На основании Федерального закона об ООПТ, Правительству России, орг анам исполнительной власти субъектов федерации и органам местного самоуправления дано право устанавливать и иные категории ООПТ, помимо тех, что рассмотрены выше. К ним относятся микрозаповедники, микрозаказники, охраняемые береговые линии, охраняемые речные системы, этноприродные парки, экологические коридоры и др. — всего около 250 различных категорий.
Объекты такого рода могут иметь различное значение или уровень: федеральный, региональный или местный. Примерами федеральных ООПТ этой группы категорий могут служить леса водоохранных зон, защитные леса вдоль железнодорожных путей и др.
Гораздо шире список региональных ООПТ, устанавливаемых субъектами федерации. Например, Республика Саха (Якутия) среди своих ООПТ имеет национальные природные резерваты, национальные ресурсные резерваты и охраняемые ландшафты; Республика Хакасия — эколого-этнические, ландшафтно-исторические и эколого-рекреационные зоны; Красноярский край — микрозаповедники и микрозаказники, охраняемые водно-болотные угодья, биологические станции (учебно-научные стационары), охраняемые водные объекты, городские леса и городские парки; Свердловская область — ландшафтные парки, этно-природные зоны, генетические резерваты; Пермская область имеет природную заповедную территорию областного значения, природный резерват областного и местного значения. Список этот можно продолжить.
Количество специальных ООПТ, созданных на местном (муниципальном) уровне, пока незначительно. В «Комментариях к федеральному закону…» 2001 г., откуда взяты и перечисленные примеры, содержится всего один объект — экологический парк «Черное озеро» в Засвияжском районе г. Ульяновска.