Помощь в учёбе, очень быстро...
Работаем вместе до победы

Разработка принципов ускоренной идентификации микобактерий лазерно-флюоресцентным методом

ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Существующие на сегодняшний день ускоренные методы идентификации микобактерий, такие как молекулярно-генетические, хроматографические, автоматизированные системы культивирования на жидких средах, при несомненных своих достоинствах и преимуществах существенно ограничены для широкого внедрения и применяются в основном в крупных централизованных микробиологических центрах: Для проведения этих… Читать ещё >

Содержание

  • СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
  • ГЛАВА I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
    • 1. 1. Современное состояние проблемы диагностики туберкулеза и микобактериоза
      • 1. 1. 1. Нетуберкулезные микобактерии
    • 1. 2. Современные методы видовой идентификации микобактерий
      • 1. 2. 1. Микробиологические методы видовой идентификации микобактерий
        • 1. 2. 1. 1. Культуральные методы исследования
        • 1. 2. 1. 2. Биохимические методы исследования
        • 1. 2. 1. 3. Автоматизированные системы культивирования микобактерий на жидких средах
      • 1. 2. 2. Хроматографические методы исследования
      • 1. 2. 3. Молекулярно-генетические методы исследования
    • 1. 3. Обоснование возможности применения лазерно-флюоресцентного метода для ускоренной идентификации микобактерий
      • 1. 3. 1. Порфирины
        • 1. 3. 1. 1. Микробиологический синтез порфиринов
        • 1. 3. 1. 2. Метаболизм микобактерий
      • 1. 3. 2. Применение лазерно-флюоресцентного метода для экспресс-индикации бактерий

Разработка принципов ускоренной идентификации микобактерий лазерно-флюоресцентным методом (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Актуальность исследования.

Согласно оценкам ВОЗ, с каждым годом во всем мире регистрируется все большее число новых случаев заболевания туберкулезом. Так, в 2007 г. во всем мире насчитывалось 9,27 миллиона новых случаев заболевания туберкулезом, из них 1,37 миллиона (15%) были ВИЧ-положительными. В 2007 г. умерло от туберкулеза 1,3 миллиона ВИЧ-отрицательных лиц и 0,45 миллиона ВИЧ-инфицированных лиц [56,97]. Возбудители туберкулеза относятся к Mycobacterium tuberculosis complex, куда входят M. tuberculosis (МБТ), M. bovis, M. bovis BCG, M. microti, M.africanum.

Сегодня, как и в предыдущие годы, туберкулез в России остается ведущей причиной смерти среди всех инфекционных заболеваний [56,63]. Так, по данным М. В. Шиловой (2008г.) из всех умерших в 2007 г. в стационаре от инфекционных и паразитарных болезней доля больных, смерть которых наступила от туберкулеза, составила 70% [63].

В распространении туберкулеза все большую роль играет эпидемия ВИЧ-инфекции [24,36,47,107,125,127,128]. Если сравнить, что в 2004 году показатель заболеваемости ВИЧ-инфекции в России был равен 19,9 на 100 тыс. населения, то в 2007 году уже составил 34,6 [56,63,97].

Наряду с широким распространением по всему миру туберкулеза, отмечается также рост заболеваемости микобактериозами, возбудителями которых являются нетуберкулезные микобактерии (НТМБ) [31,45]. Резкий подъем числа заболеваний, вызываемых НТМБ, в том числе М. avium, M. intracellulare, M. kansasii, M. fortuitum и др., в значительной мере обусловлен развитием эпидемии ВИЧ-инфекции — у 25−50% больных СПИДом развивается диссеминированная микобактериальная инфекция [67,76]. Особенностью НТМБ является их высокая природная резистентность к антибактериальным препаратам, в том числе и противотуберкулезным. На сегодня, по литературным данным, во всем мире известно более 120 видов НТМБ [92,98]. В России распространенность НТМБ в 2004;2005 гг. составила 0,5−6,2% среди всех микобактерий у впервые выявленных больных [45]. При схожей клинической картине туберкулеза и микобактериоза главным критерием при постановке диагноза микобактериоза является бактериологическое исследование больного с выделением культуры микобактерии и их идентификацией.

Классический бактериологический метод выделения и идентификации микобактерий основывается на способности роста культуры при различных температурах, оценке скорости роста, морфологии колонии, пигментообразования, ферментативной активности, биохимических свойств [20,22,23]. Основным недостатком бактериологического метода является длительность и сложность обработки диагностического материала. Так, по данным авторов Т. Ф. Оттен, А. В. Васильев (2005г.) сроки идентификации НТМБ традиционными методами достигают до 6 месяцев [45]. По приказу № 109 МЗ РФ от 21.03.2003 г. «О совершенствовании противотуберкулезных мероприятий в РФ» диагноз туберкулез ставится после двукратного подтверждения бактериологическим методом, а все остальные методы идентификации являются дополнительными [52].

Существующие на сегодняшний день ускоренные методы идентификации микобактерий, такие как молекулярно-генетические, хроматографические, автоматизированные системы культивирования на жидких средах, при несомненных своих достоинствах и преимуществах существенно ограничены для широкого внедрения и применяются в основном в крупных централизованных микробиологических центрах [45,46,55,59]: Для проведения этих исследований необходима специализированная лабораторная служба, высококвалифицированный персонал, используются дорогостоящие расходные материалы и оборудования. Все это делает актуальным поиск, разработку и внедрение в широкую практику новых современных экспресс методов идентификации микобактерий.

В связи с этим, мы обратили внимание на принципиально новый перспективный экспрессный лазерно-флюоресцентный метод [1−12]. Он основан на регистрации и анализе собственной флюоресценции микроорганизмов, индуцированной лазерным излучением. Лазерно-флюоресцентный метод разработан отечественными авторами М. Т. Александровым, А. А. Воробьевым, Е. П. Пашковым и был удостоен в 2002 году Государственной премии Российской Федерации [1,21,48]. Однако до настоящего времени экспериментально-теоретическое обоснование лазерно-флюоресцентного метода, его методическое и технологическое обеспечение для индикации и идентификации М. tuberculosis complex и нетуберкулезных микобактерий не были разработаны.

Таким образом, проблема разработки современных экспрессных, чувствительных и специфичных методов идентификации микроорганизмов, доступных для широкого применения, остается на сегодняшний день весьма актуальной и востребованной, в первую очередь, для диагностики таких опасных инфекционных заболеваний, как туберкулез и микобактериоз.

Цель исследования.

Разработать принципы ускоренной идентификации различных видов микобактерий лазерно-флюоресцентным методом.

Задачи исследования.

1) Изучить лазерно-индуцированную аутофлюоресценцию микобактерий комплекса M. tuberculosis и нетуберкулезных микобактерий in vitro.

2) Создать базу данных спектрально-флюоресцентных характеристик микобактерий в различных концентрациях и ассоциациях.

3) Разработать принципы повышения эффективности идентификации микобактерий лазерно-флюоресцентным методом на основе использования детергента (мирамистин), учета оптических характеристик среды и факторного анализа их спектральных характеристик.

4) Разработать алгоритм экспресс-идентификации микобактерий лазерно-флюоресцентным методом в чистых и смешанных культурах.

5) Провести апробацию лазерно-флюоресцентного метода экспресс-идентификации микобактерий на неизвестных клинических штаммах и оценить его эффективность.

Научная новизна.

Проведено экспериментально-теоретическое обоснование применения лазерно-флюоресцентного метода для экспресс-идентификации разных видов микобактерий (М. tuberculosis complex и НТМБ). Впервые создана база данных спектрально-флюоресцентных характеристик 17 видов микобактерий в чистых культурах и их смесях, основанная на фундаментальном изучении их лазерно-индуцированной аутофлюоресценции.

На основании базы данных амплитудно-спектральных характеристик флюоресценции микобактерий впервые разработан ускоренный метод их идентификации в смешанных культурах.

Теоретически обосновано и экспериментально установлено, что для объективной и эффективной идентификации микобактерий необходимо повышение чувствительности существующего лазерно-флюоресцентного метода. Объективно обосновано применение для этих целей детергента (мирамистин), учета оптических характеристик среды и факторного анализа их спектральных характеристик.

Практическая значимость.

Проведенные экспериментально-теоретические и лабораторно-клинические научные исследования явились фундаментальным этапом разработки лазерно-флюоресцентного метода экспресс-идентификации микобактерий.

• Данная научно-исследовательская работа имеет важное значение в практической фтизиатрии, так как может позволить реализовать новый метод экспресс индикации и дифференциации возбудителей туберкулеза и микобактериозов с предварительным результатом уже через 1−2 часа и с окончательным через 1−2 суток по сравнению с классическим бактериологическим методом идентификации микобактерий (3−6 мес.).

Положения, выдвигаемые на защиту.

1. На основании экспериментальных исследований объективно обосновано применение метода лазерной флюоресценции для ускоренной идентификации M. tuberculosis complex и нетуберкулезных микобактерий в чистых и смешанных культурах.

2. Разработаны основные принципы повышения эффективности лазерно-флюоресцентного метода идентификации микобактерий на основе использования детергента (мирамистин), учета оптических характеристик среды и факторного анализа спектральных характеристик микобактерий.

3. Лазерно-флюоресцентный метод позволяет проводить индикацию и дифференциацию возбудителей туберкулеза и микобактериоза в клинических штаммах с эффективностью 80−90%.

Апробация работы и публикации.

Основные положения работы доложены на I Международной научно-практической конференции «Научно-техническое творчество молодежипуть к обществу, основанному на знаниях» 24−27 июня 2009 года, за участие в которой работа была награждена дипломом 1 степени и удостоена золотой медали.

Результаты работы были опубликованы и представлены в следующих журналах, конференциях и монографии:

1. M.T.Alexandrov, O.G.Gaponenko, M.A.Ivanova, V.A.Khomenko, G.P.Kuzmin, M.V.Makarova, E.P.Pashkov, G.M.Sorokoumova, E.N.Vasilev. Increasing Efficiency of Laser Fluorescence Diagnostics of Microbial Diseases // Laser Physics. — 2007. — Vol.17. — No. 12. — pp. 1416−1423.

2. M.T.Alexandrov, E.N.Vasilev, M.A.Ivanova, G.P.Kuzmin, M.V.Makarova. The increase of efficiency of differential laser fluorescence diagnostics of deceases of microbe origin // Abst. of International Conference on Laser Applications in Life Science, June 11−14, 2007: Conference program. -Moscow, 2007. — p.44.

3. Г. Л. Геворков, М. Т. Александров, В. Ф. Прикулс, М. А. Иванова, Д. А. Бочарова. Инновационные лазерные флюоресцентные биотехнологии и их применение для анализа жизнедеятельности микрофлоры полости рта// Стоматология для всех. — 2008. — № 4. — с.22−24.

4. М. Т. Александров, М. А. Иванова, Е. Васильев, В. А. Хоменко, О. Г. Гапоненко. Лазерно-флуоресцентная медицинская технология исследования спектральных характеристик различных микобактерий и ее клиническая апробация // «Лазерная клиническая биофотометрия» -М.: Техносфера, 2008. — с.460−477.

5. Иванова М. А. Экспресс-дифференциация живых и мертвых бактерий лазерно-флюоресцентным методом с использованием мирамистина / I Международная научно-практическая конференция «Научно-техническое творчество молодежи — путь к обществу, основанному на знаниях» 24−27 июня 2009 г.: Сб. научных докладов. — М.: МГСУ, 2009. -с.357−358.

6. М. А. Иванова, М. В. Макарова, Е. В. Васильев, М. Т. Александров, Е. П. Пашков. Ускоренная идентификация микобактерий с помощью лазерной флюоресценции//Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. — 2009. — № 3. — с. 81−85.

Объем и структура диссертации.

Диссертация изложена на 149 страницах машинописного текста, состоит из введения, обзора литературы, главы «Материалы и методы», 2-х глав с изложением результатов проведенных исследований, заключения, выводов, практических рекомендаций и списка цитируемой литературы. В диссертации представлено 22 таблицы и 45 рисунков.

Список литературы

включает 142 источника, из них 65 отечественных и 77 зарубежных авторов.

ВЫВОДЫ.

1. В условиях эксперимента in vitro впервые изучены особенности лазерно-индуцированной аутофлюоресценции 17 видов микобактерий, в том числе 2-х видов микобактерий комплекса M. tuberculosis и 15 нетуберкулезных микобактерий.

2. Создана база данных спектрально-флюоресцентных характеристик микобактерий в их различных концентрациях и ассоциациях.

3. Разработаны принципы повышения эффективности лазерно-флюоресцентной идентификации микобактерий на основе использования детергента (мирамистин), учета оптических характеристик среды и факторного анализа их спектральных характеристик.

4. Разработан экспресс-метод лазерно-флюоресцентной идентификации микобактерий, который позволяет получить предварительный результат по идентификации микобактерий в клинических штаммах через 1−2 ч и окончательный через 1−2 сут.

5. Разработана экспресс-технология выявления живых и мертвых бактерий на основе использования детергентной методики с применением раствора мирамистина (конечная концентрация в субстрате 0,3%), имеющая важное научное и прикладное значение.

6. Апробация экспресс-метода лазерно-флюоресцентной идентификации микобактерий на клинических штаммах показала его эффективность в 80−90%, что подтверждает разработанный алгоритм диагностики.

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ.

1. Разработанный экспресс-метод лазерно-флюоресцентной идентификации микобактерий может быть рекомендован для проведения своевременной диагностики туберкулеза и микобактериоза, назначения больным соответствующей химиотерапии, проведения мониторинга ее эффективности.

2. Разработанная новая медицинская технология лазерно-флюоресцентной идентификации микобактерий, как инновационная, рекомендуется использовать для обучения студентов, аспирантов при освоении новых методов в клинической микробиологии и их усовершенствовании.

3. Разработанная методика дифференциации живых и мертвых микобактерий на основе использования детергента (мирамистин) и лазерно-флюоресцентной диагностики позволит объективно определять активность патологического процесса и эффективность его лечения, проводить ускоренный скрининг вновь разрабатываемых противотуберкулезных препаратов.

Показать весь текст

Список литературы

  1. М. Лазерная клиническая биофотометрия (теория, эксперимент, практика). М.: Техносфера, 2008. — 584 с.
  2. М.Т., Васильев Е. Н., Лебедев А. В. 2007. и др. Многофакторный анализ в лазерной флуоресцентной диагностике // Радиотехника и электроника. 2007. — том 54. — № 4. — с.486−491.
  3. М.Т., Воробьев А. А. и др. Концепция применения метода флюоресценции для индикации анаэробов при бактериологической диагностике // Свидет-во на интеллект, продукт от ВНИТЦ № 70 990 000 120 от 27.08.1999.
  4. М.Т., Морозова О. А., Круглов А. Н. и др. Новый метод лазерной спектрофлюоресценции в диагностике дисбиоза кишечника у детей // Тез.докл.конф. «Актуальные проблемы абдоминальной патологии у детей». М., 2001. — с.99−100.
  5. М.Т., Морозова О. А., Пашков Е. П. Метод флюоресцентной диагностики метод индикации микрофлоры человека в норме и патологии // ЖМЭИ. — 2001. — № 3. — с.57−60.
  6. М.Т., Пашков Е. П., Бажанов Н. Н. и др. Методика лазерной флюоресцентной диагностики качества пищевых продуктов // Тез. докл. Международ.конф. «Фундаментальные и прикладные проблемы медицинской биотехнологии». М., 2001. -с.25−26.
  7. М.Т., Пашков Е. П., Морозова О. А. и др. Интегральныйпоказатель состояния микрофлоры кишечника, выявленный с помощью флюоресценции // Клиническая лабораторная диагностика. 1999. -№ 11.- с. 4.
  8. М.Т., Таубинский И. М., Козьма С. Ю. Применение флуоресцентной спектроскопии для экспресс-оценки состояния микрофлоры желудочно-кишечного тракта // Биомедицинская радиоэлектроника. 2000. — № 1.
  9. М.Т., Таубинский И. М., Козьма С. Ю. Способ для обнаружения и оценки концентраций анаэробных бактерий в биологическом субстрате // Патент РФ № 97 100 364 от 21.01.97.
  10. М.Т., Черкасов А. С. Способ определения состояния биологической ткани // Патент РФ № 2 121 289.
  11. А. А., Марьяндышев А. О. Применение методов молекулярной биологии для исследования микобактерий туберкулеза // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2008. -№ 4. — с.3−7.
  12. В.Я. Микробиологический синтез порфиринов. ВНИИСЭНТИ. 1985.
  13. Ю.К. Биология и изменчивость микобактерий туберкулеза и атипичные микобактерии. Экспериментальные и теоретические исследования. Будапешт: Акад. Наук Венгрии. -1975. — 334с.
  14. Т. Основы доказательной медицины: пер. с англ. / под ред. И. Н. Денисова, К. И. Сайткулова. 3-е изд. — М.: ГЭОТАР-Медиа, 2009.-288с.
  15. И.Р. Микобактерии // Клиническая лабораторная аналитика. Том IV. Частные аналитические технологии в клинической лаборатории / под ред. В. В. Меньшикова. М.: Агат-Мед, 2003. — С. 557−577.
  16. М.М. Сравнительное изучение и методы дифференциации туберкулезных микобактерий, атипичных штаммов и кислотоустойчивых сапрофитов // Дис.. док. мед. наук. М., 1963.
  17. Т. А. Лазерно-флюоресцентный метод определения чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам: Автореф. дис. канд. мед. наук. М., 2006. — 24 с.
  18. М.П., Ильина Т. Б. Потенциально-патогенные микобактерии и лабораторная диагностика микобактериозов. М.: Медицина. — 1978. — 134с.
  19. Т.Б. Бактериологическая и биохимическая идентификация микобактерий // методические рекомендации. М., 1975. — 21с.
  20. Е.П., Фролова О. П., Шинкарева И. Г. Проблема туберкулеза у больных ВИЧ-инфекцией в России // Туберкулез в России, Год 2007: материалы VIII Российского съезда фтизиатров. -М.: ООО «Идея», 2007. с.366−367.
  21. Лабораторная диагностика туберкулеза / Под ред. В. И. Литвинова, А. М. Морозова. М.: МНПЦБТ, 2001. — 184с.
  22. Л.В., Салецкий A.M. Люминесценция и ее измерения. М.: МГУ. — 1985. — 279с.
  23. В.И., Макарова М. В., Краснова М. А. Нетуберкулезные микобактерии. М.: МНПЦБТ, 2008. — 256 с.
  24. М. Э. Совершенствование методов лечения микобактериозов в связи с лекарственной устойчивостью нетуберкулезных микобактерий // Актуальные вопросы лабораторной диагностики туберкулеза в эксперименте и клинике. -1989.- с. 39−44.
  25. Н.М. Атипичные микобактерии: методы идентификации, источники выделения, значение в клинике // Дис.. док.мед.наук. М., 1973.
  26. Н.М., Рудой Н. М., Лотоцкая Р. А. и др. Диагностика заболеваний легких, вызванных нетуберкулезными микобактериями // 10-й Всесоэзн. съезд фтизиатров: тез. докл. Киев. — 1986. — с.85.
  27. В.В. Анализ по месту лечения. М.: Юнимед-Пресс, 2003. — 160 с.
  28. Мирамистин: применение в хирургии, травматологии и комбустиологии: Сб. трудов / Под ред. Ю. С. Кривошеина. М.: ООО «Типогр. «Мастер печати», 2006. — 106 с.
  29. Мирамистин: Сб. трудов / Под ред. Ю. С. Кривошеина. М.: ООО «Мед. Информ. Агенство», 2004. — 156 с.
  30. Ю.В., Скачкова Е. И., Матинян Н. С. и др. Национальная стратегия борьбы с туберкулезом в России // Пробл. соц. гигиены, здравоохр. и истории медицины. 2009. — № 4. — с.33−35.
  31. В.Ю. Туберкулез у ВИЧ-инфицированных больных Электронный ресурс. // Consilium Medicum, том 10. 2008. — № 10 -Доступ: http://tbpolicy.ru/publications/7icH79, свободный.
  32. A.M. Лабораторная диагностика туберкулеза: реальность и перспективы // Туберкулез сегодня: проблемы и перспективы. Научные труды и материалы конференции, посвященный памяти М. М. Авербаха (к 75-летию со дня рождения). М., 2000. — 229с.
  33. О.А. Экспериментальное обоснование экспресс метода лазерной флюоресцентной диагностики заболеваний микробной природы: автореф. Дис.. канд. мед. наук. М., 2001. — 25 с.
  34. Я., Новакова О., Кунц К. Современная биохимия в схемах. -М.: Мир. 1984. -с.88−101.
  35. Научные труды (к 80-летию ведущего противотуберкулезного учреждения г. Москвы, 10-летию МНПЦБТ). Сб. трудов / Под ред. В. И. Литвинова. М.: Изд. «Медицина и жизнь», 2007. — 248с.
  36. Т.Ф. Микобактериоз легких: клинико-бактериологические критерии диагностики // БЦЖ. 1999. — № 5. — с.32−35.
  37. Т.Ф. Особенности бактериологической диагностики и этиотропной терапии микобактериоза легких // Автореф.дис.. д-ра мед. наук. СПб. — 1994. — 41с.
  38. Т.Ф. Характеристика нетуберкулезных микобактерий -потенциальных возбудителей заболеваний человека // Пробл.туб. -1994. № 3. — с.56−59.
  39. Т.Ф., Васильев А. В. Микобактериоз. СПб.: Медицинская пресса, 2005. — 224 с.
  40. Т.Ф., Макроусов И. В., Нарвская О. В. и др. Возможности и перспективы бактериологической диагностики микобактериоза // Пробл.туб. и болезней легких. 2004. — № 5. — с. 17−19.
  41. К.И., Маслаускене Т. Г. Летальность больных с ВИЧ/СПИД ассоциированным туберкулезом // Туберкулез в России. Год 2007: материалы VIII Российского съезда фтизиатров. М.: ООО «Идея», 2007.-с.382.
  42. Е.П. Лазерно-флюоресцентный метод экспресс-индикации микроорганизмов при гнойно-воспалительных заболеваниях, дисбактериозах и другой патологии микробной этиологии: автореф. дис. в виде науч. докл.. д-ра мед. наук. М., 2002. — 84с.
  43. М.И. Туберкулез сегодня. Материалы VII Российского съезда фтизиатров. М.: Изд.Бином. — 2003. — 352с.
  44. Порфирины: структура, свойства, синтез / Под ред. Н. С. Ениколопяна. М.: Наука. — 1985. — 333с.
  45. А.П., Тучин В. В. Лазерная диагностика в биологии и медицине. М.:Наука. — 1989.
  46. Приказ МЗ РФ от 21 марта 2003 г № 109 «О совершенствовании противотуберкулезных мероприятий в РФ» // Пробл. туб. 2004. -№ 4.-С. 31−61.
  47. Развитие мультирезистентных форм туберкулеза и влияние ВИЧ-инфекции на ситуацию по туберкулезу Электронный ресурс.: Ресурсный Центр по изучению политики в сфере туберкулеза. -Доступ: http://tbpolicy.ru/topics/?id=16&page=, свободный
  48. М.Ю. Автоматизация микробиологических исследований // Лабораторная медицина. — 2003. № 6. — с.62−70.
  49. О.И., Носова Е. А., Галкина К. Ю. и др. Современные технологии определения вида микобактерий и чувствительности
  50. M.tuberculosis к лекарственным препаратам // Туберкулез в России, Год 2007: материалы VIII Российского съезда фтизиатров. М.: ООО «Идея», 2007. — с.127−128.
  51. Туберкулез в Российской Федерации 2007 г. Аналитический обзор основных статистических показателей по туберкулезу, используемых в РФ / Под ред. М. И. Перельмана, Ю. В. Михайловой. -М., 2008.
  52. Туберкулез. Патогенез, защита, контроль: Пер. с англ. / Под ред. Барри Р.Блума. М.: Медицина, 2002. — 696 с.
  53. В.В. Лазеры и волоконная оптика в биомедицинских исследованиях. Саратов: Изд-во Сарат. ун-та. — 1998. — 350с.
  54. Фтизиатрия: национальное руководство / Под ред. М. И. Перельмана. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2007. — 512 с. — (Серия «Национальные руководства»).
  55. Э.Б. Эпидемиологические индикаторы туберкулеза // Актуальные вопросы диагностики и лечения туберкулеза (Научные труды Всероссийской научно-практ. конф. / Под ред.
  56. Ю.Н.Левашева. СПб., 2006. — с. 321−323.
  57. М.В. Туберкулез в России в 2007 году: монография. М., 2008. — 152с.
  58. С. Флуоресцентный анализ в биологии и медицине. -М.: Мир. 1965. -483с.
  59. Adle-Biassette H., Huerre M., Breton G. et al. Nontuberculous mycobacterial diseases // Ann. Pathol. 2003. — v.23. — p.216−235.
  60. Alexandrov M.T., Kuzmin G.P., Gaponenko O.G. et al. Laser fluorescence spectroscopy and factor analysis in diagnostics of microbial diseases // Laser physics. 2007. — v.17. — № 3. — p.290−295.
  61. Arend S.M., van Soolingen D., Ottenhoff Т.Н. Diagnosis and treatment of lung infection with nontuberculous mycobacteria//Curr. Opin. Pulm. Med. 2009. — v.15. — p.201−208.
  62. Bang D., Herlin Т., Stegger M. et al. Mycobacterium arosiense sp. nov., a slowly growing, scotochromogenic species causing osteomyelitis in an immunocompromised child // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2008. — v.58. — p.2398−2402.
  63. Barclay R., Ewing D.E., Ratledge C. Isolaton, identification and structural analysis of the mycobactins of Mycobacterium avium, M. intracellulare, M. scrofulaceum, and M. paratuberculosis // J. Bacteriol. -1985.-v.164. p.896−905.
  64. Barclay R., Ratledge C. Iron-binding compounds of Mycobacterium avium, M. intracellulare, M. scrofulaceum, and mycobactin-dependent M. paratuberculosis and M. avium // J. Bacteriol. 1983. — v. 153. -p.l 138−1146.
  65. Barclay R., Ratledge C. Mycobactins and exochelins of Mycobacterium tuberculosis, M. bovis, M. africanum and other related strains // J. Gen. Microbiol. 1988. — v.134. — p.771−776.
  66. Barclay R., Wheeler P.R. Metabolism of mycobacteria in tissues // In C. Ratledge, J. Stanford, and J. M. Grande (ed.) / The Biology of the Mycobacteria. Academic Press, London. — 1989. — v.3. — p.37−196.
  67. Bonard D., Messou E., Seyler C. et al. High incidence of atypical mycobacteriosis in African HIV-infected adults with low CD4 cell counts: a 6-year cohort study in cote d’lvoire // AIDS.-2004.-v. 18.-p.1961−1964.
  68. Butler W., Guthertz L. Mycolic acid analysis by high-performance liquid chromatography for identification of Mycobacterium spesies//Clin.Microbiol.Rev.-2001.-v.l4.-p.704−726
  69. Cattior V. Molecular identification of mycobacteria and detection ofantibiotic resistance//Ann. Biol. Clin. (Paris). 2004. — v.62. — p.405−413.
  70. Cloud J., Neal H., Rosenberry R. et al. Identification of mycobacterium ssp. by using a commercial 16S ribosomal DNA sequencing kit and additional sequencing libraries//J.Clin. Microbiol.-2002.-v.40.-p.400−406
  71. Cloud J.L., Meyer J.J., Pounder J.I. et al. Mycobacterium arupense sp. nov., a non-chromogenic bacterium isolated from clinical specimens // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006. — v.56. — p.1413−1418.
  72. Correa A.G., Starke J.R. Nontuberculous mycobacterial disease in children//Semin. Respir. Infect. 1996. — v. l 1. — p.262−271.
  73. Corti M., Palmero D. Mycobacterium avium complex infection in HIV/AIDS patients // Expert. Rev. Anti. Infect. Ther. 2008. — v.6. -p.351−63.
  74. Da vidson P.T. The diagnosis and and managent of disease caused by M. avium complex, M. kansasii and other mycobacteria // Clin. Chest Med. 1989.-v.l0,№ 3.-p.431−443.
  75. Dandapat P., Verma R., Venkatesan K. et al. Rapid detection of Mycobacterium bovis on its lipit profile by thin-layer chromatography//Vet.Mikrobiol.-l 999.-v.65.-p. 145−151.
  76. Dobiuk-Gad R., Dyachenko P., Ziv M. et al. Nontuberculous mycobacterial infections of the skin: A retrospective study of 25 cases//J. Am. Acad. Dermatol. 2007. — v.57. — p.413−420.
  77. Dominguez J., Blanco S., Lacoma A. et al. Utility of molecular biology in the microbiological diagnosis of mycobacterial infections // Enferm. Infecc. Microbiol. Clin. 2008. — v.26. — p.33−41.
  78. Dorronsoro I., Torroba L. Microbiology of tuberculosis//An. Sist. Sanit. Navar. 2007. — v.30. — p.67−85.
  79. El Amin N., Hanson H., Petterson B. et al. Idenfication of nontuberculous mycobacteria: 16S rRNA gene sequence analysis vs. conventional methods // Scand. J. Infect. Dis.-2000.-v.32.-p.47−50
  80. Etemadi A., Convit J., Mycolic acids from «noncultivable» mycobacteria//Infect.Immunity.-l 974.-V. 10.-p.236−239
  81. Euzeby J.P. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature -Genus Mycobacterium Электронный ресурс. 2009 Доступ: Ьйр://^^т.Ьас1епо.с1с1.&/т/тусоЬас1егшт.Мт1, свободный.
  82. Field S.K., Cowie R.L. Lung disease due to the more common nontuberculous mycobacteria//Chest. 2006. — v.129. — p.1653−1672.
  83. Floyd M., Silcox V., Jones W. et al. Separation of Mycobacterium bovis BCG from Mycobacterium tuberculosis and Mycobacterium bovis by using high-performance liquid chromatography of mycolic acids//J.Clin.Microbiol.l992.-v.30.-p. 1327−1330.
  84. Fujita J., Hibiya K., Haranaga S. et al. Overview of respiratory infection caused by nontuberculous mycobacteria/ZKekkaku. 2007. — v.82. -p.721−727.
  85. Glassroth J. Pulmonary disease due to nontuberculous mycobacteria//Chest. 2008. — 133(1). — p.243−251.
  86. Global tuberculosis control: epidemiology, strategy, financing Электронный ресурс. WHO report. Geneva, WHO. — 2009. -Доступ: http://www.who.int/tb/publications/en/.
  87. Griffith D.E., Aksamit Т., Brown-Elliott B.A. et al. An official ATS/IDSA statement: Diagnosis, treatment, and prevention of nontuberculous mycobacterial diseases/Mm. J. Respir. Crit. Care Med. -2007.-v.175. -p.367−416.
  88. Guerrant G., Lambert M., Moss C. Gas-chromatographic analysis of mycolic acidcleavage products in mycobacteria// J.Clin. Mikrobiol.-1981.-v.l3-p.899−907
  89. Hall R.M., Ratledge C. Mycobactins as chemotaxonomic characters for some rapidly growing mycobacteria // J. Gen. Microbiol. 1984. — v. 130. — p.1883−1893.
  90. Hawkins C., Cold W., Whimbey E. et al. M. avium complex infections in patient with acquired immunodeficiency syndrome // Ann. Intern. Med. -1986.-v.105.-p.184−188.
  91. Heifets L. Mycobacterial infections caused by nontuberculous mycobacteria // Semin. in Respir. Crin. Care Med. 2004. — v.25. — p.283−295.
  92. Heifets L., Jenkins P. Speciation of mycobacteria in clinical laboratories // In: Gangadharam P.R. Jenkins P.A. Mycobacteria. Vol. I. Basic aspects. New York: Chapman a Hall (Inf.Thompson Publishing). 1998. -p.308−350.
  93. Holland S.M. Nontuberculous mycobacteria//Am. J. Med. Sci. 2001. -v.32. — p.49−55.
  94. Horsburg C.R. Epidemiology of disease caused by nontuberculous mycobacteria//Semin. Respir. Infect. 1996. — v. l 1. — p.244−251.
  95. Horsburgh CR.Jr., Gettings J., Alexander L.N. et al. Disseminated Mycobacterium avium complex disease among patients infected with human immunodeficiency virus, 1985−2000 // Clin. Infect. Dis. 2001. -v.33. — p.1938−1943.
  96. Huard R., de Oliveira Lazzarini L., Butler W. et al. PCR-based method to differentiate the subspecies of the Mycobacterium tuberculosis complex on the basis of genomic deletions//.!.Clin. Mycrobiol.-2003.-v.41.-p.1637−1650
  97. Jarzembowski J.A., Young M.B. Nontuberculous mycobacterial infections//Arch. Pathol. Lab. Med. 2008. — v.132. — p.1333−1341.
  98. Johnson M.M., Waller E.A., Leventhal J.P. Nontuberculous mycobacterial pulmonary disease//Curr. Opin. Pulm. Med. 2008. — v. 14. — p.203−210.
  99. Karakousis PC., Moore RD., Chaisson RE. Mycobacterium avium complex in patients with HIV infection in the era of highly active antiretroviral therapy // Lancet Infect Dis. 2004. — v.4. — p.557−565.
  100. Katalinic-Jankovic V., Grle S.P., Obrovae M. et al. Infections due to nontuberculous mycobacteria//Lijec. Vjesn. 2007. — v. 129. — p.146−151.
  101. Katoch V.M. Infections due to nontuberculous mycobacteria (NTM) // Indian J. Med. Res. 2004. — v. 120. — p.290−304.
  102. Koh W-J., Kwon O.J., Lee K.S. Diagnosis and treatment of nontuberculous mycobacterial pulmonary diseases: a Korean perspective//.!. Korean Med. Sci. 2005. — v.20. — p.913−925.
  103. Lakowicz J.R. Fluorescence Spectroscopy. Wiley. 1982.
  104. Leite C., da Silva Rocha A., de Andrade Leite S. et 1. A comparison of mycolic acid analysis for nontuberculous mycobacteria identification by thin-layer chromatography and molecular methods// Microbiol. Immunol.-2005.-v.49.-p.571−578.
  105. Liu Z., Cai X., Zhu P. et al. Study on species identification of mycobacteria by gas chromatography analysis of whole-cell fattyacid//Zhondghua Jie He He Hu Xi Za Zhi.-2005.-v.28.-p.403−406.
  106. Lu D., Heeren В., Dunne M. Comparison of the Automated Mycobacteria Growth Indicator Tube System (ВАСТЕС 960/MGIT) With Lowenstein-Jensen Medium for Recovery of Mycobacteria from clinical specimens // Am.J.Clim.Pathol. 2002. — v. 118. — p.542−545.
  107. Macham L. P., Ratledge C. A new group of water-soluble iron-binding compounds from mycobacteria: the exochelins // J.Gen. Microbiol. -1975. -v.89. p.379−382.
  108. Macham L. P., Ratledge C., Nocton J.C. Extracellur iron acquisition by mycobactria: role of the exochelins and evidence against the participation of mobactin // Infect. Immun. 1975. — v. 12. — p. 1242−1251.
  109. Macham L. P., Stephenson M.C., Ratledge C. Iron transport in Mycobacterium smegmatis: the isolation, purification and function of exochelin MS //J.Gen.Microbiol. 1977. — v.101 — p.41−49.
  110. Mahaisavariya P., Chaiprasert A., Khemngern S. et al. Nontuberculous mycobacterial skin infections: clinical and bacteriological studies//J. Med. Assoc. Thai. 2003. — v.86. — p.52−60.
  111. Marras Т., Daley C. Epidemiology of human pulmonary infection with nontuberculous mycobacteria//Clin. Chest Med.-2002.-v.23.-p.553−567
  112. Martens H., Naes T. Multivariative Calibration. Wiley. 1998.
  113. Masakazu A. Present situation of tuberculosis and atypical mycobacteriosis in Japan // Asian. Med.J.-1998.-v.41-p. 197−202
  114. Matos E.D., Santana M.A., Santana M.C. et. al. Nontuberculosis mycobacteria at a multiresistant tuberculosis reference center in Bahia: clinical epidemiological aspects // Braz. J. of Infect. Dis. v.8. — 2004.
  115. Murcia M.I., Tortoli E., Menendez M.C. et al. Mycobacterium colombiense sp. nov., a novel member of the Mycobacterium avium complex and description of MAC-X as a new ITS genetic variant // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006. — v.56. — p.2049−2054.
  116. Natural history of disseminated M. avium complex infection in AIDS // J.1.fect. Dis. 1991. — v. 164. — p.994−998.
  117. O’Brien D.P., Currie В J., Krause V.L. Nontuberculous mycobacterial disease in Northern Australia: a case series and review of the literature//Clin. Infect. Dis. 2000. — v.31. — p.958−967.
  118. Parrish S.C., Myers J., Lazarus A. Nontuberculous mycobacterial pulmonary infections in non-HIV patients/ZPostgrad. Med. 2008. -v. 120. — p.78−86.
  119. Patel J., Leonard D, Pan X. et.al. Sequence-based identification of Mycobacterium species using the MicroSeq 500 16S rDNA bacterial identification system // J Clin Microbiol. 2000. — V.38. — p.246−251.
  120. Reed C., von Reyn CF., Chamblee S. et al. Environmental risk factors for infection with Mycobacterium avium complex // Am. J. Epidemiol. -2006. v.164. -p.32−40.
  121. Schluger N.W. Tuberculosis and nontuberculous mycobacterial infections in older adults//Clin. Chest Med. 2007. — v.28(4). — p.773−781.
  122. Shrestra N.K. Rapid diagnosis testing for mycobacterial infections//Future Microbiol. 2007. — v.2. — p.397−408.
  123. Stephenson M. C., Ratlenge C. Specificity of exochelins for iron transport in three species of mycobacteria // J.Gen. Microbiol. 1980. -v.116. — p.521−523.
  124. Stout J.E. Evaluation and management of patients with pulmonary nontuberculous mycobacterial infections/ZExpert Rev. Anti. Infect. Ther. 2006. — v.4. — p.981−993.
  125. Supplement: American Thoracic Society Diagnosis and treatment of disease caused by nontuberculosis mycobacteria // Am. J. Respir. Crit. Care Med. — 1997. — v.156. — N.2. — p.25.
  126. Tomioka H. Bacteriology of mycobacteria: taxonomic and morphological characteristics//Nippon. Rinsho. 1998. — v.56. — p.3001−3007.
  127. Wong D., Yip P., Cheung D. et al. Simple and rational approach to the identification of M. tuberculosis, MAC and other commonly isolated mycobacteria // J. Clin. Microbiol. 2001. — v.39. — p.3768−3771.
  128. Woods G.L., Washington J.A. Mycobacteria other than Mycobacterium tuberculosis: review of microbiologic and clinical aspects // Rev. infect. Dis. 1987. — v.9. -p.275−294.
Заполнить форму текущей работой