Математические модели и программный комплекс предсказания энергетических характеристик органических соединений и процессов их радикального распада
Диссертация
Не менее актуальным представляется решение и ряда конкретных задач по обозначенной проблеме. К ним относятся разработка оптимальных (для компьютерной реализации) математических моделей представления органических соединений и процессов их радикального распада. Действительно, существуюнще модели представления органических соединений созданы для специфических задач и плохо пригодны для моделирования… Читать ещё >
Содержание
- Глава 1. Методы расчета энтальпий образования и энергий диссоциации связей органических молекул и радикалов. Компьютерное представление химических соединений
- 1. 1. Методы расчета энтальпий образования и энергий диссоциации связей органических соединений
- 1. 2. Аддитивно-групповой подход
- 1. 3. Компьютерное представление органических соединений
- 1. 3. 1. Z-матрица
- 1. 3. 2. Линейные представления
- 1. 3. 3. Представления, основанные на использовании методов теории графов
- 1. 3. 4. Канонизация представления химических структур
- 1. 4. Постановка задачи
- Глава 2. Математическая модель компьютерного представления органических соединений. Алгоритмы автоматического прогнозирования энтальпии образования органических молекул и радикалов
- 2. 1. Молекулярный граф
- 2. 2. Модифицированная матрица смежности
- 2. 2. 1. Код диагонального элемента
- 2. 2. 2. Состояния атомов
- 2. 2. 3. Матрица смежности с учетом состояний атомов
- 2. 3. Компьютерное представление структурных групп
- 2. 4. Тополого-групповой алгоритм фрагментации органических соединений
- 2. 4. 1. Фрагментация молекул на структурные группы
- 2. 4. 2. Фрагментация радикалов на структурные группы
- 2. 5. Математические модели учета отклонений от аддитивности
- 2. 5. 1. Парные невалентные взаимодействия электроотрицательных заместителей
- 2. 5. 2. Сопряжение тс-электронов в ненасыщенных радикалах со свободной валентностью
Список литературы
- Орлов Ю.Д., Лебедев Ю. А. // Журн. хим. термодин. и термохим. 1992. Т. 1. N2.-C. 131−142.
- Орлов Ю.Д. Расчет параметров уравнения Аррениуса реакций термической диссоциации многоатомных молекул в газовой фазе. / Дисс.. канд. физ.-мат. наук. -Калинин, 1984.
- Francisco J.S., Montgomery J.A. Theoretical studies of the energetic of radicals. //Energetics of organic free radicals./ Ed. J. Simoes, A. Greenberg, J. Liebman. -L.: Blackie Academic & Professional, 1996. -P. 110−149.
- Орлов Ю.Д., Лебедев Ю. А., Сайфуллин И. Ш. Термохимия органических свободных радикалов. М.: Наука. 2001. — 304 е., ил.
- Franklin J.L. // J. Chem. Phys. 1953. Vol. 21. N 11. -P. 2029.
- O’Neal H.E., Benson S.W. // Int. J. Chem. Kinet. 1969. V. 1. N2.-P.221.
- O’Neal H.E., Benson S.W. // Free Radicals /Edit. K.Kochi. V. 2. -Z., N.-Y.: Wiley, 1973. -P. 275.
- Папулов Ю.Г. // Докл. АН СССР. 1962 Т. 143. № 6. С. 1395.
- Папулов Ю.Г. // Свойство веществ и строение молекул. -Калинин: КГУ, 1974. -С. 3.
- Папулов Ю.Г., Смоляков В. М. Физические свойства и химическое строение. -Калинин: КГУ, 1981. -С. 88.
- И.Витвицкий А. И. //Успехи химии. 1971. Т. 40, № 10. -С. 1879−1981.
- Luria М., Benson S.W. // J. Amer. Chem. Soc. 1975. Vol. 97, N 12. -P. 3342−3345.
- Смоленский E.A., Кочарова Л. В. // Докл. АН СССР. 1977. Т. 239, № 1. -С. 135.
- Воеводский В.В. // Докл. АН СССР. 1951. Т. 79, № 3. -С. 455.
- Веденеев В.И. // Докл. АН СССР. 1957. Т. 114, № 3. -С. 571.
- Сабо З.Г. // Химическая кинетика и цепные реакции / Под ред. В. Н. Кондратьева. -М.: Наука, 1976. -С. 46.
- Истомин Б.И. //Реакц. способность орган, соединений. 1974. Т. 11, № 1.-С. 157.
- Магарил Р.З. //Журн. физ. химии. 1990. Т. 65, № 6. -С. 1569−1573.
- Каралетьянц М.Х. Методы сравнительного расчета физико-химических свойств. -М.: Наука, 1965. -С. 403.
- Пумаль А.П. // Журн. физ. химии. 1956. Т. 30, № 1. -С. 172.
- Степанян А.Е., Папулов Ю. Г., Краснов Е. П., Кураков Г. А. Высокомолекулярные соединения. 1972. Т. 14, № 10. -С. 2033.
- Benson S.W. Termochemical Kinetic. 2 nd ed. -N.-Y.: Wiley, 1976.
- Барон P., Шанон M. Компьютерное планирование органического синтеза. В кн: ЭВМ помогает химии. / Под ред. Г. Вернена, М. Шанона — Л.: Химия, 1990. — С. 11−83.
- Кларк Т. Компьютерная химия: -М.: Мир, 1990. -383 с.
- Smith E.G., Becker P.A. The Wisswesser Line Formula Chemical Notation. -L.: Cherry Hill, 1976.
- Поролло A.A. Компьютерное моделирование термического распада нитросоединений: Дисс.. канд. хим. наук. -Йошкар-Ола: МарГУ, 1999.-С. 9−12.
- Bersohn М. A Sum Algorithm for Numbering the Atoms of a Molecule. -Comput. Chem., 1978, Vol. 2, P. 113−116.
- Bersohn M., Esack A. A Canonical Connection Table Representation of Molecular Structure. Chemica Scripta, 1974, Vol. 6, P. 122−128.
- Татевский В. M. Классическая теория строения молекул и квантовая механика. -М.: Химия, 1973.
- Фаерштейн М. Г. Возникновение и развитие классического учения о валентности // Развитие учения о валентности. -М.: Химия, 1977. С. 32−71.
- Применение теории графов в химии. Новосибирск: Наука, 1988. С. 10−25.
- Кормен Т., Лейзерсон Ч., Ривест Р. Алгоритмы: построение и анализ. -М.: МЦНМО, 2001. -с. 960
- Лебедев Ю.А., Мирошниченко Е. А., Кнобель Ю. К. Термохимия нит-росоединений. -М.: Наука, 1970. -с.168
- Орлов Ю.Д., Лебедев Ю. А. // Журн. физич. химии. 1991. Т. 65. N 2. С. 289−300.
- Нонхибел Д., Уолтон Дж. Химия свободных радикалов. -М.: Мир. 1977.
- КотреллГ. Прочность химических связей. -М.: Издатинлит, 1956.
- Веденеев В.И., Гурвич Л. В., Кондратьев В. Н., Медведев В. А., Франке-вич Е.Л. Энергии разрыва химических связей. Потенциалы ионизации и сродство к электрону. -М.: Изд. АН СССР, 1962.
- Гурвич Л.В., Карачевцев Г. В., Кондратьев В. Н., Лебедев Ю. А., Медведев В. А., Потапов В. К., Ходеев Ю. С. Энергии разрыва химических связей. Потенциалы ионизации и сродство к электрону. -М.: Наука, 1974.
- Мортимер Ч. Теплоты реакций и прочность связей. -М.: Мир, 1964.
- Kerr J.A. // Chem. Rev. 1966. V. 66. N 5. P. 465.
- Egger K.W., Cocks A.T. // Helv. Chim. Acta. 1973. V. 56, N 5. P. 1516.
- McMillen D.F., Golden D.M. // Ann. Rev. Pbys. Chem. 1982. V. 33. P. 493.
- Kerr J.A., Tortman-Dickenson A.F. Handbook of chemistry and physics. -Florida: CRC Press. P. F, 1981.-P. 180.45 .Kerr J.A., In: Handbook of chemistry and physics. -Florida: CRC Press, 1995−1996.
- Орлов Ю.Д., Лебедев Ю. А. // V Всесоюзная конференция по термодинамике органических соединений. Тезисы докладов. Куйбышев. 1987. С. 1.
- Орлов Ю.Д., Лебедев Ю. А. // Термодинамика химических соединений. Горький. 1988. С. 84.
- Ю. Д. Орлов, Ю. А. Лебедев, Л. Г. Менчиков, О. М. Нефедов // Изв. АН, Сер. хим., 1997, С. 57.
- Ю.Д. Орлов, Р. Х. Зарипов, Ю. А. Лебедев // Изв. АН, Сер. хим., 1998, С. 637.
- Ю.Д. Орлов, Р. Х. Зарипов, Ю. А. Лебедев // Изв. АН, Сер. хим., 1998, С. 643
- Ю.Д. Орлов, Ю. А. Лебедев // Изв. АН, Сер. хим., 1999, С. 286
- Руководство для публикации данных по термодинамике, подготовленное ИЮПАК // Журн. физ. химии. 1973. Т. 47. С. 2459.
- ТахистовВ.В. Органическая масс-спектрометрия. -Л.: Наука. 1990.
- Термодинамические свойства индивидуальных веществ / Под ред. Глушко В. П., Т. 2. -М.: Наука. 1979.
- Dorofeeva O.V., Gurvich Z.V. // Thermochim. Acta. 1992. V. 197. P. 53.
- Cohen N. //J. Phys. Chem. 1992. V. 96. P. 9052.
- Krestov Al.G., Lebedev Yu.A., Ocheretovyj AS. Orlov Yu.D. // 13 Th IUPAC conference on chemical thermodynamics. Clermont-Ferrand. France. My. 17−22. 1994. P. 330−331.
- Иориш B.C. Компьютерные методы расчета статистических сумм молекул и систематизации данных о термодинамических свойствах индивидуальных веществ. Дисс.. докт. хим. наук. -М.: МГУ, 1995.
- NIST Chemistry WebBook, NIST Standard Reference Database Number 69 (http ://webbook.nist. gov).
- Stein S.E., Brown R.L. Structures andPropeties Group Additivity Model in NIST Chemistry WebBook. NIST Standard Reference Database Number 69, Eds. Linstrom P.J. Mallard W.G., March 2003, National Institute of
- Standards and Technology, Gaithersburg MD, 20 899 (http://webbook.nist. gov).
- ReidR.C., Prausnitz J.M., Poling B.E. The Properties of Gases and Liquids, 4th Ed. -McGraw-Hill Book Company, 1987.
- Lyman W.J., Reehl W.F., Rosenblatt D.H. Handbook of Chemical Property Estimation Methods. Environmental Behavior of Environmental Compounds. -McGraw-Hill Book Company, 1982.
- Pedley J.B., Naylor R.D., Rylance S.P., Thermochemical Data of Organic Compounds. -Chapman and Hall, 1986.
- CHEMDATA. Chem Properties and Data Cluster (Numeric Data), http ://www. csti.yar.ru/www/websost/stn/level21 .htm.
- Дейт, К., Дж. Введение в системы баз данных, 7-е издание.: Пер. с англ. -М.: Издательский дом «Вильяме», 2001. -1072 с.
- Гарсия-Молина Г., Ульман Дж.Д., Уидом Дж. Системы баз данных. Полный курс.: Пер. с англ. М.: Изд. Дом «Вильяме», 2003. — 1088 с.
- Карпова Т.С. Базы данных: модели, разработка, реализация. СПб.: Питер, 2002. — 304 с.
- Chen P. P.-S. The Entity-Relationship Model — Toward a Unified View of Data//ACM TODS. -1976. -№ 1.
- Степанов Н.Ф., Ерлыкина И. Е., Филиппов Г. Г. Методы линейной алгебры в физической химии. -М., Изд-во МГУ. 1976.-е.184.