Молекулярная эволюция митохондриального гена цитохрома b коттоидных рыб озера Байкал: Филогенетическая реконструкция
Диссертация
По сравнению с морфологическими или физиологическими характеристиками, молекулярные данные показывают более стабильную структуру эволюционных изменений 1987), следовательно — более корректную картину филогенетического родства организмов. Кроме этого, сравнение нуклеотидных и аминокислотных последовательностей позволяет анализировать большое количество признаков (нуклеотидов или аминокислотных… Читать ещё >
Содержание
- I. ВВЕДЕНИЕ
- II. ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
- III.
- ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
- IV. ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ
- 3. 1. Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей
- 3. 2. Построение филогенетических схем
- 3. 3. Филогенетические взаимоотношения видов байкальских Cottoide
- 3. 4. Филогенетические взаимоотношения байкальских и внебайкальских Cottoide
- 3. 5. Оценка времени прошедшего с момента первой дивергенции байкальских подкаменщиков
- V. ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ
- VI. ВЫВОДЫ
- IV. ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ
Список литературы
- Berg L.S. Die Cataphracti des Baikalsees // St-Petersburg und Berlin. 1907. S. 1−75.
- Felsenstein J. The number of evolutionary trees // Syst. Zool. 1978. V. 27. P. 27−33.
- Felsenstein J. Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap
- Fitch W.M., Margoliash E. Construction of phylogenetic trees // Science. 1967.
- Hatefi Y. The mitochondrial electron transport and oxidative phosphorylationsystem // Annu. Rev. Biochem. 1985. V. 54. P. 1015−1069 Hillis D.M., Moritz C. Molecular systematics. Sinauer Associates Inc. 1990. 588 P
- Kimura M. A simple method for estimating evolutionary rates of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences // J. Mol. Evol. 1980. V. 16. P. Ill 120. Kocher T.D., White T.J. Evolutionary analysis via PCR // PCR Technology. Nev
- Pallas P. S. Reise durch verschiedene Provinzen des Russischen Reiches // St.
- Petersburg, Bd. III. 1776. S. 1 454. de Queroz K., Gauthier J. Phylogenetic taxonomy // Annu. Rev. Ecol. Syst. 1992. V. 23. P. 449 — 480.
- Saitou N., Nei M. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees // Mol. Biol. Evol. 1987. V. 4. P. 406 425.
- Sambrook J., Fritsch E.P., Maniatis T. Molecular cloning: a laboratory manual. Nev York: Cold Spring Harbor Lab. Press. 1989.
- Sideleva V.G. Speciation of endemic Cottoidei in Lake Baikal // Speciation in ancient lakes. Stuttgard. Arch. Hydrobiol. Beih. Ergebn. Limnol. 1994. V. 44.1. P. 441 .450.
- Slobodyanyuk S.Ja., Pavlova M.E., Kirilchik S.V., Novitskii A.V. The evolutionary relationships of two families of cottoid fishes of Lake Baikal (East Siberia) as suggested by analysis of mtDNA // J.Mol.Evol. 1994. V. 40. P. 392−399.
- Smith G.R., Todd T.N. Evolution of species flocks of fishes in north temperate lakes // Evolution of fish species flocks. University of Maine at Orono Press. 1984. P. 45−69.
- Tajima F., Nei M. Estimation of evolutionary distance between nucleotide sequences // Mol. Biol. Evol. 1984. V. l.P. 269 285.
- Zhang De-Xing, Hewitt G.M. Nuclear integrations: challenges for mitochondrial DNA markers // Tree. 1996. V. 6. P. 247 251.
- Берг Л. С. Академик Л.С. Берг избранные труды. М.: изд-во АН СССР. 1962. С. 58−91.
- Буркар Ж. Рельеф океанов и морей. М.: 1953. 338 с.
- Грацианов В.И. Ихтиофауна Байкала // Днев. Зоол. отд. Изв. Общ. любит.естествозн. антропол. и этногр. 1902. Т. III. № 3. С. 18 16. Гроссвальд М. Г. Оледенение континентальных шельфов. Палеогеография.
- М.: ВИНИТИ. 1983. т. 1. 145 с. Гроссвальд М. Г. Последнее великое оледенение территории СССР. М.: Знание. 1989. 48 с.
- Дрогостайский В.Ч. Вертикальное и горизонтальное распределение фауны оз. Байкала // Иркутск: Гос. унив. Тр. проф. и преп. ИГУ. 1923. С. 1 31. Дыбовский Б. И. Рыбы озера Байкала // Изв. Сиб. отд. Русск. геогр. общ. 1876.
- Т. VII. № 1 -2. С. 1−25. Дыбовский Б. И. Исследования голомянки. (Сообщено А. Л. Чекановским.) //
- Изв. Сиб. отд. Русск. геогр. общ. 1870. Т. I. № 1. С. 28 30. Карасев Г. Л. Проблемы исторического формирования ихтиофауны Байкальского рифта и прилежащих территорий Северной Азии // Рыбы и рыбное хозяйство Восточной Сибири. Улан-Уде. 1977. С. 142 — 174.
- КимураМ. Молекулярная эволюция: теория нейтральности. М: Мир. 1985. 398 с.
- Кирильчик C.B., Слободянюк С. Я. Эволюция фрагмента гена цитохрома b митохондриальной ДНК некоторых байкальских и внебайкальских видов подкаменщиковых рыб // Молекуляр. биология. 1997. т.31. № 1. С. 168−175.
- Коротнев A.A. Comephoridae Байкала // Зоол. исслед. оз. Байкала. Киев и Берлин. 1905. Вып. 2. С. 1 -39.
- Линдберг Г. У. Крупные колебания уровня океана в четвертичный период. Л.: Наука. 1972. 548 с.
- Сиделева В.Г. Сейсмосенсорная система и экология байкальских подкаменщиковых рыб (Cottoidei). Новосибирск: Наука. 1982. 150 с.
- Сиделева В.Г. Морфология сейсмосенсорной системы голомянок (Comephoridae) // Морфология и систематика рыб. Л: Наука. 1978. С. 25 30.
- Сиделева В.Г. Особенности строения сейсмосенсорной системы у прибрежных и глубоководных подкаменщиков (Pisces: Cottidae, Abyssocottidae) оз. Байкал // Докл. АН СССР. 1979. Т. 248. Вып. 3. С. 745 746.
- Талиев Д.Н. Бычки-подкаменщики Байкала (Cottoidei). M.-Л.: изд-во АН СССР. 1955. 603 с.
- Талиев Д.Н. Новые формы бычков из Байкала // Тр. Байкальск. лимнол. ст. АН СССР. 1935. T. VI. С. 59 68.
- Талиев Д.Н. К изучению остеологии байкальских Cottoidei при помощи лучей рентгена // Вестн. рентгенол. и радиол. 1938. T. XX. С. 225 235.
- Талиев Д.Н. Опыт применения реакции преципитации к познанию происхождения и истории байкальской фауны // Тр. Байкальск. лимнол. ст. АН СССР. 1940. T. X. С. 241 355.
- Черняев Ж.А. О генезисе фауны байкальских бычков-подкаменщиков (Cottoidei) // Зоол. ж. 1973. T. LII. Вып. 3. С. 459 464.
- Черняев Ж.А. Морфоэкологические особенности размножения и развития песчаной широколобки оз. Байкал Paracottus (Leocottus) kessleri (Dyb) // Вопр. ихтиол. 1977. T. 17. Вып. 6(107). С. 1055 1070.
- Шедько C.B. О скорости эволюции митохондриальной ДНК лососевых рыб // Ж. эвол. биохим. и физиол. 1991. Т. 27. № 2. С. 249 253.