Генная диагностика легионеллеза с использованием полимеразной цепной реакции
Материалы диссертации представлены на Российской научно-практической конференции «Генодиагностика инфекционных болезней» (Новосибирск, 2005) — VII Межгосударственной научно-практической конференции «Чрезвычайные ситуации международного значения в общественном здравоохранении в решениях Санкт-Пстербургского саммита «Группы восьми» и санитарная охрана территорий государств-участников Содружества… Читать ещё >
Содержание
- Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
- 1. 1. Характеристика возбудителя легионеллеза
- 1. 2. Лабораторная диагностика легионеллеза
- СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
- Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
- 2. 1. Объекты исследования
- 2. 1. 1. Бактериальные штаммы
- 2. 1. 2. Реактивы, питательные среды и диагностические препараты
- 2. 2. Микробиологические методы
- 2. 2. 1. Культивирование микроорганизмов, полученных из ГКПБ «Микроб»
- 2. 2. 2. Выделение и идентификация гетерологичных микроорганизмов из клинического материала
- 2. 2. 3. Подготовка проб
- 2. 2. 4. Выявление возбудителя легионеллеза в пробах биологического материала и из объектов окружающей среды с помощью бактериологического анализа
- 2. 2. 5. Идентификация культур Legionella spp
- 2. 2. 6. Выявление растворимого антигена
- L. pneumophila серогруппы 1 в моче
- 2. 2. 7. Выявление в сыворотке крови иммуноглобулинов к L. pneumophila серогруппы 1, Chlamydophila pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae, Coxiella bumetti методом иммуноферментного анализа
- 2. 2. 8. Выявление в сыворотке крови иммуноглобулинов к L. pneumophila серогруппы 1 в реакции аггломерации (РАО)
- 2. 3. Генетические методы
- 2. 3. 1. Обеззараживание проб для исследований методом ПЦР
- 2. 3. 2. Выделение ДНК из бактериальных суспензий, проб биологического материала и объектов окружающей среды
- 2. 3. 3. Полимеразная цепная реакция
- 2. 4. Клонирование ПЦР-продукта в вектор pGEM-T
- 2. 4. 1. Очистка ампликонов
- 2. 4. 2. Клонирование в вектор pGEM-T
- 2. 4. 3. Культивирование рекомбинантных штаммов Е. coli TGI
- 2. 4. 4. Выделение плазмидной ДНК рекомбинантного штамма Е. coli TGI
- 2. 5. Определение концентрации ДИК
- 2. 6. Программы и базы данных для анализа нуклеотидных последовательностей
- 2. 7. Статистическая обработка полученных данных
- 2. 1. Объекты исследования
- L. PNEUMOHILA И ГЕТЕРОЛОГИЧНЫХ МИКРООРГАНИЗМОВ ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ СПЕЦИФИЧНОСТИ И СПЕЦИФИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТИ ПРЕПАРАТОВ ДЛЯ ГЕННОЙ ДИАГНОСТИКИ ЛЕГИОНЕЛЛЕЗА
- 3. 1. Подбор гетер о логичных штаммов микроорганизмов
- 3. 2. Подбор специфичных штаммов микроорганизмов
3.3. Подготовка выборки штаммов L. pneumophila и гетерологичных микроорганизмов для определения специфической активности и специфичности тест-систем, направленных на индикацию и идентификацию возбудителя легионеллеза.
ГЛАВА 4. РАЗРАБОТКА ПЦР ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ ДНК
ВОЗБУДИТЕЛЯ ЛЕГИОНЕЛЛЕЗА В БИОЛОГИЧЕСКОМ МАТЕРИАЛЕ, ОБЪЕКТАХ ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ И ДЛЯ ИДЕНТИФИКАЦИИ ШТАММОВ L. PNEUMOPHILA
4.1. Выбор ДНК-мишеней.
4.2. Подбор олигонуклеотидных праймеров и зондов, оптимизация условий проведения ПЦР с электрофоретическим и гибридизационно-флуоресцентным учетом результатов.
ГЛАВА 5. РАЗРАБОТКА ТЕСТ-СИСТЕМ ДЛЯ ИНДИКАЦИИ И ИДЕНТИФИКАЦИИ L. PNEUMOPHILA МЕТОДОМ ПЦР С ЭЛЕКТРОФОРЕТИЧЕСКИМ И ГИБРИДИЗА-ЦОННО-ФЛУОРЕСЦЕНТНЫМ УЧЕТОМ РЕЗУЛЬТАТОВ.
5.1. Конструирование тест-систем для выявления ДНК возбудителя легионеллеза в биологическом материале и объектах окружающей среды методом ПЦР с электрофоретическим и гибридизацнонно-флуоресцентным учетом результатов.
5.2. Конструирование тест-систем для идентификации штаммов L. pneumophila методом ПЦР с электрофоретическим и гибридизационно-флуоресцептным учетом результатов.
5.3. Изучение диагностической ценности разработанных тест-систем для выявления возбудителя легионеллеза в биологическом материале и объектах окружающей среды и для идентификации штаммов L. pneumophila методом ПЦР с элекгрофоретическим и гибридизациионно-флуоресцентным учетом результатов.
Глава 6. АПРОБАЦИЯ СКОНСТРУИРОВАННЫХ ТЕСТ-СИСТЕМ НА ПРОБАХ ИЗ БИОЛОГИЧЕСКОГО МАТЕРИАЛА И ОБЪЕКТОВ ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ, РАЗРАБОТКА АЛГОРИТМА ГЕННОЙ ДИАГНОСТИКИ ЛЕГИОНЕЛЛЕЗА.
6.1. Апробация сконструированных тест-систем на пробах из биологического материала и объектов окружающей среды.
6.2. Алгоритм генной диагностики легионеллеза.
Список литературы
- Ашмарин И. П., Воробьев А. А. Статистические методы в микробиологических исследованиях / Л.: Медгиз, 1962. 180 с.
- Беликов Е.С., Трифонова А. Г., Коцурак Л. М., Беликов И. Е., Михайлова Д. О. Патологическая анатомия легионеллезной пневмонии по материалам вспышки в г. Верхняя Пышма // ЖМЭИ. 2008. -№ 2. — С. 105−107.
- Вишнякова Л. А, Путов Н. В. Этиология острых пневмоний. // Тер. архив. 1990. -№ 3. — С. 15−18.
- Воронина О.Л., Кунда М. С., Лунин В. Г., Карпова Т. И., Тартаковский И. С. Молекулярно-генетическое типирование штаммов Legionella pneumophila и Legionella spp., выделенных на территории Российской Федерации // КМАХ. 2008. — Том 10. — № 2. — С. 154−162.
- Воронина О.Л., Лунин В. Г. Молекулярно-генетическое типирование Legionella pneumophila серогруппы 1, выделенных в г. Верхняя Пышма, с использованием международных стандартов // ЖМЭИ. 2008. — № 2. — С. 20−23.
- Герхард Ф. Методы общей бактериологии / Пер. с англ. М.: Мир, 1983. -Т. 1. — 536 с.
- Герхард Ф. Методы общей бактериологии / Пер. с англ. М.: Мир, 1984. -Т. 3.-264 с.
- Голубев Б.П. Экологические аспекты распространения вибрионов эль-тор в объектах окружающей среды. Автореф. дис.. канд. мед. наук. Саратов, 1993. — 24 с.
- Григорьев А.А., Бондарев В. П., Борисевич И. В., Дармов И. В., Миронин А. В., Золотарев А. Г., Погорельский И. П., Янов Д. С. Умеренный легионел-лезпый бактериофаг: обнаружение и свойства // ЖМЭИ. 2008. — № 4. — С. 86−88.
- Григорьев А.А., Бондарев В. П., Дармов И. В., Миронин А. В., Золотарев А. Г., Погорельский И. П., Янов Д. С. Умеренный легионеллезный бактериофаг: обнаружение и свойства // Проблемы ООП. 2007. — Вып. 94. — С. 4649.
- Домотенко JI.B., Морозова Т. П., Сапогова А. В., Еруслаиов Б. В., Храмов М. В. Легионелбакагар: возможности и перспективы // ЖМЭИ. 2008. — № 2. -С. 62−66.
- Дуков JI. Г., Борохов А. И. Диагностические и лечебно-тактические ошибки в пульмонологии / М.: Медицина, 1988. С. 272.
- Дяченко С. С. Микробиологические методы диагностики инфекционных заболеваний / Киев: Медгиз, 1962. С. 534.
- Замогаев И. П. Острые пневмонии / Болезни органов дыхания. / Под. ред. Н. Г. Палеева / М.: Медицина, 1989. Т. 2. — С. 17−102.
- Карбышев Г. Л., Терентьев А. Н., Веркина Л. М., Симонова И. Р., Кочеткова А.Г1., Наркевич А. Н., Лысова Л. К., Ларионова Л. В. Серологическая диагностика легионеллеза // ЖМЭИ. 2008. — № 2. — С. 46−50.
- Карпова Т.И., Дронина Ю. Е., Тартаковский И. С., Романова Ю. М., Гинцбург АЛ. Природные биопленки легионелл и их роль в эпидемиологии инфекции: методы изучения и моделирования // ЖМЭИ. 2008. — № 2. — С. 13−16.
- Лабинская А. С. Практическое руководство по микробиологическим методам исследования / М.: Медгиз, 1963. 463 с.
- Лабинская А. С., Блинкова Л. П. Ещина А.С. Частная медицинская микробиология с техникой микробиологических исследований / М.: Медицина, 2005.-600 с.
- Ломов Ю.М., Карбышев Г. Л., Терентьев А. Н. Критерии диагностики болезни легионеров // Мат. VIII Межгосударственной науч.-практ. конф., 3−5 октября 2006 г. Оболенск. — С. 217−218.
- Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Молекулярное клонирование / Пер. с англ. М.: Мир, 1984. — 479 с.
- Михайлова Д.О., Лещенко И. В., Бобылева З. Д., Скляр М. С., Бубнова Е. М. Первая вспышка легионеллезной инфекции в Свердловской области. Алгоритм диагностики и лечения // Уральский медицинский журнал. 2007. -Вып. 8.-С. 4−10.
- Никонов Б.И., Романенко В. В., Жукова Ю. В., Дурасова А. Л., Астахова Т. С., Гаранина С. Б. ПЦР-диагностика при расследовании вспышки легионеллеза // ЖМЭИ. 2008. — № 2. — С. 44−46.
- Определитель бактерий Берджи / Под ред. Дж. Хоулта, Н. Крига, П. Снита, Дж. Стейли, С. Уилльямса / Пер. с англ. М.: Мир, 1999. — В 2 томах. — 800 с.
- Остерман Л. А. Методы исследования белков и нуклеиновых кислот. Электрофорез и ультра-центрифугирование / М.: Мир, 1981. 120 с.
- Прозоровский С.В., Васильева В. И., Тартаковский И. С. Выявление болезни легионеров на территории СССР // Журн. микробиол. — 1980. № 7. -С.105−107.
- Покровский В.И., Прозоровский С. В., Малеев В. В., Тартаковский И. С. Этиологическая диагностика и этиотропная терапия острых пневмоний / М.: Медицина, 1995.- 246 с.
- Покровский В.И., Прозоровский С. В., Тартаковский И. С., Беленький С. Н., Акулов К. Н., Сучков Ю. Г., Котова Е. А., Калашников И.П., Васильева
- B.И., Русакова Е. В., Ташпулагов Р. Ю., Маракуша Б. И., Радченко О. В., Белый Ю. Ф., Бархатова О. И., Брудный Р. А., Гальцева Г. В., Темежникова Н. Д. Вспышка легионеллезной инфекции в Армавире // ЖМЭИ. 1988. — № 10.1. C. 24−27.
- Прозоровский С.В., Покровский В. И., Тартаковский И. С. Болезнь легионеров (легионеллез). М.: Медицина, 1984. — 207 с.
- Пушкарева В.И. Патогенные бактерии в почвенных и водных сообществах (экспериментально-экологическое исследование): Автореф. дис.. докт. биол. наук. М., 1994. — 24 с.
- Романенко В.В., Дурасова A.JL, Оленева Е. А., Жукова Ю. В., Мотус Т. М. Лабораторная диагностика при расследовании вспышки внебольничной пневмонии в г. Верхняя Пышма // ЖМЭИ. 2008. — № 2. — С. 54−56.
- Тартаковский И.С. Болезнь легионеров: итоги 25-легнего изучения инфекции, проблемы и перспективы исследования // Вест. РАМН 2001. -Выпуск 11.-С. 11−14.
- Тартаковский И.С. Современные подходы к диагностике атипичных пневмоний // КМАХ 2000. — Выпуск 1 (2). — С. 60−68.
- Тартаковский И.С., Бархатова О. И., Темежникова Н. Д., Радченко О. В. Легионеллез // Лабораторная диагностика возбудителей опасных инфекционных заболеваний. Саратов. — 1998. — С. 166−173.
- Тартаковский И.С., Синопальников А. И. Легионеллез // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия.- 2001. Т. 3, — № 1.- С. 4−16.
- Тартаковский И.С., Темежникова Н. Д., Карпова Т. И. Легионеллез: проблемы и перспективы лабораторной диагностики // Проблемы особо опасных инфекций. 2005. — Выпуск 2 (90). — С. 17−23.
- Темежникова Н.Д. Диагностика легионеллеза в Краснодарском крае: Автореф. дис.. канд. биол. наук. Саратов, 1994. — 24 с.
- Федоров Ю.Н., Янов Д. С., Кибирев Я. А., Филиппов Н. И. // Современные технологии в диагностике особо опасных инфекционных болезней. — Саратов, 2003.-С. 184−185.
- Чураков А.А., Куличенко А. Н., Казакова Е. С., Серебряник Н. Е., Суворов А. П., Глыбочко П. В., Кутырев В. В. К вопросу о лабораторной диагностике урогениталыюго хламидиоза // Клиническая лабораторная диагностика. 2005. — № 2. — С.22−26.
- Яфаев Р.Х., Зуева П. П. Эпидемиология внутрибольничной инфекции -Л.: Медицина, 1989. 168 с.
- Методические указания по выявлению бактерий Legionella pneumophila в объектах окружающей среды. МУК 4.2.22−17−01. М, — 2007.
- Клиника, лечение и диагностика легионеллеза. Методические рекомендации. М. — 1987. — С. 34.
- Методические рекомендации по лабораторной диагностике легионеллеза (болезни легионеров). М. — 1987. — С. 30.
- Приказ № 535 МЗ СССР от 22.04.1985. Об унификации микробиологических (бактериологических) исследований, применяемых в клинико-диагностических лабораториях лечебно-профилактических учреждений. -М.- 1985.- С. 126.
- Эпидемиологический надзор за легионеллезной инфекцией. Методические указания МУ 3.1.2.2412−08. М. — 2008. — С. 42.
- EWGLI (http://www.ewgli.org)
- The genomic sequence of the accidental pathogen Legionella pneumophila, http. V/www.sciencemag. org/cgi/data/305/5692/1966/DC1/1
- Abraham W.R. Controlling biofilms of gram-positive pathogenic bacteria // Curr.Med. Chem.-2006.-Vol. 13, № 13. P. 1509−1524.
- Abu-Zant A., Asare R., Graham J.E., Abu Kwaik Y. Role for RpoS but not RelA of Legionella pneumophila in modulation of phagosome biogenesis and adaptation to the phagosomal microenvironment. // Infect. Immun. 2006. — Vol. 74, № 5.-P. 3021−3026.
- Adeleke A., Pruckler J., Benson R., Rowbotham Т., Halablad M., Fields B. Legionella-like amebal pathogens phylogenetic status and possible role in respiratory disease // Emerg. Infect. Dis. — 1996. — Vol. 2. — P. 225−230.
- Al-Ali M.K., Batchoun R.G., Al-Nour T.M. Etiology of community-acquired pneumonia in hospitalized patients in Jordan // Saudi Med J. 2006. -Vol. 27(6).-P. 813−816.
- Aoki S., Hirakata Y., Miyazafi Y., Izumikawa K., Yanagihara K., Tomono K., Yamada Y., Tashiro Т., Kohno S., Kamihira S. Detection of Legionella DNA by PCR of whole-blood samples in a mouse model // J. Med. Microbiol. 2003. -Vol. 52.-P. 325−329.
- Arancibia H.F., Diaz P.O. Severe community-acquired pneumonia in adults // Rev. Chilena. Infectol. 2005. — Vol. 22. — P. 46−51.
- Atlas R.M. Legionella: from environmental habitats to disease pathology: detection and control // J. Environ. Microbiol. 1999. — Vol. 1 (4). — P. 283−293
- Ballard A.L., Fry N.K., Chan L" Surman S.B., Lee J.V., flarrison T.G., Towner K.J. Detection of Legionella pneumophila using a real-time PCR hybridization assay // J. Clin. Microbiol. 2000. — Vol. 38, № 11. — P. 4215−4218.
- Barbeau J., Gauthier C., Payment P. Biofilms, infectious agents, and dental unit walerlines: a review // Can. J. Microbiol. 1998. — Vol. 44, № 11. — P. 101 928.
- Barka N.J., Tomasi J.P., Stadtsbaeder S. ELISA using whole Legionella pneumophila cell as antigen. Comparison between monovalent and polyvalent angens for the serodiagnosis of human legionellosis // J. Immunol. Methods. 1986. -Vol. 93.-P. 77−81.
- Benson R.F., Fields B.S. Classification of the genus Legionella II Semin. Respir. Infect. 1998. — Vol. 13, № 2. — P. 90−99.
- Berdal B.P., Farshy C.E., Feeley J.C. Detection of Legionella pneumono-phila antigen in urine by enzyme-linked immunospecific assay // J. Clin. Microbiol. 1979. — Vol. 9, № 5.-P. 575−578.
- Berry D., Xi C., Raskin L. Microbial ecology of drinking water distribution systems // Curr. Opin. Biotechnol. 2006. — Vol. 17, № 3. — P. 297−302.
- Bodmann K.F. Beatmungsassoziierte pneumonie prevention und diagnostic // Dtsch. Med. Wochenschr. — 2002. — Vol. 127. — P. 744−777.
- Bohte R., van Furth R., van den Broek P.J. Aetiology of community-acquired pneumonia: a prospective study among adults requiring admission to hospital // Thorax. 1995. — Vol. 50, № 5. — P. 543−547.
- Boom R., Sol C. J., Salimans M. M., et al., Rapid and simple method for purification of nucleic acids // J. Clin. Microbiol. 1990. — Vol. 28. — P. 495 -503.
- Borella P., Guerrieri E., Marchesi I., Bondi M., Messi P. Water ecology of Legionella and protozoan: environmental and public health perspectives // Biotechnol. Annu. Rev. 2005. — Vol. 11. — P. 355−380.
- Brassinga A.K., Hiltz M.F., Sisson G.R. et al. A 65-kilobase pathogenicity island is unique to Philadelphia-1 strains of legionella pneumophila // J Bacteriol. -2003.-Vol. 185.-P. 4630−4637.
- Brenner D.J., Steigerwalt A.G., Gorman G.V. Ten new species of Legionella U Int. J. Syst. Bacteriol. 1985. — Vol. 35. — P. 50−59.
- Brenner D.J., Steigerwalt A.G., McDade .Т.Е. Classification of the Legionnaires' disease bacterium: Legionella pneumophila, genus novum, species nova, of the family Legionellaceae, familia nova // Ann. Intern. Med. 1979. — Vol. 90, № 4.-P. 656−658.
- Cazalet C., Buchrieser C. Genomics of Legionella pneumophila // Pathoge-nomics-Genome analysis of pathogenic microbes. Wiley-VCH Verlag GmbH&Co. KGaA, Weinheim. — 2006. — P. 125−152.
- Cazalet C., Jarraud S., Ghave-Helm Y. et al. Multigenome analysis identifies a worldwide distributed epidemic Legionella pneumophila clone that emerged within a highly diverse species. Genome res. — 2008. — Vol. 18. — P. 431−441.
- Chartier B.J.Y., Lee J.V., Pond K., Surman-Lee S. Legionella and the prevention of legionellosis // WHO. 2007. — P. 268.
- Cheng Y.W., Chan R.C., Wong P.K. Disinfection of Legionella pneumophila by photocatalytic oxidation // Water. Res. 2007. — Vol. 41, № 4. — P. 842 852.
- Cirillo M., Bermudez L.E., El-Etr S.H. et al. Legionella pneumophila entry gene rtxA is involved in virulence. Infect Immun. — 2001. — Vol. 69. — P. 508 517.
- Cloud J.L., Carrol K.C., Pixton P., Erali M., Hyllyard D.R. Detection of Legionella species in respiratory specimens using PCR with sequencing confirmation// J. Clin. Microbiol. -2000. -Vol. 38, № 5. -P. 1709−1712.
- Cunha В.A. The atypical pneumonias: clinical diagnosis and importance // Clin. Microbiol. Infect. 2006. — Vol. 12. — P. 312−324.
- Declerck P., Behels J., De Keersmaecker В., Ollevier F. Receptor-mediated uptake of Legionella pneumophila by Acanthamoeba castellanii and Naegleria lo-vaniensis II J. Appl. Microbiol. 2007. — Vol. 103, № 6. — P. 2697−2703.
- Den Boer J.W., Yzerman E.P. Diagnosis of Legionella infection in Legionnaires' disease // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2004. — Vol. 23, № 12. — P. 871−878.
- De Ory F., Guisasola M.E., Eiros J.M.Detection of Chlamydophila pneumoniae IgG in paired serum samples: comparison of serological techniques in pneumonia cases // APMIS. 2006. — Vol. 114, № 4. — P. 279−284.
- Diederen B.M., Peeters M.F. Evaluation of the SAS Legionella Test, a new immunochromatographic assay for the detection of Legionella pneumophila serogroup 1 antigen in urine // Clin. Microbiol. Infect. 2007. — Vol. 13, № 1. — P. 8688.
- Diederen B.M.W., de Jong C.M.A., Kiuytmans J.A.J.W. et al. Detection and quantification of Legionella pneumophila DNA in serum: case reports and review of the literature / J. Med. Microbiol. 2006. — Vol. 55. — P. 639−642.
- Edelstein P.H. Improved semiselective medium for isolation of Legionella pneuniophila from contaminated clinical and environmental specimens // J. Clin. Microbiol. 1981.-Vol. 14, № 3. — P. 298−303.
- Edelstein P.H. Antimicrobial chemotherapy for legionnaires' disease: a review // Clin. Infect. Dis. 1995. — Vol. 21, № 3. — P. 256−276.
- Edelstein P.H., Edelstein M.A. In vitro activity of quinupristin/dalfopristin (Synercid, RP 59 500) against Legionella spp. II Diagn. Microbiol. Infect. Dis. -2000. Vol. 36, № 1. — P. 49−52.
- Erdogan H., Arslan H. Colonization of Legionella species in hotel water systems in Turkey // Travel. Med. 2007. — Vol. 14, № 6. — P. 369−373.
- Ewig S., Dalhoff K., Lorenz J. Nosokomiale pneumonie: empfehlungen zur therapie und prophylaxe // Pneumologie. 2000. — Vol. 54. — P. 525−538.
- Faris В., Faris C., Schousboe M., Heath C.FI. Legionellosis from Legionella pneumophila serogroup 1 // 3 Emerg. Infect. Dis. 2005. — Vol. 11, № 9. — P. 1405−1409.
- Feeley J.C., Gibson R.J., Gorman G.W., Langford N.C., Rasheed J.K., Mackel D.C., Baine W.B. Charcoal-yeast extract agar: primary isolation medium for Legionella pneumophila II J. Clin. Microbiol. 1979. — Vol. 10, № 4. p. 437. 441.
- Fields B.S., Benson R.F., Besser R.E. Legionella and legionnaires’disease: 25 years of investigation // Clin. Microbiol. Rev. 2002. — Vol. 15. — P. 506−526.
- Fischer G., Bang H., Ludwig В., Mann K., Hacker J. Mip protein of Legionella pneumophila exhibits peptidyl-prolyl-cis/trans isomerase (PPlase) activity // Mol. Microbiol. 1992.-Vol. 6, № 10.-P. 1375−1383.
- Franzin L., Scramuzza F, Prevalence of Legionella pneumophila serogroup 1 antibodies in blood donors // Eur. J. Epidemiol. 1995. — Vol. 11. — P. 475−478.
- Fox K.F., Brown A. Application of numerical systematics to the phenotypic differentiation of legionellae // J. Clin. Microbiol. 1989. — Vol. 27, №> 9. — P. 1952−1955.
- Friedman H., Yamamoto Y., Klein T.W. Legionella pneumophila pathogenesis and immunity // Semin. Pediatr. Infect. Dis. 2002. — Vol. 13, № 4. — P. 273−279.
- Fry N.K., Warwick S., Saunders N.A., Embley T.M. The use of 16S ribo-somal RNA analyses to investigate the phylogeny of the family Legionellaceae // J. Gen. Microbiol.-1991.-Vol. 137, № 5.-P. 1215−1222.
- Gaia V., Fry N. K., Afshar B. Consensus sequence-based scheme for epidemiological typing of clinical and environmental isolates of Legionella pneumophila // J. Clin. Microbiol. 2005. — Vol. 43, № 5. — P. 2047−2052.
- Gaia V., Poloni С., Peduzzi R. Epidemiological typing of Legionella pneumophila with ribotyping. Report of two clinical cases // Eur. J. Epidemiol. 1994. -Vol. 10, № 3, — P. 303−306.
- Gant V.A., Wren M.W., Rollins M.S., Jeanes A., Hickok S.S., Hall T.J.Three novel highly charged copper-based biocides: safety and efficacy against healthcare-associated organisms // J. Antimicrob. Chemother. 2007. — Vol. 60, № 2. — P. 294−299.
- George J.R., Pine L., Reeves M.W., flarrell W.K. Amino acid requirements of Legionella pneumophila II J. Clin. Microbiol. 1980. — Vol. 11, № 3. — P. 286 291.
- Gorelik O., Lazarovich Z., Boldur I., Almoznino-Sarafian D., Alon I., Mo-dai D., Cohen N. Legionella in two splenectomized patients. Coincidence or causal relationship? // Infection. 2004. — Vol. 32, № 3. — P. 179−181.
- Guyot S., Goy J.J., Gcrsbach P., Jaton K., Blanc D.S., Zanetti G. Legionella pneumophila aortitis in a heart transplant recipient // Transpl. Infect. Dis. 2007. -Vol. 9, № l.-P. 58−59.
- Harrison T.G., Doshi N. Evaluation of the Bartels Legionella Urinary Antigen enzyme immunoassay // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2001. — Vol. 20, № 10.-P. 738−740.
- Hebert G.A. Hippurate hydrolysis by Legionella pneumophila // J. Clin. Microbiol. 1981.-Vol. 13, № 1.-P. 240−242.
- Helbig J.H., Benson R.F., Pelaz C., Jacobs E., Luck P.C. Identification and serotyping of atypical Legionella pneumophila strains isolated from human and environmental sources//J. Appl. Microbiol. 2007 -Vol. 102, № l.-P. 100−105.
- Hindre Т., Briiggemann H., Buchrieser C., Hechard Y. Transcriptional profiling of Legionella pneumophila biofilm cells and the influence of iron on biofilm formation // Microbiology. 2008. — Vol. 154, № 1. — P. 30−41.
- Hoonan K.E., Beck C., Plolzmayer T.A. Quantitative analyses of MDR 1 (multidrug resistance) gene expression in human tumor by polymerase chain reaction//Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1990. — Vol. 87. — P. 7160−7164.
- Hwang M.G., Katayama IT, Ohgaki S. Inactivation of Legionella pneumophila and Pseudomonas aeruginosa: evaluation of the bactericidal ability of silver cations // Water. Res. 2007. — Vol. 41, № 18. — P. 4097−4104.
- Jaschek G., Gaydos C.A., Welsh L. et al. Direct detection of in urine specimens from symptomatic and asymptomatic men by using a rapid polymerase chain reaction assay //J. Clin. Microbiol. 1993. — V.31. — P.1209−1212.
- Jaulhac В., Nowicki M., Bornstein N., Meunier O., Prevost G., Piemont Y., Fleurette J., Monteil H. Detection of Legionella spp. in bronchoalveolar lavage fluids by DNA amplification // J. Clin. Microbiol. 1992. — Vol. 30, № 4. — P. 920−924.
- Jennings L.C., Anderson T.P., Beynon K.A., Chua A., Laing R.T., Werno A.M., Young S.A., Chambers S.T., Murdoch D.R. Incidence and characteristics of viral community-acquired pneumonia in adults // Thorax. 2008. — Vol. 63, № 1. -P. 42−48.
- Jimenez-Lucho V., Shulman M., Johnson J. Bordetella bronchiseptica in an AIDS patient cross-reacts with Legionella antisera // J. Clin. Microbiol. 1994. -Vol. 32, № 12. — P. 3095−3096.
- Jimenez P.P., Calvo A.M. Microbiologic diagnosis of community-acquired pneumonia in adults // Rev Chilena Infectol. 2005. — Vol. 22. — P. 32−38.
- Jonas D., Rosenbaum A., Weyrich S., Bhakdi S. Enzyme-linked immunoassay for detection of PCR-amplified DNA of legionellae in bronchoalveolar fluid // J. Clin. Microbiol. 1995. — Vol. 33, № 5. — P. 1247−1252.
- Jones T.F., Benson R.F., Brown E.W., Rowland J.R., Crosier S.C., Schaff-ner W. Epidemiologic investigation of a restaurant-associated outbreak of Pontiac fever//Clin. Infect. Dis.-2003.-Vol. 15.-P. 1292−1297.
- Joseph C.A. Legionnaires' disease in Europe 2000−2002 // Epidemiol. Infect. 2004. — Vol. 132.-P. 417−424.
- Kawano K., Okada M., Kura F., Amemura-Maekawa J., Watanabc H. Largest outbreak of legionellosis associated with spa baths: comparison of diagnostic tests. // Kansenshogaku. Zasshi. 2007. — Vol. 81, № 2. — P. 173−182.
- Kazandjian D., Chiew R., Gilbert G.L. Rapid diagnosis of Legionella pneumophila serogroup 1 infection with the Binax enzyme immunoassay urinary antigen test // J. Clin. Microbiol. 1997. — Vol. 35, № 4. — P. 954−956.
- Kellog D.E., Sninsky J.J., Kwok Quantitation of HIV 1 proviral DNA relative to cellular DNA by the polymerase chain reaction // Anal. Biochem. 1990. -Vol. 189.-P. 202−208.
- Kessler H.H., Reinthaler F.F., Fschaid A. et al. Rapid detection of Legionella species in bronchoalveolar lavage fluids with the EnviroAmp Legionella PCR amplification and detection kit // J. Clin. Microbiol. 1993. — Vol. 31. — P. 33 253 328.
- Klont R.R., Rijs A.J., Warris A., Sturm P.D., Melchers W.J., Verweij P.E. Legionella pneumophila in commercial bottled mineral water // FEMS Immunol. Med. Microbiol. 2006. — Vol. 47, № 1. — P. 42−44.
- Koide M., Saito A., Kusano N. et al. Detection of Legionella spp. In Cooling tower water by the polymerase chain reaction method // Appl. Enviroment. Microbiol. 1993.-Vol. 59, N6.-P. 1943−1946.
- Ко K.S., Hong S.K., Lee H. K, Park M.-Y., Kook Y.-H. Molecular evolution of the dotA gene in Legionella pneumophila // J. Bacteriol. 2003. — Vol. 185, № 21.-P. 6269−6277.
- Ко K.S., Miyamoto H., Lee H.K., Park M.Y., Fukuda K., Park В.Т., Kook Y.H. Genetic diversity of Legionella pneumophila inferred from rpoB and dotA sequences // Clin. Microbiol. Infect. 2006. — Vol. 12, № 3. — P. 254−261.
- La Scola В., Birtles R.J., Greub G., Harrison T.J., Ratcliff R.M., Raoult D. Legionella drancourtii sp.nov., a strictly intracellular amoebial pathogen // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2004. — Vol. 54, № 3. — P. 699−703.
- Lebeau I., Lammertyn E., De Buck E., Maes L., Geukens N" Van Mellaert L., Arckens L., Anne J., Clerens S. First proteomic analysis of Legionella pneumophila based on its developing genome sequence // Res. Microbiol. 2005. -Vol. 156, № l.-P. 119−129.
- Lee T.C., Vickers R.M., Yu V.L., Wagener M.M. Growth of 28 Legionella species on selective culture media: a comparative study // J. Clin. Microbiol. -1993.-Vol. 31, № 10.-P. 2764−2768.
- Lindsay D.S., Abraham W.H., Fallon R.J. Detection of mip gene by PCR for diagnosis of Legionnaires' disease // J. Clin. Microbiol. 1994. — Vol. 32. — P. 3068−3069.
- Liu Y.N., Chen M.J., Zhao T.M. et al. A multicenter study on the pathogenic agents in 665 adult patients with community-acqired pneumonia in cites of China // Zhonghua Jie He He HuX: Za Zhi. 2006. — Vol. 29(1). — P. 3−8.
- Lo Presti F., Riffard S., Vandenesch F., Reyrolle M., Ronco E., Ichai P., Etienne J. The first clinical isolate of Legionella parisiensis, from a liver transplant patient with pneumonia // J. Clin. Microbiol. 1997. — Vol. 35, № 7. — P. 1706−1709.
- Loret J.F., Robert S., Thomas V., Cooper A.J., McCoy W.F., Levi Y. Comparison of disinfectants for biofilm, protozoa and Legionella control // J. Water. Health. 2005. — Vol. 3, № 4. — P. 423−433. '
- Lowry P.W., Tompkins L.S. Nosocomial legionellosis: a review of pulmonary and extrapulmonary syndromes. // Amer. J. of Infect. Contr. 1993. — Vol. 21, № l.-P. 21−27.
- Luck P.C., Helbig J.H., Ehret W., Ott M. Isolation of a Legionella pneumophila strain serologically distinguishable from all known serogroups // Zentralbl. Bakteriol. — 1995.-Vol. l.-P. 35−39.
- Luck P.C., Schneider Т., Wagner J., Walther I., Reif U., Weber S., Weist K. Community-acquired Legionnaires' disease caused by Legionella pneumophila se-rogroup 10 linked to the private home // J. Med. Microbiol. 2008. — Vol. 57, № 2.-P. 240−243.
- Ma’ayeh S.Y., Al-Hiyasat A.S., Hindiyeh M.Y., Khader Y.S. Legionella pneumophila contamination of a dental unit water line system in a dental teaching centre // J. Int. Dent. Hyg. 2008. — Vol. 6, № 1. — P. 48−55.
- Marra A., Blander S.J., Horwitz M.A., Shuman H.A. Identification of a Legionella pneumophila locus required for intracellular multiplication in human macrophages // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1992. Vol. 15, № 89. — P. 96 079 611.
- Matsiota-Bernard P., Waser S., Vrioni G. Detection of Legionella pneumophila DNA in urine and serum samples from patients with pneumonia // Clin. Microbiol. Infect. 2000. — Vol. 6. — P. 223−225.
- McDade J.E., Shepard C.C., Fraser D.W., Tsai T.R., Rcdus M.A., Dowdle W.R. Legionnaires' disease: isolation of a bacterium and demonstration of its role in other respiratory disease // N. Engl. J. Med. 1977. — Vol. 297, № 1. — P. 11 971 203.
- Mclntyre M., Kurtz J.B., Selkon J.B. Prevalance of antibodies to 15 antigens of Legionellaceae in patients with community-acquired pneumonia // Epidemiol. Infect. 1990. — Vol. 104, № 1. — P. 39−45.
- McNaught В., Ricketts K., Joseph C. European surveillance of travel associated Legionnaire’s disease // Abstract from 21st Annual Meeting of the European Working Group for Legionella Infections. 2005. — P. 16.
- Marston B.J., Lipraan H.B., Breiman R.F. Surveillance for Legionnaires' disease. Risk factors for morbidity and mortality // Arch Intern Med. 1994. -Vol. 14.-P. 2417−2422.
- Mermel L.A., Joscphson S.L., Giorgio C.H., Dempsey J., Parenteau S. Association of Legionnaires' disease with construction: contamination of potable water? // Infect. Control. Hosp. Epidemiol. 1995. — Vol. 16, № 2. — P. 76−81.
- Molofsky A.B., Swanson M.S. Differentiate to thrive: lessons from the Legionella pneumophila life cycle // Mol. Microbiol. — 2004. Vol. 53, № 1. — P. 29−40.
- Muder R.R., Yu V.L. Infection due to Legionella species other than L. pneumophila // Clin. Infect. Dis. 2002. — Vol. 15. — P. 990−998.
- Murdoch D.R. Diagnosis of Legionella infection // Clin. Infect. Dis. 2003. -Vol. 36, № l.-P. 64−69.
- Murdoch D.R., Walford E.J., Jennings L.C. et al. Use of the polymerase chain reaction to detect Legionella DNA in urine and serum samples from patients with pneumonia // Clin. Infect. Dis. 1996. — Vol. 23. — P. 475−480.
- Musso D., Raoult D. Serological cross-reactions between Coxiella burnetii and Legionella micdadei II Clin. Diagn. Lab. Immunol. 1997. — Vol. 4, № 2. -P. 208−212.
- Nagai H., Kagan J.C., Zhu X. et al. A bacterial guanine nucleotide exchange factor activates ARF on Legionella phagosomes. Science. — 2002. — Vol. 295.-P. 679−682.
- Nazaian E.G., Bopp D.G., Saylors A. et al. Design and implementation of a protocol for the detection of Legionella in clinical and environmental samples // Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 2008. — Vol. 62, № 2. — P. 125−132.
- Newton H.J., Sansom F.M., Dao J. et al. Sell repeat protein LpnE is a Legionella pneumophila virulence determinant that influences vacuolar trafficking. -Infect. Immun. 2007. — Vol. 75. — P. 5575−5585.
- O’Connor В.Л., Carman J., Eckert K., Tucker G., Givney R., Cameron S. Does using potting mix make you sick? Results from a Legionella longbeachae case-control study in South Australia // Epidemiol. Infect. 2006. — Vol. 19. — P. 1−6.
- Pedro-Botet M.L., Sabria M. Legionellosis // Semin. Respir. Crit. Care. Med. 2005. — Vol. 26, № 6. — P. 625−634.
- Pelaz C.L., Garsia A., Bourgon C.M. Cross-reactivity among Legionella species and serogroups // Epidemiol. Infect.- 1987. Vol. 99. — P. 641−646.
- Pine L., George J.R., Reeves M.W., Harrell W.K. Development of a chemically defined liquid medium for growth of Legionella pneumophila II J. Clin. Microbiol. 1979. — Vol. 9, № 5.-P. 615−626.
- Plouffe J.F., File T.M., Jr., Breiman R.F., Hackman B.A., Salstrom S.J., Marston B.J., Fields B.S. Reevaluation of the definition of Legionnaires' disease: use of the urinary antigen assay // Clin. Infect. Dis. 1995. — Vol. 20, № 5. — P. 286−291.
- Polat Y, Ergin C, Kaleli I, Pinar A. Investigation of Legionella pneumophila seropositivity in the professional long distance drivers as a risky occupation // Mi-krobiyol. Bui. 2007. — Vol. 41, № 2. — P. 211−217.
- Pourcel C., Vidgop Y., Ramisse F., Vergnaud G., Tram C. Characterization of a tandem repeat polymorphism in Legionella pneiunophila and its use for geno-typing // J. Clin. Microbiol. 2003. — Vol. 41, № 5. — P. 1819−1826.
- Qasem J.A., Mustafa A.S., Khan Z.U. Legionella in clinical specimens and hospital welter supply facilities: molecular detection and genotyping of the isolates //Med. Princ. Pract. 2008. -Vol. 17, № l.-P. 49−55.
- Robinson P.N., Heidrich В., Tiecke F. et al., Species-specific detection of Legionella using polymerase chain reaction and reverse dot-blotting // FEMS Mi-cobiol. Lett.-1996.-Vol. 140.-P. 111−119.
- Rojas A., Navarro M.D., Fornes F.E., Serra E., Simarro E., Rojas J., Ruiz J. Value of serological testing for diagnosis of legionellosis in outbreak patients // J. Clin. Microbiol. 2005. — Vol. 43, № 8. — P. 4022−4025.
- Roig J., Sabria M., Pedro-Botet M.L. Legionella spp.: community acquired and nosocomial infections // Curr. Opin. Infect. Dis. 2003. — Vol. 16, № 2. — P. 145−151.
- Rogers J., Dowsett A.B., Dennis P.J., Lee J.V., Keevil C.W. Influence of plumbing material on biofilm formation and growth of Legionella pneumophila in a potable water systems // Appl. Environ. Microbiol. 1994. — Vol. 6. — P. 18 421 851.
- Rossier O., Starkenburg S.R., Cianciotto N.P. Legionella pneumophila type II protein secretion promotes virulence in the A/J mouse model of Legionnaires' disease pneumonia // Infect. Immun. 2004. — Vol. 72, № 1. — P. 310−321.
- Rowbotham T.J. Preliminary report on the pathogenicity of Legionella pneumophila for freshwater and soil amoebae // J. Clin. Pathol. 1980. — Vol. 33, № 12.-P. 1179−1183.
- Roy C.R., Berger K.H., Isberg R.R. Legionella pneumophila DotA protein is required for early phagosome trafficking decisions that occur within minutes of bacterial uptake // Mol. Microbiol. 1998. — Vol. 28. — P. 663−674.
- Ruscoe Q., Hill S., Blackmore Т., McLean M. An outbreak of Legionella pneumophila suspected to be associated with spa pools on display at a retail store in New Zealand // N. Z. Med. J. 2006. — Vol. 13. — P. 1243−1253.
- Sansom F.M., Newton H.J., Crikis S. et al. A bacterial ecto-triphosphate di-phosphohydrolase similar to human CD39 is essential for intracellular multiplication of Legionella pneumophila. Cell. Microbiol. — 2007. — Vol. 9(8). — P. 19 221 935.
- Shannon K.E., Lec D.Y., Trevors J.Т., Beaudette L.A. Application of realtime quantitative PCR for the detection of selected bactcrial pathogens during municipal wastewater treatment // Sci. Total. Environ. 2007. — Vol. 15, № l.-P. 121−129.
- Sheehan K.B., Henson J.M., Ferris M.J. Legionella species diversity in an acidic biofilm community in Yellowstone National Park // Appl. Environ. Microbiol. 2005. — Vol. 71, № i.p. 507−511.
- Shelburne S.A., Kielhofner M.A., Tiwari P. S. Serebellar involvement in legionellosis // South. Med. J. 2004. — Vol. 97, № 1. — P. 61−64.
- Soderberg M.A., Rossier О., Cianciotto N.P. The type II protein secretion system of Legionella pneumophila promotes growth at low temperatures // J. Bacterid. 2004. — Vol. 186, № 12.-P. 3712−3720.
- Steele T.W. Legionnaires' disease in South Australia, 1979−1988 // Med. J. Aust.- 1989. -Vol. 151, № 6.-P. 322−328.
- Stojck N.M., Dutkiewicz J. Legionella and other gram-negative bacteria in potable water from various rural and urban sources // Ann. Agric. Environ. Med. -2006.-Vol. 13.-P. 323−335.
- Stone B.J., Abu Kwaik Y. Expression of multiple pili by Legionella pneuimophila: identification and characterization of a type IV pilin gene and its role in adherence to mammalian and protozoan cells // Infcct. Immune. 1998. — Vol. 66. -P. 1768−1775.
- Su H. P, Tseng L.R., Tzeng S.C., Chou C.Y., Chung T.C. A legionellosis case due to contaminated spa water and confirmed by genomic identification in Taiwan // Microbiol. Immunol. 2006. — Vol. 50, № 5. — P. 371−377.
- Taylor Т.Н., Albrecht M.A. Legionella bozemanii cavitary pneumonia poorly responsive to erythromycin: case report and review // Clin. Infect. Dis. -1995. Vol. 20, № 2. — P. 329−334.
- Thomas V., Bouchez Т., Nicolas V., Robert S., Loret J.F., Levi Y. Amoebae in domestic water systems: resistance to disinfection treatments and implication in Legionella persistence // J. Appl. Microbiol. 2004. — Vol. 97, № 5. — P. 950−963.
- Tiaden A., Spirig Т., Carranza p. et al. Synergistic contribution of the Legionella pneumophila lqs genes to pathogen host interactions. J Bacteriol. -2008. — Vol. 190. — P. 7532−7547.
- Tillet H.E., de Louvois J., Wall P.G. Surveillance of outbreaks of water-borne infectious disease: categorizing levels of evidence // Epidemiol. Infect. — 1998.-Vol. 120.-P. 37−42.
- Tremolieres F. Current epidemiology of microbial low respiratory tract infections // Med. Mai. Infect. 2006. — Vol. 36, № 11. — P. 546−554.
- Uzel A., Ucar F., Hames-Kocabas E.E. Prevalence о? Legionella pneumophila serogroup 1 in water distribution systems in Izmir province of Turkey // Apmis. 2005. — Vol. 113, № 10. — P. 664−669.
- Uzel A, Cogulu D, Oncag O. Microbiological evaluation and antibiotic susceptibility of dental unit water systems in general dental practice // Int. J. Dent. Hyg.-2008.- Vol. 6,№ l.-P. 43−47.
- Veronesi L., Capobianco E., Affanni P., Pizzi S., Vitali P., Tanzi M.L. Legionella contamination in the water system of hospital dental settings // Acta. Biomed.- 2007. -Vol. 78, № 2.-P. 117−122.
- Vogel J.P., Andrews H.L., Wong S.K., Isberg R.R. Conjugative transfer by the virulence system of Legionella pneumophila II Science. 1998. — Vol. 6. — P. 873−876.
- Vonberg R.P., Sohr D., Bruderek J., Gastmeier P. Impact of a silver layer on the membrane of tap water filters on the microbiological quality of filtered water// Infect. Dis.-2008.-Vol. 8, № l.-P. 133.
- Williams T.J., Clarke D.E. Characterization of alpha 1-adrenoceptors mediating vasoconstriction to noradrenaline and nerve stimulation in the isolated perfused mesentery of rat // Br. J. Pharmacol. 1995. — Vol. 114, № 2. — P. 531−536.
- Wellinghausen N., Frost C., Marre R. Detection of Legionellae in hospital water samples by quatitative real-time LightCycler PCR // Appl. Environment. Microbiol. 2001. — Vol. 67, N 9. — P. 3985−3993.
- Wilson D.A., Yen-Lieberman В., Reischl U., Gordon S.M., Procop G.W. Detection of Legionella pneumophila by real-time PCR for the mip gene // J. Clin. Microbiol. 2003. — Vol. 41, № 7. — P. 3327−3330.
- Yzerman E.P., den Boer J.W., Lettinga K.D., Schel A.J., Schellekens J., Peeters M. Sensitivity of three serum antibody tests in a large outbreak of Legionnaires' disease in the Netherlands // J. Med. Microbiol. 2006. — Vol. 55, № 5. -P. 561−566.
- Zanetti F., Stampi S., De Luca G., Fateh-Moghadam P., Antonietta M., Sa-battini В., Checchi L. Water characteristics associated with the occurrence of Legionella pneumophila in dental units // Eur. J. Oral. Sci. 2000. — Vol. 108, № 1. -P. 22−28.