Appl. Genet. 1997.- V.95. — P. 723−733.
  70. Dong, Y. Mapping of QTL for embryo size in rice / Dong Y., Tsuzuki E., KamiuntenH. etal. // Crop science.- 2003.- V.43.- P. 1086−1071.
  71. Dudley, J. W. Molecular markers in plant improvement-manipulation of genes affecting quantitative traits / J.W. Dudley // Crop science.- 1993.- V.33.- P. 660 668.
  72. Foote, T. Detailed comparative mapping of cereal chromosome regions corresponding to the Phi locus in wheat / Foote T., Roberts M., Kurata N et al. //Genetics.- 1997.-V. 147.-P. 801−807
  73. Fuji, K. Identification of a RFLP marker tightly linked to the panicle blast resistance gene, Pbl in rice / Fuji K. Hayano-Saito Y., Saito K. et al. // Breeding science.-2000.-V.50.-P. 183−188.
  74. Fuentes, J.L. Analysis of genetic diversity in Cuban rice varieties using izozyme, RAPD, and AFLP markers / Fuentes J.L., Escobar F., Alvares A. et al. //Euphytica.- 1999.-V.109.-P. 107−115.
  75. Fuji, K. Gene analysis of panicle blast resistance in rice cultivars with rice stripe resistance / Fuji K., Hayano-Saito Y., Sugiura N. et al. // Breed. Res.- 1999.-V.I.- P. 203−210.
  76. Fukuoka, S. QTL-analysis and mapping of pi21, a recessive gene for field resistance to rice blast in Japanese upland rice / Fukuoka S., Okuno K. // Theor. Appl. Genet.- 2001.- V. 103.- P. 185−190.
  77. Girish Kumar, K. Marker assisted backcross gene introgression of major genes for blast resistance in rice/ Girish Kumar K., Hittalmani S., Srinivasachary K. // Advances in Rice Blast Research.- 2000.- P.43−53.
  78. Goff, S.G. A draft sequence of the rice genome (Oryza sativa L. ssp. japonica) / Goff S.G., Ricke D., Lan T.H., Presting G., Wang R. et al. // Science.- 2002.- V.296.- P. 92−100.
  79. Goto, K. Joint studies on fungus strains of rice blast. 2. Special report of forecasting the occurrence of diseases and insect pests injuries/ Goto K., Kosaka T., Yamada M. et al. 1964.-V. 18.-P. 1−132.
  80. Goto, K. Joint studies on fungus strains of rice blast. 1. Special report of forecasting the occurrence of diseases and insect pests injuries/ Goto K., Yamanaka T., Narita T., Ichicawa T. et al. 1961.- V.18.-P. 1−86.
  81. Gupta, P.K. Molecular markers and their applications in wheat breeding / Gupta P.K., Varshney R.K., Sharma P. S. // Plant Breed.- 1999.- V.118.- P. 369−390.
  82. Harushima, Y. A high-density rice genetic map with 2275 markers using a single F2 population/ Harushima Y., Yano M., Shomura A. et al. // Genetics.- 1998.- V.148.- P. 479−494.
  83. Hittalmani, S. Fine mapping and DNA marker-assisted pyramiding of the three major genes for blast resistance in rice / Hittalmani S., Parco A., Mew T.V. // Theor. Appl. Genet.- 2000.- V.100.- P. 1121−1128.
  84. Huang, N. Pyramiding of bacterial blight resistance genes in rice: marker-assisted selection using RFLP and PCR / Huang N., Angeles E.R., Domingo J. et al. // Theor. Appl. Genet.- 1997- V.95.- P. 313−320.
  85. Ichicawa, N. A rapid PCR-aided selection of a rice line containing the Rf-1 gene which is involved in restoration of the cytoplasmic male sterility/ Ichicawa N., Kishimoto N., Inagaki A. et al. // Mol. Breed.-1997.- V. 3.- P. 195−202.
  86. Jaisval, P. Gramene: development and integration of trait and gene ontologies for rice / Jaisval P., Ware D., Ni J. et al. // Comparative and functional genomics.- 2002.- V.3.- P. 132−136.
  87. Jena, K.K. Marker assisted selection- a new paradigm in plant breeding / Jena K.K., Moon H.P., Mackill D.J. // Korean J. Breed.- 2003.- V.35.- P. 133 140.
  88. Jansen, R. C. A Comment on Codominant Scoring of AFLP Markers / Jansen R. C., Geerlings H., A. Oeveren J. V.// Genetics.- 2001.- V.158.- P. 925−926.
  89. Jeung, J.U. Fingerprinting temperate japonica and tropical indica rice genotypes by comparative analysis of DNA markers / Jeung J.U., Hwang H.G., Moon H.P. // Euphytica.- 2005.- V.146.- P.239−251.
  90. Jia, Y. Development of Dominant Rice Blast Pi-ta Resistance Gene Markers / Jia Y., Wang Z., SinghP. // Crop Science.- 2002. V. 42. P.2145−2149.
  91. Jiang J. and Wang S. Identification of a 118-kb DNA fragment containing the locus of blast resistance gene Pi-2(t) in rice // Mol. Genet. Genomics.-2002.- V.268.- P. 249−252.
  92. Khush G.S., Brar D.S., Hardy B. Rice genetics VI.- Los Banos.- 2001.488 p.
  93. Kinoshita T., Report of Committee on Gene Symbolization, Nomenclature and Linkage Groups // Rice Genetics Newsletter- 1995.- V. 12.- P. 9−153.
  94. Kiyosawa S. Gene analysis for blast resistance // Oryza.- 1981.-V. 18.-P.196−203.
  95. Kiyosawa S., Yamaguchi H., Yamada M. The influence of resistance gene frequencies in rice plants on virulence gene frequencies in blast fungus population in Japan // Ann. Phytopath. Sos. Jap.- 1982.-V.48.- P. 199−209.
  96. Kosaka T., Yamada M., Matsumoto S., Matsuyama N. et al. Joint studies on fungus strains of rice blast // Japan. J. Breed.- 1972.- V.2.- P. 25−30.
  97. Kurata N., Moore G., Nagamura Y, Foote T. et al. Conservation of genome structure between rice and weat // Biotechnology- 1994.-V. 12, — P. 276−278.
  98. Lang N., Subudhi P., Virmani S., Brar D. et al. Development of PCR-based markers for thermosensitive genetic male sterility gene tms3(t) in rice (
  99. Levy M., Shahjahan K.M., Valent B. Lineage structure, avirulence locus polymorphism and organization of pathotype diversity in rice blast fungus // Abstract 3rd Int. Rice Genet. Symp.- Manila, the Philippines.-1995.- poster 81.
  100. Lippman Z., Tanksley S.D. Dissecting the genetic pathway to extreme fruit size in tomato using a cross between the small fruited wild species L. pimpinellifolium and L. esculentum Var. Giant Heirloomi // Genetics.-2001.- V.158.- P.413−422.
  101. Litt M., And Luty J.A. A hypervariable microsatellite revealed by in vitro amplification of a dinucleotide repeat within the cardiac muscle actin gene // Am.J.Hum.Genet.- 1989.- V.44.- P. 388−396.
  102. Liu, G. Two broad-spectrum blast resistance genes, Pi9(t) and Pi2(t), are physically linked on rice chromosome 6 / Liu G., Lu G., Zeng L., Wang G.L. // Mol. Genet. Genomics.- 2002.- V.267.- P. 472−480.
  103. Ma, Z.Q. Frequencies and sequence characteristics of dinucleotide, trinucleotide, and tetra-nucleotide microsatellites in wheat / Ma Z.Q., Roder M., Sorrells M.E. // Genome.- 1996.- V.39.- P. 123−130.
  104. Mackill, D.J. Classifying japonica rice cultivars with RAPD markers / Mackill D.J. // Crop Sci.- 1995.- V.35.- P. 889−894.
  105. Mackill, D.J. Genes for resistance to the Philippine isolates of rice blast pathogen / Mackill D.J., Bonman J.M., Such H.C. // Rice Genetics Newsletter.- 1985.-V.2.- P.80−81.
  106. Mackill, D.J. Inheritance of blast resistance in near-isogenic lines of rice / Mackill D.J., Bonman J.M. // Phytopathology.- 1992.- V.82.- P.746−749.
  107. Mackill D.J. Level of polymorphism and genetic mapping of AFLP markers in rice / Mackill D.J.-, Zhang Z., Redona E.D. et al. // Genome.-1996.- V.39.- P.969−977.
  108. McCouch, S.R. Molecular mapping of rice chromosomes / McCouch S.R., Kochert G., Yu Z.H. et al. // Theor. Appl. Genet.-1988.- V.76.- P. 815−829.
  109. McCouch, S.R. Mapping of blast resistance genes in rice / McCouch S.R., Nelson R.G., Tohme J. et al. // Rice blast disease.-1994.- V.I.- P. 167 186.
  110. McCouch, S.R. Microsatellite markers in rice: abundance, diversity, and applications / McCouch S.R., Temnykh S., Lukashova A. et al. // Rice genetic 4. Proceeding of the fourth international rice genetic symposium.- Los Banos.- 2001.-P. 117−135.
  111. McCouch, S.R. Development and mapping of 2240 new SSR markers for rice (Oryza sativa L.)/ McCouch S.R., Teytelman L., Xu Y. et al. // DNA research.- 2002.- V.9.- P. 199−207.
  112. Mekwatanakarn, P. Sexually fertile Magnaporthe grisea rice pathogens in Thailand / Mekwatanakarn P., Kositratana W., Phromraksa T., Zeigler R.S. // Plant Disease.- 1999, — V.83.- P. 939−943.
  113. Mew, T.V. Fine-mapping of major genes for blast resistance in rice / Mew T.V., Parco A.S., Hittalmani S., et al. // Rice Genet. Newsl.- 1994.-V.ll.-P. 126−128.
  114. Mitchell, T.K. The rice blast pathosystem as a case study for the development of new tools and raw materials for genome analysis of plant pathogens / Mitchell T.K., Michael R.T., Jeong J.-S. et al. // New Phytologist.-2003.- Vol.159. P. 53−61
  115. Miyamoto, M. High resolution mapping of the indica-derived genes. I. Pib / Miyamoto M., Ando I., Rybka K. et al. // Mol. Plant-Microbe Interact.-1996.-V.9.-P. 6−13.
  116. Mohan, M. Genome mapping, molecular marker and marker-assisted selection in crop plants / Mohan M., Nair S., Bhagwat A. et al. // Molecular Breeding.- 1997.- V.3.- P. 87−103.
  117. Morgante, M. PCR-amplified microsatellite markers in plant genetics /Morgante M., Oliveri A.M. // Plant J.- 1993.- V.3.- P. 175−182.
  118. Murray, M.G. Rapid isolation of high molecular weight plant DNA / Murray M.G., Thompson W.F. // Nucleic Acids Research.- 1980.- V.10.- P. 4321−4325.
  119. Openshau, S.J. Marker assisted selection in backross breeding. In: Analysis of molecular marker data / Openshau S.J., Jarboe S.J., Bears W.D. // Joint plant Breed. Symp. Ser., Corvallis, Oregon, USA.- 1994.- P. 41−43.
  120. Oka, H.I. Genetic analysis of resistance to blast disease in rice (by biometrical genetic method) / Oka H.I., Lin K.I. // Japanese Journal of Genetics.- 1957.- V.32.- P. 20−27.
  121. Panaud, O. Frequency of microsatellite sequences in rice (Oryza sativa L.) / Panaud O., Chen X., McCouch S.R. // Genome. 1995. V.38. P. 1170−1176.
  122. Ribaut, J.M. Marker-assisted selection: new tools and strategies / Ribaut J.M., Hoisington D. // trends in plant science.- 1998.- V. 3.- P.236−239.
  123. Saghai Maroof, M.A. Analysis of the barley and rice genomes by comparative RFLP mapping/ Saghai Maroof M.A., Yang G.P., Biyashev R.M. et al. // Theor. Appl. Genet.- 1996.- V.92.- P. 541−551.
  124. Saji, S. A physical map with yeast artificial chromosome (YAC) clones covering 63% of the 12 rice chromosomes/ Saji S., Umehara Y., Baltazar A.A.// Genome.- 2001.- V. 44.- P. 32−37.
  125. Sasaki, R. Inheritance of rice blast resistance/ Sasaki R. // Japan. J. Genet.- 1922.- V.I.- P.81−85.
  126. Sasaki, T. The progress in rice genomics/ Sasaki T. // Euphytica.- 2001.-V.118.P. 103−111.
  127. Science of the rice plant. Volume Three. Genetics / Edited by Matsuo T., Futsuhara Y., Kikushi F., Yamaguchi H. -Tokyo: Food and agriculture policy research center, 1997, — 1003 p.
  128. Schlotterer, C. Polymorphism and locus-specific effects on polymorphism at microsatellite loci in natural Drosophila melanogaster populations/ Schlotterer C., Soller M. // Genetics.- 1997.- V.146. P. 309−320.
  129. Tanksley, S.D. Restriction fragment lenth polymorphism maps and the concept of graphical genotypes/ Tanksley S.D.// Theor. Appl. Genet.- 1989.-V. 75.-P. 95−101.
  130. Temnykh, S. Mapping and genome organization of microsatellite in rice (Oryza sativa L.) / Temnykh S., Park W.D., Ayres N. // Theor. Appl. Genet.-2000.-V. 100.-P. 697−712.
  131. Thomas, M.R. Microsatellite repeats in grapevine reveal DNA polymorphism when analysed as sequence-tagged sites (STSs) / Thomas M.R., Scott N.S. // Theor. Appl. Genet.- 1993.- V.86.- P. 985−990.
  132. Umehara, Y. Construction and characterization of a rice YAC library for physical mapping/ Umehara Y., Inagaki A., Tanoue H. // Molecular Breeding.-1995.- V.I.- P. 79−89.
  133. Wang, G.LG. RFLP mapping of genes conferring complete and partial resistance to blast in a durably resistance rice cultivar / Wang G.L., Mackill D.J., Bonman M., McCouch S.R. // Genetics.- 1994.- V.136.- P. 1421−1434.
  134. Wang, G.L. Construction of a rice bacterial artificial chromosome library and Identification of clones linked to Xa-21 disease resistance locus/ Wang G.L., Holsten T.E., Song W.Y., Wang H.P. // Plant J.- 1995.- V.7.- P. 525 533.
  135. Weber, J.L. Human DNA polymorphism and methods of analysis // Curr. Opin. Biotechnol.- 1990.- V.I.- P. 166−171.
  136. Wu K.S. Abundance, polymorphism and genetic mapping of microsatellites in rice / Wu K.S., Tanksley S.D. // Mol. Gen. Genet.- 1993.-V.241.- P. 225−235.
  137. Yamada, M. Pathogenic specialization of rice blast fungus in Japan // Jap. Agr. Res. Quart.- 1985.-V. 19.- P.178−183.
  138. Yamamoto, T. Fine mapping of quantitative trait loci Hd-1, Hd-2 and Hd-3, controlling heading date of rice, as single Mendelian factors / Yamamoto T., Kuboki Y., Lin S.Y., // Theor. Appl. Genet.- 1998.- V. 97.- P. 37−44.
  139. Yan, J. Molecular marker-assisted dissection of genotype-environment interaction for plant type traits in rice (Oryza sativa L.)/ Yan, J., Zhu J., He C., Benmoussa M., Wu P. // Crop science.- 1999.- V. 39, — P. 538−544.
  140. Yang R.S. Comparative analysis of microsatellite DNA polymorphism in landraces and cultivars of rice / Yang R.S., Saghai Maroof M.A., Xu C.G., Zhang Q., Biyashev R.M. // Mol. Gen. Genet.- 1994.- V.245.- P. 187−194.
  141. Yang, T. Construction and utility of 10-kb libraries for efficient clone-gap closure for rice genome sequencing/ Yang T., Yu Y., Nah G., Atkins M., Lee S. et al. // Theor.Appl.Genet.- 2003.- V. 107.- P. 652−660. .
  142. Yao, F.Y. Mapping and genetic analysis of two fertility restorer loci in the wild-abortive cytoplasmic male sterility system of rice/ Yao F.Y., Xu C.G., Yu S.B. et al. // Euphitica 1997.- V. 98.- P.183−187.
  143. Yoshimura, S. Identification of a YAC clone carrying the Xa-1 allele, a bacterial blight resistance gene in rice / Yoshimura S., Umehara Y., Kurata N. et al. // Theor. Appl. Genet.- 1996.- V. 93.-P. 117−122.
  144. Yoshimura, S. Expression of Xal, a bacterial blight resistance gene in rice, is induced by bacterial inoculation / Yoshimura S., Yamanouchi U., Katayose Y. et al. // Proc. Nat. Acad. Sci. USA.- 1998.- V. 95.-P. 16 631 668.
  145. Young, N.D. A cautiously optimistic vision for marker-assisted breeding «//Mol. Breed.- 1999.-V.5.-P. 505−510.
  146. Yu, Z.H. Molecular mapping of genes for resistance to rice blast / Yu Z.H., Mackill D.J., Bonman J.M. // Theor. Appl. Genet.- 1996.- V. 93.- P. 859 863.
  147. Yu, J. A draft sequence of the rice genome (Oryza sativa L. ssp. indica) / Yu J., Hu S., Wang J., Wong G.K., Li S., Deng Y. et al. // Science.- 2002.-V.296.- P. 79−91.
  148. Zhu, J. AFLP markers for the study of rice biodiversity/ Zhu J., Gale M.D., Quarre S. // Theor. Appl. Genetic.- 1998.- V.96.- P. 602−611.
Заполнить форму текущей работой

Пора сдавать?