Основные биоинформационные программы

ACT (Artemis Comparison Tool) — геномный анализ.

Arlequin — анализ популяционно-генетических данных.

BioEdit — редактор множественного выравнивания нуклеотидных и аминокислотных последовательностей.

BLAST — поиск родственных последовательностей в базе данных нуклеотидных и аминокислотных последовательностей.

Clustal — множественное выравнивание нуклеотидных и аминокислотных последовательностей.

DnaSP — анализ полиморфизма последовательностей ДНК.

FigTree — редактор филогенетических деревьев.

Genepop — популяционно-генетический анализ.

JalView — редактор множественного выравнивания нуклеотидных и аминокислотных последовательностей.

MacClade — коммерческая программа для интерктивного эволюционного анализа данных.

MEGA — молекулярно-эволюционный генетический анализ.

Mesquite — программа для сравнительной биологии на языке Java.

Muscle — множественное сравнение нуклеотидных и аминокислотных последовательностей. Более быстрая и точная по сравнению с ClustalW.

PAUP — филогенетический анализ с использованием метода парсимонии (и других методов).

PHYLIP — пакет филогенетических программ.

PopGene — анализ генетического разнообразия популяций.

Populations — популяционно-генетический анализ.

PSI Protein Classifier — обобщение результатов, полученных с помощью программы PSI-BLAST.

Sequin — депонирование последовательностей в GenBank, EMBL, DDBJ. генетический эволюционный биоинформационный программа.

SPAdes — сборщик бактериальных геномов.

Velvet — сборщик геномов.