Локализация транспортного белка гордеивируса в ядрышке и его взаимодействие с белками ядрышка и телец Кахаля
Диссертация
Показано, что транспортный белок ТБГ1 гордеивируса полулатентного вируса мятлика, слитый с зеленым флуоресцентным белком, способен локализоваться в ядрышке эпидермальных клеток N. benthamiana при индивидуальной экспрессии (в отсутствии других вирусных белков). Показано, что сигналы, необходимые для локализации белка ТБГ1 в ядре и ядрышке, картируются в составе неупорядоченного N-концевого домена… Читать ещё >
Содержание
- СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
- ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
- 1. Общая характеристика ядра и ядерных компартментов
- 1. 1. Ядро
- 1. 2. Ядрышко
- 1. 2. 1. Фибриллари н
- 1. 2. 2. Нуклеолин
- 1. 2. 3. Белок В
- 1. 2. 4. Дополнительные функции ядрышка
- 1. 3. Тельца Кахаля
- 2. Ядрышко и вирусная инфекция
- 2. 1. Взаимодействие вирусспецифических белков вирусов человека и животных с белками ядра и ядрышка
- 2. 2. Локализация вирусспецифических белков вирусов растений в ядрышке клеток
- 3. Сигналы ядерной и ядрышковой локализации в составе клеточных и вирусных белков
- 3. 1. Сигналы ядерной локализации
- 3. 2. Сигналы локализации в ядрышке
- 4. Вирусы растений, белки которых локализуются в ядрышках зараженных клеток
- 4. 1. Умбравирусы
- 4. 2. Вирусы с тройным блоком транспортных генов
- 4. 3. Потивирусы
- 4. 4. Другие белки вирусов растений, роль локализации которых в ядрышке не ясна
- 5. Особенности транспорта в растениях вирусов с тройным блоком транспортных генов на моделях гордеивирусов и помовирусов
- 5. 1. Характеристика гордеивирусов
- 5. 2. Характеристика помовирусов
- 5. 3. ТБГ гордеивирусного типа и транспорт вируса
- 5. 4. Свойства белков ТБГ1 гордеивирусного типа
- 5. 5. Транспортная форма гордеи-подобных вирусов
- 5. 6. Субклеточная локализация белков ТБГ
- 5. 7. Модель внутриклеточного и межклеточного транспорта вирусов с гордеи-подобным ТБГ
- 5. 7. 1. Модель транспорта гордеивирусов
- 5. 7. 2. Модель транспорта помовирусов
Список литературы
- Agranovsky A.A., Karasev A.V., Novikov V.K., Lunina N.A., Loginov S., Tyulkina L.G. Poa semilatent virus, a hordeivirus having no internal polydisperse poly (A) in the 3' non-coding region of the UNA genome// J Gen Virol. 1992, v. 73 (Pt 8), 2085−92.
- Ahmad Y., Boisvert F.M., Gregor P., Cobley A., Lamond A.I. NOPdb: Nucleolar Proteome Database-2008 update// Nucleic Acids Res. 2009, v. 37, Database issue, p. D181−4.
- Anandalakshmi R., Pruss G.J., Ge X., Marathe R., Mallory A.C., Smith T.H., Vance V.B. A viral suppressor of gene silencing in plants// Proc Natl Acad Sci USA. 1998, v. 95, 22, p. 13 079−84.
- Andersen J.S., Lam Y.W., Leung A.K., Ong S.E., Lyon C.E., Lamond A.I., Mann M. Nucleolar proteome dynamics// Nature. 2005, v. 433, 7021, p. 77−83.
- Andersen J.S., Lyon C.E., Fox A.H., Leung A.K., Lam Y.W., Steen H., Mann M., Lamond A.I. Directed proteomic analysis of the human nucleolus// Curr Biol. 2002, v. 12, l, p. 1−11.
- Bailey-Serres J., Sorenson R., Juntawong P. Getting the message across: cytoplasmic ribonucleoprotein complexes//Trends Plant Sci. 2009, v. 14, 8, p. 443−53.
- Barneche F., Steinmetz F., Echeverria M. Fibrillarin genes encode both a conserved nucleolar protein and a novel small nucleolar RNA involved in ribosomal RNA methylation in Arabidopsis thaliana// J Biol Chem. 2000, v. 275, 35, p. 27 212−20.
- Baunoch D.A., Das P., Browning M.E., Hari V. A temporal study of the expression of the capsid, cytoplasmic inclusion and nuclear inclusion proteins of tobacco etch potyvirus in infected plants//J Gen Virol. 1991, v. 72 (Pt 3), 487−92.
- Boisvert F.M., van Koningsbruggen S., Navascues J., Lamond A.I. The multifunctional nucleolus// Nat Rev Mol Cell Biol. 2007, v. 8, 7, p. 574−85.
- Boulon S., Westman B.J., Hutten S., Boisvert F.M., Lamond A.I. The nucleolus under stress// Mol Cell. 2010, v: 40, 2, p. 216−27.
- Bragg J.N. L.H.S., Jackson A.O. Hordeiviruses. Encyclopedia of Virology. 3rd ed, ed. B Mahy, Mvan Regenmortel.// Oxford: Elsevier Ltd., 2008, v. 2, 459−67.
- Brakke M.K., and Langenberg, W. G. Experience with Soil-borne Wheat Mosaic Virus in North America and Elsewhere.// Association of Applied Biologists, New York., 1988, v.
- Brigneti G., Voinnet O., Li W.X., Ji L.H., Ding S.W., Baulcombe D.C. Viral pathogenicity determinants are suppressors of transgene silencing in Nicotiana benthamiana// EMBO J. 1998, v. 17, 22, p. 6739−46.
- Brown J.W., Shaw P.J. Small nucleolar RNAs and pre-rRNA processing in plants// Plant Cell. 1998, v. 10, 5, p. 649−57.
- Bureau M., Leh V., Haas M., Geldreich A., Ryabova L., Yot P., Keller M. P6 protein of Cauliflower mosaic virus, a translation reinitiator, interacts with ribosomal protein L13 from Arabidopsis thalianaIIJ Gen Virol. 2004, v. 85, Pt 12, p. 3765−75.
- Canetta E., Kim S.H., Kalinina N.O., Shaw J., Adya A.K., Gillespie T., Brown J.W., Taliansky M. A plant virus movement protein forms ringlike complexes with the major nucleolar protein, fibrillarin, in vitro// J Mol Biol. 2008, v. 376, 4, p. 932−7.
- Carmo-Fonseca M., Mendes-Soares L., Campos I. To be or not to be in the nucleolus// Nat Cell Biol. 2000, v. 2, 6, p. E107−12.
- Carrero Z.I., Velma V., Douglas H-E., Hebert M.D. Coilin phosphomutants disrupt Cajal body formation, reduce cell proliferation and produce a distinct coilin degradation product//PLoS One. 2011, v. 6, 10, p. e25743.
- Carrington J.C. RNA silencing. Moving targets// Nature. 2000, v. 408, 6809, p. 150−1.
- Chang B.Y., Lin N.S., Liou D.Y., Chen J.P., Liou G.G., Hsu Y.H. Subcellular localization of the 28 kDa protein of the triple-gene-block of bamboo mosaic potexvirus// J Gen Virol. 1997, v. 78 (Pt 5), 1175−9.
- Chook Y.M., Blobel G. Karyopherins and nuclear import// Curr Opin Struct Biol. 2001, v. 11, 6, p. 703−15.
- Chu M., Lopez-Moya J.J., Llave-Correas C., Pirone T.P. Two separate regions in the genome of the tobacco etch virus contain determinants of the wilting response of Tabasco pepper//Mol Plant Microbe.Interact. 1997, v. 10, 4, p. 472−80.
- Cioce M., Lamond A.I. Cajal bodies: a long history of discovery// Annu Rev Cell Dev Biol. 2005, v. 21, 105−31.
- Collier S., Pendle A., Boudonck K., van Rij T., Dolan L., Shaw P. A distant coilin homologue is required for the formation of cajal bodies in Arabidopsis// Mol Biol Cell. 2006, v. 17, 7, p. 2942−51.
- Conti E., Kuriyan J. Crystallographic analysis of the specific yet versatile recognition of distinct nuclear localization signals by karyopherin alpha// Structure. 2000, v. 8, 3, p. 329−38.26