Разработка методики генотипирования бифидобактерий на основе двухлокусного секвенирования с целью видовой идентификации штаммов
Диссертация
Бактерии рода Bifidobacterium являются важным компонентом индигенной микрофлоры кишечника человека и теплокровных животных. Они обеспечивают колонизационную резистентность в отношении патогенных и условно-патогенных микроорганизмов, обладают иммуномодулирующим действием, синтезируют аминокислоты, витамины (К, РР и группы В), биотин, летучие жирные кислоты, ферменты, участвующие в процессах… Читать ещё >
Содержание
- Введение
- Список сокращений
- Глава 1. Обзор литературы
- Раздел
- 1. 1. Характеристика объекта: бифидобактерии, их 6−20 свойства и значимость для нормальной жизнедеятельности человека
- Раздел
- 1. 2. История генотипирования. Эволюционная 21систематика. Таксономия бактерий
- Раздел
- 1. 3. Становление бифидофлоры кишечника у детей 42−50 раннего возраста
- Цель и задачи исследования. '
- Глава 2. Материалы и методы исследования
- Раздел
- 2. 1. Материалы
- Раздел
- 2. 2. Методы исследования
- Глава 3. Результаты и обсуждение
- Раздел 3. 1 Разработка методики видового типироваиия 70−84 бифидобактерий на основе двухлокусного секвенирования фрагментов генов 16S рРНК и tal
- Раздел 3. 2 Применение разработанной методики двухлокусного 84−92 секвенирования для видовой идентификации 21 коллекционного штамма бифидобактерий
- Раздел 3. 3 Применение разработанной методики для видового 92−100 типироваиия 30 изолятов бифидобактерий из кишечника 11 детей раннего возраста
Список литературы
- Белозерский А.Н. Нуклеиновые кислоты и их связь с эволюцией, филогенией и систематикой организмов: Пленарная лекция // Второй всесоюзный биохимический съезд.- Ташкент, 1969.- С. 38.
- Ботина С.Г., Цыганков Ю. Д. Суходолец В.В. Идентификация промышленных штаммов молочнокислых бактерий методами молекулярно-генетического типнрования // Генетика, 2006.- Т. 42.- № 12.- С. 1621−1635.
- Гуринович Г. В., Кудряшов Л. С., Патракова И. С. Пробиотики и пробиотические продукты. М.: ВНИИ мясной промышленности им. В. М. Горбатова, 2002.
- К 100-летию со дня рождения академика А. Н. Белозерского // Успехи биологической химии.- 2005.- Т. 45.- С. 455−462.
- Кафарская Л.И., Ефимов Б. А., Постникова Е. А., Донских Е. Е. Особенности становления микрофлоры у детей раннего возраста // Детские инфекции.-2006.-№ 1.-С. 6−11.
- КольманЯ., Рем К.-Г. Наглядная биохимия.- М.: Мир, 2004.- С. 256−259.
- Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Молекулярное клонирование.- М.: Мир, 1984, — С. 84,333−334.
- Миндлин С.З., Петрова М. А., Басс И. А., Горленко Ж. М. Происхождение, эволюция и миграция генов лекарственной устойчивости // Генетика.- 2006.Т. 42.-№ 11.- С. 1495−1511.
- МУК 4.2.577−96. Методы микробиологического контроля продуктов детского, лечебного питания и их компонентов.- М.: МЗ РФ.- 1998.
- МУК 4.2.1890−04. Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам.- М.: МЗ РФ.- 2004.
- Осипов Г. Невидимый орган микрофлора человека // http://www.rusmedserv.eom/microbdiag/invisibleorgan.htm#bl
- Примроуз С., Тваймен Р. Геномика. Роль в медицине.- М.: БИНОМ. Лаборатория знаний.- 2008.- С. 58−59.
- Рыбальченко О.В. Бифидобактерии, их значение и использование. Учебное пособие // СПбГУ 2003.
- Современная микробиология: Прокариоты / Под ред. Й. Ленглера, Г. Древса, Г. Шлегеля.- М.: Мир, 2005.- Т. 2.- С. 148−205.
- Чем грозит нарушение микрофлоры кишечника // http://www.jogurt.well24.lv/ru/doctor.html
- П.Чемерис А. В., Ахунов Э. Д., Вахитов В. А. Секвенирование ДНК // http ://www. anrb. га/molgen/ chemeri s .html
- Шендеров Б.А. Микробиоценозы человека и функциональное питание // http://www.disbak.ru/php/contentphp?id=1052
- Шендеров Б.А. Нормальная микрофлора и ее роль в поддержании здоровья человека // http://www.gastroportal.ru/php/content.php?id=l 880
- Шкопоров А.Н., Ефимов Б. А. Володин Н.Н., Кафарская Л. И. Бифидобактерии: традиционный взгляд и современные генетические исследования // Вопросы практической педиатрии.- 2007.-Т.2 № 5, — С. 7679.
- Щелкунов С.Н. Генетическая инженерия.- Новосибирск: Сибирское университетское издательство, 2004. С. 36−55.
- Abbad Andaloussi S., Talbaoni H., Marczak R., Bonaly R. Isolation and characterization of exocellular polysaccharides produced by Bifidobacterium longum II Appl. Microbiol. Biotechnol.- 1995.-V. 43.- P. 995−1000.
- Adams M.R. and Hall C.J. Growth inhibition of foodborne pathogens by lactic and acetic acids and their mixtures // Int. J. Food Sci. Technol.- 1988.- V. 23.- P. 287 292.
- Ahn J.B. Hwang H.J. and Park J.H. Physiological responses of oxygen-tolerant anaerobic Bifidobacterium longum under oxygen // J. Microbiol. Biotechnol.-2001.- V. 11.-P. 443−451.
- Backhed F., Hornef M. Toll-like receptor 4-mediated signaling by epithelial surfaces: necessity of threat? // Microbes Infect. 2003.- V. 5(11).- 951−959.
- Begley M., Hill C., Gahan C. G. M. Bile salt hydrolase activity in probiotics // Appl. Environ. Microbiol.- 2006, — V. 72 (3).- P. 1729−1738.
- Belozersky A.N., Spirin A.S. A correlation between the composition of deoxyribonucleic and ribonucleic acids //Nature.- 1958.- 182 (4628).- P. 132−133.
- Benno Y., Sawada K., Mitsuoka T. The intestinal microflora of infants: composition of fecal flora in breast-fed and bottle-fed infants // Microbiol. Immunol.- 1984.- V. 28.- P. 975−986.
- Berg R.D. The indigenous gastrointestinal microflora // Trends Microbiol.- 1996.-V. 4.- P. 430−445.
- Biavati B., Castagnoli P., Crociani F., Trovatelli L.D. Species of the Bifidobacterium in the feces of infants // Microbiologica.- 1984.- V. 7 (4).- P. 341 345.
- Biavati B., Castagnoli P., Trovatelli L.D. Species of the genus Bifidobacterium in the feces of human adults // Microbiologica.- 1986.- V. 9 (1).- P. 39−45.
- Biavati B. and Mattarelli P. Bifidobacterium ruminantium sp. nov. and Bifidobacterium merycicum sp. nov. from the rumens of cattle // Int. J. Syst. Bacteriol.- 1991.-V. 41.-P. 163−168.
- Biavati B., Mattarelli P. and Crociani F. Bifidobacterium saeculare a new species isolated from faeces of rabbit // Syst Appl Microbiol.- 1991.- V. 14.- P. 389−392.
- Biavati B., Scardovi V. and Moore W.E.C. Electrophoretic patterns of proteins in the genus Bifidobacterium and proposal of four new species // Int. J. Syst. Bacteriol.-1982.- V. 32.- P. 358−373.
- Biavati B., Vescovo M., Torriani S., Bottazzi V. Bifidobacteria: history, ecology, physiology and applications //Ann. Microbiol.- 2000.- 50.- P. 117−131.
- Breed R.S., Murray E.G.D., Smith N.R., eds. Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology, 7th edn., Williams & Wilkins, Baltimore.- 1957.
- Brodie E.L., DeSantis T.Z., Moberg Parker J.P. et al. // PNAS.- 2007.- V. 104 (1).-P. 299−304.
- Candela M., Vitali B., Matteuzzi D., Brigidi P. Evaluation of the rrn operon copy number in Bifidobacterium using real-time PCR // Lett. Appl. Microbiol.- 2004.-V. 38.-P. 229−232.
- Charteris W.P., Kelly P.M., Morelli L., Collins J.K. Antibiotic susceptibility of potentially probiotic Bifidobacterium isolates from the human intestinal tract // Lett. Appl. Microbiol.- 1998.- V. 26.- P. 333−337.
- Crociani F., Matteizzi D., Ghazvinizadeh H. Species of the genus Bifidobacterium found in human vagina // Zentralbl. Bacteriol. Parasitenkd. Infektionskr. Hyg. Abt. 1 Orig. Reihe A.- 1973.- V. 223.- P. 298−302.
- Crociani F., Biavati B. Alessandrini A. et al. Bifidobacterium inopinatum sp. nov. and Bifidobacterium denticolens sp. nov., two new species isolated from human dental caries // Int. J. Syst. Bacteriol.- 1996.- V. 46.- P. 564−571.
- Dehnart J. Untersuchungen uber die gram positive Stuhlflora des Brustmilchkinder // Zentrabi. Bakteriol. Parasitenkd. Infektionskr. Hyg. Abt. I. Orig. Reihe A.- 1957.- Y. 169.- P. 66−79.
- De Simone C., Ciardi A., Grassi A. et al. Effect of Bifidobacterium bifidum and Lactobacillus acidophilus on gut mucosa and peripheral blood B lymphocytes // Immunopharmacol. Immunotoxicol.- 1992.- V. 14(1−2).- P. 331−340.
- De Vries W., Gerbrandy S.J., Stouthamer A.H. Carbohydrate metabolism in Bifidobacterium bifidum II Biochim. Biophys. Acta.- 1967.- 136.- 415−425.
- Dong X., Xin Y., Jian W. et al. Bifidobacterium thermacidophilum sp. nov., isolated from an anaerobic digester // Int. J. Syst. Evol. Microbiol.- 2000.- V. 50.-P. 119−125.
- Fanaro S, Chierici R, Guerrini P, Vigi V. Intestinal microflora in early infancy: composition and development // Acta Paediatr. Suppl. 2003.- V 91 (441).- P. 4855.
- Fox G. E., Wisotzkey J. D., Jurtshuk P. How close is close: 16S rRNA sequence identity may not be sufficient to guarantee species identity // Int. J. Syst. Bacteriol.- 1992.- V 42.- P. 166−170.
- Gavini F., Pourcher A-M., Neut C. et al. Phenotypic differentiation of bifidobacteria of human and animal origin // Int. J. Syst. Bacteriol.- 1991.- V 4.- P. 548−557.
- Gibson G.R., Wang X. Regulatory effects of bifidobacteria on the growth of other colonic bacteria // J. Appl. Bacteriol.- 1994.- V 77.- P. 412−420.
- Gill S. R., Pop M., DeBoy R.T. et al. Metagenomic analysis of the human distal gut microbiome // Science.- 2006.- V 312.- P. 1355−1359.
- Gomes A.M.P. and Malcata F.X. Bifidobacterium spp. and Lactobacillus acidophilus: biological, biochemical, technological and therapeutical properties relevant for use as probiotics // Trends Food Sei. Technol.- 1999.- V 10.- P. 139— 157.
- Goodfellow M., O’Donnel A.G. Handbook of new bacterial systematics / Eds Goodfellow M., O’Donnel A.G. L.: Acad. Press Ltd.- 1993.- P. 3−54.
- Gootlieb M., Chavko M. Silver staining of native and denatured eucaryotic DNA in agarose gels // Analytical Biochemistry.- 1987.- V 165.- P. 33−37.
- Gore C., Munro K., Lay C. et al. Bifidobacterium pseudocatenulatum is associated with atopic eczema: a nested case-control study investigating the fecal microbiota of infants // J. Allergy. Clin. Immunol.- 2008.- V 121 (1).- P. 135−40.
- Grill J.P., Perrin S., Schmeider F. Bile salt toxicity to some bifidobacterial strains: role of conjugated bile salt hydrolase and pH // Edge J. Microbiol.- 2000.- V 46 (10).-P. 878−884.
- Gurtler V" Mayall B.C. Genomic approaches to typing, taxonomy and evolution of bacterial isolates // Int. J. Syst. Evol. Microbiol.- 2001.- V 51.- P. 3−16.
- Hadadji M., Behama R., Saidi N. et al. Identification of cultivable Bifidobacterium species isolated from breast-fed infant feces in West-Algeria // African Journal of Biotechnology.- 2005.- V 4 (5).- P. 422−430.
- Holland D.F. Generic index of the commoner forms of bacteria // J. Bacteriol.-1920.-V 5.-P. 191−229.
- Hoyles L., Inganas E., Falsen E., Drancourt M., Weiss N., McCartney A.L. and Collins M.D. Bifidobacterium scardovii sp. nov., from human sources // Int. J. Syst. Evol. Microbiol.- 2002.- V 52.- P. 995−999.
- InsT/Aclone™ PCR Product Cloning Kit. Technical Manual. Fermentas.- 2004.l.Jian W., Zhu L., Dong X. New approach to phylogenetic analysis of the genus
- Bifidobacterium based on partial HSP60 gene sequences // Int. J. Syst. Evol. Microbiol.- 2001.- V 51.- P. 1633−1638.
- KuIlen M.J., Brady L.J., O’SulIivan D.J. Evaluation of using a short region of the recA gene for rapid and sensitive speciation of dominant bifidobacteria in the human large intestine // FEMS Microbiol. Lett.- 1997.- V 154.- P. 377−383.
- Lauer E. Bifidobacterium gallicum sp. nov. isolated from human faeces // Int. J. Syst. Bacterid.- 1990.-V 40,-P. 100−102.
- Lauer E. and Kandler O. DNA-DNA homology, murein types and enzyme patterns in the type strains of the genus Bifidobacterium II Syst. Appl. Microbiol.-1983,-V 4, — P. 42−64.
- Leahy S.C., Higgins D.G., Fitzgerald G.F., van Sinderen N. Getting better with bifidobacteria // J. Appl. Microbiol.- 2005.- V 98.- P. 1303−1315.
- Leblond-Bounget N., Philippe H., Mangin L, Decaris B. 16S rRNA and 16S to 23S internal transcribed spacer sequence analyses reveal inter- and intraspecific Bifidobacterium phylogeny // Int. J. Syst. Bacteriol.- 1996.- V 46.- P. 102−111.
- Lee J.H., Yoon Y.H. Characteristics of cell wall hydrolyzing enzyme of Lactobacillus spp and Bifidobacterium spp. // Korean J. Anal. Sci.- 1998.- V 40.-P. 43−50.
- Maiden M. C. J., Bygraves J.A., Feil E. et al. Multilocus sequence typing: a portable approach to the identification of clones within populations of pathogenic microorganisms // Proc. Natl. Acad. Sci. USA (Microbiology).- 1998.- V 95.- P. 3140−3145.
- Matsumoto M., Ohishi H. and Benno Y. H+jATPase activity in Bifidobacterium with special reference to acid tolerance // Int. J. Food Microbiol.- 2004.- V 93.- P. 109−113.
- Matteuzzi D., Crociani F., Zani G. and Trovatelli L.D. Bifidobacterium suis n. sp.: a new species of the genus Bifidobacterium isolated from pigs feces // Z. Allg. Mikrobiol.- 1971.- V 11.- P. 387−395.
- Matto J., Malinen E., Suihko M.L., Alander M., Palva A., Saarela M. Genetic heterogeneity and functional properties of intestinal bifidobacteria // J. Appl. Microbiol.- 2004.- V 97.- P. 459−470.
- McCartney A.L. Application of molecular biological methods for studying probiotics and the gut flora // British J. of Nutrition.- 2002.- V 88 (1).- P. 29−37.
- Meile L., Ludwig W., Rueger U. et al. Bifidobacterium lactis sp. nov., a moderately oxygen tolerant species isolated from fermented milk // Syst. Appl. Microbiol.- 1997.- V 20.- P. 57−64.
- Mevissen-Verhage E.A.E., Marcelis J. H./De Vos M. N. et al. Bifidobacterium, Bacteroides and Clostridium spp. in fecal samples from breast fed and bottle-fed infants with and without iron supplement // J. Clin. Microbiol.- 1987.- V 25.- P. 285−289.
- Misra A.K., Kuila R.K. Antimicrobial substances from Bifidobacterium bifidum // Indian J. Dairy Sei.- 1995.- V 48.- P. 612−614.
- SO.Mitsuoka T. Bifidobacteria and their role in human health // J. Ind. Microbiol.-1990.- V 6.- P. 263−268.
- Mitsuoka T., Hayakawa K., Kimura N. The fecal flora of man. II. Communication: the composition of bifidobacterium flora of different age groups. Zbl. Bakt. Mikrobiol. Hyg. I. Abt. Orig. A.- 1974.- V 226, — P. 469−478.
- Miyake T., Watanabe K., Watanabe T., Oyaizu H. Phylogenetic analysis of the genus Bifidobacterium and related genera based on 16S rDNA sequences // Microbiol. Immunol.- 1998.- V 42 (10).- P. 661−667.
- Op den Camp H.J.M., Oosterhof A., Veerkamp J.H. Cell surface hydrophobicity of Bifidobacterium bifidum subsp. pennsylvanicum II Antonie Van Leeuwenhoek.-1985.-V 51.-P. 303−312.
- Rasic' J.L., Kurmann J.A. Bifidobacteria and their role. Microbiological, nutritional-physiological, medical and technological aspects and bibliography // Experientia Suppl.- 1983.- V 39.- P. 1−295.
- Reddy B.S., Rivenson A. Inhibitory effect of Bifidobacterium longum on colon, mammary and liver carcinogenesis induced be 2-amino-3-methylimidazo4,5-fjquinoline, a food mutagen // Cancer Res.- 1993.- V 53(17).- P. 3914−3918.
- Requena T., Burton J., Matsuki T. et al. Identification, detection, and enumeration of human Bifidobacterium species by PCR targeting the transaldolase gene // Appl. Environ. Microbiol.- 2002.- V 68 (5).- P. 2420−2427.
- Reuter G. The Lactobacillus and Bifidobacterium microflora of the human intestine: Composition and succession. Current Issues in Intestinal Microbiology.-2001.-V 2 (2).- P. 43−53.
- Reuter G. Vergleichende Untersuchungen uber die Bifidus-Flora im Sauglingsund Erwachsenensthul. Zentralbl. 1−14. Bakteriol. Mikrobiol. Hyg. I. Abt. Orig. 1963.-V 191.-P. 486−507.
- Rogosa M. Genus III, Bifidobacterium Orla-Jensen // Buchanan R.E., Gibbons N.E., eds, Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology, 8th edn., Williams & Wilkins, Baltimore.- 1974.- P. 669−676.
- Roy D., Sirois S. Molecular differentiation of Bifidobacterium species with amplified ribosomal DNA restriction analysis and alignment of short regions of the Idh gene // FEMS Microbiol. Lett.- 2000.- V 191 (1).- P. 17−24.
- Saitou N., Nei M. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees // Mol. Biol.Evol.- 1987.- V 4, — P. 406−425.
- Sakata S., Kitahara M., Sakamoto M., Hayashi H., Fukuyama M. and Benno Y. Unification of Bifidobacterium infantis and Bifidobacterium suis as Bifidobacterium longum II Int. J. Syst. Evol. Microbiol.- 2002.- V 52.- P. 19 451 951.
- Sakata S., Ryu C.S., Kitahara M., Sakamoto M., Hayashi H., Fukuyama M., Benno Y. Characterization of the genus Bifidobacterium by automated ribotyping and 16S rRNA gene sequences // Microbiol. Immunol.- 2006.- V 50 (1).- P. 1−10.
- Sanger F., Nicklen S., Coulson A.R. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1977.- V 74.- P. 5463−5467.
- Satokari R.M., Vaughan E.E., Akkermans A.D.L. et al. Bifidobacterial diversity in human feces detected by genus-specific PCR and denaturing gradient gel electrophoresis // Appl. Environ. Microbiol.- 2001.- V 67 (2).- P. 504−513.
- Satokari R.M., Vaughan E.E., Smidt H. et al. Molecular approaches for the detection and identification of Bifidobacteria and Lactobacilli in the human gastrointestinal tract // System. Appl. Microbiol.- 2003.- V 26.- P. 572−584.
- Scardovi V. Genus Bifidobacterium Orla-Jensen // Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology.- 1984.- V. 1. ed. Kreig, N.R. and Holt, J.G. Baltimore, MD: Williams and Wilkins.- P. 1418−1434.
- Scardovi V. Genus Bifidobacterium Orla-Jensen 1924, 472dl // Sneath P.H.A., Mair N.S., Sharpe M.E., Holt J.G., eds, Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, Williams and Wilkins MD, Baltimore.- 1986.-V.2.- P. 1418−1434.
- Scardovi V. and Crociani F. Bifidobacterium catenidatum, Bifidobacterium dentium, and Bifidobacterium angidatum: three new species and their deoxyribonucleic acid homology relationships // Int. J. Syst. Bacterial.- 1974.- V 24.- P. 21−28.
- Scardovi V. and Trovatelli L.D. The fructose-6-phosphate shunt as peculiar pattern of hexose degradation in the genus Bifidobacterium II Ann. Microbiol.-1965.-V 15.-P. 19−29.
- Scardovi V. and Trovatelli L.D. Bifidobacterium animalis (Mitsuoka) comb. nov. and the «minimum» and «subtile"' groups of new bifidobacteria found in sewage II Int. J. Syst. Bacterid.- 1974.- V 24, — P. 21−28.
- Scardovi V. and Zani G. Bifidobacterium magnum sp. nov., a large, acidophilic Bifidobacterium isolated from rabbit faeces // Int. J. Syst. Bacterid.-1974.-V 24.-P. 29−34.
- Scardovi V., Zani G., Trovatelli L.D. Deoxyribonucleic acid homology among the species of the genus Bifidobacterium isolated from animals // Arch. Microbiol.- 1970.- V 72.-318−325.
- Shimamura S., Abe F., Ishibashi N. et al. Relationship between oxygen sensitivity and oxygen metabolism of Bifidobacterium species // J. Dairy Sci.-1992,-V75.-P. 3296−3306.
- Simpson P.J., Ross, R.P., Fitzgerald, G.F. and Stanton, C. Bifidobacterium psychraerophilum sp. nov and Aeriscardovia aeriphila gen. nov., sp. nov. isolated from a porcine caecum // Int. J. Syst. Evol. Microbiol.- 2004.- V 54.- P. 401−406.
- Smehilova M., Vilkova E., Nevoral J. Comparison of intestinal microflora in healthy infants and infants with allergic colitis // Folia Microbiol. (Praha) 2008.-V 53 (3).-P. 255−258.
- Stackebrandt E., Goebel B.M. Taxonomic note: a place of DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology // Int. J. Syst. Bacterid.- 1994.- V 44 (4).- P. 846−849.
- Stackebrandt E., Rainey F.A., Ward-Rainey N.L. Proposal for a new hierarchic classification system, Actinobacteria classis nov. // Int. J. Syst. Bacterid.- 1997.- V 47.- P. 479−491.
- Talwalkar A. and Kailasapathy K. Metabolic and biochemical responses of probiotic bacteria to oxygen // J. Dairy Sci.- 2003.- V 86.- P. 2537−2546.
- Tissier H. «Recherches sur la flore intestinale des nourrissons (Etat normal et pathologique») // Thesis, ed. Georges Carre' et C. Maud, University of Paris.-1900.- Paris, France.- P. 253.
- Trovatelli L.D., Crociani F., Pedinotti M. and Scardovi V. Bifidobacterium pullorum sp. nov. A new species isolated from chicken faeces and a related groupof bifidobacteria isolated from rabbit faeces // Arch. Microbiol.- 1974.- V 98.- P. 187−198.
- Vanhoutte T., De Preter V., De Brandt E. et al. Molecular monitoring of fecal microboiota of healthy human subjects during administration of lactulose and Saccharomyces boulardii II Appl. Environ. Microbiol.- 2006.- V 72 (9).- P. 5990−5997.
- Vaugien L., Prevots F., Roques C. Bifidobacteria identification based on 16S rRNA and pyruvate kinase partial gene sequence analysis // Anaerobe.- 2002.1. V 8 (6).- P. 341−344.
- Ventura M. and Zink R. Rapid identification, differentiation, and proposed new taxonomic classification of Bifidobacterium lactis II Appl. Environ. Microbiol.- 2002.- V 68 (12).- P. 6429−6434.
- Vilkova E., Nevoral J., Jencikova B. et al. Detection of infant faecal bifidobacteria by enzymatic methods // J. Microbiol. Methods.- 2005.- V 60 (3).-P. 365−373.
- Vlkova E, Rada V, Bujnakova D, Kmet V. Enumeration, isolation, and identification of bifidobacteria from infant feces // Folia Microbiol. (Praha). 2004.1. V 49 (2).- P. 209−12.
- Ward P., Roy D. Review of molecular methods for identification, characterization and detection of bifidobacteria// Lait.- 2005.- V 85.- P.23−32.
- Watabe J., Benno Y. and Mitsuoka T. Bifidobacterium gallinarium sp. nov.: a new species isolated from the ceca of chickens // Int. J. Syst. Bacterid.- 1983.-V33.-P. 127−132.
- Woese C.R. Bacterial Evolution // Microbiological Reviews.- 1987.- V 51 (2).-P. 221−271.
- Woodcock D.M., Crowther PJ, Doherty J, et al. // Nucleic Acids Res.-1989.- V 17.- P. 3469−3478.
- XLIO-Gold® Ultracompetent Cells for Large and Ligated DNA // http://www.stratagene.com/products/displayProduct.aspx?pid=282
- Yildirim Z., Johnson M.G. Characterization and antimicrobial spectrum of bifidocin B, a bacteriocin produced by Bifidobacterium bifidum NCFB 1454 // J. Food Prot.- 1998.-V 61.-P. 47−51.
- Zhu L., Li W. and Dong X. Species identification of genus Bifidobacterium based on partial HSP60 gene sequences and proposal of Bifidobacterium thermacidophilum subsp. porcinum subsp. nov. // Int. J. Syst. Evol. Microbiol.-2003.-V 53.-P. 1619−1623.