ΠŸΠΎΠΌΠΎΡ‰ΡŒ Π² ΡƒΡ‡Ρ‘Π±Π΅, ΠΎΡ‡Π΅Π½ΡŒ быстро...
Π Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π΅ΠΌ вмСстС Π΄ΠΎ ΠΏΠΎΠ±Π΅Π΄Ρ‹

Π‘Ρ€Π°Π²Π½ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΉ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ· активности рСтроэлСмСнтов Π² Π½ΠΎΡ€ΠΌΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… ΠΈ ΠΎΠΏΡƒΡ…ΠΎΠ»Π΅Π²Ρ‹Ρ… тканях Ρ‡Π΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠ°

Π”ΠΈΡΡΠ΅Ρ€Ρ‚Π°Ρ†ΠΈΡΠŸΠΎΠΌΠΎΡ‰ΡŒ Π² Π½Π°ΠΏΠΈΡΠ°Π½ΠΈΠΈΠ£Π·Π½Π°Ρ‚ΡŒ ΡΡ‚ΠΎΠΈΠΌΠΎΡΡ‚ΡŒΠΌΠΎΠ΅ΠΉ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹

Наоборот, транскрипт, содСрТащий U3 ΠΎΠ±Π»Π°ΡΡ‚ΡŒ LTR ΠΈΠ· Π»ΠΎΠΊΡƒΡΠ° Π’Π‘52 374 Π΄Π΅Ρ‚Π΅ΠΊΡ‚ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π»ΠΈ Π² ΡΠ΅ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠΌΠ΅ ΠΈ ΡΠΌΠ±Ρ€ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ ΠΊΠ°Ρ€Ρ†ΠΈΠ½ΠΎΠΌΠ΅, Π² Ρ‚ΠΎ Π²Ρ€Π΅ΠΌΡ ΠΊΠ°ΠΊ U5 содСрТащий транскрипт этого LTR Π½Π΅ Π΄Π΅Ρ‚Π΅ΠΊΡ‚ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π»ΠΈ Π½ΠΈ Π² ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠΉ ΠΈΠ· ΠΈΡΡΠ»Π΅Π΄ΡƒΠ΅ΠΌΡ‹Ρ… Π½ΠΎΡ€ΠΌΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… ΠΈ ΠΎΠΏΡƒΡ…ΠΎΠ»Π΅Π²Ρ‹Ρ… Ρ‚ΠΊΠ°Π½Π΅ΠΉ. Π Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚Ρ‹ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° транскрипционной активности LTR Π½Π° ΠΏΠ°Π½Π΅Π»ΠΈ ΠΊΠ”ΠΠš ΠΈΠ· ΡˆΠ΅ΡΡ‚ΠΈ Ρ‚ΠΊΠ°Π½Π΅ΠΉ ΠΈ Ρ‚Ρ€Π΅Ρ… ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Ρ… Π»ΠΈΠ½ΠΈΠΉ суммированы Π² Ρ‚Π°Π±Π»ΠΈΡ†Π΅ 2.1. Из ΠΏΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π΅Π½Π½Ρ‹Ρ…… Π§ΠΈΡ‚Π°Ρ‚ΡŒ Π΅Ρ‰Ρ‘ >

Π‘ΠΎΠ΄Π΅Ρ€ΠΆΠ°Π½ΠΈΠ΅

  • ГЛАВА 1. ΠžΠ‘Π—ΠžΠ  Π›Π˜Π’Π•Π ΠΠ’Π£Π Π«
  • ΠšΠ»Π°ΡΡΡ‹ рСтротранспозонов
    • 1. LINE элСмСнты
      • 1. 1. Π‘Ρ‚Ρ€ΡƒΠΊΡ‚ΡƒΡ€Π° ΠΈ ΠΊΠ»Π°ΡΡΠΈΡ„икация L1 элСмСнтов
      • 1. 2. РаспрСдСлСниС L1 ΠΏΠΎ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΡƒ Ρ‡Π΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠ°
      • 1. 3. Π€ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½Π°Ρ Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ L
  • Вранскрипционная Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ
  • Вранспозиционная Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ
    • 2. Π­Π½Π΄ΠΎΠ³Π΅Π½Π½Ρ‹Π΅ рСтровирусы Ρ‡Π΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠ°
      • 2. 1. Π‘Ρ‚Ρ€ΠΎΠ΅Π½ΠΈΠ΅ HERV
      • 2. 2. ΠšΠ»Π°ΡΡΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΡ
      • 2. 3. ΠŸΡ€Π΅Π΄ΡΡ‚Π°Π²Π»Π΅Π½Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΈ Π»ΠΎΠΊΠ°Π»ΠΈΠ·Π°Ρ†ΠΈΡ HERV ΠΈ LTR Π² Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ΅
      • 2. 4. РаспрСдСлСниС HERV ΠΈ LTR ΠΏΠΎ Ρ…ромосомам
      • 2. 5. ΠΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ HERV ΠΈ ΠΎΠ΄ΠΈΠ½ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Ρ… LTR
      • 2. 6. Π€Π°ΠΊΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹, Π²Π»ΠΈΡΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ Π½Π° ΡΠΊΡΠΏΡ€Π΅ΡΡΠΈΡŽ HERV
      • 2. 7. Π’ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎΠ΅ участиС ERV Π² Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… Π½ΠΎΡ€ΠΌΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… ΠΈ ΠΏΠ°Ρ‚офизиологичСских процСссах
  • ERV: Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎΠ΅ участиС Π² Ρ€Π°Π·Π²ΠΈΡ‚ΠΈΠΈ ΠΏΠ»Π°Ρ†Π΅Π½Ρ‚Ρ‹ ΠΈ ΡΠΌΠ±Ρ€ΠΈΠΎΠ³Π΅Π½Π΅Π·Π΅
  • Роль HERV Π² Π²ΠΎΠ·Π½ΠΈΠΊΠ½ΠΎΠ²Π΅Π½ΠΈΠΈ ΠΎΠΏΡƒΡ…ΠΎΠ»Π΅ΠΉ
  • УчастиС ERV Π² ΠΈΠΌΠΌΡƒΠ½Π½ΠΎΠΌ ΠΎΡ‚Π²Π΅Ρ‚Π΅ ΠΎΡ€Π³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠ°
  • ΠŸΠΎΡ‚Π΅Π½Ρ†ΠΈΠ°Π»ΡŒΠ½Π°Ρ Ρ€ΠΎΠ»ΡŒ HERV Π² Π²ΠΎΠ·Π½ΠΈΠΊΠ½ΠΎΠ²Π΅Π½ΠΈΠΈ Π΄ΠΈΠ°Π±Π΅Ρ‚Π° I
  • РСтротранспозиция ΠΈ ΠΈΠ½ΡΠ΅Ρ€Ρ†ΠΈΠΎΠ½Π½Ρ‹ΠΉ ΠΌΡƒΡ‚Π°Π³Π΅Π½Π΅Π·
  • ГЛАВА 2. РЕЗУЛЬВАВЫ И ΠžΠ‘Π‘Π£Π–Π”Π•ΠΠ˜Π•
    • 2. 1. Анализ транскрипционной активности ΠΈΠ½Π΄ΠΈΠ²ΠΈΠ΄ΡƒΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… LTR сСмСйства HERV-K
    • 2. 2. Анализ транскрипционной активности ΠΈΠ½Π΄ΠΈΠ²ΠΈΠ΄ΡƒΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… LTR HERV-K Π² Π½ΠΎΡ€ΠΌΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… ΠΈ ΠΎΠΏΡƒΡ…ΠΎΠ»Π΅Π²Ρ‹Ρ… тканях Ρ‡Π΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠ°
  • Π§ΡƒΠ²ΡΡ‚Π²ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΈ Ρ€Π΅ΠΏΡ€Π΅Π·Π΅Π½Ρ‚Π°Ρ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Π° SDDIR
  • Π’Π°Ρ€ΠΈΠ°Π½Ρ‚Ρ‹ SDDIR
  • Вранскрипционная Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ LTR HERV-K
    • 2. 3. Поиск спСцифичных для ΠΎΠΏΡƒΡ…ΠΎΠ»Π΅ΠΉ ΠΈΠ½Ρ‚Π΅Π³Ρ€Π°Ρ†ΠΈΠΈ LTR HERV-K ΠΈ LINE
  • ΠžΡ†Π΅Π½ΠΊΠ° Ρ‡ΡƒΠ²ΡΡ‚Π²ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΠΈ ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Π° TGDA
  • TGDA ΠΎΠΏΡƒΡ…ΠΎΠ»ΡŒ-спСцифичных ΠΈΠ½Ρ‚Π΅Π³Ρ€Π°Ρ†ΠΈΠΉ LTR HERV-K ΠΈ LINE
  • Π˜Π΄Π΅Π½Ρ‚ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΡ Π΄ΠΈΡ„Ρ„Π΅Ρ€Π΅Π½Ρ†ΠΈΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ²
  • ГЛАВА 3. Π­ΠšΠ‘ΠŸΠ•Π Π˜ΠœΠ•ΠΠ’ΠΠ›Π¬ΠΠΠ― ЧАБВ
    • 3. 1. ΠœΠ°Ρ‚Π΅Ρ€ΠΈΠ°Π»Ρ‹
      • 3. 1. 1. Π€Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Ρ‹ ΠΈ Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Ρ‹
      • 3. 1. 2. ΠžΠ±ΠΎΡ€ΡƒΠ΄ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅
      • 3. 1. 3. РасходныС ΠΌΠ°Ρ‚Π΅Ρ€ΠΈΠ°Π»Ρ‹
      • 3. 1. 4. Π‘ΡƒΡ„Π΅Ρ€Π½Ρ‹Π΅ ΠΈ Π΄Ρ€ΡƒΠ³ΠΈΠ΅ растворы
      • 3. 1. 5. ΠœΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡ‡Π΅ΡΠΊΠΈΠ΅ срСды
      • 3. 1. 6. Π’ΠΊΠ°Π½ΠΈ
      • 3. 1. 7. ΠŸΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€Ρ‹, ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒ Π½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄ΠΎΠ²
    • 3. 2. ΠœΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Ρ‹ исслСдования
      • 3. 2. 1. Π’Ρ‹Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ РНК ΠΈ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½ΠΎΠΉ Π”ΠΠš
      • 3. 2. 2. ΠžΠ±Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚ΠΊΠ° Π”ΠΠšΠ°Π·ΠΎΠΉ
      • 3. 2. 3. Π‘ΠΈΠ½Ρ‚Π΅Π· ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΠΎΠΉ Ρ†Π΅ΠΏΠΈ ΠΊΠ”ΠΠš
      • 3. 2. 4. PCR
      • 3. 2. 5. ΠžΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΠΈΡ‡Π½ΠΎΠΉ структуры ΠΊΠ»ΠΎΠ½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½Π½Ρ‹Ρ… Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² Π”ΠΠš ΠΈ PCR Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ²
      • 3. 2. 6. ΠŸΠΎΠ΄Π±ΠΎΡ€ ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ² для Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ
      • 3. 2. 7. Поиск Π³ΠΎΠΌΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠΉ, ΠΊΠ°Ρ€Ρ‚ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ Π² Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ΅ Ρ‡Π΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠ°
      • 3. 2. 8. Π”ΠΈΡ„Ρ„Π΅Ρ€Π΅Π½Ρ†ΠΈΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΉ дисплСй SDDIR (Selective Differential Display of RNAs containing Interspersed Repeats)
      • 3. 2. 9. ΠœΠΎΠ΄ΠΈΡ„ΠΈΡ†ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½Π½Ρ‹ΠΉ TGDA (Targeted Genomic Difference Analysis)
  • ΠŸΡ€ΠΈΠ³ΠΎΡ‚ΠΎΠ²Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ Π²Π»ΠΎΠΆΠ΅Π½Π½ΠΎΠ³ΠΎ контроля
  • Π’Π«Π’ΠžΠ”Π«

Π‘Ρ€Π°Π²Π½ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΉ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ· активности рСтроэлСмСнтов Π² Π½ΠΎΡ€ΠΌΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… ΠΈ ΠΎΠΏΡƒΡ…ΠΎΠ»Π΅Π²Ρ‹Ρ… тканях Ρ‡Π΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠ° (Ρ€Π΅Ρ„Π΅Ρ€Π°Ρ‚, курсовая, Π΄ΠΈΠΏΠ»ΠΎΠΌ, ΠΊΠΎΠ½Ρ‚Ρ€ΠΎΠ»ΡŒΠ½Π°Ρ)

Около 40% Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ° Ρ‡Π΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠ° ΡΠΎΡΡ‚Π°Π²Π»ΡΡŽΡ‚ ΠΏΠΎΠ²Ρ‚ΠΎΡ€ΡΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ΡΡ элСмСнты, прСдставлСнныС Π² ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π½ΠΎΠΌ рСтроэлСмСнтами (Π΄Π°Π»Π΅Π΅ Π Π­), Ρ‚Π°ΠΊΠΈΠΌΠΈ ΠΊΠ°ΠΊ ΠΊΠΎΡ€ΠΎΡ‚ΠΊΠΈΠ΅ диспСргированныС ΠΏΠΎΠ²Ρ‚ΠΎΡ€Ρ‹ (Short Interspersed Nuclear Elements, SINEs), Π΄Π»ΠΈΠ½Π½Ρ‹Π΅ диспСргированныС ΠΏΠΎΠ²Ρ‚ΠΎΡ€Ρ‹ (Long Interspersed Nuclear Elements, LINEs) ΠΈ ΠΏΡ€ΠΎΠΈΠ·Π²ΠΎΠ΄Π½Ρ‹ΠΌΠΈ эндогСнных рСтровирусов (Human Endogenous Retroviruses, HERV), содСрТащими Π΄Π»ΠΈΠ½Π½Ρ‹Π΅ ΠΊΠΎΠ½Ρ†Π΅Π²Ρ‹Π΅ ΠΏΠΎΠ²Ρ‚ΠΎΡ€Ρ‹ (Long Terminal Repeats, LTRs), Π² Ρ‚ΠΎ Π²Ρ€Π΅ΠΌΡ ΠΊΠ°ΠΊ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΠΈ, ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ Π±Π΅Π»ΠΊΠΈ, ΡΠΎΡΡ‚Π°Π²Π»ΡΡŽΡ‚ ΠΌΠ΅Π½Π΅Π΅ 5% Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ° [1, 2].

Π§Π°ΡΡ‚ΡŒ ΠΏΠΎΠ²Ρ‚ΠΎΡ€ΡΡŽΡ‰ΠΈΡ…ΡΡ элСмСнтов Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ° экспрСссионно Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½Π°. Π‘ΠΎΠ»ΡŒΡˆΠΎΠ΅ число ΠΏΠΎΠ²Ρ‚ΠΎΡ€ΡΡŽΡ‰ΠΈΡ…ΡΡ элСмСнтов ΠΌΠΎΠ³ΡƒΡ‚ ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΎΠ²Ρ‹Π²Π°Ρ‚ΡŒ собствСнныС транскрипты, ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Π΅ ΡƒΡ‡Π°ΡΡ‚Π²ΡƒΡŽΡ‚ Π² Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΠΈ. РСтроэлСмСнты ΠΌΠΎΠ³ΡƒΡ‚ ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΎΠ²Ρ‹Π²Π°Ρ‚ΡŒ Π½Π΅ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ РНК, ΠΏΠΎΡ‚Π΅Π½Ρ†ΠΈΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎ способныС ΠΏΡ€ΠΈΠ½ΠΈΠΌΠ°Ρ‚ΡŒ участиС Π² Ρ€Π΅Π³ΡƒΠ»ΡΡ†ΠΈΠΈ Π³Π΅Π½Π½ΠΎΠΉ активности, Π½Π°ΠΏΡ€ΠΈΠΌΠ΅Ρ€ ΠΏΡ€ΠΈ посттранскрипционном сплайсингС Π³Π΅Π½ΠΎΠ² ΠΈΠ»ΠΈ участвуя Π² ΠΏΠΎΠ΄Π°Π²Π»Π΅Π½ΠΈΠΈ экспрСссии транспозонов ΠΈ Π΄Ρ€ΡƒΠ³ΠΈΡ… ΠΏΠΎΠ²Ρ‚ΠΎΡ€ΡΡŽΡ‰ΠΈΡ…ΡΡ элСмСнтов [3−5]. РНК, содСрТащиС Alu элСмСнты, ΡΠΎΡΡ‚Π°Π²Π»ΡΡŽΡ‚ 5% ΠΎΡ‚ ΠΈΠ·Π²Π΅ΡΡ‚Π½Ρ‹Ρ… мРНК [6]. Π’ 5' ΠΈ 3' UTR ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΈΡ… Π³Π΅Π½Π½Ρ‹Ρ… транскриптов ΠΏΡ€ΠΈΡΡƒΡ‚ΡΡ‚Π²ΡƒΡŽΡ‚ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΠΈ рСтроэлСмСнтов. ОсобСнно Π±ΠΎΠ³Π°Ρ‚Ρ‹ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΡΠΌΠΈ Π Π­ транскрипты ΡΠ²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΠΎΠ½Π½ΠΎ ΠΌΠΎΠ»ΠΎΠ΄Ρ‹Ρ… классов Π³Π΅Π½ΠΎΠ², Ρ‚Π°ΠΊΠΈΡ… ΠΊΠ°ΠΊ Π³Π΅Π½Ρ‹ ΠΈΠΌΠΌΡƒΠ½Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΎΡ‚Π²Π΅Ρ‚Π° ΠΈΠ»ΠΈ ΠΎΡ‚Π²Π΅Ρ‚Π° Π½Π° Π²ΠΎΠ·Π΄Π΅ΠΉΡΡ‚вия Π²Π½Π΅ΡˆΠ½ΠΈΡ… Ρ„Π°ΠΊΡ‚ΠΎΡ€ΠΎΠ² [7].

ΠŸΠ΅Ρ€Π΅ΠΌΠ΅Ρ‰Π°ΡΡΡŒ, Π Π­ ΡΡƒΡ‰Π΅ΡΡ‚Π²Π΅Π½Π½ΠΎ Π²Π»ΠΈΡΡŽΡ‚ Π½Π° ΡΡ‚Ρ€ΡƒΠΊΡ‚ΡƒΡ€Ρƒ гСнСтичСского ΠΌΠ°Ρ‚Π΅Ρ€ΠΈΠ°Π»Π° хозяина ΠΈ ΠΈΠΌΠ΅ΡŽΡ‚ Ρ„ΡƒΠ½Π΄Π°ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠ΅ Π·Π½Π°Ρ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ Π² Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ гСнСтичСской измСнчивости. Π‘Ρ‡ΠΈΡ‚Π°ΡŽΡ‚, Ρ‡Ρ‚ΠΎ ΠΏΡ€ΠΈΡ‡ΠΈΠ½ΠΎΠΉ возникновСния спонтанных ΠΌΡƒΡ‚Π°Ρ†ΠΈΠΉ ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ‚ ΡΠ²Π»ΡΡ‚ΡŒΡΡ транспозиционная Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΏΠΎΠ΄Π²ΠΈΠΆΠ½Ρ‹Ρ… элСмСнтов Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ° [8]. Являясь ΠΏΡ€ΠΈΡ‡ΠΈΠ½ΠΎΠΉ инсСрционного ΠΌΡƒΡ‚Π°Π³Π΅Π½Π΅Π·Π°, Π Π­ ΠΌΠΎΠ³ΡƒΡ‚, ΠΊΠ°ΠΊ ΠΈΠ·ΠΌΠ΅Π½ΡΡ‚ΡŒ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒ Π³Π΅Π½Π°, Ρ‚Π°ΠΊ ΠΈ ΠΈΠ·ΠΌΠ΅Π½ΡΡ‚ΡŒ Π΅Π³ΠΎ Ρ‚Ρ€Π°Π½ΡΠΊΡ€ΠΈΠΏΡ†ΠΈΠΎΠ½Π½ΡƒΡŽ Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ, Π²Π»ΠΈΡΡ‚ΡŒ Π½Π° Ρ‚ΠΊΠ°Π½Π΅ΡΠΏΠ΅Ρ†ΠΈΡ„ΠΈΡ‡Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΈ ΡƒΡ€ΠΎΠ²Π΅Π½ΡŒ экспрСссии Π³Π΅Π½Π°. Для Π½Π΅ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Ρ… рСтроэлСмСнтов ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ ΠΎΠ½ΠΈ ΠΌΠΎΠ³ΡƒΡ‚ Π±Ρ‹Ρ‚ΡŒ ΠΏΡ€ΠΎΠΌΠΎΡ‚ΠΎΡ€Π°ΠΌΠΈ ΠΈ Ρ‚Π΅Ρ€ΠΌΠΈΠ½Π°Ρ‚ΠΎΡ€Π°ΠΌΠΈ транскрипции Π±Π»ΠΈΠ·Π»Π΅ΠΆΠ°Ρ‰ΠΈΡ… ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Ρ… Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΡƒΡ‡Π°ΡΡ‚Π²ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ Π² Π°Π»ΡŒΡ‚Π΅Ρ€Π½Π°Ρ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΠΌ сплайсингС, ΠΏΡ€Π΅Π΄ΠΏΠΎΠ»Π°Π³Π°ΡŽΡ‚ участиС Π Π­ Π² Ρ€Π΅ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ Ρ…Ρ€ΠΎΠΌΠ°Ρ‚ΠΈΠ½Π° ΠΈ Π΄Ρ€ΡƒΠ³ΠΈΡ… процСссах [5, 9, 10].

ΠœΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Π°ΠΌΠΈ Π±Π»ΠΎΡ‚ Π³ΠΈΠ±Ρ€ΠΈΠ΄ΠΈΠ·Π°Ρ†ΠΈΠΈ ΠΈ PCR Π±Ρ‹Π»ΠΎ ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ Π Π­ ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ‚ ΠΈΠ·ΠΌΠ΅Π½ΡΡ‚ΡŒΡΡ Π² Π·Π°Π²ΠΈΡΠΈΠΌΠΎΡΡ‚ΠΈ ΠΎΡ‚ Π²Π½Π΅ΡˆΠ½ΠΈΡ… условий ΠΈ ΡΠΎΡΡ‚ояния ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΠΈ [10]. Показано ΡƒΠ²Π΅Π»ΠΈΡ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ количСства Alu транскриптов Π² ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΠ°Ρ… ΠΏΡ€ΠΈ стрСссовых условиях [11]. Π”Ρ€ΡƒΠ³ΠΈΠΌ Ρ…ΠΎΡ€ΠΎΡˆΠΎ извСстным ΠΏΡ€ΠΈΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠΌ являСтся ΠΈΠ·ΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΊΠ°Ρ€Ρ‚ΠΈΠ½Ρ‹ экспрСссии эндогСнных рСтровирусов ΠΈ LINE1 элСмСнтов Π² ΠΏΡ€ΠΎΡ†Π΅ΡΡΠ΅ ΠΎΠΏΡƒΡ…ΠΎΠ»Π΅Π²ΠΎΠΉ трансформации [12, 13]. ВсС эти Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Π΅ ΡΠ²ΠΈΠ΄Π΅Ρ‚Π΅Π»ΡŒΡΡ‚Π²ΡƒΡŽΡ‚ ΠΎ Ρ‚ΠΎΠΌ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ, ΠΏΠΎ ΠΊΡ€Π°ΠΉΠ½Π΅ΠΉ ΠΌΠ΅Ρ€Π΅, Π½Π΅ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Π΅ рСтроэлСмСнты Π² ΠΏΡ€ΠΎΡ†Π΅ΡΡΠ΅ ΡΠ²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΠΈ сохранили свой биологичСский ΠΏΠΎΡ‚Π΅Π½Ρ†ΠΈΠ°Π», Π½ΠΎ Π½Π΅ Π΄Π°ΡŽΡ‚ возмоТности ΠΎΡ‚Π²Π΅Ρ‚ΠΈΡ‚ΡŒ Π½Π° Π²ΠΎΠΏΡ€ΠΎΡ, ΠΊΠ°ΠΊΠΎΠ²Ρ‹ Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΈ Π Π­ Π² Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ΅ Ρ‡Π΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠ°. ΠžΡΡ‚Π°Π΅Ρ‚ΡΡ нСясным, ΠΊΠ°ΠΊΠΈΠ΅ Ρ„Π°ΠΊΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹ ΡƒΡ‡Π°ΡΡ‚Π²ΡƒΡŽΡ‚ Π² Ρ€Π΅Π³ΡƒΠ»ΡΡ†ΠΈΠΈ активности рСтроэлСмСнтов, сколько ΠΈ ΠΊΠ°ΠΊΠΈΠ΅ элСмСнты ΠΏΠΎΠ΄Π²Π΅Ρ€Π³Π°ΡŽΡ‚ΡΡ этой рСгуляции, ΠΊΠ°ΠΊ ΠΈ Π·Π° ΡΡ‡Π΅Ρ‚ Ρ‡Π΅Π³ΠΎ ΠΏΡ€ΠΈ измСнСниях Π²Π½Π΅ΡˆΠ½ΠΈΡ… условий ΠΈ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΎΠ³ΠΎ состояния измСняСтся транскрипционная Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΈΠ½Π΄ΠΈΠ²ΠΈΠ΄ΡƒΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… Π Π­.

БущСствуСт большоС число Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚, ΠΈΡΡΠ»Π΅Π΄ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Ρ€ΠΎΠ»ΡŒ ΠΏΠΎΠ²Ρ‚ΠΎΡ€ΡΡŽΡ‰ΠΈΡ…ΡΡ элСмСнтов Π² Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΠΈ, Π½ΠΎ Π²ΡΠ΅ ΠΎΠ½ΠΈ сфокусированы Π½Π° Π°ΠΊΡ‚ивности ΠΎΡ‚Π΄Π΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… прСдставитСлСй рСтроэлСмСнтов [5, 9, 10]. На ΡΠ΅Π³ΠΎΠ΄Π½ΡΡˆΠ½ΠΈΠΉ дСнь Π½Π΅ ΠΏΡ€ΠΎΠ²ΠΎΠ΄ΠΈΠ»ΠΈ ΠΏΠΎΠ»Π½ΠΎΠ³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½Ρ‹Ρ… исслСдований транскрипционно Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½Ρ‹Ρ… рСтроэлСмСнтов ΠΈ ΠΈΡΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΉ измСнСния ΠΈΡ… Π°ΠΊΡ‚ивности Π² Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… Π½ΠΎΡ€ΠΌΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… ΠΈ ΠΎΠΏΡƒΡ…ΠΎΠ»Π΅Π²Ρ‹Ρ… тканях, Ρ‚Π°ΠΊ ΠΊΠ°ΠΊ Π½Π΅ ΡΡƒΡ‰Π΅ΡΡ‚Π²ΡƒΠ΅Ρ‚ ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Π° для исслСдования всСго ΠΏΡƒΠ»Π° РНК, содСрТащих ΠΎΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½Π½Ρ‹ΠΉ класс ΠΏΠΎΠ²Ρ‚ΠΎΡ€ΡΡŽΡ‰ΠΈΡ…ΡΡ элСмСнтов, ΠΈ ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΡΡŽΡ‰Π΅Π³ΠΎ ΡΡ€Π°Π²Π½ΠΈΠ²Π°Ρ‚ΡŒ спСктры РНК Π² Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… Ρ‚ΠΈΠΏΠ°Ρ… ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΠΊ ΠΈ Ρ‚ΠΊΠ°Π½Π΅ΠΉ.

Π’ Π΄Π°Π½Π½ΠΎΠΉ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π΅ ΠΌΡ‹ Ρ€Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π»ΠΈ ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Ρ‹, ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Π΅ ΠΌΠΎΠ³ΡƒΡ‚ Π±Ρ‹Ρ‚ΡŒ ΠΏΠΎΠ»Π΅Π·Π½Ρ‹ для выяснСния Π²ΠΊΠ»Π°Π΄Π° активности Π Π­ Π² Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ° хозяина, ΠΈ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Π»ΠΈ ΠΈΡ… Π΄Π»Ρ ΠΏΠΎΠ»Π½ΠΎΠ³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ активности HERV ΠΈ LINE элСмСнтов ΠΈ Π΅Π΅ ΠΈΠ·ΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΈΠΉ ΠΏΡ€ΠΈ ΠΏΠ΅Ρ€Π΅Ρ…ΠΎΠ΄Π΅ ΠΎΡ‚ Π½ΠΎΡ€ΠΌΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… Ρ‚ΠΊΠ°Π½Π΅ΠΉ ΠΊ ΠΎΠΏΡƒΡ…ΠΎΠ»Π΅Π²Ρ‹ΠΌ.

Π’Π«Π’ΠžΠ”Π«:

1. Показано, Ρ‡Ρ‚ΠΎ транскрипционная Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΈΠ½Π΄ΠΈΠ²ΠΈΠ΄ΡƒΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… LTR сСмСйства HERV-K мСняСтся Π² Π·Π°Π²ΠΈΡΠΈΠΌΠΎΡΡ‚ΠΈ ΠΎΡ‚ Ρ‚ΠΈΠΏΠ° Ρ‚ΠΊΠ°Π½ΠΈ, ΠΏΡ€ΠΈ воздСйствии ΠΌΠΈΡ‚ΠΎΠ³Π΅Π½ΠΎΠ² ΠΈ ΡΡ‚рСссовых Ρ„Π°ΠΊΡ‚ΠΎΡ€ΠΎΠ², Π° Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ ΠΏΡ€ΠΈ ΠΎΠΏΡƒΡ…ΠΎΠ»Π΅Π²ΠΎΠΉ трансформации. ΠšΠ°ΠΆΠ΄Ρ‹ΠΉ LTR ΠΈΠΌΠ΅Π΅Ρ‚ свой Ρ…Π°Ρ€Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€Π½Ρ‹ΠΉ ΠΏΡ€ΠΎΡ„ΠΈΠ»ΡŒ экспрСссии.

2. Π Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π½ ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄ сравнСния спСктров транскриптов, содСрТащих ΠΏΠΎΠ²Ρ‚ΠΎΡ€ΡΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ΡΡ элСмСнты Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ°, Π² Ρ€Π°Π·Π½Ρ‹Ρ… тканях (Π‘Π΅Π»Π΅ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½Ρ‹ΠΉ Π”ΠΈΡ„Ρ„Π΅Ρ€Π΅Π½Ρ†ΠΈΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΉ ДисплСй РНК, SDDIR). Показано, Ρ‡Ρ‚ΠΎ SDDIR ΠΎΠ±Π»Π°Π΄Π°Π΅Ρ‚ высокой Ρ‡ΡƒΠ²ΡΡ‚Π²ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒΡŽ ΠΈ ΡΠΏΠ΅Ρ†ΠΈΡ„ΠΈΡ‡Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒΡŽ.

3. Π‘ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ΠΌ SDDIR установлСно, Ρ‡Ρ‚ΠΎ ΠΏΡ€ΠΈΠΌΠ΅Ρ€Π½ΠΎ 10% LTR HERV-K входят Π² ΡΠΎΡΡ‚Π°Π² транскриптов, ΠΏΡ€ΠΈΡ‡Π΅ΠΌ ΠΏΡ€ΠΈ ΠΏΠ΅Ρ€Π΅Ρ…ΠΎΠ΄Π΅ ΠΎΡ‚ Π½ΠΎΡ€ΠΌΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ Ρ‚ΠΊΠ°Π½ΠΈ ΠΊ ΠΎΠΏΡƒΡ…ΠΎΠ»Π΅Π²ΠΎΠΉ происходит ΠΊΠ°ΠΊ ΠΏΠΎΠ΄Π°Π²Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅, Ρ‚Π°ΠΊ ΠΈ ΡƒΡΠΈΠ»Π΅Π½ΠΈΠ΅ транскрипции ΠΎΡ‚Π΄Π΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… LTR-содСрТащих РНК.

4. Показано, Ρ‡Ρ‚ΠΎ ΠΏΡ€ΠΈ ΠΏΠ΅Ρ€Π΅Ρ…ΠΎΠ΄Π΅ ΠΎΡ‚ Π½ΠΎΡ€ΠΌΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ Ρ‚ΠΊΠ°Π½ΠΈ ΠΊ Π³Π΅Ρ€ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ³Π΅Π½Π½ΠΎΠΉ ΠΎΠΏΡƒΡ…ΠΎΠ»ΠΈ Π½Π΅ ΠΏΡ€ΠΎΠΈΡΡ…ΠΎΠ΄ΠΈΡ‚ Π·Π½Π°Ρ‡ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΠ³ΠΎ увСличСния частоты Ρ€Π΅Ρ‚Ρ€ΠΎΠΏΠΎΠ·ΠΈΡ†ΠΈΠΉ LTR HERV-K ΠΈ LINE-1 элСмСнтов.

Π—Π°ΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅

.

Π‘ ΠΌΠΎΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π° открытия ΠΌΠΎΠ±ΠΈΠ»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… элСмСнтов ΠΏΡ€ΠΎΡˆΠ»ΠΎ ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ Π²Ρ€Π΅ΠΌΠ΅Π½ΠΈ, ΠΎΠ΄Π½Π°ΠΊΠΎ Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΈ этой «ΠΈΠ·Π±Ρ‹Ρ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΎΠΉ» Π”ΠΠš Π΄ΠΎ ΡΠΈΡ… ΠΏΠΎΡ€ Π½Π΅ Π²ΠΏΠΎΠ»Π½Π΅ ясны, хотя Π΅Π΅ ΡΡ‚Ρ€ΡƒΠΊΡ‚ΡƒΡ€Π° ΠΈΠ·ΡƒΡ‡Π΅Π½Π° достаточно ΠΏΠΎΠ΄Ρ€ΠΎΠ±Π½ΠΎ. НСсмотря Π½Π° ΡˆΠΈΡ€ΠΎΠΊΡƒΡŽ Ρ€Π°ΡΠΏΡ€ΠΎΡΡ‚Ρ€Π°Π½Π΅Π½Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΏΠΎΠ²Ρ‚ΠΎΡ€ΡΡŽΡ‰ΠΈΡ…ΡΡ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚Π΅ΠΉ Π² Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ΅ эукариот ΠΈ ΠΈΡ… ΠΎΡ‡Π΅Π²ΠΈΠ΄Π½ΡƒΡŽ Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ Π²ΠΎ Π²Ρ€Π΅ΠΌΡ ΠΆΠΈΠ·Π½Π΅Π½Π½ΠΎΠ³ΠΎ Ρ†ΠΈΠΊΠ»Π° ΠΎΡ€Π³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠΎΠ², биологичСскоС Π·Π½Π°Ρ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ рСтроэлСмСнтов ΠΈ Π΄Ρ€ΡƒΠ³ΠΈΡ… Π½Π΅ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… элСмСнтов Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ° остаСтся нСпонятным. Π’Ρ‹Π·Ρ‹Π²Π°Π΅Ρ‚ сомнСниС ΠΏΡ€Π°Π²ΠΈΠ»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒ Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎ обсуТдаСмой Π² Π»ΠΈΡ‚Π΅Ρ€Π°Ρ‚ΡƒΡ€Π΅ Π³ΠΈΠΏΠΎΡ‚Π΅Π·Ρ‹ ΠΎΠ± «ΡΠ³ΠΎΠΈΡΡ‚ичности» ΠΈΠ·Π±Ρ‹Ρ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΎΠΉ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½ΠΎΠΉ Π”ΠΠš, Π² ΡΠΎΠΎΡ‚вСтствиС с ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€ΠΎΠΉ вся избыточная Π”ΠΠš являСтся Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½Ρ‹ΠΌ ΠΏΠ°Ρ€Π°Π·ΠΈΡ‚ΠΎΠΌ ΠΈ Ρ€Π°ΡΠΏΡ€ΠΎΡΡ‚раняСтся Π² Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ΅ Π² Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚Π΅ транспозиций Ρ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Ρ… ΠΊΠΎΠΏΠΈΠΉ нСмногочислСнных исходных ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚Π΅ΠΉ.

ΠŸΠ΅Ρ€Π΅ΠΌΠ΅Ρ‰Π°ΡΡΡŒ ΠΏΠΎ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΡƒ, Π Π­ ΠΌΠΎΠ³ΡƒΡ‚ Π²Π»ΠΈΡΡ‚ΡŒ Π½Π° ΡΡ‚Ρ€ΡƒΠΊΡ‚ΡƒΡ€Ρƒ гСнСтичСского ΠΌΠ°Ρ‚Π΅Ρ€ΠΈΠ°Π»Π° хозяина ΠΈ ΠΈΠΌΠ΅Ρ‚ΡŒ Ρ„ΡƒΠ½Π΄Π°ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠ΅ Π·Π½Π°Ρ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ для формирования гСнСтичСской измСнчивости.

БущСствуСт мноТСство ΠΏΡ€ΠΈΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ² Π½Π°Ρ€ΡƒΡˆΠ΅Π½ΠΈΡ рСгуляции Π³Π΅Π½ΠΎΠ² Π² Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚Π΅ встраивания Π Π­ рядом ΠΈΠ»ΠΈ нСпосрСдствСнно Π² Ρ€Π΅Π³ΡƒΠ»ΡΡ‚ΠΎΡ€Π½Ρ‹ΠΉ участок Π³Π΅Π½Π°. Однако ΠΏΡ€ΠΈΠ²Π΅Π΄Π΅Π½Π½Ρ‹Π΅ Π² ΠΎΠ±Π·ΠΎΡ€Π΅ Π»ΠΈΡ‚Π΅Ρ€Π°Ρ‚ΡƒΡ€Ρ‹ Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Π΅ ΠΎΠΏΠΈΡΡ‹Π²Π°ΡŽΡ‚ лишь Π΅Π΄ΠΈΠ½ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Π΅ случаи активности Π Π­, ΠΈ ΠΎΡΡ‚аСтся нСясным, являСтся Π»ΠΈ такая Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ свойством всСго класса Π Π­ ΠΈΠ»ΠΈ Ρ‚ΠΎΠ»ΡŒΠΊΠΎ ΠΊΠΎΠ½ΠΊΡ€Π΅Ρ‚Π½Ρ‹Ρ… элСмСнтов.

ΠŸΡ€ΠΈΠ²Π΅Π΄Π΅Π½Π½Ρ‹Π΅ Π² ΠΎΠ±Π·ΠΎΡ€Π΅ Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Π΅ ΡΠ²ΠΈΠ΄Π΅Ρ‚Π΅Π»ΡŒΡΡ‚Π²ΡƒΡŽΡ‚ ΠΎ Ρ‚ΠΎΠΌ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ, ΠΏΠΎ ΠΊΡ€Π°ΠΉΠ½Π΅ΠΉ ΠΌΠ΅Ρ€Π΅, Π½Π΅ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Π΅ рСтроэлСмСнты Π² ΠΏΡ€ΠΎΡ†Π΅ΡΡΠ΅ ΡΠ²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΠΈ сохранили свой биологичСский ΠΏΠΎΡ‚Π΅Π½Ρ†ΠΈΠ°Π», Π½ΠΎ, ΠΊ ΡΠΎΠΆΠ°Π»Π΅Π½ΠΈΡŽ, вопрос ΠΎ Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ Ρ€ΠΎΠ»ΠΈ Π Π­ Π² Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ΅ Ρ‡Π΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠ° Π΄ΠΎ ΡΠΈΡ… ΠΏΠΎΡ€ остаСтся нСясным. ΠžΡΡ‚Π°Π΅Ρ‚ΡΡ нСясным, ΠΊΠ°ΠΊΠΈΠ΅ Ρ„Π°ΠΊΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹ ΡƒΡ‡Π°ΡΡ‚Π²ΡƒΡŽΡ‚ Π² Ρ€Π΅Π³ΡƒΠ»ΡΡ†ΠΈΠΈ активности рСтроэлСмСнтов, сколько этих элСмСнтов ΠΈ ΠΊΠ°ΠΊΠΈΠ΅ ΠΈΠΌΠ΅Π½Π½ΠΎ ΠΏΠΎΠ΄Π²Π΅Ρ€Π³Π°ΡŽΡ‚ΡΡ этой рСгуляции, ΠΊΠ°ΠΊ ΠΈ Π·Π° ΡΡ‡Π΅Ρ‚ Ρ‡Π΅Π³ΠΎ ΠΏΡ€ΠΈ измСнСниях Π²Π½Π΅ΡˆΠ½ΠΈΡ… условий ΠΈ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΎΠ³ΠΎ состояния измСняСтся транскрипционная Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΈΠ½Π΄ΠΈΠ²ΠΈΠ΄ΡƒΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… Π Π­.

Π’ Π΄Π°Π½Π½ΠΎΠΉ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π΅ ΠΌΡ‹ Ρ€Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π»ΠΈ ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Ρ‹, ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Π΅ ΠΌΠΎΠ³ΡƒΡ‚ Π±Ρ‹Ρ‚ΡŒ ΠΏΠΎΠ»Π΅Π·Π½Ρ‹ для выяснСния Π²ΠΊΠ»Π°Π΄Π° активности Π Π­ Π² Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ° хозяина, ΠΈ ΠΏΡ€ΠΈΠΌΠ΅Π½ΠΈΠ»ΠΈ ΠΈΡ… Π΄Π»Ρ ΠΏΠΎΠ»Π½ΠΎΠ³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ активности HERV ΠΈ LINE элСмСнтов ΠΈ Π΅Π΅ ΠΈΠ·ΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΈΠΉ ΠΏΡ€ΠΈ ΠΏΠ΅Ρ€Π΅Ρ…ΠΎΠ΄Π΅ ΠΎΡ‚ Π½ΠΎΡ€ΠΌΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… Ρ‚ΠΊΠ°Π½Π΅ΠΉ ΠΊ ΠΎΠΏΡƒΡ…ΠΎΠ»Π΅Π²Ρ‹ΠΌ.

ГЛАВА 2. РЕЗУЛЬВАВЫ И ΠžΠ‘Π‘Π£Π–Π”Π•ΠΠ˜Π•.

2.1 Анализ транскрипционной активности ΠΈΠ½Π΄ΠΈΠ²ΠΈΠ΄ΡƒΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… LTR сСмСйства HERV-K.

Π’Ρ‹Π±ΠΎΡ€ LTR для исслСдований.

Π Π°Π½Π΅Π΅ Π±Ρ‹Π»ΠΎ ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ LTR сСмСйства HERV-K ΠΌΠΎΠ³ΡƒΡ‚ Π±Ρ‹Ρ‚ΡŒ отнСсСны ΠΊ Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹ΠΌ подсСмСйствам, ΠΈΠ½Ρ‚Π΅Π³Ρ€ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π²ΡˆΠΈΠΌ Π² Π³Π΅Π½ΠΎΠΌ Ρ‡Π΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠ° ΠΎΡ‚ 50 Π΄ΠΎ 2 ΠΌΠ»Π½. Π»Π΅Ρ‚ Π½Π°Π·Π°Π΄ Π² ΠΏΡ€ΠΎΡ†Π΅ΡΡΠ΅ ΡΠ²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΠΈ [50]. Вопрос ΠΎ Ρ‚ранскрипционной активности LTR, относящихся ΠΊ Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹ΠΌ подсСмСйствам, остаСтся ΠΌΠ°Π»ΠΎΠΈΠ·ΡƒΡ‡Π΅Π½Π½Ρ‹ΠΌ. Для Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° транскрипционной активности ΠΈΠ½Π΄ΠΈΠ²ΠΈΠ΄ΡƒΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… LTR, Ρ…Π°Ρ€Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠ·ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ…ΡΡ Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹ΠΌ Π²Ρ€Π΅ΠΌΠ΅Π½Π΅ΠΌ ΠΈΠ½Ρ‚Π΅Π³Ρ€Π°Ρ†ΠΈΠΈ Π² Π³Π΅Π½ΠΎΠΌ ΠΏΡ€ΠΈΠΌΠ°Ρ‚ΠΎΠ², ΠΌΡ‹ Π²Ρ‹Π±Ρ€Π°Π»ΠΈ Ρ‡Π΅Ρ‚Ρ‹Ρ€Π΅ LTR сСмСйства HERV-K, располоТСнных Π½Π° Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… хромосомах Ρ‡Π΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠ° ΠΈ Π°Π½Π½ΠΎΡ‚ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½Π½Ρ‹Ρ… Π² Π±Π°Π·Π΅ Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Ρ… GenBank (Ρ‚Π°Π±Π».2.1). Π’Ρ‹Π±ΠΎΡ€ Π±Ρ‹Π» основан Π½Π° Π΄Π²ΡƒΡ… критСриях: 1) LTR Π΄ΠΎΠ»ΠΆΠ΅Π½ Π±Ρ‹Ρ‚ΡŒ ΠΏΠΎΠ»Π½ΠΎΡ€Π°Π·ΠΌΠ΅Ρ€Π½Ρ‹ΠΌ ΠΈ ΡΠΎΠ΄Π΅Ρ€ΠΆΠ°Ρ‚ΡŒ всС рСгуляторныС элСмСнты- 2) LTR Π½Π΅ Π΄ΠΎΠ»ΠΆΠ΅Π½ находится Π² ΠΎΠΊΡ€ΡƒΠΆΠ΅Π½ΠΈΠΈ ΠΏΠΎΠ²Ρ‚ΠΎΡ€ΡΡŽΡ‰ΠΈΡ…ΡΡ элСмСнтов, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Π΄Π°Π΅Ρ‚ Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΏΠΎΠ΄ΠΎΠ±Ρ€Π°Ρ‚ΡŒ ΡƒΠ½ΠΈΠΊΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Π΅ ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€Ρ‹ для Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ. Π”Π²Π° Π²Ρ‹Π±Ρ€Π°Π½Π½Ρ‹Ρ… LTR присутствовали Ρ‚ΠΎΠ»ΡŒΠΊΠΎ Ρƒ Ρ‡Π΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠ° ΠΈ ΡΠ²Π»ΡΠ»ΠΈΡΡŒ ΡΠ²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΠΎΠ½Π½ΠΎ ΠΌΠΎΠ»ΠΎΠ΄Ρ‹ΠΌΠΈ, Π² Ρ‚ΠΎ Π²Ρ€Π΅ΠΌΡ ΠΊΠ°ΠΊ Π΄Π²Π° Π΄Ρ€ΡƒΠ³ΠΈΡ… являлись Π±ΠΎΠ»Π΅Π΅ старыми ΠΈ ΠΏΡ€ΠΈΡΡƒΡ‚ствовали Π² Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ°Ρ… ΠΏΡ€ΠΈΠΌΠ°Ρ‚ΠΎΠ².

НашСй Π·Π°Π΄Π°Ρ‡Π΅ΠΉ Π±Ρ‹Π»ΠΎ ΠΎΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»ΠΈΡ‚ΡŒ, ΠΎΠ±Π»Π°Π΄Π°ΡŽΡ‚ Π»ΠΈ ΠΎΡ‚ΠΎΠ±Ρ€Π°Π½Π½Ρ‹Π΅ Π½Π°ΠΌΠΈ LTR транскрипционной Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒΡŽ, являСтся Π»ΠΈ эта Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ тканСспСцифичной ΠΈ ΠΈΠ·ΠΌΠ΅Π½ΡΠ΅Ρ‚ся Π»ΠΈ ΠΎΠ½Π° ΠΏΠΎΠ΄ воздСйствиСм Π²Π½Π΅ΡˆΠ½ΠΈΡ… Ρ„Π°ΠΊΡ‚ΠΎΡ€ΠΎΠ². Π Π°Π½Π΅Π΅ Π±Ρ‹Π»ΠΎ ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ ΠΈΠ½Π΄ΠΈΠ²ΠΈΠ΄ΡƒΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Π΅ LTRs ΠΌΠΎΠ³ΡƒΡ‚ Π²Ρ‹ΡΡ‚ΡƒΠΏΠ°Ρ‚ΡŒ Π² Ρ€ΠΎΠ»ΠΈ ΠΏΡ€ΠΎΠΌΠΎΡ‚ΠΎΡ€Π°, энхансСра ΠΈ Ρ‚Π΅Ρ€ΠΌΠΈΠ½Π°Ρ‚ΠΎΡ€Π° транскрипции, ΠΈΠ»ΠΈ ΠΏΠΎΠ»Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒΡŽ Π²Ρ…ΠΎΠ΄ΠΈΡ‚ΡŒ Π² ΡΠΎΡΡ‚Π°Π² транскрипта [60, 85, 86]. ΠžΡΡ‚Π°Π΅Ρ‚ΡΡ нСизвСстным, ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ‚ Π»ΠΈ ΠΎΠ΄ΠΈΠ½ ΠΈ Ρ‚ΠΎΡ‚ ΠΆΠ΅ LTR ΠΎΠ±Π»Π°Π΄Π°Ρ‚ΡŒ Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½ΠΎΠΉ транскрипционной Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒΡŽ Π² ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠΉ ΠΈ Ρ‚ΠΎΠΉ ΠΆΠ΅ Ρ‚ΠΊΠ°Π½ΠΈ ΠΈΠ»ΠΈ Π² Ρ€Π°Π·Π½Ρ‹Ρ… тканях ΠΏΡ€ΠΈ Ρ€Π°Π·Π½Ρ‹Ρ… Π²Π½Π΅ΡˆΠ½ΠΈΡ… условиях. Π§Ρ‚ΠΎΠ±Ρ‹ ΠΎΡ†Π΅Π½ΠΈΡ‚ΡŒ Ρ‚Ρ€Π°Π½ΡΠΊΡ€ΠΈΠΏΡ†ΠΈΠΎΠ½Π½ΡƒΡŽ Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΈΠ½Π΄ΠΈΠ²ΠΈΠ΄ΡƒΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… LTR, Π±Ρ‹Π»Π° Ρ€Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π½Π° схСма экспСримСнта, прСдставлСнная Π½Π° Ρ€ΠΈΡ. 2.1.

HERV-K LTR.

ГСномная Π”ΠΠš ГСномная Π”ΠΠš — ΠΈΠ· | r | us |J.

РНК I.

I Ρ†Π΅ΠΏΡŒ ΠΊΠ”ΠΠš.

Π˜Π½ΠΈΡ†ΠΈΠ°Ρ†ΠΈΡ транскрипции.

I R I U5 |.

Всрминация транскрипции ΠΈΠ· I R.

Вранскрипция сквозь LTR ΠΈΠ· | R | LJ5 h.

PI Π 2 Π Π— Π 4.

U3 PCR ΠΏΡ€ΠΎΠ΄Ρƒ1сг U5 PCR ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΡƒΡŽΡ‚.

Π˜Π½ΠΈΡ†ΠΈΠ°Ρ†ΠΈΡ транскрипции +.

ВСрмипация транскрипции.

Вранскрипция сквозь LTR +.

Рис. 2.1 Π‘Ρ…Π΅ΠΌΠ° Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° транскрипционной активности ΠΈΠ½Π΄ΠΈΠ²ΠΈΠ΄ΡƒΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… LTR ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄ΠΎΠΌ RT-PCR. ΠŸΠ°Ρ€Ρ‹ ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ² Π 1/Π 2 ΠΈ Π Π—/Π 4 использовали для Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ U3 ΠΈ U5 областСй LTR HERV-K, соотвСтствСнно. ΠŸΡ€Π΅Π΄ΠΏΠΎΠ»Π°Π³Π°Π΅ΠΌΠ°Ρ Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ LTR ΠΈ ΡΠΎΠΎΡ‚Π²Π΅Ρ‚ΡΡ‚Π²ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΡƒΠΊΡ‚Ρ‹ RT-PCR ΠΏΡ€ΠΈΠ²Π΅Π΄Π΅Π½Ρ‹ Π² Π½ΠΈΠΆΠ½Π΅ΠΉ части рисунка.

Π‘Ρ‹Π»ΠΈ рассмотрСны Ρ‚Ρ€ΠΈ основныС ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈ участия LTR Π² Ρ‚ранскрипции: 1) LTR являСтся ΠΏΡ€ΠΎΠΌΠΎΡ‚ΠΎΡ€ΠΎΠΌ ΠΈ ΠΈΠ½ΠΈΡ†ΠΈΠΈΡ€ΡƒΠ΅Ρ‚ Ρ‚Ρ€Π°Π½ΡΠΊΡ€ΠΈΠΏΡ†ΠΈΡŽ- 2) LTR Ρ‚Π΅Ρ€ΠΌΠΈΠ½ΠΈΡ€ΡƒΠ΅Ρ‚ Ρ‚Ρ€Π°Π½ΡΠΊΡ€ΠΈΠΏΡ†ΠΈΡŽ, ΠΈΠ½ΠΈΡ†ΠΈΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½Π½ΡƒΡŽ с Π²Π½Π΅ΡˆΠ½Π΅Π³ΠΎ ΠΏΡ€ΠΎΠΌΠΎΡ‚ΠΎΡ€Π°- 3) LTR Π²Ρ…ΠΎΠ΄ΠΈΡ‚ Π² ΡΠΎΡΡ‚Π°Π² транскрипта, ΠΈΠ½ΠΈΡ†ΠΈΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΈ Ρ‚Π΅Ρ€ΠΌΠΈΠ½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½Π½ΠΎΠ³ΠΎ с Π΄Ρ€ΡƒΠ³ΠΈΡ… рСгуляторных элСмСнтов. ΠžΡ‚Π½Π΅ΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ Π΄Π°Π½Π½ΠΎΠ³ΠΎ LTR ΠΊ Ρ‚ΠΎΠΉ ΠΈΠ»ΠΈ ΠΈΠ½ΠΎΠΉ ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈ осущСствляли с ΠΏΠΎΠΌΠΎΡ‰ΡŒΡŽ RT-PCR с ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ΠΌ Π΄Π²ΡƒΡ… ΠΏΠ°Ρ€ ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ². ΠŸΠ΅Ρ€Π²Π°Ρ ΠΏΠ°Ρ€Π° ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ² Π²ΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π°Π»Π° Π² ΡΠ΅Π±Ρ ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€, ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°Ρ€Π½Ρ‹ΠΉ ΡƒΠ½ΠΈΠΊΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ части Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ°, Ρ„Π»Π°Π½ΠΊΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰Π΅ΠΉ U3 ΠΎΠ±Π»Π°ΡΡ‚ΡŒ LTR ΠΈ ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€, ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°Ρ€Π½Ρ‹ΠΉ U3 области LTR (ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€Ρ‹ Π 1 ΠΈ Π 2 Π½Π° Ρ€ΠΈΡ. 2.1).

Вторая ΠΏΠ°Ρ€Π° ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ² состояла ΠΈΠ· ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€Π°, ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°Ρ€Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΡƒΠ½ΠΈΠΊΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΌΡƒ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½ΠΎΠΌΡƒ Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Ρƒ, Ρ„Π»Π°Π½ΠΊΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰Π΅ΠΌΡƒ U5 ΠΎΠ±Π»Π°ΡΡ‚ΡŒ LTR ΠΈ ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€Π°, ΡΠΎΠΎΡ‚Π²Π΅Ρ‚ΡΡ‚Π²ΡƒΡŽΡ‰Π΅Π³ΠΎ самой U5 области LTR (ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€Ρ‹ Π Π— ΠΈ Π 4 Π½Π° Ρ€ΠΈΡ. 2.1). Если LTR, Π°Π½Π°Π»ΠΎΠ³ΠΈΡ‡Π½ΠΎ LTR рСтровирусов, ΠΈΠ½ΠΈΡ†ΠΈΠΈΡ€ΡƒΠ΅Ρ‚ Ρ‚Ρ€Π°Π½ΡΠΊΡ€ΠΈΠΏΡ†ΠΈΡŽ Π½Π° Π³Ρ€Π°Π½ΠΈΡ†Π΅ U3 ΠΈ R ΠΎΠ±Π»Π°ΡΡ‚Π΅ΠΉ, Ρ‚ΠΎ ΠΏΡ€ΠΈ RT-PCR с ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌ Π΅Ρ€Π°ΠΌΠΈ Π Π— ΠΈ Π 4 Π±ΡƒΠ΄Π΅Ρ‚ ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΎΠ²Ρ‹Π²Π°Ρ‚ΡŒΡΡ ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΡƒΠΊΡ‚ Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ, Π° Ρ ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€Π°ΠΌΠΈ Π 1 ΠΈ Π 2 — Π½Π΅Ρ‚. (Π‘Ρ‚Ρ€ΠΎΠ³ΠΎ говоря, это относится ΠΊ ΡΠ»ΡƒΡ‡Π°ΡŽ, ΠΊΠΎΠ³Π΄Π° инициация транскрипции происходит Π² ΠΎΠ±Π»Π°ΡΡ‚ΠΈ LTR ΠΌΠ΅ΠΆΠ΄Ρƒ ΡƒΠΊΠ°Π·Π°Π½Π½Ρ‹ΠΌΠΈ двумя ΠΏΠ°Ρ€Π°ΠΌΠΈ ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ²). Амплификация с ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€Π°ΠΌΠΈ Π 1 ΠΈ Π 2, Π½ΠΎ Π½Π΅ с ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€Π°ΠΌΠΈ Π Π— ΠΈ Π 4, Π±ΡƒΠ΄Π΅Ρ‚ ΠΏΡ€ΠΎΠΈΡΡ…ΠΎΠ΄ΠΈΡ‚ΡŒ Ρ‚ΠΎΠ»ΡŒΠΊΠΎ Ρ‚ΠΎΠ³Π΄Π°, ΠΊΠΎΠ³Π΄Π° LTR слуТит Ρ‚Π΅Ρ€ΠΌΠΈΠ½Π°Ρ‚ΠΎΡ€ΠΎΠΌ транскрипции. ОбС ΠΏΠ°Ρ€Ρ‹ ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ² Π±ΡƒΠ΄ΡƒΡ‚ Π΄Π°Π²Π°Ρ‚ΡŒ ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΡƒΠΊΡ‚Ρ‹ Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ Π² Ρ‚ΠΎΠΌ случаС, Ссли LTR Π²Ρ…ΠΎΠ΄ΠΈΡ‚ Π² ΡΠΎΡΡ‚Π°Π² Π±ΠΎΠ»Π΅Π΅ Π΄Π»ΠΈΠ½Π½ΠΎΠ³ΠΎ транскрипта. Для раздСлСния Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… ΠΈΠ½Π΄ΠΈΠ²ΠΈΠ΄ΡƒΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… LTR Π±Ρ‹Π»ΠΈ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Π½Ρ‹ Π½Π°Π±ΠΎΡ€Ρ‹ ΡƒΠ½ΠΈΠΊΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ² Π 1 ΠΈ Π 4 (Ρ‚Π°Π±Π». 2, Π³Π»Π°Π²Π° «ΠœΠ°Ρ‚Π΅Ρ€ΠΈΠ°Π»Ρ‹ ΠΈ ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Ρ‹»).

ΠŸΡ€ΠΈ сравнСнии уровня транскрипции U3 ΠΈ U5 областСй LTR, ΠΌΡ‹ ΡΡ‡ΠΈΡ‚Π°Π»ΠΈ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ транскрибируСтся («+» Π² Ρ‚Π°Π±Π». 2.1), Ссли ΠΊ 37 Ρ†ΠΈΠΊΠ»Ρƒ Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ Π±Ρ‹Π»ΠΎ синтСзировано ΠΊΠ°ΠΊ ΠΌΠΈΠ½ΠΈΠΌΡƒΠΌ 100 Π½Π³ ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΡƒΠΊΡ‚Π°. Π’ Π±ΠΎΠ»ΡŒΡˆΠΈΠ½ΡΡ‚Π²Π΅ случаСв ΠΌΡ‹ Π΄Π΅Ρ‚Π΅ΠΊΡ‚ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π»ΠΈ 100 Π½Π³ ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΡƒΠΊΡ‚Π° ΡƒΠΆΠ΅ послС 35 Ρ†ΠΈΠΊΠ»ΠΎΠ² Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ ΠΈΠ»ΠΈ Ρ€Π°Π½Π΅Π΅. ΠœΡ‹ ΡΡ‡ΠΈΡ‚Π°Π»ΠΈ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ Π½Π΅ Ρ‚ранскрибируСтся, Ссли количСство ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΡƒΠΊΡ‚Π° Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ Π±Ρ‹Π»ΠΎ Π½ΠΈΠΆΠ΅ уровня Π΄Π΅Ρ‚Π΅ΠΊΡ†ΠΈΠΈ ΠΈΠ»ΠΈ составляло ΠΌΠ΅Π½Π΅Π΅ 5% ΠΎΡ‚ ΠΊΠΎΠ»ΠΈΡ‡Π΅ΡΡ‚Π²Π° самого слабого ΠΈΠ· Π΄Π΅Ρ‚Π΅ΠΊΡ‚ΠΈΡ€ΡƒΠ΅ΠΌΡ‹Ρ… ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΡƒΠΊΡ‚ΠΎΠ² («-» Π² Ρ‚Π°Π±Π». Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚ΠΎΠ²).

Π‘ΠΈΠ½Ρ‚Π΅Π· ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΠΎΠΉ Ρ†Π΅ΠΏΠΈ ΠΊΠ”ΠΠš ΠΏΡ€ΠΎΠ²ΠΎΠ΄ΠΈΠ»ΠΈ Π½Π° ΠΌΠ°Ρ‚Ρ€ΠΈΡ†Π΅ суммарной РНК, Π²Ρ‹Π΄Π΅Π»Π΅Π½Π½ΠΎΠΉ ΠΈΠ· Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… Ρ‚ΠΊΠ°Π½Π΅ΠΉ Ρ‡Π΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠ° ΠΈ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Ρ… Π»ΠΈΠ½ΠΈΠΉ. Для избСТания ΠΏΠΎΡ‚Π΅Ρ€ΡŒ Π½Π΅-ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠ°Π΄Π΅Π½ΠΈΠ»ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½Π½Ρ‹Ρ… LTR-содСрТащих рСгуляторных транскриптов ΠΈ Ρ‚ранскриптов, Π² ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Ρ… LTR Π²Ρ…ΠΎΠ΄ΠΈΡ‚ Π² ΡΠΎΡΡ‚Π°Π² ΠΈΠ½Ρ‚Ρ€ΠΎΠ½ΠΎΠ², ΠΊΠ”ΠΠš Π±Ρ‹Π»Π° синтСзирована с ΠΏΠΎΠΌΠΎΡ‰ΡŒΡŽ смСси ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ²: oligo (dT) ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€Π° ΠΈ ΡΡ‚атистичСских гСксамСров. Однако Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚Ρ‹ RT-PCR Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° Π±Ρ‹Π»ΠΈ качСствСнно ΠΎΠ΄ΠΈΠ½Π°ΠΊΠΎΠ²Ρ‹ΠΌΠΈ, ΠΊΠΎΠ³Π΄Π° для синтСза Π±Ρ‹Π»ΠΈ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Π½Ρ‹ Ρ‚ΠΎΠ»ΡŒΠΊΠΎ статистичСскиС гСксамСры (Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Π΅ Π½Π΅ ΠΏΡ€ΠΈΠ²ΠΎΠ΄ΡΡ‚ся). Π’ ΠΊΠ°Ρ‡Π΅ΡΡ‚Π²Π΅ контроля Π½Π° Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎΠ΅ присутствиС Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½ΠΎΠΉ Π”ΠΠš использовали ΠΊΠΎΠ½Ρ‚Ρ€ΠΎΠ»ΡŒΠ½Ρ‹Π΅ ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·Ρ†Ρ‹, ΠΏΡ€ΠΈΠ³ΠΎΡ‚ΠΎΠ²Π»Π΅Π½Π½Ρ‹Π΅ Π°Π±ΡΠΎΠ»ΡŽΡ‚Π½ΠΎ ΠΈΠ΄Π΅Π½Ρ‚ΠΈΡ‡Π½ΠΎ ΠΎΠΏΡ‹Ρ‚Π½Ρ‹ΠΌ, Π·Π° ΠΈΡΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ΠΌ отсутствия Π² Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½Π½ΠΎΠΉ смСси ΠΎΠ±Ρ€Π°Ρ‚Π½ΠΎΠΉ транскриптазы.

Π Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚Ρ‹ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° транскрипционной активности Π΄Π²ΡƒΡ… LTR ΠΈΠ· Π»ΠΎΠΊΡƒΡΠ° АВ64 ΠΈ Π’Π‘52 374 прСдставлСны Π½Π° Ρ€ΠΈΡ. 2.2, А.

Для подтвСрТдСния Ρ‚ΠΎΠ³ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·ΠΈΡ€ΡƒΠ΅ΠΌΡ‹Π΅ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½Ρ‹Π΅ локусы присутствовали Π² Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½ΠΎΠΉ Π”ΠΠš всСх ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΡƒΠ΅ΠΌΡ‹Ρ… Ρ‚ΠΊΠ°Π½Π΅ΠΉ ΠΈ Π»ΠΈΠ½ΠΈΠΉ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΠΊ, ΠΌΡ‹ ΠΏΡ€ΠΎΠ²ΠΎΠ΄ΠΈΠ»ΠΈ PCR Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΡŽ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½ΠΎΠΉ Π”ΠΠš с ΠΏΠ°Ρ€ΠΎΠΉ ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ² Π 1 ΠΈ Π 4 (Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Π΅ Π½Π΅ ΠΏΡ€ΠΈΠ²ΠΎΠ΄ΡΡ‚ся). PCR ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΡƒΠΊΡ‚ отсутствовал ΠΏΡ€ΠΈ Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ с ΡΡ‚ΠΎΠΉ ΠΏΠ°Ρ€ΠΎΠΉ ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ² Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½ΠΎΠΉ Π”ΠΠš ΠΈΠ»ΠΈ ΠΊΠ”ΠΠš Π³Ρ€Ρ‹Π·ΡƒΠ½ΠΎΠ², Π½Π΅ ΡΠΎΠ΄Π΅Ρ€ΠΆΠ°Ρ‰ΠΈΡ… ΠΊΠ°ΠΊΠΈΡ…-Π»ΠΈΠ±ΠΎ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚Π΅ΠΉ HERV.

Π§Ρ‚ΠΎΠ±Ρ‹ ΠΎΡ†Π΅Π½ΠΈΡ‚ΡŒ Ρ‚Ρ€Π°Π½ΡΠΊΡ€ΠΈΠΏΡ†ΠΈΠΎΠ½Π½ΡƒΡŽ Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ исслСдуСмых LTR ΠΈ ΠΊΠΎΠ»ΠΈΡ‡Π΅ΡΡ‚Π²ΠΎ LTR-содСрТащих транскриптов, ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ соотнСсти ΠΏΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π΅Π½Π½Ρ‹Π΅ Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚Ρ‹ с ΠΊΠΎΠ»ΠΈΡ‡Π΅ΡΡ‚Π²ΠΎΠΌ транскриптов Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ½Π°. ΠšΠΎΠ»ΠΈΡ‡Π΅ΡΡ‚Π²ΠΎ LTR-содСрТащих транскриптов составляло ΠΎΠΊΠΎΠ»ΠΎ 0.1−1% ΠΎΡ‚ ΠΊΠΎΠ»ΠΈΡ‡Π΅ΡΡ‚Π²Π° транскриптов Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ½Π° Π² ΠΎΠ΄Π½ΠΈΡ… ΠΈ Ρ‚Π΅Ρ… ΠΆΠ΅ тканях ΠΈ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Ρ… линиях. НСсмотря Π½Π° ΡΡ€Π°Π²Π½ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎ Π½ΠΈΠ·ΠΊΡƒΡŽ ΠΏΡ€Π΅Π΄ΡΡ‚Π°Π²Π»Π΅Π½Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ, эти транскрипты Π±Ρ‹Π»ΠΈ достовСрно Π΄Π΅Ρ‚Π΅ΠΊΡ‚ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½Ρ‹ ΠΊ 33−37 Ρ†ΠΈΠΊΠ»Ρƒ Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ.

Вранскрипция Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… LTR Π² Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… тканях.

Как Π²ΠΈΠ΄Π½ΠΎ ΠΈΠ· Ρ€ΠΈΡ. 2.2 А, транскрипт, содСрТащий U5 ΠΎΠ±Π»Π°ΡΡ‚ΡŒ LTR ΠΈΠ· Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ локуса АВ6 684 присутствовал Π² ΡΠ΅ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠΌΠ΅, Π² Ρ‚ΠΎ Π²Ρ€Π΅ΠΌΡ ΠΊΠ°ΠΊ транскрипт, содСрТащий U3 ΠΎΠ±Π»Π°ΡΡ‚ΡŒ присутствовал Π² ΡΠΌΠ±Ρ€ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ ΠΊΠ°Ρ€Ρ†ΠΈΠ½ΠΎΠΌΠ΅.

А Π’.

АВ6 684.

U3 (Π 1- Π 2) U5 (Π Π— — Π 4).

Π‘Π΅ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠΌΠ°.

Π­ΠΌΠ±Ρ€ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½Π°Ρ ΠΊΠ°Ρ€Ρ†ΠΈΠ½ΠΎΠΌΠ° Ρ‰.

Π’Π‘52 374.

Π‘Π΅ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠΌΠ°.

Π­ΠΌΠ±Ρ€ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½Π°Ρ ΠΊΠ°Ρ€Ρ†ΠΈΠ½ΠΎΠΌΠ°.

33 35 37.

35 37.

АБ2 508 ΠšΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡Π½Π°Ρ линия Jurkat послС Ρ‚Π΅ΠΏΠ»ΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎ шока.

U3 (Π 1- Π 2) U5 (Π Π—Π 4).

33 35 37 33 35 37 Амплификация LTR (Π 1- Π 4).

34 37 34 37 ΠΊΠ”ΠΠš гСномная Π”ΠΠš.

Рис. 2.2 ΠŸΡ€ΠΈΠΌΠ΅Ρ€ Π΄ΠΈΡ„Ρ„Π΅Ρ€Π΅Π½Ρ†ΠΈΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠ³ΠΎ RT-PCR. На ΠΏΠ°Π½Π΅Π»ΠΈ (А) прСдставлСна Π΄ΠΈΡ„Ρ„Π΅Ρ€Π΅Π½Ρ†ΠΈΠ°Π»ΡŒΠ½Π°Ρ Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΈΠ½Π΄ΠΈΠ²ΠΈΠ΄ΡƒΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… LTR Π² Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… опухолях. Надписи U3 ΠΈ U5 ΡΠΎΠΎΡ‚Π²Π΅Ρ‚ΡΡ‚Π²ΡƒΡŽΡ‚ Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ с ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€Π°ΠΌΠΈ, ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°Ρ€Π½Ρ‹ΠΌΠΈ U3 ΠΈ U5 областям LTR, соотвСтствСнно. АВ6 684, Π’Π‘52 374, АБ2 508 — Π½ΠΎΠΌΠ΅Ρ€Π° исслСдованных LTR-содСрТащих Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½Ρ‹Ρ… локусов ΠΏΠΎ GenBank. Π¦ΠΈΡ„Ρ€Ρ‹ 33−35−37 ΠΎΠ±ΠΎΠ·Π½Π°Ρ‡Π°ΡŽΡ‚ количСство Ρ†ΠΈΠΊΠ»ΠΎΠ² Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ. На ΠΏΠ°Π½Π΅Π»ΠΈ (Π’) прСдставлСны Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚Ρ‹ Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ U3 ΠΈ U5 областСй LTR АБ2 508 Π² Π»ΠΈΠ½ΠΈΠΈ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΠΊ Jurkat послС Ρ‚Π΅ΠΏΠ»ΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎ шока. ΠžΡ‚ΡΡƒΡ‚ΡΡ‚Π²ΠΈΠ΅ транскрипта, содСрТащСго ΠΏΠΎΠ»Π½ΠΎΡ€Π°Π·ΠΌΠ΅Ρ€Π½Ρ‹ΠΉ LTR АБ2 508, Π΄ΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΎ Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠ΅ΠΉ с ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€Π°ΠΌΠΈ PI-P4.

Наоборот, транскрипт, содСрТащий U3 ΠΎΠ±Π»Π°ΡΡ‚ΡŒ LTR ΠΈΠ· Π»ΠΎΠΊΡƒΡΠ° Π’Π‘52 374 Π΄Π΅Ρ‚Π΅ΠΊΡ‚ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π»ΠΈ Π² ΡΠ΅ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠΌΠ΅ ΠΈ ΡΠΌΠ±Ρ€ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ ΠΊΠ°Ρ€Ρ†ΠΈΠ½ΠΎΠΌΠ΅, Π² Ρ‚ΠΎ Π²Ρ€Π΅ΠΌΡ ΠΊΠ°ΠΊ U5 содСрТащий транскрипт этого LTR Π½Π΅ Π΄Π΅Ρ‚Π΅ΠΊΡ‚ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π»ΠΈ Π½ΠΈ Π² ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠΉ ΠΈΠ· ΠΈΡΡΠ»Π΅Π΄ΡƒΠ΅ΠΌΡ‹Ρ… Π½ΠΎΡ€ΠΌΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… ΠΈ ΠΎΠΏΡƒΡ…ΠΎΠ»Π΅Π²Ρ‹Ρ… Ρ‚ΠΊΠ°Π½Π΅ΠΉ. Π Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚Ρ‹ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° транскрипционной активности LTR Π½Π° ΠΏΠ°Π½Π΅Π»ΠΈ ΠΊΠ”ΠΠš ΠΈΠ· ΡˆΠ΅ΡΡ‚ΠΈ Ρ‚ΠΊΠ°Π½Π΅ΠΉ ΠΈ Ρ‚Ρ€Π΅Ρ… ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Ρ… Π»ΠΈΠ½ΠΈΠΉ суммированы Π² Ρ‚Π°Π±Π»ΠΈΡ†Π΅ 2.1. Из ΠΏΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π΅Π½Π½Ρ‹Ρ… Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚ΠΎΠ² ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ ΡΠ΄Π΅Π»Π°Ρ‚ΡŒ Π²Ρ‹Π²ΠΎΠ΄, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Π² Ρ†Π΅Π»ΠΎΠΌ, транскрипционная Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ LTR зависит ΠΎΡ‚ Ρ‚ΠΈΠΏΠ° исслСдуСмой Ρ‚ΠΊΠ°Π½ΠΈ ΠΈΠ»ΠΈ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΎΠΉ Π»ΠΈΠ½ΠΈΠΈ. НапримСр, LTR-содСрТащий транскрипт ΠΈΠ· Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ локуса АБ2 508 Π½Π΅ Π΄Π΅Ρ‚Π΅ΠΊΡ‚ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π»ΠΈ Π² ΠΏΠ»Π°Ρ†Π΅Π½Ρ‚Π΅ ΠΈ ΡΠΌΠ±Ρ€ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ ΠΊΠ°Ρ€Ρ†ΠΈΠ½ΠΎΠΌΠ΅, Π² Ρ‚ΠΎ Π²Ρ€Π΅ΠΌΡ ΠΊΠ°ΠΊ U3 ΠΈ U5 области этого LTR Ρ‚Ρ€Π°Π½ΡΠΊΡ€ΠΈΠ±ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π»ΠΈΡΡŒ Π² ΡΠ΅ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠΌΠ΅ ΠΈ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΎΠΉ Π»ΠΈΠ½ΠΈΠΈ рабдомиосаркомы. Помимо этого слСдуСт ΠΎΡ‚ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΈΡ‚ΡŒ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ спСктр транскриптов ΠΈΠ½Π΄ΠΈΠ²ΠΈΠ΄ΡƒΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… LTR отличался Π² Π½ΠΎΡ€ΠΌΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ ΠΈ ΠΎΠΏΡƒΡ…ΠΎΠ»Π΅Π²ΠΎΠΉ тканях, ΠΈ Π² Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… ΠΎΠΏΡƒΡ…ΠΎΠ»Π΅Π²Ρ‹Ρ… тканях (Ρ‚Π°Π±Π». 2.1).

ΠŸΠΎΠΊΠ°Π·Π°Ρ‚ΡŒ вСсь тСкст

Бписок Π»ΠΈΡ‚Π΅Ρ€Π°Ρ‚ΡƒΡ€Ρ‹

  1. J. McPherson, et al., A physical map of the human genome. Nature, 2001.409(6822): p. 934−41.
  2. E. Lander, et al., Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature, 2001. 409(6822): p. 860−921.
  3. J. Brosius, et al., RNAs from all categories generate retrosequences that may be exapted as novel genes or regulatory elements. Gene, 1999. 238(1): p. 115−34.
  4. H. Kazazian, et al., LI retrotransposons shape the mammalian genome. Science, 2000. 289(5482): p. 1152−1153.
  5. R. Lower, J. Lower, and R. Kurth, The viruses in all of us: characteristics and biological significance of human endogenous retrovirus sequences. Proc Natl Acad Sci U S A, 1996. 93(11): p. 5177−5184.
  6. I. Yulug, A. Yulug, and E. Fisher, The frequency and position of Alu repeats in cDNAs, as determined by database searching. Genomics, 1995.27(3): p. 544−548.
  7. P. Medstrand, Retroelement distributions in the human genome: variations associated with age and proximity to genes. Genome Res, 2002. Oct- 12(10): p. 1483−95.
  8. H. Kazazian, An estimated frequency of endogenous insertional mutations in humans. Nat Genet, 1999.22(2): p. 130.
  9. P. Nouvel, The mammalian genome shaping activity of reverse transcriptase. Genetica, 1994. 93(1−3): p. 191−201.
  10. C. Leib-Mosch and W. Seifarth, Evolution and biological significance of human retroelements. Virus Genes, 1995. 11(2−3): p. 133−45.
  11. W. Chu, et al., Potential Alu function: regulation of the activity of double-stranded RNA-activated kinase PKR. Mol Cell Biol, 1998. 18(1): p. 58−68.
  12. A. Florl, et al., DNA methylation and expression of LINE-1 and HERV-K provirus sequences in urothelial and renal cell carcinomas. Br J Cancer, 1999. 80(9): p. 13 121 321.
  13. G. Alves, A. Tatro, and T. Fanning, Differential methylation of human LINE-1 retrotransposons in malignant cells. Gene, 1996. 176(1−2): p. 39−44.
  14. M. Kidwell and D. Lisch, Transposable elements as sources of variation in animals and plants. Proc Natl Acad Sci USA, 1997. 94(15): p. 7704−7711.
  15. P. Π₯Ссин, НСпостоянство Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ°. 1984, Москва: Наука. 472−472.
  16. J. Yoder, Π‘. Walsh, and Π’. Bestor, Cytosine methylation and the ecology of intragenomic parasites. Trends Genet, 1997. 13(8): p. 335−40.
  17. A. Smit, The origin of interspersed repeats in the human genome. Curr Opin Genet Dev, 1996. 6(6): p. 743−8.
  18. E. Whitelaw and D. Martin, Retrotransposons as epigenetic mediators of phenotypic variation in mammals. Nat Genet, 2001. 27(4): p. 361−5.
  19. Π‘. Esnault, J. Maestre, and T. Heidmann, Human LINE retrotransposons generate processed pseudogenes. Nat Genet, 2000. 24(4): p. 363−7.
  20. R. DeBerardinis, et al., Rapid amplification of a retrotransposon subfamily is evolving the mouse genome. Nat Genet, 1998. 20(3): p. 288−90.
  21. H. Kazazian, and J. Moran, The impact of LI retrotransposons on the human genome. Nat Genet, 1998.19(1): p. 19−24.
  22. A. Scott, et al., Origin of the human LI elements: proposed progenitor genes deduced from a consensus DNA sequence. Genomics, 1987. 1(2): p. 113−25.
  23. H. Hohjoh and M. Singer, Cytoplasmic ribonucleoprotein complexes containing human LINE-1 protein and RNA. Embo J, 1996.15(3): p. 630−9.
  24. D. Leibold, et al., Translation of LINE-1 DNA elements in vitro and in human cells. Proc Natl Acad Sci USA, 1990. 87(18): p. 6990−4.
  25. J. McMillan and M. Singer, Translation of the human LINE-1 element, LIHs. Proc Natl Acad Sci USA, 1993. 90(24): p. 11 533−7.
  26. A. Smit, et al., Ancestral, mammalian-wide subfamilies of LINE-1 repetitive sequences. J Mol Biol, 1995. 246(3): p. 401−417.
  27. M. Singer, et al., LINE-1: a human transposable element. Gene, 1993. 135(1−2): p. 183−8.
  28. A. Clements and M. Singer, The human LINE-1 reverse transcriptase: effect of deletions outside the common reverse transcriptase domain. Nucleic Acids Res, 1998. 26(15): p. 3528−35.
  29. S. Lee, J. Wong, and K. Collins, Human telomerase reverse transcriptase motifs required for elongation of a telomeric substrate. J Biol Chem, 2003.
  30. Y. Miki, Retrotransposal integration of mobile genetic elements in human diseases. J Hum Genet., 1998. 43(2): p. 77−84.
  31. J. Skowronski and M. Singer, Expression of a cytoplasmic LINE-1 transcript is regulated in a human teratocarcinoma cell line. Proc Natl Acad Sci USA, 1985. 82(18): p. 6050−4.
  32. J. Goodier, E. Ostertag, and H. Kazazian, Transduction of Π—'-flanking sequences is common in LI retrotransposition. Hum Mol Genet, 2000. 9(4): p. 653−7.
  33. V. Perepelitsa-Belancio and P. Deininger, RNA truncation by premature polyadenylation attenuates human mobile element activity. Nat Genet, 2003. 35(4): p. 363−6.
  34. B. Brouha, et al., Hot Lis account for the bulk of retrotransposition in the human population. Proc Natl Acad Sci USA, 2003. 100(9): p. 5280−5.
  35. E. Ostertag and H. Kazazian, Biology of mammalian LI retrotransposons. Annu Rev Genet, 2001. 35: p. 501−38.
  36. Y. Miki, etal., Disruption oftheAPC gene by a retrotransposal insertion of LI sequence in a colon cancer. Cancer Res, 1992. 52(3): p. 643−5.
  37. Z. Yang, et al., Apolipoprotein (a) gene enhancer resides within a LINE element. J Biol Chem, 1998.273(2): p. 891−7.
  38. S. Kurachi, et al., Genetic mechanisms of age regulation of human blood coagulation factor IX. Science, 1999. 285(5428): p. 739−43.
  39. B. Shewchuk, N. Cooke, and S. Liebhaber, The human growth hormone locus control region mediates long-distance transcriptional activation independent of nuclear matrix attachment regions. Nucleic Acids Res, 2001. 29(16): p. 3356−61.
  40. E.D. Sverdlov, Perpetually mobile footprints of ancient infections in human genome. FEBS Lett, 1998. 428(1−2): p. 1−6.
  41. M. Haltmeier, et al., Identification of S71-related human endogenous retroviral sequences with full-length pol genes. Virology, 1995. 209(2): p. 550−560.
  42. M. Cohen and E. Larsson, Human endogenous retroviruses. Bioessays, 1988. 9(6): p. 191−6.
  43. M. Barbulescu, et al., Many human endogenous retrovirus К (HERV-K) proviruses are unique to humans. Curr Biol, 1999. 9: p. 861−868.
  44. M. Knossl, R. Lower, and J. Lower, Expression of the human endogenous retrovirus HTDV/HERV-K is enhanced by cellular transcription factor YY1. J Virol, 1999. 73(2): p. 1254−1261.
  45. H. Urnovitz and W. Murphy, Human endogenous retroviruses: nature, occurrence, and clinical implications in human disease. Clin Microbiol Rev, 1996. 9(1): p. 72−99.
  46. J. Martin, et al., Human endogenous retrovirus type I-related viruses have an apparently widespread distribution within vertebrates. J Virol, 1997. 71(1): p. 437−43.
  47. M. Tristem, Identification and characterization of novel human endogenous retrovirus families by phylogenetic screening of the human genome mapping project database. J Virol, 2000. 74(8): p. 3715−30.
  48. E. Herniou, et al., Retroviral diversity and distribution in vertebrates. J Virol, 1998. 72(7): p. 5955−66.
  49. A. Smit, Identification of a new, abundant superfamily of mammalian LTR-transposons. Nucleic Acids Res, 1993. 21(8): p. 1863−72.
  50. M. Andersson, et al., Diversity of human endogenous retrovirus class II-like sequences. J Gen Virol, 1999. 80(Part 1): p. 255−260.
  51. J. Hughes and J. Coffin, Human endogenous retrovirus К solo-LTR formation and insertional polymorphisms: implications for human and viral evolution. Proc Natl Acad Sci USA, 2004. 101(6): p. 1668−72.
  52. S. Anderssen, et al., Comparative analyses of LTRs of the ERV-H family of primate-specific retrovirus-like elements isolated from marmoset, African green monkey, and man. Virology, 1997. 234(1): p. 14−30.
  53. N. de Parseval, H. Alkabbani, and T. Heidmann, The long terminal repeats of the HERV-H human endogenous retrovirus contain binding sites for transcriptional regulation by the Myb protein. J Gen Virol, 1999. 80 (Pt 4): p. 841−5.
  54. J. Mayer, E. Meese, and N. Mueller-Lantzsch, Human endogenous retrovirus К homologous sequences and their coding capacity in Old World primates. J Virol, 1998. 72(3): p. 1870−1875.
  55. I. Lavrentieva, et al., Subfamilies and nearest-neighbour dendrogram for the LTRs of human endogenous retroviruses HERV-K mapped on human chromosome 19: physical neighbourhood does not correlate with identity level. Hum Genet, 1998. 102(1): p. 107−116.
  56. Y. Lebedev, et al., Physical mapping of sequences homologous to an endogenous retrovirus LTR on human chromosome 19. Mol Gen Genet, 1995. 247(6): p. 742−748.
  57. И. Артамонова, et al., НСслучайноС распрСдСлСниС рСгуляторных элСмСнтов LTR эндогСнных рСтровирусов HERV-K Π½Π° 22 хромосомС Ρ‡Π΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠ°. Π”ΠΎΠΊΠ»Π°Π΄Ρ‹ Π°ΠΊΠ°Π΄Π΅ΠΌΠΈΠΈ Π½Π°ΡƒΠΊ, 2000. 372(1−6): Ρ€. 87−9.
  58. S. Steinhuber, et al., Distribution of human endogenous retrovirus HERV-K genomes in humans and different primates. Hum Genet, 1995. 96(2): p. 188−192.
  59. C. Leib-Mosch, et al., Genomic distribution and transcription of solitary HERV-K LTRs. Genomics, 1993. 18: p. 261−269.
  60. V. Kapitonov and J. Jurka, The long terminal repeat of an endogenous retrovirus induces alternative splicing and encodes an additional carboxy-terminal sequence in the human leptin receptor. J Mol Evol, 1999. 48(2): p. 248−251.
  61. P. Kowalski, et al., Genomic structure and evolution of a novel gene (PLA2L) with duplicated phospholipase A2-like domains. Genomics, 1997. 39(1): p. 38−46.
  62. P. Kowalski and D. Mager, A human endogenous retrovirus suppresses translation of an associated fusion transcript, PLA2L. J Virol, 1998. 72(7): p. 6164−6168.
  63. K. Kato, Description of the entire mRNA population by a 3' end cDNA fragment generated by class IIS restriction enzymes. Nucleic Acids Res, 1995. 23(18): p. 368 590.
  64. T. Vinogradova, et al., Positioning of 72 potentially full size LTRs of human endogenous retroviruses HERV-K on the human chromosome 19 map. Occurrences of the LTRs in human gene sites. Gene, 1997. 199(1−2): p. 255−264.
  65. S. Kurdyukov, et al., Full-sized HERV-K (HML-2) human endogenous retroviral LTR sequences on human chromosome 21: map locations and evolutionary history. Gene, 2001. 273(1): p. 51−61.
  66. S. Baban, J. Freeman, and D. Mager, Transcripts from a novel human ΠšΠ›ΠΠ’ zinc finger gene contain spliced Alu and endogenous retroviral segments. Genomics, 1996. 33(3): p. 463−472.
  67. A. Domansky, et al., Solitary HERV-K LTRs possess bi-directional promoter activity and contain a negative regulatory element in the U5 region. FEBS Lett, 2000. 472(2−3): p. 191−195.
  68. M. Landry, Functional analysis of the endogenous retroviral promoter of the human endothelin Π’ receptor gene. J Virol., 2003. Jul-77(13): p. 7459−66.
  69. R. Waterston, et al., Initial sequencing and comparative analysis of the mouse genome. Nature, 2002. 420(6915): p. 520−62.
  70. Π‘. Larsson and G. Andersson, Beneficial role of human endogenous retroviruses: Facts and hypotheses. Scand J Immunol, 1998. 48(4): p. 329−338.
  71. C. Patience, D. Wilkinson, and R. Weiss, Our retroviral heritage. Trends Genet, 1997. 13(3): p. 116−120.
  72. J. Harris, Placental endogenous retrovirus (ERV): structural, functional, and evolutionary significance. Bioessays, 1998. 20(4): p. 307−316.
  73. J. Lyden, J.M.Mwenda, N. Rote, Ultrastructural characterization of endogenous retroviral particles isolated from normal human placentas. Biol Reprod., 1994. Jul-51(1): p. 152−7.
  74. C. Leib-Mosch, et al., Expression and biological sugnificance of human endogenous retroviral sequences. Leukemia, 1992. 6 Suppl 3: p. 72S-75S.
  75. W. Seifarth, et al., Retrovirus-like particles released from the human breast cancer cell line T47-D display type B- and C-related endogenous retroviral sequences. J Virol, 1995. 69(10): p. 6408−6416.
  76. G. Simpson, et al., Endogenous D-type (HERV-K) related sequences are packaged into retroviral particles in the placenta and possess open reading frames for reverse transcriptase. Virology, 1996. 222(2): p. 451−456.
  77. M. Lindeskog, et al., Coamplification and dispersion of adjacent human endogenous retroviral HERV-H and HERV-E elements- Presence of spliced hybrid transcripts in normal leukocytes. Virology, 1998. 244(1): p. 219−229.
  78. M. Ono, M. Kawakami, and H. Ushikubo, Stimulation of expression of the human endogenous retrovirus genome by female steroid hormones in human breast cancer cell line T47D. J Virol, 1987. 61(6): p. 2059−2062.
  79. A. Wilier, et al., Two groups of endogenous MMTV related retroviral env transcripts expressed in human tissues. Virus Genes, 1997. 15(2): p. 123−133.
  80. N. Gotzinger, et al., Regulation of human endogenous retrovirus-K Gag expression in teratocarcinoma cell lines and human tumours. J Gen Virol, 1996. 77(12): p. 29 832 990.
  81. I. Brodsky, B. Foley, and D. Gillespie, Expression of human endogenous retrovirus (HERV-K) in chronic myeloid leukemia. Leuk Lymphoma, 1993. 11 (Suppl 1): p. 11 923.
  82. K. Boiler, et al., Evidence that HERV-K is the endogenous retrovirus sequence that codes for the human teratocarcinoma-derived retrovirus HTDV. Virology, 1993. 196(1): p. 349−353.
  83. Q. Long, et al., A long terminal repeat of the human endogenous retrovirus ERV-9 is located in the 5' boundary area of the human beta- globin locus control region. Genomics, 1998. 54(3): p. 542−555.
  84. W. Goodchild NL, Mager DL., A human endogenous long terminal repeat provides a polyadenylation signal to a novel, alternatively spliced transcript in normal placenta. Gene, 1992. 16(121(2)): p. 287−94.
  85. E. Sverdlov, Retroviral regulators of gene expression in the human genome as possible factors for its evolution. Bioorg Khim, 1999.25(11): p. 821−827.
  86. I. Afonina, et al., Efficient priming of PCR with short oligonucleotides conjugated to a minor groove binder. Nucleic Acids Res, 1997. 25(13): p. 2657−60.
  87. П. Π₯иль, et al., Бтруктурная характСристика Ρ‡Π΅Ρ‚Ρ‹Ρ€Π΅Ρ… Π΄Π»ΠΈΠ½Π½Ρ‹Ρ… ΠΊΠΎΠ½Ρ†Π΅Π²Ρ‹Ρ… ΠΏΠΎΠ²Ρ‚ΠΎΡ€ΠΎΠ² (LTR) эндогСнных рСтровирусов Ρ‡Π΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠ° ΠΈ Ρ…арактСристикаих сайтов ΠΈΠ½Ρ‚Π΅Π³Ρ€Π°Ρ†ΠΈΠΈ. БиоорганичСская химия, 1997. 23(5): Ρ€. 434−440.
  88. L. van de Lagemaat, et al., Transposable elements in mammals promote regulatory variation and diversification of genes with specialized functions. Trends Genet, 2003. 19(10): p. 530−6.
  89. L. Chene, et al., High-level replication of human immunodeficiency virus in thymocytes requires NF-kappaB activation through interaction with thymic epithelial cells. J Virol, 1999. 73(3): p. 2064−73.
  90. U. Schon, et al., Cell type-specific expression and promoter activity of human endogenous retroviral long terminal repeats. Virology, 2001.279(1): p. 280−291.
  91. A. Caricasole, et al., Bone morphogenetic proteins and retinoic acid induce human endogenous retrovirus HERV-K expression inNT2Dl human embryonal carcinoma cells. Dev Growth Differ, 2000.42(4): p. 407−411.
  92. L. Lania, et al., Structural and functional organization of the human endogenous retroviral ERV9 sequences. Virology, 1992. 191(1): p. 464−468.
  93. S. Akopov, et al., Long terminal repeats of human endogenous retrovirus К family (HERV-K) specifically bind host cell nuclear proteins. FEBS Lett, 1998. 421(3): p. 229−233.
  94. J. Liu, et al., The matrix attachment region-binding protein SATB1 participates in negative regulation of tissue-specific gene expression. Mol Cell Biol, 1997. 17(9): p. 5275−87.
  95. P. Schneider, et al., The endogenous retroviral insertion in the human complement C4 gene modulates the expression of homologous genes by antisense inhibition. Immunogenetics, 2001. 53(1): p. 1−9.
  96. C. Lin, D. Goldthwait, and D. Samols, Induction of transcription from the long terminal repeat of Moloney murine sarcoma provirus by UV-irradiation, x-irradiation, and phorbol ester. Proc Natl Acad Sci USA, 1990. 87(1): p. 36−40.
  97. H. Herbst, M. Sauter, and N. Mueller-Lantzsch, Expression of human endogenous retrovirus К elements in germ cell and trophoblastic tumors. Am J Pathol, 1996. 149(5): p. 1727−1735.
  98. R. Tonjes, et al., HERV-K: the biologically most active human endogenous retrovirus family. J Acquir Immune Defic Syndr Hum Retrovirol, 1996. 13: p. S261−267.
  99. J. Blond, et al., Molecular characterization and placental expression of HERV-W, a new human endogenous retrovirus family. J Virol, 1999. 73(2): p. 1175−1185.
  100. M. Boyd, et al., The human endogenous retrovirus ERV-3 is upregulated in differentiating placental trophoblast cells. Virology, 1993. 196: p. 905−909.
  101. A. Cordonnier, J. Casella, and T. Heidmann, Isolation of novel human endogenous retrovirus-like elements with foamy virus-related pol sequence. J Virol, 1995. 69(9): p. 5890−5897.
  102. N. Kato, et al., Tissue-specific expression of human provirus ERV3 mRNA in human placenta: two of the three ERV3 mRNAs contain human cellular sequences. J Virol, 1987. 61(7): p. 2182−21 891.
  103. N. Kato, et al., Human proviral mRNAs down regulated in choriocarcinoma encode a zinc finger protein related to Kruppel. Mol Cell Biol, 1990. 10: p. 4401−4405.
  104. K. Katsumata, et al., Tissue-specific high-level expression of human endogenous retrovirus-R in the human adrenal cortex. Pathobiology, 1998. 66(5): p. 209−215.
  105. D. Langat, et al., Characterization of antigens expressed in normal baboon trophoblast and cross-reactive with HIV/SIV antibodies. J Reprod Immunol, 1999.42(1): p. 41−58.
  106. E. Larsson, et al., Expression of the endogenous retrovirus ERV3 (HERV-R) during induced monocytic differentiation in the U-937 cell line. Int J Cancer, 1996. 67(3): p. 451−456.
  107. E. Larsson, et al., Tissue and differentiation specific expression on the endogenous retrovirus ERV3 (HERV-R) in normal human tissues and during induced monocytic differentiation in the U-937 cell line. Leukemia, 1997. 3: p. 142−144.
  108. G. Franklin, et al., Expression of human sequences related to those of mouse mammary tumor virus. J Virol, 1988. 62(4): p. 1203−10.
  109. C. Kjellman, et al., HERV-F (XA34) is a full-length human endogenous retrovirus expressed in placental and fetal tissues. Gene, 1999. 239(1): p. 99−107.
  110. T. Johansen, T. Holm, and E. Bjorklid, Members of the RTVL-H family of human endogenous retrovirus-like elements are expressed in placenta. Gene, 1989. 79(2): p. 259−67.
  111. M. Sibata, et al., Human endogenous retroviruses: expression in various organs in vivo and its regulation in vitro. Leukemia, 1997. 3: p. 145−146.
  112. G. Andersson, et al., Retroelements in the human MHC class II region. Trends Genet, 1998. 14(3): p. 109−114.
  113. T. Bera, et al., Defective retrovirus insertion activates c-Ha-ras protooncogene in an MNU-induced rat mammary carcinoma. Biochem Biophys Res Commun, 1998. 248(3): p. 835−40.
  114. N. Amariglio and G. Rechavi, Insertional mutagenesis by transposable elements in the mammalian genome. Environ Mol Mutagen, 1993. 21(3): p. 212−8.
  115. H. Herbst, et al., Gene products of human endogenous retrovirus (HERV)-K in germ cell and trophoblastic tumors. German. Verhandlungen der Deutschen Gesellschaft fur Pathologie, 1997. 81: p. 464−470.
  116. K. Nakagawa and L. Harrison, The potential roles of endogenous retroviruses in autoimmunity. Immunol Rev, 1996. 152: p. 193−236.
  117. S. Indraccolo, et al., Identification of three human sequences with viral superantigen-specific primers. Mamm Genome, 1995. 6(5): p. 339−344.
  118. A. Bengtsson, et al., Selective antibody reactivity with peptides from human endogenous retroviruses and nonviral poly (amino acids) in patients with systemic lupus erythematosus. Arthritis Rheum, 1996. 39(10): p. 1654−1663.
  119. M. Turbeville, et al., Expression of a putative immunosuppressive protein in human tumors and tissues. Pathobiology, 1996. 64(5): p. 233−238.
  120. M. Turbeville, et al., Characterization of a putative retroviral env-related human protein. Pathobiology, 1997. 65(3): p. 123−128.
  121. G. Krieg, A. Perl, Endogenous retroviruses: potential etiologic agents in autoimmunity. FASEB J., 1992. 6((8)): p. 2537−44.
  122. W. Vogetseder, et al., Detection of a 67-kD glycoprotein in human tumor cell lines by a monoclonal antibody established against a recombinant human endogenous retrovirus-K envelope-gene-encoded protein. Exp Clin Immunogenet, 1995. 12(2): p. 96−102.
  123. H. Rasmussen, et al., Expression of endogenous retroviruses in blood mononuclear cells and brain tissue from multiple sclerosis patients. Mult Scler, 1995. 1(2): p. 82−87.
  124. K. Badenhoop, et al., IDDM patients neither show humoral reactivities against endogenous retroviral envelope protein nor do they differ in retroviral mRNA expression from healthy relatives or normal individuals. Diabetes, 1999.48(1): p. 215 218.
  125. A. Muir, et al., The IDDMK (1,2)22 retrovirus is not detectable in either mRNA or genomic DNA from patients with type 1 diabetes. Diabetes, 1999.48(1): p. 219−222.
  126. M. Pani, et al., Preliminary evidence that an endogenous retroviral long-terminal repeat (LTR13) at the HLA-DQB1 gene locus confers susceptibility to Addison’s disease. Clin Endocrinol (Oxf), 2002. 56(6): p. 773−7.
  127. R. Landry, P. Medstrand, D. Mager, The opitz syndrome gene midl is transcribed from a human endogenous retroviral promoter. Mol Biol Evol., 2003. Nov-19(l 1): p. 193 442.132,133.134,135,136,137,138 139,140141,142 143,144145146147,
  128. A. Schulte and A. Wellstein, Structure and phylogenetic analysis of an endogenous retrovirus inserted into the human growth factor gene pleiotrophin. J Virol, 1998. 72(7): p. 6065−6072.
  129. F. Baribaud, et al., Identification of key amino acids of the mouse mammary tumor virus superantigen involved in the specific interaction with T-cell receptor V (beta) domains. J Virol, 2001. 75(16): p. 7453−61.
  130. A. Barnett, et al., Expression of mouse mammary tumor virus superantigen mRNA in the thymus correlates with kinetics of self-reactive T-cell loss. J Virol, 1999. 73(8): p. 6634−45.
  131. B. Morse, et al., Insertional mutagenesis of the myc locus by a LINE-1 sequence in a human breast carcinoma. Nature, 1988. 333(6168): p. 87−90.
  132. E. Amariglio, et al., Identity of rearranged LINE/c-MYC junction sequences specific for the canine transmissible venereal tumor. Proc Natl Acad Sci USA, 1991. 88(18): p. 8136−9.
  133. D. Givol, Activation of oncogenes by transposable elements. Biochem Soc Symp, 1986. 51: p. 183−96.
  134. H. Kazazian, et al., Haemophilia A resulting from de novo insertion of LI sequences represents a novel mechanism for mutation in man. Nature, 1988. 332(6160): p. 164 166.
  135. B. Moon and J. Friedman, The molecular basis of the obese mutation in ob2J mice. Genomics, 1997.42(1): p. 152−6.
  136. A. Schulte, et al., Human trophoblast and choriocarcinoma expression of the growth factor pleiotrophin attributable to germ-line insertion of an endogenous retrovirus. Proc Natl Acad Sci USA, 1996. 93(25): p. 14 759−14 764.
  137. H. Roelofs, et al., Detection of human endogenous retrovirus type K-specific transcripts in testicular parenchyma and testicular germ cell tumors of adolescents and adults: clinical and biological implications. Am J Pathol, 1998. 153(4): p. 1277−1282.
  138. Y. Lebedev, et al., Differences in HERV-K LTR insertions in orthologous loci of human and great apes. Gene, 2000. 247(1−2): p. 265−277.
  139. A. Femino, et al., Visualization of single RNA transcripts in situ. Science, 1998. 280(5363): p. 585−90.
  140. P. Nelson, et al., Negative selection: a method for obtaining low-abundance cDNAs using high-density cDNA clone arrays. Genet Anal, 1999. 15(6): p. 209−215.
  141. A. Casau, et al., Germ cell expression of an isolated human endogenous retroviral long terminal repeat of the HERV-K/HTDV family in transgenic mice. J Virol, 1999. 73(12): p. 9976−9983.
  142. C. Baust, et al., HERV-K-T47D-Related long terminal repeats mediate polyadenylation of cellular transcripts. Genomics, 2000. 66(1): p. 98−103.
  143. D. Mager, et al., Endogenous retroviruses provide the primary polyadenylation signal for two new human genes. Genomics, 1999. 59(3): p. 255−263.
  144. A. Feuchter and D. Mager, Functional heterogeneity of a large family of human LTR-like promoters and enhancers. Nucleic Acids Res, 1990. 18(5): p. 1261−1270.
  145. H. Ashe, et al., Intergenic transcription and transinduction of the human beta-globin locus. Genes Dev, 1997. 11(19): p. 2494−2509.
  146. J. Gribnau, et al., Intergenic transcription and developmental remodeling of chromatin subdomains in the human beta-globin locus. Mol Cell, 2000. 5(2): p. 377−386.
  147. J. Pardinas, et al., Differential subtraction display: a unified approach for isolation of cDNAs from differentially expressed genes. Anal Biochem, 1998. 257(2): p. 161−8.
  148. N. Ivanova and A. Belyavsky, Identification of differentially expressed genes by restriction endonuclease-based gene expression fingerprinting. Nucleic Acids Res, 1995. 23(15): p. 2954−8.
  149. Y. Prashar and S. Weissman, Analysis of differential gene expression by display of 3' end restriction fragments of cDNAs. Proc Natl Acad Sci USA, 1996. 93(2): p. 65 963.
  150. M. Matz, et al., Ordered differential display: a simple method for systematic comparison of gene expression profiles. Nucleic Acids Res, 1997. 25(12): p. 2541−2.
  151. D. Rebrikov, et al., Complete genome sequence of a novel extrachromosomal viruslike element identified in planarian Girardia tigrina. BMC Genomics, 2002. 3(1): p. 15.
  152. H. Herbst, et al., Human endogenous retrovirus (HERV)-K transcripts in germ cell and trophoblastic tumours. Apmis, 1998. 106(1): p. 216−20.
  153. Grigor, A new classification of germ cell tumours of the testis. Eur Urol., 1993. 23(1): p. 93−100.
  154. McGlynn, Trends in the incidence of testicular germ cell tumors in the United States. Cancer, 2003. Jan 1−97(1). p. 63−70.
  155. J. Wan, et al., Cloning differentially expressed mRNAs. Nat Biotechnol, 1996. 14(13): p. 1685−91.
  156. M. Schummer, et al., Comparative hybridization of an array of 21,500 ovarian cDNAs for the discovery of genes overexpressed in ovarian carcinomas. Gene, 1999. 238(2): p. 375−85.
  157. K. Eisfeld, et al., Binding of NF1 to the MMTV promoter in nucleosomes: influence of rotational phasing, translational positioning and histone HI. Nucleic Acids Res, 1997. 25(18): p. 3733−37 342.
  158. U. Scherf, et al., A gene expression database for the molecular pharmacology of cancer. Nat Genet, 2000. 24(3): p. 236−244.
  159. P. Medstrand and D. Mager, Human-specific integrations of the HERV-K endogenous retrovirus family. J Virol, 1998. 72(12): p. 9782−9787.
  160. R. Tonjes, F. Czauderna, and R. Kurth, Genome-wide screening, cloning, chromosomal assignment, and expression of full-length human endogenous retrovirus type K. J Virol, 1999. 73(11): p. 9187−95.
  161. G. Diculescu, The sources of variation in the human genome and genome instability in human cancers. Rom J Physiol, 1997. 34(1−4): p. 3−17.
  162. R. Slebos, M. Resnick, and J. Taylor, Inactivation of the p53 tumor suppressor gene via a novel Alu rearrangement. Cancer Res, 1998. 58(23): p. 5333−5336.
  163. K. Becker, et al., Binding of the ubiquitous nuclear transcription factor YY1 to a cis regulatory sequence in the human LINE-1 transposable element. Hum Mol Genet, 1993. 2(10): p. 1697−702.
  164. K. Huebner, et al., The role of deletions at the FRA3B/FHIT locus in carcinogenesis. Recent Results Cancer Res, 1998. 154: p. 200−15.
  165. K. Kuo, et al., Expression of transposon LINE-1 is relatively human-specific and function of the transcripts may be proliferation-essential. Biochem Biophys Res Commun, 1998. 253(3): p. 566−70.
  166. H. Pomykala, et al., Breakpoint junctions of chromosome 9p deletions in two human glioma cell lines. Mol Cell Biol, 1994. 14(11): p. 7604−10.
  167. G. Swergold, Identification, characterization, and cell specificity of a human LINE-1 promoter. Mol Cell Biol, 1990. 10(12): p. 6718−29.
  168. Leuer, Somatic mosaicism in hemophilia A: a fairly common event. Am J Hum Genet, 2001. Jul-69(l): p. 75−87.
  169. Moyhuddin, Somatic mosaicism in neurofibromatosis 2: prevalence and risk of disease transmission to offspring. J Med Genet., 2003. Jun-40(6): p. 459−63.
  170. Sippel, Frequency of somatic and germ-line mosaicism in retinoblastoma: implications for genetic counseling. Am J Hum Genet, 1998. Mar-62(3): p. 610−9.
  171. S. Boissinot, P. Chevret, and A. Furano, LI (LINE-1) retrotransposon evolution and amplification in recent human history. Mol Biol Evol, 2000. 17(6): p. 915−28.
  172. E. Ostertag, et al., A mouse model of human LI retrotransposition. Nat Genet, 2002. 32(4): p. 655−60.
  173. M. Matz, et al., Amplification of cDNA ends based on template-switching effect and step- out PCR. Nucleic Acids Res, 1999. 27(6): p. 1558−1560.
  174. Автор Π²Ρ‹Ρ€Π°ΠΆΠ°Π΅Ρ‚ Π³Π»ΡƒΠ±ΠΎΠΊΡƒΡŽ ΠΏΡ€ΠΈΠ·Π½Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΈ Π±Π»Π°Π³ΠΎΠ΄Π°Ρ€Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ Π·Π° ΡΠΎΠ·Π΄Π°Π½ΠΈΠ΅ творчСской атмосфСры, Π·Π° ΠΏΠΎΠΌΠΎΡ‰ΡŒ, ΠΏΠΎΠ΄Π΄Π΅Ρ€ΠΆΠΊΡƒ ΠΈ Π΄ΠΎΠ±Ρ€ΠΎΠΆΠ΅Π»Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΠ΅ ΠΎΡ‚Π½ΠΎΡˆΠ΅Π½ΠΈΠ΅ всСм сотрудникам ΠΈ Π°ΡΠΏΠΈΡ€Π°Π½Ρ‚Π°ΠΌ Π›Π°Π±ΠΎΡ€Π°Ρ‚ΠΎΡ€ΠΈΠΈ Π‘Ρ‚Ρ€ΡƒΠΊΡ‚ΡƒΡ€Ρ‹ ΠΈ Π€ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΉ Π“Π΅Π½ΠΎΠ² Π§Π΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠ° Π˜Π‘Π₯ РАН.
  175. Автор Π±Π»Π°Π³ΠΎΠ΄Π°Ρ€Π΅Π½ Π’. К. ΠŸΠΎΡ‚Π°ΠΏΠΎΠ²Ρƒ ΠΈ Н. Π’. Π‘ΠΊΠ°ΠΏΡ†ΠΎΠ²ΠΎΠΉ Π·Π° ΡΠΎΡ‚рудничСство ΠΈ ΡΠΈΠ½Ρ‚Π΅Π· ΠΎΠ»ΠΈΠ³ΠΎΠ½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ², Π±Π΅Π· ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Ρ… данная Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π° Π±Ρ‹Π»Π° Π±Ρ‹ Π½Π΅Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½Π°.
  176. Автор Π±Π»Π°Π³ΠΎΠ΄Π°Ρ€Π΅Π½ Π‘Π΅Π½ΡŽΡ‚Π΅ ΠΠ°Ρ‚Π°Π»ΡŒΠ΅ БорисовнС ΠΈ ΠšΠ»Π΅ΠΉΠΌΠ°Π½ АннС Π·Π° ΡΠΎΡ‚рудничСство ΠΈ ΠΏΡ€Π΅Π΄ΠΎΡΡ‚Π°Π²Π»Π΅Π½Π½Ρ‹Π΅ для Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹ ΠΌΠ°Ρ‚Π΅Ρ€ΠΈΠ°Π»Ρ‹.
Π—Π°ΠΏΠΎΠ»Π½ΠΈΡ‚ΡŒ Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡƒ Ρ‚Π΅ΠΊΡƒΡ‰Π΅ΠΉ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚ΠΎΠΉ