Биосинтез внеклеточных гуанилспецифичных рибонуклеаз Bacillus thuringiensis и Bacillus circulans
Диссертация
Актуальность проблемы. Щелочные внеклеточные гуанилспецифичные рибонуклеазы обнаружены у многих бацилл: B. amyloliquefaciens, B. intermedius, B. pumilus, B. circulans, B. thuringiensis, B. coagulans, B. polymyxa и др. Детальный анализ этих ферментов выявил высокую гомологию их первичных структур, физико-химических и каталитических свойств (Лещинская и др., 1974; Лещинская, 1975; Hartley, 1997… Читать ещё >
Содержание
- ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
- 1. Регуляция экспрессии генов бацилл на уровне транскрипции
- 1. 1. РНК-полимераза и стфакторы Bacillus subtilis
- 1. 2. Структура промоторов генов Bacillus subtilis
- 1. 3. Регуляция экспрессии генов Bacillus subtilis в неблагоприятных условиях внешней среды
- 1. 3. 1. Двухкомпонентныерегуляторные системы бацилл
- 1. 3. 2. Регуляция экспрессии генов альтернативным
- 2. 1. Физико-химические свойства белков
- 2. 2. Клонирование генов рибонуклеаз
- 2. 3. Биосинтез рибонуклеаз
Список литературы
- Арбузов В.А., Мардашов С. Р. Белковый синтез и разрушение иРНК у E.coliHБиохимия. — 1974. — т.39. — с.852−863.
- Аринушкина Е.В. Руководство по химическому анализу почв. М.: Изд-во МГУ. — 1970.-218с.
- Афанасенко Г. А., Дудкин С. М., Каминин Л. Б. Первичная структура рибонуклеазы Bacillus intermedius //Биоорганическая химия. 1979.- т.5,№ 2 -с. 187−202.
- Балабушевич М.И., Казаринова Л. А. Влияние антибиотиков на биосинтез 5' инозиновой кислоты мутантом Brevibacterium ammoniagenes //Прикл. Биохим. и микробиол. — 1983. — т. 19. — с.590−598.
- Банникова Г. Е., Варламов В. П. Выделение внутриклеточных ингибиторов бактериальных РНК аз на колонке с иммобилизованной РНКазой Bacillus intermedius //Прикладная биохимия и микробиология. -1994. т.30. — с.379−383.
- Боринская С.А., Янковский Н. К. Структура прокариотических геномов //Молекулярная биология. 1999. — т.6. — с.941−957.
- Виханский Ю. Д., Яруллин В. Р., Бартошевич Ю. Э., Жданович Ю. В., Насонова Л. И. Селекционное и физиологическое исследование культуры B.circulans продуцента бутирозина //Антибиотики и химиотерапия. — 1992. — т.37 — С.-61−64.
- Габдрахманова Л.А., Знаменская Л. В., Лещинская И. Б. Влияние актиномицина Д на биосинтез рибонуклеаз спорообразующих бактерий //Антибиотики и химиотерапия. 1997. — т.42,№ 11. — с.15−21.
- Гловер Д.М. Клонирование ДНК. Методы: Пер. с англ. М.: Мир, 1988, -538с.
- Головко А.Э., Голышин Н. П., Рябченко Н. Ф. Роль B.thuringiensis в природных биоценозах //Микробиологический журнал. 1993. — т.55. — с. 104 110.
- Головлев Е. А. Введения в биологию стационарной фазы бактерий: механизм общего ответа на стрессы //Микробиология. 1999. — т.68. — с.623−631.
- Гэйл Э., Кандлифф Э., Рейнолдс Л. соавт. Молекулярная основа действия антибиотиков. М.: Мир, 1975. -500с.
- Дементьев A.A., Орлов В. М., Шляпников C.B. Полная первичная структура рибонуклеазы бактерии Bacillus thuringiensis //Биоорганическая химия. 1993а. — т. 19,№ 9. — с.853−861.
- Дементьев A.A., Моисеев Г. П., Шляпников C.B. Первичная структура и каталитические свойства внеклеточной рибонуклеазы Bacillus circulans //Биоорганическая химия. 19 936. — т.19,№ 11. — с. 1065−1072.
- Дементьев A.A., Голышин П. Н., Рябченко Н. Ф. Две формы внеклеточной низкомолекулярной рибонуклеазы Bacillus s/xBCF 247. Выделение и характеристика белка //Биохимия. 1993 в. — т.58,№ 8. — с. 12 581 265.
- Демина H.H., Камзолова С. Г. Сенсорно-регуляторные системы бактерий //Успехи современной биологии. 1992. — т.26. — с.1338−1349.
- Знаменская JI.B., Клейнер Г. И., Паэгле Б. А. Оптимизация условий культивирования Bacillus intermedius для повышения биосинтеза щелочной внеклеточной РНКазы //Микробиология. 1980. -т.49,№ 5. — с.722−725.
- Знаменская JI.B., Капранова М. Н., Клейнер Г. И., Лещинская И. Б. Влияние неорганического фосфата на рост и биосинтез щелочной внеклеточной РНКазы Bacillus intermedius //Микробиология. 1982. — т .51,№ 5. — с.776−780.
- Знаменская JI.B., Ромахина Е. Р., Клейнер Г. И., Лещинская И. Б. Влияние хлорамофеникола и актиномицина Д на биосинтез щелочнойвнеклеточной РНКазы Bacillus intermedius //Микробиология. 1984. -т.53,№ 5. — с.796−801.
- Знаменская JI.B., Ромахина Е. Р., Филатова С. В., Балабан Н. П., Лещинская И. Б. Биосинтез внеклеточных ферментов Bacillus intermedius //Микробиология. 1986. — т.55,№ 3. — с.449−454.
- Знаменская JI.B., Вершинина В. И., Вершинна О. А., Лещинская И. Б. Эффективность промоторов и экспрессия генов гуанилспецифичных рибонуклеаз бацилл / 8 Конференция «Новые направления в биотехнологии1. Москва, 1998. -с.57.
- Знаменская Л.В., Ивайловская В. Л., Иванов Е. И. Биосинтез внеклеточной рибонуклеазы Bacillus pumilus //Микробиология. 1994. -т.63,№ 6. — с.986−992.
- Знаменская Л. В. Габдрахманова Л.А., Чернокальская Е. Б., Лещинская И. Б. Регуляция биосинтеза внеклеточных рибонуклеаз в исходных бациллярных и рекомбинантных штаммах Escherichia coli //Микробиология. 1995. — т.64,№ 5. — с.616−623.
- Иерусалимский Н.Д. Основы физиологии микробов. М.: Изд-во АН СССР. 1963. -245с.
- Калачева Н.В., Булгакова Р. Ш., Казанцева Н. Ю., Куриненко Б. М. Цитотоксические свойства комплекса противоопухолевого антибиотика блеомицина и рибонуклеазы Bacillus intermedius //Антибиотики и химиотерапия. 1997. — т.42. — с. 16−20.
- Клонирование ДНК. Методы //Под ред. Гловера Д. М.: Мир. 1988. -538с.
- Кожаринова Л.В., Федорова Н. Д., Передельчук М. Ю., Рябченко И. Ф., Шульга А. А., Кирпичников М. П. Клонирование гена внеклеточной РНК азы Bacillus thuringiensis var. subtoxicus //Биотехнология. 1994. — № 2. -c.9−11.
- Колпаков А.И., Куприянова-Ашина Ф.Г., Горская Е. М. Изменение биологических свойств лактобацилл под влиянием экзогенной рибонуклеазы //Микробиология. 1996. — т.41. — с. 16−18.
- Колпаков А.И., Куприянова-Ашина Ф.Г., Лещинская И. Б. Зависимость влияния РНКазы Bacillus intermedius на рост пекарских дрожжей от концентрации экзогенного фермента //Микробиология. 2000. -т.69. — с.478−482.
- Краснов С.И., Знаменская Л. В. Комплекс программ „ВЮРТ“ для оптимизации в биологических исследованиях //Биологические науки 1992. — N2.-С. 15−18.
- Кузина Л.В., Корецкая Н. Г., Трофименко А. Ф., Дубойковская З. А., Добрица А. П. Конструирование рекомбинантных штаммов В.thuringiensis, активных против насекомых отряда Lepidoptera и Coleoptera //Биотехнология. 1994. — № 7. — с. 15−20.
- Куриненко Б.М., Собчук Л. И., Хайбуллина С. А., Булгакова Р. Ш. Экспериментальное исследование противоопухолевой эффективности РНКазы Bacillus intermedius //Эксперим. Онкология. 1988. — т.10. — с.54−57.
- Лещинская И.Б., Булгакова Р. Ш., Балабан Н. П., Егорова Г. С. Препаративное получение высокоочищенной рибонуклеазы Bacillus intermedius //Прикладная биохимия и микробиология. 1974. — т. 10,№ 2. -с.242−247.
- Лещинская И.Б. Нуклеодеполимеразы сапрофитных бактерий. -Казань.: Изд-во Казанского Университета, 1975,-180с.
- Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Молекулярное клонирование. М.: Мир. 1984. 394с.
- Мецлер Д. Биохимия. М.: 1980. — т.З. — 487с.
- Несмеянова М.А., Богданов А. А., М.А. Прокофьев. Щелочная фосфатаза, связанная с рибосомами из Escherichia coli //Биохимия. 1965. -V.30. — Р.463−470.
- Нуркиянова К.М., Шульга А. А., Захарьев В. М., Кирпичников М. П., Скрябин К. Г., Баев А. А. Клонирование и определение нуклеотидной последовательности гена РНКазы Bacillus intermedius //ДАН СССР. 1989. -т.309,№ 6. — с.1476−1479.
- Озолинь О.Н. Неканонические элементы нуклеотидной последовательности бактериальных промоторов и их роль в формировании транскрипционного комплекса: Автореф. дис. д. б. н. Пущино, 1999.
- Павловский А.Г., Санишвили Р. Г., Борисова С. Н., Строкопытов Б. В., Вагин А. П., Чепурнова Н. К., Вайнштейн Б. К. Структура двух кристаллических модификаций рибонуклеазы Bacillus intermedius //Кристаллография. 1989. — т.34. — с.137−142.
- Перт С. Дж. Основы культивирования микроорганизмов и клеток. -1978.-М.: Мир.-ЗЗ 1с.
- Плохинский Н.А. Биометрия . М.: Изд-во МГУ, 1970. — 367с.
- Прист Ф. Внеклеточные ферменты микроорганизмов. М.: Изд-во Мир, 1987.-117с.
- Пучков Е.О., Говорунова В. А., Бабаева JI.B. //Прикл. Биохимия и микробиология. 1983. — т. 19. — с.599−602.
- Спирин А.С. Молекулярная биология. Структура рибосомы и биосинтез белка: Учеб. Для студентов биол. спец. вузов. —М.: Высш.шк., 1986. -303с.
- Струминская Н.К., Ивайловский B.JL, Дементьев А. А., Моисеев Г. П., Федосов Ю. А., Яковлев Г. И. Внеклеточная рибонуклеаза из Bacillus pumilus //Биологические науки. 1992. — № 2. — с.41−44.
- Федорова H.Д., Шульга A.A., Передельчук М. П., Кожаринова Л. В., Голышин П. Н., Рябченко Н. Ф., Кирпичноков М. П. Клонирование гена внеклеточной рибонуклеазы Bacillus circulans //Молекулярная биология. -1994. -№ 2. -с.468−472.
- Харвуд K.P. Бациллы. Генетика и биотехнология. М.: Мир, 1992. -530с.
- Чернокальекая Е.Б., Ромахина Е. Р., Балабан Н. П., Вершинина В. И. Клонирование генов внеклеточной РНКазы Bacillus intermedius //Биологические науки. 1992. — № 2. — с.45−50.
- Шарипова М.Р., Волкова Т. И., Ермакова О. В., Лопатнев C.B. Выделение внутриклеточного ингибитора секретируемой РНКазы Bacillus intermedius //Прикладная биохимия и микробиология. 1991. — Т.27. — вып.5. -с.673−679.
- Шляпников C.B., Дементьев A.A. Аминокислотная последовательность и каталитические свойства внеклеточной рибонуклеазы Bacillus coagulans //ДАН РАН. 1993. — т.332,№ 3. — с.382−384.
- Шульга A.A., Знаменская Л. В., Морозова О. В., Лещинская И. Б., Кирпичников М. П. Рибонуклеаза из Bacillus thuringiensis var. subtoxicus. Структура гена и регуляция биосинтеза //Биоорганическая химия. 2000. -т.26 — № 9. — 673−679.
- Шульговская Е.М., Позмогова И. Н., Работнова И. Л. Влияние ингибитора синтеза белка хлорамфеникола на основные показатели роста непрерывной и периодической культуры Bacillus megaterium //Микробиология. 1980. — Т.49. — с.893−901.
- Элисашвили В. И. Влияние циклического аденозин-3',-5'-монофосфата, хлорамфеникола и актиномицина Д на биосинтез внеклеточной левансахаразы Gluconobacter oxydans //Микробиология. -1982. -т.51. -с.436−442.
- Юдина Т. Г., Саламахова О. В., Олехнович Е. В., Рогатых Н. П., Егоров Н. С. Влияние источников углерода на биологическую активность и морфологию параспоральных кристаллов B.thuringiensis //Микробиология. -1992. т.61. — с.577−584.
- Allmansberger R. Temporal regulation of sigD from Bacillus subtilis depends on a minor promoter in front of the gene //J. Bacteriol. 1997. — v. 179. -p.6531−6535.
- Anfmsen C.B., Redfield R.R., Choate W.I., Page J., Carrol W.R. Studies of cross structure, cross-linkage and terminal sequences in ribonuclease //J.Biol.Chem. 1954. — V.207. — P.201−210.
- Antelmann H., Bernhardt J., Schmid R., Hecker M. First steps from a two dimensional protein index toward a response — regulation map for Bacillus subtilis //Electrophoresis. — 1997. — v. 18. — p. 1451−1463.
- Archerberger E. C., Whiteley H. R. The role of the delta peptide of the Bacillus subtilis RNA polymerase in promoter selection //J.Biol.Chem. 1981. -v.256. — p.7424−7432.
- Archerberger E. C., Hilton M. D., Whiteley H. R. The effect of the delta subunit on the interaction of Bacillus subtilis RNA polymerase with bases in a SP82 early gene promoter //Nucl.Acids. Res. 1982. — v. 10. — p.2893−2910.
- Benson A. K., Handelwang W. G. Characterization of a regulatory network that controls ств expression Bacillus subtilis //J. Bacteriol. 1992. — v. 174. — p.749−757.
- Bertero M.G., Gonzales В., Tarricone C, Ceciliani F., Galizzi A. Overproduction and characterization of the Bacillus subtilis anti-sigma factor FlgM //J. Biol. Chem. 1999. — v.274. — p. 12 103−12 107.
- Birnboim H, Doli J. Rapid alkalin method for screening recombinant Plasmide DNA //Nucl.Asids.Res 1979. — v.7. — 1513−1522.
- Bufe A., Spangfort M.D., Kahlert H., Schlaak M., Becker W.M. The major birch pollen allergen, Bet vi, shows ribonuclease activity //Planta. 1996. -V.199. — P.413−415.
- Burbulys D., Trach K.A., Hoch J.A. Initiation of sporulation in Bacillus subtilis is controlled by multicomponent phosphorelay //Cell. 1991. — V.64. -P.545−552.
- Burgers R.R., Travers A.A. Escherichia coli RNA polymerase: purification, subunit structure and factor requrements //FEBS J. 1970. — v.29. -p.l 164−1169.
- Carter H.L., Moran C.P. New RNA-polymerase sigma factor under spoO control in Bacillus subtilis //Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 1986. — V.83. — P.9438−9442.
- Carter H. L., Wang L.F., Doi R. H., Moran C. P. RpoD operon rpomoter used by cth RNA polymerase in Bacillus subtilis //Proc. Natl. Acad. Sei. 1988. -v.170. — p.1671−1621.
- Chamberlin M.J. Bacterial DNA dependent RNA polymerase //Enzymes. — 1982. — v.15. — p.61−65.
- Chang B. Y., Chen K. Y., Wen Y. D., Lao C. T. The response of a Bacillus subtilis tempreture-sensitive sigA mutant to heat stress //J. Bacteriol. -1994. v. 176. -p.3102−3110.
- Chen M., Nagarajan V. The roles of signal peptide and nature protein in RNase (barnase) exsport from Bacillus subtilis //Mol. Gen. Genet. 1993. — v. 239. -p. 409−415.
- Cosby W. M., Zuber P. Regulation of aH (SpoOH) and AbrB in response to change in external pH //J.of Bacteriol. 1997. — v. 179. — p.6778−6787.
- Dartois V., Debarbouille M., Kunst F., Rapoport G. Characterization of a novel member of the Degs-DegU regulon affected by solt stress in Bacillus subtilis //J. Bacteriol. 1998. — v. 180. — p.1855−1861.
- Debarbouille M., Martin-Verstraete I., Klier A., Rapoport G. The Bacillus subtilis sigL gene encodes an equvalent of from gram-negative bacteria. //Proc. Natl. Acad. Sei. 1991. — v.88. — p.9092−9096.
- Debarbouille M., Gardan R., Arnaud M., Rapoport G. Role of bkdR, a trancriptional activator of the sigL-dependent isoleucine and valine degradation pathway in Bacillus subtilis //J. Bacteriol. 1999. — v. 181. — p.2059−2066.
- Derre I., Rapoport G., Msadek T. CtsR, a novel regulator of stress and heat shock response, control clp and molecular chaperone gene expression in gram-positive bacteria//Mol. Microbiol. 1999. — v.31. — p. l 17−131.
- Dickel C.D., Burtis K.C., Doi R.H. Delta factor increases promoter selectivity of Bacillus subtilis vegetative cell RNA polymerase //Biochem.Biophys.Res.Commun. 1980. — v.95. — p.1789−1795.
- Dubnau E., Weir J., Nair G., Carter H.L., Moran C.P.Jr., Smith I. Bacillus sporulation gene spoOH codes for a (cth) //J.Bacteriol. 1988. — V.170. -P. 1054−1062.
- Dubnau D. The regulation of genetic competence in Bacillus subtilis //Mol.Microbiol. 1991. — V.5. — P. l 1−16.
- Dubnau D. Genetice competence in Bacillus subtilis //Mol.Microbiol. Rev. 1991. — V.55. — P.395−424.
- Duffi J.J., Petrusek R.L., Geiduchek E.P. Conversion of Bacillus subtilis RNA polymerase activity in vitro by protein indused by phage SPOl //Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 1975. — v.72. — p.2366−2370.
- Dunn J.J., Bautz E.K.F. DNA dependent RNA polymerase from E. coli: studies on the role of <7 in chain initiation //Biochem. Biophys. Res. Commun. — 1969. -v.36. — p.925−930.
- Eder S., Liu W., Hullet F.M. Mutational analysis of the phod promoter in B. subtilis: implication for PhoP binding and promoter activation ofp/zo-regulon promoters //J. Bacteriol. 1999. — v. 181. — p.2017−2025.
- Egami F., Nakamura K. Microbiol ribonukleases. Sprin-ger-varlag, Berlin, 1969.-N4.-91 p.
- Enatsu T., Shinmio A. In vitro synhtesis of enzymes. Physiologycal aspects of microbial enzyme production //Adv.Biochem.Engin. 1978. — V.9. -p.11−144.
- Errington J. Bacillus subtilis sporulation: regulation of gene expression and control of morphogenesis //Rev. 1993. — v.51. — p. 1−33.
- Fabret C., Feher V. A., Hoch J. A. Two-component signal transduction in Bacillus subtilis: how one organism sees its world //J. of Bacteriol. 1999. -v.181. — p.1975−1983.
- Fredrick K., Helmann J.D. Dual chemotaxis signalling partways in Bacillus subtilis: a aD -dependent gene encodes a novel protein with both CheW and CheY homologus domains //J. Bacteriol. 1994. — v. 176. — p.422−432.
- Fredrick K., Helmann J. D. RNA polymerase sigma factor determinies start-site selection but is not required for upstream promoter element activation on heteroduplex (bubble) templates //Proc. Natl. Acad. Sci. 1997. — v.94. — p.4982−4987.
- Gentry D.R., Burgess R.R. The cloning a nd sequense of the gene encoding the omega subunit of Escherichia coli RNA polymerase //Gene. 1986. -v.48.p.- 33−40.
- Gilman M. Z., Wiggs J. L., Chamberlin M. J. Nucleotide sequence of two Bacillus subtilis promoters used by Bacillus subtilis sigma-28 RNA polymerase //Nucleic. Acids Res. 1981. — v.9. — p.5991−6000.
- Grossman A.D. Genetic networks controlling the initiation of sporulation and the development of genetic competence in Bacillus subtilis //Annu.Rev.Genet. 1995. — v.29. — p.477−508.
- Hahnen E., Znamenskaya L., Koczan D., Leshchinskaya I., Hobom G. Novel secreted ribonuclease from Bacillus intermedins: genetic structure and regulatory control //Molec.Gen.Genet. 2000. -N.263. -P.571−580
- Haldenwang W.G., Losick R. A novel RNA polymerase sigma factor from Bacillus subtilis //Proc. Natl. Acad. Sci. 1980. — v.77. — p.7000−7004.
- Haldenwang W. G., Lang N., Losick R. A sporulation-induced sigma-like regulatory proteine from Bacillus subtilis //Cell. 1981. — v.23. — p.615−624.
- Haldenwang W.G. The sigma factors of Bacillus subtilis //Microbiological Reviews. 1995. — V.59,№ 1. — p.1−30
- Harley R.W., Reynolds R.P. Analyzys of E. coli promoter sequense. //Nucl.Asids.Res. 1978. — v.15. — p.2343−2361.
- Hartley R.W. A reversible thermal transition of the extracellular ribonuclease of Bacillus amyloliquefaciens //Biochemistry 1968. — v.8. — p.2629−2932.
- O.Hartley R.W., Rogerson D.L. Production and purification of the extracellular ribonuclease of Bacillus amyloquefaciens (barnase) and its inhibitor (barstar) //Preparatine Biochem. 1972. — v. 2., N2. — p. 229−242.
- Hartley R.W. Barnase and Barstar. Expression of its cloned inhibitor permits expression of clones ribonuclease //Journal of Molecular Biology. 1988. -v.202.-p.913−915.
- Hartley R.W. Barnase and Barstare. In: Ribonucleases: structures and Functions (G. D’Alessio and J.F. Riordan., Eds.). Academic Press. 1997, — p.51−100.
- Hatzelmann A, Tenor H., Schudt C. Differential effects of non-selective and selective phosphodiesterase inhibitors on human eosinophil functions //J.Pharmacol. 1995. — V. l 14. — P.821−831.
- Hecker M., Schumann W., Volker U. Heat-shock and general stress response in Bacillus subtilis //Molecular Microbiology. 1996. — v.19., N3. -p.417−428.
- Hecker M., Volker U. Non-specific, general and multiple stress resistance of growth -restricted Bacillus subtilis cells by the expression of the gb regulon //Molecular Microbiology. 1998. — v.29.,№ 5. — p. l 129 -1136.
- Helmann J. D., Chamberlin M. J. Structure and fanction of bacterial sigma factors //Annu. Rev. Biochem. 1988. — v.57. — p.839−872.
- Helmann J. D. Compilation and analysis of Bacillus subtilis oA -dependent promoter sequense: evidence for extended contact between RNA polymerase and upstream promoter DNA //Nucl.Acids.Res. 1995. — v.23. -p.2237−2255.
- Hill C. Dodson G., Heinemann U., Saenger M., Mitsue Y., Nakamura K., Borisov S., Tischenko G., Polyakov T., Pavlovsky S. The structure and sequence homology of a family of microbiol ribonuclease // Trends Biochem. Sci. 1983. — v.8,№ 10. — p.364−369.
- Hill C. Comparative study of microbial ribonuclease structures
- Structure and chemistry of ribonucleases. Proceedings of the first international meeting (28 November-2 December 1988): Moscow, 1989. p. 171−179.
- Huang X., Decatur A., Sorokin A., Helmann J. D. The Bacillus subtilis sigma (X) protein is an extracytoplasmic function sigma factor contributing to survival at high temperature //J. Bacteriol. 1997. — v. 179. — p.2915−2921.
- Hulett F.M., Lee J.K., Shi L., Sun G., Chesnut R., Sharkova E., Duggan M.F., Kapp N. Sequential action of two-component genetic switches regulates the pho regulon in Bacillus subtilis //J.Bacteriol. 1994. — V.176. — P.1348 — 1358.
- Hulett F.M. The signal transduction network for PHO regulation in Bacillus subtilis //Mol.Microbiol. — 1996. — V.19. — P.933 — 939.
- Ivanchenko O.B., Karamova N.S., Ilinskaya O.N. Genotoxity of bacterial ribonuclease in mammalian cells after its application in vivo and in vitro. //Animal cell technology/ Eds. Carrondo M.G.T. Netherlands. Academic Publ. -1997. -p.127−132.
- Jeffris G.D., Holtman W.F., Guse D. Rapid method for determining the activity of microorganisms on nucleic acids //J.Bacteriol. 1957. — V.73. — P.61−79.
- Jensen K.K., Sharkova E., Duggan M.F., Qi Y., Koide A., Hoch J.A., Hulett F.M. Bacillus subtilis transcription regulator, SpoOA, decreases alkaline phosphatase levels induced by phosphate starvation //J.Bacteriol. 1993. — V.175. -P.3749 -3756.
- Jiaj ian L., Cosby W., Zuber P. Role of Lon and ClpX in the posttranslation regulation in Bacillus subtilis //Mol. Microbiol. 1999. — v.33. — p.415−428.
- Kadowaki K., Yamaguchi K., Maruo B. Differental recovery of enzyme formation in actinomycin D inhibited cell caused by the addition of DNA //J. Biochem. 1966. — V.60. — p.341−343.
- Karamzyn-Campelli C., Bonamy C., Savelli B., Straigier P. Tandem genes encoding —factors for consecutive steps of development in Bacillus subtilis. //Genes Dev. 1989. — v.3. — p. 150−157.
- Karpetsky T.P., Shiver K.K., Levy C.C. The effect of polyamines on the poly (adenylic acid)-indused inhibition of ribonuclease activity //Biochem J. -1981. v.193. — p.325−337.
- Kroos L., Kunkel B., Losick R. Switch protein alters specificity of Bacillus subtilis RNA polymerase containing a compartment-specific sigma factor //Science. 1989. — v.243. — p.526−529.
- Kroos L., Zang B., Ichikawa H., Yu Y. T. N. Control of a factor activity during Bacillus subtilis sporulation //Molec. Microbiol. 1999. — v.31. — p. 12 851 294.
- Kruger E., Msadek T., Hecker M. Alternate promoters direct stress-inducted transcription of the Bacillus subtilis clp C operon //Molecular Microbiology. 1996. — v.20,№ 4. — p. 713−723.
- Kunst F., Rapoport G. Salt stress is an enviromental signal affecting degradative enzyme synthesis in Bacillus subtilis //J. of Bacteriol. 1995. — v. 177. — p.2403−2407.
- Kurien B.T., Scofield R.H. Polyethylene Glycol-Mediated Bacterial Colony Transformation //BioTechniques. 1995. — v.18. — № 6. — p.1023−1026.
- Kurinenko B.M., Bulgakova R.Sh., Davydov R.E. Effect of ribonuclease from Bacillus intermedius on human blood lymphocytes //FEMS Immunol. Med. Microbiol. 1998. — v.21 — p. 117−122.
- Kuroda A., Sekiguchi J. High-level transcription of the major Bacillus subtilis autolysin operon depends on expression of the sigma D gene and is affected by a sin (flaD) mutation //J. Bacteriol. 1993. — v. 175. — p.795−801.
- Lacey R.W., Chopra I. Genetic studies of a multi-resistant strains Stafilococcus aureus //J. Med. Microbiol. 1974. — v.7 — p.287−297.
- Lewin B. Genes. New-York.1995.
- Liu F., Altman S. Inhibition of viral gene expression by the catalytic RNA subunit of RNase P from Escherichia coli //Genes.Dev. 1995. — V.9 -P.471−480
- Liu W., Hulett F.M. Bacillus subtilis PhoP binds to the phoB tandem promoter exclusively within the phosphate starvation-inducible promoter //J.Bacteriol. 1997. — V.179. — P.6302−6310.
- Liu W., Hulett F.M. Comparison of PhoP binding to the tuaA promoter with PhoP binding to other PHO regulon promoters establishes a Bacillus subtilis PHO core binding site //Microbiology. 1998. — V.144. — P. 1443−1450
- Liu W., Eder S., Hulett F.M. Analysis of Bacillus subtilis tagAB and tagDEF expression during phosphate starvation identifies a repressor role for PhoP~P //J.Bacteriol. 1998a. — V.180. — P.753−758.
- Liu W., Qi Y., Hulett F.M. Sites internal to the coding regions of phoA and pstS bind PhoP and are required for full promoter activity //Mol.Microbiol. -1998b.-V.28.-P.119−130.
- Lopez de Saro F.J., Yoshikawa N., Helmann J.D. Expression, abudance and RNA polymerase binding properties of the delta factor of Bacillus subtilis. -1999. v.274. — p.15 953−15 958.
- Lu S., Halberg R., Kroos L. Processing of the mother-cell a factor, gk, may depend on events occuring in the forespore during Bacillus subtilis development//Proc. Natl. Acad. Sci. 1990. — v.87. — p.9722−9726.
- Malvar T., Baum J.A. Tn 5401is regulon of the spoOF gene, identified by direct chromosomal sequensing, results in CrylllA overproducton in B. thuringiensis //J.Bacterid. 1994. — v. 176. — p.4750−4753.
- Margolis P. S., Driks A., Losick P. Sporulation gene spoIIB from Bacillus subtilis //J. Bacteriol. 1994. — v. 175. — p.528−540.
- Mariani C., de Beuckeller M., Truettner J., Leemans J., Goldberg R.B. Induction of male sterility in plants by a chimaeric ribonuclease gene //Nature. -1990.-v.347. -p.737−741.
- Mariani C., Gossele V., de Beuckeller M., Deblock M., Degreef W., Leemans J. A chimaeric ribonuclease-inhibitor gene restores fertility to male sterile plants //Nature. 1992. — v.357. — p.384−387.
- Missiakas D., Raina S. The extracytoplasmic function sigma factors: role and regulation //Molec. Microbiol. 1998. — v.28. — № 6. p. 1059−1066.
- Mogk A., Homuth G., Scholz C., Kim L., Schmid F. X., Schumann W. The GroE chaperon machine is a major modulator of the CIRCE heat shock regulon of Bacillus subtilis //EMBO J. 1997. — v. 16. — p.45 79−4590.
- Moran C.P., Lang N., Le Grice S.F., Lee G., Stephens M., Sonenshein A.L., Pero J., Losick R. Nucleotide sequense that signal the initiation of transcription and translation in Bacillus subtilis //Mol.Gen.Genet. 1982. -186. -p.339−346.
- Moszer, I., Glaser, P., Danchin A. SubtiList: a relational database for the Bacillus subtilis genome //Microbiology. 1995. — V.141. — P.261−268.
- Mueller J.P., Bukusoglu G., Sonenshein A.L. Transcriptional regulation of Bacillus subtilis glucose starvation inducible genes: control of gsiA by the ComP-ComA signal transduction system //J.of Bacteriol. 1992. — v. 174. — p.4361−4373.
- Nagarajan V., Albertson H., Chen M., Ribbe J. Modular expression and secretion vectors for Bacillus subtilis //Gene. 1992. — v. l 14. — p.121 -126.
- Nakamura A., Koide Y., Miyazaki H., Kitamura A., Masaki H., Beppu T., Uozumi T. Gene cloning and characterization of a novel extracellular ribonuclease of Bacillus subtilis IIEur. J. Biochem. 1992. — V. 209. — P. 121−127.
- Nakano M.M., Zuber P., Glaser P., Danchin A., Hulett F.M. Two-component regulatory proteins ResD-ResE are required for transcriptional activation of fnr upon oxygen limitation in Bacillus subtilis //J.Bacteriol. 1996. -V.178. — P.3796 — 3802.
- Natsoulis G., Boeke J.D. New antiviral strategy using capsid nuclease fusion proteins //Nature. 1991 — V.352. — p.632−635.
- Paddon C.J., Hartley R.W. Cloning, sequensing and transcription of an inactivated copy of Bacillus amyloliquefaciens extracellular ribonuclease (barnase) //Gene. 1986. — v.40. — p.231−239.
- Paddon C.J., Hartley R.W. Expression of Bacillus amyloliquefaciens extracellular ribonuclease (barnase) in Escherichia coli following inactivating mutation//Gen. 1987. -N.53. — c. 11−19.
- Paddon C.J., Vasantha N., Hartley R.W. Notes Translation and processing of Bacillus amyloliquefaciens extracellular RNAse //Journal of Bacteriology. 1989.-v. 171 — p. 1185−1187.
- Partridge S. R., Fouleger D., Errington J. The role of in presporespecific transcription in Bacillus subtilis //Mol. Microbiol. 1991. — v.5. — p.757−767.
- Pedraza-Reyes M., Guetierrez-Corona F., Nicholson W.L. Temporal regulation and forespore-specific expression of the photoproduct lyase gene by sigma-G RNA polymerase during Bacillus subtilis sporulation //J. Bacteriol. -1994.-v. 176.-p.3983−3991.
- Perez-Martin J., Rojo F., de Lorenzo V. Promoters responsive to DNA binding: a common them in prokariotic gene expression //Microbiol. Rev. 1994. — v.58. — p.268−290.
- Pero J., Nelson J., Fox T.D. Hightly asymmetric transcriprion by RNA polymerase containing phage SPOl induced polypeptides and a new host protein //Proc.Natl.Acad.Sci.USA. — 1975. V. — 72. — p. 1589−1593.
- Predich M., Nair G., Smith A. Bacillus subtilis early sporulation genes kinA, spoOF and spoOA are transcrabe by the RNA polymerase contaning crH //J. Bacteriol. 1992. — v. 174. — p.2771−2778.
- Prep-A-Gene DNA Purification Kit Instruction Manual Bio-Rad Laboritories. -1991.
- Price V. A., Feavers I. M., Moir A. Role of sigma H in expression ofthe fumarase gene (citG) in vegetative cells of Bacillus subtilis //J. Bacteriol. 1989. -v.171. — p.5933−5939.
- Promega’s Protocols and Applications Guide. 1990. — p.37.
- Qi Y., Kobayashi Y., Hullet F.M. The pst operon of B. subtilis has a phosphate regulated promoter and is involved in phosphate transprot but not in regulation of the pho-regulon //J. Bacteriol. 1997. — v. 179. — p.2534−2539.
- Qi Y., Hulett F.M. Role of PhoP~P in transcriptional regulation of genes involved in cell wall anionic polymer biosynthesis in Bacillus subtilis //J.Bacteriol. 1998. — V.180. — P.4007−4010.185."Qiagen». Plasmid Handbook. 1995. — № 2. — 34p.
- Qiu J., Helmann J.D. Adenines at -11, -9 and -8 play a key role in the binding of Bacillus subtilis Esigma (A) RNA polymerase to -10 region single stranded DNA //Nucleic Acids Res. 1999. — v.21. — p.4541−4546.
- Robbins I., Mitta G., Vichier-Guerre S., Sobol R., Ubysz A., Rayner B., Lebleu B. Selective mRNA degradation by antisense oligonucleotide-2,5Achimeras: involvment of RNAse H and RNAse L //Biochimie 1998. — v.80. -p.711−720.
- Ronson C. W., Nixon T. B., Ausubel F. M. Conserved domains in bacterial regulatory proteins that respond to environmental stimuli //Cell. 1987. -v.49. — p.579−581.
- Rosario M. M. L., Ordal G.W. CheC and Ched interact to regulate methylation of Bacillus subtilis methyl-accepting chemotaxis proteins //Mol. Microbiol. 1996. — v.21. — p.511−518.
- Ross W., Gosink K., Salomon J., Idarashi K., Zou C., Ishihama A., Severinov K., Gorse R. A. A third recognition element in bacterial promoters: DNA binding by the subunit of RNA polymerase //Science. 1993. — v.262. -p.1407−1413.
- Rusal S., Sanches-Rivas K. In Bacillus subtilis DegU-P a positive regulator of the osmotic response //Current Microbiology. 1998. — v.37. — p.368−372.
- Rybak S.M. Ribonuclease based therapeutics for cancer and AIDSth
- Proceedings of the 5 Meeting on ribonucleases. 12−16 May, Warrengton, USA. 1999.-P.18.
- Sabelnikov A., Greenberg B., Lcks A. An extended -10 promoter alone directs transcription of the dpn II operon of Streptococcus pneumonial //J.Mol.Biol. 1995. — v.250. — p. — 144−155.
- Schaffer P., Millet J., Aubert J.-P. Catabolite repression of bacterial sporulation //Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 1965. — V.54. — p.-704−711.
- Schaffer P. Sporulating and the production of antibiotics, exoenzymes and exotoxins //J.Bacteriol. 1969 V.33. — P.48−71.
- Sethi V.S., Zellig W. Dissociation of DNA dependent RNA polymerase from E. coli in lithium chloride //FEBS Lett. — 1970. — v.8. — p.236.
- Shi L., Hulett F.M. The cytoplasmic kinase domain of PhoR is sufficient for the low phosphate-inducible expression of PHO regulon genes in Bacillus subtilis //Mol.Microbiol. 1999. — V.31. — P.211−222.
- Shorenstein R.G., Losick R. Comparative size and propeties of the sigma subunits of ribonucleic acid polymerase from Bacillus subtilis and Escherihia coli. //J. Biol. Chem. 1973. — v.248. — p.6170−6173.
- Shulga A.A., Nurkiyanova K.M., Zakharyev Y.M. Kirpichnikov M.P., Skryabin K.G. Cloning of the gene encoding RNAse binase from Bacillus intermedius 7P //Nucleic Acids Res. 1992. — v.20. — p. 2375.
- Simonen M., Palva I. Protein secretion in Bacillus species //Microbiological Reviews. 1993. — v.57.,№l. — p. 109 -137.
- Sobell H.M. AMD and DNA transcription //Prac. Natt. Acad. Sci. USA. -1985. V.92., N16. — p.328−533.
- Spigelman G.B., Hiatt W.R., Whiteley H.R. Role of the 21 000 molecular weight polypeptide of Bacillus subtilis RNA polymerase in RNA synthesis //J.Biol.Chem. 1978. — v.253. — p. 1756−1765.
- Spigelman G.B., Whiteley H.R. Subunit composition of Bacillus subtilis RNA polymerase during transcription //Biochem. Biophys. Res. Commun. 1979. — v.87.-p.811−817.
- Spiegelhalter F., Bremer E. Osmoregulation of the opuE proline transport gene from Bacillus subtilis: contributions of the sigma A and sigma B dependent stress-responsive promoters //Mol. Microbiol. 1998. — v.29. — p.285−296.
- Stock J.B., Ninfa A.J., Stock A.M. Protein phosphorylation and regulation of adaptive responses in bacteria //Microbiol.Rev. 1989. — V.53. -P.450−490.
- Stragier P., Kunkel B., Kroos L., Losick R. Chromosomal rearrangment generating a composite gene for a development transcription factor //Science. -1989. 243. — p.507−512.
- Stragier P., Losick R. Cascade of sigma factors revisited //Mol. Microbiol. 1990. — v.4. — p. 1801−1806.
- Strauch M.A., Webb V., Speigelman B., Hoch J.A. The SpoOA protein in Bacillus subtilis is a repressor of the abrB gene //Procl.Natl.Acad.Sci.USA. -1990. V.87. — P.1801−1805.
- Strauch M.A., Hoch J.A. Transition-state transcription regulators: sentinels of Bacillus subtilis post-exponential gene expression //Mol.Microbiol. -1993. V.7. — P.337−342.
- Strittmatter G., Janssens J., Opsomer C., Batterman J. Inhibition of fungal disease development in plants by ingineering controlled cell death //Biotechnology. 1995. — V.13. — p.1085−1089.
- Sun G., Straiger P., Setlow P. Identification of a new sigma-factor involved in compartmentalized gene expression during sporulation of Bacillus subtilis //Genes Dev. 1989. — v.3. — p.141−149.
- Sun G., Birkey S.M., Hullet F. M. Three two-component signal-transduction systems interact for PHO regulon in Bacillus subtilis //Mol. Microbiol. 1996a. — v. 19. — p.941−948.
- Sun G., Sharkova E., Chesnut R., Birkey S., Duggan M.F., Sorokin A., Pujic P., Ehrlich S.D., Hulett F.M. Regulators of aerobic and anaerobic respiration m Bacillus subtilis //J.Bacteriol. 1996b. — V.178. — P.1374−1385.
- Tatti K.M., Shuler M.F., Moran C.P. Sequence-specific interaction between promoter DNA and the RNA polymerase sigma factor E //J. Mol. Biol. -1995. v.253. -p.8−16.
- Terui G. Kinetics of hydrolase production by microorganisms //Pure. Appl. Chem. 1973. — V.36. — p.377−395.
- Tomilo M., Wilkinson K.S., Ryan P. Can a signal sequense become too hydrophobic //The Journal of Biological Chemistry. 1994. — v.269., N50. -p.32 016−32 021.
- Trach K. A., I loch J. A. Multisensory activation of the phosphorelay initiating sporulation in Bacillus subtilis: identification and sequence of the protein kinase of the alternate pathway //Mol. Microbiol. 1993. — v.8. — p.67−79.
- Travers A.A. Structure and fanctions of E. coli promoter DNA, CRC critic //Rev. In Biochem. 1987. — v.22. — p.181−221.
- Trempy J. E., Morrison-Plummer J., Handelwang W. G. Synthesys of sigma-29, an RNA polymerase specificity determinant, is a developmentally regulated event mBacillus subtilis 111. Bacteriol. 1985. — v.161. — p.340−346.
- Volker U., Andersen K.K., Antelmann H., Devin K.M., Hecker M. One of two OsmC homologs in Bacillus subtilis is part of the aB-dependent general stress regulon //J. of Bacteriol. 1998. — v.180. — p.4212−4218.
- Voskuil M. I., Chambliss G. H. The -16 region of Bacillus subtilis and other gram-positive bacterial promoters //Nucleic Acids Res. 1998. — v.26. -p.3584−3590.
- Wang L.F., Doi R. H. Nucleotide sequence and organization of the Bacillus subtilis RNA polymerase major sigma (a43) operon //Nucleic. Acids Res. 1986. -v.14. — p.4293−4307.
- Wen Y.D., Liou C. T, Wang W.H., Huang W.C., Chang B.Y. Structural and functional propeties of a Bacillus subtilis temperature-sensitive sigma (A) factor //Proteins. 2000. — v.40. — p.4293−4307.
- Wiggs J. L., Gilman M. Z., Chamberlin M. J. Heterogeneity of RNA polymerase in Bacillus subtilis: evidence for an additional sigma factor in vegetative cells //Proc. Natl. Acad. Sci. 1981. — v.78. — p.2762−2766.
- Wodzinski R.J. Intoduction to extracellular enzymes from the ribosome to the markat place //Adv. Appl. Mickrobiol. 1979. — v.25. — p. 1−6.
- Wu J. J., Piggot P. J., Tatti K. M., Moran C. P. Transcription of the Bacillus subtilis spoIIA locus //Gene. 1991. — v. 101. — p. 113−116.
- Yakovlev G.I., Moiseyev G.P., Struminskaya N.K., Borzykh O.A., Kipenskaya L.V., Znamenskaya L. V, Leschinskaya I.B., Chernokalskaya E.B.
- Hartley R.W. Mutational analyses of the active site of RNase of Bacillus intermedius (binase) // FEBS Letters. 1994. — v.354. — p.305−306.
- Yakovlev G.I., Struminskaya N.K., Znamenskaya L.V., Kipenskaya L.V., Leschinskaya I.B., Hartley R.W. Contribution of arginine-82 and arginine -86 to catalysis of Rnases from Bacillus intermedius (binase) //FEBS Lett. 1998. -v.428. — p.57−58.
- Yang D.H., von Kalkreuth J., Almansberger R. Synthesys of the sigmaD protein is not sufficient to trigger expression of motility functions in Bacillus subtilis I ft. Bacteriol. 1999. — v. 181. — p.2942−2946.
- Youle K.J., Newton D., Wu Y.N., Gadina M., Rybak S.M. Cytotoxic ribonucleases and chimerical in cancer therapy //Grit. Rev. Ther. Drug. Carrier Syst. 1993. -v.10. -p.1−28.
- Zhang B., Kroos L. A feedback loop regulates the switch from one sigma factor to the next in the cascade controlling Bacillus subtilis mother cell gene expression //J. of Bacteriol. -1997. v. 179. — p. 6138−6144.
- Znamenskaya L.V., Gabdrachmanova L.A., Chernokalskaya E.B., Leshchinskaya I.B., Hartley R.W. Phosphate regulation of biosynthses of extracellular RNAse of endospore-forming bacteria //FEBS Letters. 1995. -v.357.- 16−18.