Разработка мультилокусной системы генетического анализа крупного рогатого скота по микросателлитам и ее использование для характеристики аллелофонда черно-пестрого скота
Диссертация
Следует отметить, что проведение исследований крупного рогатого скота России по микросателлитам сдерживается отсутствием доступных по цене наборов для одновременного исследования нескольких локусов. Существующие мультилокусные наборы для крупного рогатого скота предлагаются на Российском рынке только компанией Applied Biosystems (США), и вследствие высокой стоимости (более 300 руб… Читать ещё >
Содержание
- СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
- 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
- 1. 1. Определение и свойства микросателлитов
- 1. 1. 1. Сателлитные ДНК
- 1. 1. 2. Определение микросателлитов
- 1. 1. 3. Происхождение микросателлитов
- 1. 1. 4. Области применения микросателлитов
- 1. 2. Методы анализа микросателлитов
- 1. 2. 1. Проблемы и ограничения использования МС
- 1. 2. 2. Выбор микросателлитных локусов
- 1. 2. 3. Связь МС с признаками продуктивности
- 1. 3. Микросателлиты крупного рогатого скота
- 1. 1. Определение и свойства микросателлитов
Список литературы
- Бакай A.B., И.И. Кочиш, Г. Г. Скриппиченко. Генетика. М.: КолосС, 2006. 448 с.
- Вартапетян А.Б. ПЦР // Молекулярная биология. 1991. Том 25. № 4. с. 926−936.
- Вейр Б. Анализ генетических данных. М.: Мир, 1995. 400 с. Пер. с англ. Д. В. Зайкина, к.б.н. А. И. Пудовкина, А. Н. Татаренкова.
- Генетика и биотехнология в селекции животных / П.М. Кленовиц-кий, Н. С. Марзанов, В. А. Багиров и др. М.: ФГУП «Эксплор», 2004. 285 с.
- Гладырь Е.А. Анализ овец с использованием ДНК-микросателлитов // Методы исследований в биотехнологии сельскохозяйственных животных: школа-практикум. Дубровицы. 2003. Вып 2. с. 12−21.
- Гладырь Е.А., Зиновьева H.A., Брем Г. Характеристика генофонда и выявление генеалогических связей между породами овец России с использованием ДНК-микросателлитов // Доклады Российской академии сельскохозяйственных наук. 2004. № 2. с. 26−29.
- Глазко В.И., Дунин И. М., Глазко Г. В. и др. Введение в ДНК-технологии. М.: ФГНУ «Росинформагротех», 2001. 436 с.
- Глазко В.И., Глазко Г. В. ДНК-технологии в популяционно-генетических исследованиях сельскохозяйственных видов // Актуальныепроблемы биологии в животноводстве. Боровск. 2000. с. 387−389. (Сб. третьей международной конференции).
- Глазко В.И. ДНК-технологии животных. К.: Нора -Принт, 1997.173с.
- Жебровский Л.С. Селекция животных. СПб.: Издательство «Лань», 2002. 256 с.
- Животовский Л.А. Микросателлитная изменчивость в популяциях человека и методы ее изучения // Вестник ВОГиС. 2006. Том 10. № 1. 96 с.
- Животовский Л.А. Популяционная биометрия. М.: Наука, 1991.271 с.
- Зайцева М.А. Использование микросателлитных маркеров ДНК в контроле происхождения лошадей // Режим доступа (http://www. ruhorses. ru / genetic /articles, html 78 k).
- Зиновьева H.A., Попов А. П., Эрнст Л. К. и др. Методические рекомендации по использованию метода полимеразной цепной реакции в животноводстве. Дубровицы: ВИЖ, 1998. 47 с.
- Зиновьева H.A., Гладырь Е. А., Эрнст Л. К. и др. Введение в молекулярную генную диагностику сельскохозяйственных животных. Дубровицы, ВИЖ, 2002. 112 с.
- Зиновьева H.A., Эрист Л. К. Проблемы биотехнологии и селекции сельскохозяйственных животных. Дубровицы, ВИЖ, 2004. 316 с.
- Зиновьева H.A. Методы исследований в биотехнологии сельскохозяйственных животных // Методы исследований в биотехнологии сельскохозяйственных животных: школа-практикум. Дубровицы. 2003, Вып 2. с. 53−59.
- Зиновьева H.A. Введение в ДНК-диагностику // Методы исследований в биотехнологии сельскохозяйственных животных: школа-практикум. Дубровицы. 2005. Вып 4. С.38−41.
- Зиновьева H.A. и др. Генетическая характеристика свиней пород крупная белая и йоркшир различного происхождения с использованием ДНК-маркеров //Доклады РАСХН. 2008. № 2. с. 33−36.
- Калашникова Л.А., Дупин И. М., Глазко В. И. Селекция XXI века: использование ДНК-технологий. Московская обл, Лесные Поляны, ВНИИп-лем, 2000. 31 с.
- Калашникова Л.А., Дунин И. М., Глазко В. И. и др. ДНК технологии оценки сельскохозяйственных животных. ВНИИплем, 1999. 148 с.
- Кленовицкий П.М., Марзанов Н. С., Багиров В. А. и др. Генетика и биотехнология в селекции животных. М.: ФГУП «Эксплор», 2004. 285 с.
- Кленовицкий П.М., Багиров В. А., Иванов В. А. и др. Современные проблемы зоотехнии. Дубровицы, 2005. 116 с.
- Коновалова E.H., Сельцов В. И., Зиновьева H.A. Характеристика симментальского скота различного происхождения с использованием ДНК-микросателлитов // Зоотехния. № 4. 2006. с. 6−9.
- Красота В.Ф., Лобанов В. Т., Джапаридзе Т. Г. Разведение сельскохозяйственных животных. М.: Агропромиздат, 1990. 463 с.
- Марзанов Н.С., Насибов М. Г., Озеров М. Ю. и др. Аллелофонд у различных пород овец по микросателлитам. Дубровицы, 2004. 120 с.
- Марзанов Н.С., Озеров М. Ю., Насибов М. Г. и др. Микросателлиты и их использование для оценки генетического разнообразия животных // Сельскохозяйственная биология. 2004. № 2. с. 104−111 с.
- Марзанов Н.С., Саморуков Ю. В., Ескин Г. В. и др. Сохранение биоразнообразия. Генетические маркеры и селекция животных // Сельскохозяйственная биология. 2006. № 4. с. 3−19 с.
- Марзанов Н.С., Саморуков Ю. В., Ескин Г. В. Генетические исследования животных в России и за рубежом // Мат. Междунар. науч.-практич. семинара. Быково. 2005. с. 6−10.
- Машуров A.M. Генетические маркеры в селекции животных. М.: Наука, 1980. 315 с.
- Меркурьева, Е. К. Биометрия в селекции и генетике животных. М.: Колос, 1970. 424 с.
- Молочное скотоводство России (в рамках национального проекта «Развитие агропромышленного комплекса России»). / Н. И. Стрекозов и др. М., 2006. 604 с.
- Никитина Т.В., Назаренко С. А. Микросателлитные последовательности ДНК: мутационный процесс и эволюция // Генетика. 2004. т. 40. с. 1301−1318.
- Новиков A.A., Романепко Н. И. Генетическая экспертиза племенного материала // Зоотехния. 2001. № 7. с. 14−18.
- Новиков A.A., Романенко НИ., Ананин В. Н. и др. Использование генетических маркеров для контроля направленности селекционных процессов. Киев: Нора принт, 1999. с. 109. (Тезисы докладов третьей международной конференции).
- Озеров М.Ю., Марзанов Н. С., Насибов М. Г. и др. Генетический профиль у различных пород овец по микросателлитам // Вестник РАСХН. 2003. № 5. с. 72−75.
- Озеров М.Ю., Тапио М., Марзанов Н. С. и др. Микросателлитный анализ эволюционно-генетических связей у различных пород овец // Доклады Российской академии сельскохозяйственных наук. 2006. № 2. с. 30−33.
- Петухов В.Л., Эрнст Л. К., Гудилин И. И. и др. Генетические основы селекции животных. М.:Агропромиздат, 1989. 448 с.
- Рузыбакиев P.M., Юлдашева Н.Ю // Журнал теоретической и клинической медицины. 2000. № 1.
- Савенко H.A. Племенная работа в животноводстве Московской области. М.: МСХиП МО, 2006. 84 с.
- Сердюк Г. Н. Иммуногенетика свиней: теория и практика. Спб, Лекс-Стар, 2002. 390 с.
- Сулимова Г. Е., Зинченко В. В. Анализ полиморфизма ДНК с использованием метода полимеразной цепной реакции // Мет. пос. Москва. 1999. с. 43.
- Храброва JI.A. Маркер-вспомогательная селекция в коневодстве // ВНИИ коневодства. 2002. с. 1−4. Режим доступа: (http://www.ruhorses.ru).
- Шибата Д.К. ПЦР и молекулярно-генетический анализ био-птатов. М.: Мир, 1999. 530 с.
- Эйдригевич Е.В., Раевская В.В Интерьер сельскохозяйственных животных. М., Колос, 1978. 88 с.
- Эрнст JI.K., Брем Г., Зиновьева Н. А. Генно-инженерные технологии новый путь развития животноводства // Зоотехния. 1994. № 5. с. 2−4.
- Alford R.B., Hammond Н.А. Rapid and efficient resolution of parentage by amplification of short tandem repeats // Am. J. Hum Genet, 1994. Vol. 55. P. 190- 195.
- Amos, W., S. J. Sawcer, R. W. Feakes microsatellites show mutational bias and heterozygote instability//Nat. Genet. 1996. Vol. 13. P. 390−391.
- Arranz J.J., Bayon Y., San Primitivo F. // Anim. Genet. 1998. Vol. 29(6). P. 435−440.
- Ashley C.T., Warren S.T. Trinucleotide repeat expansion and human disease // Annu. Rev. Genet, expansion. 1995. Vol. 29. P. 703 728.
- Bailey E., Reid R.C., Skow L.C. Linkage of the gene for equine combined immunodeficiency disease to microsatellite markers HTG8 and HTG4- Syn-teny and FISH mapping to ECA9 // Animal Genetics. 1997. Vol. 28. P. 268−273
- Ball A.O. and Chapman R.W. Population genetic analysis of white shrimp, Litopenaeus setiferus, using microsatellite genetic markers // Mol. Ecol. 2003. Vol. 12. P. 2319−2330.
- Balloux F. The estimation of population of population differentiation with microsatellite markers // J. Molec. Ecol., 2002. Vol. 11. P. 155−165.
- Balloux F. and Lugon-Moulin N. The estimation of population differentiation with microsatellite markers//Mol. Ecol. 2002. Vol. 11. P. 155−165.
- Barendse W., Armitage S. M., Kossarek L. A genetic linkage map of the bovine genome // Nature Genetics. 1994. Vol. 6. P. 227−234.
- Barton N.H. Genetic hitchhiking. Philos. Trans. R. Soc. Lond. B // Biol. Sci. 2000. Vol. 355. P. 1553−1562.
- Baumung R., Simianer H., Hoffmann I. Genetic diversity studies in farm animals a survey//J. Anim. Breed. Genet. 2004. Vol. 121. P. 361−373.
- Beamount M. and Bruford M. Microsatellites in conservation genetics.1.: Microsatellites Application and evolution. Oxford: Oxford University Press., i1999. P. 165−180.
- Beja-Perera A., Alexandrino P., Bessa I. Genetics characterization of south-western Europian bovine breeds: a historical and biogeographical reassessment with a set 16 microsatellites // J. Hered. 2003. Vol. 94. P. 243−250.
- Beridse T. Satellite DNA. Berlin: Springer Verlag., Heidelberg, 1986.302 p.
- Bishop M.D., Kappes S.M., Keele J.W. A genetic linkage map for cattle//Genetics. 1994. Vol. 136. P. 619−639.
- Bostock C. Phil. Trans. // Roy. Soc. Lond .B. 1986. Vol. 312. P. 261 273.
- Brookfield J.F.Y. A simple new method for estimating null allele frequency from heterozygote deficiency // Mol. Ecol. 1996. Vol. 5. P. 453−455.
- Brown, S.M. and Kresovich S. Molecular characterization for plantgenetic resources conservation in Genome Mapping in Plants. RG Landes Company, Georgetown, TX, 1996. P. 85−93.
- Brownstein, M.J., Carptren, J.D. and Smith, J.R. Modulation of non-templated nucleotide addition by Taq DNA-Polymerase: Primer modifications that facilitate genotyping// Biotechniques. 1996. Vol. 20. P. 1004−1010.
- Bruford M.W., Waine R.K. Microsatellites and their application to population genetic studies I I Curr. Opin. Develop. 1993. Vol. 3. P. 939−943
- Buchanan F.C., Adams L.J., Littlejohn R.P. // Genomics. 1994. Vol. 22(2). P. 397−403.
- Buitkamp J., Filmether P., Stear M. J. Class I and class II major histocompatibility complex alleles are associated with faecal egg counts following natural, predominantly Ostertagia circumcincta infection // Parasitol. Res. 1996. Vol. 82. P. 693−696.
- Callen D.F., Thompson A.D., Shen Y. Incidence and origin of «null» alleles in the (AC)n microsatellite markers //Am. J. Hum. Genet. 1993. Vol. 52. P. 922−927.
- Canon J., Checa M.L., Carleos C. // Anim. Genet. 2000. Vol. 31(1). 3948 p.
- Chakraborty R., De Andrade M., Daiger S.P. Apparent heterozygote deficiencies observed in DNA typing data and their implications in forensic applications // Ann. Hum. Genet. 1992. Vol. 56 (Pt 1). P. 45−57.
- Coppieters W., Van de Weghe A. Characterization of porcine polymorphic loci // J. Animal Genetics. 1993. Vol. 24. P. 163−170.
- Cornuet J.M., Piry S., Luikart G. New methods employing multilocus genotypes to select or exclude populations as origins of individuals // Genetics.1999. Vol. 153(4). P. 1989−2000.
- Crawford A.M., Cuthbertson R.P. Mutation in sheep microsatellites // Genom Research. 1996. Vol. 6. P. 876−879.
- Cawford A.M., Dodds K.G. Ede An autosomal genetic linkage map of the sheep genome // Genetics. 1995. Vol. 140. P. 703−724.
- Crooijmans R.P.M.A., Van der Poel J.J., Groenen M.A.M. Functional genes mapped on the chicken genome // Anim. Genet. 1995. Vol. 26. P. 73−78.
- DeWoody, J. A., and J. C. Avise. Microsatellite variation in marine, freshwater and anadromous fishes compared with other animals // J. Fish Biol.2000. Vol. 56. P. 461−473.
- Dib C., Faure S., Fisanes C. //Nature. 1996. Vol. 380. P. 152−154.
- Diehl S.R., Ziegle J., Buck G.A. // Amer. J. Hum. Genet. 1990. Vol. 47. P. A177.
- Diez-Tascon C., Dodds K.G., Krawford A.M. // Anim. Genet. 2000. Vol. 33(3). P. 229−230.
- Dimsoski P., Hines H.C., Irvin K.M. Microsatellite variation in yorkshire and large white pigs // J. Anim Sci. 1996. P. 343−345.
- Di Rienzo A., Peterson A.C., Garza J.C. Mutational processes of simple-sequence repeat loci in human populations // Proc. Am. Soc. Anim. Sci. 1994. Vol. 91. P. 3266−3179.
- Dodgson J.B., Cheng H.H., Okimoto R. DNA Marker Technology: A Revolution in Animal Genetics // Poultry Science. 1997. Vol. 76, no. 8. P. 11 081 114.
- Dover G.A. Molecular drive a cohesive mode of species evolution //Nature. 1982. Vol. 299. P. 111−117.
- Ede A.J. and Crawford A.M. Mutations in the sequence flanking the microsatellite at the locus prevent the amplification of some alleles // Anim. Genet. 1995. Vol. 26. P. 43−44.
- Edwards A., Civitello A., Hammond H.A. DNA typing and genetic mapping with trimeric and tetrameric tandem repeats // Am. J. Hum. Genet. 1991. Vol. 49. P. 746−756.
- Edwards C.J., Dolf G., Loftus R.T. Relationships between the endangered Pusstertaler-Sprinzen and three related European cattle breeds as analysed with 20 microsatellite loci // Animal Genetics. 2000. Vol. 31. P. 329−332.
- Estoup A. and Cornuet J.M. Microsatellite evolution: inferences from population data. In: Microsatellites Evolution and application // Eds.: D. B. Goldstein and C. Schlotterer. Oxford: Oxford University Press, 1999. 200 p.
- Fan B. Genetic variation analysis withing and among Chinese indigenous swine populations using microsatellite // J. Animal Genetics. 2002. Vol. 33. P. 422−427.
- FAO Swines. In: Secondary Guidelines for Development of National Farm Animal Genetics Resources Management Plants. Measurement of Domestic Animal Diversity (MoDAD): Recommended Microsatellite Markers. Rome: FAO, 1998. pp. 19−24.
- Fischbein M. Isoagglutination in main and lower animals // J. Infect. Diseases. 1913. Vol. 12. P. 133−139.
- Ganal M., Hemleben V. // Theor. Appl. Genet. 1986. Vol. 73. P. 129 135.
- Georges M., Dietz A.B., Mishra A. Microsatellite mapping of the gene causing weaver disease in cattle will allow the study of an associated quantitative trait locus// Proc. Natl. Acad. Sci. 1993a. Vol. 90. P. 1058−1062.
- Gerbens F., Harders F.L., Groenen M. A. A dimorphic microsatellite in the porcine H-FABP gene at chromosome 6 // Anim Genet. 1998. Vol. 29(5). P. 408- 409.
- Ginot F., Bordelais I., Nguyen S. Correction of some genotyping errors in automated flourescent microsatellite analysis by enzymatic removal of one base overhang // Nucleic Acids Res. 1996. Vol. 24. P. 540−541.
- Glowatski Mullis M.L., Gaillard C., Wigger G. Microsatellite based parentage control in cattle // J. Animal Genetics. 1995. Vol. 26. P. 7−12.
- Goldstein D., Linares A., Cavalli-Sforza L. // Genetics. 1995. Vol. 139. P. 463−471.
- Goldstein D.B. and Pollock D.D. Launching Microsatellites: A review of mutation processes and methods of phylogenetic inference // J. Hered. 1997. Vol. 88. P. 335−342.
- Goldstein D.B., Schlotterer C. Microsatellites. Evolution and Applications. Oxford, 1999. 321 p.
- Grimaldi M.C., Claiton J., Pontarotti P. // Hum. Imunol. 1995. Vol. 51. P. 89−94.
- Guo Li Zhou, Hai Guo Jin, Qi Zhu. Genetics diversity analisis of five cattle breeds native to China using microsatellites // Genetics. 2005. Vol. 84. no.l. P. 77−80.
- Hammond E.L., Lymbery A.J., Martin G.B. Microsatellite analysis of genetic diversity in wild and farmed Emus (Dromaius novaehollandiae) // J. Hered. 2002. Vol. 93. P. 376−380.
- Hancock J.M. Microsatellites and other simple sequences: genomic context and mutational mechanisms. In: Microsatellites Evolution and application // Ed. D. B. Goldstein und C. Schlotterer. Oxford: Oxford University Press, 1999. P. 1−6.
- Henderson S.T., Peter T.D. Instability of simple sequence DNA in Sac-charomyces cerevisia // Molecular and Cell Biology. 1992. Vol. 12. P. 2749−2757.
- Heme C., Ghosh S., Todd J. // Trends Genet. 1992. Vol. 8. P. 288−294.
- Heyen, D.W., Beever, J.E., Da, Y. Exclusion probabilities of 22 bovine microsatellite markers in flourescent multiplexes for semi-automated parentage testing // Anim. Genet. 1997. Vol. 28. P. 21−27.
- Heyer E., Puymirat J., Dietjes P. Estimating Y chromosome specific microsatellite mutation frequencies using deep rooting pedigrees // Hum. Mol. Genet. 1997. Vol.6. P. 799−803.
- Hibert P., Lindpaintner K., Beckmann J.S. // Nature. 1991. Vol. 353(6344). P. 521−529.
- Hohenhorst J. Use microsatellites for parentage control in pigs // J. Animal Genetics. 1994. Vol. 25 (2). P. 33.
- Holm L.E., Loeschcke V. and Bendixen C. Elucidation of the molecular basis of a null allele in a rainbow trout microsatellite // Mar. Biotechnol. 2001. Vol. 3. P. 555−560.
- Horng Y.-M. and Huang M.-C. Male-Specific Band in Random Amplified Microsatellite Polymorphism Fingerprints of Holstein Cattle // Proc. Natl. Sei. Counc. ROC (B). 2000. Vol. 24. no.l. P. 41−46.
- Jeffrey A.J., Wilson V, Thein S.L. Individual specific fingerprints of human DNA//Nature. 1985. Vol. 316. P. 76−79.
- Jeffreys A.J., Hillel J., Hartley N. Hyppervariable DNA and genetic fingerprints//Anim. Genet. 1987. Vol. 18. Suppl.l. P. 141.
- Jeefreys, A.J., Tamaki, K., MaCLeod, A. Complex gene conversion events in germline mutation at human minisatellites // Nat. Genet. 1994. Vol. 6. P. 136−145.
- Jones A.G., Stockwell C.A., Walker D. The molecular basis of a microsatellite null allele from the white sands pupfish //J. Hered. 1998. Vol. 89. P. 339 342.
- Jorde L.B., Bamshad M.J., Watkins W.S. // Am. J. Hum. Genet. 1995. Vol. 57. P. 523−538.
- Kacirek S.L., Irvin K.M., Dimsoski P.I. Variation at microsatellite loci in the large white, Yorkshire and Hampshire breeds of swine // J. Research"and reviews. 1998. P. 41−43.
- Kaempffer A. Uber ein zweites Isoagglutinogen Agglutininpaar B in Schweineblut//Z. Rassenphysiol. 1932. Bd. 5. P. 53−58.
- Kappes S.M., Keele J.W., Stone R.T. A second-generation linkage map of the bovine genome // Genome Research. 1997. Vol. 7. P. 235 249.
- Kim T.H., Kim K.S., Choi B.H. Genetic structure of pig breeds from Korea and China using microsatellite loci analisis // J. Anim Sei. 2005. Vol. 83(10). P. 2255−2263.
- Kimura M. and Crow J.F. The number of alleles that can be maintained in finite populations // Genetics. 1964. Vol. 49. P. 725−738.
- Kimura M. and Otha T. Stepwise mutation model and distribution of allelic frequencies in a finite population // Proc. Natl. Acad. Sei. 1978. Vol. 75. P. 2868−2872.
- Koorey D.J., Bishop G.A. and McCaughan G.W. Allele non-amplification: a source of confusion in linkage studies employing microsatellite polymorphisms//Hum. Mol. Genet. 1993. Vol. 2. P. 289−291.
- Kumar P., Freeman A.R., Loftus R.T. Admixture analysis of South Asian cattle // Heredity. 2003. P. 243−250.
- Lehmann T., Hawley W.A. and Collins F.H. An evaluation of evolutionary constraints on microsatellite loci using null alleles // Genetics. 1996. Vol. 144. P. 1155−1163.
- Lenstra J. A., Van Boxtel J. A., Swaagstra K. A. Short interspersed nuclear element (SINE) sequences of the Bovidae // Anim. Genet. 1993. Vol. 24. P. 33−39.
- Levinson G, Gutman G. A. // Mol. Biol. Evol. 1987. Vol. 4(3). P. 203 221.
- Levinson G., Gutman G. A. High frequencies of short frameshifts injpoly-CA/TG tandem repeats borne by bacteriophage M13 in Eschericha coli K12 // Nucleic Acid Research. 1987. Vol. 15. P. 5323−5328.
- Li K., Fan B., Zhao S. Analisis of diversity and genetic relationships between four Chinese indigenous pig breeds and one Australian commercial pig breed // J. Animal Genetics. 2000. Vol. 31. P. 322−325.
- Li S.-J., Yang S.-H., Zhao S.-H. Genetic diversity analyses of 10 indigenous Chinese pig populations based on 20 microsatellites // J. Anim Genet. 2002. Vol. 83(10). P. 2255−2263.
- Litt M., Luty J.A. // Am. J Hum. Genet. 1989. Vol. 44(3). P. 397−401.
- Luca L., Cavali Sforza. The DNA revolution in population genetics // Trends Genet. 1998. Vol. 14. P. 60−65.
- Luikart G. Statistical analisys of microsatellite DNA data // Trends in Ecology and Evolution. 1999. Vol. 14. P. 253−256.145.. Ma R. Z., Beever J. E., Da Y. // J. Hered. 1996. Vol. 87. P. 261−267.
- MacHugh D.E., Loftus R.T., Cunningham P. // Anim. Genet. 1998. Vol. 29(5). P. 333−340.
- Maddox J.F., Davis K.P., Crawford A.M. An enhanced linkage map of the sheep genome comprising more than 1000 Loci // Genome Res. 2001. Vol. 11. P. 1275−1289.
- Martinez A.M., Delgado J.V., Rodero A. Genetic structure of the Iberian pig breed using microsatellites // J. Animal Genetics. 2000. Vol. 31. P. 295 301.
- Maudet C., Beja-Pereira A., Zeyl E. A standart set of polymorphic microsatellites for threatened mountain ungulates (Caprini, Artiodactila) // Molecular Ecology Notes. 2004. Vol. 4. P. 49−55.
- Maynard Smith J. and Haigh J. The hitchhiking effect of a favourable gene//Genet. Res. 1974. Vol. 23. P. 23−35.
- Metta M., Kanginakudru S., Gudiseva N. // BMC Genetics. 2004. Vol. 5. P. 16.
- Moore S.S., Byrne K. Dinucleotide polymorphism at the bovine brain ribonuclease locus// Animal Genetics. 1992. Vol. 23. P. 574.
- Moran C. Microsatellite repeats in pigs and chicken genomes // J. Hered. 1993. Vol. 84. P. 274−280.
- Nechtelberger D., Kaltwasser C., Stur I. DNA microsatellite analisis for parentage control in Austrian pigs // Animal Biotechnology. 2000. Vol. 12(2). P. 141−144.
- Nei M. Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals // Genetics. 1978. Vol. 89. P. 583−590.
- Nei, M., Koehn R. Genetic polymorphism and the role of mutation in evolution // Evolution Genes and Proteins. 1983. P. 165- 90.
- Nickerson D.A., Taylor S.L., Weiss K.M. DNA sequence diversity in a 9.7-kb region of the human lipoprotein lipase gene // Nat. Genet. 1998. Vol. 19. P. 233−240.
- Nowak Z., Charon K.M. Identification of fecundity gene (FecB) carriers using microsatellite markers and its effect on sheep weight // J. Appl. Genet. 2001. Vol. 42. P. 49−57.
- Pazrec A. A., Flickinger G. H, Fontanezi L. Livestock variation of linked microsatellite markers in diverse swine breeds // J. Anim. Biotechnology. 1998. Vol. 9. P. 55−66.
- Pemberton J.M., Slate J., Bancroft D.R. Nonamplifying alleles at microsatellite loci: a caution for parentage and population studies // Mol. Ecol. 1995. Vol. 4. P. 249−252.
- Perez E., Martinez A.M., Vega J. L. Preliminary genetic characterization of Cuban Creole PIG using microsatellites // J. Arch. Zootec. 2004. Vol. 53. P. 349−352.i
- Paetkau D., Slade R., Burdens M. Genetic assignment methods for the direct, real time estimation of migration rate: a simulation-base exploration of accuracy and power// Molecular Ecology. 2004. Vol. 13. P. 55 65.
- Primmer C.R., Moller A.P. and Ellegren H. Resolving genetic relationships with microsatellite markers: a parentage testing system for the swallow Hi-rundo rustica // Mol. Ecol. 1996. Vol. 4. P. 493−498.
- Pritchard J.K. Inference of population structure usingmultilocus genotype data // Genetics. 2000. Vol. 155. P. 945 959.
- Polli M., Hefford C.G., Faddy M.J. Efficacy and reliability of paternity testing in cattle using DNA microsatellites // Animal Genetics. 1998. Vol. 29. P. 910.
- Putnova L., Knoli A., Dvorak V. A novel porcine microsatellite panel for the identification of individuals and parentage control in the Czech Republic // Czech J. Anim Sci. Suppl. 48. 2003. Vol. 8. P. 307−314.
- Rasad S.D. Abstammungs und Identitatskontrolle beim Schwein met-tels Microsatellitenanalyse. Gottingen: Cuviller, 2001. XIV. P. 125.
- Richards R.I., Sutherland G.R. // Trends Biochem Sci. Nat Genet. 1994. Vol. 6(2). P. 114−116.
- Richardson T., Cato S., Ramser J. Hybridization of microsatellites to RAPD: a new sourse of polimorphic marcers // Nucleic Acids Res. 1995. Vol. 23. P. 3798−3799.
- Robic A., Dalens M., Wolossyn N. Isolation of 28 new porcine microsatellites revealing polymorphism // J. Mamtn, Genome. 1994. Vol. 5. P. 580−583.
- Robison O.W. The influince of maternal effects on the efficiency of selection//Science. 1981. Vol. 8. P. 121−137
- Rohrer G.A., Alexander L.J., Keel J.W. A mikrosatellite linkage map of the porcine genome // Genetics. 1994. Vol. 136. P. 231−245.
- Rohrer G. A., Alexander L. J" Hu Z. // Genome Res. 1996. Vol. 6. P. 371−391.
- Rubinsztein D., Leggo J., Amos W. // Genomics. 1995. Vol. 10. P. 3 373 431.
- Saiki R.K., Scharf S.J., Faloona F. Enzymatic amplification of B-globulin genomic sequences and restriction site analisis for diagnosis of sickle cell anemia // Science. 1985. Vol.230. P. 1350−1354.
- Saison R. Report of a blood group system in swine // J. Immunol. 1958. Vol. 80. no.6. P. 463−467.
- Saitbekova N., Gaillard C., Obexer-Ruff G. Genetic diversity in swiss goat breeds on microsatellite analisis // Anim. Genet. 1999. Vol. 30. P. 36−41.
- Schlotter C. Microsatellites. Molecular Genetic Analysis of Population. A. Practical Approach. Second Editior, 1998. P. 238−261.
- Schlotter C. Evolutionary dynamics of microsatellite DNA // Chromo-soma. 2000. Vol. 109. P. 365−371.
- Schlotter C. Opinion: The evolution of molecular markers just a matter of fashion // Nature Rev. Genet. 2004. Vol. 5. P. 63−69.
- Schlotter C. and Tautz D. Slippage synthesis of simple sequence DNA // Nucleic Acids Res. 1992. Vol. 20. P. 211−215
- Schenkel F.S., Miller S. P., Jiang Z. Association of a single nucleotide polymorphism in the calpastatin gene with carcass and meat quality traits of beef cattle // Journal of Animal Science. 2006. Vol. 84. P. 291
- Schmid M, Saitbekova N., Gaillard C. Genetic diversity in Swiss cattle breeds //J. Anim. Breed. Genet. 1999. Vol. 116. P. 1−8.
- Slatkin M. Hitchhiking and associative overdominance at a microsatellite locus // Mol. Biol. Ecol. 1995 b. Vol. 12. P. 473−480.
- Smith G.P. Evolution of repeated DNA sequences by unequal crossover // Science 1976. Vol. 191. P. 528−535.
- Smith C.A.B. A note on genetic distance // Ann. Human Genet. 1977. Vol. 21. P. 254−276.
- Smith C., Simpson S.P. The use of genetic plimorphismsin liveshtock improvement // Journal of Animal Breeding Genetic. 1986. Vol. 103. P. 205.
- Smith C.L., Warburton P.E., Cantor C. Analyses of genome organization and rearrangements by pulsed field gradient gelelectrophoresies // Genetic engeneeringN.Y.: Plenum press. 1986. Vol. 8. P. 45−70.
- Smith J.R., Carpten J.D., Brownstein M.J. Approach to genotyping errors caused by nontemplated nucleotide addition by Taq DNA polymerase // Genome Res. 1995. Vol. 5. P. 312−317.
- Solinas Toldo S., Fries R., Steffen P. Physically mapped cosmidderived microsatellite markers as anchor loci on bovine chromosomes // Mamm. Genome. 1993. Vol. 4. P. 720−727.
- Soller M. Genetic mapping of the Bovine Genome Using Deoxyribonucleic Acid-Level Markes to Identify Loci Affecting Quantitative Traits of Economic Importance // J. Dairy Sci. 1990. Vol. 73. P. 2682−2646.
- Stallings R. L, Ford R., Nelson O. Evolution and distribution of (GN)n repectitive sequences in mammalian genomes // Genomics. 1991. Vol. 10. P. 807 815.
- Steffen P., Eggen A., Diets A.B., Womack J.E., Stranzinger G. Isolation and mapping of polymorphic microsatellites in cattle // Anim. Genet. 1993. Vol. 24. P. 121−124.
- Strand M, Prolla T.A., Liskay R.M. Destabilization of tracts of simple repetitive DNA in yeast by mutations affecting DNA mismatch repair // Nature.1993. Vol. 365. P. 274−276.
- Szymanowski L., Stetkewicz S, Walcher B. Les groupes serologiques dans le sang du pore et leur relation avec les groupes du sang human // C. r. soc. boil. 1926. Vol. 94.
- Tachida H. and Izuka M. Persistence of repeated sequences that evolve by replication slippage // Genetics. 1992. Vol. 131. P. 471 -478.
- Takezaki N., Neim M. Genetic distances and reconstruction of phylo-genetic trees from microsatellite DNA // Genetics. 1996. Vol. 144 (1). P. 389−399.
- Tautz D. Hypervariability of simple sequences as a general source for polymorphic DNA markers // Genetics. 1989. Vol. 17. P. 6463−6471.
- Tautz D. and Schlotter C. Simple sequences //Curr. Opin. Genet. Dev.1994. Vol.4. P. 832−837.
- Vaiman D., Mercier D., Moazami-Goudarzi K. A set of 99 cattle microsatellites: characterization, synteny mapping, and polymorphism // Mamm. Genome. 1994. Vol. 5. P. 288−297.
- Vaiman D., Immam-Chali M., Moazami-Goudarzi K. Conservation of a synthenic group of microsatellite loci between cattle and sheep // Mammalian Genome. 1996. P. 676−683.
- Valdes A.M., Slatkin M. and Freimer N.B. Allele frequencies at microsatellite loci: The stepwise mutation model revisited //Genetics. 1993. Vol. 133. P. 737−749.
- Van Zeveren A., Peelman A., Van de Weghe A. A genetic study of four Belgian pig population by mean of seven microsatellite loci // J. Anim. Breed Genet. 1995. Vol. 112. P. 191−204.
- Vankan D.M., Hefford C.G., Faddy M.J. Efficacy and relialiability of paternity testing in cattle using DNA microsatellites // Animal Genetics. 1998. Vol. 29. P. 9−10.
- Vogt P. Potential genetic function of tandem repeated DNA sequence blocks in human genome are based on highly conserved chromatine folding code //Human Genetics. 1990. Vol. 84. P. 301−336.
- Waser, P.M. & Strobeck, C. Genetic signatures of interpopulation dispersal //Trends in Ecology and Evolution. 1998. Vol. 13. P. 43 44.
- Weber J.L., May P.E. Abundant class of human DNA polymorphism which can be typed using the polymerase chain reaction // Am. J. Hum. Genet.1989. Vol. 44. P. 388−396.
- Weber J.L. Informativeness of human (dC-dA)n (dG-dT)n polymorphisms // Genomics. 1990. Vol.7. P. 524−530.
- Weber J.L., Wong C. Mutation of human short tandem repeats // Human Molecular Genetics. 1993. Vol. 2. P. 1123−1128.
- Weimann C., Leyhe-Horn B., Gauly M. Suitability of microsatellites BM1329 and OarAElOl as markers for the introgression of the Fee (B) locus into different sheep breeds // Arch. Tierzucht. 2001. Vol. 44. P. 435−440.
- Weising K., Atkinson R. and Gardner R. Genomic fingerprinting by microsatellite-primed PCR: a critical evalution // PCR Merhods Applic. 1995. Vol. 4. P. 249−255.
- Williams J.CG.K., Kubelic A.R., Livac K.J. DNA polymorphism amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers // Nucleic Acids Res.1990. Vol. 18. P. 6531−6535.
- Wintero A. K., Fredholm M., Thomsen P. D. Variable (dG dT) n (dC -dA)n Sequences in the Porcine // Genome. 1992. Vol. 12. P. 281−288.
- Ziegle J.S., Su Y., Corcoran K.P. // Genomics. 1992. Vol. 14. P. 10 261 031.