После выяснения причин нарушения порядка ИВП России разрешение на дальнейшее выполнение международного полета или полета, связанного с пересечением более двух зон Единой системы, принимает начальник дежурной смены главного центра Единой системы, а в остальных случаях — начальники дежурных смен зонального центра Единой системы.
По каждому случаю нарушения порядка ИВП России проводится расследование в целях установления причин нарушений и выработки рекомендаций по их предупреждению.
Расследование и учет нарушений порядка ИВП России проводятся в порядке, установленном нормативными правовыми актами Российской Федерации для государственной, гражданской и экспериментальной авиации, а также настоящими Федеральными правилами.
Расследование и учет нарушений порядка ИВП России, в которые вовлечены ВС различных видов авиации, проводятся Росавиацией с участием заинтересованных федеральных органов исполнительной власти и Государственной корпорации по космической деятельности «Роскосмос».
Расследование нарушений порядка ИВП России, которые относятся к деятельности, не связанной с полетами ВС, проводится Росавиацией.
Организация указанного расследования, а также определение состава его участников возлагаются на Федеральное агентство воздушного транспорта.
По результатам проведенных расследований нарушений порядка ИВП России заинтересованные федеральные органы исполнительной власти и Государственная корпорация по космической деятельности «Роскосмос» разрабатывают мероприятия в целях предупреждения повторения нарушений.
Регистрация нарушений порядка ИВП России ведется оперативными органами Единой системы в порядке, установленном Минтрансом России.