Биоразнообразие энтеробактерий в природных местообитаниях Нижегородской области
Диссертация
Апробация работы. Результаты работы представлены на VIII Всероссийском популяционном семинаре «Популяции в пространстве и во времени» (Н.Новгород, 2005), научной конференции «Новые технологии в профилактике, диагностике, эпиднадзоре и лечении инфекционных заболеваний» (Н.Новгород, 2006), на 10-й Пущинской школе-конференции молодых ученых «Биология — наука 21 века» (Пущино, 2006), Всероссийской… Читать ещё >
Содержание
- ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ Ы. Условно-патогенные бактерии в природе. Экологические аспекты
- 1. 1. 1. Сапрофитическая природа возбудителей
- 1. 1. 2. Типы природных резервуаров бактерий 13 1.2. Возможные резервуары энтеробактерий в природе
- 1. 2. 1. Почва как среда обитания микроорганизмов
- 1. 2. 1. 1. Влияние дождевых червей {Lumbricus terrestris L.) на почву
- 1. 2. 1. 2. Видовой состав бактерий кишечной группы, встречающихся в почве
- 1. 2. 2. Муравьи и их гнезда
- 1. 2. 3. Растения как резервуары энтеробактерий в окружающей среде
- 1. 2. 3. 1. Формирование эпифитной микрофлоры
- 1. 2. 3. 2. Источники питания эпифитной микрофлоры
- 1. 2. 3. 3. Состав микроорганизмов на надземных органах растений
- 1. 2. 4. Пчелы как резервуар энтеробактерий в природе
- 3. 1. Поиск новых резервуаров энтеробактерий в природной среде
- 3. 1. 1. Пейзаж энтеробактерий в составе общей микрофлоры медоносных пчел
- 3. 1. 2. Анализ энтерофлоры медоносных растений
- 3. 1. 2. 1. Исследование энтерофлоры липы сердцевидной
- 3. 1. 2. 2. Исследование энтерофлоры цветов малины
- 3. 1. 2. 3. Исследование энтерофлоры цветов одуванчика
- 3. 1. 2. 4. Исследование энтерофлоры вегетативной части кипрея узколистного
- 3. 1. 2. 5. Исследование микрофлоры вегетативной части клевера лугового
- 3. 1. 2. 6. Медоносные растения как резервуар энтеробактерий в природе
- 3. 1. 3. Исследование пейзажа энтеробактерий в компонентах муравейника
- 3. 1. 4. Исследование энтерофлоры содержимого кишечника дождевых червей
- 3. 1. 5. Природные резервуары бактерий сем. Entevobacteriaeae
- 3. 2. Распространение бактерий Klebsiella sp. в исследуемых природных субстратах
- 3. 3. Изучение физиоло го-биохимических свойств штаммов Klebsiella pneumoniae, изолированных из различных источников
- 3. 3. 1. Изучение адаптационных свойств 92 3.3.1.1 .Способность фиксировать атмосферный азот
- 3. 3. 1. 2. Способность роста при высоких значениях хлористого натрия 94 в среде
- 313. 1. 3. Антагонистическая активность штаммов
- 3. 3. 1. 4. Устойчивость штаммов к действию эфирных масел
- 3. 3. 2. Исследование потенциальной патогенности штаммов
- 3. 3. 2. 1. Поиск генов, кодирующих токсины энтеробактерий
- 3. 3. 2. 2. Изучение антибиотикорезистентности штаммов
- 3. 3. 2. 3. Исследование гемолитической, лецитиназной, фосфатазной и ДНК-азной активностей
- 3. 3. 2. 4. Анализ адгезивности культур к эритроцитам человека
- 3. 3. 2. 5. Исследование лизогенности культур клебсиеллезным бактериофагом (1^мБио, Н. Новгород)
- 3. 3. 2. 5. 1. Исследование литической активности клебсиеллёзного бактериофага в отношении штаммов, изолированных от насекомых
- 3. 3. 2. 5. 2. Лизирование бактериофагом штаммов Klebsiella pneumoniae, выделенных из почвы
- 3. 3. 2. 5. 3. Лизирование бактериофагом штаммов Klebsiella pneumoniae, выделенных от растений
- 3. 3. 2. 5. 4. Исследование литической активности поливалентного бактериофага в отношении штаммов Klebsiella pneumoniae, выделенных из организма человека
- 3. 3. 3. Физиолого-биохимические свойства штаммов Klebsiella pneumoniae, выделенных из различных местообитаний
- 3. 3. 1. Изучение адаптационных свойств 92 3.3.1.1 .Способность фиксировать атмосферный азот
Список литературы
- Алексахина Н.Н., Мирясова Л. В., Баснакьян И. А. Влияние оксидов металлов на рост, гемолитические и серологические свойства Klebsiella pneumoniae//Микробиология. 2002. № 6. С. 13 — 18.
- Алешукина А.Н. Медицинская микробиология.- Ростов: Феникс, 2003.-480с.
- Аркадьева З. А, Безбородов A.M., Блохина И. Н., Воробьёва Л. И., Головлёв Е. Л., Головлёва Л. А., и др. Промышленная микробиология. М.: Высш. шк., 1989.-688с.
- Африкян Э.К. Энтомопатогенные бактерии и их значение. Ереван: Изд-во АН Армянской ССР, 1973. 362 с.
- Бергер М.О. Справочник по микробиологическим и вирусологическим методам исследования. М: Медицина, 1982. 224с.
- Берджи. Определитель бактерий. Под ред. Дж. Хоулта, Н. Крига, П. Снита. М.: Мир, 1997.
- Блохина И.Н., Ладыгина Т. Н., Соколова К. Я. и др. Методы идентификации бактерий. Горький, 1986. 76 с.
- Бондаренко В.М. Общий анализ представлений о патогенных и условно-патогенных бактериях // Микробиология. 1997. № 4. С. 20 26.
- Бондаренко В.М. Факторы патогенности бактерий и их роль в развитии инфекционного процесса //Микробиология. 2001. № 4. С. 67−74.
- Бондаренко В.М. «Острова» патогенности бактерий //Микробиология. 2001. № 6. С. 54−61.
- Брилис В.И., Брилене Т. А., Ленцнер Х. П., Лешнер А. А. Методика изучения адгезивного процесса микроорганизмов // Лабораторное дело. 1986. № 4. С. 210−212.
- Бухарин О.В. Биомедицинские аспекты персистенции бактерий // ЖМЭИ. 1994. № 5, С. 4−13.
- З.Бухарин О. В., Стадников А. А., Усвяцов Б. Я. Особенности взаимодействия бактерий с эритроцитами и их роль в развитии инфекционного процесса // Микробиология, эпидемиология и иммунология. 2006. № 4. С. 25 — 28.
- Н.Бухарин О. В., Усвяцов Б. Я, Ханина Е. А. Способ определения антигемоглобиновой активности микроорганизмов (патент РФ № 2 262 705). М., 2005. 29с.
- Бухарин О. В., Литвин В. Ю. Патогенные бактерии в природных экосистемах. Екатеринбург, 1997.
- Бызов Б.А. Зоомикробные взаимодействия в почве. М.: ГЕОС, 2005. с. 213.
- Ваксман С.А. Актиномицеты. М: Мир, 1945. С 89.1<8.Вигоров Л. Н. О выделении веществ проростками пшеницы при гуттации //Природа. № 2. 1954.
- Возняковская Ю.М. Микрофлора растений и урожай. Л: Колос, 1969. 240 с.
- Габидуллин З.Г., Габидуллин Ю. З., Ахтариева А. А., Мамбетова Э. Ф. Характеристика свойств, определяющих персистенцию моно- и ассоциатированных культур условно патогенных энтеробактерий // Микробиология. 2006. № 4. С. 62−64.
- Габрилович И.М. Практическое пособие по бактериофагии. М.: Высш. шк., 1968.-190с.t
- Гинцбург A. JI. Мезанизм действия и природа факторов, индуцирующих образование некультивируемых форм Salmonella tiphymurium //Микробиология. 1999. № 6. С.3−8.
- Гинцбург A. JT., Романова Ю. М. Некультивируемые формы бактерий и их роль в сохранении сапронозов во внешней среде // Микробиология. 1997.3. с. 116−121.
- Голиченков М. В., Нейматов A.JT. Сезонная динамика микробиологической активности серых лесных почв под муравейниками Lasius niger // «Муравьи и защита леса»: Матер. ХП Всеросс. мирмекол. симп. Новосибирск, 2005. С.218−220.
- Головлев E.JI. Экологическая стратегия бактерий: специфика проблемы// Микробиология. 2001. Т.70, № 4, С. 437−443.
- Государственная Фармакопея СССР. МЗ СССР. М.:Медицина, 1989. Вып.1. 333 с.
- Гоггшалк Г. Метаболизм бактерий. М: Мир, 1982. С. 280−285
- Голубев В.И., Бабьева И. П. Методы выделения и идентификации дрожжей. М: Пищевая промышленность, 1979
- Громов Б.В., Павленко Г. В. Экология бактерий. JI: Издательство ленинградского университета, 1989. 247с.
- Гузев B.C., Бызов Б. А. Морфометрический анализ бактерий, ассоциированных с почвенными многоножками // Микробиология. 2006. Т.75, № 2. С. 264−270.
- Домарадский И. В. Некоторые проблемы адаптации патогенных бактерий к окружающей среде // Микробиология. 1997. № 4. С.29−34.
- Егоров Н. С. Основы учения об антибиотиках. М.: Наука, 2004. С.253−257.
- Егоров Н. С., Баранова И. П. Бактериоцины. Образование, свойства, применение // Антибиотики и химиотерапия. 1999. Т.44, № 1. С.33−40.
- Ефимова Н.М., Каменева М. А., Функнер Е. В. Бактериофаги биологические антисептики // Тр. Межд. науч. конф.: Рациональное природопользование, здоровье населения. Пермь, 2001. Т. 4. С. 206−208.
- Жеребцова Н.Ю., Баймиев А. Х., Валишин Д. А. Генетические маркеры патогенности условно патогенных энтеробактерий, выделенных у детей и подростков при острых кишечных инфекциях // Микробиология. 2007. № 2. С. 3−8.
- Зуева Л.П., Поляк М. С., Кафтырева Л. А. и др. Эпидемиологический мониторинг антибиотикорезистентности микроорганизмов с использованием компьютерной программы WHONET (методические рекомендации). СПб., 2004. 42с.
- Иванов Н.Р., Бриль Г. Е. Экология и патогенность // Микробиология. 1984. № 9. С. З -9.
- Иванов Д.Р., Крапивина И. В. Этиология внутрибольничных инфекций, вызванных грамотрицательными бактериями, и профиль их антибиотикорезистентности // Микробиология. 2007. № 5. С. 90−93.
- Иванова Т.Н. Микробиологические особенности дисбиоза кишечника у жителей крайнего севера. Пермь. 2007. Автореферат.
- Климова С.Ю., Нетрусов А. И., Цавкелова Е. А., Чердынцева Т. А. Микроорганизмы — продуценты стимуляторов роста растений и их практическое применение // Прикладная биохимия и микробиология. 2006. Т.42, № 2. с. 133- 143.
- Коганова Г. А., Рахлеева А. А. Ценотические отношения в муравейниках: разнообразие и распределение раковинных амеб (Protista, Testacea) // «Муравьи и защита леса»: Матер. ХП Всеросс. мирмекол. симп. Новосибирск, 2005. С. 106−110.
- Крапивина И.В., Галеева Е. В. Антибиотикочувствительность и молекулярные механизмы резистентности к бета-лактамазам грамотрицательных микроорганизмов возбудителей внутрибольничных инфекций // Микробиология. 2007. № 5. С. 16−20.
- Кулагин B.C. Роль муравьев в циркуляции энтомопатогенных кристалломорфных бацилл в лесном биоценозе // Муравьи и защита леса. Материалы 4 Всесоюзного мирмекологического симпозиума. М., 1971. С. 4851.
- Кулдай Д.Г., Лиходод В. Г. Бактериоциногения. Л.: «Медицина», 1966. 203с.
- Литвин В.Ю. Сапрофитическая фаза в экологии возбудителей инфекционных заболеваний // ЖМЭИ. 1985. № 6. С.98−103.
- Литвин В.Ю., Пушкарева В. И. Факторы патогенности бактерий: функции в окружающей среде // Микробиология. 1994. 35. с.83−87.
- Литвин В.Ю. Эколого-эпидемиологические аспекты случайного паразитизма некоторых патогенных бактерий //ЖМЭИ. 1986. № 1. С.85−91.
- Литвин В.Ю. Категории общей эпидемиологии в связи с проблемой сапронозов//ЖМЭИ. 1988. № 3. С.93−99.
- Литвин В. Ю. Общие закономерности и механизмы существованияпатогенных микроорганизмов в почвенных и водных экосистемах // Экология iвозбудителей сапронозов: Сб. науч. тр. М., 1988. С. 20−34.
- Литвин В. Ю. Потенциальная патогенность и случайный паразитизм микроорганизмов // Потенциально патогенные бактерии в природе: Сб. науч.тр. М., 1991. С. 9−30.
- Литвин В. Ю., Емельяненко Е. Н., Пушкарева В. И. Патогенныебактерии общие для человека и растений: проблема и факты // t
- Микробиология. 1996. № 2. С. 101−104.
- Литвин В. Ю., Коренберг Э. И., Природная очаговость болезней: развитие концепции к исходу века// Природная очаговость болезней: исследования института Гамалеи РАМН. Под ред. Проф. Э. И. Коренберга. М.:Русаки. 2003. С. 12−34.
- Лобакова Е.С. Ассоциативные микроорганизмы растительных симбиозов. М. 2004. 48с. Автореферат.
- Мавзютов А.Р., Бондаренко В. М., Жеребцова Н. Ю. Факторы патогенности оппортунистических энтеробактерий и их роль в развитии диареи // Микробиология. 2007. № 1. С.89−97.
- Маркова Ю. А., Романенко А. С., Духанина А. В. Выделение бактерий семейства Enterobacteriaceae из растительных тканей. // Микробиология. 2005. Т.74, № 5,С. 663−666.
- Микрофлора почв, www.ssmu.ru.html, 2006.
- Мишустин Е.Н. Почвенные организмы как компоненты биогеоценоза. М., 1984. 246с.
- Мнацаканов С.Т., Коцинян М. Е. О выделении энтеробактерий у КРС // Биологический журнал Армении. 1984. № 2. С. 100−152.
- Навашин С. М. Отечественному пенициллину 50 лет: история и прогнозы // Антибиотики и химиотерапия. 1994. Т.39, № 1. С. 3−10.
- Непомилуев В.Ф., Федоров М. В. Основные формы ризосферных бактерий клевера и их количественное содержание в ризосфере по фазам развития растения и года его жизни // Микробиология. 1954. Т. 23, № 4.
- Нетрусов А.И., Цавкелова Е. А., Чердынцева А. И. Образование ауксинов бактериями, ассоциированными с корнями орхидей // Микробиология. 2005. Т.74, № 1. С. 55 62.
- Новикова Н.С. Бактериальная флора надземных органов растений. Изд. АН УССР. 1965. I
- Перетц Л.Г., Медвинская К. Г. Гигиена и санитария. М., 1965. 27с.
- Перцовская М.И. Санитарная микробиология. М.: Медицина, 1989. 254с.
- Пивоваров Ю.П., Лапенков М. И., Меренюк Г. В. Определитель санитарно-значимых микроорганизмов. Справочник. Изд. «Штиинца». Кишинев. 1982. 156 с.
- Подборнов В. М. Клещи и сальмонеллы // Дезинфекционное дело. № 2. 2000.
- Покровский В.И., Малеев В. В. Актуальные проблемы инфекционнойпатологии//Эпидемиология и инфекционные болезни. 1999. № 2. С.17−20.i
- Покровский В.И. Энтеробактерии. М.: Медицина, 1990. 321с
- Покровский В.И. Медицинская микробиология. М: ГЭОТАР Медицина, 1999. С. 352−353.
- Поправке С. А. Растения и пчелы. М.: Агропромиздат, 1985. 240 с.
- Приказ № 535. Об унификации микробиологических (бактериологических)методов исследования, применяемых в клинико-диагностическихлабораториях лечебно-профилактических учреждений. М., 1985. 36с.133
- Проворов Н.А., Воробьев Н. И., Андронов Е. Е. Макро- и микроэволюция бактерий в системах симбиоза //Генетика. 2008 Т. 44, № 1. С. 12−26.
- Прозоров А.А. Горизонтальный перенос генов у бактерий: лабораторное моделирование, природные популяции, данные геномики // Микробиология. 1999. Т.68, № 5. С.632−646.
- Розенберг Г. С., Мозговой Д. П., Гелашвили Д. Б. Экология. Элементы теоретических конструкций современной экологии. Самара, 1999. 395 с.
- Рокицкий П.Ф. Биологическая статистика. Минск: Высшая школа, 1964. 328 с.
- Романова Ю.М., Гинцбург A.JT. Есть ли сходство в механизмах образования «некультивируемых форм» у грамотрицательных бактерий и спор у бацилл? // Молекулярная генетика. 1993. № 6. С.34−37.
- Романова Ю.М., Гинцбург A.JI. Участие мобильных элементов в формировании свойств патогенных бактерий // Микробиология. 1999. № 5. С.22−29.
- Романова Ю.М., Смирнова Т. А., Андреев A.JL, Ильина Т. С., Диденко JT.B., Цинцбург A.JT. Образование биопленок пример «социального» поведения бактерий // Микробиология. 2006. Т. 75, № 4. С. 556−561.
- Романова Ю.М., Бошнаков Р. Х., Баскаков Т. В., Гинцбург A.JT. Механизмы активации патогенных бактерий в организме хозяина // Микробиология. 2000. № 4. С.7−11.
- Руководство к лабораторным занятиям по микробиологии. Под редакц. проф. JL Б. Борисова. М: Медицина, 1984. 256 с.
- Салимов P.M. Выделение и выживаемость гафний и шигелл в различных медах //Повышение продуктивности сельскохозяйственных животных: Сб. науч. тр. Приморский сельхозинститут, 1978. Вып.47. С.60−66.
- Солдатченко B.C. История применения эфирных масел в медицине. 2007. http://www.aroma-doctor.com/history
- Сомов П.П., Литвин В. Ю. Сапрофитизм и паразитизм патогенных бактерий: экологические аспекты. Новосибирск: Наука, 1988. 207с.
- Супотницкий М.В. Микроорганизмы токсины и эпидемии. М., 2000.
- Телесманч Н.Р., Ломов Ю. М., Бардых И. Х. Адгезивные и некоторые другие свойства энтеробактерий, изолированных из объектов внешней среды Ростовской области в 2002 году // Микробиология, эпидемиология и иммунология. 2004. № 6. С. 3- 6.
- Тихоненко А.С. Ультраструктура вирусов бактерий. — М.: Наука, 1968.-90с.
- Тиунов А.В., Добровольская Т. Г., Полянская Л. М. Микробные комплексы в стенках жилых и покинутых нор дождевых червей Lumbricus terrestris L. дерново-подзолистой почве.//Почвоведение, 2001. № 5. с. 594−599.
- Третьякова Е.Б., Добровольская Т. Г., Бызов Б. А., Звягинцев Д. Г. Сообщества бактерий, ассоциированные с почвенными беспозвоночными // Микробиология. 1996. Т.65, № 1. с. 102−110.
- Туктаров В.Р., Тетрациклины. М: Наука, 2000. С. 52.
- Фёдоров М.В. Почвенная микробиология. М., 1974. 113с.
- Холодный Н.Г. Летучие выделения цветов и листьев как источника питания микроорганизмов // ДАН СССР. 1944. Т. 43, № 2.
- Хомяков Н.В., Добровольская Т. С., Нечитайло Т. Ю. и др. Судьба бактерий в кишечнике дождевых червей // Экология и биология почв. Материалы междунар. науч. конф. Ростов-на-Дону, 21−25 апреля 2005 г., 2005. с. 523−528.i135
- Хомяков Н.В., Харин С. А., Нечитайло Т. Ю. и др. реакция микроорганизмов на воздействие пищеварительной жидкости дождевых червей // Микробиология. 2007. Т.76, № 1. с.55−64.
- Цавкелова Е.А., Климова С. Ю., Нетрусов А. И., Чердынцева Т. А. Микроорганизмы — продуценты стимуляторов роста растений и их практическое применение // Прикладная биохимия и микробиология.2006. Т.42, № 2. с. 133 143. <
- Шустрова Н.М., Дубровский Ю. А. Природные резервуары условно-патогенных бактерий // Потенциально-патогенные бактерии в природе.
- Amellal N., Burtin G., Bartoli F., Heulin T. Colonization of Wheat Roots byan Exopolysaccharide-Producing Pantoea agglomerans Strain and Its Effect on
- Rhizosphere Soil Aggregation Applied and Enviromental Microbiology, Vol. 64, i
- No. 10. Oct. 1998, p. 3740−3747
- Anderson J.M. soil organisms as engineers: microsite modulation of macroscale processes // Linking Species and Ecosystems. C.J. Jones, J.H. Lawton (eds.). Champan and Hall, New York. 1995. p. 94−106.
- Andrews J., Hirano S. Microbial ecology of leaves. New York: Springer, 1991.449р.
- Bagley S. T. Isolation of Klebsielleae from within living wood // Applied and environmental Microbiology, July 1978, p. 178−185
- П0. Bagley S. T. Primary Klebsiella Identification with MacConkey-Inositol-Carbenicillin Agar// Applied and environmental Microbiology, Sept. 1978, p. 536 538
- Bagley S. T. Significance of Fecal Coliform-Positive Klebsiella // Applied and environmental Microbiology, May 1977, p. 1141−1148
- Barak J. D., Gorski L., Pejman Naraghi-Arani, Amy O. Charkowski2 Salmonella enterica Virulence Genes Are Required for Bacterial Attachment to Riant Tissue // Applied and environmental Microbiology, Oct. 2005, Vol. 71, No. 10. p. 5685−5691
- Beattie, G. A., Lindow S. E. The secret life of foliar bacterial pathogens on leaves. Annu. Rev. Phytopathol. 1995.33:145−172.
- Beattie, G. A., Lindow S. E. Bacterial colonization of leaves: a spectrum of strategies. Phytopathology 1999. 89:353−359
- Brandl M. Т., Lindow S. E. Cloning and Characterization of a Locus Encoding an Indolepyruvate Decarboxylase Involved in Indole-3-Acetic Acid Synthesis in Envinia herbicola Applied and Enviromental Microbiology, Vol. 62, No. 11, Nov. 1996, p. 4121−4128
- Burwen, D. R., S. N. Banerjee, and R. P. Gaynes. Ceftazidime resistance among selected nosocomial gram-negative bacilli in the United States. J. Infect. Dis. 1.-994.170:1622−1625.
- Byzov B.A., Kurakov A.V., Tretyakova E.B., e.a. Principles of the digestion of microorganisms in the gut of soil millipedes: specificity and possible mechanisms//Appl. Soil. Ecol. 1998. v.9. p. 145−151.
- Chelius M. K. Immunolocalization of dinitrogenase reductase produced by Klebsiella pneumoniae in association with Zea mays L. // Applied and environmental Microbiology, Feb. 2000, p. 783−787
- Chernin L., Ismailov Z., Haran S. Chitinolytic Enterobacter agglomerans antagonistic to fungal plant pathogens // Applied and environmental Microbiology, May 1995, p. 1720−1726
- Chiarini L., Tabacchioni S., Beverino A. Interactions between rhizosphere microorganisms under iron limitation // Arch. Microbiol. 1993. V. 160. P. 68−73.
- Duncan D. W. Klebsiella biotypes among coliforms isolated from forest environments and farm produce // Applied and environmental Microbiology, Dec. 1972, p. 933−938
- Edwards C.A., Lofty J.R. Biology of Earthworms. London, Chapman & Hall, 1977. 190p.
- Haahtela K. Root -associated N2 fixation (acetylene reduction) by Enterobacteriaceae and Azospirillum strains in cold-climate spondosols // Applied and environmental Microbiology, Jan. 1981, p. 203−206
- Haahtela K. Associative nitrogen fixation by Klebsiella spp.: adhesion sites and inoculation effects on grass roots // Applied and environmental Microbiology, Nov. 1986, p. 1074−1079
- Halda-Alija L. Incidence of antibiotic-resistant Klebsiella pneumoniae ands
- Enterobacter species in freshwater wetlands // Letters in Applied Microbiology 2004, 39, 445−450
- Han Ch., Salonen N. Culture-Independent Analysis of Fecal Enterobacteria in Environmental Samples by Single-Cell mRNA Profiling // Applied and Environmental Microbiology. 2004. Aug. P. 4432−4439.
- Jacobs J. L., Sundin G. W. Effect of Solar UV-B Radiation on a Phyllosphere Bacterial Community // Applied and environmental Microbiology, Dec. 2001, Vol. 67, No. 12 p. 5488−5496
- Janssen P. H. Identifying the Dominant Soil Bacterial Taxa in Libraries of 16S rRNA and 16S rRNA Genes. Applied and Enviromental Microbiology, Mar. 2006, p.1719−1728
- Jenks P. J., Akalin E., Bergan T. Susceptibility testing of Klebsiella spp. an international collaborative study in quality assessment // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 1998. № 42. P. 29−48.
- Johan H. J. Leveau and Steven E. Lindow Appetite of an epiphyte: Quantitative monitoring of bacterial sugar consumption in the phyllosphere. PNAS, March 13, 2001, vol. 98, no. 6, p. 3446−3453.
- Lichter A., Barash I., Valinsky L., Manulis S. The Genes Involved in Cytokinin Biosynthesis in Envinia hevbicola pv. gypsophilae: Characterization and Role in Gall Formation // J. of Bacteriology, Aug. 1995, Vol. 177, No. 15, P. 44 574 465
- Lidija Halda-Alija Identification of indole-3-acetic acid producing freshwater wetland rhizosphere bacteria associated with Juncus effiisus L. Can. J. Microbiol./Rev. can. microbiol. 49(12): 781−787 (2003)
- Leveau H.J., Lindow S.E. Appetite of an epiphyte: quantitativy monitoring of bacterial sugar consumption in the phyllosphere // PNAS: 2001. V.98, № 6. P. 34 463 453
- Makeschin F. Earthworms (Lumbricidae: Oligochaeta): Important promoters of soil development and soil fertility // Fauna in soil ecosystems. Recyclingprocesses, nutrient flexes and agricultural prodaction / Ed. Benckiser G. 1997. p. 173−223.
- Materon L. A., Hagedom C. Competitiveness of Rhizobium trifolii Strains Associated with Red Clover (Trifolium pratense L.) in Mississippi Soils. Applied and Enviromental Microbiology, Nov. 1982, P. 1096−1101
- Matsen J. M. Characterisanion of Klebsiella isolates from natural receiving waters and comparison with human isolates // Applied Microbiology, Oct. 1974, p. 672−678
- McCoy R. H. Potential pathogens in the environment: isolation, enumeration, and identification of seven genera of intestinal bacteria associated with small green pet turtles // Applied Microbiology, Apr. 1973, p. 534−538
- Neilson A. H. Acetylene reduction (nitrogen fixation) by Enterobacteriaceae isolated from paper mill process waters // Applied and environmental Microbiology, Aug. 1976, p. 197−205
- Ming Guo, Shulamit Manulis, Isaac Barash, and Amnon Lichter The operon for cytokinin biosynthesis of Envinia herbicola pv. gypsophilae contains two promoters and is plant induced. Can. J. Microbiol./Rev. can. microbiol. 47(12): 1126−1131 (2001)
- Monier J.M.. Lindow S. E Aggregates of Resident Bacteria Facilitate Survival of Immigrant Bacteria on Leaf Surfaces. Microbial Ecology, Vol. 49, No. 3, April, 2005, p. 343−352
- Monier J.M., Lindow S.E. Frequency, size, and iocalization of bacterial aggregates on bean leaf surfaces // Appl. Environ. Microbiol. 2004. № 70, P. 34 6355t
- Morris C.E., Monier J.M. The ecological significance of biofilm formation by plant-associated bacteria // Annu.Rev.Phytopathol. 2003. № 41, P. 429−453
- Ochuba G.U., Riesen V.L. Fermentetion of polysaccharides by Klebsielleae and other facultative bacilli // Applied and environmental Microbiology, May 1980, p. 988−992
- Parle J.N. A microbial study of earthworms casts // J. Gen. Microbial. 1963. v.31. p.13−22.
- Г53. Pofschun R., Ullmann U. Klebsiella spp. as Nosocomial Pathogens: Epidemiology, Taxonomy, Typing Methods, and Pathogenicity Factors // Clinical Microbiology Reviews. 1998. Oct. P. 589−603.
- Ramey B.E., Koutsoudis M. Biofilm formation in plant-microbe associations // Current opinion in microbiology. 2004. № 7. P.602−609
- Sahly H., Podschun R. Clinical, Bacteriological, and Serological Aspects of Klebsiella Infections and Their Spondylarthropathic Sequelae // Clinical and diagnostic laboratory immunology, July 1997, Vol. 4, No. 4 p. 393−399
- Schroder, D. Intracellular endosymbiotic bacteria of Camponotus species (carpenter ants): systematics, evolution and ultrastructural characterization/ D. Schroder, H. Deppisch, M. Obermayer, G. Krohne // Mol Microbiol. 1996. № 21. P. 479−489.
- Seidler R. J. Potential pathogens in environment: cultural reactions and nucleic acid studies on Klebsiella pneumoniae from clinical and environmental sources // Applied and environmental Microbiology, June 1975, p. 819−825
- Seidler R. J. Biochemical Characteristics and Virulence of Environmental
- Group F Bacteria Isolated in the United States // Applied and environmental
- Microbiology, Oct. 1980, p. 715−720 i
- Steinhaus E. A. A study of the bacteria associated with thirty species of insects, 1941. Downloaded fromjb.asm.org by on July 30, 2007
- Talbot H. W. Gas Chromatographic Analysis of In Situ Cyclitol Utilization by Klebsielleae Growing in Redwood Extracts // Applied and environmental Microbiology, Oct. 1979, p. 599−605
- Talbot H.W., Seildler R.J. Cyclitol utilization associated with the presence of Klebsielleae in botanical environments// Applied and environmental Microbiology, May 1979, p. 909−915
- Tiunov A.Y., Scheu S. Microfungal communities in soil, litter and casts of Lumbricus terrestris L. (Lumbricidae): a laboratory experiment.// Appl. Soil. Ecol. 2000. V.14. p. 17−26.
- Toyoto K., Kimura M. Microbial community indigenous to the earthworms Lumbricus terrestris L.// Biol. Fertil. Soils. 2000. V.31, №¾. p. 187−190.
- Tsavkelova E. A. Bacteria associated with orchid roots and microbial production of auxin //Microbiological Research 162, 2007, p. 69−76
- Widmer F. Analysis of nifH Gene Pool Complexity in Soil and Litter at a Douglas Fir Forest Site in the Oregon Cascade Mountain Range // Applied and environmental Microbiology, Feb. 1999, p. 374−380
- Wilson M.- Hirano S. S., Lindow S. E. Location and Survival of Leaf-Associated Bacteria in Relation to Pathogenicity and Potential for Growth within the Leaf. Applied and Environmental Microbiology, Vol. 65, No. 4. Apr. 1999, p. 1435−1443
- Yadav R. K. P., Karamanoli" K. and D. Vokou Bacterial Colonization of the Phyllosphere of Mediterranean Perennial Species as Influenced by Leaf Structural and Chemical Features. Microbial Ecology Vol. 50, No. 2, August, 2005, p. 185 196
- Успехибиологическойнаукив1999г.http://bio. 1 septcmber.ru/article.php?rD=200 000 606. 2 000 174. http://www.sciteclibrary.ru/, 2 009 175. http://www.haerbiona.ru, 2008sг
- Первоначально для выбора критерия, с помощью которого будет проводитьсяанализ, необходимо было определиться подходят ли данные под нормальноераспределение или использовать непараметрические критерии, t
- Для определения нормальности распределения данных по биоразнообразию в изучаемых объектах пользовались критериями Колмогорова-Смирнова, Лиллиефорса и Шапиро-Уилка.