Военно-транспортный факультет учреждения образования «Белорусский государственный университет транспорта» создан в соответствии с Постановлением Совета Министров Республики Беларусь № 775 от 11 июня 2003 года.
Факультет формировался на базе военной кафедры созданной в 1953 году и заложившую славные традиции обучения и воспитания военным и военно-специальным дисциплинам первым начальником факультета был назначен полковник Левтринский В.В.
С 1 сентября 2004 года были образованы две кафедры: общевойсковой подготовки и военно-специальной подготовки.
С этого времени факультет осуществляет подготовку офицеров для Вооруженных Сил по специальности «Управление подразделениями железнодорожных войск» (квалификация — специалист по управлению — инженер) по направлениям.
В 2005 году при непосредственном участии подразделения Департамента железнодорожных войск (войсковая часть 83 469) в поселке Березки был создан Учебно-полевой центр факультета.
Подготовка офицеров для замещения первичных офицерских должностей (с присвоением звания «лейтенант») производится со сроком обучения 5 лет. Обучаемые именуются курсантами.
На период обучения курсанты обеспечиваются всеми видами довольствия, на них распространяются все льготы, предусмотренные для военнослужащих, выплачивается стипендия. Первые два года обучения предусматривается проживание в казарме. Старшекурсники (3 — 5-й курсы) проживают в общежитии. Два раза в год (в зимний и летний периоды) курсантам предоставляется каникулярный отпуск продолжительностью 14 и 30 суток.