Тейхоевые кислоты актиномицетов
Исследование анионных полимеров клеточных стенок представляет интерес также с точки зрения таксономии микроорганизмов. Возможность использования с этой целью тейхоевых кислот обсуждается с момента их открытия, и уже в настоящее время признак «наличие — отсутствие» тейхоевых кислот входит в обязательные характеристики при описании некоторых грамположительных кокков. В порядке Actinomycetales… Читать ещё >
Содержание
- Список сокращений
I. Обзор литературы. Тейхоевые кислоты и другие анионные полимеры клеточных стенок грамположительных бактерий.
Глава 1. Тейхоевые кислоты актиномицетов и других грамположительных бактерий.
1.1. Тейхоевые кислоты клеточных стенок.
1.1.1. Тейхоевые кислоты I ипа.
1.1.2. Тейхоевые кислоты II типа.
1.1.3. Тейхоевые кислоты III типа.
1.1.4. Тейхоевые кислоты IV типа.
1.1.5. ТК актиномицето в.
1.1.6. Область связи ТК и пептидогликана.
1.2. Липотейхоевые кислоты.
1.2.1. ЛТК I типа.
1.2.2. ЛТК II типа.
1.2.3. Способность ЛТК образовывать в растворе мицеллы.
1.2.4. Локализация ЛТК.
Глава 2. Биосинтез тейхоевых кислот.
Глава 3. Локализация тейхоевых кислот.
Глава 4. Другие анионные полимеры клеточных стенок грамположительных бактерий.
4.1. Тейхуроновые кислоты.
4.2. Сахар-1-фосфатные полимеры.
4.3. Анионные полисахариды.
Глава 5. Свойства и функции тейхоевых кислот.
5.1. Участие ТК в катионном обмене.
5.2. Участие ТК в регуляции активтости автолитических ферментов.
5.2.1. Регуляция активности L-амидазы у пневмококков.
5.2.2. Регуляция активности автолизинов у Bacillus subtils.
5.3. Участие ТК в создании и регуляции плотности отрицательного заряда клеточной поверхности.
5.3.1. Поверхностный заряд микроорганизмов.
5.3.2. Роль отрицательного заряда в функциях тейхоевых кислот.
5.3.3. D-аланин — регулятор общего заряда клеточной поверхности.
5.4. Роль тейхоевых кислот в адгезии и вирулентности бактерий.
5.4.1. Связывание положительно заряженных пептидов.
5.4.2. Образование биопленок.
5.5. Иммунологические свойства ТК и ЛТК.
5.6. Рецепция фагов.
Глава 6. Тейхоевые кислоты как хемотаксономический признак в порядке Actinomycetales
6.1. Использование признака «наличие-отсутствие» тейхоевых кислот для дифференциации таксонов высших орядков.
6.2. Использование химической структуры и некоторых структурных элементов тейхоевых кислот для дифференциации актиномицетов на уровне вида.
6.2.1. Тейхоевые кислоты как маркер рода Nocardiopsis.
6.2.2. Тейхоевые кислоты в систематике рода Nocardioides.
6.2.3. Тейхоевые кислоты в систематике рода Streptomyces.
6.3. Гетерогенность рода Actinomadura. Необходимость поиска новых систематических подходов.
6.4. Род Brevibacterium. Первые попытки использования ТК в качестве хемотаксономических признаков.
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
II. Материалы и методы
Глава 1. Материалы.
Глава 2. Методы исследования.
2.1. Общие методы. Хроматография и электорофорез на бумаге.
2.2. Аналитические методы.
2.3. Получение клеточной стенки.
2.4. Экстракция тейхоевых кислот.
2.5. Очистка тейхоевых кислот:.
2.5.1. Ионообменная хроматография.
2.5.2 Электрофорез на бумаге.
2.5.3. Дробное осаждение этанолом.
2.5.4. Разделение олигомеров и гликозидов.
2.6. Методы определение первичной структуры тейхоевых кислот.
2.6.1. Кислотный гидролиз.
2.6.2. Щелочной гидролиз.121.
2.6.3. Ферментативный гидролиз.
2.6.4. Определение О-ацильных групп.
2.6.4.1. Аммонолиз тейхоевых кислот.
2.6.4.2. Гидроксиламинолиз тейхоевых кислот.
2.6.5. Определение соотношения Р-пс и Рфмэ в тейхоевых кислотах.
2.6.6. Определение молекулярной массы.
2.6.7. Определение абсолютной конфигурации рамнозы.
2.6.8. Определение абсолютной конфигурации маннита.
2.6.9. Масспектроскопия MALDI-TOF.
2.6.10. Масспектроскопия с бомбардированием тяжелыми атомами.
2.6.11. ЯМР спектроскопия.
Глава 3. Оценка выбора методов, использованных в работе.
3.1. Экстракция тейхоевых кислот.
3.2. Установление первичной структуры тейхоевой кислоты.
3.2.1. Механизмы кислотного, щелочного и ферментативного гидролизов.
3.2.2. Идентификация полиола.
3.2.3. Разделение и изучение фосфорных эфиров.
3.2.4. Исследование гликозидов.
3.2.5. ЯМР спектроскопия.
III. Результаты исследований
Глава 1. Тейхоевые кислоты представителей родов Actinomadura и Nonomuraea.
1.1. Распространение тейхоевых кислот у представитетелей рода Actinomadura и Nonomuraea.
1.1 Тейхоевые кислоты Actinomadura cremea ИНА 292 т.
1.2. Тейхоевые кислоты Actinomadura madura ВКМ Ас-809т.
1.3. Тейхоевые кислоты Actinomadura viridis ВКМ Ас-1315Т и Ас-631.
1.4. Тейхоевые кислоты Nonomuraea roseoviolacea subsp. carminata
ИНА4281.
1.5. Тейхоевые кислоты Nonomuraea recticatena BKM Ac-940.
Глава 2. Тейхоевые кислоты и другие анионные полимеры представителей рода
Brevibacterium.
2.1. Выделение трех новых видов рода Brevibacterium: Brevibacterium permense sp. nov. Brevibacterium antiquum sp. nov., Brevibacterium aurantiacum sp. nov.
2.2. Распространение TK у представителей рода Brevibacterium.
2.3. Тейхоевые кислоты Brevibacterium iodinum BKM Ac-2106T.
2.4. Тейхоевые кислоты Brevibacterium permense BKM Ac-2280T.
2.5. Тейхоевые кислоты Brevibacterium antiquum BKM Ac-2118T и BKM Ac-2281.
2.6. Анионные полимеры Brevibacterium aurantiacum BKM Ac-2111T.
2.7. Тейхоевые кислоты Brevibacterium linens BKM Ac-2119 и Gk-3.
2.8. Анионные полимеры Brevibacterium linens BKM Ac-2159.
Глава 3. Тейхоевые кислоты актиномицетов родов Glycomyces, Streptomyces и Nocardiopsis.
3.1. Тейхоевые кислоты Glycomyces tenuis BKM Ас-1250т.
3.2. Тейхоевые кислоты Streptomyces roseolus ISP 5174.
3.3. Тейхоевые кислоты Nocardiopsis dassonvillei subs, albirubida
BKM Ас-1882т и Ac-1454.
IV. Обсуждение результатов.
Список литературы
- Лгрс Н.С., Ефимова Т. П., Грузева JI.H. О гетерогенности рода Actinomadura Lech. Л. Lech. // Микробиология 1975. Т. 44. В. 2. с. 253−257.
- Гаузе Г. Ф., Преображенская Т. П., Свешникова М. А., Терехова Л.П., Максимова
- Т.С. Определитнль актиномицетов. Роды Streptomyces, Slreptoverlicillum, Chainia. М.: Наука, 1983. с. 8.
- Гладышев Б.Н. Определение амииосахаров в гидролизатах животных, растительных и бактериальных объектов // Биохимия 1959. Т. 24. с.789−793.
- Гнилозуб В.А. Тейхоевые и лнпотсйхосвые кислоты актиномицетов // дис. на соиск. уч. степ. канд. биол. наук. Москва, 1994.
- Гнилозуб В.А., Стрешинская Г. М., Евтушенко Л. И., Шашков А. С., Наумова И. Б. Липотейхоевые кислоты видов рода Agromyces II Микробиология 1994а. Т. 63. № 3. с. 495−502.
- Гнилозуб В.А., Стрешинская Г. М., Наумова И. Б., Евтушенко Л. И., Шашков А.С.1,5-Поли (рибитфосфат) с тстрасахаридными заместителями в клеточной стенке Agromyces fucosus ssp. luppuratus II Биохимия 19 946. Т. 59. № 12. с. 1892−1899.
- Деревицкая В.А., Шашков А. С., Новиков О. С., Евстигнеев А. И. Синтез моно- и диметиловых эфиров метил-2-ацетамидо-2-дезокси-0-галактопирапозндов и их спектры 13С-ЯМР // Биооран. химия 1981. Т. 7. № 3. с. 410−421.
- Дерябин П.Н. и Каралышк В.В. Биологические свойства и использование тейхоевых кислот микроорганизмов // ЖМЭИ 1983. Т. 9. с. 26−29.
- Дмитриева Н.Ф., Вылегжанина Е. С., Грабовская К. Б., Битко С. А., Наумова И. Б. Некоторые химические и биологические свойства ЛТК стрептококка группы, А // Вестник АМН СССР 1986. № 7. с. 30−34
- Дмитриева Н.Ф., Наумова И. Б., Стрешинская Г. М., Ланина Л. И. О клеточной стенке Actinomyces rimosus II Биоорган, химия 1976. Т. 2. № 6. с. 815−821.
- Евтушенко Л.И. Актинобактерии: развитие систематики уа примере семейств порядка Actinomycetales//дис. на соиск. уч. степ. док. биол. наук. Пущино, 2003.
- Евтушенко Л.И., Янушкене Н. А., Стрешинская Г. М., Наумова И. Б., Агре Н.С.
- Распространение тейхоевых кислот в представителях порядка Actinomycetales // ДАН СССР 1984. Т. 278. с.237−240.17,18