Генетическая характеристика новых типов скота бурой швицкой и сычевской пород Смоленской области по микросателлитам
Диссертация
Одним из путей генетического усовершенствования молочного скота является создание новых специализированных типов. Эффективным приемом, в этой связи, является «прилитие крови» высокопродуктивных пород с последующим целенаправленным отбором помесных животных разных долей кровности по улучшаемой породе и их разведением «в себе». Такая стратегия обеспечивает, с одной стороны, сохранение ценных… Читать ещё >
Содержание
- СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
- 1. ВВЕДЕНИЕ
- 2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
- 2. 1. История создания новых типов скота сычевской и 10 бурой швицкой пород в Смоленской области
- 2. 1. 1. Смоленский тип бурого швицкого скота
- 2. 1. 2. Вазузский тип сычевского скота
- 2. 2. Введение в геномный анализ
- 2. 3. Определение и свойства микросателлитов
- 2. 4. Эволюция микросателлитов
- 2. 5. Методы анализа микросателлитов
- 2. 6. Проблемы и ограничения использования МС
- 2. 7. Выбор микросателлитных локусов
- 2. 8. Области применения микросателлитов
- 2. 9. Связь МС с признаками продуктивности 41
- 2. 1. История создания новых типов скота сычевской и 10 бурой швицкой пород в Смоленской области
- Заключение
- 3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДИКА ИССЛЕДОВАНИЙ
- 3. 1. Животные
- 3. 2. Реактивы и оборудование
- 3. 2. 1. Реактивы и расходные материалы
- 3. 2. 2. Оборудование
- 3. 3. Методы исследований
- 4. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
- 4. 1. Анализ продуктивных показателей коров Смоленского 55 и Вазузского типов
- 4. 2. Характеристика аллелофонда изучаемых типов 63 крупного рогатого скота по микросателлитам
- 4. 3. Характеристика генетической консолидированности 88 изучаемых типов крупного рогатого скота
- 4. 4. Оценка уровня гетерозиготности и анализ показателей 97 F-статистики
- 4. 5. Анализ генеалогических связей изучаемых типов крупного рогатого скота
- 4. 6. Выявление связей аллелей МС с показателями молочной продуктивности изучаемых типов
- 4. 6. 1. Влияние аллелей МС на показатели молочной 107 продуктивности коров Смоленского типа бурой швицкой породы
- 4. 6. 2. Влияние аллелей МС на показатели молочной 116 продуктивности коров Вазузского типа сычевской породы
Список литературы
- Айала Ф. Введение в популяционную и эволюционную генетику / Ф. Айала. М.: Мир, 1984. 230 с.
- Бронекий В.И. Ускорение процесса совершенствования бурых пород скота при чистопородном разведении. // Селекция, гибридизация и акклиматизация сельскохозяйственных животных / Всесоюз. Акад. С.-х. наук им. В. И. Ленина. М.: 1983. С. 50−56.
- Брем Г., Кройслих X., Штранцингер Г. Экспериментальная генетика в животноводстве // М.: РАСХН, 1995. 326 с.
- Букаров Н.Г. Использование полиморфизма антигенов эритроцитов и главного комплекса тканевой совместимости в разведении и совершенствовании крупного рогатого скота: дис.. д-ра биол. наук, Дубровицы, 1995. 300 с.
- Вейр Б. Анализ генетических данных. М.: Мир, 1995. 400 с.
- Глазко В.И., Дунин И. М., Глазко Г. В., Калашникова Л. А. Введение в ДНК-технологии. М.: ФГНУ «Росинформагротех», 2001. 436 с.
- Гладырь Е.А., Зиновьева Н. А., Брем Г. Характеристика генофонда и выявление генеалогических связей между породами овец России с использованием ДНК-микросателлитов // Доклады Российской академии сельскохозяйственных наук, 2004. № 2. С. 26−29.
- Гладырь Е.А., Зиновьева Н. А., Каплинская Л. И., Брем Г., Мюллер М. / Методические рекомендации по молекулярно-генетическому анализу овец с использованием микросателлитных маркеров. РАСХН, 2004. С. 3−30.
- Данкверт С.А., Холманов A.M., Осадчая О. Ю. Скотоводство стран мира. М., 2007. 608 с.
- Дмитриев Н.Г. Современные тенденции в методах совершенствования пород крупного рогатого скота. // Методы совершенствования скота и птицы Сборник научных трудов ВНИИ разведения и генетики с.-х. животных, Ленинград, 1978. С. 13−21.
- Дмитриев Н.Г. Современные направления совершенствования существующих и создания новых пород молочного скота. // Современные методы селекции молочного скота. Сборник научных трудов. ВНИИ разведения и генетики с.-х. животных, Ленинград, 1981. С. 5−11.
- Дмитриев Н.Г., Басовский Н. З., Бойков Ю. В., Шульга Л. П. Пути увеличения генетического потенциала молочных пород скота. // Вестник сельскохозяйственной науки, № 1, 1982. С. 93−99.
- Дунин И.М. Использование мирового генофонда пород молочного скота. // Научные труды ВНИИплем, М.: 1990. С. 4−13.
- Дунин И., Спивак М., Прохоренко Л., Пархоменко Л., Князева Т., Зыскнова Р. Испытание пород на отличимость, однородность и стабильность. // Молочное и мясное скотоводство. № 6, 1997. С. 26−28.
- Животовский Л.А. Популяционная биометрия / Л. А. Животовский. -М.: Наука, 1991. 271 с.
- Животовский JI. А. Микросателлитная изменчивость в популяциях человека и методы ее изучения // Вестник ВОГиС, 2006. Том 10, № 1. С. 74−96.
- Захаров И.А. Генофонды сельскохозяйственных животных: генетические ресурсы животноводства России / отв. Ред. И. А. Захаров. М.: Наука, 2006. С. 77−82, 138−407.
- Зиновьева Н.А., Эрнст Л. К. Проблемы биотехнологии и селекции сельскохозяйственных животных. Дубровицы, ВИЖ, 2004. 316 с.
- Зиновьева Н.А., Ларионова П. В., Тихомирова Т. И., Гладырь Е. А., Шавырина К. М. Генетическая характеристика свиней пород крупная белая и йоркшир различного происхождения с использованием ДНК-маркеров // Доклады РАСХН, 2008, № 2, с. 33−36.
- Зиновьева Н.А., Стрекозов Н. И., Молофеева Л. А. Оценка роли ДНК-микросателлитов в генетической характеристике популяции черно-пестрого скота // Зоотехния, 2009, № 1, С. 2−4.
- Зиновьева Н.А., Костюнина О. В., Гладырь Е. А., Банникова А. Д., Харзинова В. Р., Ларионова П. В., Шавырина К. М., Эрнст Л. К. Роль ДНК -маркеров признаков продуктивности сельскохозяйственных животных // Зоотехния, 2010. № 1. С. 8−10.
- Зиновьева Н.А. Введение в ДНК-диагностику. Школа-практикум «Методы исследований в биотехнологии сельскохозяйственных животных», вып.4. — ВИЖ, 2005.- 134 с.
- Зиновьева Н.А., Серов В., Адаменко В., Эрнст Л. К. Сохранение локальных пород // Животноводство России. № 6, 2006. С. 46−47.
- Зиновьева Н. А., Гладырь Е. А., Державина Г., Кунаева Е. Методы маркер-зависимой селекции // Животноводство России. № 3, 2006. С. 29−31.
- Зиновьева Н.А., Попов А. П., Эрнст Л. К., Марзанов Н. С., Бочкарев В. В., Стрекозов Н. И., Брем Г. Методические рекомендации по использованию метода полимеразной цепной реакции в животноводстве. Дубровицы: ВИЖ, 1998. 47 с.
- Зиновьева Н.А., Гладырь Е. А., Эрнст Л. К., Брем Г. Введение в молекулярную генную диагностику сельскохозяйственных животных. ВИЖ, 2002. 112 с.
- Калашникова Л.А. Нуклеиновые кислоты в органах и тканях крупного рогатого скота и их взаимосвязь с хозяйственно-племенными качествами. // Сельскохозяйственная биология, 1986. № 1. С. 31−37.
- Калашникова Л.А., Дунин И. М., Глазко В. И. Селекция XXI века: использование ДНК-технологий // Московская обл., Лесные поляны, ВНИИплем, 2000. 31 с.
- Киселева Т. Ю, Подоба Б. Е., Заблудовский Е. Е., Терлецкий В. П., Воробьев Н. И., Kantanen J. Анализ 29 микросателлитных маркеров у локальных популяций крупного рогатого скота // Сельскохозяйственная биология.
- Кленовицкий П.М. Генетика и биотехнология в селекции животных / П. М. Кленовицкий, Н. С. Марзанов, В. А. Багиров, М. Г. Насибов. М.: ФГУП «Эксплор», 2004. — 285 с.
- Коновалова Е.Н., Сельцов В. И., Зиновьева Н. А. Характеристика симментальского скота различного происхождения с использованием ДНК-микросателлитов // Зоотехния, 2006. № 7. С. 6−9.
- Кугелев И.М. Сравнительная оценка сычёвской и швицкой пород крупного рогатого скота в нечерноземной зоне России: дис.. канд. с.-х. наук, Дубровицы, 2001. С. 3−29.
- Лакин Г. Ф. Биометрия: Учебное пособие для биологических специальностей вузов. -М.: Высшая школа, 1980. С. 291.
- Левонтин Р. Генетические основы эволюции. // М.: Мир, 1978. 351с.
- Листратенкова В.И., Чернушенко В. К., Петкевич Н. С., Кольцов Д. Н. Эти «немодные» бурые породы // Зоотехния. 2009. № 7. С. 4−6.
- Листратенкова В.И., Чернушенко В. К., Кольцов Д. Н., Петкевич Н. С., Майорова Г. В., Тюриков В. И. Отличимость, однородность и стабильность животных Вазузского типа сычевской породы крупного рогатого скота. // Зоотехния. 2009. № 7. С. 10−11.
- Марзанов Н.С. Микросателлиты и их использование для оценки генетического разнообразия животных / Н. С. Марзанов, М. Ю. Озеров, М. Г. Насибов, Л. К Марзанова // Сельскохозяйственная биология, 2004. № 2. С. 104−111 с.
- Меркурьева Е.А., Абрамова З. В., Бакай А. В. и др. Генетика. М., 1979.
- Молофеева Л. А. Разработка мультилокусной системы генетического анализа крупного рогатого скота по микросателлитам и ее использование для характеристики генофонда черно-пестрого скота: дис.. канд. биол. наук, Дубровицы, 2009. 132 с.
- Молочное скотоводство России (в рамках реализации приоритетного национального проекта «Развитие агропромышленного комплекса» России) / под ред. Н. И. Стрекозова и Х. А. Амерханова. М.: 2006. 573 с.
- Никитина Т. В. Назаренко С. А. Микросателлитные последовательности ДНК: мутационный процесс и эволюция // Генетика, 2004. № 10. С. 1301−1318.
- Столповский Ю.А. Ключевой вопрос в сохранении «культурного» биоразнообразия животных сохранение породного многообразия // Известия ТСХА, 2007. С. 125−134.
- Серебровский А.С. Генетический анализ. М.: Наука, 1970. С. 3−341.
- Стрекозов Н.И., Чернушенко В. К., Цысь В. И. Интенсификация молочного скотоводства России. Смоленск, 1997. С. 12.
- Свердлов Е.Д. Очерки современной молекулярной генетики. // Молекулярная генетика. Микробиология и вирусология, 1995. № 2. С. 3−15.
- Сулимова Г. Е. ДНК- маркеры в генетических исследованиях: типы маркеров, их свойства и области применения. // Успехи современной биологии, 2004. Т 124. № 3. С. 260.
- Сулимова Г. Е. Полиморфизм длин рестрикционных фрагментов ДНК у сельскохозяйственных животных. Успехи современной генетики, 1993. С. 330.
- Сулимова Г. Е. Молекулярно-генетический анализ генома животных и человека с использованием ДНК-маркеров: дис.. д-р биол. наук, М., 1998. 285 с.
- Храброва JI.A. Маркер-вспомогательная селекция в коневодстве./ Л. А. Храброва // ВНИИ коневодства, 2002. С. 1−4. Режим доступа: (http://www.riihorses.ru).
- Хедрик Ф. Генетика популяций. М.: Техносфера, 2003. 588 с.
- Хемлебен В., Беридзе Т. Г., Бахман Л., Коварик Я., Торрес Р. Сателлитные ДНК // Успехи биологической химии, 2003. Т. 43. С. 267—306.
- Чернушенко В.К., Листратенкова В. И., Тюриков В. Тип Смоленский // Молочное и мясное скотоводство, 2008. № 2, С. 19.
- Эрнст Л.К., Зиновьева Н. А. Биологические проблемы животноводства в XXI веке. М.: РАСХН, 2008. 508 с.
- Adrian R.A., Taylor М., McKeown В. Compilation of a panel of informative single nucleotide polymorphisms for bovine identification in the Northern Irish cattle population//BMC Genet., 2010. 5(11): 1107−1127.
- Archibald A.L., Haley J.F., Brown S. et. al., The PIG-MaP consortium linkage map of the pig (Sus scrofa). // Mamm. Genome, 1995, 6: 157−175.
- Arranz J.J., Bayon Y. and San Primitivo F. Differentiation among Spanish sheep breeds using microsatellites. // Genet. Sel. Evol., 2001b, 33: 529−542.
- Armstrong E., Postiglioni A., Martinez A., Rincon G. and Luis Vega-PIa J. Microsatellite analysis of a sample of Uruguayan Creole bulls (Bos taurus) // Genetics and Molecular Biology, 2006, 2: 267−272.
- Ball A.O. and Chapman R.W. Population genetic analysis of white shrimp, Litopenaeus setiferus, using microsatellite genetic markers. // Mol. Ecol., 2003, 12:2319−2330.
- Barton N.H. Genetic hitchhiking. Philos. Trans. R. Soc. Lond. В // Biol. Sci., — 2000, 355: 1553−1562.
- Barendse Wo, Armitage S.M., Kossarek L.M. et.al. A genetic map of the bovine genome. //Nature genet., 1994, 6: 227−235.
- Balloux F. and Lugon-Moulin N. The estimation of population differentiation with microsatellite markers. // Mol. Ecol., 2002, 11: 155−165.
- Beamount M. and Bruford M. Microsatellites in conservation genetics. In: Microsatellites Application and evolution. // Oxford University Press, Oxford, 1999.- 165−180.
- Baumung R., Simianer H., Hoffmann I. Genetic diversity studies in farm animals-a survey. //J. Anim. Breed. Genet., 2004, 121: 361−373.
- Beridze, T. Satellite DNA. Springer Verlag. Berlin, // Heidelberg, 1986:257−269.
- Bicalho H.M.S., Pimenta C.G., Mendes I.IC.P., Репа H.B., Queiroz E.M., Pena S.D.J. Determination of ancestral proportions in synthetic bovine breeds using commonly employed microsatellite markers // Genet. Mol. Res., N. 5(3), 2006: 432 437.
- Bischop M.D., Kappes S.M., Keele J.W. et. al. A Genetic linkage map for cattle. Genetics. 1994, 136: 619−639.
- Bostock, C. Phil. Trans. Roy.Soc. Lond .B, 312, 1986: 261−273.
- Brookfield J.F.Y. A simple new method for estimating null allele frequency from heterozygote deficiency. // Mol. Ecol., 1996, 5: 453−455.
- Brezinsky, L.S., Kemp, J., Teale, A.J. ILSTS005: a polymorphic bovine microsatellite. // Anim. Genet. 1993a, 24: 73.
- Brezinsky, L.S., Kemp, J., Teale, A.J. ILSTS006: a polymorphic bovine microsatellite. // Anim. Genet. 1993b, 24: 73.
- Brezinsky, L.S., Kemp, J., Teale, A.J. Five polymorphic bovine microsatellites (ILSTS010−014). // Anim. Genet. 1993c, 24: 75−76.
- Callen D.F., Thompson A.D., Shen Y, Phillips H.A., Richards R.I., Mulley J.C. and Sutherland G.R. Incidence and origin of «null» alleles in the (AC)n microsatellite markers. //Am. J. Hum. Genet., 1993, 52: 922−927.
- Chakraborty R., De Andrade M., Daiger S.P. and Budowle B. Apparent heterozygote deficiencies observed in DNA typing data and their implications in forensic applications. //Ann. Hum. Genet., 1992. 56: 45−57.
- Comuet J.-M., Piiy S., Luikart G., Estoup A. and Solignac M. New methods employing multilocus genotypes to select or exclude populations as origins of individuals.//Genetics. 2000, 153: 1989−2000.
- Crawford A.M., Dodds K.G., Ede A.J., Pierson C.A., Montgomery G.W., Garmonsway H.G., Beattie A.E., Davies K., Maddox J.F., Kappes S.W. and. An autosomal genetic linkage map of the sheep genome. // Genetics. 1995, 140: 703 724.
- Csink AK, Henikoff S. Something from nothing: the evolution and utility of satellite repeats. Trends Genet. 1998 May- 14(5):200−41 998
- Charlier C., Denys В., Belanche J.l. et. al. Microsatellite mapping of the bovine roan locus: A major determinant of White Heifer Disease. Mamm. Genome, 1996, 7: 138−142.
- Charlier C., Coppieters W.Y., Famir F. et. al. The mh gene causing doublemuscling in cattle maps to bovine Chromosome 2. Mamm. Genome, 1995, 6: 788−792.
- Curi R.A., Lopes C.R. Evaluation of nine microsatellite loci and misidentification paternity frequency in a population of Gyr breed bovines. // Brazil J. Vet. Res. Anim. Sci., 2002, 39(3): 129 135.
- Chen H. Y., Zhang Q., Yin С. C., Wang С. K., Gong W. J., and Mei G. Detection of Quantitative Trait Loci Affecting Milk Production Traits on Bovine
- Chromosome 6 in a Chinese Holstein Population by the Daughter Design // J. Dairy Sci. 2006, 89: 782−790.
- Dib C., Faure S., Fisanes C. et al. // Nature. 1996. — Vol. 380. — P. 152 154.
- Di Rienzo A., Peterson A.C., Garza J.C., Valdes A.M., Slatkin M. and Freimer N.B. Mutational processes of simple-sequence repeat loci in human populations. //Proc. Am. Soc. Anim. Sci. 1994, 91: 3166−3170.
- Diehl S.R., Ziegle J., Buck G.A., Reynolds T.R., Weber J.L. // Amer. J. Hum. Genet. 1990. — V. 47. — P. 177.
- Dover G.A. Molecular drive a cohesive mode of species evolution. // Nature 1982., 299:111−117.
- Ede A.J. and Crawford A.M. Mutations in the sequence flanking the microsatellite at the Kap8 locus prevent the amplification of some alleles. // Anim. Genet., 1995- 26: 43−44.
- Edwards A., Civitello A., Hammond H.A. and Caskey C.T. DNA typing and genetic mapping with trimeric and tetrameric tandem repeats. // Am. J. Hum. Genet., 1991 49: 746−756.
- Estoup A. and Cornuet J.M. Microsatellite evolution: inferences from population data. In: Microsatellites Evolution and application. //Eds.: D. B. Goldstein and C. Schlotterer. Oxford University Press, Oxford, 1999 — 49−64.
- Fries, R., Eggen, A., Womack, J.E. The bovine genome map. // Mamm. Genome 1993,4:405−428.
- Goldstein D.B. and Pollock D.D. Launching Microsatellites: A review of mutation processes and methods of phylogenetic inference. // J. Hered., 1997, 88: 335−342.
- Goldstein D.B., Schlotterer С. Microsatellites. Evolution and Applications. Oxford, 1999, 321 p.
- Glowatzlci-Mullis M.-L., Gaillard C., Wigger G. and Fries R. Microsatellite-based parentage control in cattle. // Anim. Genet. 1995, 26: 7−12.
- Georges M, Nielsen D, Mackinnon M, Mishra A, Okimoto R, Pasquino AT et al. Mapping quantitative trait loci controlling milk production in dairy cattle by exploiting progeny testing. // Genetics. 1995, 139: 907−920.
- Georges M, Drinkwater R, King T, Mishra A, Moore SS, Nielsen D et al. Microsatellite mapping of a gene affecting horn development in Bos taurus. // Nature Genetics 1995b, 4: 206−210.
- Hammond E.L., Lymbery A.J., Martin G.B., Groth D. and Wetherall J.D. Microsatellite analysis of genetic diversity in wild and farmed Emus (Dromaius novaehollandiae). //J. Hered., 2002 93, 376−380.
- Hall J.G. and Bradley D.G. Conserving livestock breed biodiversity. // Trends Ecol. Evol. 1995, 10: 267−270.
- Hancock J.M. Microsatellites and other simple sequences: genomic context and mutational mechanisms. In: Microsatellites Evolution and application. // Ed. D. B. Goldstein und C. Schlotterer. Oxford University Press, Oxford, 1999, 16.
- Holm L.E., Loeschcke V. and Bendixen C. Elucidation of the molecular basis of a null allele in a rainbow trout microsatellite. // Mar. Biotechnol. 2001, 3: 555−560.
- Hibert P., Lindpaintner K., Beckmann J.S., Serilcawa Т., Soubrier F., Dubay C., Cartwright P., De Gouyon В., Julier C., Takahasi S. // Nature. 1991. -353(6344) -521−529.
- HeyenD.W., Beever J.E., Da Y., Evert R.E., Green C., Bates S.R.E., Ziegle J.S. and Lewin H.A. Exclusion probabilities of 22 bovine microsatellite markers in flourescent multiplexes for semi-automated parentage testing. // Anim. Genet. 1997, 28, 21−27.
- Hedrick P.W. Perspective: Highly variable loci and their interpretation in evolution and conservation. //Evolution 1999, 53: 313−318.
- Ibeagha-Awemu E.M. and Erhardt G. Genetic structure and differentiation of 12 African Bos indicus and Bos taurus cattle breeds, inferred from protein and microsatellite polymorphisms. // J. Anim. Breed. Genet. 2005, 122: 1220.
- Jeffreys A.J., Hyppervariable DNA and genetic fingerprints. // A.J. Jeffreys, J. Hillel, N. Hartley // Anim. Genet. 1987. — V.18. Suppl.l. — P.141.
- Jorde L.B., Bamshad M.J., Watkins W.S. et al. // Am. J. Hum. Genet. -1995.-Vol.57.-P. 523−538,
- Jones A.G., Stockwell C.A., Walker D. and Avise J.C. The molecular basis of a microsatellite null allele from the white sands pupfish. // J. Hered., 1998 -89: 339- 342.
- Jesse W. Breinholt, Renee V. Buren, Olga R. Kopp and Catherine L. Stephen Population genetic structure of an endangered Utah endemic, Astragalus ampullarioides (Fabaceae) // American Journal of Botany. 2009, 96: 661−667.
- Janik A., Zabek Т., Radko A., Natonek M. Evaluation of polymorphism at 11 microsatellite loci in Simmental cattle raised in Poland // Ann. Anim. Sci., Vol. 1, No. 2 (2001): 19−29.
- Kappens M.S., Keele J.W., Stone R.T. et. al. A second-generation linkage map of bovine genome. // Genome Res., 1997, 73.: 235−249.
- Kantanen J., Olsaker I., Holm L.E., Lien S., Vilkki J., Brusgaard K., Eythorsdottir E., Danell B. and Adalsteinsson S. Genetic diversity and population structure of 20 North European cattle breeds. // J. Hered. 2000, 91: 446−457.
- Kemp S.J., Hishida О., Wambugu J., Rinlc A., Longeri M.L., Ma, R.Z., Da, Y., Lewin H.A., Barendse Wo. and Teale A.J. A panel of polymorphic bovine, ovine and caprine microsatellite markers. // Anim. Genet. 1995,26, 299−306.
- Kevorkian S.E.M., Georgescu S.E., Manea M.A., Zaulet M., Hermenean A.O., Costache M. Genetic diversity using microsatellite markers in four Romanian autochthonous sheep breeds // Biotechnological Letters, 2010. 15(1): 125−133.
- Kaukinen, J., Varvio, S.L. Eight polymorphic bovine microsatellites. // Anim. Genet. 1993,24: 148.
- Kimura M. and Crow J.F. The number of alleles that can be maintained in finite populations. //Genetics, 1964. 49: 725−738.
- Kimura M. and Otha T. Stepwise mutation model and distribution of allelic frequencies in a finite population. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1978 75: 2868−2872.
- Koorey D.J., Bishop G.A. and McCaughan G.W. Allele non-amplification: a source of confusion in linkage studies employing microsatellite polymorphisms. //Hum. Mol. Genet., 1993 2: 289−291.
- Lagercrantz U., Ellegren H. and Andersson L. The abundance of various polymorphic microsatellite motifs differs between plants and vertebrates. // NAR. 1993, 215.:1111−1115.
- Levinson G. and Gutman G.A. Slipped strand mispairing: a major mechanism for DNA sequence evolution. // Mol. Biol. Ecol. 1987, 4: 203−221.
- Lehmann Т., Hawley W.A. and Collins F.H. An evaluation of evolutionary constraints on microsatellite loci using null alleles. // Genetics, 1996 -144, 1155−1163.
- Leroy G., Callede L., Verrier E. Genetic diversity of a large set of horse breeds raised in France assessed by microsatellite polymorphism. // Genetics Selection Evolution, 2009. 41: 1186−1297.
- Litt M., Luty J.A. // Am. J Hum. Genet. 1989. — 44(3) -397−401.
- Li YC, Korol AB, Fahima T, Beiles A, Nevo E. Microsatellites: genomic distribution, putative functions and mutational mechanisms: a review. // Mol Ecol. 2002, 11(12): 2453−2465.
- Ma R.Z., Beever J.E., Da Y. et. al. A male linkage map of the cattle (Bos taurus) genome. //Y.J. of Heredity, 1996, 87: 261−271.
- Mahtani M. M, Willard H.F. A polymorphic X-linked tetranucleotide repeat locus displaying a high rate of new mutation: implications for mechanisms of mutation at short tandem repeat loci. // Hum Mol Genet. 1993, 2(4): 431−437
- Machugh D.E., Loftus R.T., Bradley D.G. et al. Microsatellite DNA variation within and among European cattle breeds. // Proc. R. Soc, Lond., 1994, 256: 25−31.
- Mittal N., Dubey A.K. Microsatellite markers- A new practice of DNA based markers in molecular genetics // Genetics, 2009. 3(6): 235−246.
- Mommens, G.W., Coppieters, A. et al. Dinucleotide repeat polymorphism at the bovine MM12E6 and MM8D3 loci. // Anim. Genet. 1994, 25: 368.
- Moore, S.S., Byrne, K. Characterization of 65 bovine microsatellites // Mamm. Genome, 1994. 5: 84−90.
- Moioli В., Napolitano F., Catillo G. Genetic diversity between Piedmontese, Maremmana, and Podolica cattle breeds // J. of Heredity 2004: 95(3):250−256.
- Nickerson D.A., Taylor S.L., Weiss K.M., Clark A.G., Hutchinson R.G., Stengard J., Salomaa V., Vartiainen E., Boerwinlcle E. and Sing C.F. DNA sequence diversity in a 9.7-kb region of the human lipoprotein lipase gene. //Nat. Genet., 1998 19, 233−240.
- Nei M. Genetic distance between populations. // Amer. Natur., 1972, 106(949): 283−291.
- Nei M. The theory and estimation of genetic distance. In: Genetic structure of populations. // Ed. N. E. Morton. University Press of Hawaii, Honululu, 1973 a.
- Nei M. Analysis of gene diversity in subdivided populations. // Proc. Natl. Acad.Sci. USA 1973b, 70: 3321−3323.
- Nei, M. 1978. Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. // Genetics 89: 583−590.
- Notter D.R. The importance of genetic diversity in livestock populations of the future. //J. Anim. Sci., 1999, 77: 61−69.
- Ogorevs J., Kunej Т., Razpet A., Poyc P. Database of cattle candidate genes and genetic markers for milk production and mastitis. // Animal Genetics, 1 2009, 6: 40−45.
- Ozkan E., Soysal M. I., Ozder M., Koban E., Sahin O. and Togan I. Evaluation of parentage testing in the Turkish Holstein population based on 12 microsatellite loci//Livest. Sci., 2009, 124(1−3): 101−106.
- Paetkau D., Slade R., Burdens M. et. al. Genetic assignment methods for the direct, real-time estimation of migration rate: a simulationbased exploration of accuracy and power. // Mol. Ecol., 2004, 13: 55−65.
- Paetkau D., Calvert W., Stirling I. and Strobeck C. Microsatellite analysis of population-structure in Canadian polar bears. // Mol. Ecol., 1995, 4: 347 354.
- Pemberton J.M., Slate J., Bancroft D.R. and Barrett J.A. Nonamplifying alleles at microsatellite loci: a caution for parentage and population studies.// Mol. Ecol., 1995 4: 249−252.
- Peakall, R., and P.E. Smouse. GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. // Molecular Ecology, 2007. Notes 6: 288—295. Available: http://www.anu. edu. au/BoZo/GenAlEx/ genalex download.php.
- Primmer C.R., Moller A.P. and Ellegren H. Resolving genetic relationships with microsatellite markers: a parentage testing system for the swallow Hirundo rustica. //Mol. Ecol., 1996−4: 493−498.
- Richards R.I., Sutherland G.R. // Trends Biochem Sci. Nat Genet.1994. -6(2).- 114−116.
- Rubinsznein D.C., Amos W., Leggo J., Goodburn S., Jain S., Li S.H., Margolis R.L., Ross C.A. and Ferguson-Smith M.A. Microsatellite evolution -evidence for directionality and variation in rate between species. // Nat. Genet.1995, 10: 337−343.
- Rubinsztein D., Leggo J., Amos W. // Genomics.-1995.-Vol. 10 P. 3337−3431.
- Rincon G., Farber E.A., Farber C.R., Nkrumah J.D. and Medrano J.E. Polymorphisms in the STAT 6 gene and their association with carcass traits in feedlot cattle. // Animal Genetics, 2009, V.40, P.6.
- Reinecke P., ReiBmann M., Muller U., Abdel-Rahman S. Fine Mapping of milk yield QTL on chromosomes 6 and 20 in German Holstein population using Microsatellite Markers // Anim. Genet., 2005, 38: 25−33.
- Ron M., Kliger D., Feldmesser E., Seroussi E., Ezra E. and Weller J. I. Multiple Quantitative Trait Locus Analysis of Bovine Chromosome 6 in the Israeli Holstein Population by a Daughter Design // J. Anim. Sci., 2001, Vol. 3, No. 3: 29−37.
- Sadeghi R., Mahmoudi В., Babayev M.S., Rameshknia Y. and Daliri M. Genetic Analysis in Tali Goats Based on 13 Microsatellite Markers // Journal of Biological Sciences, 2009. 4 (6): 734−737.
- Soheir M., El N., Amal A.H., Mossallam A.A., et. al. Analysis of genetic variation in different sheep breeds using microsatellites // African Journal of Biotechnology 2008, Vol. 7 (8), P. 1060−1068.
- Schrooten C. Genomic variation in dairy cattle. Identification and use. // Animal Breeding and Genetics Group. Doctoral thesis, Netherland, 2004.
- Schloetterer C. Evolutionary dynamics of microsatellite DNA. // Chromosoma 2000, 109:365−371.
- Schloetterer C. Opinion: The evolution of molecular markers just a matterof fashion? // Nature Rev. Genet., 2004, 5: 63−69.
- Schloetterer C. and Tautz D. Slippage synthesis of simple sequence DNA.//Nucleic Acids Res. 1992, 20: 211−215.
- Smith C.L., Analyses of genome organization and rearrangements by pulsed field gradient gelelectrophoresies / C.L. Smith, P.E. Warburton, C. Cantor // Genetic engeneering N.Y.: Plenum press. 1986. — V. 8. — P. 45−70.
- Strand M., Prolla T.A., Liskay R.M. and Petes T.D. Destabilization of tracts of simple repetitive DNA in yeast by mutations affecting DNA mismatch repair.//Nature, 1993 365: 274−276.
- Solinas T.S., Fries, R. Physically mapped, cosmid-derived microsatellite markers as anchor loci on bovine chromosomes. // Mamm. Genome, 1993, 4: 720 727.
- Steffen, P., Eggen, A. Isolation and mapping of polymorphic microsatellites in cattle. Anim. Genet. 1993, 24: 121−124.
- Sifuentes-Rincon A.M., Puentes-Montiel H., Parra-Bracamonte G.M. Assessment of genetic structure in Mexican charolais herds using microsatellite markers // Molecular biology and genetics. 2007, V. 10, N.4.
- Soller M. Genetic mapping of the Bovine Genome Using Deoxyribonucleic Acid-Level Markers to Identify Loci Affecting Quantitative Traits of Economic Importance. J. Dairy Sci. 1990, 73: 2682−2646.
- Slatkin M. Hitchhiking and associative overdominance at a microsatellite locus. //Mol. Biol. Ecol., 1995 b 12, 473−480.
- Stallings R. L, Ford R., Nelson О et al Evolution and distribution of (GN)n repectitive sequences in mammalian genomes. Genomics, 1991, 10: 807−815.
- Su Y., Chen G.H. DNA microsatellite analysis of genetic diversity among Chinese indigenous laying-type ducks (Anas platyrhynchos) // Czech J. Anim. Sci., 2009. 54: 128−135.
- Tautz D. Hypervariability of simple sequences as a general source for polymorphic DNA markers / Tautz D. 1989. Vol.17. — P. 6463−6471.
- Tautz D. and Schlotter C. Simple sequences. //Curr. Opin. Genet. Dev., 1994- 4: 832−837.
- Tachida H. and Izuka M. Persistence of repeated sequences that evolve by replication slippage. //Genetics, 1992 131, 471−478.
- Valdes A.M., Slatkin M. and Freimer N.B. Allele frequencies at microsatellite loci: The stepwise mutation model revisited. // Genetics, 1993 133, 737−749.
- Vaiman, D., Osta, D. Characterisation of five new bovine microsatellite repeats. //Anim. Genet. 1992, 23: 537.
- Vaiman, D., Mercier, D. A set of 99 cattle microsatellites: characterisation, synteny mapping, and polymorphism. // Mamm. Genome 1994, 5: 288−297.
- Vilkki H.J., Koning D.J., Elo K. et. al. Multiple marker mapping of quantitative trait loci of Finnish dairy cattle by regression. // J. Dairy Sci., 1997, 801.: 198−204.
- Waser P.M. and Strobeck C. Genetic signatures of interpopulation dispersal. // Trends in Ecology and Evolution 1998, 13: 43−44.
- Weimann C., Leyhe-Horn В., Gauly M., Erhardt G. Suitability of microsatellites BM1329 and OarAElOl as markers for the introgression of the Fee (B) locus into different sheep breeds // Arch. Tierzucht 2001, 44, 435−440.
- Weir B.S. and Cockerham C. Estimating F-statistics for the analysis of population structure. // Evolution, 1984, 38: 1358−1369.
- Weber J. L, Wong C. Mutation of human short tandem repeats. // Hum Mol Genet. 1993, 2(8): 1123−1128.
- Weber J.L. Abundant class of human DNA polymorphism which can be typed using the polymerase chain reaction / J.L. Weber, P.E. May // Am. J. Hum. Genet. 1989. -V. 44. — P. 388−396.
- Weber J.L. Informativeness of human (dC-dA)n (dG-dT)n polymorphisms / Weber J.L. // Genomics. 1990. — Vol.7. — P. 524−530.
- Weller J. L Current and Future Developments in Patents for Quantitative Trait Loci in Dairy Cattle // Institute of Animal Sciences, A. R. O., The Volcani Center, Israel, 2007, 69−76.
- Wintero A. K., Fredholm M., Thomsen P. D. Variable (dG dT) n (dC -dA)n Sequences in the Porcine Genome, 1992, 12: 281−288.
- Xin Xu, Mei Peng, Zhian Fang, Xiping Xu. The direction of microsatellite mutations is dependent upon allele length. // Nature Genetics. 2000, 24: 396 — 399.
- Yinglei Lai and Fengzhu Sun The Relationship Between Microsatellite Slippage Mutation Rate and the Number of Repeat Units // Mol. Biol. Evol. 2003, 20(12): 2123−2131.
- Ziegle J.S., Su Y, Corcoran KP, Nie L, Mayrand PE, Hoff LB, McBride LJ, Kronick MN, Diehl SR. Application of automated DNA sizing technology for genotyping microsatellite loci. // Genomics. 1992. 14: 1026−1031.