Взаимодействие 5-аминоурацила с молекулярным кислородом в водных растворах в присутствии хлорида меди (II)
Диссертация
На IX Международном семинаре по магнитному резонансу (Ростов-на-Дону, 2008), на Всероссийской конференции молодых ученых и III школе им. академика Н. М. Эмануэля «Окисление, окислительный стресс и антиоксиданты» (Москва, 2008), на XI Молодежной конференции по органической химии, посвященной 110-летию со дня рождения И. Я. Постовского (Екатеринбург, 2008), на Всероссийской конференции «Теория… Читать ещё >
Содержание
- ГЛАВА I. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР
- 1. 1. Кислотно-основное равновесие аминоурацилов
- 1. 1. 1. Таутомерия аминоурацилов
- 1. 1. 2. Кислотно-основные свойства аминоурацилов
- 1. 2. Комплексообразование аминоурацилов с металлами переменной валентности
- 1. 2. 1. Комплексообразование аминоурацилов с водой
- 1. 2. 2. Комплексообразование 5-аминоурацила с металлами переменной валентности
- 1. 2. 3. Комплексообразование производных 6-аминоурацила с металлами переменной валентности
- 1. 2. 4. Комплексообразование 5,6-диаминозамещенных урацилов с металлами переменной валентности
- 1. 3. Окисление аминоурацилов
- 1. 1. Кислотно-основное равновесие аминоурацилов
- ГЛАВА II. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
- 2. 1. Используемые реагенты
- 2. 2. Методы анализа
- 2. 2. 1. Электронная спектроскопия
- 2. 2. 2. ЯМР-спектроскопия
- 2. 2. 3. Высокоэффективная жидкостная хроматография
- 2. 2. 4. Квантово-химические расчеты кето-енольных таутомеров 5-аминоурацила
- 2. 2. 5. Квантово-химические расчеты химических сдвигов 5- и 6аминоурацилов
- 2. 3. Методы проведения эксперимента
- 2. 3. 1. Изучение комплексообразования 5-аминоурацила с ионом меди (П)
- 2. 3. 2. Окисление 5-аминоурацила кислородом воздуха в присутствии хлорида меди (П)
- 2. 3. 3. Манометрическое определение количества поглощенного кислорода
- 2. 3. 4. Определение концентрации пероксида водорода
- 3. 1. Изучение кислотно-основного равновесия 5- и 6-аминоурацилов в водных растворах
- 3. 1. 1. Квантово-химические расчеты кето-енольных таутомеров 5-аминоурацила
- 3. 1. 2. Кислотно-основное равновесие 5- и 6-аминоурацилов в водных растворах
- 3. 2. Окисление 5-аминоурацила кислородом в присутствии хлорида меди (П)
- 3. 2. 1. Влияние кислорода на скорость окисления 5-аминоурацила
- 3. 2. 2. Температурная зависимость эффективной константы скорости расходования 5-аминоурацила
- 3. 2. 3. Влияние воды на окисление 5-аминоурацила
- 3. 2. 4. Манометрическое определение количества поглощенного кислорода
- 3. 2. 5. Зависимость начальной скорости окисления 5-аминоурацила от концентрации [СиС12]о
- 3. 3. Комплексообразование СиСЬ с 5-аминоурацилом в водных растворах
- 3. 4. Идентификация продуктов окисления 5-аминоурацила
- 3. 5. Обсуждение механизма реакции
- 3. 6. Сравнительная реакционная способность 5-аминоурацила, 6-амино-урацила и 5,6-диамино-1,3-диметилурацила в реакции окисления молекулярным кислородом в присутствии хлорида меди (П)
Список литературы
- Topal M.D., Fresco J.R. Complementary base pairing and the origin of substitution mutations //Nature. — 1976-V. 263, № 5575. — P. 285−289.
- Watson J.D., Crick F.H.C. Genetical implication of the structure of deoxyribonucleic acid //Nature. 1953 — V. 171, № 4361. — P. 964−966.
- Singh J.S. FTIR and Raman spectra compared with ab initio calculated frequency modes for 5-aminouracil // J.Biol. Phys. 2008. — V. 34, № 6. — P. 569−576.
- Singh J.S. Laser Raman and Infra-Red spectra of biomolecule: 5-aminouracil // J. Phys. 2008. — V. 70, № 3. — P. 479−486.
- Shishkin O.V., Kolos N.N., Orlov V.D. Molecular and crystal structure of N, N'-dimethyl-5,6-diaminouracil // Crystallography Reports. 1997. — V. 42, № 2.-P. 253−255.
- Toth A., Billes F. Dissociation constants of heterocyclic compounds // Acta Chim. Acad. Sci. Hung. 1968. — V. 56, № 2. — P. 229−250.
- Draminski M., Fiszer B. Dissociation constants of some uracil derivatives // Chemistry of Heterocyclic Compounds. 1970. — V. 6, № 6. — P. 799−800.
- Barlin G.B., Pfleiderer W. Ionization constants of heterocyclic substances. Part IX. Protonation of aminopyridones and aminopyrimidones // J. Chem. Soc. B. 1971. — V. 7, № 8. — P. 1425−1432.
- Visinski B.M., Dryhurst G. Mechanism of electrochemical oxidation of 5,6-diaminouracil at the pyrolitic graphite electrode // J. Electroanal. Chem. — 1976. -V. 70, № 2. P. 199−212.
- Shishkin O.V., Sukhanov O.S., Leszczynski J. Interactions of water with mono- and diamino derivatives of N, N'- dimethyluracil // J. Phys. Chem. A.- 2002. V. 106, № 34 — P. 7828−7833.
- Masoud M.S., Khalil E.A., Hindawy A.M., Ramadan A.M. Structural chemistry of some pyrimidine transition metal complexes // CJASS. -2005. -V. 50, № 6. — P. 297−310.
- Rastogi V.K., Palafox M.A., Kumar V., Mital H.P., Sharma R. Laser raman and IR spectra of complexes of lanthanide (III) with 5-aminouracil // Proceedings of the XIX International Conference on Raman Spectroscopy. -2004.-P. 150−151.
- Cappuccino J.G., Banks S., Brown G., George M., Tarnowski G.S. The effect of copper and other metal ions on the antitumor activity of pyruvaldehyde bis (thiosemicarbazone) // Cancer Research. 1967. -V. 27, № 5.-P. 968−973.
- Urena F.H., Illan-Cabeza N.A., Moreno-Carretero M.N., Penas-Chamorro A.L.P. Ni (II), Cu (II), Zn (II) and Cd (II) complexes with dinegative N, N,0-tridentate uracil-derived hydrazones // Acta. Chim. Slov. 2000. — V. 47, № 4.-P. 481−488.
- Booysen I., Gerber T.I.A., Mayer P., Schalekamp H.J. Imido, amino and amido coordination of diaminouracil to rhenium (V) // J. Coord. Chemistry. — 2007. — V. 60, № 16.-P. 1755−1761.
- Mostafa S.I., Kabil M.A., Saad E.M., El-Asmy A.A. Ligational and analytical applications of a uracil derivative toward some transition metal ions // J. Coord. Chem. 2006. — V. 59, № 3. — P.279−293.
- Behrend.R., Roosen O. Synthese der Harnsaure // Justus Liebigs Ann. Chem. 1889. — V. 251, № 1−2. — P. 235−256.35.0ffe.G. Oxidation some uracil derivatives // Ann Chem. — 1907. V. 65, № 3. — P.278−280.
- Baudisch.O., Davidson D. The oxidation of 5-aminouracil // J. Biol. Chem. -1927. V. 71, № 2. — P. 497−499.
- Patterson L.K., Bansal K.M. Pulse radiolysis studies of 5-halouracils in aqueous solutions //J.Phys. Chem. 1972. -V. 76, № 17. -P.2392−2399.
- Neta P. Electron spin resonance study of radical produced in irradiated aqueous solutions of 5-halouracils // J. Phys. Chem. 1972. — V. 76, № 17. -P. 2399−2402.
- Bansal K.M., Patterson L.K., Schuler R.H. The production of halide ion in the radiolysis of aqueous solutions of the 5-halouracils // J. Phys. Chem. -1972. V. 76, № 17. — P. 2386−2392.
- A1-Arab M.M., Hamilton G. Possible model reaction for some amine oxidases. Kinetics and mechanism of the copper (Il)-catalyzed autooxidation of some diaminouracils // J. Am. Chem. Soc. 1986. — V. 108, № 19. — P. 5972−5978.
- Wilmot C.M. Oxygen activation in a copper-containing amine oxidase // Biochemical society transactions. 2003. — V. 31, part 3. — P. 493−496.
- Lobenstein-Verbeek C.L., Jongejan J.A., Frank J., Duine J.A. Bovine serum amine oxidase: a mammalian enzyme having covalently bound PQQ as prosthetic group // FEBS Letters. 1984. — V. 170, № 2. — P. 305−309.
- Owens J.L. Dryhust G. Electrochemical oxidation of 5,6-diaminouracil an investigation by thin-layer spectroelectrochemistry // J.Electroanal. Chem. — 1977.-V. 80, № 1.-P. 171−180.
- Нугуманов T.P. Окислительные превращения 5-гидрокси-6-метилурацила под действием молекулярного кислорода в присутствии хлорида меди (II), гидроксильных и пероксильных радикалов: Автореферат дисс. канд. хим. наук. Уфа- 2009. 22 с.
- Matsuura I., Ueda Т., Nagai S., Nagatsu A., Sakakibara J., Kurono Y., Hatano K. Oxidative transformation of 5-aminouracil into imidazolone by thallium (III) nitrate thrihydrate in methanol // J. Chem. Soc. Chem. Commun. 1992. — № 19. — P. 1474−1475.
- Matsuura I., Ueda Т., Murkami N., Nagai S., Nagatsu A., Sakakibara J. Synthesis of imidazoles by the oxidative transformation of 5-aminopyrimidinones // J. Chem. Soc. Perkin Trans. I. 1993. — № 8. — P. 965−968.
- Neese, F. ORCA an ab initio, Density Functional and Semiempirical program package, Version 2.6. University of Bonn, 2008.
- Nanayakkara A., Challacombe M., Gill P.M.W., Johnson В., Chen W., Wong M.W., Gonzalez C., Pople J.A., Gaussian, Inc., Pittsburgh P.A. -Gaussian 03.-2003.
- Baboul A.G., Curtiss L.A., Redfern P.C., Raghavachari K. Gaussian-3 theory using density functional geometries and zero-point energies // J. Chem. Phys. 1999. -V. 110, № 16. — P. 7650−7657.
- Perdew J.P., Burke K., Ernzerhof M. Generalized gradient aproximation made simple // Phys. Rev. Lett.- 1997.- V. 78, № 7. P. 1396.
- Woon D.E., Dunning Т.Н. Gaussian basis sets for use in correlated molecular calculations. III. The atoms aluminum through argon // J. Chem. Phys 1993. — V.98, № 2. — P. 1358−1371.
- Eckert F., Klamt A. Fast solvent screening via quantum chemistry: COSMO RS approach // AIChE J — 2002. — V. 48, № 2 — P. 369−385.58.http://www.chemcraftprog.org
- Parr R.G., Yang W. Density Functional theory of atoms and molecules // N.Y.: Oxford university press. — 1989. — P. 342.
- Keith T.A., Bader R.F.W. // Chem. Phys. Lett. 1993. — V. 210. — P.223−231.
- Иванов С.П. Изучение кето-енольного равновесия некоторых производных урацила в водных растворах: Автореферат дисс. канд. хим. наук. Уфа- 2003. 22 с.
- Kwiatkowski J.S., Pullman В. Tautomerism and electronic structure of biological pyrimidines // Adv. Heterocycl. Chem. 1975. — V. 18. — P. 199 335.
- Katrizky A.R., Lagowski J.M. Prototropic tautomerism of heteroaromatic compounds //Adv. Heterocycl. Chem. 1963. -V. 2. — P. 1−81.
- Elguero J., Marzin C., Katritzky A.R., Linda P. The tautomerism of heterocycles //. Eds. Katrizky A.R. and Boulton A.J. London: Academic Press.-1976.-P. 486.
- Даутова И.Ф., Иванов С. П., Хурсан СЛ. Влияние гидратации на стабильность кето-енольных таутомеров 5-гидрокси-6-метилурацила // ЖСХ. 2009. — Т.50, № 6. — С. 1155−1165.
- Иванов С.П., Хурсан СЛ. Относительная стабильность кето-енольных таутомеров 5-гидрокси-6-метилурацила: неэмперический расчет // ЖФХ. 2004. — Т. 78, № 7 — С. 1283−1288.
- Иванов С.П., Лукманов Т. И., Хамитов Э. М., Закирьянова О. В., Хурсан СЛ. Теоретическое исследование относительной устойчивости кето-енольных таутомеров 5-аминоурацила // Башкирский химический журнал. -2010. Т. 17, № 2. — С. 95−99.
- Kryachko E.S., Nguen М.Т., Zeegers-Huysken Т. Theoretical study of tautomeric forms of uracil. 1. Relative order of stabilities and their relation to proton affinities and deprotonation entalphies // J. Phys. Chem. A. -2001 V. 105, № 8. — P. 1288−1295.
- Markova N., Enchev V., Timtcheva I. Oxo hydroxy tautomerism of 5-fluorouracil: water — assisted proton transfer // J. Phys. Chem. A. — 2005. -V. 109, № 9-P. 1981−1988.
- Хмельницкий Р.А., Клюев Н. А., Кунина Е. А., Кропачева А. А. Масс-спектры и строение 4-аминоурацилов // ХГС. 1974. — № 5. — С. 697 701.
- Скибида И.П., Сахаров A.M. Каталитические системы на основе комплексов Си1 и Си11 как модели оксидаз и оксигеназ в реакциях оксиления молекулярным кислородом // Российский химический журнал. 1995. — Т.34, № 1. — С. 14−31.
- Сахаров A.M., Скибида И. П. Новые химические модели ферментативного окисления. I. Окисление спиртов до альдегидов, катализируемое комплексами Cu (I) // Кинетика и катализ. — 1988. -Т.29, № 1. С. 110−117.
- Сахаров A.M., Скибида И. П. Новые химические модели ферментативного окисления. II. Окисление спиртов до кислот, катализируемое комплексами Cu (II) // Кинетика и катализ. 1988. -Т.29, № 1.-С.118−123.
- Bonchio M., Carraro M., Conte V., Scorrano G. Aerobic photooxidation in water by polyoxotungstates: the case of uracil // Eur. J. Org. Chem. 2005. -№ 22.-P. 4897−4903.
- Nelson V.C. Synthesis of isotopieally labelled DNA degradation products for use in mass spectrometric studies of cellular DNA damage // Journal of Labelled compounds and radiopharmaceuticals. — 1996. V. 38, № 8. — P. 713−723.
- Riviere J., Bergeron F., Tremblay S., Gasparutto D., Cadet J., Wagner J.R. Oxidation of 5-hydroxy-2'-deoxyuridine into isodialuric acid, dialuric acid, and hydantoin products // J. Am. Chem. Soc. 2004. — V. 126, № 21. — P. 6548−6549.
- Riviere J., Klarskov K., Wagner J.R. Oxidation of 5-hydroxypyrimidine nucleosides to 5-hydroxyhydantoin and its a-hydroxy-ketone isomer // Chem. Res. Toxicol. -2005. -V. 18, № 8. P. 1332−1338.
- Peuzin M.C., Cadet J., Polverelli M., Teoule R. Parabanic acid and 5-hydroxy hydantoin upon y-irradiation of aerated aqueous solutions of uracil. Biochim. Biophys. Acta. 1970. — Y. 209, № 2, — P. 573−574.
- Yu T.J., Sutherland R.G., Verrall R.E. The sonolysis of uracil // Can. J. Chem.- 1980.-V. 58, № 18.-P. 1909−1915.
- Perez-Benito J.F. Copper (II)-catalyzed decomposition of hydrogen peroxide: catalyst activation by halide ions // Monatshefte fur Chemie. 2001. — V. 132, № 12. — P.1477−1492.
- Eberhardt M.K., Colina R., Soto K. The reaction Cu1+ 02 and Cu2+ -ascorbic acid — 02 with dimethyl sulfoxide. The effect of solvent // J. Org. Chem. — 1988. -V. 53, № 5. — P. 1074−1077.
- Bielski B.H.J., Cabelli D.E., Arudi R.L., Ross A.B. Reactivity of H02/02 radicals in aqueous solution // J. Phys. Chem. Ref. Data. 1985. — V. 14. -P.1041−1100.