Эпидемиологические и микробиологичесике особенности хронической инфекции, вызванной бактериями комплекса Burkholderia cepacia, у больных муковисцидозом
Диссертация
Полученные нами данные послужили основанием для заключения, что для больных муковисцидозом характерным проявлением инфекционных осложнений является смешанная инфекция и что В. cepacia является" типичным представителем госпитальной микрофлоры. О видах микроорганизмов Р. aeruginosa, S. aureus как основных возбудителях легочной инфекции у больных муковисцидозом имеется достаточное число публикаций… Читать ещё >
Содержание
- СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
- ЧАСТЬ I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
- ГЛАВА 1. ЭПИДЕМИОЛОГЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ ИНФЕКЦИИ, ВЫЗВАННОЙ БАКТЕРИЯМИ BURKHOLDERIA CEPACIA
- 1. Эпидемиологические особенности инфекции, вызванной бактериями комплекса В. cepacia у больных муковисцидозом
- 2. Особенности биологии и экологии бактерий рода Burkholderia
- 3. Клиническое значение бактерий В. cepacia для человека
- 4. Методы исследования фенотипических и генотипических свойств бактерий В. cepacia
- ГЛАВА 2. МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА БАКТЕРИЙ BURKHOLDERIA CEPACIA
- 1. Идентификация бактерий В. cepacia
- 2. Антигенные свойства бактерий В. cepacia
- 3. Особенности генома В. cepacia
- 4. Необычные метаболические свойства В. cepacia
- 5. Факторы патогенности бактерий В. cepacia
- 6. Формирование биопленок
- 7. Инсерционные последовательности (ИП)
- 8. Межклеточное и внутриклеточное выживание бактерий комплекса В. cepacia
- ЧАСТЬ И. СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
- ГЛАВА 1. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
- 1. Материалы
- 2. Методы
- ГЛАВА 2. СТРУКТУРА МИКРОФЛОРЫ НИЖНИХ ДЫХАТЕЛЬНЫХ ПУТЕЙ У БОЛЬНЫХ МУКОВИСЦИДОЗОМ ДЕТЕЙ РАЗЛИЧНЫХ ВОЗРАСТНЫХ ГРУПП
- ГЛАВА 3. РАЗРАБОТКА АЛГОРИТМА ИДЕНТИФИКАЦИИ И ТИПИРОВАНИЯ БАКТЕРИЙ КОМПЛЕКСА В. CEPACIA
- 1. Фенотипические методы исследования свойств клинических штаммов В. cepacia
- 2. Изучение продукции факторов патогенности клиническими штаммами В. cepacia
- 3. Молекулярно-биологические методы для исследования госпитальных штаммов бактерий В. cepacia
- 4. Генетическое типирование штаммов В. cepacia, циркулирующих в различных клиниках г. Москвы и других городов России
- 5. Выявление эпидемически значимых штаммов В. cepacia
- ГЛАВА 4. СРАВНИТЕЛЬНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ШТАММОВ В. CEPACIA, ВЫДЕЛЕННЫХ ОТ БОЛЬНЫХ МУКОВИСЦИДОЗОМ И ПАЦИЕНТОВ МОСКОВСКИХ СТАЦИОНАРОВ
- 1. Сравнение продукции факторов патогенности
- 2. Изучение чувствительности штаммов к антимикробным препаратам
- 3. Изменение чувствительности штаммов к антибиотикам по годам
- 4. Выявление эпидемических маркеров
- 5. Выявление степени генетического родства между штаммами, выделенными от больных муковисцидозом и клиническими штаммами
- ГЛАВА 5. МОНИТОРИНГ ПЕРСИСТЕНЦИИ ШТАММОВ В. CEPACIA У ДЕТЕЙ БОЛЬНЫХ МУКОВИСЦИДОЗОМ
- 1. Фенотипические свойства штаммов В. cepacia
- 2. Генотипические свойства штаммов В. cepacia
Список литературы
- Зубков М. Н, Самойленко В. А., Гугуцидзе E.H., Чучалин А. Г. Микробиологические аспекты этиологии и антимикробной терапии бронхолегочной инфекции при муковисцидозе у взрослых. Пульмонология 2001- т. 11, № 3, с. 38−41.
- Малышев В., Картель H.A. Молекулярные маркеры в генетическом картировании растений. Молекулярная Биология 1997- т. 31, с. 197−208.
- Капранов Н.И. Современные проблемы ш достижения в области изучения муковисцидоза в России. Пульмонология 1994- т. 4, № 3, с. 616.
- Капранов Н.И., Каширская Н. Ю. Актуальные проблемы муковисцидоза на современном этапе в России. Пульмонология 1997- т.7, № 4, с. 7−16.
- Капранов Н.И., Каширская Н. Ю., Петрова Н. В. Муковисцидоз. Достижения и проблемы на. современном этапе. VII национальный конгресс по муковисцидозу: сборник статей и тезисов. М. 2005- с. 3−19.
- Капранов Н.И., Шабалова Л. А., Каширская Н. Ю., Воронкова А. Ю., Блистинова З. А., Лубская Т. В., Осипова И. А., Капранов А. Н. Муковисцидоз (Современные достижения и проблемы). Методические рекомендации. М.: Медпрактика 2001.
- Капустина Т.Ю., Каширская Н. Ю., Капранов Н. И. Состояние гепатобилиарной системы у детей, больных муковисцидозом. Пульмонология 2006- Приложение, с. 22−24.
- Капустина Т.Ю., Каширская Н. Ю., Капранов Н. И., Чесноков СВ.,
- Воронкова А.Ю. Российский регистр больных муковисцидозом. VII национальный конгресс по муковисцидозу: сборник статей и тезисов. М. 2005- с. 48−50.
- Кучкина Н.В., Самсонова М. В. Влияние осмотичности среды на морфофункциональное состояние нейтрофилов крови при MB. Пульмонология 1996- № 4, с. 77−79.
- Самсонова М.В., Черняев А. Л., Амелина Е. Л. Патология лёгких при муковисцидозе. Пульмонология 2006- Приложение, с. 113−117.
- Сулимова Г. Е., Шайхаев Г. О., Берберов Э. М., Маркарян А. Ю., Кандалова Л. Г. Генотипирование локуса каппа-казеина у крупного рогатого скота с помощью полимеразной цепной реакции. Генетика 1991- т.27, с. 2053−2062.
- Сулимова Г. Е., Удина И. Г., Шайхаев Г. О., Захаров И. А. ДНК-полиморфизм гена BoLA-DRB3 у крупного рогатого скота в связи с устойчивостью и восприимчивостью к лейкозу. Генетика 1995- т.31, № 9, с. 1294−1299.
- Черкасский Б.Л. Традиционные и новые понятия в современной эпидемиологии. Материалы IX съезда Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов. Москва 2007- т. 1, с. 36−38.
- Чернуха М.Ю. Реализация патогенности бактерий Burkholderia cepacia при разных формах инфекции. Автореферат докторской диссертации. М. 2008.
- Шабалова JI.A., Передерко Л. В., Каширская Н. Ю., Капранов Н. И. Аллергический бронхолёгочной аспергиллёз у детей с муковисцидозом. Пульмонология 2006- Приложение, с. 52−56.
- Шагинян И.А. Идентификация и типирование патогенных бактерий: современные подходы. Вестник РАМН 2000- т. 1, с. 22−28.
- Шагинян И.А., Першина М. Ю. Генетические маркеры в эпидемиологиибактериальных инфекций. Журн. микробиол. 1997- № 4, с. 54−59.
- Шагинян И.А., Тарасевич И. В. Молекулярная эпидемиология: предмет, iцель и задачи новой науки. Материалы IX съезда Всероссийскогонаучно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов. Москва 2007- т. 1, с. 41−42.
- Шагинян И.А., Чернуха М. Ю. Неферментирующие грамотрицательные бактерии в этиологии внутрибольничных инфекций: клинические, микробиологические эпидемиологические особенности. Клиническая микробиология и антимикробная терапия 2005- т.7, № 3, с. 271−285.
- Agodi A., Mahenthiralingam Е., Barchitta М. et al. Burkholderia cepacia complex infection in Italian patients with cystic fibrosis: prevalence, epidemiology, and genomovar status. J. Clinical microbiology 2001- vol. 39, n. 8, p. 2891−2896.
- Aubert D. F., Flannagan R. S., Valvano M. A. A novel sensor kinase-response regulator hybrid controls biofilm formation and type VI secretion system activity in Burkholderia cenocepacia. Infection and Immunity 2008- vol. 76, n. 5, p. 1979−1991.
- Avgeri S.G., Matthaiou D.K., Dimopoulos G., Grammatikos A.P., Falagas M.E. Therapeutic options for Burkholderia cepacia infections beyond co-trimoxazole: a systematic review of the clinical evidence. Int. J. Antimicrob.
- Agents 2009- 33(5), p. 394−404.
- Ambrose C.B., Kadlubar F.F. Toward an integrated approach to molecular epidemiology. Am. J. Epidemiol. 1997- 146, p. 912−918.
- Anthony M., Rose B., Pegler M.B. et al. Genetic analysis of Pseudomonas aeruginosa isolates from the sputa of Australian adult cystic fibrosis patients. J. Clin. Microbiol. 2002- 40, p. 2772−2778.
- Arber W. Promotion and limitation of genetic exchange. Science 1979- vol. 205, p. 361 -365.
- Arbeit R.D. Laboratory procedures for the epidemiologic analysis of microoranisms. Manual Clin microbiol. ASM Press 1995- p. 190−208.
- Avise J.C. Molecular markers, natural history and evolution. Chapman and HALL: An International Thomson Publishing Company 1994.
- Bauernfeind A., Schneider I., Jungwirth R. et al. Discrimination of Burkholderia multivorans and Burkholderia vietnamiensis from Burkholderia cepacia genomovars I, III, and IV by PCR. J. Clinical microbiology 1999- vol.37, n. 5, p. 1335−1339.
- Berger M., Sorensen R.U., Tosi M.F. et al. Complement receptor expression on neutrophils at the inflammatory site, The Pseudomonas-infected lung in cystic fibrosis. J. Clin. Invest 1989- 84, p. 1302−1313.
- Bombieri C., Giorgi S., Carles S. A new approach for identifying non-patogenic mutations. An analysis of the cystic fibrosis transmembrane regulator gene in normal individuals. Hum. Genet. 2000- vol. 106, p. 172−178.
- Bonfeld T.L., Konstan M.W., Burfeind P. et al. Normal bronchial epithelial cells constitutely produce the anti-inflammatory cytokine IL10 which is down regulated in cystic fibrosis. Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 1995- 13, p. 257 261.
- Bontemps C., Elliott G. N., Simon M. F. et al. Burkholderia species are ancient symbionts of legumes. Molecular Ecology 2010- vol. 19, n. 1, p. 4452.
- Botstein D., White R.L., Skolnick M., Davis R.V. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. Amer. J. Hum. Genet 1980- vol. 32, p. 314−331.
- Burns J.L., Emerson J., Stapp J.R. et al. Microbiology of Sputum from patients at cystic fibrosis centers in United States. Clin. Infect. Dis. 1998- 27, p. 158−163.
- Cheng A.C., Currie B.J. Melioidosis: epidemiology, pathophysiology, and management. Clin. Microbiol. Rev. 2005- 18(2), p. 383−416.
- Cheng H., Lessie T. Multiple replicons constituting the genome of Pseudomonas cepacia 17 616. J. Bacteriol. 1994- vol .176, p. 4034−4042.
- Chiarini L., Bevivino A., Dalmastri C., Tabacchioni S., Visca P. Burkholderia cepacia complex species: health hazards and biotechnological potential. Trends in Microbiology 2006- vol.14, n. 6, p. 277−286.
- Christenson J. C., Welch D.F., Mukwaya G., Muszynski M.J., Weaver R.E., Brenner D.J. Recovery of Pseudomonas gladioli from respiratory tract specimens of patients with cystic fibrosis. J. Clin. Microbiol. 1989 February- 27(2), p. 270−273.
- Coenye T., and LiPuma J.J. Molecular epidemiology of Burkholderia species. Fronti. Biosci. 2003- 8, p. 55−67.
- Coenye T., LiPuma J. J., Henry D. et alr. Burkholderia cepacia genomovar VI, a new member of the Burkholderia cepacia complex isolated from cystic fibrosis patients. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001- n. 51, p. 271−279.
- Coenye T., Mahenthiralingam E., Henry D. et al. Burkholderia ambirafaria sp.nov., a novel member of the Burkholderia cepacia complex including biocontrol and cystic fibrosis-related isolates. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001- vol. 51, p. 1481−1490.
- Coenye T., Vandamme P., Gowan J.R.W., Lipuma J.J. Taxonomy and identification of the Burkholseria cepacia complex. J. Clin. Microbiol. 2001- vol. 39, p. 3427−3436.
- Coenye T., Vandamme P. Burkholderia: molecular microbiology and genomics. Horizon Scientific Press 2007.
- Cystic Fibrosis Foundation. Patient Registry 1999 Annual Data Report. Cystic Fibrosis Foundation. Bethesda 2000.
- Dahl M., Tybjaerg-Hansen A., Lange P., Nordestgaard B.G. Asthma and COPD in. cystic fibrosis intron-8 5T carriers. A population-based study. Respiratory research 2005- vol. 113, № 60, p. 1155−1163.
- De Rose V. Mechanisms and markers of airway inflammation in cystic fibrosis. Eur. Respir. J. 2002- 19, p. 333−340.
- Deng Y., Boon C., Eberl L., Zhang L.-H. Differential modulation of Burkholderia cenocepacia virulence and energy metabolism by the quorum-sensing signal BDSF and its synthase. Journal of Bacteriology 2009- vol. 191, n. 23, p. 7270−7278.
- Dodge J.A., Lewis P.A., Stanton M. et al. Cystic fibrosis mortality and survival in the United Kingdom, 1947 to 2003. Eur. Respir. J. 2006 Dec 20.
- Donlan R.M. Biofilms and device-associated infections. Emerg. Infect. Dis. 2001- n. 7, p. 277−281.
- Donlan R.M., Costerton J.W. Biofilms: survival mechanisms of clinically relevant microorganisms. Clin. Microbiol. Rev 2002- 15, p. 167−193.
- Drevinek P., Vosahlikova S., Dedeckova K., Cinek O., and Mahenthiralingam
- E. Direct culture-independent strain typing of Burkholderia cepacia complex in sputum samples from patients with cystic fibrosis. Journal of Clinical Microbiology 2010- vol. 48, n. 5, p. 1888−1891.
- Dubarry N., Du W., Lane D., Pasta F. Improved electrotransformation and decreased antibiotic resistance of the cystic fibrosis pathogen Burkholderia cenocepacia strain J2315. Applied and Environmental Microbiology 2010- vol. 76, n. 4, p. 1095−1102.
- Duff A. J. A. Psychological consequences of segregation resulting from chronic Burkholderia cepacia infection in adults with CF. Thorax 2002- 57, p. 756−758.
- Estrada de los Santos P., Bustillos-Cristales R. and Caballero-Mellado J. Burkholderia, a genus rich in plant-associated nitrogen exers with wide environmental and geographic distribution. Appl. Environ. Microbiol. 2001- 67, p. 2790−2798.
- Frederiksen B., Koch C., Hoiby N. Changing Epidemiology of Pseudomonas aeruginosa infection in Danish cystic fibrosis patients (1974−1995). Pediatric pulmonology 1999- 28, p. 159−166.
- FitzSimmons S.C. The changing epidemiology of cystic fibrosis. Curr. Probl. Pediatr. 1994- 24, p. 171−179.
- Foxman B., Riley Lee. Molecular Epidemiology: Focus on Infection. American Journal of Epidemiology- vol. 153, n. 12, p. 1135−1141.
- Gan Y.H. Interaction of Burkholderia pseudomallei with host immune response: sleeping with the enemy? J. Infect. Dis. 2005- 192, p. 1845−1850.
- George A. M., Jones P. M., and Middleton P. G., Cystic fibrosis infections: treatment strategies and prospects. FEMS Microbiology Letters 2009- vol. 300, n. 2, p. 153−164.
- Gilligan P.H., Lum G., Vandamme P., Whittier S. Burkholderia,
- Stenotrophomonas, Ralstonia, Brevundimonas, Comamonas, Delftia, Pandorea, and Acidovorax. In: Murray P.R., Baron E.J., Jorgensen J.H., Pfaller M.A., Yolken R.H., editors. Manual of Clinical Microbiology. 8th ed. Washington: ASM Press 2003- p. 729−748.
- Goldstein R., Sun Li, Ru-zhang Jjang et al. Structurally variant classes of pilus appendage fibers coexpressed from Burkholderia (Pseudomonas) cepacia. J. Bacteriol. 1995- vol. 177, n. 4, p.1039−1052.i
- Govan J.R.W., Brown P.H., Maddison J. et al. Evidence for transmission of P. cepacia by social contact in cystic fibrosis. Lancet 1993- vol. 342, p. 15−19.
- Govan J.R.W., Vandamme P. Agricultural and medical microbiology: a time for bridging gaps. Microbiol. 1998- vol. 144, p. 2373−2375.
- Guggino W.B. Cystic fibrosis and the salt conroversy. Cell 1999- 96, p. 607 610.
- Holden M. T. G., Seth-Smith H. M. B., Crossman L. C. et al. The genome of Burkholderia cenocepacia J2315, an epidemic pathogen of cystic fibrosis patients. Journal of Bacteriology 2009- vol. 91, n. 1, p. 261−277.
- Holmes A., Govan J., Goldstein R. Agricultural use of Burkholderia (Pseudomonas) cepacia: a threat to human health. Emerg. Infect. Dis. 1998- n. 4, p. 221−227.
- Henry D.A., Mahenthiralingam E., Vandamme P. et al. Biochemical and molecular approaches for determining genomovar status of the ofv Burkholderia cepacia complex. Pediatr. Pulmonol.1999- Suppl. 19, p. 271. i
- Henry D.A., Mahenthiralingam E., Vandamme P. et al. Phenotypic methods for determining genomovar status Burkholderia cepacia complex. J. Clinical microbiology. 2001- vol. 39, n. 3, p. 1073−1078.
- Hodson M.E., Geddes D.M. Cystic fibrosis. London: Chapman 1995.
- Hutchison M., Poxton I. R., Govan J. R. Burkholderia cepacia produces a Hemolysin that is capable of inducing apoptosis and degranulation of mammalian phagocytes. Infect. Immun. 1998- vol. 66, n. 5, p. 2033−2039.
- Jelsbak L., Johansen H.K., Frost A.-L. et al. Molecular epidemiology and dynamics of Pseudomonas aeruginosa populations in lungs of cystic fibrosis patients. Infect. Immun 2007- 75, p. 2214−2224.
- Jensen E.T., Giwercman B., Ojeniyi B. et al. Epidemiology of Pseudomonas aeruginosa in cystic fibrosis and the possible role of contamination by dental equipment. J. Hosp. Inf. 1997- 36, p. 117−122.
- Jia B., Yang J.-K., Liu W.-S., Li X., and Yan Y.-J. Homologousoverexpression of a lipase from Burkholderia cepacia using the lambda Red recombinase system. Biotechnology Letters 2010- vol. 32, n. 4, p. 521−526.
- Jones A.M., Govan J.R., Doherty C.J. et al. Spread of a multiresistant strain of Pseudomonas aeruginosa isolates from patients with cystic fibrosis. Lancet 2001- 358, p. 557−558.
- Jones A.M., Todd M.E., Webb A.K. Burkholderia cepacia: current clinical issues, environmental controversies and ethical dilemmas. Eur. Respir. J. 2001- n. 17, p. 295−301.
- Kikuchi Y., Meng X.Y., Fukatsu T. Gut symbiotic bacteria of the genus Burkholderia in the broad-headed bugs Riptortus clavatus and Leptocorisa chinensis (Heteroptera: Alydidae). Appl. Environ. Microbiol. 2005- 71, p. 4035−4043.
- Kilbane J.J., Chatterjee D.K., Karns J.S., Kellogg S.T. Chakrabarty A.M. Biodegradation of 2,4,5-trichlorophenoxyacetic acid by a pure culture of Pseudomonas cepacia II. Appl. and Environ. Microbiol. 1982- v. 44, № 1, p. 72−78.
- Lee W.Riley. Molecular Epidemiology of Infectious Diseases. Principles and Practices. ASM Press 2004.
- Leelarasamee A. Recent development in melioidosis. Curr. Opin. Infect. Dis. 2004- 17, p. 131−136.
- Leitao J. H., Sousa S. A., Ferreira A. S., Ramos C. G., Silva I. N., and Moreira L. M. Pathogenicity, virulence factors, and strategies to fight against
- Burkholderia cepacia complex pathogens and related species. Applied Microbiology and Biotechnology 2010- vol. 87, n. 1, p. 3140.
- Lennin E. and DeCicco B. Plasmid of P. cepacia strains of diverse origins. Appl. Environ. Microbiol. 1991- vol.57, p. 2345−2350.
- Liou T.G., Adler F.R., FitzSimmons S.C. et al. Predictive 5-year survivorship model of cystic fibrosis. American Journal of Immunology 2001- 153, p. 345 352.
- LiPuma J.J., Mahenthiralingam E. Commercial use of Burkholderia cepacia. Emerg. Infect. Dis. 1999- n. 5, p. 305−306.
- Mahenthiralingam E., Baldwin A., and Dowson C.G. Burkholderia cepacia complex bacteria: opportunistic pathogens with important natural biology. Journal of Applied Microbiology 2008- vol. 104, n. 6, p. 1539−1551.
- Mahenthiralingam E., Baldwin A., Vandamme P. Burkholderia cepacia complex infection in patients with cystic fibrosis. J. Med. Microbiol. 2002- 51, p. 533−538.
- Mahenthiralingam E., Campbell M.T., Foster J. et al. Random amplified polymorphic DNA typing of Pseudomonas aeruginosa isolates recovered from patients with cystic fibrosis. J. Clin. Microbiol. 1996- 34, p. 1129−1135.
- Mahenthiralingam E., Urban T.A., Goldberg J.B. The multifarious, multireplicon Burkholderia cepacia complex. Nature Reviews. Microbiology 2005- vol.3, n. 2, p. 144−156.
- Mann T., Ben-David D., Zlotkin A. et al. An outbreak of Burkholderia cenocepacia bacteremia in immunocompromised oncology patients. Infection 2010- vol.38, n. 3, p. 187−194.
- Matsui H., Grubb B.R., Tarran R. et al. Evidence for periciliary liquid layer depletion, not abnormal ion composition, in the pathogenesis of cystic fibrosis airways disease. Cell 1998- 95, p. 1005−1015.
- McCallum S.J., MJ. Gallagher, J.E. Corkill et al. Spread of an epidemic Pseudomonas aeruginosa strain from a patient with cystic fibrosis (CF) to non-CF relatives. Thorax 2002- 57, p. 559−560.
- McDowell A., Mahenthiralingam E., Moore J.E. et al. PCR-based detection and identification of Burkholderia cepacia complex pathogens in sputum from cystic fibrosis patients. J. Clinical microbiology 2001- vol.39, n. 12, p. 42 474 255.
- Nakazawa T., Yamada Y., Ishibashi M. Characterization of hemolysin in extracellular products of Pseudomonas cepacia. J. Clin. Microbiol. 1987- vol.25, p. 195−198.
- Ngauy V., Lemeshev Y., Sadkowski L., Crawford G. Cutaneous melioidosis in a man who was taken as a prisoner of war by the Japanese during World War II. J. Clin. Microb. 2005- 43, p. 970−972.
- Nierman W.C., DeShazer D., Kim H., Tettelin H., Nelson K. E., et al. Structural flexibility in the Burkholderia mallei Genome. Proc. Natl. Acad. Sei. USA 2004- 101, p. 14 246 14 251.
- Noone P., Zhou Z., Silverman L. Cystic fibrosis gene mutations and pancreatitis risk: relation to epithelial ion transport and trypsin inhibitor gene mutations. Gastroenterology 2001- vol. 6, p. 1310−1319.
- Olive D.M., Bean P. Principles and application of methods for DNA-based typing of microbial organisms. J. Clin. Microbiol. 1999- 37, p. 1661−1669.
- Olsen G.J., Woese C.R. Ribosomal RNA: a key to philogeny. FASEB 1993- 7, p. 113−123.
- Palleroni N. J. Genus I Pseudomonas Migula 1894. Bergeys manual of systematic bacteriology volume 1. Williams and Wilkins. Baltimore, USA 1984.
- Rabkin C.S., Jarvis W.R., Martone W.J. Current status of Pseudomonas cepacia typing systems. Eur. J. Epidemiol. 1987- 3, p. 343−346.
- Rabkin C.S., Jarvis W.R., Anderson R.L., Govan J. et al. Pseudomonas cepacia typing systems: collaborative study to assess their potencial in epidemiologic investigation. Rev. Infect. Dis. 1989- 11, p. 600−607.
- Reddi K., Phagoo S.B., Anderson K.D. et al. Burkholderia cepacia-induced IL-8 gene expression in an alveolar epithelial cell line signaling through CD14 and mitogen-activated protein kinase. Pediatr. Res. 2003- vol. 54, p. 297−305.
- Riley L.W. Molecular Epidemiology of Infectious Diseases. Principles and Practices. ASM Press 2004.
- Rioddan J.R., Romens J.M., Keren B.S. et al. Identification of the cystic fibrosis gene: cloning and characterization of complementary DNA. Science 1989- vol. 245, p. 1066−1073.
- Romens J.M., Iannuzzi M.C., Keren B.S. et al. Identification of the cystic fibrosis gene: chromosome walking and jumping. Science 1989- vol. 245, p. 1059−1065.
- Saiman L., Siegel J. Infection control in cystic fibrosis. Clin. Microbiol. Rev. 2004- 17, p. 57−71.
- Saijan S. and Forstner J. Identification of the mucin-binding adhesin of P. cepacia isolated from patients with cystic fibrosis. Infect. Immun. 1992- vol. 60, p. 1434−1440.
- Saijan S. and Forstner J. Role of a 22-kilodalton pilin protein in binding of P. cepacia to buccal epithelial cells. Infect Immun. 1993- vol. 61, p. 3156−3163.
- Sald’ias M. S., Lamothe J., Wu R., and Valvano M. A. Burkholderia cenocepacia requires the RpoN sigma factor for biofilm formation and intracellular trafficking within macrophages. Infection and Immunity 2008- vol. 76, n. 3, p. 1059−1067.
- Sald’ias M. S. and Valvano M. A. Interactions of Burkholderia cenocepacia and other Burkholderia cepacia complex bacteria with epithelial and phagocytic cells. Microbiology 2009- vol. 155, n. 9, p. 2809−2817.
- Scordilis G.E., Ree H., Lessie T.G. Identification of transposable elements which activate gene expression in Pseudomonas cepacia. J. Bacteriol. 1987- vol. 169, p. 8−13.
- Seigle-Murandi F., Guiraud P., Croize J., Falsen E., and Eriksson K. L. Bacteria Are Omnipresent on Phanerochaete chrysosporium Burdsall. Applied and Environmental Microbiology Journal 1996 July- 62(7), p. 2477−2481.
- Sharrer G. Terry. The Great Glanders Epizootic, 1861−1866: A Civil War Legacy. Agricultural History. Winter 1995- 69(1), p. 79−97.
- Shaw D., Poxton I.R., Govan J.R. Biological activity of Burkholderia (Pseudomonas) cepacia lipopolysaccharide. FEMS Immunol. Mol. Microbiol. 1995- n. 11, p. 99−106.
- Smith J.J., Travis S.M., Greenberg E.P., Welsh M.J. Cystic fibrosis airway epithelia fail to kill bacteria because of abnormal airway surface fluid. Cell 1996- 85, p. 229−236.
- Snyder M.P., Kimbrell D., Hunkapiller M., Hill R., Fristrom J., Davidson N. A transposable element that splits the promoter region inactivates a
- Drosophila cuticle protein gene. Proc. Nat. Acad. Sei. USA 1982- vol. 79, p. 7430−7434.
- Sommerhof C.P., Nadel J.A., Basbaum C.B., Caughey G.H. Neutrophil elastase and catepsin G stimulate secretion from cultures bovine airway glands. J. Clin. Invest. 1990- 85, p. 682−689.
- Sousa S.A., Ramos C.G., and Leitao J.H. Burkholderia cepacia Complex: Emerging Multihost Pathogens Equipped with a Wide Range of Virulence Factors and Determinants. International Journal of Microbiology 2011.
- Southern E.M. Detection of specific sequences among DNA fragments separeted by gel electrophoresis. J. Mol. Biol. 1975- 98, p. 503−517.
- Stull T.L., LiPuma J.J., Edling T.D. A broad-spectrum probe for molecular epidemiology of bacteria: ribosomal RNA. J. Infect. Dis. 1988- 157, p. 280 286.
- Sun L., Jiang L.Z., Steinbach S. et al. The emergence of a highly transmissible lineage of cbl+ Pseudomonas (Burkholderia) cepacia causing CF center epidemics in North America and Britain. Nat. Med. 1995- n. 1, p. 661−666.
- Tateda K., Ishii Y., Horikawa M. et al. The Pseudomonas aeruginosa Autoinducer N-3-Oxododecanoyl Homoserine Lactone Accelerates Apoptosis in Macrophages and Neutrophils. Infect. Immun. 2003- vol.71, n. 10, p. 57 855 793.
- Thiel T., Kota R., Grosse I., Stein N., Graner A., SNP2CAPS: a SNP and INDEL analysis tool for CAPS marker development. Nucleic Acids Research 2004- vol. 32, n. 1, p. e5.
- Trezise A., Buchwald M. In vivo cell-specific expression of the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator. Nature 1991- vol. 353, p. 434−437.
- Tyler S.D., Rozee K.R., Johnson W.M. Identification of IS 1356, a newinsertion sequence, and its association with IS402 in epidemic strains of Burkholderia cepacia infecting cystic fibrosis patients. J. Clin. Microbiol. 1996- vol. 34, p. 1610−1616.
- Van Belkum A., Renders N.H.M., Smith S. et al. Comparison of conventional and molecular methods for the detection of bacterial pathogens in sputum samples from cystic fibrosis patients. FEMS Immunol. Med. Microbiol. 2000- vol. 27, p. 51−57.
- Van Borm S., Buschinger A., Boomsma J.J., Billen J. Tetraponera ants have gut symbionts related to nitrogen-fixing rootnodule bacteria. Proceedings of the Royal Society of London. Biological Sciencees 2002- 269, p. 2023—2027.
- Van de Peer Y. TREECON for Windows user manual. Antwerp (UIA), 1998.
- Van Eijk M.J.T., Stewart-Haynes J.A. and Lewin H.A. Extensive polymorphism of the BoLA-DRB3 Gene Distinguished by PCR-RFLP II. Animal Genetics 1992- v. 23, n. 6, p. 483−496.
- Van Pelt C., Verduin C.M., Goessens W.H.F. et al. Identification of Burkholderia spp. in the clinical microbiology laboratory: comparison of conventional and molecular methods. J. Clin. Microbiol. 1999- vol. 37, p. 2158−2164.
- Vandamme P., Pot B., Gillis M. et al. Polyphasic taxonomy, a consensus approach to bacterial systematics. Microbiol. Rev. 1996- vol. 60, p. 407−438.
- Vasil M.L., Krieg D.P., Kuhns J.S. et al. Molecular analysis of hemolytic and phospholipase C activities of Pseudomonas cepacia. Infect. Immun. 1990- vol. 58, p. 4020−4029.
- Venter J.C., Ramington K., Heidelberg J.F. et al. Environmental genome shotgun secueencing of the Sargasso Sea. Science 2004- vol. 304, p. 66−74.
- Vinion-Dubiel A.D., Goldberg J.B. Lipopolysaccharide of Burkholderia cepacia complex. Endotoxin Res. 2003- n. 9, p. 201−213.
- Walker R., Emslie K.A., Allan E.J. Bioassay methods for the detection of antifungal activity by Pseudomonas antimicrobica against the grey mould pathogen Botrytis cinerea. J. Appl. Bacteriol. 1996 Nov- 81(5), p. 531−537.
- Wallace R. B. DNA recombinant technology. Boca Raton (Fla.): CRC press, 1983.
- Welsh J., McClelland M. Fingerprinting genomes using PCR with arbitraryprimers. Nucleic Acids Res. 1990- v. 18, p. 7213−7218.
- Wheelis M. First shots fired in biological warfare. Nature 1998- № 395, p. 213.
- Williams J. G., Kubelik A. R., Livak K. J., Rafalski J. A., Tingey S. V. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleic Acids Res. 1990- 22, 18, S. 6531−6535.