Стадия обжалования решений налоговых органов призвана защитить интересы тех лиц, в отношении которых они вынесены. Как и всякий акт органов административной юрисдикции, решение о привлечении к ответственности за совершение налогового правонарушения и решение об отказе в привлечении к ответственности за совершение налогового правонарушения могут быть обжалованы и в административном порядке — в вышестоящем налоговом органе, и в судебном порядке. Статья 101.2 НК предусматривает некоторые особенности обжалования данной категории решений. Прежде всего следует обратить внимание, что в суде указанные решения могут быть обжалованы только при соблюдении обязательного досудебного обжалования в вышестоящем органе. Иными словами, сначала свое суждение по решению должен вынести вышестоящий налоговый орган, а затем это решение можно обжаловать в суде. Подобный порядок призван снизить нагрузку на судебную систему, допуская к рассмотрению в суде только те споры, которые не были разрешены в вышестоящем налоговом органе. Рассмотрение арбитражным судом или судом общей юрисдикции заявлений о признании недействительными решений о привлечении к ответственности за совершение налогового правонарушения или об отказе в привлечении к ответственности за совершение налогового правонарушения осуществляется в порядке, предусмотренном для обжалования актов государственных органов. Особенностью рассмотрения в суде этой категории дел является то, что бремя доказывания своей правоты возложено законодателем не на лицо, подавшее заявление, а на орган, вынесший обжалуемое решение.
Что касается обжалования решений, выносимых по итогам налоговых проверок в вышестоящем налоговом органе, то порядок их обжалования зависит от того, вступило или не вступило решение в силу. Если решение не вступило в законную силу, то оно обжалуется в апелляционном порядке. При этом жалоба подается в тот налоговый орган, который вынес решение, для последующей передачи в вышестоящий налоговый орган вместе с другими материалами дела. Если решение уже вступило в силу (т.е. прошло 10 дней с момента его вручения лицу, в отношении которого оно вынесено, и не было подано апелляционной жалобы или же апелляционная жалоба не была удовлетворена), то лицо, в отношении которого оно вынесено, вправе подать жалобу в вышестоящий налоговый орган. Такая жалоба подается в вышестоящий орган в течение трех месяцев со дня, когда лицо узнало или должно было узнать о нарушении своих прав (п. 2 ст. 139 НК). При этом жалоба направляется уже непосредственно в вышестоящий налоговый орган. В случае необходимости вышестоящий налоговый орган истребует материалы из той налоговой инспекции, которая вынесла обжалуемое решение.
