Избрание Фридриха Пфальцского на чешский престол. Нарушение привилегий чешских протестантов послужило причиной нового восстания против Габсбургов, начавшегося в мае 1618 г. Восставшие создали временное правительство, которое лишило Габсбургов власти над Чехией, изгнали орден иезуитов и высшее немецкое католическое духовенство. В июле 1619 г. был принят закон о новом устройстве страны. Чехия должна была стать конфедерацией чешских, моравских и силезских земель во главе с выборным королем, власть которого была ограничена. На чешский престол был избран глава протестантской унии Фридрих V Пфальцский.
Сражение при Белой Горе. Утрата независимости Чехии. Среди чешских сословий не было единства. Часть из них выступила на стороне Габсбургов и католической церкви. Кроме того, в ходе восстания не было выдвинуто ни одного требования в защиту интересов крестьянства и плебса. Поэтому они вскоре отошли от восстания. Таким образом, силы восставших были незначительными. В сражении при Белой Горе близ Праги в ноябре 1620 г. войско повстанцев было наголову разбито армией австрийского императора Фердинанда II (1619 — 1637). Участники восстания понесли суровые наказания. У них были конфискованы имения. Преследование протестантов вызвало эмиграцию, в ходе которой Чехию покинуло более 30 тыс. семей ремесленников и до 20−25% феодалов. Покинули родину ученые, писатели, среди них знаменитый чешский педагог Ян Амос Коменский, который был епископом Общины чешских братьев. Онемечивание Чехии после поражения восстания еще более усилилось. Чехия окончательно утрачивает свою независимость.
Разорение чешских земель в период Тридцатилетней войны. Чешское восстание 1618−1620 гг. против Габсбургов совпало с началом Тридцатилетней войны (1618−1648), в ходе которой австрийские и испанские Габсбурги в союзе с Римом попытались создать в Европе могущественную католическую империю. Против притязаний Габсбургов выступили Франция, Швеция, Дания, Голландия, Россия и другие страны. Чешские земли на протяжении войны были одной из территорий, где велись военные действия.
Тридцатилетняя война нанесла государству исключительно тяжелый урон, В Чехии было разорено 80 городов, 813 сел и 215 замков. В Моравии были разграблены 22 города, 333 села и 63 замка. К 1648 г. население Чехии уменьшилось с 1 млн. 700 тыс. человек до 950 тыс., в Моравии — с 900 тыс. до 600 тыс. человек. Длительное время после окончания Тридцатилетней войны Чехия не могла оправиться от постигшего ее разгрома и упадка.
