Помощь в учёбе, очень быстро...
Работаем вместе до победы

Микросателлитные последовательности (TG) n-типа генома крупного рогатого скота

Диссертация: Микросателлитные последовательности (TG) n-типа генома крупного рогатого скота
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Проанализировать исследуемые хромосомоспецифичные последовательности на полиморфизм и видоспецифичность. Научная новизна. Установлено, что геном крупного рогатого скота содержит около пятнадцати тысяч микросател-литных последовательностей (TG)n-Tnna. Выделены космиды, позволяющие маркировать хромосомы крупного рогатого скота. Определена нуклеотидная последовательность семи TG-положительных… Читать ещё >

Содержание

  • 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
    • 1. 1. Использование полиморфизма в изучении гено- 11 ма
      • 1. 1. 1. Морфологический и биохимический полиморфизм
      • 1. 1. 2. Полиморфные ДНК-маркеры

      1.2. Повторяющаяся ДНК 17 1.2.1 Особенности структурной организации эукариотического генома 17 1.2.2. Организация, состав и хромосомная локализация повторяющейся ДНК 20 1.2.2.1 Микросателлитные последовательности

      1.3. Использование микросателлй. тньщ>,.цоследова-тельностей в исследованйй-^енома сельскохозяйственных животных

      1.3.1. Генетические карты сельскохозяйственных животных

      2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

      2.1. Используемые материалы

      2.2. Выделение ДНК

      2.3. Слот-блот гибридизационный анализ космидной

      2.4. Мечение (ТС)8 зонда

      2.5. Мечение ДНК (ТО-содержащих космид биотином

      2.6. Гидролиз космидной и плазмидной ДНК эндонуклеазами рестрикции

      2.7. Электрофоретическое разделение ДНК

      2.8. Блот-гибридизация

      2.9. Препаративное выделение ДНК-фрагментов из геля

      2.10. Субклонирование фрагментов ДНК

      2.11. Определение нуклеотидной последовательности

      2.12. Амплификационный анализ образцов ДНК

      2.13. Определение полиморфизма микросателлитных локусов

      3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ

      3.1. Анализ космидной геномной библиотеки быка

      3.2. Установление хромосомной локализации ТС-содержащих космид

      3.3. Выделение Т6-содержащих фрагментов хромосомоспецифичных космид

      3.4. Определение нуклеотидной последовательности ТС-содержащих фрагментов

      3.5. Анализ полиморфизма исследуемых локусов

      3.6. Оценка видовой специфичности микросателлитных локусов

      ВЫВОДЫ

Микросателлитные последовательности (TG) n-типа генома крупного рогатого скота (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Актуальность исследований. Изучению структуры и функционирования генома сельскохозяйственных животных в последнее время уделяется все большее внимание. Значение таких исследований становится очевидным не только для фундаментальной науки, но и для сельского хозяйства. Они позволят выявить генетические структуры, определяющие хозяйственно-полезные признаки, понять механизмы работы генов, определить меру генетической изменчивости той или иной популяции, осуществлять контроль происхождения животных, а также, в конечном итоге, расширить представление об организации генетического материала, путях и закономерностях его эволюции.

В настоящее время происходит переход от классической («прямой») генетики, двигавшейся к идентификации генов от признаков, кодируемых этими генами, к «обратной» генетике (Свердлов, 1995). Это объясняется тем, что «прямой» подход (функциональное клонирование) возможен в том случае, когда признак является моногенным и для выделения гена, определяющего данный признак, можно использовать какую-либо информацию о функциональной роли продукта искомого гена. Но, к сожалению, в большинстве случаев для выявления генетических основ хозяйственно-важных признаков сельскохозяйственных животных такой подход невозможен. Множество фенотипических признаков, в частности, количественные признаки сельскохозяйственных животных, являются результатом совокупного действия многих генов, кроме того, одни и те же фенотипические проявления могут быть следствием мутации разных генов. Поэтому, в данном случае наиболее доступным является подход (позиционное клонирование), предполагающий при поиске определенных генетических структур использовать полиморфные маркеры, сцепленные с фенотипическими проявлениями искомых генов.

Концепция поиска локусов количественных признаков (QTL) с помощью сцепленных с ними маркеров была предложена Карлом Саксом еще в 1923 году. Однако такой подход не получил развития из-за ограниченного количества маркеров. Появление иммунологических, биохимических и, наконец, ДНК-маркеров сняло эти ограничения (Soller, 1991).

Настоящий прорыв в изучении генома млекопитающих обеспечило открытие микросателлитных последовательностей, играющих в последнее время доминирующую роль в качестве неисчерпаемого источника генетических маркеров.

Микросателлиты относятся к классу тандемных повторов, которые составляют значительную часть эукариотического генома, и в частности, 23% генома крупного рогатого скота (Perret et al., 1990). Микросателлитные блоки достаточно равномерно распределены по всему геному и присутствуют в составе как транскрибируемых, так и нетранскрибируемых последовательностей ДНК (Soller, 1990). Основная единица повтора может быть образована 1−6 нуклеотидами. Характерной чертой организации этих последовательностей является вариабельность в количестве тандемно-повторенных единиц (от 2 до 200), именно она составляет основу их высокого полиморфизма. В геноме млекопитающих наиболее многочисленны микросателлитные последовательности, образованные v 4 динуклеотидным мотивом TG — от 5 до 10×10 на геном. Мик^ росателлитные последовательности (Тб)п-типа составляют в среднем 57% от общего числа микросателлитных повторов.

Vaiman et al., 1994). Находящиеся внутри уникальных последовательностей, микросателлиты могут быть амплифициро-ванны при помощи пар фланкирующих уникальных олигонуклео-тидов.

С помощью микросателлитных маркеров построены генетические карты для человека и мыши (Moore et al., 1993). 24 9 локусов из 269 генетической карты крупного рогатого скота, построенной Ma, Beever et al., являются микросателлитами (Ma et al., 1996). Самая подробная генетическая карта крупного рогатого скота (со средним расстоянием между маркерами 2,5 сМ) на 94% состоит из микросателлитов (Kappes et al., 1997). Эта популярность объясняется тем, что такие свойства, как равномерная представленность в геноме, высокий уровень полиморфизма, а также, возможность типирования с помощью полимеразной цепной реакции делают эти последовательности удобным инструментом для картирования и анализа генома (Vaiman et al., 1994).

Одним из основных условий идентификации локусов, определяющих как моногенные, так и полигенные хозяйственно-полезные признаки сельскохозяйственных животных является создание насыщенных полиморфными маркерами генетических карт, которые дают возможность найти корреляцию между интересующими фенотипами и определяющими их генетическими структурами (Ron, Band et al., 1994). Когда будет достигнута достаточно высокая степень насыщения генетической карты маркерами, окажется возможным по-новому использовать гибридизацию в селекции. Применительно к сельскохозяйственным животным станет возможной селекция с помощью генетических маркеров (MAS — marker assistant selection), которая по сути является реализацией выдвинутого еще А. С. Серебровским принципа «сигналей» (Захаров и др., 1993).

Важное преимущество ДНК-маркеров в этом случае состоит в возможности определения генотипа у эмбрионов, молодых животных, а также у быков по признакам, реализующимся только у коров.

Кроме того, построение подробных генетических карт является одним из условий успеха и в клонировании генов, создает основу для работ по получению трансгенных животных с заданными свойствами (Захаров и др., 1993).

Работы по созданию таких карт являются в последнее время предметом научной интеграции исследователей стран Европейского Союза, Северной Америки, Африки, Австралии. Уже существуют генетические карты приблизительно для 30 видов (O'Brien et al., 1993). Особое внимание уделяется картированию геномов важнейших видов сельскохозяйственных животных. Наиболее интенсивно ведутся работы по созданию генетических карт крупного рогатого скота. Протяженность созданных за последнее время генетических карт находится в пределах 2500−3000сМ, а размер генома крупного рогатого скота оценивается в 4000 сМ (Barendse et al., 1997).

Ввиду вышесказанного, становится очевидной необходимость работ по получению микросателлитных маркеров для построения подробных генетических карт, являющихся необходимым условием идентификации локусов, определяющих хозяйственно-полезные признаки сельскохозяйственных животных.

Цель и задачи исследований. Целью работы было выделение и анализ микросателлитных последовательностей (TG)n-типа из космидной библиотеки быка. В связи с этим были поставлены следующие задачи:

1.Выделить из геномной библиотеки быка космиды, содержащие TG-микросателлиты.

2.Провести рестрикционный анализ последовательностей, выделенных из TG-положительных космид.

3.Определить хромосомную локализацию TG-положительных космид.

4.Определить нуклеотидную последовательность TG-положи-тельных фрагментов из состава хромосомоспецифичных космид.

5.Проанализировать исследуемые хромосомоспецифичные последовательности на полиморфизм и видоспецифичность. Научная новизна. Установлено, что геном крупного рогатого скота содержит около пятнадцати тысяч микросател-литных последовательностей (TG)n-Tnna. Выделены космиды, позволяющие маркировать хромосомы крупного рогатого скота. Определена нуклеотидная последовательность семи TG-положительных фрагментов из состава хромосомоспецифичных космид, три из них зарегистрированы Европейским институтом биоинформации под номерами: Х81 898, Y07736, Y07735. (EMBL Nucleotide Sequence Database). Проведена оценка полиморфизма и видоспецифичности исследуемых локусов. Выполнен сравнительный анализ гомологичных последовательностей быка и барана.

Научно-практическая значимость работы. Полученные данные о структурной организации повторов могут быть использованы при разработке стратегии выделения локус-специфичных маркеров. Результаты анализа геномной космид-ной библиотеки быка могут быть использованы для дальнейшего выделения и физического картирования генетических маркеров.

Выделенные хромосомоспецифические космиды могут быть использованы в качестве хромосомных маркеров.

Полиморфная микросателлитная последовательность 42.3, находящаяся в составе космиды № 42 с установленной хромосомной локализацией, может быть использована как «якорный» локус для генетического картирования Y-хромосомы крупного рогатого скота.

Положения выносимые на aaupray.

1. Геном крупного рогатого скота содержит около пятнадцати тысяч микросателлитных последовательностей (TG)n-Tnna. т. е. один микросателлит приходится на каждые 203 т.п.о.

2. В большинстве случаев (>72%) каждый участок хромосомы может быть маркирован более чем одной микросателлитной последовательностью (TG)n типа.

3.Праймеры, подобранные для типирования определенных ло-кусов крупного рогатого скота, могут быть использованы для выполнения аналогичных работ на близкородственных видах.

4.Выделенная полиморфная последовательность 42.3 может быть использована в качестве «якорного локуса» для генетического картирования.

Апробация работа. Основные положения диссертационной работы доложены на: I Международной конференции по моле-кулярно-генетическим маркерам животных, Киев, 1994; II Международной конференции по молекулярно-генетическим маркерам животных, Киев, 1996; 12th Europen Colloquium on Cytogenetics of Domestics Animals, Zaragoza, Spain, 1996; 47th Annual Meeting of the European Association for Animal Production, Norway, 1996; Научной конференции «Акту.

10 альные проблемы биотехнологии в растениеводстве, животноводстве и ветеринарии", Москва, 1996; Международной конференции «Агробиотехнология растений и животных», Киев, 1997; Втором съезде биохимического общества Российской академии наук, Москва, 1997.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

ВЫВОДЫ.

1.Геном крупного рогатого скота содержит около пятнадцати тысяч микросателлитных последовательностей (ТОп-типа, т. е. один микросателлит приходится на каждые 203 т.п.о.

2. В большинстве случаев (>72%) каждый участок хромосомы может быть маркирован более чем одной микросателлитной последовательностью (TG)n типа.

3.Выделено одиннадцать хромосомоспецифичных (TG)n-положительных космид. Из их числа шесть космид содержат аутосомоспецифические последовательностипять космид содержат Y-специфические последовательности ДНК.

4. В составе семи секвенированных фрагментов обнаружено десять микросателлитных последовательностей, шесть из которых являются совершенными и четыре — несовершенными повторами. Среднее количество единиц повтора равно двенадцати .

5.Из четырех проанализированных на полиморфизм последовательностей три (локусы Х818 98 (1.1), Y07735 (1.3), и.

5.2)) ~ мономорфны, одна — (локус Y07736 (42.3)) ~ полиморфна. Последняя может быть использована как «якорный» локус для генетического картирования. В случае локуса Х81 898 (1.3) гомология с аналогичным фрагментом генома барана составила 92,8%, в случае локуса Y07735 (42.3) ~ 82%.

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ.

• Полиморфная микросателлитная последовательность 42.3. (У7 736), находящаяся в составе космиды с установленой хромосомной локализацией, может служить «якорным» локу-сом для генетического картирования генома крупного рогатого скота.

• Картированные космиды могут быть использованы для маркирования хромосом крупного рогатого скота.

Показать весь текст

Список литературы

  1. Ф. Введение в популяционную генетику// М.: Мир. 1984.
  2. Ф., Кайгер Дж. Современная генетика. М.: Мир. 1988. Т.2 367 стр.
  3. З.Захаров И. А., Никифоров B.C., Степанюк Е. В. Генетическое картирование сельскохозяйственных животных// Успехи современной генетики. 1993. Вып. 18. С. 36−74.
  4. И.А. Генетические карты с.-х. животных// Информационно-справочные материалы. Ин-т общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН. 1995. Вып. 2. 34 с.
  5. .М., Банников A.A., Ломов A.A. Рестрикционный анализ повторяющейся ядерной ДНК. Критерий вида и механизм видообразования// Молекулярная биология. 1995. т. 29. С. 1308−1319.
  6. Р., Кофмен Т. Эмбрионы, гены и эволюция. М: Мир. 1986. 289 стр.
  7. Е. Д. Очерки современной молекулярной генетики// Молекулярная генетика. Микробиология и вирусология. 1995. N2. С. 3−15.
  8. Н.С., Машуров A.M. Картирование генов ЛДГ, Г6ФД и ПРО+ Bos taurus методом гибридизации соматических клеток// Докл. АН СССР. 1982. т. 266. с. 1012−1013.
  9. Г. Е. Полиморфизм длин рестрикционных фрагментов ДНК у сельскохозяйственных животных// Успехи современной генетики. 1993. С. 3−30.
  10. Ю.Сулимова Г. Е. Молекулярно-генетический анализ генома животных и человека с использованием ДНК-маркеров//Реф. докт. дисс., Москва, 1998.
  11. Andersson L., Haley C.S., Ellegren et al. Genetic mapping of quantitetive trait loci for growth and fatness in pig// Science. 1994. v. 263. P. 1771−1774.
  12. Ansari H.A., Pearce P.D., Maher D.W. et al. Resolving ambiquities in the karyotype of domestic sheep (Ovis aries)// Chromosoma. 1992. v. 102. P. 304−307.
  13. Anzari H.A., Pearce P.D., Macher D.W. et al. Regional assignment of conserved referenca loci anchors unas-signed linkage and syntenic groups to ovine chromosomes// Genomics. 1993. v. 24. P. 451−445.
  14. Archibald A.L., Haley J.F., Brown S. et al. The PiGMaP consortium lineage map of the pig (Sus scrofa)// Mamm. Genome. 1995. v. 6. P. 157−175.
  15. Arranz J.J., Bayon Y., Primitivo F. Comparison of protein markers and microsatellites in differentiation of cattle populations// Anim. Genet. 1996. v. 27 6. P. 415−419.
  16. Ashwell M.S., Rexroad C.E., Miller R.H. et al. Mapping economic trait loci for somatic cell score in Holstein cattle using microsatellite markers and selective geno-typing// Anim. Genet. 1996. v. 27 4. P. 235−242.
  17. Baker C.M., Manwell C. Chemiccal classifications of cattle. I. Bred groups// Anim. Blood Groups and Bio-chem. Genet. 1980. v. 11. P.127−150.
  18. Band M., Ron M. Isolation of polymorphic AGC repeats located 3' to bovine SINEs// Animal Genetics. 1994. v. 25. P. 281−283.
  19. Barendse W., Armitage S.M., Kossarek L.M. et al. A genetic map of the bovine genome// Nature genet. 1994. v. 6. P.227−235.
  20. Barendse W., Vainman D., Kemp S.I. et al. A medium density genetic linkage map of the bovine genome// Mam-maline genome. 1997. v. 6. P. 21−28.
  21. Beamonte D., Guerra A., Ruiz B. et al. Microsatellite DNA polymorphism analysis in the case of an, illegal cattle purchase// J. Forensic Sci. 1995. v. 40. P. 692 694.
  22. Beckmann J.S. and Weber J.L. Surley of human and rat microsatellites// Genomics. 1992. v. 12. P. 627−631.
  23. Bishop M.D., Kappes S.M., Keele J.W. et al. A genetic lineage map for cattle// Genetics. 1994. v. 136. P. 619−639.
  24. Blaho J.A. and Wells R.D. Left-handed Z-DNA and genetic recombination// Progress in Nucleic Acid Research and Molecular biology. 1989. v.37. P.107−126.
  25. Botstein D., White R.L., Skolnick M., Davis R.W. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms// Amer. J. Hum. Genet. 1980. v.32. P. 314−331.
  26. Broad T.E., Hill D.E. Mapping the sheep genome: practice, progress and promise// Brit. vet. J. 1994. v.150. P. 237−252.
  27. Builtkamp J., Schwaiger F.W., Solinas-Toldo S. et al. The bovine interleukin-4 gene: genomic organization, localizzation and evolution// Mamm. Genome. 1995. v. 6. P. 350−356.
  28. Charlier C., Coppieters W., Farnir F. et al. The mh gene causing double-muscling in cattle maps to bovine Chromosome 2// Mamm. Genome. 1995. v.6. P.788−792.
  29. Charlier C., Denys B., Belanche J.I. et al. Microsatellite mapping of the bovine roan locus: A major determinant of White Heifer Disease// Mamm. Genome. 1996. v.7. P.138−142.
  30. Charrlesworth B., Sniegowski P., Stephan W. The evolutionary dynamics of repetitive DNA in eucaryotes// Nature. 1994. v. 371. P. 251−220.
  31. Chowdhary B.P., Fronicke L., Gustavsson I. Et al. Comparative analysis of the cattle and human genomes: detection of ZOO-FISH and gene mapping-based chromosomal homologies// Mamm. Genome. 1996. v. 74. P. 297−302.
  32. Cocket N.E., Jackson S.P., Shay D. et al. Chromosomal localization of the callipyge gene in shep (Ovis aries) using bovine DNA markers// Proc. Natl. Acad. Sei. 1994. v. 91. P.3019−3023.
  33. Crawford A.M., Dodds K.G., Ede A.J. et al. An autosomal genetic linckage map of the sheep genome// Genetics. 1995. v. 140. P.703−724.
  34. Dain A.R., Tucker E.M., Donnker R.A. et al. Chromosome mapping in cattle using mouse myeloma/calf lymph node cell hybridomas// Biochem. Genet. 1984. v. 22. P. 429 439.
  35. Dallas J.F. Estimation of microsatellite mutation rates in recombinant inbred strains of mouse// Mamm. Genome. 1992. v.3. P.452−456.
  36. Deka R., DeCroo S. et al.// Population genetic characteristics of the D1S80 locus in seven human populations. Hum. Genet. 1994, v.94, p.252−258.
  37. Destro-Bisol G., Presciuttini S. et al.// Genetic variation at the ApoB 3KHVR, D2S44, and D7S21 loci in the Ewondo ethnic group of Cameroon. Am. J. Hum. Genet., 1994. v.55, p.168−174.
  38. Dietrich W.F., Katz S.E., Lincoln E. et al. A genetic map of the mouse suitable for typing intraspecific crosses// Genetics, v. 1992. P. 423−447.
  39. Dietrich W.F., Miller J.C., Steen R.G. et al. A genetic linkage map of the mouse with 4006 simple sequence length polymorphisms// Nature Genetics. 1994. v. 7. P. 220−245.
  40. Dodgson J.B., Cheng H.H., Okimoto R. DNA marker technology: a revolution in animal genetics// Poult. Sei. 1997. v. 7 6 8. P. 1108−1114.
  41. Dulittle W.F., Sapientza C. Selfish genes, the pheno-type paradigm and genome evolution. Nature. 1980. v. 284. P.601−603.
  42. Edfors-Lilja I., Gustafson U., Duval-Iflah et al. The porcine intestinal receptor for Escherichia coli K88ab, K88ac: Regional localization on chromosome 13 and influence of lgG response to the K88 antigen// Anim. Genet. 1995. v. 26. P. 237−242.
  43. Edvards A., Civitello a., Hammond H. et al. DNA typing and genetic mapping with trimeric and tetrameric tandem repeats// Am. J. of Human Genetics. 1991. v. 49. P.746−756.
  44. Ellegren H., Johansson M., Sandberg K et al. Cloning of highly polymorphic microsatellites in the horse// Animal Genetics. 1992. v. 23. P. 133−142.
  45. Ellegren H., Moore S., Robinson N. et al. Microsatellite evolution a reciprocal study of repeat lengths at homologous loci in cattle and sheep// Mol. Biol. Evol. 1997. v. 14(8). P. 854−860
  46. Ferretti L., Leone P., Pilla P. et al. Direct characterization of bovine microsatellites from cosmids polymorphism and synteny mapping// Animal Genetics. 1994. v.25. P. 209−214.
  47. Ferretti L., Urquhart B.G., Eggen A. et al. Cosmid-derived markers anchoring the bovine genetic map to the physical map// Mamm. Genome. 1997. v.8l. P.29−36.
  48. Fischer P.E. Genome mapping in domestic animals// Brit. Vet. J. 1994. v. 150. P.215−217.
  49. Fomage M., Chan L., Siest G. et al. Allele frequency distribution of the (TG)n (AG)n microsatellite in the apolipoprotein C-II gene// Genomics. 1992. v. 12. P. 63−68.
  50. Fries R. Mapping the bovine genome: metodological aspects and strategy// Animal Genetics. 1993b. v. 24. P.111−116.
  51. Fries R., Eggen A., Stranzinger G. The bovine genome contains polymorphic microsatellites// Genomics. 1990. v. 8. P. 403−406.
  52. Fries R., Eggen A., Womack J.E. The bovine genome map// Mammalian Genome. 1993a. v. 4. P.405−428.
  53. Gao Q., Womack J.E. A genetic map of bovine chromosome 7 with an interspecific hybrid backcross panel// Mamm. Genome. 1977. v. 8 4.. P. 258−261.
  54. Georges M. f Dietz A.B., Mishra A. et al. Microsatellite mapping of the gene causing weaver disease in cattle will allow the study of an associated quantitative trait locus // Proc. Nat. Acad. Sei. 1993a. USA. v. 90. P. 1058−1062.
  55. Georges M., Dietz A.B., Mishra A. et al. Microsatellite mapping of a gene affecting horn development in Bos taurus// Nature Genetics. 1993. v. 4. P. 206−210.
  56. Georges M., Gunawardana A., Threadgill D.W. et al. Characterization of a set of a variable number of tandem repeat markers conserved in Bovidae// Genomics. 1991. v. 11 P. 24−32.
  57. Georges M., Leguarre A.s., Hanset R. et al. Genetic variation of the bovine thyroglobulin gene studied at the DNA level// Anim. Genet. 1987. v. 18. P. 77−78.
  58. Georges M.D., Nielsen M.,. Mackinnnon M. et al. Mapping quantitative trait loci controlling milk production in dairy cattle by exploiting progeny testing// Genetics. 1995. v. 139. P. 907−920.
  59. Gortari M.J., Freking B.A., Kappes S.M. et al. Extensive genomic conservation of cattle microsatellite heterozygosity in sheep// Animal Genetics. 1997. v. 28. P. 274−290.
  60. Greider C.W. and Blackburn E.H. The telomer terminal transferase of Tetrahymena is a ribonucleoprotein enzyme with two kinds of primer specificity// Cell. 1989. v. 51. P. 887−898.
  61. Grodzicker T., Willams B., Sherp P. et al. Physical mapping of temperature-sensitive mutation of adenoviruses// Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1974. v. 39. P. 439−446.
  62. Gross D.R., Garrard W.T. The ubiquitous potential Zforming sequence of eucaryotes, (dT-dG) n'(dC-dA) n isnot detectable in the genome of eubacteria, archaebac-teria or mitichondria// Moll. Cell. Biol. 1986. v. 6. P. 3010−3013.
  63. Hamada H., Petrino M.G., Kakunaga T. A novel repeated element with Z-DNA-forming potential is widely found in evolutionarity diverse eukaryotic genomes// Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1982. v. 79. P. 6465−6469.
  64. Hamada H., Seidman M., Howard B.H. and Gorman C.M. Enhanced gene expression by the poly (dT-dG)'poly (dC-dA) sequence// Molecular and cellular biology. 1984. v. 4. P. 2622−2630.
  65. Harley C.B., Futcher A.B. and Greider C.W. Telomeres shorted during ageing of human fibroblasts// Nature. 1990. v.345. P.458−460.
  66. Hayes H., Petit E., Dutrillaux B. Comparison of RBG-banded karyotypes of cattle, sheep and goats. Cytogenetics and Cell genetics. 1991. v. 57. P.51−55.
  67. Hearne C.M., Chosn S., Todd J.A. Microsatellites for linkage analysis of genetic traits// Trends in Genetics. 1992. v. 8. P. 288−294.
  68. Hediger R., Ansari H.A., Stranzinger G. Chromosome banding and gene localization support extensive conservation of chromosome structure between cattle and sheep// Cytogenetics and Cell genetics. 1991. v. 57. 51−55.
  69. Heuerts S., Horesaula M.C. Cattle gene mapping by somatic cell hybridization study of 17 enzyme marcers// Cytogenet and Cell Genet. .1981. v. 30. P. 137−145.
  70. Heyen D.W., Beever J.E., Da Y. et al. Exclusion probabilities of 22 bovine microsatellite markers in fluorescent multiplexes for semiautomated parentage testing// Anim. Genet. 1997. v. 281. P. 21−27.
  71. Hillel J. Map-based quantitative traits locus identification// Poult. Sei. 1997. v. 6 8. P. 1115−1120.
  72. Hirano T., Nacane S., Mizoshita K. et al. Characterization of 42 highly polymorphic bovine microsatellite markers// Animal Genetics. 1996. v. 27. P. 365−368.
  73. Hochgeschwender U. and Brennan M.B. Identifying genes within the genome: new ways for finding the needle in a haystack// BioEssays. 1991. v.13. P.139−144.
  74. Hors-Cayla M.C., Heuertz S ., Van Cang N. Et al. Cattle gene mapping by somatic cell hybridization// Cyto-genet. and Cell Genet. 1979. v. 25. P. 173−178.
  75. Hudson T.J., Engelstein M., Dracopoli N.C. Isolation and chromosomal assignment of 100 highly informative human simple sequence repeat polymorphisms// Genomics. 1992. v. 13. P. 622−629.
  76. Hudson T.J., Stein I.D., Gerrety S.S. et al. An STS-based map of the human genome// Sciece. 1995. v.70. P. 1945−1954.
  77. Hussein A.A., Schmoll F., Fuhrer F. et al. Evaluation of seven microsatellite loci in Simmental cattle// Zentrabi Veterinarmed. A. 1996. v. 43. P. 1−8.
  78. Jeffreys A.J., Wilson V., Thein S.L. Hypervariable «minisatellite» regions in human DNA// Nature. 1985. v. 314. P.67−73.
  79. Johnson S.E., Moore S.S., MacKinnon R. et al. The cos-mid CSSM25 assigns group U2 to bovine chromosome.9 and is localized to ovine chromosome 8// Mamm. Genome. 1995. v. 6. P. 529−531.
  80. Kappes M. Steven, Keele J.W., Stone R.T. et al. A second-generation lineage map of bovine genome// Genome Res. 1997. v.73. P. 235−249.
  81. Kaukinen J. and Varnio S.L. Artuodactyl retroposons as-sotiation with microsatellites and use in SINE morph detection with PCR // Nucleic Acids Res. 1992. v. 20. P. 2955−2958.
  82. Kemp S.J., Brezinsky L., Teale A.J. A panel of bovine, ovine and caprine polymorphic microsatellites// Anim. Genet. 1993. v. 24. P. 363−365.
  83. Kirkpatrick B.W. Identification of a conserved microsatelite site in the porcine and bovine insulin-like growth factor-I gene 5' flank// Animal genetics. 1992. v.23. P.543−548.
  84. Lagercrantz U., Ellegren H., Andersson L. The abundance of various polymorphic microsatellite motifs differs between plants and vertebrates// NAR. 1993. v. 21 5.. P.1111−1115.
  85. Levinson G., Gutman G.A. Slipped-strand mispairing: A major mechanism for DNA seguence evolution// Moll. Biol. Evol. 1987. v.4. P. 203−221.
  86. Litt M., Luty J.A. A hypervariable microsatellite revealed by in vitro amplification of a dinucleotide repeat within the cardiac muscle actin gene// Am. J. Hum. Genet. 1989. v. 44. P.397−401.
  87. Love J.M., Knight A.M., McAleer M.A. et al. Towards construction of a high resolution map of the mouse genome using PCR-analysed microsatellites// Nucleic Acid Res. 1990. v. 18. P.4123−4130.
  88. Ma R.Z., Beever J. E., Da. Y. et al. A male linkage map of the cattle (Bos taurus) genome// J. of Heredity. 1996. v. 87. P. 261−271.
  89. Machugh D.E., Loftus R.T., Bradley D.G. et al. Microsatellite DNA variation with and among Europen cattle breeds// Proc. R. Soc. Lond. 1994. v.256. P.25−31.
  90. Mains P.E. A region flanking H-2K is duplicated to a distant site in most mouse T haplotypes// Immunogene-ties. 1986. v. 20. P. 81−108.
  91. McKusick V.A. The anatomy of the human genome// J. of Heredity. 1980. v. 71. P. 370−391.
  92. Mezzelani A., Zhang Y., Redaelli L. et al. Chromosomal localization and molecular characterization of 53 cos-mid-derived bovine microsatellites// Mamm. Genome, 1995. v.6. P. 629−635.
  93. Miesfeld R., Krystal M., .Arnheim N. A member of a new repeated sequence family which is conserved throughouteucaryotic evolution is found between the human delta and beta globin genes. Nucleic Acids Res. 1981. v. 9. P. 5931−5947.
  94. Moyzis R.K., Buckingham J.M., Cram L.S. et al. A highly conserved repetiteve DNA sequence, (TTAGGG)n, present at the telomeres of human chromosomes// Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1988. v.85. P. 6622−6626.
  95. Nanda I., Deubelbeiss C., Guttenbach M. et al. Geterogeneities in the distribution of (GACA)n simple repeats in the karyotypes of primates and mouse// Human Genetics. 1990. v.85. P.187−194.
  96. Orgel L.E., Crick F.H.C. Selfish DNA: The ultimate parasite. Nature. 1980. v. 284. P. 604−607.
  97. Paszek A., Schook L.B., Louis C.F. et al. First international workshop on porcine chromosome 6. Report and abstracts// Anm. Genet. 1995. V. 26. P. 377−401.
  98. Pearce P.D., Ansari H.A., Maher D.W. et al. Five re-gionallocalizations to the sheep genome: first assignments to chromosomes 5 and 12// Animal Genetics. 1995. v. 26. P.171−176.
  99. Peariman R.E., Tsao N. and Moens P.B. Synaptonemal complex from Dnase-treated rat pachytene chromosomes contain (GT)n and LINE/SINE sequences// Genetics. 1992. v. 130. P. 865−872.
  100. Pepin L., Amigues Y., Lepingle A. et al. Sequence conservation of microsatellites between Bos taurus (cattle), Capra hircus (goat) and related species. Examples of use in parentage testing and phylogeny analysis// Heredity. 1995. v. 74 1. P. 53−61.
  101. Piedrahita J. A., Weaks R., Petrescu A. et al. Genetic characterization of the bovine leukaemia inhibitory factor (LIF) gene: isolation and sequencing, chromosome assignment and microsatellite analysis// Anim. Genet. 1997. v. 28 1.. P. 14−20.
  102. Ponce de Leon F.A., Ambady S., Hawkins G.A. et al. Development of a bovine X chromosome linkage group and painting probes to assess cattle, sheep and geat X chromosome segment homologies// Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996. v. 93. P. 3450−3454.
  103. Poncz M., Schwartz E., Ballantine M. et al. Nucleotide sequence analysis of theP-globin gene region inhumans// Journal of Biological Chemistry. 1983. V. 258. P. 11 599−11 609.
  104. Price C.M. Fluorescence in situ hybridization//Blood Reviews 1993. V. 7. P. 127−134.
  105. Rando A, Di., Gregorio P, Masina P. Identification of bovine kappa-casein genotypes at the DNA level// Anim. Genet. 1988. 19(1). P. 51−4.
  106. Rogers J. CACA sequences the ends and the means?// Ibid. 1983a. v.305. P. 101.
  107. Rogers J. Retroposons defined// Nature. 1983b. v. 301. P. 460.
  108. Ron M., Levin H., Da Y. et al. Prediction of informa-tiveness for microsatellite markers among progeny of sires used for detection of economic trait loci in dairy cattle// Anim. Genet. 1995. v.26. 6. P. 439 441.
  109. Royle N.J., Clarkson R.E., Wong Z and jeffreys A.J. Clustering of hypervariable minisatellites in the proterminal regions of human autosomes// Genomics. 1988. v. 3. P. 352−360.
  110. Rubertis F., Comincini S., Leone P. et al. Construction of a library of bovine genomic fragments enriched in CpG islands// Animal Genetics. 1993. v. 24. P. 1−7.
  111. Rubinsztein D.C., Amos W., Leggo J. et al. Microsatellite evolution evidence for directionality and variation in rate between species// Nature Genetics. 1995. v.10. P/337−343.
  112. Schaf er R., Ali S. and Epplen J.T. The organization of the evolutionary conserved GATA/GAGA repeats in the mouse genome// Chromosoma. 198 6. v. P. 502−510.
  113. Scheller R.H.McAllister L.B., Crain W.R. et al. Organization and expression of multiple actin genes in the sea urchin// Moll. Cell. Biol. 1981. v. 1. P. 609 628.
  114. Schmutz S.M., Marquess F.L., Berryere T.G. et al. DNA marker-assisted selection of the polled condition in Charolais cattle// Mamm. Genome. 1995. v. 6. P. 710 713.
  115. Schwerin M., Gallagher D.S., Miller J.R. et al. Mapping of repetitive DNA sequences on cattle Y chromosomes // Cytogenet. Cell Genet. 1992. V.61. P. 189−194.12 6. Sertedaki A., Lindsay S. CAC the neglected repet// BioEssays. 1996. v. 18 3. P. 237−242.
  116. Shen S., Slightom J.L., Smithies 0. A history of the human fetal globin gen duplication// Cell. 1981. v. 26. P. 191−203.
  117. Solinas-Toldo S., Lengauer C. and Fries R. Comparative Genome Map of human and Cattle// Genomics. 1995. v.27. P.489−496.
  118. Soller M. Genetic mapping of the Bovine Genome Using Deoxyribonucleic Acid-Level Markes to Identify Loci Affecting Quantitative Traits of Economic Importance// J. Dairy Sei., 1990. v. 73. P. 2682−2646
  119. Stallings R.L., Ford A.F., Nelson D. et al. Evolution and distribution of (GT)n repetitive sequences in mammalian genomes// Genomics. 1991. v. 10 P. 807−815.
  120. Steffen P., Effen A., Diets A.B. et al. Isolation and mapping of polymorphic microsatellites in cattle// Animal Genetics. 1993. v. 24. P. 121−124.
  121. Sun H.S., Cai L., Davis S.K. et al. Comparative linkage mapping of human chromosome 13 and bovine chromosome 12// Genomics. 1997. v. 39 1.. P. 47−54.
  122. Takezaki N., Nei M. Genetic distances and reconstrac-tion of phylogenetic trees from microsatellite DNA. Genetics. 1996. v. 144. P.389−399.
  123. Tanskley S.D. Mapping polygenes// Ann. Rev. Genet. 1993, v. 27. P. 205−305.
  124. Tautz D., Renz M. Simple sequences are ubiquitous repetitive components of eukaryotic genomes// Nucleic Acids Res. 1984. v. 12. P. 4127−4138.
  125. Tautz D., Trick M., Dover G.A. Cryptic simplicity in DNA is a major sourse of genetic variation// Nature.1986. v. 322. P. 652−656.
  126. Thomsen P.D., Jorgensen C.B. Distribution of two conserved, male-enriched repeat families on the Bos taurus Y chromosome //Mammalian Genome 1994. V. 5. P. 171−173.
  127. Threadgill D.S., Womack J.E. Syntenic conservation between humans and cattle. I. Human chromosome 9// Genomics. 1990. v. 8. P.22−28.
  128. Tindall B. Genome mapping in domestic animals// Br. Vet. J. 1994. v. 150. P.215−217.
  129. Threadgill D. W, Womack J. E Genomic analysis of the major bovine milk protein genes//NAR. 1990. v. 11, 18(23).P.6935−42.
  130. Treco D., Arnheim N. The evolutionarily conserved repetituve sequence d (TG'AC)n promotes reciprocal exchange and generates unusual recombinant tetrads during yeast meiosia// Moll. Cell. Biol. 1986. v. 6. P. 39 343 947.
  131. Usha A.P., Simpson S.P., Williams J.L. Probability of random sire exlusion using microsatellite markers for parentage verification// Anim. Genet. 1995. v. 26. P. 155−161.
  132. Vainman D., Imam-Gahli M., Moazami-Goadarzi K. Et al. Conservation of a syntenic group of microsatellite loci between cattle and sheep// Mammalian genome. 1994. v. 5. P. 310−314.
  133. Vainman D., Mercier D., Moazami-Goudarzi et al. A set of 99 cattle microsatellites: characterization, synteny mapping, and polymorphism// Mammalian genome. 1994. v.5. P.288−297.
  134. Vilkki H.J., Koning D.J., Elo K. Et al. Multiple marker mapping of quantitative trait loci of Finnish dairy cattle by regression // J. Dairy Sci. 1997. v. 80 1.. P. 198−204.
  135. Vogt P. Potential genetics functions of tandem repeated DNA sequuence blocks in the humane genome are based on a highly conserved «chromatine folding code"// Humane Genetics. 1990. v. 84. P.301−336.
  136. Wahls W.P., Wallace L.J.-, Moore P.D. The Z-DNA motif d (TG)30 promotes reception of information during gene conversion events while stimulating homologous recombination in human cells in culture// Moll. Cell. Biol. 1990. v.10. P.785−793.
  137. Weber B., Allen L., Magenis R.E. et al. Intrachromo-somal location of the telomeric repeat (TTAGGG)n// Mammalian Genome. 1991. v. 1. P. 211−216.
  138. Weber J.L. Informativeness of human (dC-dA)n» (dc-dt)n polymorphism// Genomics. 1990. v.7. P.524−530.
  139. Weiler K.S., Wakimoto B.T. Heterochromatin and gene expression in Drosophila// Ann. Rev. Genet. 1995. v. 29. P. 577−606.
  140. Weintraub H., Groudine M. Chromosomal subunits in active genes have an altered conformation// Science. 1976. v. 193. P. 848−856.
  141. Weissenbach J., Gyapay G., Dib C. et al. A second-generation linkage map of the human genome// Nature. 1992. v. 359. P. 794−801.
  142. Wilkie P.J., Higgs D.R. An unusually large (CA)n re-pet in the region of divergence between subtelomeric alleles of human chromosome 16p// Genomics. 1992. v. 13. P.81−88.
  143. Williams J.L., Usha A.P., Urquhart B.G. and al. Verification of the identifity of bovine semen using DNA microsatellite markers// Vet. Rec. 1997. v. 14 017. P. 446−449.
  144. Wintero A.K., Fredholm M. and Thomsen P. D// VariabledG-dT) n" (dC-dA) n Sequences in the Porcine Genome. Genomics. 1992. v.12. P.281−288.
  145. Womack J.E. The goats and status of the bovine gene map// J. Dairy Sci. 1993. v. 76. P. 1199−1203.
  146. Womack J.E., Moll Y.D. Gene map of the cow: Conservation of linkage with mouse and man// J. Hered. 1986. v. 77. P.2−7.
Заполнить форму текущей работой

Пора сдавать?