Биологические особенности автохтонных и аллохтонных бактерий из озера Шира и маркеры антропогенного воздействия на водную экосистему
Диссертация
В настоящее время в микробной экологии наблюдается возрастание интереса к исследованию сезонного распределения различных физиологических групп бактериопланктона по акваториям экосистем, а также его генетического разнообразия. Это связано со стремлением выявить важнейших бактериальных представителей автохтонной микрофлоры, а также понять их роль в функционировании и поддержании устойчивости… Читать ещё >
Содержание
- ВВЕДЕНИЕ
- Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
- 1. 1. Влияние абиотических факторов на бактерии природных водных экосистем
- 1. 2. Влияние биотических факторов на бактерии природных водных экосистем на примере микроводорослей
- Д
- 1. 3. Влияние антропогенных на бактерии природных водных экосистем
- 1. 4. Проблемы мониторинга антропогенной нагрузки на природные экосистемы
- Глава 2. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
- Глава 3. ВЛИЯНИЕ ЕСТЕСТВЕННЫХ ФАКТОРОВ НА РАСПРЕДЕЛЕНИЕ АВТОХТОННЫХ И АЛЛОХТОННЫХ БАКТЕРИЙ В ОЗ. ШРА
- Глава 4. ВЛИЯНИЕ АНТРОПОГЕННЫХ ФАКТОРОВ НА АВТОХТОННЫЕ И АЛЛОХТОННЫЕ БАКТЕРИИ ИЗ ОЗ. ШИРА
- 4. 1. Сезонная динамика устойчивости к ампициллину и канамицину автохтонных и аллохтонных бактерий из оз. Шира
- 4. 2. Оценка влияния природных и антропогенных факторов на устойчивость к антибиотикам автохтонных и аллохтонных бактерий из оз. Шира
- Глава 5. ВОЗМОЖНЫЕ МЕХАНИЗМЫ УСТОЙЧИВОСТИ БАКТЕРИЙ ИЗ ОЗ. ШИРА К ФАКТОРАМ СРЕДЫ
- 5. 1. Плазмидный профиль бактерий из оз. Шира
- 5. 2. Исследование горизонтальной миграции природной и рекомбинантной плазмид в модельных условиях
Список литературы
- Анисимова Л.А., Воронин A.M. Детерминируемая плазмидами грамотрицательных бактерий устойчивость к металлам//Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 1994. — N. 3.- С. 3−9.
- Балашов С.В., Балашова Н.В, Воронин A.M. Плазмидный контроль деградации n-толуолсульфоновой кислоты штаммом Comamonas testosteroni BS1310//Микробиология. 1997. — Т.66. N. 1. — С. 65−69.
- Башенин В.А. Курс частной эпидемиологии. Л.: Медгиз., 1955. С. 556.
- Безбородое А. М. Биохимические основы микробиологического синтеза. М.: Легкая и пищевая промышленность. — 1984. С. 304.
- Воронин A.M. Выделение и характеристика микроорганизмов -деструкторов полициклических ароматических углеводородов//Микробиология. 1997. — Т. 66. N. 2. — С. 269−272.
- Вельков В.В. Новые представления о молекулярных механизмах эволюции: стресс повышает генетическое разнообразие//Молекулярная биология. 2002. — Т. 36. N. 2. — С. 1−9.
- Ганин B.C., Хунданов Л. Е. О роли вибрионов Эль-Тор в эпидемиологии холеры//ЖМЭИ. 1967. — N. 11. — С. 37−93.
- Головлев Е.Л. Другое состояние неспорулирующих бактерий//Микробиология. 1998. — Т. 67. N. 6. — С. 725−735.
- Головченко Н.П., Чувильская Н. А., Акименко В. К. Регуляция биосинтеза целлюлолитических ферментов и начальных ферментов катаболизма глюкозы и целобиозы у Clostridiumthermocellum//Mmpo6uonorw. 1986. — Т. 55. Вып. 1. — С. 31−33.
- Гольдман И.Л., Кадулин С. Г., Разин С. В. Трансгенные сельскохозяйственные животные: экспрессия чужеродныхгенов//Биотехнология. 1996. — N. 9. — С. 3−23.
- Голышин П.Н., Гузев B.C. Роль минеральных солей и цАМР в утилизации почвенными микроорганизмами полимерных субстратов//Вестн. Моск. Ун-та. 1992. — Сер. 17. N. 2. — С. 56−62.
- Горленко В.М., Дубинина Г. А., Кузнецов С. И. Экология водных микроорганизмов. М.: Наука. 1977. С. 287.
- Гринбаум Ф.Т. Изменчивость патогенных микробов в зависимости от условий их обитания//Сб. Труды конференции по направленной изменчивости и селекции микроорганизмов. М.: Изд-во АН ССР, 1952. -С. 92−99.
- Громов Б.В., Павленко Г. В. Экология бактерий. JL: Изд-во ЛГУ. -1989. С. 246.
- Гузев B.C., Халимов Э. М., Волде М. И., Куличевская И. С. Регуляторное действие глюкозы на активность углеводородокисляющих микроорганизмов в почве//Микробиология. 1997. — Т. 66. N. 2. — С. 154−159.
- Дегерменджи Н.Н., Зотина Т. А., Толомеев А. П. Структурно-функциональные компоненты планктонного сообщества экосистемы озера Шира (обзор и эксперименты)//Сибирский экологический журнал. 1996. -N. 5. — С. 439−452.
- Егоров Н.С. Основы учения об антибиотиках /М.: «Высшая школа», 1979. С. 545.
- Ермольева З.В. Холера. М.: Медгиз, 1942. С. 123.
- Ильина Т.С. Структурная организация и механизмы перемещений генных кассет, кодирующих резистентность к антибиотикам и факторы вирулентности бактерий//Молекулярная генетика микробиология и вирусология. 2001. — N. 1. — С. 3−12.
- Кашнер Д. Жизнь микробов в экстремальных условиях. М.: Мир, 1981. С. 365.
- Киктенко B.C. Лептоспирозы человека. М.: Медгиз, 1954. С. 211. Кочетков В. В., Балакшина В. В., Мордухова Е. А., Воронин A.M. Плазмиды биодеградации нафталина в ризосферных бактериях рода PseudomonasllMmvpo5\onoTviK. 1997. — Т. 66. N. 2. — С. 211−216.
- Кондратьева JI.M., Гаретова JI.A., Имранова E.JL, Кириенко О. А., Чухлебова J1.M., Каретникова Е. А. Микроорганизмы в экосистемах Приамурья. Владивосток: Дальнаука, 2000. С. 198.
- Кошелева И.А., Балашова Н. В., Измалкова Т. Ю., Филонов А. Е., Соколов C.JL, Слепенькин А. В., Воронин А. М. Деградация фенантрена мутантными штаммами-деструкторами нафталина//Микробиология. 2000. -Т. 69. N. 6. — С. 633−669.
- Курлов М. Т. Курорт оз. Шира. Томск, ТГУ, 1927.
- Кусковский B.C., Кривошеее А. С. Минеральные озера Сибири. Новосибирск: Наука, 1989. С. 200.
- Лакин Г. Ф. Биометрия. Учебное пособие для университетов и педагогических институтов.- М.: «Высшая школа», 1973. С. 343.
- Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. М.: Мир, 1984. С. 479.
- Матвеева Н.И., Воронина Н. А., Борзенков И. А., Плакунов В. К., Беляев С. С. Состав и количественное содержанием осмопротекторов в клетках нефтеокисляющих бактерий при разных условияхкультивирования/УМикробиология. 1997. — Т. 66. N. 1. — С. 32−37.
- Методы общей бактериологии / Под ред. Герхардта Ф. и др. М.: Мир. 1983, Т. 1.С. 535.
- Мирзоев Г. Г. Выживаемость и изменчивость дизентерийных бактерий Флекснера во внешней среде//ЖМЭИ. 1962. — N. 7. — С. 68−91.
- Мойсеенко Н.Н. Устойчивые к антибиотикам клебсиеллы в прибрежной воде каспийского и Балтийского морей//Антибиотики и химиотерапия. 1990. — Т. 35. — С.24−26.
- Никитин Ж.И., Слабова О. И., Питрюк И. А., Сорокин В. В., Оранская М. С. Отклик на температурные условия психроактивных олиготрофных бактерий с необычным составом клеточных липидов//Микробиология. 1998. -Т. 67. N. 1.-С. 65−72.
- Оксиюк О. П., Жукинский В. Н., Брагинский Л. П., Линник П. Н., Кузьменко М. И., Клинус В. Г. Комплексная экологическая классификация качества поверхностных вод суши//Гидробиологический журнал. 1993. -Т. 29. N. 4. — С. 62−74.
- Определитель бактерий Берги / Под ред. Хоулта Дж. и др. М.: Мир. 1997. С. 368.
- Остроумов С.А. Критерии экологический опасности антропогенных воздействий на биоту: поиски системы//ДАН. 2000. — Т.371. N. 6. -С. 844−846.
- Отчет о научно-исследовательской работе «экспертиза, мониторинг, прогноз качества воды и лечебных свойств уникального Сибирского озера Шира (сводный, промежуточный, этап 2000 года) ФЦП „Интеграция“ per. Л» 73. С. 318.
- Парначев В.П., Вишневецкий И. И. «О целевой программе по оздоровлению экологической обстановки природного комплекса озеро Шира»//В сб.: Медико-биологические и экологические проблемы курортного комплекса озера Шира. Томск, 1997. — С. 114−124.
- Пименов Н.В., Русанов И. И., Карначук О. В., Рогозин Д. Ю., Брянцева И. А., Лунина О. Н., Юсупов С. К., Парначев В. П., Иванов М. В. Микробные процессы круговоротов углерода и серы в озере Шира (Хакасия)//Микробиология. 2003. — Т. 72. N. 2. — С. 221 -229.
- Прозоров А.А. Дифференцировка клеток и ее регуляция при генетической трансформации у бактерий//Микробиология. 1997.- Т. 66. N. 1.-С. 5−13.
- Проценко О.А., Сергеева Г. М. Некоторые экспериментальные данные о размножении холерных вибрионов в воде//Проблемы особо опасных инфекций. 1969.- N. 3. — С. 123−126.
- Пунтус И.Ф., Филонов А. Е., Кошелева И. А., Гаязов P.P., Карпов А. В., Воронин A.M. Выделение и характеристика микроорганизмов-деструкторов полициклических ароматических углеводородов//Микробиология. 1997. -Т. 66. N. 2. — С. 269−272.
- Сахаровский И.Г., Барышникова Л. М., Крюков Д. В., Козловский А. Г. Определение состава экзогенных органических кислот Rhodococcus minimus В293 по данным Н-ЯМР//Биотехнология. 1989. — Т. 5. — С. 82−87.
- Сиренко Л.А., Козицкая В. Н. Биологически активные вещества водорослей и качество воды. Киев: Наукова думка. 1988.
- Слабова О.И., Оранская М. С., Никитин Д. И. Развитие олиготрофов при низкой температуре//Микробиология. 1993. — Т. 62. N. 6. — С. 1072−1078.
- Экологическая биотехнология: Пер. с англ. / Под ред. К. Ф. Форстера, Д.А., Дж. Вейза. Л.: Химия. 1990.
- Суходолец В.В. Природа адаптивных и генетических изменений: приспособленность и экологический потенциал//Генетика. 1998. — Т. 34. N. 12.-С. 1589−1596.
- Терских В.И. Лептоспирозы. М.: Изд-во АМН ССР. 1952. С. 56.
- Трунова О.В. Биологические факторы самоочищения водоемов и сточных вод. Л.: Наука. 1979.
- Чернина Г. П. О выживаемости Leptospira grippotyphosa в воде//ЖМЭИ. 1964. — N. 3. — С. 143−145.
- Четина Е.В. Влияние некоторых физиологических и генетических факторов на процесс перехода энтеротоксигенных штамов Escherichia coli в некультивируемое состояние//Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 1997. — N. 1. — С. 8−13.
- Шарыпова Л.А., Симаров Б. В. Перспективы конструирования и выпуска в окружающую среду генетически модифицированных штаммов клубеньковых бактерий//Генетика. 1994. — Т. 30. N. 11. — С. 1435−1457.
- Швинка Ю.Э. Энергетическая эффективность метаболизма бактерий//Успехи микробиологии. 1992. — Т.25. — С. 211−237.
- Bacterial genetics in natural environments//Eds. Fry J.D., Day M.J. L.: Chapman and Hall. 1990.
- Backhaus Т., Grimme LH. The toxicity of antibiotic agents to the luminescent bacterium Vibrio fischerillChemosphere. 1999. — V. 38. N. 14. -P. 3291−301.
- Bale M.J., Day M.J., Fry J.C. Novel method for studying plasmid transfer in undisturbed river epilithon//Appl. Environ. Microbiol. 1988. — V. 54. P. 2756−2758.
- Barcina I., Arana I., Iriberri J., Egea L. Factors affecting the survival of Escherichia coli in a river//Hydrobiologia. 1986. — V. 141. — P. 249−253.
- Barkay T, Schaefer J. Metal and radionuclide bioremediation: issues, considerations and potentiaIs//Curr. Opin. Microbiol. 2001. — V. 4. N. 3. — P.318−23.
- Beaudeau P., Tousset N., Bruchan F., Lefevre A., Taylar H.D. In situ measurement and statistical modeling of Escherichia coli decay in small rivers//Water Res. 2001. — V. 35. N. 13. — P. 3168−3178.
- Beil S., Timmis K.N., Pieper D.H. Genetic and biochemical analyses of the tec operon suggest a route for evolution of chlorobenzene degradation genes// J. Bacteriol. 1999.-V. 181. N. 1. — P. 341−346.
- Ben-Israel O., Ben-Israel H., Ulitzur S. Identification of toxic chemicals by use of Escherichia coli carrying lux genes fused to stress promoters//Appl. Environ. Microbiol. 1998. — V. 64. N. 11. — P. 4346−4352.
- Bogosian G., Morris P. J. L., O’Neil J. P. A mixed culture recovery method indicated that enteric bacteria do not enter the viable but nonculturable state//Appl. Environ. Microbiol. 1998. — V. 64. N. 5. — P. 1736−1742.
- Briggs C., Fratamico. Molecular characterization of an antibiotic resistance gene cluster of Salmonella typhimurium DT104//Antimic. Agent Chemoterapy. -1999.- V. 43. N. 4. P. 846−849.
- Brown F., Cuthberston W.F.J., Fogg G.E. Vitamin Bi2 activity of Chlorella vulgaris Beij and Anabena cylindrical Lemm//Nature. 1956.- V. 177. N. 4500.-P. 188.
- Chandrasekaran S., Venkatesh В., Lalithakumari D. Transfer and expression a multiple antibiotic resistance plasmid in marine bacteria//Curr. Microbiol. 1998. — V.37.-P. 347−351.
- Chao W.L., Feng R.L. Survival of genetically engineered Escherichia coli in natural soil and river water//J. Appl. Bacteriol. 1990. — V. 68. N. 4. -P. 319−325.
- Chopra I., Roberts M. Tetracycline antibiotics: mode of action, applications, imolecular biology and epidemiology of bacterial resistance//Microbiol. Molec. Biol. Rev. 2001. — V. 659. N. 2. — P. 232−260.
- Cooke M.D. The role of mutatirs in the emergence of antibiotic-resistant bacteria //Antimicrob. Agents Chemother. 1976. — V. 9. — P. 879−884.
- Conan P., Turley C., Stutt E., Pujo-Pay M., Van Wambeke F. Relationship between phytoplankton efficiency and the proportion of bacterial production to primary production in the Mediterranean sea//Aquat. Microb. Ecol. 1999. -V. 17.-P. 131−144.
- Dabizzi S., Ammannato S., Fani R. Expression of horizontally transferred gene clusters: activation by promoter-generating mutations//Res.Microbiol. 2001. — V. 152. N. 6.-P. 539−549.
- Davison J. Genetic exchange between bacteria in the environment//Plasmid.-1999.-V. 42. N. 2.-P. 73−91.
- De Witt N.D., Natalie D. Marker outgrow antibiotic resistance//Nat. Biotechnol. 2000. — V. 17. N. 9. — P. 840.
- Doucette G.J. Interaction between bacteria and harmful algae: a review//Nat. Toxins. 1995. — V. 3. N. 2. — P. 65−74.
- Doust JL, Schmidt M, Doust LL. Biological assessment of aquatic pollution: a review, with emphasis on plants as biomonitors//Biol. Rev. Phios. Soc. 1994. -V. 69. N. 2.-P. 147−86.
- Droge M., Puhler A., Selbitschka W. Horizontal gene transfer among bacteria in terresterial and aquotic habitats as assessed by microcosms and field studies//Biol. Fertil. Soils. 1999. — V. 29. — P. 221−245.
- Droop M.R. Cobalamin requirement in ChrysophyceaelГЫature. 1954. -V. 174.N. 4428.-P. 520−521.
- Eisen J.A. Horizontal gene transfer among microbial genomes: new insights from complete genome analysis//Curr. Opin. Genet. Dev. 2000. — V. 10. N. 6. — P. 606−611.
- Esteve-Nunez A., Caballero A., Ramos J.L. Biologocal degradation of 2,4,6-trinitrotoluene//Microb. Molec. Biol. Rev. -2001. V. 65. N. 3. — P. 335−352.
- Fairey E.R., Ramsdell J.S. Reporter gene assays for algal-derived toxins//Nat. Toxins. 1999. — V. 7. N. 6. — P. 415−421.
- Feler G., Narinx E., Arpigny J.L., Aittaleb M., Baise E., Genicot S., Gerdey C. Enzymes from psychrophilic organisms//FEMS Microbiol. Rev. 1996. — V. 18. -P. 189−202.
- Fluit A.C., Schits F.J. Class 1 integrons, gene cassettes, mobility, end epidemiology//Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 1999. — V.18. N. 11. — P. 761 770.
- Froechner K., Backhaus Т., Grimme L.H. Bioassays with Vibrio fischeri for the assessment of delayed toxicity//Chemosphere. 2000. — V. 40. N. 8. — P. 821 828.
- Goldsmith M., Sarov-Blat L., Livneh Z. Plasmid-encoded MucB protein is a DNA polymerase (pol RI) specialized for lesion bypass in the presence of MucA', RecA, and SSB//Proc. Nat. Acad. Sci USA. 2000. — V. 97. N. 21. — P. 1 122 711 231.
- Gomes-Lus R. Evolution of bacterial resistance to antibiotic during the la? t three decades//Int. Microbiol. 1998. — V. 1. — P. 279−284.
- Goni-Urriza M., Capdepuy M., Arpin С., Raymond N., Caumette P., Quentin C. Impact of a Urban effluent • on antibiotic resistance of riverine Enterobacteriaceae and Aeromonas spp.//App. Environ. Microbiol. 2000. -V. 66. N. 1.-P. 125−132.
- Gordon D.M. Rate of plasmid transfer among Escherichia coli strains isolated from natural populations//J. Gener. Microb. 1992. — V. 138. — P. 17−21.
- Grabov W.O.K., Prozesky O.W. Drug resistance of coliform bacteria in hospital and city sewage//Antimicrob. Agents Chemother. 1973. — N. 3. — P. 175 180.
- Grass G., Grobe C., Nies D. Regulation of the cnr cobalt and nickel resistance determinant from Ralstonia sp. strain CH34//J. Bacteriology. 2000. — V. 182. N. 5. — P. 1390−1398.
- Grossart Hans-Peter. Interactions between marine bacteria and diatoms {Cylindrotheca fusiformis, Nitzschia laevis, and Thalassiosira weissJJogii) incubated under various conditions in the lab//Aquat. Microb. Ecol. 1999. -V. 19.-P. 1−11.
- Guardabassi L., Petersen A., Olsen J.E., Dalsgaard A. Antibiotic resistance in Acinetobacter spp. isolated from sewers from a hospital and a pharmaceutical plant//Appl. Environ. Microbiol. 1998. — V. 64. N. 9. — P. 3499−3502.
- Guerrini F., Mazzotti A., Boni L., Pistocchi R. Bacterial-algal interactions in polysaccharide production//Aquat. Microb. Ecol. 1998. — V. 15. — P. 247−253.
- Gurung T.B., Urabe J., Nakanishi M. Regulation of the relationship between phytcplankton Scenedesmus acutus and heterotrophic bacteria by the balance of light and nutrients//Aquat. Microb. Ecol. 1999. — V. 17. — P. 27−35.
- Hayatsu M., Hirano M., Nagata T. Involvement of two plasmids in the degradation of Carbaryl by Arthrobacter sp. strain RC100//Appl. Enviton. Microbiol. 1999.-V. 65.N.3.-P. 1015−1019.
- Heinmets F., Taylor W.W., Lehman J.J. The use of metabolites in the restoration of the viability of heat and chemical inactivated Escherichia colill J. Bacteriol. 1953. — V. 67. — P. 5−14.
- Hernandez A., Mellado R.P., .Martinez J.L. Metal accumulation and vanadium-induced multidrug resistance by environmental isolates of Escherichia hermannii and Enterobacter cloacae//Appl. Environ. Mocrobiol. 1998. — V. 64. N. 11.-P. 4317−4320.
- Ho M-W., Traavik Т., Olsvik Т., Tappeser В., Howard C.V., von Weizsacker C., McGavin G.C. Gene technology and gene ecology of infections disease//Microb. Ecol. Health and Disease. 1998. — V. 10. — P. 3−11.
- Jacobs M.J., Tynkkynen S., Sibacov M. Highly bioluminescent Streptococcus thermophilius strain for the detection of dairy-relevant antibiotics in milk//Appl. Microbiol. Biothechnol. 1995. — V. 44. — P. 405−412.
- Joux F., Lebaron P., Trousseller M. Succession of cellular states in a Salmonella typhimurium population during starvation in artifical seawater microcosms//FEMS Microbiol. Ecol. 1997. — V. 22. — P. 65−76.
- Kamiyama Т., Itakura S., Nagasaki K. Changes in microbial loop components: effects of a harmful algal bloom formation and its decay//Aquat. Microb. Ecol. 2000. — V. 21. — P. 21−30.
- Kaprelyants A.S., Gottschal J.C., Kell D.B. Dormancy in non-sporulating bacteria//FEMS Microbiol. Rev. 1993. — V. 140. — P. 271−286.
- Kolling G.L., Matthews K.R. Examination of recovery in vitro and in vivo of nonculturable Escherichia coli 0157: H7//Appl. Environ. Microbiol. 2001. -V. 67. N. 9.-P. 3928−3933.
- Kopylov A.I., Kosolapov D.B., Degermendzhy N.N., Zotina T.A., Romanenko A.V. Phytoplankton, bacterial production and protozoan bacterivory in stratified, brackish-water Lake Shira (Khakasia, Siberia)//Aquat. Ecol. 2002. -V. 36.-P. 205−217.
- Kormas К. Ar., Kapiris К., Thessalou-Legaki M., Nicolaidou A. Quantitative relationships between phytoplankton, bacteria and protist in an Aegean semi-enclosed embayment (Maliakos Gulf, Greece)//Aquat. Microb. Ecol. 1998. -V. 15.-P. 255−264.
- Kragelund L., Nibroe O. Culturability and expression of outer membrane proteins during carbon, nitrogen, or phosphorus starvation of Pseudomonas putida DF14//Appl. Environ. Microbiol. 1994. — V. 60. — P. 2944−2948.
- Krstulovic N., Pucher-Petkovic Т., Solic M. The relation between bacterioplancton and phytoplankton production in the mid Adriatic Sea//Aqua+. Microb. Ecol. 1995. — V. 9. — P. 41−45.
- Kruse H., Sorum H. Transfer of multiple drug resistance plasmids between bacteria of diverse origins in natural microenvironments//Appl. Environ. Microbiol. 1994.-V. 60. N. 11.-P. 4015−4021.
- Majewski J., Cohan F.M. Adapt globally, act locally: the effect of selective sweeps on bacterial sequance diversity//Genetics. 1999. — V. 152. N. 4. — P. 14 591 474.
- Mary P., Defives C., Hornez J.P. Occurrence and multiple antibiotic resistance profiles of non-fermentative gram-negative microflora in five brands of non-carbonated French bottled spring water//Microb. Ecol. 2000. — V. 39. N. 4. -P. 322−329.
- Matic I., Taddei F., Radman M. Genetic barriers among bacteria//Trends Microbiol. 1996. — V. 4. N. 2. — P. 69−72.
- Matic I., Taddei F., Radman M. No genetic barriers between Salmonella enterica serovar typhimurium and Escherichia coli in SOS-induced mismatch repair-deficient cells//J. Bacteriol. 2000a. — V. 182. N. 20. — P. 5922−5924.
- Matic I., Taddei F., Radman M. Interspecies recombination and mismatch repair. Generation of mosaic genes and genomes//Methods Mol. Biol. 20 006. — V. 152.-P. 149−157.
- McArthur J.V., Tuckfield R.C. Spatial patterns in antibiotic resistance among stream bacteria: effects of industrial pollution//Appl. Environ. Microbiol. 2000. -V. 66. N. 9. — P. 3722−3726.
- Miller J.H. Experiments in Molecular Genetics//Cold Spring Harbor lab., New York.: Gold Spring Harbor. 1972. P. 436.
- Miller-Niklas С., Hernde G.J. Dynamics of bacterioplancton during a phytoplankton bloom in the high Artie waters of the Franz Joseph Land archipelago//Aquat. Microb. Ecol. 1996. — V. 11. — P. 111−118.
- Moiseenko NN. Antibiotic-resistant enterobacteria in sewage and the water of surface reservoirs//Antibiot. Khimioter. 1994. — V. 39. N. 3. — P.64−68.
- Moiseenko NN. Opportunistic bacteria in the seawater of recreational areas//Zh. Mikrobiol. Epidemiol. Immunobiol. 1994a. — N. 1. — P. 8−11.
- Moiseenko NN. Antibiotic-resistant enterobacteria in sewage and the water of surface reservoirs//Antibiot. Khimioter. 19 946. — V. 39. N. 2. — P. 64−68.
- Morishita H. Genetic regulation on salt resistance in halophilic bacteria//In S.R. Caplan and M. Ginzburg (ed), Energetics and structure of halophilic microorganisms. Elsevier//North-Holland Biomedical Press, Amsterdam, The Netherlands. 1978. P.599−606.
- Muella A., Arana I., Justo J.I., Seco C., Barcina I. Changes in DNA content and cellular death during a starvation-survival process of Escherichia coli in river water//Microb. Ecol. 1999. — V. 37. — P. 62−69.
- Naik G.A., Bhat L.N., Chopade B.A., Lynch J.M. Transfer of broad-host-range antibiotic resistance plasmid in soil microcosms//Curr. Microbiol. 1994. — V. 28.-P. 209−215.
- Nedwell D.B. Effect of low temperature on microbial growth: cowered affinity for substrates limits growth at low temperature//FEMS Microbiol. Ecol. -1999.-V. 30.-P. 101−111.
- Netherwood Т., Gilbert H.J., Parker P. S., O’Donnell A.G. Probiotics shown to change bacterial community structure in the avian gastrointestinal tract//Appl. Environ. Microbiol. 1999. — V. 65. — P. 5134−5139.
- Nield B.S., Holmes A.J., Gillings M.R., Recchia G.D., Mabbutt B.C., Nevalainen K.M., Stokes H.W. Recovery of new integron classes from environmental DNA//FEMS Microb. Lett. 2001. — V. 195. N. 1. — P. 59−65.
- Nystrom T. The trials and tribulations of growth arrest//Trends Microbiol. -1995. V. 3. — P. 131−136.
- Oliver J.D., Hite F., McDouglad D., Anbon N.L., Sipson L.M. Entry into and resuscitation from the viable but nonculturable state by Vibrio vulnificus in an estuarine environment//Appl. Environ. Microbiol. 1995. — V. 61. N. 7. — P. 26 242 630.
- Oliver J.D. The viable but non-culturable state in the human pathogen Vibrio vulmificusHFEMS Microbiol. Lett. 1995. — V. 133. — P. 203−208.
- O’Morchoe S.B. Oqunseitan O., Sayler G.S., Miller R.V. Conjugal transfer of R68.45 and FP5 between Pseudomonas aeruginosa trains in a freshwater environment//Appl. Environ. Microbiol. 1988. — V. 54. — P. 1923−1929.
- Oren A. Diversity of halophilic microorganisms: environments, phylogeny, physiology and application//!. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2002. — V. 28. N. 1. — ' P. 56−63.
- Paget E., Simonet L.J., Monrozier P. Adsorption of DNA on clay minerals: protection against DNAse I and influence on gene transfer//FEMS Microbiol. Lett. 1992.-V. 97.-P. 31−40.
- Patridge S.R., Brown H.J., Stokes H.W., Hall R.M. Transposons Tnl696 and «
- Tn21 and their integrons In4 and In2 have independent origins//Antimicrob. Agents Cheother. 2000. — V. 45. N. 4. — P. 1263−1270.
- Partridge S.R., Brown H.J., Stokes H.W., Hall R.M. Transpsons Tnl696 and Tn21 and their integrons In4 have independent origins//Antimicrob. Agents Chemother. 2001. — V. 45. N. 4. — P. 345−350.
- Paul J.H. Microbial gene transfer an ecological perspective//J. Molec. Microbiol. Biotechnol. 1999. — V. 1. N. 1. — P. 45−50.
- Ploy M.C., Lambert Т., Couty J.P., Denid F. Integrons: an antibiotic resistance gene capture and expression system//Clin. Chem. Lab. Med. 2000. -V. 38. N. 6.-P. 483−487.
- Poirel L., Laurent F., Naas Т., Labia R., Boiron P., Nordmann P. Molecular and biochemical analysis of AST-1, a class a beta-Iactamase from Nocardia asteroids Sensu Stricto//Antimicrob. Agents Chemother. 2001. — V. 45. N. 3.- P. 878−882.
- Radu S., Mutalib S.A., Rusul G., Hassan Z., Yeang L.K. Molekular characterization of Salmonella weltervreden isolated from poultry: evidence of conjugal transfer of plasmid and antibiotic resistance//Microbios. 2001. — V. 104. N. 407. — P. 39−47.
- Randall L.P., Woodward M.J. Multiple antibiotic resistance (mar) locus in Salmonella enterica serovar typhimurium DT104//Appl Environ. Microbiol. -2001. V. 67. N. 3. — P. 1190−1197.
- Rice L.B., Carias L.L. Transfer if Tn5385, a composite, multiresistance chromosomal element from Enterococcus faecalislli. Bacteriol. 1998. — V. 180. N.3.-P. 714−721.
- Rice L.B. Tn916 family conjugative transposons and dissemination of antimicrobial resistance determinants//Antimicrob. Agent Cheother. 1998. -V.42.-P. 1871−1877.
- Roszak D.B., Colwell. Survival strategies of bacteria in natural environment//Microbiol. Rev. 1987. — V. 51. — P. 367−379.
- Ronchel MC, Ramos-Diaz MA,'Ramos JL. Retrotransfer of DNA in the rhizosphere//Environ. Microbiol. 2000. — V. 2. N. 3. — P. 319−23.
- Rontani J-F., Bonin P.C., Volkman J.K. Biodegradation of free phytol by bacterial communities isolated from marine sediments under aerobic and denitrifying conditions//Appl. Environ. Microbiol. 1999. — V. 65. N. 12. -P. 5484−5492.
- Rosenberg S.M. Evolving responsively: adaptive mutation//Nature Reviews. 2001.-V. 2.-P. 504−515.
- Samecka-Cymerman A., Kempers A.J. Bioindication of heavy metals with aquatic macrophytes: the case of a stream polluted with power plant sewages in Poland//Toxicol. Environ. Health. 2001. — V. 62. N. 1. — P. 57−67.
- Sayler G.S., Ripp S.A. Field applications of genetically engineered microorganisms for bioremediation processes//Curr. Opin. in Biotech. 2000. -V. П. — P.286−289.
- Schwedt G., Reiter C., Uthemann R., Grabert E. Development of an automated bacterial luminescence test for biomonitoring of environmental contaminants//Fresenius J. Anal Chem. 1997. — V. 359. — P. 155−160.
- Sedgwick S.G., Thomas S.M., Hughes V.M., Lodwick D., Strike P. Mutagenic DNA repair genes on plasmids from the 'pre-antibiotic era'//Mol. Gen. Genet. 1989. — V. 218. N. 2. — P. 323−329.
- Serhara V.T.N., Abraham A., Hansen I.A. Accumulation of Co58 -vitamin B12 by Euglena gracilis! IL Protzooe. 1961. — V. 8. N. 2. — P. 211−216.
- Signoretto C., Lleo M., Tafi M.C., Canepari P. Cell wall chemical composition of Enterococcus faecalis in the viable but nonculturable state//Appl. Environ. Microbiol. 2000. — V. 66. N. 5. — P. 1953−1959.
- Simon M., Glockner F.O., Amann R. Different community structure and temperature optima of heterotrophic picoplancton in various regions of the Southern Ocean //Aquat. Microbial Ecol. 1999. — V. 18. — P. 275−284.
- Simon M., Wunsch Chr. Temperature control of bacterioplanton growth in a temperate large lake//Aquat. Microbial Ecol. 1998. — V. 16. — P. 119−130.
- Sondergaard M., borcn N.H., Riemann B. Dynamics of biodegradable DOC produced by freshwater plankton communities//Aquat. Microb. Ecol. 2000. -V. 23. — P. 73−83.
- Shiba Т., Hill R.T., Straube W. L, Colwell R.R. Decrease in culturability of Vibrio cholerae caused by glucose//Appl. Environ. Microbiol. 1995. — V.61. -P. 2583−2588.
- Shetty R.S., Deo S.K., Shah P., Sun Y., Rosen B.P., Daunert S. Luminescence-based whole-cell-sensing systems for cadmium and lead using genetically engineered bacteria//Anal. Bioanal. Chem. 2003. — V. 376. N. 1. -P. 11−17.
- Smit E., Wolters A., van Elsas L.D. Generic stability, conjugal transfer and expression of heterologous DNA inserted into different plasmids an the genome of Pseudomonas fluorescens in soil//Rev. Microbiol. 1995. — V. 26. — P. 169−179.
- Stewart K.R., Koditchek L. Drug-resistance transfer in Escherichia coli in New York Blight sediment//Mar. Pollut. Bull. 1980. — V. 11. — P. 130−133.
- Takeyama H., Burgess G., Hiroaki S., Sode K., Matsunaga T. Salinity-dependent copy number increase of marine cyanobacterial endogenous plasmid//FEMS Microbiol. Lett. 1991. — V. 90. — P. 95−98.
- Tholozan J. L., Cappelier J. M., Tisser J. P., Delattre G., Federighi M. Physiological characterization of viable-but-nonculturable Campylobacter jejuni cells//Appl. Environ. Microbiol. 1999. — V. 65. N. 3. — P. 1110−1116.
- Toop E., Zhu H., Nour S.M., Houot S., Lewis M., Cuppels D. Characterization of atrazine-degrading Pseudaminobacter sp. isolated from Canadian and French agricultural soils//Appl. Environ. Microbiol. 2000. — V. 66. N. 7. — P. 2773−2782.
- Traavik Т., Olsvik Т., Tappeser В., Howard C.V., von Weizsacker C., McGavin G.C. Gene technology and gene ecology of infections disease//Microb. Ecol. Health and Disease. 1998. — V. l 0. — P. 3−11.
- Tran J.H., Jacoby G.A. Mechanism of plasmid-mediated quiolone resistance//Prot. Natl. Acad. Sci. USA. 2002. — V. 16. N. 8. — P. 5638−5642.
- Turner N.L., Horsburgh A., Paton G.L., Killhman K., Meharg A., Primrose S., Strachman N.J. A novel toxicity fingerprinting method for pollutant identification with /шг-marked biosensors//Environ. Toxicol Chem. 2001. — V. 20. N. 11.-P. 2456−2461.
- Van Elsas J.D., Govaeret J.M., Van Veen J.A. Transfer of plasmid FT30 between Bacillus in soil as influenced by bacterial population dynamic and soil conditions//Soil. Biol. Biochem. -.1987. N. 5. P. 639−647.
- Van Dolah F.M. Marine algal toxins: origins, health effects, and their increased occurrence//Environ. Health Perspect. 2000. V. 108. — P. 133−141.
- Van Dolah F.M., Ramsdell J.S. Review and assessment of in vitro detection methods for algal toxins//J. AOAC Int. 2001. V. 84. N.5. — P. 1617−1625.
- Velkov V.V. Environmental genetic engineering: Hope or hazard ?//Curr. Science. 1996. — V.70. — P.823−832.
- Velkov V.V. How environmental factors regulate mutagenesis and gene transfer in microorganisms//J. Biosci. i 999. — V. 24. N. 4. — P.529−559.
- Ventosa A., Nieto J., Oren A. Biology of moderately halophilic aerobic bacteria//Microbiol. Molec. Biol. Rew. 1998. — V. 602. N. 2. — P. 504−544.
- Vreland R.H. Mechanism of halotolerance in microorganisms//Cret. Rev. Microbiol. 1987. — V. 14. — P. 311−356.
- Vulic M., Donisio F., Taddei F., Radman M. Molecular keys to specification: DNA polymorphism and control of genetic exchange in enterobacteria//Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1997. — V. 94. — P. 8763−9787.
- De Witt N.D., Natalie D. Marker outgrow antibiotic resistance//Nat. Biotechnol. V. 17. N. 9. — P. 840.
- White DG, McDermott PF Biocides, drug resistance and microbial evolution//Curr. Opin. Microbiol. 2001. — V. 4. N. 3. — P. 313−317.
- Wiggins B.A., Andrews R.W., Conway R.A., Corr C.L., Dobratz E.J., Dougherty D.P., Eppard J.R., Knupp S.R., Limjoco M.C., Mettenburg J.M.,
- Rinehardt J.M., Sonsino J., Torrijos- R.L., Zimmerman M.E. Use antibiotic resistance analysis to identify nonpoint sources of fecal pollution//Appl. Environ. Microbiol. 1999. — V. 65. N. 8. — P. 3483−3486.
- Wierman J., Liebaert C.A., Smith Т., Summers A.O. Association of mercury resistance with antibiotic resistance in the gram-negative fecal bacteria of primates//Appl. Environ. Microbiol. 1997. — V. 63. N. 11. — P. 4494−4503.
- White D.G., McDermott P.F., Biocides, drug resistance and microbial evolution//Curr. Opin. Microbiol. 2001. — V. 4. N. 3. — P. 313−317.
- Woegerbauer M., Jenni В., Thalhammer F., Graninger W., Burgmann H. Natural genetic transformation of clinical isolates of Escherichia coli in urine and water//Appl. Environ. Microbiol. 2002. — V. 68. N. 1. — P. 440−443.
- Xu X., Zhang M., Liao P. Analysis of bacterial resistance to antibiotics in a burn ward//Zhonghua Shao Shang Za Zhi. 2001. — V. 2. — P. 83−87.
- Yang Y., Yao J., Hu S., Qi Y. Effects of agricultural chemicals on DNA sequence diversity of soil microbial community: a study with RAPD marker//Microb. Ecol. 2000. — V. 39. N. 1. — P. 72−79.
- Zhontang Yu., Stewart G.R., Mohn W.W. Apparent contradiction: psychrotolerant bacteria from hydrocarbon-contaminated Arctic tundra soils that degrade diterpoinds synthesized by trees//Appl. Environ. Microbiol. 2000. -V. 66. N. 12.-P. 5148−5154.
- Zotina T.A., Tolomeev A.P., Degermendzhy N.N. Lake Shira, a Siberian salt lake: ecosystem structure and function. 1: Major physico-chemical and features/Ant. J. Salt Lake Res. 1999. — N. 8. — P. 211−232.